
MS016526 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATTCCTACGATTCTCTGCTACAGAAACTCCGGCTTCCACAGCCGTCGCTTCAACGATTCGCCGTCACTTCAATCTTCTGCAAGCTCCGAACTGCTCCGAAGCATCTCAACTCCGATTCCGGGCCGGGAAGGGAAGCGATTTCCCAATGCCTACTCCACTCCTCTCCCGCCGTCGTCGACCAATCCGTTCGGGAGCTCTGCCGCTTCGTCAAGGATTCGCAAATGGACGTCTATCGCGGCCTGATGGAGCTCCAAGCTGCTCTTGAAGGATCGGAATCGCGGTTCGTTGACGTGTTCGTCAAGGGACTGGGATTTCTAGTTCAGTTTGGATTCCGGAAACACAATGGTAAATGGCAGTTTGGCTCGACGGAAACTCATCCGTTTGTTAAGGTAAGAGAAGAAGTTGCTCTCTACTTTTGTAATTTTCATTTGAATTCTTGATTGCTTTAGTTTGTCGTTTAGTTTGATTGGTTAGCTTAAATCTTCTATTGGGAAGGATTCATTTCTTGAATTGACATACTTTTGAATCATGGTAAACCACTCCTCTGTGGATTCTGAAGTTAGTTTAGACTTCACTGATGTTGATCGTATCAAACATGTTGTGTTATCTTGGGTTAGATGATCCCAATGGCTACTTTCATTATAAGCTATAGGATTATAAAATTTGAGAGTAGATCATATGGTTCTGTATTCAATTTCATGAGATCGCTATGGCTTATATCGGTTGAAGAAATTGAATAATGATTAATCTAGTTCTCGCTGGTTAATATAAACTTAGGGTGCGTGGCAGGTGTTGTCTTGTCGAGTTGATGTCCAAGCCCAGCTCTTGCACCAAATTCCGCTATTTATGGTACAGAAGAAGTCACTGGGAATGGAGGCTGTTGGAGAATTCTTAAGCCCATTTGTGAACTATTCCATATTAAGAACACAGTCTTCAGGCTTATCATCTTCATCATTTTCACGGAATCTGATATCATCAATTATGTCTGTTTGTTGCTCATTTCCGCACGAGGCAATGCCTCTATTTGCTTTGTTAACCCGAAGCCTCAAGTTTGTCCCATGCAAGACTCTAGAAGTAAGTTGGAACAGAGGCAGATTATTTCTAGTGCTGATTCGAATCTACTTTATATTTATCATTTTAAGATTTTTTCCACAATGAGCATAAGATACGAATAATTGCACTTAATTTGTACCAACGAGGTTTATTAGAGTTCTTCATAATCTTGCAGGATTTTTGGAACTTCATACATCTGGTGGAATCTTTGGTGGATACCTGTACTGTGGTTCTAAAACTCTTAGTCACCAATGGATCGGTATGCAGCAGTTTCATTCTTTATCGCAGTGAGATAATAGGTTATTTTGTCATTTTGTTTGTCTGTGTATACTCTTGCTTTCACTGAAGTTCGTAAGTTTAGTGAAACTGGTTGATAGTTTGGAACTGTCTTGAATTAAGTTATAAAGTTTTAAATTTTAATCTCTCTCTCGACTTCATTTTTTCCCTGCTTAGCATCTCATAATGGAGGCTCAACAACGCAGCATAGAACTTCTAGATACAATTCTCTCCCTATATGCATGTCTTGATAGGCATGTTTCTGGCTTTGAGCGCATTATTGAACTATCAAAATACTTGCTGTTGGTACAAAAGGACCTCGGGATGCAATATGTACCTAAGCTATCCTCAGCCTTCCCATCGTTATTTACAATCCTCATAAAATCAGAGCTAGAGCATGAGCAATTGTTGATTTTGAAACTTCTTCTCTCCCTCTTGCGGTGGAAAGCTGAACATGGTATGTAAGCTGTTCAGTTGAATGTGTCCTACCTTTTATTTATGTTTTCAAATTTTCAATTTCTTTCAACAGTTGCCATTTTACTGCCGTTCTGTTGTATATATAATTGCTCGTGGTTTTTCAGATGTTCCTAATAGGACGAGGACACTTGTTCCGAGTGAAGAACTTTTATTTGTCTTTCCTGCCATCAGCCTCATGTCATCTCCTTCAAAATCTATTAAAGGAGCAGCAACTGAATTGCTTTCCATATTAGAAAAGTTTTTGGTGACACTATCAATGACCACAAAGGATGAAGTTGTAAAGGAGAGGGGGTTTCACTTTCCATCGATTAGCACACCTGGATCTATTGTTGTTAAGCTTTTGGAAAAGCTACGTTTCCAGGTCAGTTTTATAATATGTCTCGAGTATTTTCCTTTGTATAACCTGAAATGGTCGCCTAAACCTGCAGAGATTGGATTCTTACTTGAAATGGTGACTGACATTTGATAAGTTCAAACCATTTTATCTCAGGAACTTTCTTCACTATCCAGTAGGTTCTTTTTGGGCCAGAGTAATGGCAAAGATGATAATGATTTGCCCAGGAAGTGTTGGACACATAAATTAAGAGAGTACTCATTATGGATTGTTGATAGGCGGAAATCACTCTTGCCCCTCTCTCAATTTGAGGAATTATTTGTTTCAGGTAAAAGAAAAACCCTATTCTTGATGAGTTTTCTTCATAACAATTTTTATATTTTGGCATCCCTGGATTGATGGGGTAAGTGATTGATATTATTGTATCATTTGCCTGTACAGAAATGCCCTTCCTCGTAAGTGCAATCACTGCCGTTATGGTGGTACATCATTCATTGGCGAGTGATGCTGTACAGTTACTAGCTGCAATCGGAATTTTGGATCCAAAAATTGGATTTCAATTGTTGCTTCTAGTCCTCTTTTACAGTAATATATTTTCAAGGAAAGAAGTTGATCGCCAGGATATGGTGGTGAGTTTTCTTTTTGCACTTAGATCTTACTAGTTTTCTAGAATGTGATTGCATGTGATATTTTTAGGTTGTTATTTGATCTTTAAATGAATTTGTTTCCAATTCAAGATTGTCTTTATATTCATTTGAGTTGAGTTGATGCTAGTCACAATATTGCTGTCATGATTACCACAAATTATTGAGCATCAACTTATTATAATACATACATACATACATATTTATATATATTAGAAAAAGAAATTAATGACATCAATACTAACAATAATGTTAATGGGCCTAGCAATCAAATCAATAGCATACCTTGTGCAATGACAATGCTGAATCAATCAACCATCTTCTCTTTGACTGTTTTCTTGTCCCCTCAAAGACCGGAACAGATTGTCTGAGGTTTTCAACCTAGAAGACTGTTTTCCTTTGGACACTAAAGCTTCCGTAATTTGTTGCTTTATGGTCCTAATTTCAAGAGACATGCTCAGGTTATTTGGAGGAGTGATAATCCGGTTCTTGAATGGGAAGTTTGTTTTGATAGAAATATATGGATTTTTCAGGATGTTGGAGGATGTTAGGACACATTTTGGACCTCTTGACCCTTTTAGCTTCTTGAATGCTAATCTGGTCCTATTATTTTCTAAAAGAATCTGAATCCTTATAGAACTTAAAAAAAAAAGAAAAGAATTCCACTTCCTTTTTTTTTTTTTGGTTAATGTCGATAGTTGATTTTAAAAATTATATAGTGAGAAAATATATTATTTGATATAAATTTATTGTATTTACCTATTATAGTTAACTTTAACTGTTCGCTTATAAAACGAGGTTCAATAGAAATTTAATAGAAGTCTATGGACATTATTCCAAAAAAAAAAAGTTTCTCCAGTACACTATCCTCACTCTTATATATGGCATGGATAATTAGTACTTCGAATATTTGCTTTTTTTTCCAGAGACACATCATTTGTCTTTGTTGTTTAAATATATGAACGTATACTTCTTTCATGTTGATGCACAGCTTAAACTTTTGGCGATACTTCCATGCCTTGCTTCTCATAGTGAAATGGTTCCATTCATAGTTGAAGCTATTTCACCAATGCTTCGCAAGGATTCAAAACCGTAAGTGCCTTAAAAGAAAATCTTTATGGTCTTGTTTCACTTACATTTATTTGTACATATTTTGTGGCCAGTAGCCACTTTTCCTCATATATAATCTTTTATAGGATAAGTGATTCTTGATAAATGAAATATACAAAGCTGATTCCTCTCTCATTAAAGACTTCAGTAATGAATGAATGAATTCCTCTGCTCAGTTGAAGCATAGTTGCAGAAAAAACCAGAATGTCTGTCCCCTTTTGTAAGCCATTTGAATGCACATTTTTTGCCTCCATAGCAACACTTCTTTAAACACGGTTCTCAAGCCTTCAGCCATCTTTTCTATTTAGTCTCTTTTTCCTCTTTAGCGTTTCATCCCAATCCTCCTTGATCTAGAAGACCAAAATTATGAACACCAGATTTCAAGCTTAGTGGTTTCCTTAGTAAGATTAAACATCGTAGACTCATCCATGGTTTTCGCCCCAATGGTGTATGTAAAGTGCAATTGAAATTCTTGGAGAGTTATACACTTGTACATTGAAAATACCGTTTGCTATTTCTTGAAGCTCAATCTCTCTCCTAGATGAATCATATAGCCAATAGAAACCATGAACCAGAATAGAAGAACTTGTCCCACCCATGAGTAAATATTTTGTAATATTGGCCTGAAGTGGGGAAGATCCATATTATATAATAAAGTATTCTATTGGTATGAGGTATTTTAGATGAAACCAAAAGCAAATTTATGTGAGCTTAGGCCAAATGTGGACAATATCATATTATTTTGAAAATATGGGGAGACTTGTTGTCCTGACAAGACAAGAGGACATCAAGGGATATGGATCATGTATTTTTGGAGGTGCCACTTTGCTGTGAAACTTTGAAACAAAATTTTGGACACAAGGTGGAGATGGTGCTTGTTTTGTAATTGTCCTTTATTTTTTATTGCTAATAACGGGAGGAGTCTCTTGTAATTTTGTACTTTATTTATTTTGTTTTTTTGTATTGCTCAATTGTCTGTGTAGTTCATTCTTTTAAGGCTCCTCCTTTTGTACTTCTATTTGTCCTAATGAAAACTAGTTTCTCATATTTATGCTAAAAAACCCACTTCTTTAGACCGGGCTTTGAAGCTAACCTT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MDSYDSLLQKLRLPQPSLQRFAVTSIFCKLRTAPKHLNSDSGPGREAISQCLLHSSPAVVDQSVRELCRFVKDSQMDVYRGLMELQAALEGSESRFVDVFVKGLGFLVQFGFRKHNGKWQFGSTETHPFVKVLSCRVDVQAQLLHQIPLFMVQKKSLGMEAVGEFLSPFVNYSILRTQSSGLSSSSFSRNLISSIMSVCCSFPHEAMPLFALLTRSLKFVPCKTLEDFWNFIHLVESLVDTCTVVLKLLVTNGSHLIMEAQQRSIELLDTILSLYACLDRHVSGFERIIELSKYLLLVQKDLGMQYVPKLSSAFPSLFTILIKSELEHEQLLILKLLLSLLRWKAEHDVPNRTRTLVPSEELLFVFPAISLMSSPSKSIKGAATELLSILEKFLVTLSMTTKDEVVKERGFHFPSISTPGSIVVKLLEKLRFQELSSLSSRFFLGQSNGKDDNDLPRKCWTHKLREYSLWIVDRRKSLLPLSQFEELFVSEMPFLVSAITAVMVVHHSLASDAVQLLAAIGILDPKIGFQLLLLVLFYSNIFSRKEVDRQDMVLKLLAILPCLASHSEMVPFIVEAISPMLRKDSKPVLYATATRLLCQTWEINDRVFGSLQTVLIPKGFSDFASEREICLSLAASIRDVCRKDADRGVDLILSVSACIESPDPMIQALGFQGLAHLCEADVIDFYTAWEVIAEYPLDYSANPILAKSLCNLLRWGAIDAEVYPDASSDIIRILFAVGTSTTSCEHDLQWTKAKASAFDALAQYEVPLLENISDFKERCTSLLSTETDLNILSAIKDLLVKIIAYEHSNRRRLVKEKRVAGSKIEKLLDVFPRLLFSSGNRSNVKELPAAALLCHSFSSRKGNDPARRTPDKHASYENALCEIAESLQLSRNIVMAVLALESWKPFMERWLKSEILSFDVRDTAVMSDKTCKAANDILKIVIHAAEEALPRSAENMALAMGALCMVLPQSAHAVKSTASKFLLNWLFQYEHEHRQWPSAISLGIISSCLHVTDHKLKFQNISGLLEVLSVSKSILVKGACGLGLGYSSHDLLSRVEIVDKSKLDKDKQTTKIEEVELLGAIVRALSLMICQFTKSSKDMLEDLSVLFPVHSFNISVDAQLLHENGDLEEEVWGVAGLILGLANTIVAIYKAGEYDAVLKIKSLITSWIPHGNSVLQCSGSFDEDASRSLSVGSCLALPTIMMFCHRLELINGNELDHLVNTYKEIISELLSVKRSSTSHQNLMMASCIGAGNLLACILNEGVHSIEVGCVKELLELFRRCYSNPYNPMIHFGGMLGVVNSMGVGVGSLFNVHPTTTSSVQAEHDLMESSHLMGPLLSSHVCEPLLTSLMQEMYLVAQNSDDNQLQQYAAWAVSFLRHNIWSKQFSKLQILNETNVAGSRSIPQNFQMDGVVMRLCNLLMQVNLSGVIATTHIDTVVTTLRCLSQAPRLPTLDWGAIIRRCIRYEDQVSELPPPGSALRKGSLKEECLKFSLAHANQFDELLIFLDELSDISRFRKLVLNLQSCLLIHLADLVKVFSNSRVEKLLDDMTRYLPSVYSDKLYNNYEKHLLSISCWKGLYQCLEEASLDSLECVSHIENLMEALFTMLPTLPSCTNTEVDEVHSPKEWFEAIRCLGKARQTWLLKFLQISPEDLVSRDEKFFEVLKKMKAKAKLIRNGSLPLSELGKMKTLMLNLKSQDVWDVLIEVAAAVQLAEGNVKRQWLVDAVEISCVSVYPSTALQFLGLLSGGFCKYMPLLILDPRAVLDDLPVTLNSLLSVSGWGSIAEPVASHLLASTERIYYSVTYSPNVDGAHSSQAIDESEIDIGVSLLHVMHNTCVSLKDFLPLERQIRLANMNMKL Homology
BLAST of MS016526 vs. NCBI nr
Match: XP_022152150.1 (protein RST1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 3603.9 bits (9344), Expect = 0.0e+00 Identity = 1848/1856 (99.57%), Postives = 1851/1856 (99.73%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. NCBI nr
Match: XP_022928248.1 (protein RST1 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2986.4 bits (7741), Expect = 0.0e+00 Identity = 1549/1860 (83.28%), Postives = 1663/1860 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. NCBI nr
Match: XP_023529339.1 (protein RST1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 2985.3 bits (7738), Expect = 0.0e+00 Identity = 1547/1860 (83.17%), Postives = 1662/1860 (89.35%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. NCBI nr
Match: XP_022989080.1 (protein RST1 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 2979.1 bits (7722), Expect = 0.0e+00 Identity = 1544/1860 (83.01%), Postives = 1664/1860 (89.46%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. NCBI nr
