Moc03g02260 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATCCAATTGTTGCAACGAAGGAGCTATCGTTTCGCGTCGGCTTTTCCGGCCACAGCGGCCATCTCAGAATCGAGCCTCTTGCAACTGTGGAGCGCCCCAGCCCTGTTAGATCGCTCCCGGATTTCATACTTGTAAGCAGTGCTTTGTTTTATAGTATAGCCCTCGCGGAAGCTTACGGTCAGTAGGTGTCTGCGTATAGTTTTTGAATATTTACGTGTAAAATTATTTCTAGGGTTTATCAGTATTATACAATTCTTCTTCATTTTTTAGTATGTGGGTTTTAGCTCAATGAGGAGAAATGCAGCCATAAAAGATAAATAAATGAATTCGAATACAATGAGCCGTCAAACTAAAAGAACCATGGACAACGGCACCAAGAAACCACAAGGCTCTACCGAAAAAACCCTAAAGCAACCGTAGCCACCTAAACAAAGGAGAAGAAGCAGTTAAAAAAAAACCACTTGGAACAGGCGACACCCAAAGAAAAAGACCATTAAACATCAAACAATTTCAAAAAGAAATTTTAAGGAATATACTGCCGTTTCCTGAGATAAAATCGAATGCATTAGCAAAATATCCTTGTTAATAGCCGATTTGACTCTTATTCTTCTATTGCCATAAACTGGAGAAAAATACTTTCCGATGCTTTCCTTTGGCGTAGAAAAGGTCTCATACTCTTCATTCCCTTTCGATAAAACAGGAGAGATTGAATAAACGCCTAAGTTTCCATCAATAATCAGATGAGGAGATTTCAAACTTGCAAAAGAGGAAGCCCCATTGGATTTCTTATTAGAAGTCGGAATAGAAAATTGAAACACTTCCTCCCCAAAATTAGAAATGAAGGGCCTGTTTGGTAACATGTCCATTTCTTGTTTATGTTTCCTTCTTTTTTTAATAAAGAAAAATTCCTTATGTTTCCTTCGGTGGAGTGCTTCAGCTTGGCTAAGTTTAAAGCGTCTCAATGGTGTGCTCTATCCAATCTTTTTGCTAATTATTCTCCAAACATGATATATGTTAATTGGGGGGCTTTCATTTTCCCTAGTTAGACATACATAGGATGATACTCTGTCTTTTTATTTTTACTATTCTGGATTGTATCTTTTTATTTTATGTTTTTTCACTCCCTTGGGAGTGTGTATCTTTGAACATTTTATGTTCCTTTTCATCTATCAATGAAAAGTTCGTTTCTTGTTAAAAAAAAAATTGCATACCATGACACCCATGGAAACAAGAACGATAAAACAATATTTTTATTTATGTTTTGAAATAAATTGGAAATGACAACAAGAAACAAGAAAATTCGGTTTCTCAAAGCCAGGAAATGATCACAATAAAAACATTTTTAATTTCCAAATCACTCCTCGTATTGGAGGATTAATCCAATCTCCAGCTGGATTCTTCATACAAGAGGAAACCGAAAAATCTTCATAAGCTTCTACTTCCAAAAGTTTAGCGAGCAGACCCACCTCATTGAAGTTTGCTTCAGGAAACTCAACATCAGAATGAAATACTTTTTCGGGCACCACAAAATTGACTCCATCACACACATCAATCTCCTTTGTGTCTTTGACAACTTTGAACCAAGGGCAATGGCAAGCCAACAATTCCTTCATCCCCAGCTGCTTTTCACATGGGAATTAACCATAAAAGGAGGATCAGCCTCCAAAAAAGACCCTTCATCTCCTTTACTGATATAGTTCAATTCAAAGGACTATTAAACCAATATGAATCCATTATATTCAAAATTTCTGCTCGAATTGAAGAGCCACAAACAATAGAAGGGGAAGTTTGAAAGGTCACATCGTCGAGAAAAGAATCGTGAACAAAAGAATCATTGAAGCAGGGATGAATCCACATTGATTCCTCTTAACCTCAATTGATGCTTCAAAACAATTCAACAAATTAATGGTTTCCAACAAAATGCTAATGAACTCTCCACATTTCTCACCAATGGCTACAAAATTTTCCTTATTCCATAAAGAGAGAGGTAAATTCTTAATTTTGATCCAACCACCATTGCACTTCATCCACTCCATCCTATTGTGTTTTCCGCATTCCATTTTTCGATCTTGATATGCATCCCTCCAAAGTTATGCCAATGCCAAAGAAAAACCTCCAACTTTAAAACCAATGCTATCATCAATTTTAAGCAATGTTTTATCTACTGAAAATGAATTGATCGAACAACTCCTTGAAACTTCATTTTTCAAAATCTCTGAAATAGATTTCCAATCATCAAAAGAGCAAAGCCTCGAGACTACAAAGATCAACTGAAAATCCATAGCCACCCCATTGTCATCCTTTTTAAGCCAATCTCCATGTAAGAAAGTGACATCTTCTTTCACGGAAAAACTTGTCCCACAAGCCACAATCTGAAAGATTGGGATCTCGTTGAACAGATGAATAAAAGCAAAAGGAATCAAACATGCCTTTAGAGAGATATTGGAACTCGAGTAACATGTCCCAAAAAAGTAACCTAGCCTGTTCCTTGCACCTCAACCGGAACCAAGATTTGACTCTTAGTACCTTCTATTGACCGAAAAGCAATTTCAGGAAATCTTCCAAATACTTACACACTAGTTCAAATGACTAAACAACAATTTATAAATAGTATGCCACATATAAAGTCGGTGAAAACAGTATGCCCCCTTTCTCCTTTTCGTATTATCTATTTCTCAATTTTTCTCTGCAGTGGAATTTCTTCATGTTTGATCAGTCAATTTTTTTTCTTCAGAAGATGGTAAAGGTAGCTTGCTTCCAAGCCACTGTAGGCTTTGTGGCCAAAGTTGTGATGATTTGGCAAGCAGTGCATCTTAATAATGTTCCCTGTCCTATATCTTTGTTTTTTTTCTCCATTTCTTAAGAAGGAGACTCTTCTTGCTCAACTTGAGTATTATTCAATTGATTACGACAATAGTAATCTTCTTTATAGGTCGAAGCTTTGAATCCCCATCCCTATGTTATAATATTATTTTCTAGAAAAAAGGATGTTTTTTAATTGCCATCAACGCGTCAATTATGCATCATATTTATTTTTAAATTTTTGGTTCAAATTCAGCCACCTGCATTTCCTAAGGAAACTCCTGAAACGATAAAAGGCTACATTGAAGAGACTTTTCTCCGGCCGGAGTTAGACCCTGATGAATTTTCCCCACAAAAGGCAGGAAGACAGTGGGATTTTGATTGGTTTGAAATGGCAAAAGTATCTTTGGATCCATCTCAGCCAAGATCAGTCATGGTCCCTACATGGGTGTTGCCATTTGAACGCCCAAAGAAGGATGGAACTTCTGGAGGGACATGGGAACCTGGTTCTGTGCAGGTACTGCTTGATTGTTCAGTCTATTTGCCATGACATGAAAAATGTTGGTTAGGTTTACTGAATTAAGATTTCTGTTACGATAAATTTCACATATTTATGTTTCTAGGGTTTGGGTCATCAAGTCAATGATCTTGGCTATATTTATTCATTTTGAATGCTAATCATGCTATGGAATGGCTTTCCAATCTGACTAATGTCGCTTTTCAGGTGGATGTTTCAGAATTAAATGTGGAAACTCAAGAATCTGGTTCACAGCCACGAGTGCCAGGACCAGCAAAAGATTTTGTAAGGGGAAGCATAAATAATCGCCCTTTTCGACCTGGTGGTTTGGATGATTCTCAATCTATTGAAAGAATTCTTCCTGATGCAGCTTCTAATGGCGAGTGGGTGCATGAAGTTCTAAATGGTGGTCCTGCTCAATCTGTTCCACCTATTTTAAAGCAAGGATTGGACCTCGGTGATCTAAAGGTAAATTCTATTATCATTGAGAAATGGCCAACCAAATTATATTACTGCAGAATGTGTTGACTTCATTTATATTTTTTTGCTGTTTTTTTTAACTTTCTTTTGTCTGGGTAATAAGGTGTATCCAAACTCTTGGAATGTTTATGAGGACCAAAGTTCATTCAAGAGCTCATCAGTTGGAAACCTGGTTTGTTTTAATGCCTTAGTTTCATTATTAATTGTTGAAAAGTGTTTTCGTTTATGGAGACTATATCTTGAAAACCTTCCTTAATAGGTGTGGATAATAAGGTTTTCCTTTTCTGACTGAACTATCTACCAATGACACAGCAGAGTGAGTTGTCTGTACAATTTGATGATTTGTTCAAGAAGGCTTGGGAAGAGGATGCCATAGTATCCGTGGAAGATGGTATGTATTCTGGTATTTTTAAGCTGACACTTTACTCTATAAATTTAAATTGATGATATCATCTACATGAATGTCTTTTGAGACTAAAAATTAAATACTGAATTCTGCTATATTTGTAAGTCATGAATCCTTTTATTGAGTCTGGTTCAATGTTGTTGGCTCTGCTGGTTTTCCTTTGGGTTGCATCAATTCTTTATCAATAAATTTGGTTCTTTTCCCGTTCTTTTTGCCTCTAAACTTATTCCAAAAAGATTAGAATGATTAAAATCAATTTCATTTGATGACATTTGCAGCTATGCATTGAAAAGTAAACTTCATCTTTTTGGTTGGAAATGTTTGCCACATTGGGGGTAAATATGCTTAATCAATTGATAGGCACAAGATTAAGAATGTATATTTTAGAAAAAGGAGTCGTACTGGTAAGGCATAGAAGTGAGGCAGAAAATCGTTAGGAAGGGGGGCCACTGTACGAGTAGTAGAAAGGCTGTCTGGTATTTTGAAGTATGGGTATATACACTTAGGTAGTGAGATGGAGGGACACATTTTTGGCTATTTTGTCTAGGATTCTTCTATGGCTCTTTGTAATTAATTTTCTCTGATCATAAATGATAGACAGGGTGTTTTTATCATTTTGGTATTAGAGAAACTAGGATTGAGGCTATTGAACAGAAGTTTCAAGTGCGCTAAGTGTCGTGGGCATGCTTGTCCAGGGTGTGTTACCCATGGCCGCATGTCCAAACCATCCTCACCACTCGATTTTCTTTCATGTCTCTAAAGCTTTCTAGTGTAATTTTCTTGTA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Homology
BLAST of Moc03g02260 vs. NCBI nr
Match: XP_022150906.1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2667.5 bits (6913), Expect = 0.0e+00 Identity = 1354/1354 (100.00%), Postives = 1354/1354 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. NCBI nr
Match: XP_038896039.1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2487.2 bits (6445), Expect = 0.0e+00 Identity = 1261/1356 (92.99%), Postives = 1300/1356 (95.87%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. NCBI nr
Match: XP_038896037.1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2485.3 bits (6440), Expect = 0.0e+00 Identity = 1260/1356 (92.92%), Postives = 1300/1356 (95.87%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. NCBI nr
Match: XP_038896040.1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2480.7 bits (6428), Expect = 0.0e+00 Identity = 1260/1356 (92.92%), Postives = 1299/1356 (95.80%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. NCBI nr
Match: XP_038896038.1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2478.7 bits (6423), Expect = 0.0e+00 Identity = 1259/1356 (92.85%), Postives = 1299/1356 (95.80%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JAA5 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SKI2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1870.1 bits (4843), Expect = 0.0e+00 Identity = 958/1360 (70.44%), Postives = 1115/1360 (81.99%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q15477 (Helicase SKI2W OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SKIV2L PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 771.9 bits (1992), Expect = 1.2e-221 Identity = 504/1244 (40.51%), Postives = 697/1244 (56.03%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O59801 (Putative ATP-dependent RNA helicase C550.03c OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=SPCC550.03c PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 746.9 bits (1927), Expect = 4.0e-214 Identity = 451/1026 (43.96%), Postives = 619/1026 (60.33%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P35207 (Antiviral helicase SKI2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SKI2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 724.5 bits (1869), Expect = 2.1e-207 Identity = 515/1374 (37.48%), Postives = 742/1374 (54.