PI0000875 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTGGCCGGCGGAAGAATCTTGGGATGCTCCCACATAAGGACCATTGTCGTCCACATCATCACCGGACGGTGGCTCGTGTTGTTCTTTTCACTCCTACTCATGGCGGTGGCAGGTGCAACATACATGTTTAGCTTGTATTCAAACGACATAAAATTGATTTGGGTTACGATCAATCAACATTGAATTTGTTGAGTTTTTATAAGGATTTGGGTGCAAACGTTGGTATTTTGTCCGGACTTATTAACGAGGTTACACCGGCATGGGTGGTTTTGTCTATTGGTGCCGTTATGAATTTCTTTGGTTACTTTATGATTTGGCTCACCATTACTCGTCGAACCTCCGCTCCCAAAGTTTGGCAAATGTGTCTTTATATTTGTATAGGAGCCAATTCTCAATCCTTTGCTAATACAGGTTCCATGGTTACTTGTGTCAAGAACTTTCCCGAAAGTCGTGGTGCGGTTCTTGGTAAGTATTTTAATTGACTATTTTTTAAAAGTAGAAAATCACTCCTGCTAATTAAACGTTAAAACTTTTAGGTATTTTAAAGGGATATATTGGGCTGAGCGGCGCCATAATCACACAACTCTTCCACGCATTTTATGGCGCCGATACCAAATCCTTAATTCTCTTCATCGGATGGCTCCCGACGGCAATTTCCTTTGCATCTTTACCAATAATTCGTATCATGAAAGTCATCCGACAACCAAACGAGCTCAAAGTCTTCTACAACTTCCTTTACATTTCTCTTTCCCTCGCCGGATTCCTAATGTTATTGATCATTTTAGAGAGTAAAACAGAGTTCACTCAAACCAATACGGTGGCAGCGCCGCCGTCGTCCTCCTCCTTCTCCTCCTCCCACTCCTCATCGTCATCATCGAAGAATACAATCTCTGGAAACTCAAAACCTCTCTCATTAAATCTCCAACTCCCTCTGTTCAAATCGTTACAGAGCAACGCCCAAAAAAGAGCATCCAAGACAAGAACAAAAAGAACCATCTTGTTGGACAACAATTTTCAGCCCACCAGAACGCGGCGAGGATTTCACAATTCTCCAAGCTTTCTTCAGCGTCGATATGCTGATTCTGTTCACGTCTGCGGCTTGCGGCATCGGAGGAACGTTAACGGCAATCGACAATTTGGGACAAATCGGAATGTCTTTGGGATACCCAAAAAAAAAGCATTAGCACATTTGTAACATTAGTTAGCGTTTGGAATTACCTGGGGAGAGTTGCCTGTGGTTTCTTCTCTGAAATGGTTTTGATAAAATACAAATTCCCTCGTACTTTAATATTATCAATGATCCTTCTGTTGTCCTGTGTCGGCCATTTGATGATCGCATTTAATGTCCCAAATGGGCTATATGTTGCTTCCATCGTAATCGGATTCTGCTTTGGAGCACAATGGCCGTTGGTTTTCGCCATAATTTCAGAGCTTTTTGGGTTGAAATATTACGCCACACTTCACGTTTTTGGGGCAGCGGCGAGCCCAGTTGGGCTTTATGTTCTGAATGTGAAAGTGACAGGGAACTTCTACGACAGGGAAGCAGAGAAGCAGCTCAACACGAAAGGGATTTTACGAAAAGCAGGGAAGAACTAAAGTGCTATGGAGTGGAATGTTTTAAGCTTTCATTCCTTGTAATCACTGCAGTTACTTTGTTGGGTATGTTTATTTCATTGATTTTAGTGATTAGAACAAGAAGTTTTTACAAGAGTGATATTTATAAAAAGTTTAGAGATGAAGCCGAAACAGAGGTGGCCGGAAATGAGGCTGTGGCGACGGCCGGAGCAGCAGAGGAGACAGAGAAAATTATAAGACAAAGAAGAAGTTGAAAAGTGGAGTAAAATCCAAAAAGTTTGTAGCAAAGAGATGAGAAAGGCAGATTTGATAGACTCTTTTTTCATGATATCTGTTCTTTGTTTGAAGGTACAATGTTTTATCATCCTATTGTAAAATTAAGGTTTTAAAGGGTTTATGTTTAAGGAAGTTGCATATTGTCATTCAAGAATTGATCAATCTTATCAATTGTGTGTTTATTTAATTTTTCAATTTTTTTCGACTTACGAGTTAGAGTCGAAACGAGCATAATTTGACTAGCATAATCCTTTTATTATAATTTTAAAGTCGATAAAATTTGATTTTATCATCTAACATATTAATTTTTTAAGGCCCGATAATTTGGAGTATTAGAGTCTAACATCATGCAAATAACCTAGGTCAATTTGACAAGCATTTAAGACATGTTTGATAAACATTTTTATTCTAAAGATAGATTACTATAAAATAAATGATTATCAAATGAGAGGTTGATTTTAGGAGCAATGTGTTTGGTTTTGAAAATAAGTCATTTTTAAAAAAATTTAAAAGCGTGTTTGGAATACATTTTTAAGTGTTTAATTTTTTTTAAAAGAAATAATTTAAGAAAATAGCTATTAAAGTGTAGTTTAAAATGTTGTTATCGAGTTTGAAAGCACTGTAAACGATTTTATCAAACGGGATTAGATAAAAATATTATTTATTTTTTCTTTCTTTCTCTAGTAAATTCAAACTCACTCATAAGGTTTGATTTTTGGGTAATGTTAATTTTATAAACACTATTACTATTTTTTTATTTTTTTTTAACATGATTTCAAGTTTCTTTGTTTTTAAAGTTTTACATCAAATTAGATAAATTCCAAAAACTTAAATAAAATCGTGATCATGAGTCAATTTCTAACGATTAATTCCAAAACACTTGACAATTAACAATCTTATATTCTATTCTTGATCTCTTCAATTTTTCTAGTGAACGTCAATACAAGCATAGTTCAACCAAAAAGTTTGGAATAAAATTTGTACTATACATATGTGAGATTAGAGTCTTACGAGTTTGATTCTCTAACCCTTCGTATACTTAAAAATATAATGGATAAGAGTATTGAATCAACTTCTAATACTTCTTATATTCTAAAAATAATGGTCCAAAAATGCTTTTAAAAATTCTTGCTTTTTAATAAGTATATGCGTTGGAATAATAAAATCTTTCTATAAACTCGAGGTTGATATTATTTACGAGCTTTATCTCAATTAATTAGATTTATTTTGACATACTTTTTGAAATATAATAAAATTGTTAATTAGTTCGAACATTTATCTCATTTGTCACATCAACTAACTAAAACTTTACGCATTTAAATCTCAATCAACTCAATAAAACTAAGATAGTTATCTCAAAGTTAACCCACACTAAAAAAAAGGGCAAACAATGACATAATTTAATTAAAATTGATAATCTTCCCTTTAGATGTCACAAGTCAACTATAGAATTTGTCAAAACAAGTATAACTCAACTGACGTACGAGTATATTAAATAGTCACTAGGAGTTCATAAGTTGAATCCACTCCCTCGTTAACTATAGAATCTATGCTTGATTTGAAAAAATCTCTATATATTCTCCATCCATTCGACATTCACAACCATCCAATTTTCATTTGGAACAATAATCCAACTCTAAGAAAATGGCGGTCAGCCAAGGAATATTGAGATGTGTTGACATAAAAAGCATAGTCGTCCATGTCATCATCGGACGGTGGTTCATGGTGTTTGCTTCACTCCTAATCATGTCGATGTCTGGAGCAACGTACATGTTCGGCCTGTTTTCGAGCGACATTAAATCAATTTTGGGTTACGACCAAACGACGTTGAATTTGTTAAGTTTTTTTAAGGATTTGGGTGCAAACGTCGGTATTTTATCCGGTCTTATTAACGAGGTTACGCCACCATGGGTGGTTCTATTAATTGGTGCCGTTATGAATTTCTTTGGTTACTTTATGATTTGGCTCGATGTTACTAATCGGATCTCCGCACCAAAAGTTTGGCAAATGTGTCTCTATATTTGTATTGGAGCAAGTTCTCAAGTCTTTGCTAATACAGGTTCTATGATTACCTGTGTCAATAACTTTCTTGAGAGGCGTGAATTTGTTCTCGGTAAGTCTTTATTAAAATTTAGTCCCTAGAATTTCATGAAATTAATTATTATATACCATTATATATTTTAGTTATTCCATAAGGATTATATTTTATTACTTAGAAAATAATAATATTAATAATAATAGAATCACTGCTAATTCAAACGTAAAAAACAAATTTAGGTATTTTAAAGGGACACGTCGGGCTAAGCGGCGCCATAATCACACAGCTCTTCCACGCATTTTACGGCGGCGACACCAAATCCTTAATTCTCCTCATCGGATGGCTTCCGGCCGCAATTTCCTTCGCATTTTTACGAACAATCCGTATCATGAAAGTCATCCGACACCCAAATGAGCTCAAAGTTTTCTACAATTTCCTATACATTTCTCTTGTCCTCGCCGGATTCCTGATGCTAATGATCATTGTACAAAGCAAAACAGAGTTCACTCATAACCAATATGGTGGCAGCGCCGCCGCCGCCGTCGTCCTTCTCTTTCTCCCACTCGCCGTCGTCATTATCGAAGAATACAATCTCTGGAAACTTAAAACCAAATCACCAAATCCCTCTGCTCAAATCATAACAGAGCAACTCCCAAAACTGACCATCCAAAACAAAAAGAACCATCTTGTTGGACAACAATTTTCAACCCACCACAACGAGGCGAGGATTTCACAAATTCTCCAAGCTCTCTTCAGTGTCGACATGCTGATTTTGTTCATATCTATAATTTGTGGCGCTGGTGGAACATTAACGGCGATCGACAATTTGGGTCAAATCGGAATGTCTTTGGGATACCCAAAAAAAAAAGCATTAGCACATTTGTAACATTAGTCAGTATTTGGAATTACCTCGGTCGAGTTGTCTCTGGTTTCGTCTCTGAAATCGTTTTGATAAATACAAATTCCCTCGTCCTTTAATACTTTCTCTGACCCTTCTTTTATCCTGTTTCGGCCACTTGATGATCGCATTTGATGTCCCAAATGGATTATATGTTGCTTCCATCGTAATTGGATTCTGTTATGGAGCAGAATGGCCAGTGAT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MLAGGRILGCSHIRTIVVHIITGRWLVLFFSLLLMAVAGATYMFSLYSNDIKLIWDLGANVGILSGLINEVTPAWVVLSIGAVMNFFGYFMIWLTITRRTSAPKVWQMCLYICIGANSQSFANTGSMVTCVKNFPESRGAVLGILKGYIGLSGAIITQLFHAFYGADTKSLILFIGWLPTAISFASLPIIRIMKVIRQPNELKVFYNFLYISLSLAGFLMLLIILESKTEFTQTNTVAAPPSSSSFSSSHSSSSSSKNTISGNSKPLSLNLQLPLQEQKEPSCWTTIFSPPERGEDFTILQAFFSVDMLILFTSAACGIGGTLTAIDNLGQIGITFVTLVSVWNYLGRVACGFFSEMVLIKYKFPLMAGFLSEHLLIKYKFPRPLMLTIVLLLSCIAHLLIAFNPSGGLYIASVLTGFCYGAQWPLLFAIVSEIFGLKYYATLYNFGSVASPVGLYVLNVNVAGYLYDKEAKKQLAMTGRIRKTGEELICNGTVCFKLSFVIITAVSLFGALVSLVLVLRTKKFYKSDIYKKFREAEEAAAVEEEEDDGRVVRNGGGLMEETKQGLKQ Homology
BLAST of PI0000875 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4I9E1 (Protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NFD4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 74.7 bits (182), Expect = 3.7e-12 Identity = 119/550 (21.64%), Postives = 220/550 (40.00%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GZI8 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458291 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 704.9 bits (1818), Expect = 2.7e-199 Identity = 392/612 (64.05%), Postives = 455/612 (74.35%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CFW3 (Protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold475G002400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 704.5 bits (1817), Expect = 3.6e-199 Identity = 391/604 (64.74%), Postives = 447/604 (74.01%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BG09 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489435 