Moc09g06710 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview


Name	Moc09g06710
Type	gene
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	Pectin lyase-like superfamily protein
Location	chr9: 5237969 .. 5273515 (+)
RNA-Seq Expression	Moc09g06710
Synteny	Moc09g06710

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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GAAAAGAAGATTTACATGACGGGCAATGCCCGACAATTAAAATTGTTCGTCATTGAAAGGAAACAAGGACACTCGCATAGATGTCGGTCAATGACCGACATGGTTACTCGTTAATGACGGGCAATGCCCGTCATGAAAAGCCGAATTTGTTGTAGTGTTTCTGTTGAGAGATTTAAAAAAGATCTAGTAGTTAGCTTTTTTTTACCTTAATCTCGACTAATTAATTTAATTAATTAATATTTTGATGATAACAAACACAATTAGTAATTATTATTTTTGGTGTATTAGAATTGTTGTTATAAAACATAAATTTATTATGAGCTTCAATTAATTATGTGTAGACACCGTATTTGATTCGGTTCATTTTTTATTTTTTTATATCTTATTTTTTTTTAGTTTAGAAAAAGAGGAAAAAAAACTAAGTTTACTTTATTATTGTCTTTAACCTAAAGTTTAATTAAATTTAAAAAAAATTTGATTTGTTTAAAGGTTTTGATTTTATTAATAAAATTAAGAAATGAATTTTATCTTGTTTTCAATTCAAAAGAATTTTTTTTAAAGGTATTGTTTTAAATAATGAAAATGAATTTCTTTAAATTGCAAAGTTTAAGTTGAGTTTTAAATAAGGAAATTTTTGTTTTGATTAGGTTTTAAGATAAAGCTTTAGAAAGAAAATTAAATTGGTTTAAACTTAGGAAAACGAAGTCGACACCATTGGGTGCTGGCACGATGGCAAGAAGCTTTGGTATTGAAATTCACGATCTAGGATCGAGCCCTCCTGTGTGTAGAAATAAAAAAGGTATGTTGTAATTCATTAATCAATTCGTATTTGTATCTACAGTATAAAATTCACTGTGTGACCAAATAAGATATTTGCCAACATGAAATTAGCTATGCAATAATTGATACCTGTTTTTGACTAAGAGATAATTAGTTCGAATCCCGAATCTTTACTTGTTGATATTTAATAAATAAATATCAATTTGATCTCTACACCATGTGGTGTGTAATTATTATACCAAGTACTATCAATCAAAATTTAAAATGTCAAACATCAAATACTCAATTTTATAATAATGTAGATAGAAATTAAATATCGTGTTGATGTTAATAGATATTTCTAGAAGAATAAAAAAAATTGATAAAAGATATTTAAATGAACAAATAAACATTTCAATAAGTTAAATTAGGTTCTATGTTTATTCCAAAATGAAAAAAATGCCTATTTATGACTGAAAGAATATTCTCCTACCTCTTTATTCTTTCAAAATTGTTAAATGAATCAATAGCATGTACCTCATAATTTATTAATCACTCGATGTCTATAGTATAGAATTCACTGTGACACCAACTAAGATATTTGCCAACATGAGTTTAGCGGTAGTTGACATCTGTTTTTGATTAAGTGGATATGAGTTCGAATTCTCCACCTTCACTTGTTGACTTGTTGGGAGTTTTTAATTTAAACACTCTCACTATTGATGATATACTTCCCCATCTCTCTTTTCTATTATTTTCTCTATCTACAAAATTTTCTCTCTTAATCTTCTTATTTCTTTCTCATTTAGGGTGTATCGGGGAGCGATACTATGGTGAGTGATTTTGAAAAAAAAAAGATTTAAGAATAATTAATTTTTCAAAATCACCATCCAAGTGGTACATTAAAAATCAATTTAAAATGATATTAAACTTTCCTAAAATCAGTGATTTTGACAATGATAAAAGGGTGTGTTTTGGAGTGAAGGTAGAATGGGCGATTTTTTTTTTCTTTTTAAAAAGAGAGATTGAAGTATAATTAGTTTTTTAAAATTGTTCACACGATATTTCTGGAGAAATTATATTTCGTGGACTAAATTTGTATTGATATTTGTGGTTTGTACAATCTATAATATTTATCCTCTTATTCTTTCCCTTGAATTCTTAGCTTGTTGATCTTGATCGGTCTCTTGGCGGCTTGTTCATCTTGATCGGTCTCTTGGCGGCATGTTGATCTTGATCGGTCTCTCGGAGGCGTGTTGATCTTGATAGACCTCTTGGCAGCTTGTTCATCTTGATCGGCTTCTTGGTGGCTTGATGATTTTGATCAATGTCTAGCTTGATGATGATCTTGATCGGCCTCTGGCTTGATGATGATCTTGATCGACCTGTGGCTTGTTGATGATCTTTATCGACCTGTGGCTTGATGATGATCTTGATCGGCCTCTGGCTTGATGTTGATCTTGATCGACCTCTTGATTTGTTAATCTTGATCGAACTCTTGGCGGCTTGTTGATCTTGACTGACCTCTAGACTTGTTGATCTTGATCGGCCTCTTAGCAACTTGTTGATCTTGATCGGCCTCTTGGCGGCGTGTTGATCTTGATGATCTTGTGACTAGCCTCTAGCTTGATGATGATCTTAATCCGCCTCTGGACTTGTTGATCTTGATCAAACACTTGGCAGCTGGTTCATCTTGAACAGCCTTTGGACTTATTGATCTTGATAGGCTAGGTCTTATGGACTTATTGATCTTGATCATTTATTATGTTTACTAATTTCTTATTTTCGAACATTTTTTATACTTTAAAATAAAACTACAAATTTCAGGTGTAACACACATATTTTTTATTAGTCAGTAGTTATACAAAGTACTACTAATATCTCTTAGGGATCACGATGCAGCATTCACGGCCCTTTTCATCAACGCGATAAATTTAAGTAATACATCCTCTTTGTATTGCAAAAAAAAACCCATGGGACCTGATCCTCTCTGGTACCCATCACGATTGGGTCAAGGAATCCCCAGTTTGACTGAGGAAGGGGTCAAACCGGAGATCCTAATCAGGGTCCCCGACGGGGATGGAGGGAGGTCTCCCCGCCCGGTCCTCGTTTAATATTTTATTAAATTTTATTTTATGTATATAAAATAGTATTAATATATATTATTTTTTATAAATATTTTTTTTAATTTTGTAGCTGTATTTATTTAAATTTTACGTTATTCCATAAAAAAAGTTTATATTTTCTAAAGAATTAAAATATTTATAAATTAAAAAAAATAAAATATAAATAAAAAGATCGAGGACAGGTTCTTCGCGGGGAATCCATCCCCGATCAGGGAATCCCGCCCCGTCCTTGCCCCCGAATTCGAGGGCGGAGGCGAGGATCGAGATGGCCCCCCGGCCGTGCCATGCCCCGTTGCCATCCCTAGTTGTTGTATATGAACGTAACATTTTAATTTGAATATGAAATGTGTTGTATCTAGGGGTATTCTAAAACTTTGGTGACAAAAGAATCGGAGCAGGCCAATACCAAACGTAATGGTTGGGATGGACTTAGATAGAGATAAATTATTGATTGAGTTGTGTTGGGTTAGAAACGTCAAGAACCAAGTACTACTACTATCCCTTAGGGATCATGATGCAGCAATCACGACCCTTTTCATGAACGCGATAAATTTCAGCAATACATCCTCTTTTGTTCGTGGTCTTTTCAATCCAAAAGAAATACTCATCACATCTCTTCTCTTGAGAAAATCTGTTGTAATTTCTGCTGGTGGCGATGACGGTTTTCAAAGTGGTGTGTAGTCAGTCAAGTGAATCCTGCGTATGTATAGGGACATTGAAAAAGACTTGTATGAGCCGATTTCTGATAGTAATATATTATTACCTCTTGTGCGTCTGTCTTGAGCGTGGAAGGTGTCGGAGTGGGCCATTGTCCGGCTACTAATCAAAGTTTTAAATGTCGATATCAAAATTTTCAAAGAAAAAAAATGTTGATATCAAATAAAATGCCGATTTCTCAAATTTATAGGAACTAGATAGAAATTGATAAAATGTCCATGTTGATGAATATTTAAGTGAGCAAATAAATAGTACACCATTCTTAAATAAGTTAAAAAAATCTTATCATTAATATTATATTCACAATGATATTTTGTTGATGTTTTCGATTTCTATTGTTAATTTTTCTATGATATATAATAGAAATATCGATTAATCACCCTGATCGTAATGTCACAATCATGAATATATGGAAATGTGGTAGAAAATATCGACATTACTCTGTTACCTAACTTTTCATGTTTTTTGTGGAAAAAAAAAAACCAATCAAAAGTTTCTAATTTCAACGTGAAGGAAATATCGTCTCAATTTTATGAAAATGTTGATCAGGGTAGATATTTATGAAAAAATTATATAAAAATATTTAAATTAACAATAAACGTTTCACCATTTTTAAATAAAATTCATAATTATTAATATTATATTTAGTGAAATGCTGTCAATATTTTGTTAGTTTATCTTGCGCTATACTGTGAAAATTTCGAGTCACTATGTCCAACCGAAAATTAAATAACTGAAAGCAATAGTCAGTCTGGTTGTTTCATGTAAGAGACTTTATCAAAACGAAAATTTGAGAGCGAAAAAGACTCCGAAATTGAAAGCATTCTAAAGATAGATTGTGGTGGCGAAAAAATATGGCCAAAGGGCGGATTACGTTATGGGTTTTCACAGCACTATAAATTTCGAAGTCAGAAGTCTTATTTTTCACAAATAAAAAAAACAAAAAAAAAGAAGTCAATCTGGTGGGTTAATATAATTCAAGTCACCGTCCATTATGGCCATCCCGGAGAGATCGCACGCCGCCGCCGCCGCTCGTCGGTTAATAATTCTAGGCATGGCATGGCTCTCCTGTATGGCCTGGTGCAGCTCCGCCGTTGCACCTAACTTTTTTGGTGACTTCTCCGACGGTCGTGGTCGTTCCCTCGCTGCGGCTGCACCGGCTACTCCGGCTAAGGCTGGGGCCGCTCAGGCTGGGATTGCTCCTGAAGCCGCTAAGGTTGGGGCCGCTCCTGAAGCCGCTCCCGCTGGGGCCGCTCCTGAAGCCGCTAAGGATGGGGCCGCTAAGGCTGGAGCGGCTCCTGCAGCCGCTCCTGCTGGGGCCGCTCCTGCCGGTGCCGCCTCGGGCGGGAAGGTTATCGATGTTAAAGCCCATGGCGCCGTACCGGATGGCAAGAAAGTTAGCACACAGGTAAGATAATTGTTTACCATAATGATGCCAACTCAAAAGCTTAAGGCTTAATTGATGGGTTAATTTATTTAATTCATATATACATATCTCAACATTAAACGTGAGCACGAATTGGGTTGAAAATATACAGGCATTCATGAACGCGTGGGTTGAAGCATGTCGTTCAACTGGACCAACAAAACTGCTTTTCTCGGCAGGGACGTTTCTTATCGGACCAGTGGTATTTGCCGGGCCATGCACCGCGTCACCCATGACTGTCGAGATTCAGGGAACTGTCAAAGCTACCACAGATCTTTCTGAATATTCTGGTCCGGATTGGATTCTGTTCGAATCTGTGAACGATCTGACGATCACCGGGAGTGGAACCTTCGACGGGCAAGGTCAGGAAGTATGGAAGTTCAACGATTGTAGTCAAAATCCCCGTTGTGTACTTCTGGCGCACACAATCAAGTTAAACAAGGTGAAAAAAGGGTTGGTAGAGCACGTTTCTTCAGTGAACGCCAAAGCCTTCCATTTCTTCTTGTTTGCTTGCAATGA

