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MS017878 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCAAAGCTTCCACCGGGCCCAAGGCGGCTTCCGATCATCGGAAACTTGTTGGATCTCGGAGACAAGCCCCACAAGTCCCTGGCCCGCCTCGCCAACGCCCACGGCCCAATCATGTCCTTGAAACTCGGCCAAGTTACCGCCGTCGTCGTGTCCTCGCCGGAGATGATCCGGCACGTCCTTCAAACCCACGACCACATCACGTCTTCAAGAGCCGTTCCGGACGCCGCCGCGGTTTTCGACCACCACCAACTCGCTCTGCCCTGGATTCCGGTCTCGCCCATTTGGAGAAACATTCGAAGAATTTACAACACCCGCCTTTTTGCCCCCAACATTCTCGACGCCAATGAGATCCTGCGCCGCGCCAAGCTGGAGGACCTTCTGGCAAATATCCGGCAAAGCGCCGTGAGCGGCGCGGCGGTGGACATAGGAGGAGCTGTGTTTGCGACGACGCTTAATATGATGTCGAACTCCATTTGGTCGGTGGATTTGGCGGACCCGAATTCTGAAATGGCGAAAGAATTTAATGAGACTTTGAGGGGAGTGTTGGAAGAATCTGGGAAACCCAATATCAGCGACTTTTTCCCTGTGCTGAAGATGATGGATATCGAAGGTGTAAGGAGGCGCAACGCCGTTCATTTGAGAAAGATGTTAGATTTGATCGACAAGATGATTGATCGACGGCTGGAAATCATGCGGGAATCGCCTGATTTCGCACCAAAAAATGATGTGCTACATCATCTTCTCAACATGGGGGAGCACAACGGGGAGATTTCTCTTGATAGAAGTCAAATCAAACATTCAATATTGGTCAGTCATTTTCCCTTTTCCCTTTTTTGTTTGTTGAAACTGAAAATAAACTATTTTTCAGTCTAAAAATGGAAACAATAATACGACTTAGGGGCTAGGGCACTCATTGATAATGATTTTGTTTCAAATTCTCTGTTTTTAAGAATTATATAGGTTTTGATCTTCTTATAACTACGTTGACTTCTTAGCTCAATTTTGAAAAAGGAAAACAAATAAAGTTATTTATGTTACAATTTACAAACCATTTTTAAGAATATAGAAGTTTTAATTCCTCCGCATAGGCATGTTAAGAAAAGGAGAAATAAAAGTGAGAGATCATTTGAGAGAAATTTATTAGAGACAAAAATTTAGAGAGAAAGGAAAATAAATTTGTTTGAGAGATATGTCAAATAGAAAAAAAAAAATGAAGGAAAAGAAACAACTTTTCAATGAGGGTCAGAACAAGATTGGGTGATTTGCATTGACGGACTTTAGTTGGTGATGATTTTAGGTTTTATTTATAGCGGGAATTGATACAACTACGGCAATGGTTCAATGGACAATGACATATCTTTTAAAAGATCCAAAAAGTATGTCAAAAGCCAAAGAAGAGCTCCAACGAGTGATTGGGAAAGGAAATCCGATGGAAGAGTCACACATCGACAAACTTCCATATCTACAAGCAATCGTCAAAGAAACCATGCGATTGCAATCTTCACTTCTACTTCCTCGTCGAGCCGAAGAAGAATTAACCATTGGAGGCTTCACAATTCCAAAGGGCACTCAAATAATGGTCAATACTTGGGCTTTAGGCAGAGACCCAAATGTTTGGGAAAATCCAAATTCATTTAGGCCGGAGAGGTTCTTGGGTTCGGGTTCAGCTCACGCTAAAGGTCGGAATTTTGAGTTTATTCCGTTCGGCGGTGGCCGGAGAATTTGCCCTGGTCAACCATTGGCGGTGAGGGTGATGCATTTGATGGTGGGTTCGCTGGTTCATTGGTTTGATTGGAAGCTTGAAGATGGAACCACACCACAAAATTTGAACATGGATGACAAATTTGGTATTACTGTGAAGAAGGCTCATCCTTTACTAGCTGTACCTGTTCTTACGTAATACAGATGACAACTTTCCTATTTATTCTATTTTAGTCTCCAAATTTTTAAAATATTGTAATGATTGTGATGTTTATTATTGTTTTGTCATCAATTATATTTATCAAATAAAAGAAATTATTAAGAATATATGTCTTAATGTGTTGACCTTTAAGTATAAATTGAAAATAAAATAAAATAATGCCCGATCAAGTGAAAATAATTTTTATTGTTATTTTTGTTTTTTTGATGATGTGAAAATATTTCATTTAAAGGACCATTATGGTTGAAAGGCATATATTCTCAACGGCCATTTCCAGATAGAATTCAATTTTATTTAGGGTATAAACAAAATACTTCTGAACTTTGTCACTGGTTCAAAAATTGCATCCATCCTTTCAAAAATTTCAAACTTTTTTCAACATATTTATAAACATTTTAAAAATACTTTTTGAACCAACATTATGAACTTTAGAAACAATTGTCAAATCCATATCCTTTGCTTAAAAGATCAAATAAAATAATAATAATAACAAAACATTGAAAGTGTGGATAACAACTGGTAATCACTTGAAATATTATATATATACACTTTTAAAAAGTAGTTTTGGAGACAATAAAAAAATAAGAATAAATAAATAAAATAACATGGGTAAGGTAGAGGAAGAAAAAAGAAGGAAAAAAAAACGAGAAGGAAGAAAGAAAATAAGAAGAAGAAGAGAAAATGAGAGAGATGAGAACAGAGAGGGGCAATAAAGTCGAAAAGTCATTGGAAAAGCTATGGGCAATGCCGAAGAAGATTCAAGGAGGCTTATAGACAGATACCAAACTTGGTCAAGTGGACCGAGCTAATTATCAATTAAAATTTTCGTGTCAACAATCCTGTGCATGGTCATTTTATAAAGTATGTTTATAGTTGCAGTAATCGTTGAACTTCCATATTGGAATTTTGAGTTGATTCATATTAATGATTTAGTTATTGAGAATCATGGGATATTCAAAGAAATTTATGCTTATATCGTAAGTGATTTGTGATTATTAAATTGATTTCGATCTTACGTTGAGAAATGTTAAGCAATATATATTTATGTATGAATTTTTATTACAGTGACATGCTACATTATTATTTGTGTTTATGAAAAGTTAAATTTATTTTAGAATCTTGATATAGCTTATTTGGTAAAAGTCTTGCCTACGGTAAATTTAAGTTTTGCGAAATTGAAGTGATTGGTGGTTGTTAAGGTTTAATTTTTGTTGAATTGAGATTTAAAATCATTTGTAACGATTGGTGCCTGTGATATGAGATTTCTAAGTTAATATGACTTGGTAATTTAAAAATGTCTCAGGATCATCAAATTATGATTTTTGCTAAAAGATGAGTCTCAACCTTGTTTCATTCAAAGTATGGTAATTGGGATGCTAACTAATATAGTAGAATATTGAATCATTAATATTTAAAGATTAAAATACTTTGATTTAAATAATTATGATTTGGTGTGGTTTGAAAAATATTAAAGCTATTCTAGAAACTATTTCAAACTACTACATCTTTTATCCATGATGATTGTTAAATACACATACGCGTATAGTTGACCAGCTTTGCGTATAGTTGACCAGCTTTGCTTTATCATGTATCTAAAGTTTACTCGATATATAGTAGGACCAGTTTGCTCTGCTATATATCCTTGATGTTACTCGATACATAGGTATGACCAATATTCCACTGCTACATGTATTGAGCTTGCTCGATACGTCAACCAGTTTTGCTCTACTATACATCTTGAGGTTGCGTGATGTATAGTATGACCAATTTTACCCTACTATACATCTTGAGGTTGTTCGATGTATATTATGACCAGTTTTTCTCTGTCATGCATCTTGATGCATAGTATGACCTGTTTATCTGCCATGTGTAGGAGTATTAAAGCCTATGCATATATAATCTGTATGCTCTGCTATATGCATTGAAATTCTCTGTACATAATATGGCCAGATGGCCAGTTTACTCTGCTATGCGTATTGAAAAATTACTCTACACTAGTATGGCTAGTTTCAAGTATAAATTTAGTGATGAGTTTTCCTAGCCATGATGATGTTTTAAAGGTGATGTTTGAAAAGATCTATTACCATGGATTATATCAAGTTATTTAGTATATCAAGTTATTTATTTCTCAATGTATTCATGACAGTCTCATCAATTATAGTCTATTATTCATCATATGTTAAGAGTTTCATCAGCATTATTTCCCTATAAATCGCTTCCACTCACTGAGCTTTAGCTCACCTTTTTGTCCTTATTCTTTTTCTAGGTAGCAATCGAGTCTCCAACAATCCTACTGAGATAGAGATCATCCACCAATCTCGTATAGATTGCATAACACTTTGCATGTAAATGTCATAATGTGTTTGTATTTGTAACTAGCATGGCTAATATTATTCTTACAACATACATTGCTTTCAAATTTTCTAGGTATTTAGGTGCATGAATAGTTTCTGTACTAGTATACACTGAGACACATTTTATTGTAGTTGCTGATAAAATATTTGAAGTGTAAATATTTTCTTTTCAGGTGTATTTTATCCAATTTTCAAAATAAATTCTGTCTATTTTTTTTTTTTATGATTTGCTTTAAGTCAAAATTGGTTAGCCACGATTAAATTCTCAAATGATAGACCAGTTCATGTTAGATTGACTACAAACTCTACAGGTAGTTGGAGTTTGTGGTTGGCGCGACTTGTTCTAGAATTAGTAGAGTGTTTTGGGGCGGGTAGTGTCAAAGTCGAATTCCCTTCTTGCTATTGATCGGTGTTCCTTTTTAGAAGCTTCGACAAGGCGTCAAGATTCTTTTGTTTGGAAGAGTATTAGGGGAAGCAACTTCCTTCTAAAGGGATTCGTTGTAGAGTCGTAAATGGTGATCAAATTATTATCAACAAGGACAAGTTGGATTTATTAAAATAAATCATTAGGCTTGATATTAGTTTTTGAAGCAGAAAGTATGATTGAATTCTAAAATATAAAAAGGAGAGAATGGGACTCCAAATATTTAGTAGATGTTGGATTTGTTTTGTCTGTTTTTTCTTTATTTGTAAAATATAATGAATGTTTTATGAAATTA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BLAST of MS017878 vs. NCBI nr