Match: KAG7022714.1 (Protein RST1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 2963.7 bits (7682), Expect = 0.0e+00 Identity = 1549/1897 (81.66%), Postives = 1663/1897 (87.66%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XZF5 (Protein RST1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RST1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1694.5 bits (4387), Expect = 0.0e+00 Identity = 936/1864 (50.21%), Postives = 1268/1864 (68.03%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2AKG8 (Focadhesin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Focad PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 9.7e-09 Identity = 48/166 (28.92%), Postives = 76/166 (45.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5VW36 (Focadhesin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=FOCAD PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 1.3e-08 Identity = 47/166 (28.31%), Postives = 76/166 (45.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DD42 (protein RST1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019939 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 3603.9 bits (9344), Expect = 0.0e+00 Identity = 1848/1856 (99.57%), Postives = 1851/1856 (99.73%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ENG0 (protein RST1 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435141 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2986.4 bits (7741), Expect = 0.0e+00 Identity = 1549/1860 (83.28%), Postives = 1663/1860 (89.41%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JLD4 (protein RST1 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486259 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2979.1 bits (7722), Expect = 0.0e+00 Identity = 1544/1860 (83.01%), Postives = 1664/1860 (89.46%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B7V5 (protein RST1 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487116 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2873.2 bits (7447), Expect = 0.0e+00 Identity = 1485/1860 (79.84%), Postives = 1636/1860 (87.96%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B944 (protein RST1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487116 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2867.4 bits (7432), Expect = 0.0e+00 Identity = 1485/1865 (79.62%), Postives = 1637/1865 (87.77%), Query Frame = 0
BLAST of MS016526 vs. TAIR 10
Match: AT3G27670.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1694.5 bits (4387), Expect = 0.0e+00 Identity = 936/1864 (50.21%), Postives = 1268/1864 (68.03%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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