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P47047 (ATP-dependent RNA helicase DOB1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=MTR4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 567.4 bits (1461), Expect = 4.4e-160 Identity = 361/1037 (34.81%), Postives = 579/1037 (55.83%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DCW3 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018945 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2667.5 bits (6913), Expect = 0.0e+00 Identity = 1354/1354 (100.00%), Postives = 1354/1354 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KCV3 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492717 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2447.9 bits (6343), Expect = 0.0e+00 Identity = 1246/1355 (91.96%), Postives = 1295/1355 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K6C8 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492717 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2447.2 bits (6341), Expect = 0.0e+00 Identity = 1246/1355 (91.96%), Postives = 1294/1355 (95.50%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KB75 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492717 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2442.2 bits (6328), Expect = 0.0e+00 Identity = 1245/1355 (91.88%), Postives = 1295/1355 (95.57%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KFA8 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492717 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2441.0 bits (6325), Expect = 0.0e+00 Identity = 1245/1355 (91.88%), Postives = 1294/1355 (95.50%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. TAIR 10
Match: AT3G46960.1 (RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB1 protein ) HSP 1 Score: 1870.1 bits (4843), Expect = 0.0e+00 Identity = 958/1360 (70.44%), Postives = 1115/1360 (81.99%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. TAIR 10
Match: AT2G06990.1 (RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB1 protein ) HSP 1 Score: 536.6 bits (1381), Expect = 5.9e-152 Identity = 355/1015 (34.98%), Postives = 555/1015 (54.68%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. TAIR 10
Match: AT1G59760.1 (RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB1 protein ) HSP 1 Score: 533.1 bits (1372), Expect = 6.5e-151 Identity = 364/1006 (36.18%), Postives = 549/1006 (54.57%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. TAIR 10
Match: AT1G70070.1 (DEAD/DEAH box helicase, putative ) HSP 1 Score: 259.2 bits (661), Expect = 1.8e-68 Identity = 189/502 (37.65%), Postives = 273/502 (54.38%), Query Frame = 0
BLAST of Moc03g02260 vs. TAIR 10
Match: AT4G32700.2 (helicases;ATP-dependent helicases;nucleic acid binding;ATP binding;DNA-directed DNA polymerases;DNA binding ) HSP 1 Score: 80.5 bits (197), Expect = 1.2e-14 Identity = 57/171 (33.33%), Postives = 92/171 (53.80%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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