Match: XP_024045360.1 (uncharacterized protein LOC18047923 [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 870.9 bits (2249), Expect = 9.2e-249 Identity = 454/1002 (45.31%), Postives = 636/1002 (63.47%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. NCBI nr
Match: XP_022159618.1 (geraniol 8-hydroxylase-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 869.0 bits (2244), Expect = 3.5e-248 Identity = 433/500 (86.60%), Postives = 459/500 (91.80%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. NCBI nr
Match: KAF4404811.1 (hypothetical protein G4B88_006197 [Cannabis sativa]) HSP 1 Score: 816.6 bits (2108), Expect = 2.1e-232 Identity = 456/978 (46.63%), Postives = 623/978 (63.70%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. NCBI nr
Match: RVX15474.1 (Geraniol 8-hydroxylase [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 767.7 bits (1981), Expect = 1.1e-217 Identity = 423/954 (44.34%), Postives = 601/954 (63.00%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. NCBI nr
Match: XP_022159633.1 (geraniol 8-hydroxylase-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 760.8 bits (1963), Expect = 1.3e-215 Identity = 385/388 (99.23%), Postives = 385/388 (99.23%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VWZ7 (Geraniol 8-hydroxylase OS=Catharanthus roseus OX=4058 GN=CYP76B6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 7.6e-137 Identity = 252/499 (50.50%), Postives = 356/499 (71.34%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D1MI46 (Geraniol 8-hydroxylase OS=Swertia mussotii OX=137888 GN=CYP76B10 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 486.9 bits (1252), Expect = 4.9e-136 Identity = 247/497 (49.70%), Postives = 357/497 (71.83%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: W8JMV1 (Cytochrome P450 76T24 OS=Catharanthus roseus OX=4058 GN=CYP76T24 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 455.7 bits (1171), Expect = 1.2e-126 Identity = 231/503 (45.92%), Postives = 330/503 (65.61%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: W0FKI0 (Drimenol monooxygenase OS=Persicaria hydropiper OX=46901 GN=CYP76AJ1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 443.7 bits (1140), Expect = 4.8e-123 Identity = 227/493 (46.04%), Postives = 332/493 (67.34%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: I3PFJ5 (Cytochrome P450 76AD1 OS=Beta vulgaris OX=161934 GN=CYP76AD1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 439.9 bits (1130), Expect = 6.9e-122 Identity = 230/493 (46.65%), Postives = 320/493 (64.91%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZB2 (geraniol 8-hydroxylase-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025978 