Moc07g02530 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAACTCCGCCGCTATGTCACCGCGCCGCCGCAGAACCCGCCGGACGCTTCCCTTCCCCGAGGAGCCGCCCGCTGCCGCCGCCGCCGTGGTTTCAGAGACGCCGCACAATGGTGAGTACTTATGAACCAATCCTTTAAATTGAATGATGATTTAAATTCCACATCTTTTTACTTTTACTTTTTAGTCAAAAATATATATACATTTTTTTTTTGAGAAATAAAATTTTTTTTTTTTAACATAGAGAATGTTGAACTATGTTCGTATTATTAATATGAAAATTTTCGATGGAGTTAATAGGTTGGAATGCTATTTTTATTAGCAATCTATGTATTGGATGTTGCGAGATAATTTATTTATTTTTAAATAAAATATAATAACTTTTTAAATTATTTGTCGGATATTACAAATATAAGGTTTCATTTTGTAAAAGAAAAATTAAAAAAATAGCAATAATGATTAATGAAAGTATATTACAAGCATCTTGCTTTGAAAAAATTTTGTTCTTAGAAATTAAGATTATTAATTATTATTATTCACTATCATATTTAGAAGAAAATAAATTAAGTCAAATTTAGAAAATGAAAAATATACTTTTTGTTTTCTCCTAATTATTTTTCTTATTTAAAAAAAAATGGATCAATTTGTTAAGATATCTATCTCGAATTAAAATGCTGTGGTTTTAAAAAAGAACAACTAGTTTCGAAAATCTATATTCTGTACTTTAAGTTCGTCGTTTTCAAAATAACTCCTAAAAACCAAAACATAAAATCAGTGTCAAATCAACTTTTATAATATAAAAACATACAGTAAAATACATCTCACATGTAATACACCTAAATATTTTTAGTACTTTTTTAAATATAAATATATCAAATAGTAATTCTCGATTTGGTGTTTAATATTTTAACATTCTCAATTTTACCATTGATTTATCTCCAACCAATAGGTTATGAGTTCGATCCCCTACTCCTACATGTTGTACTTAAAAAAATGTCGATGTAAATAGGTATTTAAGAAAAAAATTATAAAATAAAAAATTAATAAAAATATTAATATTAGTATTTTGTTGTCATATTAGTGCTATTTTCTATATTTTGTCTATTTTTGTTTTTGGCTACACTATATAAATGTCAATATTGAACCTTTAAACATGCAAAAATCTCGATGGATATCTAATATATATGTGCTTACAATTTTGAAGCGTTCCGGGTCGGGTCGACAGTAGGATCCGAGTGCGATGTCATCGACGGCCCAATAAGGGCCCGTAAAAGGACGGCCCACGAAAGCCCTAGCTGTGGCCATGCACTCGCTCTTCCCTCTTCCCCGCAGAGAGAGAAATTTTATTTTTTCTTCTCACGCCAGGCTCGATCTTCCCCCAGTCTTCGTCGTCTTCCTCGCATGGAGCTCGCTCACTCAACGTAATTTCTGCAATTTCAATCTGTTTCAACCACCATCGGTACCTTCTCCACACTCCTCCTCTCGTTTTTTCTTCGTTTCTCTCTCCCCATATTTCAATTGTTCGTTCATTTTCAGCTCGGAGAATGTTTACTACTGTGTGGTGAAAGTTGATCAGACTGTTTTTTGTTGTTTTTTTTTTTAATTGTTGAAGGCGGCGTGTTGCTGATGCTGGGGTGACAGAGTGGAAGCGTGGCAGAAGGAACCAAGGTTTGTTTAATAGCATGCAATGCAACTGCTGAATGTCTGCTATTATATATGCTTGCTCAAATGCTTAAATCATGGACAATATTTGGTTGATGAGAGATATTGCGCGGTATTTCGATGTTTTAAACTCATAATTAGCTTCTTATTCGTGGAATGTATGGTTCTTCGTAGCAGTCATACCATTAAGTATATGATCATACGAGGACATGAAAATTATTAAGGAAGTAAACACAAGTGATTAGTGGAGTTTGCACCTTATATATTTGTACCGAATCTCAGGTCCAGAGGGGATATTACTAGTGCACTTCAATTCAATGATCAAATCTACAACATTATTACCTCTGATAACCATTATTTTTAGGATAAGATTGACTAGAATATTTTTGTTACTGATTGAAGAAATAGATAGGCATAAGATTGAGACGTGCCCCTCTAGTCATGGTTAGGAATGTGGGTCTTGTGTAATAATTTGTGCCGTCTAGGTCTAGTCTTGGTACCTTTTCGTTGTTCATTATTGGGCTTTAATTACCTTTTCTATTTGGCTAATGGAGCAGAGGATATGTTATTGCACTTCCTCACCCTTTTATCATTGGTAATGTCTTGGTAACTTGCAAAATGTAATTATATTGCATAGTGGTTTTCTGACCATGATGTTGGTTGTATATCTTAAAATTTAAGAGATTATTCTTATGGAAATGGTTGTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAGAACAATTTCATTTATGAGATGTAATTACGGACAACAATGAAAACGAATGTTGACTAAAGCATTTTATTATATGTTTGTTTTCCAAGTCATTGGCTAAAGATTGATGAGGTTAATTACTTGTCAGGTTTTGTCTTCAAACGCATTCATGGGAAATTCTATCAATCCAATCTAGCTCTTGCATCACCCATGTATCCGAAACAAACTGGTTTAGGGGATGGACCAGTCTCCAGCCCACTACGCACAAGTGCTCGACCGAGGAGAAGGCCAATATCATATGGTCGTCCATATGTATATTATGGTTCTTCTACAACCTTCAAACCCAACAAGAAAAGGACACCAGCTACTAGAATTGCCAAGATGCTTCGTCCGAAGAAGCAATCCGTGCCTACTGCAAATGTTGTTGTGAGAACTACATCCTAGATCTTATTTCAATTCAAAAAGTCTCATTGACTTTGCGTTCAGCTAGAATAAATACTTGTTTAAGGTTAATCTCCTAGTTCCAACCATTTGAAAGATAGACGATCTTGTAAAAAAAAACACTCTTTGGAAATATGGCTGGATGGGAGAAAAAAATTTGAAAGCCAGACTCTCTTATATTTTTTTTACATTACAGCCAACTAAAGAGGCTTTTTGGTAATCTCAGTTGCCTCGAAAGAAGGATACTTGTTCCCTTTTATATTTTTTGTCTTTTTGGAGGAAGGCATCATCTTTAGAGGATTATAGGATTATGAAAGTGGAGTATATTATCTTTAAAATTTATTTTGAGTAGGTAGTATGGGTTGGCTTGTCTACCATTGGATGATAAACTGCTATGATAATATCTTCAAATGATATTTTGTATTTTAACCGAAGTGGTGTGTTTTGTGCAAATGGGAGGCTTATCTATTGATCACTTTCTTGATTGTAGTTACATGCTAACAGGAGCATTATTAATCCCCTATTATGTGAAAGTCTATGTTTTCTGTTTCCTTTGGTAGGTAGTTTTTTGATGGTCTATGTCACATTTGACTTGAAAGGAATATTAGTAGCTTGGAGGTGTAGAAGGTGTTTGGGAGGATCTTTTAACCTCACCCAATTTAATTCCTACTTTTGGGCTTATGCCTCATAAGTGTTTTTTTATGGGTGAACTTCCACCACCTTTTGTGTATTTTTATTTTTTTTATAAGAAACGAAACTTTCAATATCAAAAGGGAAAAATACAAAAGGAGGGTTATGATATCCCCGAATGCCCAAAGGTTACAAAAAAGACTCCCAATTGGCAAACATTTGAGTCACACCATAATTACAAAAAGGTTTATTAATAGAAGACCTCGAGGATACAAAAATTTGAACAAGCTCCCAAAATATGGCTCTATTGGAATCATCTTTGGGAAGATCCTTTTGTTTCTTCCATACCACACTCTCCACAGCAAACTAGCCACCGCATTGGACCATAGGATACTCGCTTGGCCTTTAAAATGTGTCCCAACTATGAGCTGAAGATACATAACAACTCTGCTCAACAAGCAGCTATGAAAGGGCAATTTAAAAAGAGGTGGGTTAAGTCTTCTCCACTATTTCTACAGAGAACACACCAATTAGAAGAGAGGTTCACTATGGGCATCAATTGCCGAAGTCTGCAGTATGTCATAAGCCTCTTTTTAGCAAAAATCCACTAGAATACATTAACTTTTTTGGAATTTCCAGCTGCCAAATAACATTCCCAATGCTAGGTTGCATCAATGCCTGATGATTAACTAGCTTAGGCATGAAAGATTTGAGCCGTCAAGAGTCCAGACTTTTACATCTTTATGATTGGTGGGAGCAAAATCTGCCAAGGTGTTTGAGAGTTCAAACCATTCCTCCACCTCCAAGCCTGAAAGATTTCTTTTGAAAAGTAGGTCCCAACCTCTTTGATTTTCAAACCAACATTGAGCTATCACCTGCTCTGAGTTGGTCACTCTAAATAATCTAGGAAAAGCATTGAGAACGTAGGAAAAGCATTGAGAAGAGATCCATTTAGGAGCCGTAGGTCTTTCTAAAAATGCACCTTATCCCCTTTGCCCACCTTGATTTTGTAAAATTCATCTGCATTGAAGTAGCGTTTGAGGACGTTAACCCATGAACCTCTGTGATTGCATCCTCCTTTAATAATCGGTCACCACTCATGGGATAACAGCTGGTCTTTGCTAGCTATAATTGATCTCCAAAGGGGGTGTCCCCTTTTCCATTAAGGACCACCATCCCTATTTTGCTAAAAGAGCAGTATTTTTTGTAGCCAAACGGCCTAAACCCACTCCAATCTAGTAGGCATAGCAGTAACCTCCCTACTAATAGGATTCCGGCCTCCTTCCTCCTTGTCGCCTTTCTAATAGAAGTTCCTGATTAGTCTTTCCCCAAGTATTTGAAGATTGAGAGGAAGTAGGGGGATGCTCGAAAGGACTTAGGTGGCCATCGTTAATTTGCCTCCTCTCGAAAGAAGAAGAGATTTCCAGCTTGGCAATTTCATTGCCACTTTCTCTTCAATAGTCTCCCAAAAAGCCAACTTATTAGCTCTACCTCCTAAAGCATACCCAGATAAGAAAAGGGCCAGGAACCTACCTCACCGCCCCAGTGGACAACACCTCC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Homology
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BLAST of Moc07g02530 vs. NCBI nr
Match: XP_038883970.1 (ATPase family AAA domain-containing protein At1g05910 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2115.1 bits (5479), Expect = 0.0e+00 Identity = 1087/1175 (92.51%), Postives = 1122/1175 (95.49%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. NCBI nr
Match: XP_023004398.1 (ATPase family AAA domain-containing protein At1g05910 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2072.0 bits (5367), Expect = 0.0e+00 Identity = 1066/1174 (90.80%), Postives = 1105/1174 (94.12%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. NCBI nr
Match: XP_023514122.1 (ATPase family AAA domain-containing protein At1g05910 isoform X6 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2068.5 bits (5358), Expect = 0.0e+00 Identity = 1069/1175 (90.98%), Postives = 1105/1175 (94.04%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. NCBI nr
Match: XP_022960329.1 (ATPase family AAA domain-containing protein At1g05910 isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2067.0 bits (5354), Expect = 0.0e+00 Identity = 1067/1175 (90.81%), Postives = 1104/1175 (93.96%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IAE9 (ATPase family AAA domain-containing protein At1g05910 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g05910 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1483.8 bits (3840), Expect = 0.0e+00 Identity = 804/1203 (66.83%), Postives = 944/1203 (78.47%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ULI0 (ATPase family AAA domain-containing protein 2B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATAD2B PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 4.7e-164 Identity = 381/870 (43.79%), Postives = 487/870 (55.98%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CDM1 (ATPase family AAA domain-containing protein 2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Atad2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 568.2 bits (1463), Expect = 3.2e-160 