
Moc11g07990 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACGAGTCTTCGCTGCAAGTTATCTTCGACGTCGGCACTAAATTGAGCAAACACAATCGCTCAACCAAGGATTACATCGTCAAATCCCTTCGGGTAATTTTTCTGCCTTGAATTTTCTTTGCATTTCCGTTTCCGAATTTCTCTTCAAGAAGTTTGACTACACTGTCGTTGGGAGTGTTCTCATTTGCTCTCTGTAGACCGAGTAAGACGTCGACTATAGTTTTCGTTCATATATATTCGCTTCTAATATTAAGTTGATACATGATGAAATCGTTGACGAAGATCGAATGGGTTTTCACGGGGTTTAGTTTAAATTTCCCGGCGATAAGTTTTCAGCGTAGTATTTGTTAATTATCTCCAATTAAGAATGTGAGGAGGCAGCTTCTGTTCATACTCTAATGACGAATGTGTCTAGTAGTTAGTTGCAGTCGATTTGCACTTTGGACTCGGACATTCCAGCACGTGTGAGACTTGTAAAACATCACTTTATTTTATTTTATCTCATCTCTATCGCTCAACCTCTCTCTGCATCCACAACTAATAATCTCAATATCAAACACTTGAAAGTGTTCACCTCCAATTTATCATCTACACGTATGGTTAAGTTTGAAAATATTTGCATCGTTAATGATTTTGATCATAAAGCCTTCTGGGGAACATATGTTACTCTAATAACTCTGAAGCTGAGGCACTTAACATGTTCCATAGAGCGTTTTAAAAAATCACACAAAAAATTTGTTAGTTCCTCTGTTGTATTTAATATTTCATACATATATCTATTTTGTTAATTCATTAGAATGAAAATAATTCACCAGTTTCCGTTTGGTCTTATTGATAAAACTCCGAGTCTCCTTTTTTGTTTCTACGGTTTTTTTATTGCCTGTAAATGGTCATTTTATTAAACAGTTGTTTTTTGCGTTGCTTGGTCTTTCATTTTTTCATTGCAGCAAGTCATAGATGCTTTTGCATGCTTGGAACAGTCTTACACTCCAGATGCTACAGGGAAGTCAGAACCGGCTAAAATATTAGAGAGTTCTACAAAGCCTCTAAGGAAATCTATAATTAATGGTCTTCTACGGAATAGAGATAAAGATGTGAGACTTCTATTAGCTATATGTGTTGGTGAACTTTTTCGAGTCATGGCCCCAGAACCACCTTTTGAAGACAAGTATCTAAGGGTAACGAATTACTTCTTGATGAAATGTATATTCATTATATAGCGACAATTGTATAAAAATTCATCTTTATGTTTACTATGATATTTATCCCATCTCTTTATTTCTTTAGGACGTTTTTAAACTTCTTTTGAGCCCTTTTTACGAGCTAGCAGATACAACCAGTCCACTTTTCACTCACAGGGTCAAAATACTAGAGACAGTGGCCCGATGTAAATGTTGTGTGATAATGCTTGACATTGGATGCAACGACTTGGTGTTGGAGATGTTTAATACATTTTTCTCTATTTTGAGGTCAATACTCTTATCTTGAACTTCTCCATCTTTGTACTTGTACTCTATTGTTTAATAAATTTTACAAATTTCCTGTTATGCCAATTTGTTAAACTACTCCTTTTTGTAAATTAAGTTTTAAATCTAAGGGAGGACAACCCTCCAAGTGGTTCGTCTTTTTACAACCTGAGGCATTAAATTTCCCAAATATTATCCTTAATACTTACAATTTTAATACGTCAGTTTTGTTGCGAGTAAAAGTTGGACTGTATATTGGGATATTTATAGTTTTGTAGAGGAAGAACTTAATTTATTCTGCTATCATAAAAAATTCAGAAAGGTTCATTTTACGCTTTGTTGTAAGCCTACACAACATTCCTTTGAGGTAATGGATTCATGTTGGGGAGTGTTCAATATAGTTCCATTTCTAGCCCTCAACTAAAATGTCTATAATATACCTTTTTTCTCGCTCATTCTTTTTATACATGTAAGCTTGAAATGGAGAAAGAAGTATTACTTGACAATATGTATGTTTCAATCGTATGTTAATGTGTTTAGTATAATAATTTCAACCTTTTTGAATTGTTTCATATTTACAATAGCTCTTTCTTTTCCATAGAGACTATCACGAGGATGGTGTGGTAAAAAACATTGTGTCAATAATGACTCATATTCTAAGCGAGGATCCCTCTCTACCGCTTGTAGATGTCGTTTTGCATAATCTTGTAAAGGAGGAAAAGGTCAGAATCATTAATTGATGTTTTTTCCCTACTTTTTGGAGGGATCAGAAATATTATTTATTGAGAAATTTATCAACTAGATAAATTTTTTGGTCATTTTTATTATGCTACCTAGCGATAACAATCTTGTTGAATGATGGTGCATTGTATAGGTAGCCGATTTTGCGAGATATGGAAAATTTCATGTTATTTTATTAATAATAAATCTAATTTTTACAAAAGGCAACCCAAGCATCTTATATATTGGCTAGGTTGAAAGCTAAAGGAAGGAACTACACGAGGAAAATAACCATTAATCTAAGGTTATTAGGAAACTTACGAACTGAACTTAAATCTAACTAAAACATAAAAAGTTAAAAAATAGGATAACAATTATAATACACCCCACATCAGTTATTGTCTTCTGAAAAAAAAAAAACTGCTCCCTCAAGTTCAAAATCACTCCTCACTAGGAGAAGGGTAACAGGTACCTAGATCAGAAATGTTGAGTTTAGCGGACAATTCCAACATGTAGGTGTTATTCCTAAATCTCTTCACAATTTTGAAAAGCCTTGGTGGCACTTGCAAAAAAATTTCTACATCCCTGTATAGCCAAGCAAATAAAGTCGTTAAAGGTGATTTGGTATAAAGTTTTATTACACCTAAAATGTCCACCCAATCCCCTTTACGATATGCTCGTGAAGATTAGTGCTGTATATTAGATTAAAGAATGTTTAGGTGGACCTTTGTCTTCAAATAAATTTTGCTTCTTAAATAAAACATGTTAAGGTAAATACTCTGTAATAAGCGAAATTTTTGACTTGAGGCCTTCCAACCACATTTTCAGATACTCGCAGCAAGGTACGGATGTTCAATTACTTTTTAACCAACTTGAGAAGAATTGAAAATGGTGTCCTTCCTCTCTTATGGGTCTTAGTTAACAGCCATCTGACAATTTGACTGTCAAATGCTTGTCATTAGATCTTCATCTAATCTCATGTGTGTTAATATTTTCCAATTGCTAAACAAGCTTCGATCCTTTTGCATGTCACTACGGAGGGATTTTATTTATTTTTTGTTTTGGGAATTTTGTGTTTCTATTGTAGGCCTTGATTTGATTAGTAAAGGAGAAAAAATTGCTTGTTAGACGGGTGTTTGAGTGTTGCCCTGACAACTTTCCACATTTTTTCAGGGTGAACCTACAGCTGCTTCTCGCATTGCACTCTCCATCATTGAAACTTGTGCTGAGACGCTTGAGCCATTTATTTGTGGATTCTTAACATCTTGTCTTTCAGAGAGAGATGTTGTGGGGAGTGAACTTAAAGAATTTTACCATGAAATAATTTTTAGAATTTTCCAACGTGTCCCTCAAATGCTTCTTGCTGTGATTCCGAACTTGACTCTAGAGCTTTTGGTATGTCGTTTGGTTGGTTTATTTTATTCCATTTTCTGGGTTGCAACATGCGACTATTTGTTATTCTCACATTTTTATTTTCATTGATATAATGAATTTAACAAAAGACAGTAGAGAACCAAATGAGTGACCCTAAAAATCTCCAATTTGTCTGATACGAGATGAGGACTAGTTACAAAAGCTTTTGACCTTAGACACCAAGAGGTAAAGACAACATCATCCCAGATATGCCAAACCTCCCAAAACAATGCCCAAAAACTAATGATCCAAAGCAGTTTCTTCTAGTCCTTGAAATTGTTCCCAAATTACTGAAGCACGAAATATTTGGAGGATCTTGGACGTCTTCAAATTTACTATTATTATTATTTTTATTTTTAATTATCTTTTTGTGTGTGTATTTTTGAAGGCAACACCAATTTAGGTTGAGGTAGTGGTAAGGTTTTCTTTTTGAACTCTATTACTTTGGTTCAGCCTACCCCAGGAAAGAGTCCGTTAGAAAACCTTACACTTAATTTTTATTTCCAAAGCTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAAGAAAAAAACGCTGGCCGAAGAATAGGAAATCTTTGGGCCAGATGATTGGATAGAGATTTGACAGAAAATGTCCCACTCCTTTCAAGGCTCTACCATTTCTAATGCTCCCCAAAGTTTTCCTTCAACCATTTAAACATTCCAGGATGCTCAGTTTCTTTGTTTCCTCATTATATCTCTATCCTTTGTAGACGGATCAAGTTGATGTTAGAATAAAAGCGGTTAAAATCATCGGGAGACTTTTAGCTCTACCTGAACACCATGTAGCAAAGAAGTACCGAGGACTTTTTATGGAATTCTTGAAAAGGTTTTGTGACAAGTCAGCAGAAGTGAGAATTCATGCCATCCAATGTGCTAAAGATTGTTATATGGCCAATCCTGCTAGTTCAGAATCTCTTGAAGTTCTGGGTCAGTGATTTAGTAGTTATGATGTCATTAAGATTCTTCAATCCATTATGTACAATATATCTAATTAGTTGGTATTCGTGAACATAACAGCTGCAGTTGAAGAACGATTATTAGACTTGGATGATAGAGTGAGAACACAAGCAATAGTTGTTATTTGCGATATTGTCCGGTCAAATATCAAATTTGTTCCAGTGAGACTAATATATCAAGCTATTGAAAGACTACGAGATAAGAGGGTATTTTATTGTATATGGTTTTTGTATGCACTAAGCAATCAAAACTCACCTAATATTTGATTTGTTTTTTTAGATATCAGTTAGAAAAAAAGCCCTTCAGAAATTGTTGGAAGTATATCGAGATTATTGTGATAAATGTTCCAAAGGCCAATTGAATTTGAACGATGACTTTGAACAGATCCCATG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MDESSLQVIFDVGTKLSKHNRSTKDYIVKSLRQVIDAFACLEQSYTPDATGKSEPAKILESSTKPLRKSIINGLLRNRDKDVRLLLAICVGELFRVMAPEPPFEDKYLRDVFKLLLSPFYELADTTSPLFTHRVKILETVARCKCCVIMLDIGCNDLVLEMFNTFFSILRDYHEDGVVKNIVSIMTHILSEDPSLPLVDVVLHNLVKEEKGEPTAASRIALSIIETCAETLEPFICGFLTSCLSERDVVGSELKEFYHEIIFRIFQRVPQMLLAVIPNLTLELLTDQVDVRIKAVKIIGRLLALPEHHVAKKYRGLFMEFLKRFCDKSAEVRIHAIQCAKDCYMANPASSESLEVLAAVEERLLDLDDRVRTQAIVVICDIVRSNIKFVPVRLIYQAIERLRDKRISVRKKALQKLLEVYRDYCDKCSKGQLNLNDDFEQIPCKVLMLCYDKDCKEYRSQCMEFVLVEDLFPPHLSIEERTIHWIHLFSLFNIHHEKALRYVFLQKQRLQNELQSYLALRKKDKENRSEEIEKKIVTAFINMAACFPDPTKAEESFHKLNQIKDNNVFNLLELLMDKLTIVEAQATRDKFLRMIGSKHPHFEFLKSLSLKCSHNLFSTEHVRYALDCILSNRLGNKHLEASASKLLLAIINTFPSLIRGSEGQLLRLLEERNSIDSRLIKVLSKAGPHLSIELRDVYPFLERLCLEGTRAQSKSAVSAISTLAGTSGHFWFSKLCKELVDSLHRGINLPTVLQSLGCVAKYSVSTFDDQDVGITPYIYEKILQVDLSDDLNILDGDAACSNSCDLKIYGLKTLVKSFLPHQGTPRRNIDEFLNILSRMLKMCETSVEIIPTEDYKAQIRLAAAKSVICLARKWDLQIGPEIFRLTILMAKDSSSVVRRLFIDKAHKLLKEQAIPTRYACAFAFCISDSVKDLQDDSLKYMAEFIEQYSKIAQIHQTSVVQDGSMTLFPAYIVVFLIYILAHDSGFPHLDCQDEKVYAQFCSPLLFVLQMFINADVNAARDTVLYLHSIFRAIRRVEDAVNIDISPKLHILADIGLSFVTSLNNYGVSLSCAPKQILLPLSLYRVNSRQLSQHSYDECFVGRVLKAFQSQIILPANTTRGDQKWLESNMQTNINPCSSMSMRACKQVEIITSKAMKKSKIVNQENIVGRRRKRAVSPTTSTSIELHERSQVFQRNFPTNRDKNKLSSELETTEASPVETHASIQSVDMNVTSQDNVLADSSFDDESSMHVNDQLTNTCSMKDMNMGNGSKTETCHVQPYKILSGILLSGEKGGGQERSLALVHRTTHSWRPLYHVRSPMANLRTDSPVACRIVRAFLDFLNSVEPGPGVDVEGLEVAKQCLEQVFKVESPASDELTEFDSLVDIFSSPESFQRPDTNSFVDNGALPMDHHCPLNLNNSDANLSKSPKSQGDDWSRESHPLGVLKDELLGQFVLALEKLHYFRTTADGKDDPDQLERATLLFHDALGEMERSGCTEINYKNLAESLKSLGNRAMQSKLYSDAIELYSCAIALCENNAIYYCNRAAAYTQIQKYSEATRDCLKSIEIDPNYSKAYSRLGLALYDQGNYRDAIDKGFIKALMLDPNNEAVRENIRVAEQKLKEAQRQSQHEQGSSSRSQESQNQSGGGSRNDNTSPPFPSMPFNVTLPSEISNMFMNMAANATTPFHGQHPQDGQEENRNGNGLDDPGPSMDGNFSFSIGDGMPQDLNGALRSMMQMFTGSAPSGNPQDDTNRRSPPQG Homology
BLAST of Moc11g07990 vs. NCBI nr
Match: XP_022131918.1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2459.5 bits (6373), Expect = 0.0e+00 Identity = 1261/1266 (99.61%), Postives = 1263/1266 (99.76%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. NCBI nr
Match: XP_022131924.1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2459.5 bits (6373), Expect = 0.0e+00 Identity = 1261/1264 (99.76%), Postives = 1262/1264 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. NCBI nr
Match: XP_022131934.1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2371.7 bits (6145), Expect = 0.0e+00 Identity = 1226/1266 (96.84%), Postives = 1228/1266 (97.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. NCBI nr
Match: XP_022131945.1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-B isoform X4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2169.0 bits (5619), Expect = 0.0e+00 Identity = 1113/1118 (99.55%), Postives = 1115/1118 (99.73%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. NCBI nr
Match: XP_022937151.1 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022937153.1 sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X1 [Cucurbita moschata] >KAG7024760.1 Sister chromatid cohesion protein PDS5-like A [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2028.8 bits (5255), Expect = 0.0e+00 Identity = 1050/1262 (83.20%), Postives = 1137/1262 (90.10%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5F3V3 (Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A OS=Gallus gallus OX=9031 GN=PDS5A PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 279.6 bits (714), Expect = 2.4e-73 Identity = 283/1119 (25.29%), Postives = 517/1119 (46.20%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4L9P7 (Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Pds5a PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 273.9 bits (699), Expect = 1.3e-71 Identity = 306/1248 (24.52%), Postives = 565/1248 (45.27%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4QXM3 (Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-A OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=pds5a-a PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 273.1 bits (697), Expect = 2.2e-71 Identity = 317/1263 (25.10%), Postives = 567/1263 (44.89%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6A026 (Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pds5a PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 272.7 bits (696), Expect = 2.9e-71 Identity = 310/1251 (24.78%), Postives = 571/1251 (45.64%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4KLU7 (Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-B OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=pds5a-b PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 268.9 bits (686), Expect = 4.2e-70 Identity = 322/1312 (24.54%), Postives = 581/1312 (44.28%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BUT7 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004935 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2459.5 bits (6373), Expect = 0.0e+00 Identity = 1261/1266 (99.61%), Postives = 1263/1266 (99.76%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BRL6 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004935 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2459.5 bits (6373), Expect = 0.0e+00 Identity = 1261/1264 (99.76%), Postives = 1262/1264 (99.84%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BRM7 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004935 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2371.7 bits (6145), Expect = 0.0e+00 Identity = 1226/1266 (96.84%), Postives = 1228/1266 (97.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BR35 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-B isoform X4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004935 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2169.0 bits (5619), Expect = 0.0e+00 Identity = 1113/1118 (99.55%), Postives = 1115/1118 (99.73%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F9K0 (sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443537 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2028.8 bits (5255), Expect = 0.0e+00 Identity = 1050/1262 (83.20%), Postives = 1137/1262 (90.10%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. TAIR 10
Match: AT1G77600.2 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1072.8 bits (2773), Expect = 2.5e-313 Identity = 567/1146 (49.48%), Postives = 799/1146 (69.72%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. TAIR 10
Match: AT1G77600.3 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1063.1 bits (2748), Expect = 2.3e-310 Identity = 567/1160 (48.88%), Postives = 799/1160 (68.88%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. TAIR 10
Match: AT1G77600.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1002.3 bits (2590), Expect = 4.9e-292 Identity = 547/1155 (47.36%), Postives = 770/1155 (66.67%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. TAIR 10
Match: AT5G47690.1 (binding ) HSP 1 Score: 615.5 bits (1586), Expect = 1.3e-175 Identity = 383/1097 (34.91%), Postives = 625/1097 (56.97%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g07990 vs. TAIR 10
Match: AT5G47690.2 (binding ) HSP 1 Score: 615.5 bits (1586), Expect = 1.3e-175 Identity = 383/1097 (34.91%), Postives = 625/1097 (56.97%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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