PI0004087 (gene) Melon (PI 482460) v1

Overview
NamePI0004087
Typegene
OrganismCucumis metuliferus (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr08: 3861347 .. 3865059 (-)
RNA-Seq ExpressionPI0004087
SyntenyPI0004087
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
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ATGACAAGAGAGTCCTGTGGCCATGTCATATGGGTTAGTTCATCGCTTTCGCTCTATACTATGTTTCCATGATTTTATGTTGTTTTTTAACACTATTTTGCATAATTATTTTCTTTTATCGTTTTATCAGGGGACCTCAAGCTAAAACTTTTAATTATTTGTTTATTTCATTGATTACCTATTCATTTATTTTCTTCTTAAGGTTTTTTTTCTACGTTTCTTGAGTTAAAATATTTTTAAAGATTACATTGTTATGATTTAAATCTTGTTTTTGTTGGGTAACAACCTTAGTTTGATATTTAGAAAAGACAGAATGTCGTTTCTTTGATTCTTGCACGTGACTCAAATTTTAACTTAATTCGTTAGAATCATTATTTACAATCTTTCACTTAATATTTTGATGCCAACCAATGTCTTTTAAGTGAAAATAATAGAGGATATTATAGTGGATAATAACAACTATAATAGTACTGTACTCTTTGACGATTGTCCGAATGAGCATGAACCACTATAACTCTTTGAAACTGTATGACATTGTTGTTCCATTAGAAAAAACAAGTGCAAATGGGCTATTCCTCAAAATTTCCATCAATCTTGCAATAAGTACTACTTCACTCAATGGAACATTCTTCAATATTTTAAGTCTGCTATTTACTTCATTTAAGTATCATAAAAATATAATTGAAAGAATATTGGTCTTTCTTTAGGTAATAGTGTCGGGAGACCGTGAAAATTTTAGCCTTGTGCTCTAAATGTATAAAGTCTTTTTTTTAAGAAAGCAAGAATTTCATTTAACTTTACTCCCAATGAAGTGAATGAAAATAGACTTCTAGGCTTGAATATTTATTCTAAACAAAATCTCTTCTTCAGTTTGAGATGTATATAGAAAATACAGATCATCAGGCACTTTGGTTGTTGCTAGGTGAACCTGCTATGTCTAATTTAGTTAATAATCTACATGTAAAATAATAGGAAAAAAGTTTGTAGTGTGTATATATATTGAATTTGTACTTATACTTGGTCATTATAGCAACAAAATGTTGGAGTTTCATGTTCCCATCTCAACGCCCAACAAAACTCACATGAACATAACTTTTTAAGTTGATGAAACAAAGATTGAAACGGCAAAACTTAAATCTAAACCAAAAATGTATGTAAGAAATTTGTTTAGATATATGTATATAATTTTGTAAGTGTATTCCATTGTGTATAAAGAAGTAATCATTTTCAATTTACTTTTAAGAGTCATAGTAAATAAAGTACCTTTCTCTTGTTTTAAGATTATTTGTGTAATTTTAACCATTCTGACTTTGGCTATTTACTGCTTCTACTACTTTTTCCATTTTGCCTCTTCTTCCTTCCATCATTAGTTGAATTTTTTTCTTCATTGCTAAACATGGAATATGTCTTCTTCCTTGATTCTTTCTCCATATCTGTTTGCTCAGCATGAAAATTAAATTTGGACATGTTGATTATAGGCAATGTTTTCTTTCTAATTGAAACTCACTTCATGAGCCTTTCAAAGAATAAAAAAAAAAAAAAAAAACAAACAAAGAATCACTTTCGCCATCTAGTACTCTCACTTATCATTTTAGATATACTAGTGTTATACCGCGTCCGCACATGCACATGTGTTCTAATTTAAAAAATCAAAATAAATACTTCCTTTAGTAATTTAAATTAAATATTAGTTAGCAAATTTATTTTAAAAATTATTTCAGATTCATTTTAAATGTTCTTATAATATATTATTATTTAATTGTTAATATCTTATGGTTCATGTTATATAATTTTAATTCAGTTAATTTAACTAATTTACTAATAATTTTTTAATTAATTTAATAACTAAAACCATAAATTTTAAAAATAATTATTAAATTTTTGGAGAAATTTTTTATTTAAAAAAAAAGTAAAAAATGTTAGACCATATAAATATATTTATTATTTAACTTTTAAGTAATAATTAACAATTTTGTAAGAATATAGCTTTTTTTTTATGACATGTGAAATATTTTTACTTAGTTTTTATTATAATGTGAAACTATATTTCATTTACTATCCGTATTGTCAATATTAGCGTAAATATAAAAATATAATATTAAAAATCATCATTATTATTAATAAGAACGTGATAAATTTTGGTTTATATATAAATAATTATACGGTTGTTATATAATAATAGAAACATAATATTTTGGATATGTATTTTTAATTAGTCAATTTTTTTATATAATTTACCTTTTCATCAAAATCTTGGTTGGTTTATTAATTATCTTTGTCATATGCTTTAGTTTTAAAATTTCTTAAAATAAAGCTTTCAAAATTTTCTAGAAATGAATATAATAAAAATATTTGGTGCTGATAAAATTAAATGCAAAATTATAAAAACTTTAGACATACCAAAATTTCATATGTTGTAATTAATTATAATTGGATAAAAATTAATTAGTAATAATTTTAAAGAATTAATTAGTTAATAATTTATTATAATCGTTTGCATTCCATTTTTAATAAATTTTATGTTACATTTTTTTGTTTTAGTGTAAATTAATATACATAGTTCTTCTATCTTTGGGAGAAAAAAAATATTTATTTTAATGATTTTTAAAGTTTATTTCCAATTTTGAACCATTAATTTCACTAATTACTTTATCTGTTTATTAAAATTTGATAAACTCTTATGCTAATTTTTTTTTATAAACTTTTATTGAATCAGTTTATTTAAAGCAAATTATGAAATCCTTTTAACATCGCATAATCTTAAGATGTCGAACATGTTTACTGTGCATTCTTCACCGTGTTCTTTATGCAAGTTACAACTGTACTTTGAGCAAGATTTTCTTTCATACGGTCGTTGTGATCTTCATTGCAATTGCTCGTTGCTCACCTTATTCACTGCAAGAATATTTCGATTTTGAGGGTGCCTAAACTTTGCCATCAGGAAGGGATTCTTGGTCTTAGGGAACCTAAGACTTCAGTACAACAAGAAATTCTCTATCTTAGGGGGCCTAAGATCTTTCAGCAAAGAGAGTTTGTTGAACACAAGGAAAGATATCTTCGTGAGAGAGAGTCTTACAATTACCAAGGGGAAGCCGAGGTGAAGACACTAACATTATCATACTTAGGGGGAGCCTAATGTCACGTCCAAAATTTTGCCCCATAATTTTTTCGCGAATAAAGGCCCCTTAACAATAGCCAAGGGGAGCCTAAACACAATCACTTGACCAAATAAATCAAATTTGCTGCCTAGACTTAAAAGGACATTTGGCCTGGAGGAGACAGCATGGCACGCAAGCCACGCCCAACACACAGCACCCTGGGTGCGCATGCCTGCGTGCAGGCACTATGTGCACGCAGCACTAGGTGCACGACATCAAGCACGCGGCACCAGGCGCACGACACCAGGCGGGCGGGGCATGGGCATGCATGCCTGGCACAACCCATACGCGCGCAAGCTTGCGTGCAACGGACATGGACAGGTACGCGCTATGCGCGCGCGCACGAAAGGCGGACGGACGAAGCTGGCCGAAGATTCCAGAACTTTTCATGACGGTCAGGAAAATTCCAGAACATGCGAGACTGACCAGGAAGGGACTGGACGCGTGCGGGATCCGGATGGTTTGCGATAGGGCGCGCGCGCTAAGTGTCACAATCGTAGTCTTTCAAAGACAAGACAAACGATTGTGCGACACTTGTTCTAGCTCGATGAACAA

