
Moc11g04570 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTTACTCAATTAGAGGTAAGTTGACTTTTTTCAAGTCGTGAAGTGAAGTAACATTTCATTCTTCATTATCTTTAAAACACTCTATCATGAAACCTTATTCAATAGTTTTGGAAGTAAGTTAACTTAAGTCAAAACTTCCATTTCTTGGTATTACAAAAAACTCTTGTAGTGATATATCATTGTGATGGAGTTGAGCCTGTAAATATACTTCTTTCACAGAATAGTAAGGACTTTTCTGATGACTCATGGCATGTTTAAACTATTTAATTTGGTATGAATACGTGGTATGCTTTTGCTTTGTCTTTCTTGTCAAATTAAGAGAAGGACAGCCAGTTTTTGTGGTTGGTGCCATGCTCTCATTATCTTTTGTGGCACTGCATATACCATTTGATATAGGTATCATATTGTACTCTTTTAAACTGTAGCTTCAAGTTGATGGTGGAATAAGTCAAAACCTGAATCCGAAGGCAATGTCTGCCCCTAATCTTACTGCAATGGACTTTCCCGCACTCACTGTATCCAGCGGTCAAAATGGTCATCCAAAATTTGATGATCTCCAACAATGTGCCAACCCGTATCTGTCTTCTGATAAAGATAGCATGCTTTTCTTCGAACCCAGCGCTGTTCCATCAAGAGGTGCTGCAGACTTTGCTTCTACTATCAGGAAATTGGCATCTCAGGATTCTGGTATGTGGAAGTACAATGGAAACGGTTCTGCTGATGACTCTATTGGCTCGAGTAGAAGTTCTCATACGTTAGCTAGCAAATACACTAGTGGTCATGGGAAAGACACCTATAGTGAGAGGCTGCTACAGCGAGGTTCAGCCCAGGCTGCTCCGGTTTGGCTTGAAACTGGTGAAGCAGTTGGTAATTGGCTTACCTGTCAAATTTATTTTCTTTATTAATGTGGCGTAGGGCAAACTTTTGTATGTATTCCTACTTTAACATTATTAAGTTGGCAGCAAACATGTATTCTGGGCAGCGGGAGGAAGCACGTGATAATGCTCGCCTGCGAAATGCATATTTTGAACAGGTAAGTCAGAATAATTGTTAGTTCTCTTCTTTGACCCCCCACCAAAGAAAAGGGCACACAATCCTCTCTTTTCTCCTGATTTGTTAGTCTTTAATTTATCTACTAATATGAAATCTATACCTATCTACTGTAACAAACGAGCTGTGTGATTTGATATATGCTTTTCCATGGTAAACGATATATACCCTAATATAGAATTTTATTCCCCTTCCACATTTTTGCTCCGTTAATTATACTTTTTATTTTTTAAAATAGGCACGACAAGCATACCTCATCGGTAATAAAGCTTTAGCAAAGGAGCTAAGTGTGAAGGGTCAGTTACATAACATGCACATGAAGGCAGCTCATGGAAGGGCCCAAGAATCCATTTATCGCCAGAGGTTTGTTAAGAATCCATTTATCGCCAGAGGTTTGTTCTCCCCTTGCTGCTTTTGTCTAGACTCAGAACAAGGTTGACGCAGGTGAAATTTCATGGCTAATTTTGGTTTCCTATTATTGGAAAAATTATTTGGTGTAGTCGTCACAATATTGCTGCCCCTTCCTAATTTGGATGCATTGTCAAAAATACAGTTTTTAATCTATCATGTACATCTAATGGTATAAAACTGTCTGGCTCCTCGAATAATTTCTCTTATTACTGTCATTCTTGCCACGCTTTGCTAAAACATAATTTGGAGGGAGTATTGATTCATTTCCCGAAGATGGTATATCTTTGATTACTTGGACCGATCATCCCATGGTTCTGACATGGCTCTTATCATTCGATTCGATGAATGGTTCAAAGATCTCGATGGCACAGTTTTCTTAAGATATAGCACCACGACACTGCTACAGGAATTTTCTGAATTGCTTTATGACTACCTTACATTTATTTTCTGTTCTGCTGTTTGTTCTGTTGCACGCTGTTTCTTCAGGAACCAAATAGGCGCAGATGCTCAGGGAAATGGGAGGGGACAGGAACGAATGATCGACTTGCATGGGCTGCACGTGAGCGAAGCGATTCACGTTCTGAAGCACGAGCTGAGCGTGCTGAGGGGTACTGCCAGGGCCTCGGGACAACGTCTGCAGGTTTATATTTGCGTTGGAACAGGGCATCACACCCGGGGTGCCCGCACTCCTGCCAGACTTCCAGTAGCTGTACAGAGATACTTGATCGAAGAAGAAGGCCTCGACTTTAGCGAACCGCAACCAGGGCTGCTTAGAGTTGTGATTTACTGAGCCAGGGAGTGAGAGGAGAGCACAGTGAAGTGTAGGAGTTTTTTTATAATTTTTTTCTTCTTTTTTTGACTAAAAAAAAAAAAGAGCCATGAAATCATACTTGTGATAGTCACCATTGTTGTACGGTAAATGGTTAGAGTTGGGGAAAAGAGTTATTCAGGCCGAAACCAAAAAAAAGAAAAGAGAAAAAAAAGAGAGAGGGAAGAAGATAAAGAATTAGGAGAAGAAAATGAAGAAGGGAAGATGAAGAAAGGTGAGAAAAGTAAGTAGAATTGTATCAAGTTTGATCGGTTGACAGGGGTTTAACATTTCTTAGCCCTGAAATCGGCATTCTCTTGCTACTTTGTTTTTTAAGGTTTACATTGTACCTTAAATTTTTGTCAGTTGTTTTTTCTTACTCAGTTCTTCCAATCTTTTCTTTTTCTAAGATGTAAATGGTAGAATTGAATTATATATATGAGGATGTAATTCATCAGATAACTTTTCAAAACAGCTCCTCAACCATGAATTTTGATTGATTTAACCAGAAGATTTGTCCCATTTTTATGTATTAAGAACCTGAAATATTTCTTCATTGAAGATGTGGAGCAGCGACGTGATCAGAAAGCGTTTTTTTTTAAAAAAAAAACTTAACTCGGCATTGAGCTCCAATGGCGGAAAGTTTCTTGATCAAATTTCTGGGTTTTTGCCATTCGGGGGAATTGTATATGTTGCATCCAGAGGGAATATTTTTTCTCAATCAAGAATGCCTCAACTGGATAAATTGGAAAATGCTTTTGCGAGCCAATCCCAAAAGTTTTTGTTGCCCATCCCAAAAGTTTTTGTTGCCCGTTCCTACTTCGCCAATTCTCATATCTCTCCCCCTCTCCGTCGTGGCCGCTGTCTTCTTCCTCTTCTCAATGGTTCTCTCTTCTTCACTCTGCCGATTCCAGTATCGAGAATCTTCTCGAGGGCTTTCGCCTCTTTGGCCTTCTGTGGGAGTCTGGTTTTTCAGCGACTCAACTTACTTTGGCGCCAATCTTGAAGCTCTTGAAGCTGTGTTTGGTTTCTGGCTTTGTGGAGGTATCTGAGGTTGTTCACGGATTTGCTGTTAAGATTGGATTTTACTACAAATATGGCTTGTTTGGTGAGGCACGGGTTCTTCTCTGCATTTCATCGGTGTGGGATCTTACCCGATTTCTTGAGCCTGCATTGTCTTCTTGGTGGTGTTAACAATGGCGGTTCTGATAATATAAAGAGGTACAAAGAGCAGGTCAAGGCCTATAAGATGAAGATGTTTCCATTGGACGAGGGCTTGGATATACTTTCTTGGAACAAGAAATTGTCGGAATATATTCAAGCTGGCCAAAATTTGGCAGCTGTTGATTGTTTTAAGAGCCTGTTTAGATCAGTAGAAGGATATGATAGTGTAACATTAATCGTCGTTCTATCCGCAGTTGTTGGCACGGGTGATCTTGACTTGGGGGAACAAATTCACGCACTTGTTATAAAATCCGGTTTTGATTCAGTAGCTCCTGTTGCAAATAGTCTTATGAACATGTACTCGAAGGTCGGGGTTGTTTATGTTGCAGAAAAGATGTTTGTTAACTCACTCAAATTGGATCTAACATCGTGGAACACGATGATATCGAGTTATGCTCAGAATCATCTTGAAAAAGAGGCAATATGCACATTCATAGATCTATTACGCGATGGCCCGATGCCCGATCAATTCACCTTTGCTAGTGTTTTAAGAGGCTGCTCAACCAGTGAGGAAGGAGAGTGTTTCAATCTCAACACACAGGTTCATGACTATGCAATAAAATGTGGTATTGTCAATGATAGTTTTGTTTTGACAGCACTTATTGACGTGTACTCGAAGAGCGGAAAAGTGGACGAGGCAGAACTTCTGTTGCATAACAAGTATGAATTTGATTTGGCTTCTTGGAACGCATTGATGTTTGGGTACATAAAGAGTAACAAAACTAAAAAGGCGTTAGAACTTTTGAGTCAGATGCATGCAACAGGGCTGCTGATCGATGAAATCACGTTGGCAACCGCAATGAAAGCTTCCAGTTACTTGATCAATTTGGAGCAAGGTAAACAAGTTCATGCTCATCCAATAAAATTAGGATTCAACGATGATTTATGGGTCAGTAGTAGTATTTTGGACATGTACATTAAATGTGGAGACATGTCAAATGCTCTTGAATTGTTCAATGAAATTAGCAGACCTGATGATGTTGTTTGGACGACTATAATCTCGGGTTATGTTGAAAATGGAGACGAGGATCGTGCTCTTTTTGTGTACCAGTTAATGAGGGTCTCAGGAATTCAACCTGATGAATATACCTTTTCTACTCTTATCAAAGCTAGTTCTTGTTTAACAGCTCAGGGGAGACAGATTCATACTAATGTGATAAATTTGGATTATGCTTTGGACCATTTTGTTGGTACTTCCCTGGTCGACATGTATTGCAAATGTGGTAGTGTTTGAGATGCCTATCGTGTGTTCGGGAAGATGGACGTTGGGAAAGTTGCCTTTTTGAATGACATGTTGTTAGGTTTAGCCCAACACGGTAATGCGGATAAAGCTCTCAATCTTTTCAAAATTATGCAATCAAATGGTATTGAGCCTAATAAAGTTACCTTCATTGGAGTTCTTTCTACTTGTAGTAATTCTGGTTTGTTTTCTGAAGCCTACAAATATTTTGATGCAAGGCCCAAAATATATGGGATTGTTCCTGATATCGAACATTAC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MLTQLELQVDGGISQNLNPKTMSAPNLTAMDFPALTVSSGQNGHPKFDDLQQSANPYLSSDKDSMIFFKSSAVPSRGAADFASTVRKLASQDSGMWKYNGNGSADDSIGSSRSSHTLASKYTSGHGKDTYSERLLQRGSARAAPVWLETGEAVANMYSEQREEARDHARLRNAYFEQARQAYLIGNKALAKELSVKGQLHNMHMKAAHGRAQESIYRQRNQIGADAQGNGRGQERMIDLHGLHVSEAIHVLKHELSVLRGTARASGQRLQVYICVGTGHHTRGARTPARLPVAVQRYLIEEEGLDFSEPQPGLLRVVIY Homology
BLAST of Moc11g04570 vs. NCBI nr
Match: XP_022142699.1 (LOW QUALITY PROTEIN: polyadenylate-binding protein-interacting protein 7 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 617.1 bits (1590), Expect = 8.7e-173 Identity = 316/319 (99.06%), Postives = 318/319 (99.69%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. NCBI nr
Match: XP_038896660.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g33170 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 576.2 bits (1484), Expect = 1.7e-160 Identity = 297/322 (92.24%), Postives = 307/322 (95.34%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. NCBI nr
