Moc04g09650 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc04g09650
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr4: 7125932 .. 7130876 (-)
RNA-Seq ExpressionMoc04g09650
SyntenyMoc04g09650
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGTCGGGCTCGGCCCCGAGCACGGGTATTCGGTCGGTTGACATAGGAACTGGGCGGAAGAGATCGGGTGGCATCTTGACCCAGAGACCAAGACTAGATACTGGTGTCAAGGAGGTCTCAGCGTCGAGGCGGGGTCGGCTCCAAGCCGGGTCGGTCTTTAAGAATGGGCCAACCCTCTTTGTCGATGATCTCAGGCTTCACGGTTCGACCTCTCGTCTCACTTGGATCATTTTTGCTCCCTATAACACCTAGTGTCAATTTTTTTTCCTAATCTTTTTATCGTTGTTGTTGCTTACGATCTAGGTTGGTTTATCTATGCTGAATTTCAATTTAATTTAATTATGCTATAATTAGAATCGAACATGATCTGTGATTAGTTAATATATATTGTATGCTTTTGATTTACATAATATATAGTTGGCTTTTTTTATCTCTAACGTTTAACACAAAATTTTATATACAATGGAACCCTTCTAATATAAATTTATGGCATAAAAAAATAGTATCATGCTACAATTTTTTTATCAAAATAAATTAAATGTGATAAAAATAAAAATGAATGGACCAAAATGATCACTTTTTTAAAAACACAGGGACCAAAATGAACAACTTAGAAATATAAGGACTAAAATGAACAAAAGTTGAAAGTATAGAGATCAAAACAGTGTACAATCACTAAAATGGACCAAAATTGAAAATACAAGCTAAATATTTTTTTAAGTACAAAAAATCAACATAGTTTTTTTTTAGCCACACCGAGCATAGCTCAAGTGCTTAAAGCACCTATCTCATGATCAAGAGGTCATGAGTTCAAATTCTCACCCCCACATGTTCTATAAAAAAGAACGCAAAAACTAAAATAGTATTTAAACTCATTTTTTTCTTTCATTTTTATTTAATTGTTATATAGATACACTAAAATTAACTTCGGTGAATAATGGCTTCAATTGGTACAAAAATAGAAACATATTCAATTACAAATCTAAATCTTTCAGAAAAAAAAAATTACAAATCTAAAAAATAAAAAATAAAAAAAAAATTAAAACAGTTTTTAAAACAGCTGTCATTTCTTTATCAAGATGTTGCTTGAGTATATTTTATTCAATCGTTTTCAATTCTTTTTAATATAAAATAAAAGTTTATTCTTGACAAATTTTTAATTGTCACGTATCCATGCAAACCTATAATTAAATTATAAAAAATTGGTGTAAAAAATAATGAGGTTTGTATACTCCACGGCCACATGTGATGAAAACTGAGATCTAAATTCTAAATTAAAGATTATAGTGAATATTTTATAATTTTGACCTAAAAAATTTTGGGGATTTCAAAAATATATTTAAAGAACTTAGAAGAGAGAGAAAAAATTAAGTAAATAACCCAAACCCACATACACAAAACAATATTCTCCTTTTTTTTTCTTTCTCGACTACTAGAATTTGGGGTTTTTGTGACGTTAGTGAACAGTTTTTAAACTATCACAAATTCTACTAAATAATATATATAAAATTTAAAATATATATTGTTAAATATAGCACAGAGTTAAAATTCTAAAAAGAAAAATTAGTATAATATGTTAAATTAGAAGGTAAAGGTTAAACGCATCAAAAGAAAATTAAAGTTACGACACATGAAAAAGAATGAAAAAGTTGTGATATTTTCTAGTTATGAAATACTTTAATTTCGAGATCCTCACTGAAGTAACAATGTACGTAGTCTCTAGACTTTATATTATCTCCTTGAATTTTAGTAGGTAACAATTTAATCTTTATAATTTAAACACTATAGTAATTTAATCTCTATCGAAAAAAATCTCATCAAAATTAAATGTCACATCTTATTATATATTTTTTTAAGTACAATATGTGGGGTGGGAATAGAACTCCCAATTTCTTGATTGGAGATATATATCAATTATCTTTGAGTTACGCTCGCTTTGGCTGTCGGCTGCCACCTATCAATGTTAAAAAGAAGATAGTTTACCATGTTTAATAATTATTTCTTGTTTTTTTGTTATCTAAAATTTTGAATTAGAAAACGTAAAAGTTTTATATGAAAATTAAATCTTAAAATTTTTTAGGTTAGAATTAATTTTTGAATATATATTGTGCATTTTATAAATAAAAAAGGATAAAATAATATTTTTATTATGTTTTGAAAAAAAAAGACTGAAAACAATGACAAGAAAGAAGAAACTTGATTTTGTTGTTTCCAAAATTTTTACACAATCTAACACAGAAAAAATTACCAAATGCTATGTTTTTCAAAAATTGAAAATGACAATGTTATCAAATGGGACTATCGTGATCGTCTCTGTGAAATAGTCGAAGAATGGATCCAGAAAAATGTTGAAAAGCAATTCAGCCCTAAGATGTATTGGTCCATTTACTCTTGATAGGAGAAATGTGTGCTTGAAGTTAAATATCTTCTCCATTTTGGCCTACTTTATTCTCACGAAAATCACTTCAACTATAATACATGATTTATGTTACTTTAATATGATATTTTTCGATTCAAAGAGTAAATGCACATTTCTATTATTTTGTCTGTAATATATAATTGTAAATAGCTCAGTGGTAATTGACATATATCTCCAACCAAGAGGTTATTAGAAAAAGTACGTAGTTCTTGCGAGAAGAGTCGCGTCAGAGATATTTTTATCAAACTTTCTTCGCCAATTTTCTTTCATTCACTTGATAGGAGCTGTAATAAATATATTTATCTATGTCTCGATGTCTAAGTAAATTCTTGTTCCTAAACAGAGCAATAATTATCAGTTCGGTAACATTAATTGTGTAATAAGTTATTACTAATAACCATTGATTTCTTTAATGTGTTAAATATACGATGTCGAACACGCGTCCGACATCTTTCAAATGTGTCAGACAAGTATCATTTCAAAAATTCAAAAATCAATTTGACTTAAACCAAAATTATTTTAGTTCTTGTGAACATTTTTATAAACCTAACACAAACACACATTTTATTCATTTATGAATATATATCTAAGTAAATATATGATCTACGGTAGGTGTGGTGTCAAATTTTAGCTTATATTTTTTAAAAATAAAAATTAACGACAATGACTAAAATTTAAATAAAATGTTTAAAAATTTAAATAGTAAAATAGTATAATTTTTTCCTCCGAAAAAAAAATAGTATAATTTTAAATTTTAAAACTAAAATGACTTAAATAAGAAAATTTTGAGATAAAAATAGAATTTAGACATCCTTCATTAATTAAATGTTGGTGCCTACCAATTTATTTTATTTTTCAATCTCTTCATATATATATATGCATACAATACATACATACATATGTGTGCGCACACACATATATTTTTATCTACATTTCTATAAAGTCTCTTTCAAACCTCGAGACACAAATATTCATAAGATGACCAAAAAAATCAACAATTAACATGATTTACAAAGGGTGTAAATATTGTTAATATCTTTCTTATTTAAGTTTATATTATCATGCATTTTATAGGTAAAAAAATAATGATATAATATTTTTATCTATGTTTTGAAAAAAGACGTAAAACAAGAACAAAAAAGCTCATTTGATAACATTTACATTTCTTGTTTGGGATATCCTTTTAATAAAGAAAAATTAATTACATGACCTCCACCCCATAGAAATATAAAAAAAAATATATAATTTGGAAGAAAAACTCAAAAATTACTTTTAAAACATTTTCTTAAACGGCTGTCATTTTCATCAAAATATTGGAGTATATTTTATTCACTTTCTTATAAAAAAAAAAACATATTTCTCCTTGACAAATCTTGAATTGTCATGTATCTCTGCTTCAGCCTATTAATTAAATTATTAAAAAATGGTCTAAAAGATAATGAATTTTTGGTATACCCAACATGTGATGAGACCTAAATTAAATGCTATAATGAATACTTTATTTAGAAGTTGACGTGATAGAGGAAATCAATTATGAACTTTGGGCATTACAAAAATATTGTTTAAAGAATTTAGAAGAAAAAGGAAAAATGAAATAAATAACCCAAACCCACACACAACAATATTACATTTTCATAATCTTTTTAATTTTCTACTTGATACCAAATGGATGTACCTAAAACCCATACTTAAAAATAGGAGTACTCCACAATAAATGGAAGAAGTTGCCACATGGGCCAAACTGAAAATATTGATATAAAAAACAAACATGGTTGTGTGCTGGCTGGAAGGAATTAGATCCGACTCGAAGATGGGTGCAATTGAGAGATCGAGCCCGCCATGAATCTCCCAAAGCTAAACAAGATGCCACTTGCTCGAATGTCTCCACAAGATCCACAAAAATTAAGTTTCAACTTCAATTTGTTCGTCAAACAACAACCTTCGAACATTCCAACGTATTGTTTTCGCAACTGCGTCGATAAATTGTTGAAAACAGTGTCGTTGGCCGAGATGAGAGTCTGTTTCATCTTCTTTTGGTTCAGCCTTCTCCAGAACAGCATCGGCTTGTATGCAACTTCAGAGATACTTGTTGGGCATGAGAGGATGGTGAGATAGAAGGAAATGGGCCTTCTCGTGCTCTTTGTTTCCGTTGCTGGATATTACGCCCAATGAAGATATGGAGAAACATGAGCGATGGGATTAATGTGCTTCTTAAATTTGGTACGAGAATGCTGAGGTGGGTTCGTAGCCTTTAATGGTTATGGAAAGGTTGACGATTAGAGGGAATTAATGCAAATGGTGCCCTTTTTGGTATCCAAATCGGTGAAACGAAAGCAGAAGGAATGTGCTTTCATGACACCTAAGTTGGTAACGGGTAGATATTCTTACGTCACCGCCAAAAGATCCGCTAGCGTGAAGGTAACCCATGTCGTCGTCGGAGAGGCTGGCTGGCTGGCAGCAGCCAGACTGTTGGATGGAAAGGCTGTGATGTCGCAGGCAGATTGGAGATGGGAAAGAATGTATTGA