mRNA sequence

ATGGCCATCCCGGAGAGATCGCACGCCGCCGCCGCCGCTCGTCGGTTAATAATTCTAGGCATGGCATGGCTCTCCTGTATGGCCTGGTGCAGCTCCGCCGTTGCACCTAACTTTTTTGGTGACTTCTCCGACGGTCGTGGTCGTTCCCTCGCTGCGGCTGCACCGGCTACTCCGGCTAAGGCTGGGGCCGCTCAGGCTGGGATTGCTCCTGAAGCCGCTAAGGTTGGGGCCGCTCCTGAAGCCGCTCCCGCTGGGGCCGCTCCTGAAGCCGCTAAGGATGGGGCCGCTAAGGCTGGAGCGGCTCCTGCAGCCGCTCCTGCTGGGGCCGCTCCTGCCGGTGCCGCCTCGGGCGGGAAGGTTATCGATGTTAAAGCCCATGGCGCCGTACCGGATGGCAAGAAAGTTAGCACACAGGCATTCATGAACGCGTGGGTTGAAGCATGTCGTTCAACTGGACCAACAAAACTGCTTTTCTCGGCAGGGACGTTTCTTATCGGACCAGTGGTATTTGCCGGGCCATGCACCGCGTCACCCATGACTGTCGAGATTCAGGGAACTGTCAAAGCTACCACAGATCTTTCTGAATATTCTGGTCCGGATTGGATTCTGTTCGAATCTGTGAACGATCTGACGATCACCGGGAGTGGAACCTTCGACGGGCAAGGTCAGGAAGTATGGAAGTTCAACGATTGTAGTCAAAATCCCCGTTGTGTACTTCTGGCGCACACAATCAAGTTAAACAAGGTGAAAAAAGGGGTTGGTAGAGCACGTTTCTTCAGTGAACGCCAAAGCCTTCCATTTCTTCTTGTTTGCTTGCAATGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCCATCCCGGAGAGATCGCACGCCGCCGCCGCCGCTCGTCGGTTAATAATTCTAGGCATGGCATGGCTCTCCTGTATGGCCTGGTGCAGCTCCGCCGTTGCACCTAACTTTTTTGGTGACTTCTCCGACGGTCGTGGTCGTTCCCTCGCTGCGGCTGCACCGGCTACTCCGGCTAAGGCTGGGGCCGCTCAGGCTGGGATTGCTCCTGAAGCCGCTAAGGTTGGGGCCGCTCCTGAAGCCGCTCCCGCTGGGGCCGCTCCTGAAGCCGCTAAGGATGGGGCCGCTAAGGCTGGAGCGGCTCCTGCAGCCGCTCCTGCTGGGGCCGCTCCTGCCGGTGCCGCCTCGGGCGGGAAGGTTATCGATGTTAAAGCCCATGGCGCCGTACCGGATGGCAAGAAAGTTAGCACACAGGCATTCATGAACGCGTGGGTTGAAGCATGTCGTTCAACTGGACCAACAAAACTGCTTTTCTCGGCAGGGACGTTTCTTATCGGACCAGTGGTATTTGCCGGGCCATGCACCGCGTCACCCATGACTGTCGAGATTCAGGGAACTGTCAAAGCTACCACAGATCTTTCTGAATATTCTGGTCCGGATTGGATTCTGTTCGAATCTGTGAACGATCTGACGATCACCGGGAGTGGAACCTTCGACGGGCAAGGTCAGGAAGTATGGAAGTTCAACGATTGTAGTCAAAATCCCCGTTGTGTACTTCTGGCGCACACAATCAAGTTAAACAAGGTGAAAAAAGGGGTTGGTAGAGCACGTTTCTTCAGTGAACGCCAAAGCCTTCCATTTCTTCTTGTTTGCTTGCAATGA

Protein sequence

MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAKAGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLLAHTIKLNKVKKGVGRARFFSERQSLPFLLVCLQ

Homology

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. NCBI nr
Match: XP_022153883.1 (polygalacturonase ADPG2-like [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 473.8 bits (1218), Expect = 1.0e-129
Identity = 252/253 (99.60%), Postives = 253/253 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 1   MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK 60
           MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK
Sbjct: 1   MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK 60

Query: 61  AGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKV 120
           AGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKV
Sbjct: 61  AGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKV 120

Query: 121 IDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT 180
           IDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT
Sbjct: 121 IDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT 180

Query: 181 VEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLL 240
           VEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLL
Sbjct: 181 VEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLL 240

