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Moc09g29420 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTTTGGCTTAATATTGTGATGAATTCTCTTGTTAATGGCTTGTATCCACAGGTTTGGAAAAAGAAGACAAGACATGAAGAAAGTTGAACCTAGAAAAAAGTAGATGAAGTATGTACAAGGTAGAGCAGAAAAGAGTTGGAGAAAATAATCGTTGGAGTAGGGATTTACATCGTAGTAGCTGTCCCAAACGCGGGATAAATTACCATGTCCGTACAATCACCAGTTGGGTGCCCTAAAACTGGGACCCGATATGAAAGGGGCAATATATCCTAGCCGACACACACAGATCCCAATAGAGAACACTCTTTGGTGTTAGAAAAGACAAGGGAGAAGAATCTCACCATTTTCGGAGGAGAGCTGACGACAAAGAAGGATATTCGGCTGCTGCTGCAAGCTGTCGTCTCCATCTTCAATTTTCTTCTCTTTTCTTTAAATGGGTTGTAACATTTCTTTACCTATTTCATTTTCTCCCTCTCTCATGAGCTAAACCCCATTTTAGGGGGAGATTTATGTGCTGTAACTAATGAACAAGTGAAAGTCTAGCTGATTTCCGTTTGTTATTAAATAGAGCTGTGTTTATTTCTTAAATCTTACTGAATATTGTTGGCCACCTTGTTTAGTATGTTAGCGTTGTATGACCCGGGAGGGCTTACGGGTAGCTGACTTGCTCTATTTGTGATTAGCTACTTTTTTCTAGTAGGGTCGTTGATGCTCAGGAATAAGGTCCCCTAATCATGCTTAAAACTTGTGTTTATTGCTTGGGTATTTAACAATGGAAGTTTGTAGGTATCCATGTTTGGGTGTCTCGGAAGGGAACCATGTCGAGTTGAGCATTAATGAATGATTTCGTGCTAGAGTATAGATTGAGATTGAGTGAAAGCATATATGTCTCCCCTGCTTTTTCATATATGTTTATCCTTCATTTCGTCGTTCTGTTCTGAAGCTTCTCTCTGTTGTCAACATTTTAAAGTGTGTTTACTGCTAGATTTGTTTATGATATTTTCTTTTACTGTGAACACCAACATCTATATTTTATTATTTTTGTAATTTTCGGTATCTTCAAATATAATTTAGAATATTTCCCTAAGTCCCTGTGGATTGGAACTTGTTTCTTACTACAATCGACAGATATAGTGTATACTTGCACTTGTATCTATCACTGTTGTGAGGATGCAAAAGTCGGCTGGCCCTTCCCCTTACTTGGGTCACGAAGGATTGAAGAGGTAGACTCCCCTTCGCCTTGCTCCATAGCAGCAAGGCAATCCTTCGCAATATCAGCGATGGTGTTGGTAATAATAGTTGGGTCGACACTATTCTCGAAACGTGTGCGGGTTCTTCCCCAGTCTCAGATCAGCTGGGCATGGGGTGGAAGTACCTACTGAGCCTGTAGAGGAGGAAACTGGTCCTCCCTATTCTCAGGTGCCAATGGGTTTTAAGGCTGCTGAGGATCAATCAGAGGGGTGTTGGTTCAGCCTCCTTCCCGTTGACCCCCTACTGGGGGTGGTTTGCAATGGGACGATCTACACCCACTTGGTGCACTGGGACTCGATGCCTCGAAGTCCCGACGACCCAAGAATAGGTCCGACGGGTATAGGTTCGACAAACGTTTGTCATGATCACGACCCAGAGTAGGAGTGTGTGACAGTTGAGAACGAGTTGGGATTGTTATTGGTCAATTCAGCTTTGAGAGGAAATGACTTAGAGAAATAGTAGTTTCCCACAGACGGTACCAAATGTTTGATCACAAAAATGACCAAGCCCGTGAACCTCCGCTCGGACTGGAAGATGACCCAGAGGACGAGCTGGAGAGAGCTGGACAAGAGACCTGCAAAATAGAAAACAATCTGACGCCCAAGTCAGAAAGAATCCAAGTTGTATTCAGAGAGTAATATAGTGTTCGCTACTTTAAATGGAGACAAATGAGTTCTATTTATAGGCGAATTCCCTGACAATGTTTCCGATAAGGCCTCAACGACTCATTAAGATAACCGCGAGTCTGTTAGAGTTCTAAGCTAAACTGAGTGTACCTTCATGTCAGTTCGATCTACGAAAGGAAACAGGACCTAAGTTTAAGAGGGTTGGTTCGACTATAACAGGCATCGGCTCGGCAATGGACCCCAATATTGAGGTGGCAAAACTTGGCCTTATCATCTCGAGGCTACGTATGTCTTTTTCCTCCAATCAAGATATGCCATGTGTCTAGCTGAAAAATCACCTCCAACATGTTTAATTATTTTAAACTACAAAAATGGAGATAGACTCAGTCGTTTCAATTCATAATGCAAGATTGAGATGGACTCAATTAGAGTTGTTTCACGATTTGGAACTACAAAAAGGCAAGGGTGCAAGAAATTGACTCGATTCGAAAATTTAACTTGAACCAATCCACCTCTTTATGTTCTCTGACAACGCAGCATTACCAAGATTTATGCACTGTTCAATTTACTCGACCCCCTCCATACTCGTTAGATCTAAGCTAACAAACTTGGTCTCAATGTAGGGATTGTCATCAAACAAGAAAAAAGTTTCGAGAGAAGTTTGAAGTTTTTGTTTTAAGAAAACAATTTTGTTAAGAGAGACGCTAAAGAAAGAAAGCTAAAAAATATGGGTAAGAAAAGTAATTTCAACTCTATTGTTTATCTGGAAAGGGTCGTCATACCATAGTTGCACTTGACATGACTTTTTCATATTCAAATCTTGGGATTTAAGCTCCCAACCTTTTAATGTATGCCTTAACAAATTAAATTATGCTAAGTCACCTTTCGCCATTTTTTAAGTCTTCTTTCAACAATTTTCTGTTTTAACTTGGGAGGAAAAAAAAAAAGTAAAAAACACTATCAATAATCACACCCGCAAAATTTAACTATCAATTCCTAACACAATTTAATGAAAGATATAAATTGAGCCACTTAAAATAAGTTTACGGTTTTAATTAGGGGTGTAAGGAACCAACCCGATAAAAAAGGAAAAACGCCCCAGGAGTTCGGTCCGAACCGAAACGGATAGAGGTTTTCGGTTCGGTTCTCATATTAACCCAAAAAACCGAGGGTTTTGTTTGGTACGCAGCTTCAGTTCTGGCCGTTTCTACAGGCCGCCCACAGCACACTGCCACTTCTCTCTCTCTCGCACCGGCAACTCCGACAAGTTGTATAACCAGCAGGCGAAATTTTCCGTCCTGTCTCAGGTAGCGGTACCATTTCAATTTCTGAAGAATTTACCACTTTTTAGATTCTACTTTCTGTTCTGTTGAATCAAAAAGGGTTTTGAGTTGTTGAAAACTTTGTTTAACCATAAACAAATTCTATCTGTGAATCAAAAGTGGGGAGGAGTTGGAATTTTGAGGGGTTAAAGAAAAGTAGAGTTCGAGTCTCAATGCTCAGATATCTAATTCCCTCTCTTTTCCTAGGTTTGGCTTTTGGGGGTATGTGTCCATAGTTGTTACTTGTTGCATAGTTAAATTTGTAGATAATCTAATCTTGTGATTAAATACATCACTTTGTATACAAATCTTCATATGGGTAAATTTTTTTGACAGTCAAATTTTACGTTAACAATCTATCATCACCTGGATCTTTCTATTTTTTTTTTAACTCACGACCTTTTGGTTGGAGACATATGTCAATTACTTAATTACTGCTTATGCTTGTTTTGGCATTGTATCTTTCTATCTACTACAATTAAAAAATTGACAACTATTTAATTAAAAAAATATAATTCCTCTCTTCTCCTTTATTCATTTATCTTTATGCATTTATCTCTCTTAACTGTCAATTCTTTTAGTGGTGGTAAATAGTAAACGCCTAGATATTATTTGTTTAAGTTTTTCTTGTATCAAGGGAGGAAGAAGGAAGGAAGAAGAAGAAAAACCAACCATGAACCGAGTTGACCAGAACCAAGCAATTTGGTTCAATTTCCTTCTCCGCTAAATCGAACCTATTTGGTTTTTCCTCTTTTGAGTTTTGCCTAAAAATTGACCCAACCTAGTTACATTGCTAGTTTTAATTGATGAAATTATTAGTTTAGGGTTTTAACTTTTAATTGACTCAACCTACAAAGCTCATAGGTATGGTTTGATTTTTTTCCAAACAAAAATCTATATTTTCACCCTTTTGTTGTTAAAAAACAAAAATAGCTGAGTTTTATATTACTTTCAAAATAGTAAAGATTTTTTTTTTTAACTAAATAAAAACACTTTTCAAATTCATATGGCATACATGTATGTCATGTTTTTCCAAATTCATATATATCACGATATTCTAAAGATGTGGCCAAATATTAGAAAATATTTAGAAGTGATTTTGACAGGATTAAAATCACTTTTGTCCTTGTCAAAATCACTTTTGAACGTTTTTTTTTTATGCTATAGTGTATAAAGCCATCTCTTGGTGTAAATCCTCTCCTATTTTTCATTACTATAGCTATGCTTCCCTCTTGTTTAATTGGAAGTGCTTTATGCAACCCATCAATGGGCTTTTTGTAACCCTTCCATGGACTTCTGTAATTTCATACATCAATTAAATTGTTTCTTACTCAACAAAAAAATACAAAAAAAAATCACTTCTATAGTAATGCTTGTCAGTTTATAGCTCTTAACTAAAAAATTGATTTACTAATGAAGACCAATCGTTAGTTGTTTACGTATGTTCCATTTAGGCTTAAAAGGAGAAGAATGGGAACACAAATCTTACAGCCTTGTTCGAGGAAAAGGAAGGTGAGAGATGGGCATCATAATATTGACGAAGTTGAAGGGCACTGTATGGATGTTCTTAGTGAACTTCCTGGTATCCCAATGGTTCCTTCAAATCAGAACATGAAATCTAGAGTTATTTTTGTACTTGACAAGGCTTCTCTGACACTTGCCCTTGTTGGGAAGGTAAAAACTCTCTTTGCTGCATTGCATCTCTTTTTATACTTTCTAGTGTTTTTTGTTTAGTTCATTTTTTTGGCTTATTCTGTTCTTTTAGCCTGACTTTTTATTAGCTAGTAATTCA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BLAST of Moc09g29420 vs. NCBI nr
Match: XP_022150056.1 (ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1-like [Momordica charantia] >XP_022150057.1 ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 487.6 bits (1254), Expect = 1.6e-133 Identity = 243/259 (93.82%), Postives = 248/259 (95.75%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. NCBI nr
Match: TYK19496.1 (ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 379.4 bits (973), Expect = 6.3e-101 Identity = 185/240 (77.08%), Postives = 209/240 (87.08%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. NCBI nr
Match: XP_008448880.1 (PREDICTED: ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 322.0 bits (824), Expect = 1.2e-83 Identity = 156/193 (80.83%), Postives = 175/193 (90.67%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. NCBI nr
Match: XP_018502548.1 (PREDICTED: ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1-like [Pyrus x bretschneideri]) HSP 1 Score: 275.4 bits (703), Expect = 1.3e-69 Identity = 144/264 (54.55%), Postives = 190/264 (71.97%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. NCBI nr