mRNA sequence

ATGACAAGAGAGTCCTGTGGCCATGTCATATGGGAAGGGATTCTTGGTCTTAGGGAACCTAAGACTTCAGTACAACAAGAAATTCTCTATCTTAGGGGGCCTAAGATCTTTCAGCAAAGAGAGTTTGTTGAACACAAGGAAAGATATCTTCGTGAGAGAGAGTCTTACAATTACCAAGGGGAAGCCGAGGAGACAGCATGGCACGCAAGCCACGCCCAACACACAGCACCCTGGGTGCGCATGCCTGCGTGCAGGCACTATGTGCACGCAGCACTAGGTGCACGACATCAAGCACGCGGCACCAGGCGCACGACACCAGGCGGGCGGGGCATGGGCATGCATGCCTGGCACAACCCATACGCGCGCAAGCTTGCGTGCAACGGACATGGACAGGTACGCGCTATGCGCGCGCGCACGAAAGGCGGACGGACGAAGCTGGCCGAAGATTCCAGAACTTTTCATGACGGTCAGGAAAATTCCAGAACATGCGAGACTGACCAGGAAGGGACTGGACGCGTGCGGGATCCGGATGGTTTGCGATAGGGCGCGCGCGCTAAGTGTCACAATCGTAGTCTTTCAAAGACAAGACAAACGATTGTGCGACACTTGTTCTAGCTCGATGAACAA

Coding sequence (CDS)

ATGACAAGAGAGTCCTGTGGCCATGTCATATGGGAAGGGATTCTTGGTCTTAGGGAACCTAAGACTTCAGTACAACAAGAAATTCTCTATCTTAGGGGGCCTAAGATCTTTCAGCAAAGAGAGTTTGTTGAACACAAGGAAAGATATCTTCGTGAGAGAGAGTCTTACAATTACCAAGGGGAAGCCGAGGAGACAGCATGGCACGCAAGCCACGCCCAACACACAGCACCCTGGGTGCGCATGCCTGCGTGCAGGCACTATGTGCACGCAGCACTAGGTGCACGACATCAAGCACGCGGCACCAGGCGCACGACACCAGGCGGGCGGGGCATGGGCATGCATGCCTGGCACAACCCATACGCGCGCAAGCTTGCGTGCAACGGACATGGACAGGTACGCGCTATGCGCGCGCGCACGAAAGGCGGACGGACGAAGCTGGCCGAAGATTCCAGAACTTTTCATGACGGTCAGGAAAATTCCAGAACATGCGAGACTGACCAGGAAGGGACTGGACGCGTGCGGGATCCGGATGGTTTGCGATAG

Protein sequence

MTRESCGHVIWEGILGLREPKTSVQQEILYLRGPKIFQQREFVEHKERYLRERESYNYQGEAEETAWHASHAQHTAPWVRMPACRHYVHAALGARHQARGTRRTTPGGRGMGMHAWHNPYARKLACNGHGQVRAMRARTKGGRTKLAEDSRTFHDGQENSRTCETDQEGTGRVRDPDGLR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 138..180
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 141..180

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
PI0004087.1PI0004087.1mRNA