Query: 241 AHTIKLNKVKKGV 254
           AHTIKLNKVKKG+
Sbjct: 241 AHTIKLNKVKKGL 253

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. NCBI nr
Match: XP_022153873.1 (exopolygalacturonase clone GBGE184-like [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 418.7 bits (1075), Expect = 3.9e-113
Identity = 230/270 (85.19%), Postives = 238/270 (88.15%), Query Frame = 0


Query: 1   MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK 60
           MAIPER HAAAAARRLIILGMA LSCMAWCSSAVAPNFFGDFS+GRGRSLAAAAPA PAK
Sbjct: 1   MAIPERFHAAAAARRLIILGMACLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSNGRGRSLAAAAPAAPAK 60

Query: 61  AGAA---------QAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPA-------- 120
           AGAA         + G APEAAK GAAP+AAP GAAP+AA  GAAKAG APA        
Sbjct: 61  AGAAPEAXPAGDNKTGAAPEAAKAGAAPDAAPVGAAPDAAPAGAAKAGLAPAAAGATPVG 120

Query: 121 AAPAGAAPAGAASGGKVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTF 180
           AAP GAAPAGAASGGKVIDVK HGA+PDGKKVSTQAFM AWVEACRSTGPT LLF AGTF
Sbjct: 121 AAPVGAAPAGAASGGKVIDVKVHGAIPDGKKVSTQAFMKAWVEACRSTGPTTLLFPAGTF 180

Query: 181 LIGPVVFAGPCTASPMTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQ 240
           LIGPVVFAGPCTASPMTVEIQGTVKATTD+SEYSGPDWILFES+NDLTITGSGTFDGQGQ
Sbjct: 181 LIGPVVFAGPCTASPMTVEIQGTVKATTDISEYSGPDWILFESINDLTITGSGTFDGQGQ 240

Query: 241 EVWKFNDCSQNPRCVLLAHTIKLNKVKKGV 254
           EVWKFNDCSQNPRCVLLAHTIKLNKVKKG+
Sbjct: 241 EVWKFNDCSQNPRCVLLAHTIKLNKVKKGL 270

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. NCBI nr
Match: XP_022146404.1 (exopolygalacturonase-like [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 7.8e-90
Identity = 183/253 (72.33%), Postives = 189/253 (74.70%), Query Frame = 0


Query: 1   MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK 60
           MAIPER HAAAAARRLIILGMA LSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSL  AAP     
Sbjct: 1   MAIPERFHAAAAARRLIILGMACLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLLEAAP----- 60

Query: 61  AGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKV 120
                                                      AAPAGAAP     GGKV
Sbjct: 61  -------------------------------------------AAPAGAAP----GGGKV 120

Query: 121 IDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT 180
           IDVK HGAVPDGKK STQAFM AWVEAC STGPTKLLF AGTFLIGPVVFAGPCTASPMT
Sbjct: 121 IDVKVHGAVPDGKKDSTQAFMKAWVEACHSTGPTKLLFPAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT 180

Query: 181 VEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLL 240
           VEIQGTVK +TD+S+YSGPDWILFES+NDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNP CVLL
Sbjct: 181 VEIQGTVKGSTDVSQYSGPDWILFESINDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPNCVLL 201

Query: 241 AHTIKLNKVKKGV 254
           AH+IKLNKVKKG+
Sbjct: 241 AHSIKLNKVKKGL 201

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. NCBI nr
Match: XP_038899827.1 (exopolygalacturonase clone GBGE184 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 230.3 bits (586), Expect = 1.9e-56
Identity = 124/253 (49.01%), Postives = 151/253 (59.68%), Query Frame = 0


Query: 1   MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK 60
           MAIPER H A  A R ++LG+AWLSCMAWCSSAVAP+++GDF+  +GR L  AAPATP  
Sbjct: 1   MAIPERFHIATTAVRGLVLGLAWLSCMAWCSSAVAPDYYGDFAGIKGRFLVGAAPATP-- 60

Query: 61  AGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKV 120
                                                    P A              KV
Sbjct: 61  ----------------------------------------TPTA--------------KV 120

Query: 121 IDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT 180
            D++ +GA  DG  +STQAFM  WV AC S GP K++F AGTFL GP+V+AGPC   PMT
Sbjct: 121 FDIRTYGAKADGTTISTQAFMQTWVAACHSGGPAKVVFPAGTFLTGPLVYAGPCD-GPMT 180

Query: 181 VEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLL 240
           VEIQGTVKATTD++EYS  +WILFES+  L++ GSGTFDGQG E W +NDC ++ RCVL 
Sbjct: 181 VEIQGTVKATTDITEYSSAEWILFESITGLSLIGSGTFDGQGAETWMYNDCRKHSRCVLP 196

Query: 241 AHTIKLNKVKKGV 254
             +IK NKV  G+
Sbjct: 241 PTSIKFNKVTNGL 196

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. NCBI nr
Match: XP_022953710.1 (exopolygalacturonase clone GBGE184 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 212.6 bits (540), Expect = 4.2e-51
Identity = 119/255 (46.67%), Postives = 146/255 (57.25%), Query Frame = 0


Query: 1   MAIPERSH--AAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATP 60
           MAI  R H   AA+A R ++LG+AWLSC+A CSS  AP+F GDF   RGR LA  AP+TP
Sbjct: 1   MAIAGRFHIAVAASAVRGVVLGLAWLSCVARCSSTPAPHFSGDFLPLRGRFLANTAPSTP 60

Query: 61  AKAGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGG 120
           +                                                         G 
Sbjct: 61  S----------------------------------------------------TPTTPGT 120

