Moc04g28640 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc04g28640
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr4: 21272050 .. 21277480 (+)
RNA-Seq ExpressionMoc04g28640
SyntenyMoc04g28640
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTAGGTTGGGGCCCATTTCTGAAGAACGTCATACGGCCATCGCCACAGAACTTGGCCGGCAGTCAGGAACTGGTCGGCGTCGATCATTCGAGTGGTCTACCCTCCGTGGATCAGGTCTCTGCACTCAGGTTGGGCTTTTGGATTTGGGCCTCTCTCATCTGGGCCCGTTTTGGATCTCTCATTTAGCTTCCTCGTGTCTGACTTTATCTCTCCATAATAGAAGTTAATACTTTTTTTGACCTTAAATTTTTGAAACTTTTTTTTAGTATTAATTTGATTCACGTACTTACGCTTCAATCTCTTTTTTTTTTTTTTGGTCTCGTAGCACTGCACTAAAAAAAATCTTAACATATTGTCATAACTTTATATTAAAGATTTTTATTGTTTATACGATATAGAATGTGTACGGATTTTTCAAACAAAGTAGTCACTTTTTAAATATAAAAGGATCAAATATACGTTAAGTCGACAAAAATTAAAAATATAAATAAATCAAAATAAATATTTTGCAAAATACAAAAATCAACACTAACACCAGTGAAAAATAGATGAATGATGGTATTAATTTAAAAATTTCATTCAATAATTTTTGATTTGAATGACTCTTAGTCTCTTCCTAGCACAAATGAACTACATTATTAATATCGTTTTTTCTTTCTTCTTTTATTTTCTTTTGATTTAAAATATATTATTATTTTCAGTACAATAAATATGAGAGTTAAGATTTGAACCTCTATCTTCGCGAGTAATTGATGTATTTTATTGTTGATATTCATGCTGCAGCCATCGTATTGTTAATATTGATGTCTGATATAATTATGGAAAAATATATATTACGTGATAAAATAAACATGGTGTTACTGCTAGGAGATACTGCACCCCACCACCTCTACCAATTTTATGTCGGCTTGAAAATATTTGCAGAAATTTCAAAGGTTCATTGGCTAATGATCAATATATACATAAATTCTTTCTTTTATAGATCTAAGAAGAATTTATTCAAATACTAGTCATTTTAGATTAAATACATGATTTTGATTACTAATTCATGTACTCATTTTTCAATTTCATCTCTAAAATCTTTAAAATATTTGGTTCCATCACTTAAATATTAAATTTAAATTATCTTTTACTAAATATTTTTGTAACTATTAACTAGATTATAAAAAGATACTTCATATTTAATTTAATAGATTTGACATGTCATATGCCAACTCATACTATAAAAAAATCTACCCCTCCACTTCACATGCAATATTATCTTGAGATGTGTAGTTCCATAAAAGATTACTCAAAATTTATGTATTAATTAATAGACAAAAGGAGAAAAAAAGGTTGTGTTTGCTTTGAAAGCATAGCTCTATCTAATTTATGTCTTCATTTTGTTTTTTTTCTGATACATTTTAAAAATATTTTCAAAATTTAAGCCGAATTTTGAAAGTTAAAGGAGTAGTAGTTTGAAAAAATTTATTTTTTCGTTTAACTAAGAATTCGAATATGTTTTTAGAAAACGTGAAAAACATATCTAAGAAAGGAGGAGAAAACAAACCTATATTTTAAAGACCAGAAATTAAAAAAGAAAAAAGAAAAATCAGATTTGGCTTTCATTCTATCACATGCCACAGTGACAATGGTTGAAAATGTTTGAAAACATATATAATTATACCTTTGATTAAAGTATTTTTTTCAAAAGATCCTTCTAGCCCAAGTTGCAATAGACAAATCTAGCATAATATTTCCCAATTTGGAGGGGTGGCTTTGGAGTAATTGATTTTAGTTTTGTCAACCAAATTCATGTAATTTTCACTTTCTTCATGAATTTTTCTCATCTTCTTGCCAAAAGAATAAAGGATGTCAAAAGCTTTAGGTTGTTGCGTTTTCATCATCTAAAATGAAATGTAAATTTTTACCTACTCAAATGCGAAGTGAACTCCAATATAACCAAAAACTAAAGTAACCAAACATTAAATCAAGAGTAAAACTTTGAACCTACATGATTTTGTTAGGAAAATAAAAAAGGTAGTTGAAACTAAGCAGGCTATTGGGTCGTGTGAGCACGACGGCTGCAACACTGACTTCACAACGTTAGAGATACAGTATCGCAGTGCTAGTGCTATGACGATAATTTATAAAAGCATCACTTTCTACTGGCTATTTTCAACCATAGAAACATAAGAAGTGTGTGTGGAGATCAAAGAGATAAAGAGTGTAAGCTTTGTTGCCACCATGTTCTCATGATTTCGTGTGACCCATTGTAATTTTCATATATATTCATAGTAGAATCTATTATTGTAAAAGAGACTACCTAAATGTAGTCACGTGTTTGGGGTGAACCAATGCATGCGTGTATAAATAATATATCATATTCACAGAATATATTATTATGCACGTCACTTTGCAATTAATGTACCTACTTTTCAAAGTCTAGTTTTGTTTTTAAAAGACAGGCCATCTTCACAAGCAGTCCTCCATTTTGGATTAAAGCTAGAGTTTGCAATTCCTTGAGAGAAAATTCAATCTGAAAATGAATTGCCTTTTCTTTATATAATCAAACATGACCAAGTAGGCCACTTGTCTTTGAAATTCACTTAATAATTGACATTTTAATTATTTAGGTAGATGGTTGTCAAAATCCCGTTTAATTTGCATCTTAAGTCAAGCTCAAGTCTCTCCATTTGGCCTTGTTGCCTAACTTTTGGTCTTACCATCATGGATTTAGAATTAAATAAAGTATTAATAATCTCACTTATGAAAGTTCGAATTTACCCTACTAATTTTCTGGTTTATGATTTCATGAAAGATTGTTTTTATTAAATACAAGATCAATATAGACAATAACACTATTTTCTTTTCTCCAGTAGTACAATAATGAATGATGAAGATTTGGACCTCTGAGTTTTAAACAAGTAAGTGATGTATTGGCAAGTTGAACTATATTATACATTTAATGAAATGTATAATGATTTATTGGAATATAAGATTTAGAACTTGTAGTTAAGCTTTTTTTTTTAGCATAAAATAATTAGTGGGGGTAAACATTAAAAAATTTGTTACTTTTAACCCCTTAATTAATCAATTGAGCAAGCTCAATTGCTATTTAAACTGAGGCATGTAATTAAACAAGTTAATAAAAGCATAGCAAATATTCCTAGCTAGCTTGTAGAACAGTAAAACTATTAACTTTAGAGGTTCAAGTAACATTAGTGCAATATTTATCAAAAGCGAAAATTACTTTAGGCAAATAAAGTAAATAGTGTATACTGTGAAAAATGTATGTGACCTCAACTCAAGTAATTAATATTGGTGAGAATTAATTTAAACAAAAAGCACAATTTTCTATTCTCTATGCACTATTTCTTCATGAAACAAAAGTTCTTCATAAGATAAGAAATTTATTTTAGAAGGAAATTTTGAAAAGATAGAGACTTTAATTTAAAAGTTATGAAATTTTTTCTAGGGAGGGCTCGGTATTTGAATAATAGCCTAAAGGTGTGTATGAGAGCATAGGTAAAATGAGTAGTTTTTTTATAAAAAAAATTCAATTAGTATAATTGATTTTTAAAAAAATCAAAGTGATATGCCTAAAAAAAAATCAATTTAAAATGATTTTAAATTTTTCTCAAAATCAATTTTTTAATTTGTCAAACATAATCTAATGAAAAGGACACCATCCTAAATATTATATTATATTTTACAAAGCAATTACCTCCGTCATAGGGTAACGGAATCATCAAAATAATCATTCGTTTGTGAAATCTTAAGACTAAGCTAGGATTTAGGTTTAATTTGACCATGCTTATGGCTTAATTATTATGATTTTAGTCTAAAACCAGTGGCTGTTTAATTTAATGTGTATAATAATTGAAAAGTATAATTTCTGTGAGCATAAAAAAAGGGGGAAAAAAAGAGTAGAATTTTCGAGGGGGAAAAGTGACTGGATTATTGAAATCGGACGGCTGAGAAAGGCCAAAGGGGTTGAGAGATCTGTGGCTGCGATAGAAACCTATGGGTTCATTCTGATCCGCAGATTGCTCTATCATTTCTCATATGCTCTCAAAACCCATATATAAACCCTCCTTATATTCACTCCTTCCCACAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAATCCTCTCTCTCAAAATGAAGTTTTCCGCTGCAATTTTTCTGCTTCTACTGATTTTTGGCACTGGTAATTTCTTTGTTGGGTTTAAAAAATGCATTCTTCTTGTTTTTTCAAATATATAGCATAACTGTGATATAATTTTTCTTTATATTTTTTTAGTACCACACGTAGGAATGCATACTCGAACTACTTTTTAGTTGGGAATGTATGATTTTTAACTCGTTTGAACCGTGTTTGGACGATTGACATGATTTTTTCTTCCAATATTTTGTATTACATTTGAAAATATATATTTATTACATGTGATTGTCTCAAAATCAAAAGTATATTAGAATAAGAAATAATTTGCACGCAGATCTCCATTCTTTCAAATTATATAGTCATTTTATTTGTTATTTTCTCGACAAAATAAATACAAGCTATTTCATAGTGATAATCTAACTTTTTTTTTTGAGATTGAGTTAATTATGTAACTGTGCTTGATTCCCCTTGGCTAGATGATTATATCTAATAATCCGCTTTGCTGAAGTTTTATTTAGTGATGCCTATATCCTATCGTTTGTAAATTGAAATCTAAAAAGAAAATAATTTGCATGCACAACTCAATTTTTTCAATCTACTGTAAATTTATTTGTTATTTGTTTTAATATTGTAGCTAAATTGCAAATTTAGTCCTCATGGATTTCGACTTAAAATTTTCAATTTAATTTTTATGATTTAATTTAATTTCAATCCGTCTCCATAATTTAGTCAAATTTCACGAATCATCCATGTTATAATCATATTGAATACCATTCATCCATGTTGTTTCATTACACAGTAACGAGGTTATATTTATTAATTTTACCAAATTAGGATTTTCAAATCAAACTAAATTGAAATTAAATCCAAATTTATAATATAACCCAATATTCAACCCCTTGACAATCGAAACGGTTTTTAGAGCAAGAAAGCACAGAAAAACAACAAACAACTTAAATTTATTTCTCAAGGAGTTTTAGGAACTATATAATACGTGTTATATTTTCAAAATGAGAAAAAAGAAATTAGATGAAATTGAAAGAGGGGAATTATTTAACAAAATAGCTTGGTTTGGTGCATGGCTTGGGGAGCAGGGATGGCGCCGATGGTTGCGGAGGCGAGGGTCTGTGAATCTCAGAGCCACAACTTCAAAGGGCTATGCTTTAGTGGAACCAACTGCGCCAGTGTCTGCAAGACAGAGGGCTTCCATGGCGGCCACTGCAGGGGCTTCCGCCGCCGGTGCTTCTGCACAAAGCACTGCGTTTGAAATTCAATAA

mRNA sequence

ATGGTAGGTTGGGGCCCATTTCTGAAGAACGTCATACGGCCATCGCCACAGAACTTGGCCGGCAGTCAGGAACTGGTCGGCGTCGATCATTCGAGTGGTCTACCCTCCGTGGATCAGGGATGGCGCCGATGGTTGCGGAGGCGAGGGTCTGTGAATCTCAGAGCCACAACTTCAAAGGGCTATGCTTTAGTGGAACCAACTGCGCCAGTGTCTGCAAGACAGAGGGCTTCCATGGCGGCCACTGCAGGGGCTTCCGCCGCCGGTGCTTCTGCACAAAGCACTGCGTTTGAAATTCAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTAGGTTGGGGCCCATTTCTGAAGAACGTCATACGGCCATCGCCACAGAACTTGGCCGGCAGTCAGGAACTGGTCGGCGTCGATCATTCGAGTGGTCTACCCTCCGTGGATCAGGGATGGCGCCGATGGTTGCGGAGGCGAGGGTCTGTGAATCTCAGAGCCACAACTTCAAAGGGCTATGCTTTAGTGGAACCAACTGCGCCAGTGTCTGCAAGACAGAGGGCTTCCATGGCGGCCACTGCAGGGGCTTCCGCCGCCGGTGCTTCTGCACAAAGCACTGCGTTTGAAATTCAATAA

Protein sequence

MVGWGPFLKNVIRPSPQNLAGSQELVGVDHSSGLPSVDQGWRRWLRRRGSVNLRATTSKGYALVEPTAPVSARQRASMAATAGASAAGASAQSTAFEIQ
Homology
[Close]
BLAST of Moc04g28640 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KLL1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G114560 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 1.2e-04
Identity = 36/62 (58.06%), Postives = 39/62 (62.90%), Query Frame = 0 

Query: 37 VDQGWRRWLRRRGSVNLRATTSKGYALVEPTAPVSARQRASMAATAGASAAGASAQSTAF 96
          V QGWR+W RRRG  NLRAT S+  ALV     +SARQR    A AG  A  A AQST F
Sbjct: 7  VVQGWRQWWRRRGYANLRATISRVCALVTQIVGISARQRGLAVAFAGDFAVAAFAQSTVF 66

Query: 97 EI 99
          EI
Sbjct: 67 EI 68

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Moc04g28640 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Moc04g28640 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Moc04g28640 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KLL11.2e-0458.06Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G114560 PE=4 SV=1[more]
BLAST of Moc04g28640 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc04g28640.1Moc04g28640.1mRNA