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 869.0 bits (2244), Expect = 1.7e-248 Identity = 433/500 (86.60%), Postives = 459/500 (91.80%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6ICL0 (Uncharacterized protein OS=Cannabis sativa OX=3483 GN=G4B88_006197 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 816.6 bits (2108), Expect = 1.0e-232 Identity = 456/978 (46.63%), Postives = 623/978 (63.70%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A3Q7GX60 (Uncharacterized protein OS=Solanum lycopersicum OX=4081 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 774.2 bits (1998), Expect = 5.7e-220 Identity = 415/920 (45.11%), Postives = 584/920 (63.48%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A438K2N6 (Geraniol 8-hydroxylase OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=CYP76B6_14 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 767.7 bits (1981), Expect = 5.3e-218 Identity = 423/954 (44.34%), Postives = 601/954 (63.00%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A3Q7I915 (Uncharacterized protein OS=Solanum lycopersicum OX=4081 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 766.1 bits (1977), Expect = 1.5e-217 Identity = 410/935 (43.85%), Postives = 594/935 (63.53%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. TAIR 10
Match: AT2G45550.1 (cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 4 ) HSP 1 Score: 429.5 bits (1103), Expect = 6.6e-120 Identity = 231/498 (46.39%), Postives = 322/498 (64.66%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. TAIR 10
Match: AT2G45570.1 (cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 2 ) HSP 1 Score: 423.7 bits (1088), Expect = 3.6e-118 Identity = 228/496 (45.97%), Postives = 316/496 (63.71%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. TAIR 10
Match: AT2G45580.1 (cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 3 ) HSP 1 Score: 419.9 bits (1078), Expect = 5.2e-117 Identity = 233/513 (45.42%), Postives = 333/513 (64.91%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. TAIR 10
Match: AT2G45560.1 (cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 1 ) HSP 1 Score: 415.2 bits (1066), Expect = 1.3e-115 Identity = 227/508 (44.69%), Postives = 321/508 (63.19%), Query Frame = 0
BLAST of MS017878 vs. TAIR 10
Match: AT1G33720.1 (cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 6 ) HSP 1 Score: 400.6 bits (1028), Expect = 3.3e-111 Identity = 220/498 (44.18%), Postives = 318/498 (63.86%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Pages
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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