Identity = 312/690 (45.22%), Postives = 427/690 (61.88%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6PL18 (ATPase family AAA domain-containing protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ATAD2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 554.7 bits (1428), Expect = 3.6e-156 Identity = 364/903 (40.31%), Postives = 506/903 (56.04%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RDX4 (ATPase family AAA domain-containing protein 2 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=ATAD2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 553.5 bits (1425), Expect = 8.1e-156 Identity = 361/901 (40.07%), Postives = 506/901 (56.16%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DAI8 (ATPase family AAA domain-containing protein At1g05910 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018545 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2295.8 bits (5948), Expect = 0.0e+00 Identity = 1176/1182 (99.49%), Postives = 1176/1182 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KZD7 (ATPase family AAA domain-containing protein At1g05910 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497729 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2072.0 bits (5367), Expect = 0.0e+00 Identity = 1066/1174 (90.80%), Postives = 1105/1174 (94.12%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KQB3 (ATPase family AAA domain-containing protein At1g05910 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111497729 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2067.0 bits (5354), Expect = 0.0e+00 Identity = 1063/1174 (90.55%), Postives = 1103/1174 (93.95%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HAN4 (ATPase family AAA domain-containing protein At1g05910 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111461088 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2067.0 bits (5354), Expect = 0.0e+00 Identity = 1067/1175 (90.81%), Postives = 1104/1175 (93.96%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DWM8 (LOW QUALITY PROTEIN: ATPase family AAA domain-containing protein At1g05910 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488668 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2062.7 bits (5343), Expect = 0.0e+00 Identity = 1065/1176 (90.56%), Postives = 1109/1176 (94.30%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. TAIR 10
Match: AT1G05910.1 (cell division cycle protein 48-related / CDC48-related ) HSP 1 Score: 1483.8 bits (3840), Expect = 0.0e+00 Identity = 804/1203 (66.83%), Postives = 944/1203 (78.47%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. TAIR 10
Match: AT3G11470.1 (4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily ) HSP 1 Score: 320.9 bits (821), Expect = 6.3e-87 Identity = 159/293 (54.27%), Postives = 211/293 (72.01%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. TAIR 10
Match: AT3G11470.2 (4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily ) HSP 1 Score: 318.9 bits (816), Expect = 2.4e-86 Identity = 158/293 (53.92%), Postives = 211/293 (72.01%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. TAIR 10
Match: AT3G15120.1 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 283.1 bits (723), Expect = 1.4e-75 Identity = 157/320 (49.06%), Postives = 211/320 (65.94%), Query Frame = 0
BLAST of Moc07g02530 vs. TAIR 10
Match: AT2G02770.1 (4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily ) HSP 1 Score: 252.3 bits (643), Expect = 2.7e-66 Identity = 131/272 (48.16%), Postives = 175/272 (64.34%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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