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 704.5 bits (1817), Expect = 3.6e-199 Identity = 391/604 (64.74%), Postives = 447/604 (74.01%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FZF2 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449326 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 704.1 bits (1816), Expect = 4.6e-199 Identity = 390/610 (63.93%), Postives = 444/610 (72.79%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K186 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489721 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 702.2 bits (1811), Expect = 1.8e-198 Identity = 381/578 (65.92%), Postives = 444/578 (76.82%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. NCBI nr
Match: XP_004142500.2 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like [Cucumis sativus] >KAE8648848.1 hypothetical protein Csa_009434 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 716.8 bits (1849), Expect = 1.4e-202 Identity = 396/603 (65.67%), Postives = 448/603 (74.30%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. NCBI nr
Match: XP_038893353.1 (LOW QUALITY PROTEIN: protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 706.8 bits (1823), Expect = 1.5e-199 Identity = 388/607 (63.92%), Postives = 451/607 (74.30%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. NCBI nr
Match: XP_011655862.2 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4 [Cucumis sativus] >KAE8648847.1 hypothetical protein Csa_008229 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 706.8 bits (1823), Expect = 1.5e-199 Identity = 389/604 (64.40%), Postives = 451/604 (74.67%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. NCBI nr
Match: XP_022956604.1 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 704.9 bits (1818), Expect = 5.6e-199 Identity = 392/612 (64.05%), Postives = 455/612 (74.35%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. NCBI nr
Match: KAG6573851.1 (Protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 704.5 bits (1817), Expect = 7.3e-199 Identity = 390/601 (64.89%), Postives = 444/601 (73.88%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. TAIR 10
Match: AT2G39210.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 633.3 bits (1632), Expect = 1.9e-181 Identity = 354/609 (58.13%), Postives = 421/609 (69.13%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. TAIR 10
Match: AT2G28120.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 548.9 bits (1413), Expect = 4.8e-156 Identity = 308/568 (54.23%), Postives = 385/568 (67.78%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. TAIR 10
Match: AT1G74780.1 (Nodulin-like / Major Facilitator Superfamily protein ) HSP 1 Score: 258.8 bits (660), Expect = 9.9e-69 Identity = 185/585 (31.62%), Postives = 289/585 (49.40%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. TAIR 10
Match: AT5G14120.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 257.3 bits (656), Expect = 2.9e-68 Identity = 183/598 (30.60%), Postives = 295/598 (49.33%), Query Frame = 0
BLAST of PI0000875 vs. TAIR 10
Match: AT5G50630.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 255.8 bits (652), Expect = 8.4e-68 Identity = 181/550 (32.91%), Postives = 292/550 (53.09%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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