PI0002707 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAAGGTTTTCAGGATGCCAGTGGGCCTCCAAACTTGGCTCAACTTCAGGCCACCATGCAAGCCATTGAACTTGCTTGCAGTTCCATTCAGGTTTTACTCAGTCTTACTACTGTTTTTGGTTGCCAGAAAATATTAGATAAGTGTGGGATTTTATAACCATATGATATGACTATGCCAAGAATGTTTGATTGGATTCAAATCTCTTGTAACTGTAAAGGGTAGTAAAAACATTTTGAAGTAAACCCATTTGCCCATGAGTTGATTTTATAATCTATATGGGTGCTAAGCCCAATTGTAGTCTTGTGAATGAGAAAAGACTGCCTAGTTCTTTTGTTTCTCTTAAATATTGGTAATTATTATAAGTTTTCAACTAGTGGAGAATCTGGTAACTTGTTGGTGAACTCGTTGGTAATGAGTTTAATGACAAACGAGATAAAAGAGGCTGAAAGGATCTAAAGTTACTTTATTTTCCCTTGAAAAGTTAAAAGAGACTTGATACTCTGAAGTGAGGCGCTCTGGAACTCTGTTACAAAATTTTCAATAATTCTGGATACTACTGATAACATTGGAACTCTGAGCCAAACAGTTATTAATTGTTTTGGTGTAAAATTGTCTTGAAAACATATGATCGTTTCAGAAAAGCATTTATGCACCTTTATGGCCTTTTCAATTCTACCTGTTTGTCTTTTTGGAAAGGAGATCAACTTCTTTATTGATAACAGGAGCAAAGATAAAGAAACCAAAATAAGGATCACGAGGTGCACTTGGACATCTCAACTAGGTTGACACCTCCTTAGCACCTCATCATATCCAAGAACACATCAAACAAGGAATAAGAGTACATAGAGACTTCTAACTAAAACATAGTAATCCTCAAACAAGGCAAAAACAAAGCAATAGCAAAATAAAGCAAAACCTTGACAGTTCTAAAGCTAGTCCAAAAAGAAAACTTGAATGGAGACAATATAAAAACAATAAGTTGGAGATCTTCAGCAACTTCTTCAGCGAGCTTGAGAATCTTGGCCTGCTAAATAAGGGCAGAGGTCTGAAATAAAATTGAAAAACCCGAGTATAACACACTGTAAGAGCTATCAAGGTTGTGAGACGAAGGCCAGCCAATTTAAGCATTAAGTCCTGAATGTGATTTTACCTGAACGTGTTTTCAATTGTACCTGTTTGTGATTTTCTGAATTCTAAAATAGTACTTTTGGTGTCTTTGTGATTATCAGTTTTTAGCCAAAATAGTCTTTAATTACTTTGATACTTAGAAAGAAATCTGCATATAATTTGGCTTGTGTGCTTGAGAGCTTATGATAATTTCAAAGAAGTCCACTGCTTAGGAACAATGGTAAATTAGGTCTCAGCTTTTGCAGCACTTTTATATCCTTTTGAATTGACTAAACCCGTTTTGATTATATATATATATATTTCAAAATGCTACTTTCAATGTTCTTAGTATGTATCAGTGGCCAGGCTAATGCTATTCTGTAAGCCTTTTCTGTTAGAATGTTTGCACAATCCATTATCTTGGGGACAGAAATTTTATGCATATTCTTTCTTAGATGCACATCAATCCATCTGCAGCTGAGGCAACTATTCTATCACTTTGCCAGTCGCCTCATCCATATCAAACATGTCAGTTCATTCTTGGTAAGTTGATTTTGCTGAAGAAATTTTCAATGGAATAAATTTGAAGGTCTTCTAGTCCTACGAACTACATAATTTTTATGCTAAATTTTACAAATCAAATATGGTCTATAGGCCTGCAAAAACACAAGTTTTGAGAAATTGATTCCTCTACACGATTCAAGAGGCACAGCTTCCTGAACTCAAACTTGTACAAATCTAGGCTTTCCAAACCCCTAGCCAATTGACCTCTGATAGTAAGATGTAATTTTCCTTTCCACCAAGAAAATTACATCTTACCAGCTGGCTGTTAGACGTCTCTTTAGCTAATTATTATGCTTTGTACTATTTTGTTTAAGCTAGTTTCTTGTTGCTTAGTATTTTGTTTAGCTAATTTTAAGGGTTGTTTTTGAAAATTGTTTCTAAAAATAAGTATACCAAACATGTTTTTATTGTTTCCCTTGTATTTTTTGTTTTTGAAAACATAAAACTAAAATGAATCATGACCCAAACGGTGCCTAAAGATTCATGAATCTTTTGCTTTCCTATTATGGTGCAAAAGATGATCTCTCAGGTTTAGTGCTGATCTTGGCTTTTGATGTCTTATCCAGAAAATTCTCAGGTAGCTAATGCACGATTTCAAGCTGCTGCTGCAATTCGAGATGCTGCTATTAGAGAGTGGAGTTTTCTTACTGCTGATGTCAAGAGAAATTTAATTAGGTCATTTTTACTTCTATGAAATACTGTACTTTTTGGTTTCTTGTTTCAGTGAAGTATGTTTTTAAAACTGCTAGGCGCACTGGACGGACAAAAGGAATTGCCAATTTACTTGTGCTATTTTGGATATGCCTTGAGGCACTTGGTGGTAGATATATGCAAAACATTCGGGGGATATATGTCTAAAATGGGATGCTTTAATTTCTTCTGTGTAATCTTTTTGTAACTTGTTGGGATATGATGAGGATGTTATGGTTGTGTCTGCCTAATTGAGATAGTTTGGTGCATCTGCTGATCCCCATCTTTTTGTTTCCATGGATTATTATTTCTTATTGCATTTTGAGCAATAGTCTCCTTTCATCTTATCAATAAAATGTCTCGTTACCGTTTCAAGAAAAAATTTAAGAGGTGTGGAATATTGTTTTTAAACAAAAACTACTCTCTTCATTGAATTAATGAAATGAGACTAATGCTCAAAGTACAAAGGAAATACAAAGAGCAAAAGAAATAAAAGCATAGTGGATCAGGAGGTGCAGTCGGGCATCTCAACTAGGTCGACACCCCCTTAGCACCCTCATCATCTCCAAATAAGAAACCCAATCCTTATAGACTTCCGGATTAAGTACAATACAAGAGGTTAACATCTAGACCGAAAACAAATTTACAGTAATACAACGTAAAGACCTGTAGACAGAACAACCAAATGTAAAAACCTGTAGACAGAACAACCAAAAAACTAATACAAATACACTATTACATAGATTGGAAGAAGCAAAAGTTAACGAGCTAGCTGAAGAAGAGAGTTCCAATTTAGACTGATTTCAAGCACCGAGTAGGCTTCGAAATGCTTCGATGGAGGATAACATGAAGAAGCATTGATTTTTGCAATCTCAAACCTATCCTCCCAAGAGGTTGTTTTTTCCTGGAACACTCTTTGATTCCTCTCAAACCACAATTCAAAAAGCAGAGCCTTGACAACATTATTCAAGAGAATTTTTGGCCCCGAATACAGCGAAGGTCGCATCAGAAGCTGCAAAATATTTTCCTGGAATAATTTGCCAAAAACTCGATTTAGCCCAAAGACTTTGAATAACTTCTGCCAACACTTTACAGCATACGAGCAGTTGAGCACTCAATGAATAGATGCTAGAGCGTTTCACTTGCTGCCTTACAAAGGGGACAAATTGAGGGAGACAAACTGTGGGATGGGAGCTTTCGTTGAAGAACTTCTGAGCAGTTTAAAGAGCCAAAGTGCATTATCCATACTACTATGTTGCCTCTTCGAGGGCTCTTAGATTTCCAAAGTGCCTTCTTCGAACTTTTTTCTAGTGAACCCAAAGGTGATTAACAGCCGATTTTACTGTGTATGATCTCCCACTGTCCAGCGACCAAGTTCTGTTATATGGACTTGCCTCCACCCTCCTGCTTGATAATAAACCAAGAAGGGCCTGAAATTCTGTGATTTCATCCTCCTTTAAGAGCCTTCTAAAGAAAATTGCCCATGATGAAGTGGAAAACACCCAGTCTTCAGCTACTGTTCCTTGGGGATTGATTGTGAATTATGATCTTGAAGAGTTTGGGAAACATCTCTTTTATAGGCAGCTTATCTAACAATGATGCATCCAGAAACCAATTCTACTCCCGTTACCCAACTTGAAGAGTGCTAGGGCACTGTATTCAGCCGCTTCTTGAAGCTTATCTAGCAGAGTACTGATTTTTTCCTGTATTTTTCACCTTGTCTGTGTAGCTGGATTCTTGAAGCTTGTAGGGAAACTCATTTTGTTTCTACTTCTGTTGTCTGATGAGATTTGTTGACGGAAGAATGGACATTTACCAGACCCTGTATTCTTGATTCACCTGAAAACTTTTTAGCATTTTGGTGTACCCAAGAGTGAGAAAGAGAGTTAATTGTAATAGAATAGAAATGTTAGTTAAGAAAGTTAGATAGAAGGGTAGTTTGGATCTTGTACTCATATTTTCCTATAAATACAACATTTCTCCCCTCATTTGAGAGGATAATCATTTTGAGGAAAAATTTGACTTTTTGGTTTTTTTTTGAAACGGAAACAAGCCTAGTTTACACCACATTTTTAGAAACGAATGCCAACCTTGCTTAGAGTCCTCCGAATACACATGAATGTACGATCTACCTCCTGTGCCTGGCCAAATGACACATCTTAGAACCCAACCTGATGTTGCAGGCAATTTCAGCAGTCTTGTAGCTCCGGTCTCATCCCTTCCATCCTTTAGGAAGAAGCTCCTTTTTGGTTCTTGTTCTAGATCTGAAATAGCTTCAATAGACAAACTCAACTGAGACTTTGATGCTTTCAAAATTTCGATGCTTTCATCTGTTGCCAAAGCTTTAAAACCTTGGAGTTTCAAGTTTTGCCTTTGAAGTTTTTTCGATTGGAAGGTTCTTTTGTCTCAAGATTTCTAAATCAGTGTGGAAGTCTCAGTCTCTGTTGATTTTTGAAGTTTTGGTCCTTTTTAACTACTTTCCATCGTCCATGCTTCACATGGTTGTTCTCATAGCTTCAGACTTGGTAGTTTCTCAAGAGCCAATTTATTCTGTTATGTGTTGTATTTGATTGTAATTGCTTTACTTTTCTGGCTTTGTCTAGTTCAGGCCTTCTTCTAGTTGTATTTTC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ATGCAAGGTTTTCAGGATGCCAGTGGGCCTCCAAACTTGGCTCAACTTCAGGCCACCATGCAAGCCATTGAACTTGCTTGCAGTTCCATTCAGATGCACATCAATCCATCTGCAGCTGAGGCAACTATTCTATCACTTTGCCAGTCGCCTCATCCATATCAAACATGTCAGTTCATTCTTGAAAATTCTCAGGTAGCTAATGCACGATTTCAAGCTGCTGCTGCAATTCGAGATGCTGCTATTAGAGAGTGGAGTTTTCTTACTGCTGATGTCAAGAGAAATTTAATTAGTTTCTGTCTGTGCTATGTTATGCAACATGCAAGCTCACCAGAGCGCTATGTTCAGGCAAAGGTTTCTGCTGTGGCTGCTCAATTGATGAAGAGGGGCTGGCTTGATTTTGAAGCCTCTGAGAAGGAGTCTTTCTTTTATCAGATAAATCAGTCTATTCATGGTGTTCATGGTGTTGATGTGCAATTTTGTGGAGTTAACTTCCTGGAGTCATTGGTATCGGAATTTTCACCCTCTACGTCAAGTGCTATGGGTCTTCCTAGGGAGTTTCACGAGCAGTGCAGGAGATCATTGGAGTTGAACTACCTGAAGACGTTCTACTGTTGGGCAAAAGATGCTGCTGTAAGTGTCACCAACGTAATAATTGATTCTCAGACTGAGGTTCCTGAAGTCAAAGTTTGTACGGCTGCTTTACGCCTGATGTTTCAAATTTTGAACTGGGATTTTTGTAATACTGGTGCTAAGGCTAGTATAAGCTGGTACTTTGCCGGAGTCAAGGATCATGGTGATACAACCAAGAGAACTGAGTATAGCTTGGTGCAGCCTGGTCCTGCTTGGCATGACGTTTTGATTTCAAGTGGCCATATCTCATGGCTTTTGAATTTATATTCCGCACTTCGACAGAAGTTTTCATGTCAAGCCTTTTGGCTTGACTGCCCTATAGCCGTATCTGCTCGAAAGCTAATTGTACAATTTTGCTCCTTGGCAGGGACAATATTTCATTCTGATAATGGGCAGATGCATGAAAATCATCTATTACAGCTCCTTTGGGGATAA MQGFQDASGPPNLAQLQATMQAIELACSSIQMHINPSAAEATILSLCQSPHPYQTCQFILENSQVANARFQAAAAIRDAAIREWSFLTADVKRNLISFCLCYVMQHASSPERYVQAKVSAVAAQLMKRGWLDFEASEKESFFYQINQSIHGVHGVDVQFCGVNFLESLVSEFSPSTSSAMGLPREFHEQCRRSLELNYLKTFYCWAKDAAVSVTNVIIDSQTEVPEVKVCTAALRLMFQILNWDFCNTGAKASISWYFAGVKDHGDTTKRTEYSLVQPGPAWHDVLISSGHISWLLNLYSALRQKFSCQAFWLDCPIAVSARKLIVQFCSLAGTIFHSDNGQMHENHLLQLLWG Homology
BLAST of PI0002707 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C0E2 (Exportin-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 108.2 bits (269), Expect = 1.9e-22 Identity = 94/341 (27.57%), Postives = 161/341 (47.21%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ESJ0 (Exportin-4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Xpo4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 106.7 bits (265), Expect = 5.5e-22 Identity = 92/340 (27.06%), Postives = 162/340 (47.65%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZMR9 (Exportin-4 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=XPO4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 105.1 bits (261), Expect = 1.6e-21 Identity = 91/341 (26.69%), Postives = 161/341 (47.21%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q499Y0 (Exportin-4 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=xpo4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 102.4 bits (254), Expect = 1.0e-20 Identity = 87/334 (26.05%), Postives = 158/334 (47.31%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q802D3 (Exportin-4 OS=Danio rerio OX=7955 GN=xpo4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 6.8e-20 Identity = 88/337 (26.11%), Postives = 156/337 (46.29%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B9L0 (exportin-4 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487293 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 698.7 bits (1802), Expect = 1.2e-197 Identity = 343/354 (96.89%), Postives = 347/354 (98.02%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LY17 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G680070 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 669.8 bits (1727), Expect = 6.0e-189 Identity = 332/353 (94.05%), Postives = 337/353 (95.47%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F4U8 (exportin-4 isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440841 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 667.2 bits (1720), Expect = 3.9e-188 Identity = 330/355 (92.96%), Postives = 340/355 (95.77%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EZQ7 (exportin-4 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440841 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 667.2 bits (1720), Expect = 3.9e-188 Identity = 330/355 (92.96%), Postives = 340/355 (95.77%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F4P1 (exportin-4 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440841 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 667.2 bits (1720), Expect = 3.9e-188 Identity = 330/355 (92.96%), Postives = 340/355 (95.77%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. NCBI nr
Match: XP_011660266.1 (exportin-4 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 699.9 bits (1805), Expect = 1.1e-197 Identity = 343/354 (96.89%), Postives = 346/354 (97.74%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. NCBI nr
Match: XP_008443788.1 (PREDICTED: exportin-4 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 698.7 bits (1802), Expect = 2.5e-197 Identity = 343/354 (96.89%), Postives = 347/354 (98.02%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. NCBI nr
Match: XP_038877264.1 (exportin-4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 686.0 bits (1769), Expect = 1.7e-193 Identity = 338/355 (95.21%), Postives = 348/355 (98.03%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. NCBI nr
Match: XP_023530569.1 (exportin-4 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 667.2 bits (1720), Expect = 8.1e-188 Identity = 331/355 (93.24%), Postives = 339/355 (95.49%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. NCBI nr
Match: XP_022933418.1 (exportin-4 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 667.2 bits (1720), Expect = 8.1e-188 Identity = 330/355 (92.96%), Postives = 340/355 (95.77%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. TAIR 10
Match: AT3G04490.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT4G38092.1); Has 75 Blast hits to 64 proteins in 20 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 36; Fungi - 0; Plants - 22; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 474.6 bits (1220), Expect = 7.2e-134 Identity = 241/361 (66.76%), Postives = 289/361 (80.06%), Query Frame = 0
BLAST of PI0002707 vs. TAIR 10
Match: AT4G38092.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT3G04490.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 138.7 bits (348), Expect = 9.3e-33 Identity = 73/107 (68.22%), Postives = 87/107 (81.31%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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