Query: 121 KVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASP 180
           KV D+  +GA  DGKK++TQAFM AWVEAC S GP K++F  G FL GP+V+AGPC A P
Sbjct: 121 KVFDITTYGAKSDGKKINTQAFMKAWVEACHSGGPAKVVFPPGKFLTGPLVYAGPCDA-P 180

Query: 181 MTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCV 240
           MTVEIQGTV ATTD++EYS P WILFES+  L + G+GTFDGQGQE W +NDC  NP C+
Sbjct: 181 MTVEIQGTVLATTDITEYSSPVWILFESITGLNLIGNGTFDGQGQETWMYNDCRDNPSCI 202

Query: 241 LLAHTIKLNKVKKGV 254
           +   ++K NKV  G+
Sbjct: 241 MPPTSLKFNKVTNGL 202

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P49062 (Exopolygalacturonase clone GBGE184 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PGA3 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 5.7e-27
Identity = 63/139 (45.32%), Postives = 88/139 (63.31%), Query Frame = 0


Query: 114 AASGGK--VIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFA 173
           AA+ G   V D+   GAV DG   + +AF+N W++ C S  P  LL   GTFL GPV+FA
Sbjct: 43  AANSGNPTVYDITKFGAVGDGSTNTFKAFLNTWIQVCDSPVPATLLVPKGTFLAGPVIFA 102

Query: 174 GPCTASPMTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDC 233
           GPC  S +TV + GT+ ATT  S Y+ P+W LFE V++L +TG+GTF G+G+ VWK + C
Sbjct: 103 GPC-KSKVTVNVIGTIIATT--SGYATPEWFLFERVDNLVLTGTGTFHGKGEAVWKADGC 162

Query: 234 SQNPRCVLLAHTIKLNKVK 251
            +  +C L   ++K   +K
Sbjct: 163 GKKVQCNLPPTSLKFRNMK 178

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6H9K0 (Exopolygalacturonase (Fragment) OS=Platanus acerifolia OX=140101 GN=plaa2 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 109.0 bits (271), Expect = 8.6e-23
Identity = 54/143 (37.76%), Postives = 78/143 (54.55%), Query Frame = 0


Query: 113 GAASGGKVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAG 172
           G  S G V +V  +GA   G    +QA M AW  AC S GP+ +L   G + +G V   G
Sbjct: 2   GVQSSGSVFNVNDYGA--KGAGDISQAVMKAWKAACASQGPSTVLIPKGNYNMGEVAMQG 61

Query: 173 PCTASPMTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCS 232
           PC  S +  +I G VKA  D S++    W+ F  ++ LT++G+GT DGQGQ  W  N+C 
Sbjct: 62  PCKGSKIGFQIDGVVKAPADPSKFKSDGWVSFYRIDGLTVSGTGTLDGQGQTAWAKNNCD 121

Query: 233 QNPRCVLLAHTIKLNKVKKGVGR 256
           +NP C   A  ++ + +K  + R
Sbjct: 122 KNPNCKHAAMNLRFDFLKHAMVR 142

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P35339 (Exopolygalacturonase OS=Zea mays OX=4577 GN=PG2C PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 9.5e-22
Identity = 56/142 (39.44%), Postives = 79/142 (55.63%), Query Frame = 0


Query: 112 AGAASGGKVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFA 171
           A A+  G   D+   GA  +GK  ST+A   AW  AC  TG   +L   G FL+GP+ F 
Sbjct: 32  AKASGPGGSFDITKLGASGNGKTDSTKAVQEAWASACGGTGKQTILIPKGDFLVGPLNFT 91

Query: 172 GPCTASPMTVEIQGTVKATTDLSEYSG-PDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFND 231
           GPC    +T+++ G + ATTDLS+Y    +WI    V++L ITG G  DGQG  VW  N 
Sbjct: 92  GPCKGD-VTIQVNGNLLATTDLSQYKDHGNWIEILRVDNLVITGKGKLDGQGPAVWSKNS 151

Query: 232 CSQNPRCVLLAHTIKLNKVKKG 253
           C +   C +L +++ ++ V  G
Sbjct: 152 CVKKYDCKILPNSLVMDFVNNG 172

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P26216 (Exopolygalacturonase OS=Zea mays OX=4577 GN=PG1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 104.0 bits (258), Expect = 2.8e-21
Identity = 55/142 (38.73%), Postives = 79/142 (55.63%), Query Frame = 0


Query: 112 AGAASGGKVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFA 171
           A A+  G   D+   GA  +GK  ST+A   AW  AC  TG   +L   G FL+G + F 
Sbjct: 32  AKASGPGGSFDITKLGASGNGKTDSTKAVQEAWASACGGTGKQTILIPKGDFLVGQLNFT 91

Query: 172 GPCTASPMTVEIQGTVKATTDLSEYSG-PDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFND 231
           GPC    +T+++ G + ATTDLS+Y    +WI    V++L ITG G  DGQG  VW  N 
Sbjct: 92  GPCKGD-VTIQVDGNLLATTDLSQYKDHGNWIEILRVDNLVITGKGNLDGQGPAVWSKNS 151

Query: 232 CSQNPRCVLLAHTIKLNKVKKG 253
           C++   C +L +++ ++ V  G
Sbjct: 152 CTKKYDCKILPNSLVMDFVNNG 172

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P35338 (Exopolygalacturonase OS=Zea mays OX=4577 GN=PG9 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 103.6 bits (257), Expect = 3.6e-21
Identity = 55/142 (38.73%), Postives = 79/142 (55.63%), Query Frame = 0


