Moc11g17420 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc11g17420
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr11: 13379450 .. 13384622 (+)
RNA-Seq ExpressionMoc11g17420
SyntenyMoc11g17420
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGCGTTTCCATATGGCAAGTGCTCTGATGCTCCTTGGGTGGTGGAAAGAATGGATGAAGGTATGAAGCCATTCATTGTTTCTGATTTAAATTCGAAATATGATAATTCTGATCAATATCGTTTCTATCATTCCAAATCTACCAACAGACAATAGCAACCATTTCAAGCTTTTATGTATTCAGACAAGATAGAATAGGAACTTCTCCAAGTGATTAGAGAAGGATATAAGCGAATCAGAGGGTATAGGAGCTGCAGGGAGGGTCCTTTGTCAGATGGAGCCAGCTCGTTTACAGATGAAAAGAGAATGGAGAGCAGTCTCAGTCTTTGTTGAACAGTAGGGGCAAAGAGGTACTACGTCCAAACCTCTTTTATATAAAGTGTGCATAGTAGGTAGAAAATCATGAATTGCCTTCCATAAGAAAATTTTGATCTTAGAAAGGATGTTTAGTTGTCAAATAGATTTCCGTGGATGCTCATTTGCGTTAGAACTTCGAGGCTGTGTAGGGAGATGCAGGTTCATGAAGAGCTTGTAGGTACTTTTAACACTAAAGATGTCTCTCTTATCATTGAGCCCCACAACCAACCATCTGCAACATTGAAAGAATTTAAAGGAATTTTGAGAACCAAATTGACATCTTTTTTTTACAAAGATTTAGGTCTAATATGTCCATAAATACCACAAAAATGACATATAGAACTTGTTGATGTAGAAATTTGGCCTCTTAGAATTCCGCTAAATTCGCACCAATCTTCTAGAATAAAAGGGATCGACGAGACTTGCAAAACATAATAACACTAAAGACTGGTGTGGCTATTACCATACAAGCTTCCATGCTTAAGTCAGAATTGAAGTAGTTGAGTATGGAGAGTAGGGTATTTTGGCGTATCTTTAGGGCTTGGTTCACCCTCCTATTTATAGAAGTCGAATCCTAATGCCTTTAGGAATTATAGAAGTCGAATCTCAATCCTTTTAGGATTTACCTAAGTCGAATCGTGGTGTGCTTAGTGGATATGTGAACGGACGTTAATCCCGCCACAAAAACGAAAATCTTGTTATTGAATTTTGAGGAACAAAACACACATAGGAAAAAGAAAAATACAGAGGAAAAGAAATTACATTTGAAGACTTTCTTCAATAAATCACAAACGAACACTACCACTGATCTTCCCGCTATTCTCCACAAGCAATTGAAAGGGAATTGAGAGACAATTTTTAGAGAGAATTCTTCTTTGTATCAGGAACAACTACACAACCATTATGCAGTTAAGGAAGAAAATGACGTGGGGAGCTATTAATCTAATTAATTAATTAAATTAATCAAATTAATTAACATTTAACTAATTTAATTAATGATTAATCTAATTAATAATCAATTGTGTAAATGATTAATCTAATTAATAATTAATAAATTTGATTAATAATTATTAATTTAATTAATAATTATTAATCTAATTATAATACTATAAATAAATAATTAAAAATTAATTATTAATCTTTAATTTAAATATCACATATTTAATTAAAACCATATATTTGAATCATATTCAAAGAGAACTCTCTTGTATAACTTATAGTTTTAATATGAATTCAATTCGTATTAATTTTTATTTGGATTTCATTCAAATAATTTATCTCATAATATATAGTTTCAATTTAGAATTAACTATATATTATAATGTATTAGTATACCTATAATCCCTTGAGCAATTTGAACATCTCAAAATTTTCCAAAAAATTTTATCCTTGTTTTACCCGTTGTGAGCTAGCAAGGGGATCTAATGGACCTATAGATTAGAAGCTCCAACGATACGAGATCAATCGGTCAAACTCATTAGTTTAGTTAATCAACATTCATTAACTACAGATCACTACATTAATGACCTGCAGTTGCACACTTCTCACTATAGAATATTTTCGTGTCCATGGATATACGACCATTAATGGCAAGTCAATCCTTCACAAATGCTCGTAACTCTAGCTAGGTCAAATTACCGTTTTACACTCGAGTTACATCTTACTCCTTAAATATCAACGTTCATCTAATGAACAACTCGGATATGGTCCGACCAACAATCGGAAGTCGTTCTCGGACCAGTGAGAGGGTGGGGCCCCTTGTTCAAGTCTCGAAGACAGCATTTAAGAGAACACTTATCTACTCCCCTAAAGTCGGGGAGAAGTGAATTCCATCTTGTGAAGTTATGTTCCCAGCTCCCCACTCGGTCTCGTCCCCAAAATGGTAAGAATGTTGAGTCGGCGACTCTGGCCACTCTCACCCATACATATCAAAGGACGAGCCCTCACGATCAGGAATCCATAACTCACTCAGGATTGAGAACACCTCGGCACCGAGACCTGGTCGGCCGTAATCAGCCCGGGTCGCTAGTTCTAACGTTCTTACTTGGCGTCGTGAGCCCGCTCATCTCTGCGCCCAACTTCCCTCTTCCGTTGTTTGGTCCGTTCTTCTTTTATCTTCCCATAACAATAGCTCCACTCTCAAAATAGAAGGCAACTAGCATGTTAAAGCTTTTCTTTTTGTCGCTATCGGTTGTCGCCTTGATAGGCTGGCTTTCCTAGCCCCCATTCTCTTTCGTTGTAGTTGACTACAATCAAGTCTCTTGGACACTGCTATATGGTTAGTTTTAACTGTTAAATTTTGGCCTTTGGGATCCAACCTTTAGCTGAGTCAGTTCTAACCTATTTGGCTTTTGCCCATGATTCTATACCCAAGATTTACTCTTGGGTTTCTAACCTATTTGGATTTCGCTAATGGTGTTTATACCTTGAGTTTAGTTGGCCTTGGGTTTCTAACTTATTTCGCTTCTGCTTGTTTTTTGCCCTGAGTTCAATAACACCCTTGGGTTTCTAACCTAATTTGGCTTTTGGCAAGTGATTTTATACCTTGGGTTTTGTTGATTGGTTTTGGTTTGCCAGGTTTCTATTTTGACCTTGTTGGACATGTCTTTTTCAACACATTTGAGATTCTCTTTCCTAGTTTCACTGACTGGCTTCTAGCTTATCAGCCTGATTCTAGGTCTCTTCTGATTCGAGTTCCTTGACCAGTATTGACTAACTTACCCATGCCCCCCACTCGAAGAAATTTGATTTAGAATAAGAGATAAATGCTCAAGTAATAAGGAATTAATTAAAGCTCAGATGGTATAACAGATAACCCGAAGTAAGTAAGTATTCTTGGAAACATAAAATCAGACGTAATTTGAAACGAAGCAAATGATAATCTAACTCATGCTGCCTCACATGTAAAAAATTAGCATTAAACTTATTCAATTATCAACCAGAAGAAGAAAAACAAAGAAACAAAGAGAAATTAGATATTGTCCTGCAATGCGCATTTTTCAGGTTGTCTTGCGATACTTGTTGCTCTCCGAGACTATCGTTGAGGTATATTTCTTCAGAGGGTCTCATTGATCTGATTAATCTTGAGTTCTATCGAGACCCCGTTTAAAATGGAGTAGCTCTTCTACGCTTATATATTCTTGGACTCGATTCAATGCCCTGAGAAAGCTGCTGGGGCCCTTTTTTCCAAATGAGAATAATAGCCCTTTGTTTCTTATGCCAGATATGAAAGCGAGTAACGATATTCCATCGGTAAGATCTTTGACTAGTAATTTTTTCTCATTGAAGCGAGCCACATATTATTTGAGGCTCTTCGTTCATTATTCCTTTATGGTAAGGAGGTAGGTCACATGTCAACTTCTATTCGCCATCCAATGAATTGCATAACAAATGTGTCGGCTAGTTCTTTGAAGGAGAAGATTGATTTTCTTTTTAATTGTCGAAATCAGATGCGGGCCATGCTGGTTAACGTGAAAGAAAATATTCTGCACCTAATTGTCTCTATCATCGTGTAGAGGTTCAACTATCTATATGCATATAGATGGTCAATAGGATCTGTTGAGTCATCGTACTGCATTATAGTAGGGAGTTTGAACTTTAGAGGGATTTTTTCTCTCATTATCTCTTCCATGAACGAAGAATCTGCCTGATCTATGGTCTCCTCAAGGTCGTATTCTCCGTCTTTTCGTTTTCTACTACGTTTCTACGATTTCTCTACATGCTTATGTCAATTAAGTGATTCTTCTTTGTCGCGCATGGTATTCCTGAGGTCTGGTTAGGCTTCTTGTCTACCTCTACTGTTATGCGTTGTTAACCTTTGCGGTCGTGCGATTACCGGACTCTATTAGCTAACAACGTCGTTCTGCGGTTTGTTGTTGCTTCCCATTCTTAGTTTACTTTATGCCAGTGAGTTGAATCTTTAACATCTTCAAATGCAGGAGTTTTGCCCTTCTAGGGATCCCGATCGAGTGTAGGTGGGCTCTTTTCCTGTTGCTCAAGTTTTTTGAGAAGGAGAGATACGCTCTGATGCATTCTCGTAACATTCTATTCTAGAACAACTAATATGCTCTTTGGTTGTTATGGAATCTCAGTTAATCGCTCTCTCTGTCCTGGAATTTGCCAATTTATTTCACCTAGGAACTGCTCCGGAACTTGTTGACCTACTTCATCTTCAGCTACCTCAAGTAGGGGCAACCCTCGAGTCCCATGGAATTCGTCGTCAGAAAGTTGTGGTATGACTCCAGAATCCATGTCGATTTATTTCTCCCGAGATCTCCTCAGATCAGAGCAGTTCTCGATCAATTCATCGTCAATCGTCTAGGCTTTTAGATCTTAGTCATCCTCACAGACGGCACCAATCGTTGATGCAGAAATTTGGCTTCTTGGAATTCCGTCAAATTTGCATCAATCTTCTAGAATAAAAGGAATCGACGAGACCTGCAAAACAGAATAACACTAAAGACCTGTATGGCTCTTGCCACACAGGCTTTGATGCTTAAGTCAGAATTGGAGTTGTCGAGTATGGACAATGGAGTATTTTGTCGTATCTTTAGGATTTGGTTCACCCTCTTATTTATAGAAGTCGAATCATAATCCCTTTAGGAATTATAGAAGTCGAATCCTAGTGTGCTTAGGAGATCTGGA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mRNA sequence

ATGCGTTTCCATATGGCAAGTGCTCTGATGCTCCTTGGGTGGTGGAAAGAATGGATGAAGCTCCCCACTCGGTCTCGTCCCCAAAATGGTAAGAATGTTGAGTCGGCGACTCTGGCCACTCTCACCCATACATATCAAAGGACGAGCCCTCACGATCAGGAATCCATAACTCACTCAGGATTGAGAACACCTCGGCACCGAGACCTGGTCGGCCGTAATCAGCCCGGGTCGCTAGTTCTAACGTTCTTACTTGGCGTCGTGAGCCCGCTCATCTCTGCGCCCAACTTCCCTCTTCCGTTGTTTGGTTTCTATTTTGACCTTGTTGGACATGTCTTTTTCAACACATTTGAGATTCTCTTTCCTAGTTTCACTGACTGGCTTCTAGCTTATCAGCCTGATTCTAGGAGTTTTGCCCTTCTAGGGATCCCGATCGAGTGTAGGTGGGCTCTTTTCCTGTTGCTCAAGTTTTTTGAGAAGGAGAGATACGCTCTGATGCATTCTCGAACTGCTCCGGAACTTGTTGACCTACTTCATCTTCAGCTACCTCAAGTAGGGGCAACCCTCGAGTCCCATGGAATTCGTCGTCAGAAAGTTGTGGCTTTGATGCTTAAGTCAGAATTGGAGTTGTCGAGTATGGACAATGGAGGTAAACCCGGATCGGGCTGCACAAGGGTCGAGGAGAACCACTGGTGTTCCCGCCCGGTTGGCCAAGAACACCTCGACGTCGATAAGGTCTCGGCACCGAGACCTGGTCAGTCGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCGTTTCCATATGGCAAGTGCTCTGATGCTCCTTGGGTGGTGGAAAGAATGGATGAAGCTCCCCACTCGGTCTCGTCCCCAAAATGGTAAGAATGTTGAGTCGGCGACTCTGGCCACTCTCACCCATACATATCAAAGGACGAGCCCTCACGATCAGGAATCCATAACTCACTCAGGATTGAGAACACCTCGGCACCGAGACCTGGTCGGCCGTAATCAGCCCGGGTCGCTAGTTCTAACGTTCTTACTTGGCGTCGTGAGCCCGCTCATCTCTGCGCCCAACTTCCCTCTTCCGTTGTTTGGTTTCTATTTTGACCTTGTTGGACATGTCTTTTTCAACACATTTGAGATTCTCTTTCCTAGTTTCACTGACTGGCTTCTAGCTTATCAGCCTGATTCTAGGAGTTTTGCCCTTCTAGGGATCCCGATCGAGTGTAGGTGGGCTCTTTTCCTGTTGCTCAAGTTTTTTGAGAAGGAGAGATACGCTCTGATGCATTCTCGAACTGCTCCGGAACTTGTTGACCTACTTCATCTTCAGCTACCTCAAGTAGGGGCAACCCTCGAGTCCCATGGAATTCGTCGTCAGAAAGTTGTGGCTTTGATGCTTAAGTCAGAATTGGAGTTGTCGAGTATGGACAATGGAGGTAAACCCGGATCGGGCTGCACAAGGGTCGAGGAGAACCACTGGTGTTCCCGCCCGGTTGGCCAAGAACACCTCGACGTCGATAAGGTCTCGGCACCGAGACCTGGTCAGTCGTAG

Protein sequence

MRFHMASALMLLGWWKEWMKLPTRSRPQNGKNVESATLATLTHTYQRTSPHDQESITHSGLRTPRHRDLVGRNQPGSLVLTFLLGVVSPLISAPNFPLPLFGFYFDLVGHVFFNTFEILFPSFTDWLLAYQPDSRSFALLGIPIECRWALFLLLKFFEKERYALMHSRTAPELVDLLHLQLPQVGATLESHGIRRQKVVALMLKSELELSSMDNGGKPGSGCTRVEENHWCSRPVGQEHLDVDKVSAPRPGQS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 234..253
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 47..69

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc11g17420.1Moc11g17420.1mRNA