MS012301 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAAAGCATCATCTTCCATAACTTAGAAGTTGATAACTTATACTCCAAAGCAGCATCATCAATGGCTCCCAAAGGGAAGTTGGAGGCCAATGTAGAAATTAAGTCTCCACCTTCAAAGTTCCATGAAATGTTCCACAAGAGACCACACCATATTTCCAATGCTTCTGGTGACAAAGTACAAGGTTGTGAGTTACGTGAGGGTAATTGGGGCGAAGTTGGTTCTGTCGTCTGCGCCAAATACTTTCATGGTTTGTTTTCATCATTTTTCTTTCTATATTTTTTTACTCTTTTCAACGTGGGATCTTTATTATTGTTAGAACTGGTTGAGAATTTAAATGAAATTGATTGTTGTGGTATGGATGAACCACTGCCTCGAAAGCAATTTGAGTACGATCACGGTGCTAAATAATGTACTCGTCGGAGTCGAATGGAATCGAAGAACATTTGACAGAGGTTTTGGATTTTTACCCTGAAGAAGAAAACTTGACTTTATTTTAAAACGGAAAAATAAAAACGTTTTAATTGAAACGTTACAAAAAAAAATGAATTTGTTAATTAAAATGTTAAACAATTAATAAGTAACATTCAAATAATTAATCAAAACAGAAATAAACGTTTTTCATTAAAACATTTAAAAATAAGCAATAATAAAATATCACTTATTTTTGCAGTGTAAATATGTAAATACGTATTTTTCTTTTATCATCCCCAATGGTTCTTTTGAGCTCCAATATTTGTTGGATCCCATTTTTTTTTATCGAATATACTCATTTGAACTTTTGGGCTCTAATACATAGTACGATATTGTCTATTTTGAACATAACCCTCACAACTTTATTTTTGGTTTCATCCAAAAAGAACTTCATACCAATTAATGGAGACGTTGTCCCTCGCATATATATCCATGATCCTTTCTCGAGCCAATGTAGAACTTTATTTGCACTCTCTACAAATCCAACATCGTGTATATTATAAATTTTTGTTACGTCTTTTTACTAGGATCCCAAACAAGCATGCCATATTAATTTATGTAGTGTTGAACCACAGATGGGAAGCCTCAAATGGCAAAGCATTTAATTGAAGCAGTGGATGAGAAGAAGAATTTGATCTCTTCAAAAGTTATAGAAGGAGACCTTTTGAAGGATTATAAAACCTTCAACTTTACGCTCCAAGCTACTCCAAAGGGCAAGGGAAGTGAAGTTCACTGGGTTTTGGAATTCGAGAAACTGCATGAAGAAATTCCAGATTCATGCAGCTTGCTTGAGTTTTGTGTGAGCATGTCCAAGGACATTGATGCTCACCTTATGAATGGCAATTAGGAAGAAGCAAATTATTTAGTTTTACTATATGTTATATGTGTACCAACTCTATGTTTAAATAAATGCTCGTATGCAATATGTGTTCTCTTTGGGCTTGTTCTAAGTTATCATGCCTTGGAGAATAGTCATAAAGTATCCTAAATGTAATGCTACTATTAAATTTAACTATGGGAATAAAATCACTAAATTAAATGTGTTTTAGAATTGATATTGGAAAGCTTTTCATTAGTATATTTTTCTATCATTTGTAATCTTTTTTAAATAATAAACGTCGAGAATTATTGGAATCAGGCCGGATCCACGTAGGGGCAGACGAGCGTGAATTTTGTTTCCTTCGAGCACGACGTTTGTAGTTCGTGTTAACCTTTAGGAGATAGAGAGAAAATAAAGAAAATGACAAATAGGGTTTTGTCACAACATCATCACGCAAGCCAACATCGTCCGTCTCTTTCGAGAGAAGGGTTTGAAATCGTCACCAACCATTATGAGTGAGGTTTGATTGAGTCAGCTAAAAGAAAAAAAAAAAAAAGTCTGCGAACAACAGATTTTGGTTCAGGGGTCGATTGAGAGAGAAGTATTAGAGTAGCCTACAACACTAGTTCAAAAAATGGTATGGAGAAGCACGAAAATCTCATAAAACGCTCTAAATTAATAATTCAGAAGTAATTTCATTAAAAAAAAAAAAACTTTTTTTCGTTTTTTTTTTCCCAAAGTCATCAACGCATTAAAATATGTTCCAAATAAATTATGTAACAATGTTGACCATAATGAATTCTCATATTAACAAGGCAGTTGGTTGGTTTATTTAAAAGAACATAAATATAAAGTACATTATTATATCTAAAACTCATTATTATAACCATATTCATCCATAAGTCACAGCATAAGCGAATAGGTTATAAGTATAAAACAATTATGAATAATTTATACCTAATCTCAAACTTATTCAAGCCAGATCTATTTGTTGAGACCAAATTGAAAATTAGTATTACAAAATCTTCCTCCCAGAAAATTTTATCTATGCAACCACTTTGTAACTGGTTACAAAGTGCGTAAACAAAATCTCACATTGGTTAGAAAAGAGAGAGATCAATAATACATAAATGAGGACAATTACCTTGTATGAAATTTTTGAATGAAATCAAAAGCAAAATCATGAGAGTTATCTTAAAGGGCACGTTAAAAATCCTACATGGAAAAGATAAAGGAACTCGATAAATATTAATAACAATGACGTAGGTAAGGTGAATGACAAAGTTGTTCGTTGGCTATACCATATCTTAGCTTATACACATCAACTCTAGATTTCTATTATTATTTCATCCATTTCATTAATTTTTTTTCTAACTCTATAACGTCTCAAAATTTATTTAATTATTATGTTTTACCATACATTTATTATAGAATTCCAAATAAAAAATTTTAGATATGTTACAAACTATATTACAAGAAAGTAATATATTTTTTTCGATGGTTTTGAATATCATGAACATATTCAGCAACGTCCCTAAGAAATGATATAGTCTGAAAAGTCAGGTTGTAGTGGGTAATATTGGTCGTTTTTTTGGTTGGAATCCAAGATTTACATAATGAGTATTTAGATTTCTAGTGTTTGTTTGGTAGGAATATAAAATACTTTGATATTTTTTTTAATTTGAGTTCAACAATATGTGAGTGTCGCAACGTTATTGCGACGCGGAGCGGCCAATGTCATATCCTGAAGGGTCTTTTTCGAGATAAGAGTTTGGATTCGCCACCAAACATCAACAAGGTGTGATCGGTCACCTAAAAATAGAGACAATGTCTGAGAAAACATATTGTTGGTTCGGGAGTCAACTGAGCGTACTACGACACCCGTTCGAAAACGGTACCACATTTTGTCAAAAATTATCCTATTATTTTATTTGGTCCAAAAAAAAAGAAATGTTTTTATTTTATTTTAAATGTCTTATATTATATTAATTCACATTTTGTAATAAGATATGAATTAATAGGTATGAGTGGTACGAAGGCCATTAGAAAAATTTTGATACAGAATACTCGAAGGTTCCAGTTCCCATCATTGAAGTTTTTGAAATAATTATTTAGCAAAAAAATAATAAATAAAAATAATTTTAATATTAGGAAACATTGAGATTTAAACTTGTGACATAAATGTAAACACTACGTCTTACTAATGTGCCAACACCTTAAGATACAAATTAACTTTCTTTTTTTAATACAAACTTTTATTTTTAAACTTTGTTAAAAAAAAAACTCTAAACGAAATCTTTTATTCAAAATAATAGTTGTAGTTATGGAAGAAAAAGACGAATTTTAGAGAGGAAGATAAGAAGAAAAAGAGAGGGTTAAGGGTTTATAGTGGGTATTAAAGAGGGGAGGTGATTCTCCCTAGAAAGTAAAAACTTTAACGAGGATTCGCTATTTTATTTCTAGCTCTCTACACTGTATGTCTTCCCTTCTGTGTGTTACCTTTAAATACACAATGCTCCAACAATAATATGGAAAGGATAAAAGAGAGTTAGAGAAAAAGAAAGGAGAGTTAGAGAAAAAGAAGGGAAGGAAAAGGGGGAGGTCACACGCCTTGGGTTTGACGAGGGAAATAAAATTAATTAAAACGAAATCTTTTTAAAATAAATTTATCTATTTTTTATTTTAATAATAAAACAAAATCTAAACAAAACCATTTTTTTATTTTCTTATTAATAAATCTAACATTTTTTAGTTTAAGTTAATTTAACTTTATCTTAAAACTTATAATAAAGTAAAATGATGTTATTTTTAACTAAAACCATTAAAATCAATGTAGATACCGTATTTCGTCCGGTCATTTTAATTTTATTTGATATTTGTTATTGAAAATACAAAAAGTATAAAATAACAAAAAAAACTAAAAATTAATAATAAATTTTAAATTGAATTATGATTTTTAAAATGAAAAGAGAAAATAGAATTTTAAAAAGATAAAATAATCTTTCGTTTAATTTCTCTCCATATTCCCTCTCCCCTGATTCTCTCCCACTTCCCTCCTCTCTTTCTCTCCCCTCCACTCTCTACGAACTTCCCCTACATTTCCAACAATATCTCCTTCTCTCTCACATTTCTCTCTCCCCAACTATTTTTCTTCCTCCTTCACATTCTCCATCAATTCCACTAATCTTTCTCTTTTTCTATAGCATCGTACATCTTACATTCATTTATTTCCAAGTTTCATCCTCCCTATATAAGGATTGATTTTTATGATAAGAGAGAAGGAAACACGTACAAAAAAATGGGAAAGGAAAAGGATCTCTATAAGGAGAAGAAATACACACGGAACAAAGGAGGAGAGGTCTCTATCAATTTTTGGTGGAATACAAAATTTTATCAAGATCCGCTCCAAAATCTCCTGGGAGGGGGGAAGTTCTTTAGGATATCAAAATCTCTCTGTTCTTACCTTCGCTGCAAGAATCTTCATTTTCCTACATAGTGCATCCTCTTCTAGATCTCTCTCTCCTCACTTCTCATAAAATGATCTCATAATATTATCTTCCTCTCAAAATCTCATTCTAGGGAGCCAGGGAGAAAAAGTCAAAAGGAACGCACAAACTACAAACTACAAACTACAGAGAGAAGGAAATATTTGGAGATTTACCATATCGTTCCATCTCTCCAAATTCCCTTTAACCAATTTTTT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Match: XP_022941966.1 (MLP-like protein 28 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 387.1 bits (993), Expect = 1.5e-103 Identity = 185/310 (59.68%), Postives = 230/310 (74.19%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. NCBI nr
Match: XP_023526913.1 (MLP-like protein 34 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 372.1 bits (954), Expect = 5.0e-99 Identity = 185/339 (54.57%), Postives = 230/339 (67.85%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SSK9 (MLP-like protein 28 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MLP28 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 346.3 bits (887), Expect = 3.9e-94 Identity = 173/328 (52.74%), Postives = 227/328 (69.21%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SSK7 (MLP-like protein 34 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MLP34 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 339.3 bits (869), Expect = 4.7e-92 Identity = 167/317 (52.68%), Postives = 220/317 (69.40%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q941R6 (MLP-like protein 31 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MLP31 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 184.5 bits (467), Expect = 2.0e-45 Identity = 84/146 (57.53%), Postives = 106/146 (72.60%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SSK5 (MLP-like protein 43 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MLP43 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 182.2 bits (461), Expect = 9.7e-45 Identity = 89/154 (57.79%), Postives = 114/154 (74.03%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P85524 (Kirola OS=Actinidia deliciosa OX=3627 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 127.1 bits (318), Expect = 3.7e-28 Identity = 60/143 (41.96%), Postives = 92/143 (64.34%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DRI4 (MLP-like protein 28 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022522 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 417.5 bits (1072), Expect = 5.1e-113 Identity = 199/314 (63.38%), Postives = 246/314 (78.34%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FUE9 (MLP-like protein 34 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448885 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 396.0 bits (1016), Expect = 1.6e-106 Identity = 186/314 (59.24%), Postives = 235/314 (74.84%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FMJ6 (MLP-like protein 28 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447174 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 387.1 bits (993), Expect = 7.3e-104 Identity = 185/310 (59.68%), Postives = 230/310 (74.19%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. ExPASy TrEMBL
Match: W9QSL3 (MLP-like protein 28 OS=Morus notabilis OX=981085 GN=L484_018882 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 357.1 bits (915), Expect = 8.1e-95 Identity = 167/308 (54.22%), Postives = 227/308 (73.70%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A178W0M5 (MLP28 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AXX17_At1g65010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 350.1 bits (897), Expect = 9.9e-93 Identity = 174/328 (53.05%), Postives = 229/328 (69.82%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. TAIR 10
Match: AT1G70830.1 (MLP-like protein 28 ) HSP 1 Score: 346.3 bits (887), Expect = 2.8e-95 Identity = 173/328 (52.74%), Postives = 227/328 (69.21%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. TAIR 10
Match: AT1G70850.1 (MLP-like protein 34 ) HSP 1 Score: 339.3 bits (869), Expect = 3.4e-93 Identity = 167/317 (52.68%), Postives = 220/317 (69.40%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. TAIR 10
Match: AT1G70850.3 (MLP-like protein 34 ) HSP 1 Score: 339.3 bits (869), Expect = 3.4e-93 Identity = 167/317 (52.68%), Postives = 220/317 (69.40%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. TAIR 10
Match: AT1G70830.4 (MLP-like protein 28 ) HSP 1 Score: 272.7 bits (696), Expect = 3.9e-73 Identity = 134/254 (52.76%), Postives = 178/254 (70.08%), Query Frame = 0
BLAST of MS012301 vs. TAIR 10
Match: AT1G70830.2 (MLP-like protein 28 ) HSP 1 Score: 256.5 bits (654), Expect = 2.9e-68 Identity = 131/246 (53.25%), Postives = 169/246 (68.70%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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