Query: 112 AGAASGGKVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFA 171
           A A+  G   D+   GA  +GK  ST+A   AW  AC  TG   +L   G FL+G + F 
Sbjct: 32  AKASGPGGSFDITKLGASGNGKTDSTKAVQEAWASACGGTGKQTILIPKGDFLVGQLNFT 91

Query: 172 GPCTASPMTVEIQGTVKATTDLSEY-SGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFND 231
           GPC    +T+++ G + ATTDLS+Y    +WI    V++L ITG G  DGQG  VW  N 
Sbjct: 92  GPCKGD-VTIQVDGNLLATTDLSQYKEHGNWIEILRVDNLVITGKGNLDGQGPAVWSKNS 151

Query: 232 CSQNPRCVLLAHTIKLNKVKKG 253
           C++   C +L +++ ++ V  G
Sbjct: 152 CTKKYDCKILPNSLVMDFVNNG 172

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DIR2 (polygalacturonase ADPG2-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021293 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 473.8 bits (1218), Expect = 4.9e-130
Identity = 252/253 (99.60%), Postives = 253/253 (100.00%), Query Frame = 0


Query: 1   MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK 60
           MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK
Sbjct: 1   MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK 60

Query: 61  AGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKV 120
           AGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKV
Sbjct: 61  AGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKV 120

Query: 121 IDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT 180
           IDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT
Sbjct: 121 IDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT 180

Query: 181 VEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLL 240
           VEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLL
Sbjct: 181 VEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLL 240

Query: 241 AHTIKLNKVKKGV 254
           AHTIKLNKVKKG+
Sbjct: 241 AHTIKLNKVKKGL 253

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DIQ4 (exopolygalacturonase clone GBGE184-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021282 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 418.7 bits (1075), Expect = 1.9e-113
Identity = 230/270 (85.19%), Postives = 238/270 (88.15%), Query Frame = 0


Query: 1   MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK 60
           MAIPER HAAAAARRLIILGMA LSCMAWCSSAVAPNFFGDFS+GRGRSLAAAAPA PAK
Sbjct: 1   MAIPERFHAAAAARRLIILGMACLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSNGRGRSLAAAAPAAPAK 60

Query: 61  AGAA---------QAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPA-------- 120
           AGAA         + G APEAAK GAAP+AAP GAAP+AA  GAAKAG APA        
Sbjct: 61  AGAAPEAXPAGDNKTGAAPEAAKAGAAPDAAPVGAAPDAAPAGAAKAGLAPAAAGATPVG 120

Query: 121 AAPAGAAPAGAASGGKVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTF 180
           AAP GAAPAGAASGGKVIDVK HGA+PDGKKVSTQAFM AWVEACRSTGPT LLF AGTF
Sbjct: 121 AAPVGAAPAGAASGGKVIDVKVHGAIPDGKKVSTQAFMKAWVEACRSTGPTTLLFPAGTF 180

Query: 181 LIGPVVFAGPCTASPMTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQ 240
           LIGPVVFAGPCTASPMTVEIQGTVKATTD+SEYSGPDWILFES+NDLTITGSGTFDGQGQ
Sbjct: 181 LIGPVVFAGPCTASPMTVEIQGTVKATTDISEYSGPDWILFESINDLTITGSGTFDGQGQ 240

Query: 241 EVWKFNDCSQNPRCVLLAHTIKLNKVKKGV 254
           EVWKFNDCSQNPRCVLLAHTIKLNKVKKG+
Sbjct: 241 EVWKFNDCSQNPRCVLLAHTIKLNKVKKGL 270

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CY21 (exopolygalacturonase-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015625 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 3.8e-90
Identity = 183/253 (72.33%), Postives = 189/253 (74.70%), Query Frame = 0


Query: 1   MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK 60
           MAIPER HAAAAARRLIILGMA LSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSL  AAP     
Sbjct: 1   MAIPERFHAAAAARRLIILGMACLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLLEAAP----- 60

Query: 61  AGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKV 120
                                                      AAPAGAAP     GGKV
Sbjct: 61  -------------------------------------------AAPAGAAP----GGGKV 120

Query: 121 IDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT 180
           IDVK HGAVPDGKK STQAFM AWVEAC STGPTKLLF AGTFLIGPVVFAGPCTASPMT
Sbjct: 121 IDVKVHGAVPDGKKDSTQAFMKAWVEACHSTGPTKLLFPAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT 180

Query: 181 VEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLL 240
           VEIQGTVK +TD+S+YSGPDWILFES+NDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNP CVLL
Sbjct: 181 VEIQGTVKGSTDVSQYSGPDWILFESINDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPNCVLL 201

Query: 241 AHTIKLNKVKKGV 254
           AH+IKLNKVKKG+
Sbjct: 241 AHSIKLNKVKKGL 201

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GQF2 (exopolygalacturonase clone GBGE184 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456159 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 212.6 bits (540), Expect = 2.0e-51
Identity = 119/255 (46.67%), Postives = 146/255 (57.25%), Query Frame = 0


Query: 1   MAIPERSH--AAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATP 60
           MAI  R H   AA+A R ++LG+AWLSC+A CSS  AP+F GDF   RGR LA  AP+TP
Sbjct: 1   MAIAGRFHIAVAASAVRGVVLGLAWLSCVARCSSTPAPHFSGDFLPLRGRFLANTAPSTP 60

Query: 61  AKAGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGG 120
           +                                                         G 
Sbjct: 61  S----------------------------------------------------TPTTPGT 120