mRNA sequence

ATGTCGGGCTCGGCCCCGAGCACGGGTATTCGGTCGGTTGACATAGGAACTGGGCGGAAGAGATCGGGTGGCATCTTGACCCAGAGACCAAGACTAGATACTGGTGTCAAGGAGGTCTCAGCGTCGAGGCGGGGTCGGCTCCAAGCCGGGTCGGTCTTTAAGAATGGGCCAACCCTCTTTGTCGATGATCTCAGGCTTCACGTGTCGTTGGCCGAGATGAGAGTCTGTTTCATCTTCTTTTGGTTCAGCCTTCTCCAGAACAGCATCGGCTTGTATGCAACTTCAGAGATACTTGTTGGGCATGAGAGGATGAGGGAATTAATGCAAATGGTGCCCTTTTTGGTATCCAAATCGGTGAAACGAAAGCAGAAGGAATGTGCTTTCATGACACCTAAGTTGGTAACGGGTAGATATTCTTACGTCACCGCCAAAAGATCCGCTAGCGTGAAGGTAACCCATGTCGTCGTCGGAGAGGCTGGCTGGCTGGCAGCAGCCAGACTGTTGGATGGAAAGGCTGTGATGTCGCAGGCAGATTGGAGATGGGAAAGAATGTATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCGGGCTCGGCCCCGAGCACGGGTATTCGGTCGGTTGACATAGGAACTGGGCGGAAGAGATCGGGTGGCATCTTGACCCAGAGACCAAGACTAGATACTGGTGTCAAGGAGGTCTCAGCGTCGAGGCGGGGTCGGCTCCAAGCCGGGTCGGTCTTTAAGAATGGGCCAACCCTCTTTGTCGATGATCTCAGGCTTCACGTGTCGTTGGCCGAGATGAGAGTCTGTTTCATCTTCTTTTGGTTCAGCCTTCTCCAGAACAGCATCGGCTTGTATGCAACTTCAGAGATACTTGTTGGGCATGAGAGGATGAGGGAATTAATGCAAATGGTGCCCTTTTTGGTATCCAAATCGGTGAAACGAAAGCAGAAGGAATGTGCTTTCATGACACCTAAGTTGGTAACGGGTAGATATTCTTACGTCACCGCCAAAAGATCCGCTAGCGTGAAGGTAACCCATGTCGTCGTCGGAGAGGCTGGCTGGCTGGCAGCAGCCAGACTGTTGGATGGAAAGGCTGTGATGTCGCAGGCAGATTGGAGATGGGAAAGAATGTATTGA

Protein sequence

MSGSAPSTGIRSVDIGTGRKRSGGILTQRPRLDTGVKEVSASRRGRLQAGSVFKNGPTLFVDDLRLHVSLAEMRVCFIFFWFSLLQNSIGLYATSEILVGHERMRELMQMVPFLVSKSVKRKQKECAFMTPKLVTGRYSYVTAKRSASVKVTHVVVGEAGWLAAARLLDGKAVMSQADWRWERMY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..27

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc04g09650.1Moc04g09650.1mRNA