
MS013266 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTTTCTTCAGTGGTTCGACCAATGGTAATGTACCAATTCCTTGGAGGGAAGTGGAGAGCAAATTGTTTGCTCTTAATGTGGTGAGGCAACATGCTGTTTTGTTTTTGTCCTTATATGATAACATGTGACATATGAATTTTCCTTTTTTTTTTGTCCACTTGAGATCTGGAAGAAAACTAAAAGCATGATTATTGCTGCTGATTCCAATCTTTGGAAAAATTATCTTTAGTGTTTCTTTTTACCCATATATTGGAAAGTCAAACTTGGTTTCACAATCCTTATGATCTTCTCTTTGATGCTAAATATAGTTTCGTTGAAACCTTTCAACCTGTCTCATAATGAGGAAACCTAGATGGTCCCTAATGTACTAATAACATGCTGCTAATGTTTTAAAAGGCTAAAGACATCTTGAGGATTATCCTCTCGAAGGGGCAAGGTATATGCCCCAATTTTAATAAAGATAATGATACAAATCATACCTATACGTTGTTAAGTGCATGAATGATAATCTTTATTGCTTCACGTTTTTCGCTTTCAAGTTGGTTTATCATTGATGGTTTCATGGGAAAACGTAAAAGTCTTCATCGCTTCTGCATTTTGGGTTTTCAAGGTGGATCATTATTGATGGATGAGAGGAGATCGAAGAGTCTCCATGCAGCCTCTTTACTTTAATTCTTCTTGGTAATATCAAAGTCCTTTGCATGCTTCCTCACGGTTTCCCATTGTCAGCATTTATGCTAGTCTTTATTGGTGGTTTCCGTGGGATTTGAGGAGTCCTTTTCTGCAGAAATTATTTCTTATTGGTTGGATTTAATTTCGAGAAGTTGAAAGGTCTTTTTTTTGTTTGCTTTTCTTTTTTAAAGGAAGGGTTCCTTTGTTGGTTTATTCCATTTTAGGCGTTTTCTTTTCAGTTTGTTTTGAGTCCTCCTTGGCTTCATGGATCTTCCTTGCAAGTTTCTCAAGAAGACATCGTTTCTTCCCTCAAGTTCATCTCAAACTTATCTCTCTCTCATTTGGATGCTTATTTATCCTTTCTTAAGTCCGAGCTTGTCAATATTCGCAAAGAAAAGACTCTTTTTTTGAAGCTCACTCCATAATAAAGAGGAGATTCAAGCCGAGCGGGAAAGAGCTTGCTTAAGGTATTAGAAATATTTGGGCCAAATATTCTCGGAGGTTTAAAGAGTTGTTTCCAGATGATAAAGTTGTCCTCGACGATGTTATTTTTGTTCAAGGTTCCTGAAGCTTCTTTTTGGGTTTCATTGCTTTTGGGAGGCTCTATTCGAAAGTTCATGTTTTGGTCTTTATGTCATATCTGTCAGTAATTTTGCCTCTTGGCTTTTTTATTTTTTCGCTCCCTTTGGGAGTTTGTATCTTTTGAACATTTTGTTCCTTTTCATTAAACAATGAGAAGTTCATATCTTGTGAAAAAAAAAGAGGCTCCCTCTCCCATCTAGTTGACAGATAAAAGCATCTTAAGCCTTACTACTTTAGTTTATAAGGTGTAAGCAATAGCCCTTGCTGAGTGTCTCAAGAAAGTTATGCCTTCCACCATCACTTTGAATCAAAGTTCCTTCCTTCAAATACTAGATCACATTCTCATTGCCAGTGAATTGGTAGAAATACAAGTGGCTAAAGAAGAGTGGTTGAATTTTGAAGCTTGACCTTGAAAAGGCCTTCAACATGGTGGATTGAGACTTCCTATAGATACAGAAAGGGTTTGGTTCAAGATAGATAAAGTGGATCAGGGGATGCGTTAGGGGAACCAAGTTGTGACCAAGGGGCAGAATTTCAGCCTCAAGAGGTTTAAGGCAAGGACATCCTCTTTCTCCCTTCCTTTTCCTTCCAGTGAGTGATATCTTCAGTAGTTTGTTGGAAAATGCTCATGCCAAAGGTCTTTTAGAAGGTTTCATTGTGGGGCAGCAGAAAGTCCACATTTCTCATCTTTAATTTGCAGACGATACGTTGCTGTTTTGTAAAGATGACGATAGTAAGTTGAACTCCTTACTTAATTCTATCGAAATTTTTGAATGGCTTTCAAGTTTGAAGGTGAATTGGCCAATTGGGACAAATCTTCTGTTTGCGGAATCAACATTGATCAATTAAGGAAACATTTTTTTGTGTCCTTGCATCTTGGTGGATCGTTTTGTTAGTAGTTAGCATGATCTTATTGTTGGCTTTTATTATCGTTCTTTGTAATGCTCCTTGTTGAGCCTCTTTTCCACTTTGGTTTGATCTCTTTTTCTTTCATTCCTTCGGAAGTTTGTATCCTTCAACTTTTTTTAATTTTTCTATATCAATGAAAAGTTGTTTCTTGTTGGAAAAAAAACATTGATCAATCAAGGACAAATCAGCTAGCCCATAGATTGAATTGCAAGGCGGTCTATCTTCCCTTTTCCTATTTAAATATGCCACTTGGAGGGAACCCAAAGACTTCCATTTTTTGGCAGCCCATCCAAGAGAAAATTTCAAAGAAGTTGGCAAGTTGGAGTCATTTTCAGCTCTCAAGATTGATCAATCTAGTGCATTGGGATGTGACTTCCCTTCGTTTATGTGATGGTGGATTGGGTTTTCGAGACTTTGAGCAGAAAAATCAAGCCCTTCTTGCAAAATGGGGTTTGCGACTTATGCAAGAGGTTGATTCTTTGTGGCGTATTGTAATTGCAAGCATATATGGCATGGATGCTTTCAAATGGAATACTTTGGAGAGAGAGAATAGTTGTTCAATATGTCCTTGGACCAACATTTCTAAGCATTGGAGGAAGGTTCAACATCTCTCTATTTTCAAGGTGGGCAACCGTAGAAGAATTCATTTTTGGCTTGATCTGTGGAATGGTGATTTCATTTTTAAAGATCGTTTTTTTCATCTCTTTGTGGTGGTAAAGCTTCCACTAAACTCTGTTTGTGAAAATTGGGATGCTCTTTCTTCTTCTTGGGTCATTGAAACCAGAAGAAGCCTTGAAGATTTTGAGGTCCAGGACTTCTTATCCATATTATCCATTTTGAATTCAGTATTTATTTAAGTGGATGTAGATAGATTCTCATGGGATCTTGAAGATCTAAAGGTATTCTCTGTAAAATCTCTATATTCGTTTGTTGGAAATGGGAATCCTTTGTCAAAGGTTTTGCCCTCGGGTCTTTGGAAATCCTCTTGTCCAAGAAAGGTCAGCATCCTATTGTGGATTCTTTCAAATGGGAATTTGAATACTTCTGTAACTATGCAAAAGAATCTTGCCAATTTCTCTCTTCAACCCTCTATCTATATGCTGTTTGTGCTTATCGAGCAAGGAGAATCAAGATCACATATACTTTCATTGCTCTTACGCCTTGAGTTGTTGGTGGTCTCTCTTCAAAGTTTTCAACTTATCTTGGGTCTGATGTCAAAAGTAACCTATAGCTGCCTTTTTATTGTTTCTTTCATCATCCGAAGGCCCAGTATTTATGGGTTAATGTAGTCAAAGCCTTACTTTTAGAAATTTGGTTTAAAAAGAATCGTCGCATCTTCCGAGGAAAGAAGAAGGATTGTTTCGAGTGTTTTTAGCTTGCAAAATTCAAGGCGTCCTAATGGTGCCCTTTTTTCTGTCTTATTTTCGGGCTACTCTTCCATCATAATCTTCGGTTACTGGAAAGCCATTATTTAATCTTAGTTTTCTGCTCTTTACCTTATTTTATTTTGTTTCTCTTTCATTTCCTTTTGGAGTTCGTATCTTTAAATATTTTTGTTTTTTTTATTTATCAATGAAAATTGTTTCTTGTAAGAAAAAAAATAGACACTGGGAATGAGAATAATCACCAGTGTTTAGAGAAATTTTGCAGTGATTTAGATACCTGTTGTAATATATGGAATGGATAAACCGTTAGTACAAAATAGAAACAACCATATGAAGCTTTTTTCTTGTCTTATGATTAAAAGAAATATTTACACATTTCAGGTTGCTGAAGTAGTCCTACAGGAGGGTCAGAGTTTTGATTTCTCTGTTATCACGCAACTGGTGACGATCCTGTCTGCTAGACCTTCAAATGAGATTAAAGGCATAATGTGCCTTGTATGTTGGTCAATCTTACCCTTACAAAGCGTGAATAGTTTAGTTGATCTAGATCTACTGGAAGATTATGACCTCATTAATCAAGAAGGTCGACATTTTTTTTTTCATTTAGTCTAATCCTTTGTAATGTTTAAAAATTCCATTCCAGGTTTATAGATCCCTGGCAGAAGTTGTTGGGTCTTACTTTAGGTCAATATCTGCTTTCCACACCGATGCCAGACCCTTACTGTATGTACTCTCCTCTATTTCCTTTTATCCTTTTCAATTTGTGTGATTTGATTCTTGTTGATTGTTCATTTGTTATTGCATTTACTCTTTGTACTGCTTTTAAGTTTATAATTTCTGTTTAGAGTTAAGATTCAAGTGGTTCTTTCTAGTATCATCTTCACTATCTTTAAGAATGTCATAAAGCAGCGGCCATTTGTTAAGAATACATCCAATCCAGCTGAATACTTCTTTATCTAGATAATGATCTCGCAAATGGGTAACCATATACTTGATTATTGTTCTTCTTCCAAGAGTTTTTGTCATCAATATGGAAGAAGTGATAATTTGTGCTGCTTTGACTTGAAATCTCTTTGACCACTAGTTTAAGATGAAACTTGTAATAAGGTTCGTTCCTCCTTCCAATTCTCCTATCCTTTTAAGAGATTCCTTCAGCAACAATCAGGAAGATTTTTTCGCTACTTGGAGGAAGTTGGGATCACCCTCGTAGAAATCAATCATCGAAGCTAATTAATGTGAAAGGAGGTTCAATGGTGACTAATCACAGCAAGGATCTGAAAATTGTTCCTTTGTCGGAAGCTTCCCTCGATGTTTTTGAGGTGCTAAAAGAAGAATTTCAAGAATTTTCATCTACCTCAAGGGGTTATCCATTCAACCAATGAAGACATTGTCAAAGAAGCTCTGGAAGATTATGTTTCAGATTATTCCGAAGATTAGGTAGTCAG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Match: XP_038891351.1 (transportin-3 [Benincasa hispida] >XP_038891359.1 transportin-3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 776.2 bits (2003), Expect = 1.5e-220 Identity = 416/463 (89.85%), Postives = 424/463 (91.58%), Query Frame = 0
BLAST of MS013266 vs. NCBI nr
Match: XP_011651344.1 (transportin-3 isoform X3 [Cucumis sativus] >XP_031739064.1 transportin-3 isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 772.3 bits (1993), Expect = 2.2e-219 Identity = 413/463 (89.20%), Postives = 424/463 (91.58%), Query Frame = 0
BLAST of MS013266 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D496 (transportin-3 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 798.9 bits (2062), Expect = 1.1e-227 Identity = 430/463 (92.87%), Postives = 430/463 (92.87%), Query Frame = 0
BLAST of MS013266 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D4H9 (transportin MOS14 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 798.9 bits (2062), Expect = 1.1e-227 Identity = 430/463 (92.87%), Postives = 430/463 (92.87%), Query Frame = 0
BLAST of MS013266 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D347 (transportin-3 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016896 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 798.9 bits (2062), Expect = 1.1e-227 Identity = 430/463 (92.87%), Postives = 430/463 (92.87%), Query Frame = 0
BLAST of MS013266 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L6T7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G253520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 792.3 bits (2045), Expect = 9.9e-226 Identity = 415/434 (95.62%), Postives = 426/434 (98.16%), Query Frame = 0
BLAST of MS013266 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BN70 (transportin-3 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 771.2 bits (1990), Expect = 2.4e-219 Identity = 413/463 (89.20%), Postives = 423/463 (91.36%), Query Frame = 0
BLAST of MS013266 vs. TAIR 10
Match: AT1G12930.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 541.6 bits (1394), Expect = 5.9e-154 Identity = 287/463 (61.99%), Postives = 358/463 (77.32%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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