Match: KAA0064547.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK20043.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 574.3 bits (1479), Expect = 6.4e-160 Identity = 297/322 (92.24%), Postives = 303/322 (94.10%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. NCBI nr
Match: XP_008453077.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At4g33170-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 574.3 bits (1479), Expect = 6.4e-160 Identity = 297/322 (92.24%), Postives = 303/322 (94.10%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. NCBI nr
Match: KGN55389.1 (hypothetical protein Csa_012546 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 571.6 bits (1472), Expect = 4.2e-159 Identity = 295/322 (91.61%), Postives = 303/322 (94.10%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O64843 (Polyadenylate-binding protein-interacting protein 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CID7 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 439.1 bits (1128), Expect = 4.2e-122 Identity = 230/322 (71.43%), Postives = 264/322 (81.99%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q86UW6 (NEDD4-binding protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=N4BP2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 70.9 bits (172), Expect = 3.0e-11 Identity = 52/162 (32.10%), Postives = 82/162 (50.62%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CM79 (LOW QUALITY PROTEIN: polyadenylate-binding protein-interacting protein 7 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012749 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 617.1 bits (1590), Expect = 4.2e-173 Identity = 316/319 (99.06%), Postives = 318/319 (99.69%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VC58 (Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold134G001630 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 574.3 bits (1479), Expect = 3.1e-160 Identity = 297/322 (92.24%), Postives = 303/322 (94.10%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BW44 (pentatricopeptide repeat-containing protein At4g33170-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493901 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 574.3 bits (1479), Expect = 3.1e-160 Identity = 297/322 (92.24%), Postives = 303/322 (94.10%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L2X8 (Smr domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G649590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 571.6 bits (1472), Expect = 2.0e-159 Identity = 295/322 (91.61%), Postives = 303/322 (94.10%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FHA7 (polyadenylate-binding protein-interacting protein 7 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445761 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 569.7 bits (1467), Expect = 7.7e-159 Identity = 295/322 (91.61%), Postives = 305/322 (94.72%), Query Frame = 0
BLAST of Moc11g04570 vs. TAIR 10
Match: AT2G26280.1 (CTC-interacting domain 7 ) HSP 1 Score: 439.1 bits (1128), Expect = 3.0e-123 Identity = 230/322 (71.43%), Postives = 264/322 (81.99%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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