MS018773 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTAGCTTTCAAGTTCTTCAAATGGGCTGGAAGCCAGGTTGGTTTCCGCCATACCACCGAGGCTTACTGCATTGTAGTTCACATACTGTTTCGTGCGAGAATGTATGCAAATGCCCACGATATTATCAAGGAAGTGATTTTGAAGAGCCAGAACGACTTGGTTTTGCCAGTTTGTAAGATATTTGATATACTTTGGTCGACTAGGAATATTTTTGTGTTAGGAACAGGGGTCTTTGACGTTTTATTTAGTGTTTTGGTAGAGTTGGGGCTGCTTGAGGAAGCTAATGAATGTTTCTTGAGAATGAGGAAGTTTAGAACTCTTCCCAAAGCCCGTTCTTGCAATTTTTTTTTGCATAGGTTATCAAAGTCAGGGAAAGGACAGTTGGTGAGGAAGTTTTTCCATGACATGATTGGGGCTGGTATTGCACCTTCGGTTTTTACCTACAATGTAATGATAGATTACTTGTGCAAAGAAGGAGATTTGGAAAATGCTAGACGTTTGTTTGTGCAAATGAGGCAGATGGGCTTTTCTCCTGATGTTGTGACATATAATTCTTTGATTGATGGCTATGGCAAGGTTGGTTTATTGGAAGAATCTGTGTATTTATTTAATGAAATGAAAGGTGCAGGCTGTGTTCCTGATGTAATTACCTACAATGCTTTAATCAATTGTTTCTGCAAGTTTGAGAAGATGCCTCGAGCTTTTGAGTATCTCTCTGAGATGAAGAACAATGGGTTGAAACCAAATGTTGTAACCTATAGCACCTTGATTGATGCTTTTTGCAAGGAGGGAATAATGCAAGGTGCCATAAAACTTTTTGTTGATATGAGAAGAGTAGGCCTTGTACCTAATGAATTCACCTACACTTCTCTGATTGATGCCAATTGTAAGGCAGGTAATTTGACAGAAGCATGGAAGTTGTCTCACGATATGTTGCAAGCAGGAGTTAACTTAAACATAGTCACTTATACTGCTCTAATGGATGGCCTTTGTGAAGATGGAAGAATGACGGAGGCAGAAGAAGTGTACAGGGCAATGCTGAAAGATGGAATATCTCCCAACCAGCAAGTTTACACTGCTTTGGTTCATGGCTATATCAAGGCGGAGAGAATGGAGGATGCAATGGAAATATTGAAGCAAATGACAGAATGTAACATCAAACCAGATTTAATACTCTATGGAACCATTATTTGGGGTCTCTGTAGTCAAAATAAACTTGAAGAAACTAAGCTTATAATTAAAGAAATGAAGAGTCGGGGTATTAACGCAAATCCAGTTATATACACAACAATTATAGATGCTTATTTTAAGGCTGGAGAAAGCTCAGATGCAATAAATCTTCTTCAGGAGATGCAGGATGCAGGTATTGAGGCTACTGTTGTAACCTACTGTGTATTAATTGATGGTTTGTGCAAAACAGGTAAGGTCGAACTAGCAGTTGATTATTTTGGTAGAATGTCTGCTGTTGGTTTACAACCTAATGTTGCAGTTTATACAGCCCTCATTGATGGTCTTTGTAAAACAAATTGCGTTGAATCTGCCAAAAAGTTGTTTGATGAAATGCAATGTAGGGGTATGGCCCCGGATAAAACAGCTTTCACTGCTCTGATTGATGGCAACTTGAAGCTTGGAAATCTTCAGGAAGCTTTGAATTTGAGTAGTAGAATGACAGAATTAGCTATCGAGTTTGATTTGCATGCTTACACTTCCTTGGTTTCGGGATTTTCTCAATGCGGTGAGCTGCACCAAGCGAGGAAGTTTTTTGATGAGATGGTTGAGAAGGGCATACTTCCTGAGGAGATTTTATGTATATGTCTATTGAGAGAGTATTACAAGCTTGGACAGTTGGATGAAGCCATTGAATTGAAGAGTGAAATGCAAAGAAGGGGTTTGATTACTGAAAAGTGCAGCCATGCAGTTCCTAGTCTAACAAGAGGACTCCAATGACTAATCTGATCATCTTTGGCGTCTGGAAGCTGAGGTTGTATCTTAATCGCAAGCACATGCGGCATTTATTTGGAATTCAGAAGTATGATGACCCAAGAAACCCACCATTCAAATGGGTTCTGTGTTTGATGGGAAGAACTTGCAAGCGATGCATGATGTATCTGATGTTGGTTTTGGAAGCTCTGATGCAAAATCTTCCATTTGATAAGATGTAGCTTTCCAGTTTTCAAATGACATTCTGCAGAAAAATCCCATAATGTCATGTGTTTCATTAATCATCAATCTTCTAAAAATGTGAGTGACAGTCTTGTTCCTCCTCTTCCTCCTTTTTCCGAAAAGAAGATTTTCTTTTTAGATATGAGATACAGGCGTGGAATTTTTGGCAGTAATAGCCATTTACGTGAGATTGAAAGTAATAACTTTTTCTACAACGATTATGCATGATGTATCCATCTTGCTTGTCTTCTGTCAACTAATTTGGCATGTTGGTTTACAGGTCCAAAGAGGATTCGTGTGGGCAGAGATATTGATTCCCATGGAGGCATTCTAGTGAAAATACCTATCTGTTATTGGTTCCGAGGGAAGCATATTCATTCAAGTTTGAAGCTCGGCACTGCTTATTATGAGCAAGGTGTTCCATTCTTCATGCTTCTTTATATTTCTGAAACTCTTGGAATCCAAGCCTTTGAATGGCCCTTAGAGACTCTGGATTGGAAGAGTGGTAGGTTCTTAGGGAGATTATTGGCAACATTCAACCTAATTCTAGAGAGAACTCTTTGAAATGGATCCTTGATCCTTTTCAGTAGTTTATGAGCGTCTCTCTATTTTCCTTTTTCATGAATGGTTATAGCCTTTTGCCAACAAACCTTGCTAGGAAGATTTGAATGGCAAAATTCCTATGGAAGTCAGAACATCCCTCTGTTCTCTCAATTTCTATTAAGAAGAATAGAAAAGCAAATTACACCAATTCTCTTCTTTAGAGATAGATTGAGCCAACGACCCAAAACCCATCTAAAATTGACAAAACTGACTGCAAAAATCAGTGAAACCAACCAGTTCGTTAAAAACCAAAGCTATTGAAATATTTGCGATTTTGAAACTATATAAAATTGAATAGACCGACACTTTTACCAAATTGACCCAACTAGCATGATAAGTGCCAAGGTTGCTCGGGTTTACAAAACTAGAGGTCCTTCTAAGATCCTTGCAAACATTCACAAAAACGACTAACTTACCAAATGATTCCAACCAAGAGTAAGGTTAGAAGATGATTCACTCTTAGATCAGACTTAGAATCTACGATGGTCACTCCTAGATCCTAAGATGACTTACTCCAGAATTAGCTTGATCGAGACTGATCCAATGAATCGAGTTTAATATCAAACCTAAGCAAGATTTGAAAGAAGCAACACCAAATGTGTTAAGGAACAGAAGTTCTTGAATTTCAATATGTTGAATCTAAAACAAGGTGATTACAAGCCTTTAAATAGGCTAAATGGTCGTTTAACATAGGAACACCAAAAGTCTTTCAAAATACTACTTAATGCAAATTGAAGAAAATAAGACATGCAAATTAAAACTTGATTGCACATCATTCTAGACACTTAAATGCGGATCAGAAAACGTAGTCACGCTTCAAATGGTCTTACCTATGTGCTGTAGGAGGTGCTTCACATTTTGATATGGTTTGACAACTTTTGATTTCACAAACTCCCAAGAGGTGCAATCTGCAAAGGCACCTGTTCACGAATCTGCACACTTTTTTTGTTCTCCGTGCCATCTCTCAAAATAGACAACTTTTCCTGTGCCATCTTTGGTCAATTCTCTTCTTGACTCATTGAAGTAACATTGTAAATAAATTTGGGATAAAACTCTTCGTTGGTTCTTGTGTATTAATCATCCTTTGAAGATGTAGTGTGAAAGCCTCTTGAATCTTCTTTGCCTTTCTTGTAATAATTGTTCCTTTGATACATGTAATTGGTCACAAATGGATTCGATCATAGCACGACTTCATTGTTTTCATTGGTCCCATACCTAAGAATGTTTCAGCCTCTCTCCTAAGTCCTGAAAGCCTGGGTGGCCTCCCTTTGGGTGCTAAGGCTTGTTCTCCAGTGTGTGGGAAATGGGAATGTTGTTCTAGTTTTTTGTTGGAACATTTAGTCAGGGAAAAATACAAGGGTCTTTCAAGTTCTTCATATAGAGATTAGGGGATCCTTTTGGTTATAGTAATCTTCTTGTCTCCTGTTGATGGTTCTTTCAGGAGCTGCTACAGCTATTGTACTACTACTATAGTTGGCAGCTGGACAACTTTTTGTAGTTTTTAGTTGCTCTGGGGCTTGAGAGATGCCTTATATTTCTCCCTTATTTTTACAGGATTTTTCTTCCTCTGGAAAAAGCTCATCAACTTCCTTTTCCTCCAAATGGAAGGTCTTCACGGATGAGGAGCCACTTCTAAATCATCATGGGTTGACTTAGTGTTCATAAATGTAAATAGTAAAGGGTTGAGAAAAAATAAGCTCAAAGTTCAAACCATAGTGGCCACCTACCTATGATTTAATATCCTACCAGTTAACTTGGCAATCCAATATAGTAGGGTCATGTAGTTGTTTTGTGAGATTAATTGAGGTGCGTTCAAGCTGGTCTGGACACTCATGGATATCAAAAGATAAAAGTAAATAAATAAGTAGGCACTTCTCTGTTATGTTTTTATTTTAAAATTTTTATGTACCTTAAAGCAGTGTATTTTTAGTTATTTATCATAACACTGTAGTTATCCTTATGTGGTTGTTCTCGTTTCTATTGTTAGATATTTAGTTCGTTACAACATGATGATGGTGATTAAGAAGGCTATAGCATTGGTTAAGCATTCCAAAGCTGCTTTCTTTTTTCAAGTTAATTTGTCAAGTGAAACTGATTATCAGTACAATTTTCACTTCTGATTAGTGATTTTTGGCACCTCCACTAATAGTGACTTGCAAAAGCTTTAGATGGTTCCCATTTCTGTTCATTACCATCTTCAGGAGTCCTACTGTAGGGAACAAAACTTA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BLAST of MS018773 vs. NCBI nr
Match: XP_022146419.1 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 [Momordica charantia] >XP_022146420.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 [Momordica charantia] >XP_022146421.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1286.2 bits (3327), Expect = 0.0e+00 Identity = 638/644 (99.07%), Postives = 639/644 (99.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. NCBI nr
Match: KAG6601913.1 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1183.3 bits (3060), Expect = 0.0e+00 Identity = 571/638 (89.50%), Postives = 609/638 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. NCBI nr
Match: KAG7032608.1 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1182.9 bits (3059), Expect = 0.0e+00 Identity = 570/638 (89.34%), Postives = 609/638 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. NCBI nr
Match: XP_023534824.1 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023534833.1 putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1179.9 bits (3051), Expect = 0.0e+00 Identity = 568/638 (89.03%), Postives = 609/638 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. NCBI nr
Match: XP_038906984.1 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1176.8 bits (3043), Expect = 0.0e+00 Identity = 574/639 (89.83%), Postives = 607/639 (94.99%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0C894 (Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g02150 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 780.8 bits (2015), Expect = 1.5e-224 Identity = 371/640 (57.97%), Postives = 489/640 (76.41%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZUA2 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g01740 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g01740 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 390.6 bits (1002), Expect = 4.5e-107 Identity = 207/547 (37.84%), Postives = 318/547 (58.14%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LVQ5 