Moc03g03070 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc03g03070
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr3: 2348104 .. 2351817 (+)
RNA-Seq ExpressionMoc03g03070
SyntenyMoc03g03070
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGACACCTATCTTTTACATGCTAGTGGAGTTTGAAGTGGAAGGTATGCAAGGCTTGTCCTTGCATGCATTTGGTCTTTATATAGGTGATGAAGATCACTTGGATAAGGCTAATGCTTCCTTGCATAAGTGCAGAATTTTTCCACTCAAATTTCTATTGTCTTCTCCTAGCCATTAGTGTTTTCACTCAAAATTCGGTCCCACAACCGTGTTCATCAACCCGGGGATAGCACGAATTTGTCGTTGGTGGTCCACCCTTGAAGTTCCGAGCCATCTCTGACCATCTCCGACCAGCCGCCCCACCACAGGCAGCGGCACAAAGTAGCTGGCGACGGCGAGGATTGGTGTTCTGCTCGATCATAACAGATACGGGACTTCAATGTAGTGACCACGAGCAGATCCGTTCTCGATTTGCATCCTTCGAACAGCGATGGCTTTGCCCCATGCAGATCTACGACAGCCTCAACGATACACGAACGCAACAGGCAAATCCACACCGGCGAGATCTTGTGTGACCCATTTGTGATGTTTTGCAGATCTGAGAACGTCGACATACAGCGACAGATTCAATCGGCGATGCCATGGTCGTTTGATCTCGGCTCGGAGGCGACGAAGCAGTCGGCAGCGCTTTCCGACAAGTATCGAACATGAAGAGGCTCAAAGATATGGAATAAGATCTACACAAATCATGAACACATTAACCAAAGGTGAAGACTCGATTCACGAACACCCGAACTGAAAAGATCTACGAAGAACAAATCCTTGGCGACGAGGTATGAACAAATCTAAATAGACTTGCTAACGAACAGCGAAGAACCAGTTCTGAGACTCAGCACATTTTCCACACCCAAATCTGAACAAATTTGCACATAAAAAAATTAATGATATTAATAATAATATTGCTACGAACCATATCTGTTATTCCGGGGTTGGTTTTTTTATCTTAAACTTTGAAGGACCGATTCGGTTGGCCATTCTCTAGATCTGAAGCAATTGTGGCTGTGACATGACCCACAACGATCATTTGATTTCAGCAGCCCCTATCTTAGTACAGTAGCAAATCTGGAGTTTTTGGATAAAATTGCTAAGATTTATTTTCATATAATTGCCCAAAATTAATTGCTTCCAGATTGTTGGAACAATTAGGATTAAAAGAAAAAGATTGTTGTGCCGTGGATGAAGCCACTGCCCTGAAAAAGTAATTACGGCACAACCATGGTGCTATATCGTATGCTTGTTGATTGCTCCCCAAGGTTGCACGACCATAGTGCTATATCGTATGCTTTTTGATTGCTCCCCAAGGTTAACACAACTTCGAAACAAGGCGTGCACTCACTGGAGTTGAATGGAATCGATAAACGTGCTAATAAAAGTTTTCTTATTCTATTGTAAAACAAAACAAGTCTTAGTTATTTAGAGACGATATGCTATTTTTGGTGGTTTATAAAATAGTAAAGTTAAAAATAGCATGCTCGAAATTTATCAAGTTTAAACATAGTTAGAAGACTGAGTCTTTTAAGGACAAATTAGTAATTACAAACAATACATAACTACTTAACAGGTGAATTTACTAAAAATACCTTGTGTTCTCTCTCCAGGTCGGATTGGAGGCGAAGTCTGGAAAAGTTCGTAATTCCATAGAGTGTTCATAAAAAAAAAAGGCATTGTCTAACGAGTGACAAATTTGGATGGAGTCTCGCTTTGATGCTGCGGACACGTCAGCTCTTTTTTATGCGCCGTTTTACCCTGAAATAAAATGAGCTTTGTTCCTCTGGTCTCCAGGTGCTCCCTAACTTCGTGTTAGGTTCACTTCCATGAAATTTTGTTAAACCAAACTAACAGTCACAGCTTTCCTTCCGCTTTTAGAGGTAGGGATTGAATCAATTATTGCTCAATGAGATATTTATTGCCTCCCATAGCACTTCGCTTGTACGTGAGTGCCACGCCTGGTAGAGCTATTGCGTGACTCATCAACACTTGAGACGTTACGTTTTGTTAGGTTAGTAACTTGAATCAAATCATCGGATGTCACAAGAGCTCGATTTTAATTCAGTTTGACAAAGTAAGTAGATCTGTGTTATCTTATTATCTTAGTTGTTGTATCTTAAGAAGCAAACATTTACTAATTTCAAGCATTGACAAAAAAAAATATATATACTTTAAGAATACCATGTGACATGCATACTTTAACTATCTAAATTTCTTATAATATTCTTTTTATTGTAAAATTGAGGAGCAAATAAGACACCACAAGAACCCAAATGATGGAAGAGTACCAAATTAGAAAATATATAAAAATGTAATGTAGAAACATAAATTTGAATTTCTCAAATTTCTCACTTATTTTCCTACCCTTTCATCCTTTTTAAAATAAACGATGAATTGCCACTATTTATAGGCAATTTGGACAATCCTGAGGTGTAACAATTTGACACTAATAACAGGTAGAAATGTGACACATGGAACATTTGGAGATTAAGACTTGGGGCATAGGTCAATTTAACACTTAGATTGAGACACTGAGCAAATTGAGGAAATTTAGATACATGGAGCTAGAACATCAATACACCTCTTAATTTGGACATTAAGTTCCAAGTCTTGGGTATCTATAATATTTAATTAAAGTTTATAGTACTTTTTTCATATTTTATGCTGTTTAATTTTCATATTTATAACATGCTACAAATTTCTTACGATATTCTTTTGTTATATTTTTATACTATTTAATTTTCGTATTTATAGCTTACCCTCATCATTTGGTCGACTCGGCCCAGTCTAATCCAAAGAAAAAAAGGTCTGAGATCACCTTAGGCCCAAGTTATAAAGCCTTAATATTATTCGGGTCCGCCTTGGGCCGGCCCAACCACTAAAACCTAGGCCCATTGTCCAATCTATGGACCTAACTCAATGAACCAAAATCAGATCGAGCTTGGATTGACCCTATAATATTTTTTCAATCATGTTATTAAGTTTTAGAATTTACGTTTTTATTTTATTCATTTGTAATTTTTTGTATTTTTCAAAAAGTTATCAATAAATTTTGTTATATCATATTTTTACCACTTCGTTTATTTTATTTTTTAAAAAATAAATTGTATTACTATACTAATATATAAAAAATTAGAGGAATAAGAATGACTATAAAGAATAGTCCTAAATACTAATTAATCATATATTAATAATTAATACATGTATATATACAATATATAACAATAATAATTGTTGATGCTGAATTTTGGTAGAAGGGCCACGTGTCCCTCAGACGAACAGCCCGGCCAGAGGACAAAGGAACCTGAAACCAAAGAACTCAACATCGGTGTGGTGTCCTGCCTAAAACACTCCGACGATCGAGTCAGTAATCAGAATAAAAATAAGAAAAGACACCTTAAGTGTGAGTGACATATTTTTCACTTGCTTGGTGAGGATGAGGGTCCTTCATTTTATAGCATTGGACAGCCAACCAGGAAGGACGACGGTTAAAGGTGGCAGGGACGTGTCGTGCCGTACGGACAGCATCTTCGAGTACACTCCCGACAACTGCGGGGTGGCACCTCCTCCTGTAGCTCAGAGCTTGTCGCTTGCAGCACTGCGGGGCATGCCCGCTGTACCAGTTACGTGCGCCTCCTGCTACAGTTACATACGGTGTCCAGCTGTTCGTGGTCCCCCGTCCCTCCATGAGCGGGCATGTAGCCTGCTCGGCATTGCCAGCTTGTGA