Match: CAB4298223.1 (unnamed protein product [Prunus armeniaca]) HSP 1 Score: 270.0 bits (689), Expect = 5.4e-68 Identity = 138/240 (57.50%), Postives = 178/240 (74.17%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92979 (Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EMG1 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 149.4 bits (376), Expect = 1.4e-34 Identity = 83/197 (42.13%), Postives = 122/197 (61.93%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O35130 (Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Emg1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 148.3 bits (373), Expect = 3.1e-34 Identity = 81/197 (41.12%), Postives = 124/197 (62.94%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XX15 (Ribosomal RNA small subunit methyltransferase nep-1 OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=Y39A1A.14 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 130.6 bits (327), Expect = 6.7e-29 Identity = 79/212 (37.26%), Postives = 118/212 (55.66%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9W4J5 (Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=CG3527 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 129.4 bits (324), Expect = 1.5e-28 Identity = 69/196 (35.20%), Postives = 112/196 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10107 (Ribosomal RNA small subunit methyltransferase mra1 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=mra1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 124.4 bits (311), Expect = 4.8e-27 Identity = 78/204 (38.24%), Postives = 111/204 (54.41%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DAB0 (ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018323 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 487.6 bits (1254), Expect = 8.0e-134 Identity = 243/259 (93.82%), Postives = 248/259 (95.75%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D7D3 (Ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold443G001510 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 379.4 bits (973), Expect = 3.1e-101 Identity = 185/240 (77.08%), Postives = 209/240 (87.08%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BLD0 (ribosomal RNA small subunit methyltransferase NEP1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490911 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 322.0 bits (824), Expect = 5.8e-84 Identity = 156/193 (80.83%), Postives = 175/193 (90.67%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J5WCX0 (Uncharacterized protein OS=Prunus armeniaca OX=36596 GN=ORAREDHAP_LOCUS10480 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 270.0 bits (689), Expect = 2.6e-68 Identity = 138/240 (57.50%), Postives = 178/240 (74.17%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498KD62 (Uncharacterized protein OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_006553 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 269.2 bits (687), Expect = 4.5e-68 Identity = 146/269 (54.28%), Postives = 189/269 (70.26%), Query Frame = 0
BLAST of Moc09g29420 vs. TAIR 10
Match: AT3G57000.1 (nucleolar essential protein-related ) HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 3.4e-44 Identity = 100/232 (43.10%), Postives = 143/232 (61.64%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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