Query: 121 KVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASP 180
           KV D+  +GA  DGKK++TQAFM AWVEAC S GP K++F  G FL GP+V+AGPC A P
Sbjct: 121 KVFDITTYGAKSDGKKINTQAFMKAWVEACHSGGPAKVVFPPGKFLTGPLVYAGPCDA-P 180

Query: 181 MTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCV 240
           MTVEIQGTV ATTD++EYS P WILFES+  L + G+GTFDGQGQE W +NDC  NP C+
Sbjct: 181 MTVEIQGTVLATTDITEYSSPVWILFESITGLNLIGNGTFDGQGQETWMYNDCRDNPSCI 202

Query: 241 LLAHTIKLNKVKKGV 254
           +   ++K NKV  G+
Sbjct: 241 MPPTSLKFNKVTNGL 202

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9C4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G404800 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 207.2 bits (526), Expect = 8.6e-50
Identity = 117/253 (46.25%), Postives = 145/253 (57.31%), Query Frame = 0


Query: 1   MAIPERSHAAAAARRLIILGMAWLSCMAWCSSAVAPNFFGDFSDGRGRSLAAAAPATPAK 60
           M IPER H AA   R ++LG+  LS M WCSSA AP++ GDF   R R L  AAPAT   
Sbjct: 1   MTIPERFHVAAV--RGLVLGLTLLSSMVWCSSAAAPHYSGDFFGTRSRFLTGAAPATTTT 60

Query: 61  AGAAQAGIAPEAAKVGAAPEAAPAGAAPEAAKDGAAKAGAAPAAAPAGAAPAGAASGGKV 120
                                                    P A              KV
Sbjct: 61  T--------------------------------------TTPTA--------------KV 120

Query: 121 IDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTASPMT 180
            ++ AHGA  DG+  STQAFM AWV+AC S+GP K++F  GTFL GP+V+AGPC   PMT
Sbjct: 121 FNIIAHGAKADGRTDSTQAFMQAWVKACHSSGPAKVVFPPGTFLTGPLVYAGPCD-GPMT 180

Query: 181 VEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRCVLL 240
           VEIQGTVKATTD+S+YS  +WILFESV  L + G GTFDGQG + WK+NDCS++P+C++ 
Sbjct: 181 VEIQGTVKATTDISQYSSAEWILFESVTGLNLIGRGTFDGQGADTWKYNDCSKHPQCIIP 198

Query: 241 AHTIKLNKVKKGV 254
             +IK NKV +G+
Sbjct: 241 PTSIKFNKVTQGL 198

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. TAIR 10
Match: AT1G02790.1 (polygalacturonase 4 )

HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 4.1e-28
Identity = 63/139 (45.32%), Postives = 88/139 (63.31%), Query Frame = 0


Query: 114 AASGGK--VIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEACRSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFA 173
           AA+ G   V D+   GAV DG   + +AF+N W++ C S  P  LL   GTFL GPV+FA
Sbjct: 43  AANSGNPTVYDITKFGAVGDGSTNTFKAFLNTWIQVCDSPVPATLLVPKGTFLAGPVIFA 102

Query: 174 GPCTASPMTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDC 233
           GPC  S +TV + GT+ ATT  S Y+ P+W LFE V++L +TG+GTF G+G+ VWK + C
Sbjct: 103 GPC-KSKVTVNVIGTIIATT--SGYATPEWFLFERVDNLVLTGTGTFHGKGEAVWKADGC 162

Query: 234 SQNPRCVLLAHTIKLNKVK 251
            +  +C L   ++K   +K
Sbjct: 163 GKKVQCNLPPTSLKFRNMK 178

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. TAIR 10
Match: AT2G15460.1 (Pectin lyase-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 1.5e-25
Identity = 57/127 (44.88%), Postives = 77/127 (60.63%), Query Frame = 0


Query: 119 KVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEAC-RSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTAS 178
           KV +V+ HGA PDGK  +  AF + W  AC R +G +K+    GTF +G V F GPC  +
Sbjct: 29  KVFNVQRHGAKPDGKTDNANAFTSIWSRACKRISGSSKIYVPKGTFYLGGVEFVGPC-KN 88

Query: 179 PMTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRC 238
           P+   I GT+ A  + S+     WI F  +N+L+I+GSGT DGQG++ W  NDC  NP C
Sbjct: 89  PIEFIIDGTLLAPANPSDIKQDTWINFRYINNLSISGSGTLDGQGKQSWPHNDCHTNPNC 148

Query: 239 VLLAHTI 245
             LA T+
Sbjct: 149 PKLAMTM 154

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. TAIR 10
Match: AT2G15450.1 (Pectin lyase-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 1.5e-25
Identity = 57/127 (44.88%), Postives = 77/127 (60.63%), Query Frame = 0


Query: 119 KVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEAC-RSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTAS 178
           KV +V+ HGA PDGK  +  AF + W  AC R +G +K+    GTF +G V F GPC  +
Sbjct: 29  KVFNVQRHGAKPDGKTDNANAFTSIWSRACKRISGSSKIYVPKGTFYLGGVEFVGPC-KN 88

Query: 179 PMTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRC 238
           P+   I GT+ A  + S+     WI F  +N+L+I+GSGT DGQG++ W  NDC  NP C
Sbjct: 89  PIEFIIDGTLLAPANPSDIKQDTWINFRYINNLSISGSGTLDGQGKQSWPHNDCHTNPNC 148

Query: 239 VLLAHTI 245
             LA T+
Sbjct: 149 PKLAMTM 154

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. TAIR 10
Match: AT2G26620.1 (Pectin lyase-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 113.2 bits (282), Expect = 3.2e-25
Identity = 55/124 (44.35%), Postives = 77/124 (62.10%), Query Frame = 0