mRNA sequence

ATGACACCTATCTTTTACATGCTAGTGGAGTTTGAAGTGGAAGGTATGCAAGGCTTGTCCTTGCATGCATTTGGTCTTTATATAGGTGATGAAGATCACTTGGATAAGGCTAATGCTTCCTTGCATAAATCTGAGAACGTCGACATACAGCGACAGATTCAATCGGCGATGCCATGGTCGTTTGATCTCGGCTCGGAGGCGACGAAGCAGTCGGCAGCGCTTTCCGACAAGGCCACGTGTCCCTCAGACGAACAGCCCGGCCAGAGGACAAAGGAACCTGAAACCAAAGAACTCAACATCGGTGTGGTGTCCTGCCTAAAACACTCCGACGATCGAGTCACATTGGACAGCCAACCAGGAAGGACGACGGTTAAAGGTGGCAGGGACGTGTCGTGCCGTACGGACAGCATCTTCGAGTACACTCCCGACAACTGCGGGGTGGCACCTCCTCCTGTAGCTCAGAGCTTGTCGCTTGCAGCACTGCGGGGCATGCCCGCTGTACCAGTTACGTGCGCCTCCTGCTACAGTTACATACGGTGTCCAGCTGTTCGTGGTCCCCCGTCCCTCCATGAGCGGGCATGTAGCCTGCTCGGCATTGCCAGCTTGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGACACCTATCTTTTACATGCTAGTGGAGTTTGAAGTGGAAGGTATGCAAGGCTTGTCCTTGCATGCATTTGGTCTTTATATAGGTGATGAAGATCACTTGGATAAGGCTAATGCTTCCTTGCATAAATCTGAGAACGTCGACATACAGCGACAGATTCAATCGGCGATGCCATGGTCGTTTGATCTCGGCTCGGAGGCGACGAAGCAGTCGGCAGCGCTTTCCGACAAGGCCACGTGTCCCTCAGACGAACAGCCCGGCCAGAGGACAAAGGAACCTGAAACCAAAGAACTCAACATCGGTGTGGTGTCCTGCCTAAAACACTCCGACGATCGAGTCACATTGGACAGCCAACCAGGAAGGACGACGGTTAAAGGTGGCAGGGACGTGTCGTGCCGTACGGACAGCATCTTCGAGTACACTCCCGACAACTGCGGGGTGGCACCTCCTCCTGTAGCTCAGAGCTTGTCGCTTGCAGCACTGCGGGGCATGCCCGCTGTACCAGTTACGTGCGCCTCCTGCTACAGTTACATACGGTGTCCAGCTGTTCGTGGTCCCCCGTCCCTCCATGAGCGGGCATGTAGCCTGCTCGGCATTGCCAGCTTGTGA

Protein sequence

MTPIFYMLVEFEVEGMQGLSLHAFGLYIGDEDHLDKANASLHKSENVDIQRQIQSAMPWSFDLGSEATKQSAALSDKATCPSDEQPGQRTKEPETKELNIGVVSCLKHSDDRVTLDSQPGRTTVKGGRDVSCRTDSIFEYTPDNCGVAPPPVAQSLSLAALRGMPAVPVTCASCYSYIRCPAVRGPPSLHERACSLLGIASL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 72..86
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 72..94

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Moc03g03070.1Moc03g03070.1mRNA