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g55840 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g55840 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 383.6 bits (984), Expect = 5.5e-105 Identity = 236/818 (28.85%), Postives = 401/818 (49.02%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WVK7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g05670, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g05670 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 3.7e-101 Identity = 203/636 (31.92%), Postives = 341/636 (53.62%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FJE6 (Putative pentatricopeptide repeat-containing protein At5g59900 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g59900 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 341.7 bits (875), Expect = 2.4e-92 Identity = 217/803 (27.02%), Postives = 380/803 (47.32%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CX77 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015641 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1286.2 bits (3327), Expect = 0.0e+00 Identity = 638/644 (99.07%), Postives = 639/644 (99.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H589 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460688 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1175.2 bits (3039), Expect = 0.0e+00 Identity = 567/638 (88.87%), Postives = 608/638 (95.30%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FET4 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444847 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1172.5 bits (3032), Expect = 0.0e+00 Identity = 570/637 (89.48%), Postives = 608/637 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K035 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489432 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1158.3 bits (2995), Expect = 0.0e+00 Identity = 562/635 (88.50%), Postives = 603/635 (94.96%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CT40 (putative pentatricopeptide repeat-containing protein At2g02150 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503999 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1115.9 bits (2885), Expect = 0.0e+00 Identity = 542/637 (85.09%), Postives = 588/637 (92.31%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. TAIR 10
Match: AT2G02150.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 780.8 bits (2015), Expect = 1.1e-225 Identity = 371/640 (57.97%), Postives = 489/640 (76.41%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. TAIR 10
Match: AT2G01740.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 390.6 bits (1002), Expect = 3.2e-108 Identity = 207/547 (37.84%), Postives = 318/547 (58.14%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. TAIR 10
Match: AT5G55840.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 383.6 bits (984), Expect = 3.9e-106 Identity = 236/818 (28.85%), Postives = 401/818 (49.02%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. TAIR 10
Match: AT1G05670.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein ) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 2.6e-102 Identity = 203/636 (31.92%), Postives = 341/636 (53.62%), Query Frame = 0
BLAST of MS018773 vs. TAIR 10
Match: AT1G05670.2 (Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein ) HSP 1 Score: 370.9 bits (951), Expect = 2.6e-102 Identity = 203/636 (31.92%), Postives = 341/636 (53.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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