Query: 119 KVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEAC-RSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTAS 178
           KV +V+ HG+ PDGK  +T AF + W  AC R +G +K+    GTF +G V F GPC  +
Sbjct: 29  KVFNVQRHGSKPDGKTDNTNAFTSIWSRACKRISGSSKIYVPKGTFYLGGVEFVGPC-KN 88

Query: 179 PMTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRC 238
           P+   I GT+ A  + ++     WI F  +N+L+I+GSGT DGQG++ W  NDC +NP C
Sbjct: 89  PIEFIIDGTLLAPANPNDIKQDTWINFRYINNLSISGSGTLDGQGKQSWPLNDCHKNPNC 148

Query: 239 VLLA 242
             LA
Sbjct: 149 PKLA 151

[Close]

BLAST of Moc09g06710 vs. TAIR 10
Match: AT4G13760.1 (Pectin lyase-like superfamily protein )

HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 7.2e-25
Identity = 54/127 (42.52%), Postives = 77/127 (60.63%), Query Frame = 0


Query: 119 KVIDVKAHGAVPDGKKVSTQAFMNAWVEAC-RSTGPTKLLFSAGTFLIGPVVFAGPCTAS 178
           K+ +V+ HG+  DGK  +T  F + W  AC R +G +K+    GTF +G V F GPC  +
Sbjct: 29  KMFNVQRHGSKSDGKTDNTNVFTSVWNRACRRKSGSSKIYVPKGTFYLGGVEFVGPC-KN 88

Query: 179 PMTVEIQGTVKATTDLSEYSGPDWILFESVNDLTITGSGTFDGQGQEVWKFNDCSQNPRC 238
           P+   I GT+ A  + +      WI F+ +NDL+I+GSGT DGQG++ W  NDC +NP C
Sbjct: 89  PIEFLIDGTLLAPANPNNIKQDTWIKFKYINDLSISGSGTLDGQGKQSWPLNDCHKNPNC 148

Query: 239 VLLAHTI 245
             LA T+
Sbjct: 149 PKLAMTM 154

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Moc09g06710 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022153883.1	1.0e-129	99.60	polygalacturonase ADPG2-like [Momordica charantia]	[more]
XP_022153873.1	3.9e-113	85.19	exopolygalacturonase clone GBGE184-like [Momordica charantia]	[more]
XP_022146404.1	7.8e-90	72.33	exopolygalacturonase-like [Momordica charantia]	[more]
XP_038899827.1	1.9e-56	49.01	exopolygalacturonase clone GBGE184 [Benincasa hispida]	[more]
XP_022953710.1	4.2e-51	46.67	exopolygalacturonase clone GBGE184 [Cucurbita moschata]	[more]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
P49062	5.7e-27	45.32	Exopolygalacturonase clone GBGE184 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PGA3 PE=2 ...	[more]
Q6H9K0	8.6e-23	37.76	Exopolygalacturonase (Fragment) OS=Platanus acerifolia OX=140101 GN=plaa2 PE=1 S...	[more]
P35339	9.5e-22	39.44	Exopolygalacturonase OS=Zea mays OX=4577 GN=PG2C PE=2 SV=1	[more]
P26216	2.8e-21	38.73	Exopolygalacturonase OS=Zea mays OX=4577 GN=PG1 PE=1 SV=1	[more]
P35338	3.6e-21	38.73	Exopolygalacturonase OS=Zea mays OX=4577 GN=PG9 PE=2 SV=1	[more]

BLAST of Moc09g06710 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1DIR2	4.9e-130	99.60	polygalacturonase ADPG2-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021293 PE=3...	[more]
A0A6J1DIQ4	1.9e-113	85.19	exopolygalacturonase clone GBGE184-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111...	[more]
A0A6J1CY21	3.8e-90	72.33	exopolygalacturonase-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015625 PE=3 SV...	[more]
A0A6J1GQF2	2.0e-51	46.67	exopolygalacturonase clone GBGE184 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111456159...	[more]
A0A0A0K9C4	8.6e-50	46.25	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G404800 PE=3 SV=1	[more]

BLAST of Moc09g06710 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G02790.1	4.1e-28	45.32	polygalacturonase 4	[more]
AT2G15460.1	1.5e-25	44.88	Pectin lyase-like superfamily protein	[more]
AT2G15450.1	1.5e-25	44.88	Pectin lyase-like superfamily protein	[more]
AT2G26620.1	3.2e-25	44.35	Pectin lyase-like superfamily protein	[more]
AT4G13760.1	7.2e-25	42.52	Pectin lyase-like superfamily protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR012334	Pectin lyase fold	GENE3D	2.160.20.10		coord: 107..251 e-value: 1.6E-28 score: 101.7
IPR000743	Glycoside hydrolase, family 28	PFAM	PF00295	Glyco_hydro_28	coord: 148..251 e-value: 6.6E-15 score: 55.0
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31375:SF158	POLYGALACTURONASE	coord: 16..253
None	No IPR available	PANTHER	PTHR31375	FAMILY NOT NAMED	coord: 16..253
None	No IPR available	PROSITE	PS51257	PROKAR_LIPOPROTEIN	coord: 1..26 score: 5.0
IPR011050	Pectin lyase fold/virulence factor	SUPERFAMILY	51126	Pectin lyase-like	coord: 114..240

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Moc09g06710.1	Moc09g06710.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0005975	carbohydrate metabolic process
molecular_function	GO:0004650	polygalacturonase activity