
MS009860 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTGAGCTCGAGAGGGATCATCGGACCGAAGAAGGCCCTCTTCTTACTTCAAAACTGCAAGAATTTCAAACATCTCAAGCAAATCCACGCCAACATAATTCGCAGCGGCCTTTCCAACCATCAGTTACTCGCTAGGAAATTGATTCACCTCTACTCTTCTCATGGAACGATAGCGTACGCGATTATTCTATTCCGCCAAATCGAGATTCCTTGCACGTTTACTTGGAATCTGTTCATCCGGGCCAACACTATCAATGGTCTCTCTGAAGAAGCCCTTCTTTGGTACAGGAATATGGTACGTCATGGAATTGCACCCGATAAGTTTACTTTTCCATTTGTCATCAAAGCTTGCACACTTTCCTTCGCAATTGACCTTGGAAAAGTGGTTCACGCGTCGTTGATCAAATACGGATTTTCGACGGATACATTTGTGCAGAACAATCTGATAGATTTGTACTTCAAGTGTGGACATAAACAGTGTGGTCATAAGGTGTTCGAGAAAATGCGTGTTCGCAATGTGGTGTCGTGGACAAGCATGATATCCGGGCTGGTTGCTTGCGGGGAAGTCCAGGCAGCACGAAGGGTATTCGATGAAATGCCATCTAAAAATGTTGTCTCCTGGACAGCAATGATTAATGGGTATATAAGAAGTCAACAGCCTGAAGAAGCTGTGGAACTATTTGGGAGAATGCAGGCAGAGAATGTTTGTCCAAATGAGTATACGCTGGTAAGCTTGATCAAAGCATGTACTGAAATGGGAATCCCAAGTTTAGGTAGAAAGATTCATGATTTTGCCATCACAAATTGTTTCGAGATCGGTGTTTATCTAGGGACGGCTTTGATTGACATGTACAGCAAATGTGGTAGTTTAAAGGATGCGGTAGAAGTTTTTGAGACGATGCCCGAAAGAAGTTTGGCGACTTGGAATTCGATGATCAGTAGCTTAGGGGTGCATGGGCTTGGGGAGGAAGCGCTCAATGTTTTCAGTGCTATGGAAAGGGTAAATGTGAAGCCAGATGCAATCACTTTTGTGGGTGTTTTGTGCGCTTGTGTACATATGAAGAATGTGGAGGCAGGCTGCGCTTACTTCAAACGAATGACACAACATTATGGCATTGTGCCAATTCCTGAGCACTACAAGTGCATGGCTGAGCTATATGCTCGTTATAGTTCCTTGGATGAAGCCTTCGAATCAGCGAAACCCACGTAGATGGAAAGGACGCGTTGGCCTGTGAGCGGGCACGCATGTAAGATATTGATAGAATAATACTTGGTTACTGATTCGCTTACTGATCGGTCAGTAGCCAAGTGTTATTTGCAGGGATAATGAGTACAGAAATATGTAAATGAATGAGGTTGCAAGTTCGACCAACATCCCTTTCTAAGCAGATGCGGACTTCTTGTGGAGTATTTTGACTTCTTGCTTGCCTTTTAACTGTCATTTTGTATGTTGAAGAAGCGTTTTTTTATGCAATACTTGTAATTGATTGTCATTTCAATGGGTATACGATTTTAATGGATAGCAAATTGTTGATATCAAAATATATAGATGTAGCATACAAGAGTTGGACTTGCATTCATTATTCTTATGTTTGTGCAATTCTTTGTCTGGAATTTTCACAGGAACAATCTTCTATTAAATTAGAAGTTAGTTTCTTTAAATTTTAGTAGACCACAACATGATCCTTATTTGATTGAATCAATGAGACCGCACATGTAATTATTTAATAAAATGCTCTAATTATGGGTAAGTTTTGGTTTAACAGAGTAATTATAAAATGACAATGGGTAAAATATATAGATACGTAGTTTTTTTGTCGGTTACAGAGGGGCTATGGTCCCCAAGTCGAGAAATCTATAAGACTAATTCGTGATTATCTAGACTTGGAAGGTCAAATCCATTGATCAACTTTTAATTATGGATCAAGGTATGTTTCCATTTCTTTGGTATTAATTCTCTTGAATTTAACATGGAAACCGATCTCTGACTTTTAAATTTTGGGTTTTTATTTTCCCAACAAACCAATCTTTAGTTAATAATATCCAAAAAGTTTATCAATCTCAAGATGCTCCAAACTCATCAAGGGGAAGTCACTTGATTTCTTTTTAGTTGTTCAATTAACCAATTTAAATAATCACAAAGTTTGATGAGGTTATATTAAAAAGCTATAACCGTAAAATTAGTCGAAGTGTGTGTTAGCTGGTCCAGACACTCACAGAGATCAAAAGGGAAAAAAAAAACCTATAATCTATGTTATGTTGGTTAGGTGACCTGAGTAATAACCTACCTATCACATTTGGTTGTAATATCAACCTAGTTTATATGCTACGAACCAACAAACCACTTGCAATGCTCAACTTGCCTAAAACATTTTACTGAGGTAATAGTGGTGAGGACAAAATTGCTCTTTACGGTTCAGGAACCAAGTATTTTTCTAATATTATTATCTTACTTTTGACCTTGTTTGTATCACTCCATCAATTTAATTAGCTGCAACAAAAAGTATGCAACACTGAGAAATGACGACCTAACCTTTATATGATGCATCATGCATGTCCTCTTATAAATAATTGCGAGCGCCACAACTAAAAGGAAAAAGAGTGAAACAATTTAACATTTCATGACACATATTCCAACTTCTTTTCTTTGGTCTTCAAAACAATGCAACTTCTTTCTAAGAATATAAATACAAAAACATAAATTAAACTTGTGAGAGAACATAACTCAATTGGTTAAAGAATTTATATTCGATCAAATGGTTTAGAGTTCGAATCTCCACCTCCACTTTGTTTTAAAAATAATAAAAGATGGTGACAAGTTTTTGTTCAAAATCTGGGTTGAAAATGGACTGGGCCCAGCTTAAAAGCGTTTGGCCCAAATTATGCCATTGGCCTATCATCCAAATAGCTAAATTGGACTCATAGGTCTATAATATTATTATTTTTTTGGGACATTCGATAGCATAATTTTTAAAAATATTTAAAAATGTACATAGTTACATATTTTTAAAATAATAATAATAATAAATAAATAAACAATTATAGATTTAATATTTTCATTAAGGCGTATTAATGATATACCTACGCACTAATTCATATGTCATATTTGTCATTCAAAAAAAAAAACTCAAATATCTTTTTTTTCAATAAATTGGAGATATAGATGTTCGAACCTTTATCTCAAGAGAAGAAGTAGATACTAATTATCATTGAATTATGTTCATAGTCCATAAATATCTATCTTTTTTTTGTGACGTTTAAGTTTTTGTATTTATTCGTACTAGTAATTTGATATTCAAAACTTGTGAATTTTAGTTGATTTGGACAAGTTTGCTTTTTTTTATAAAATATTTCGACTAAAATGAAATATTTACATGATCGTGTTTTGTTTTTATTGATATGTCTCTATCTTTTTCTTTTCGAGTTAAAAAGAATAAAAGGTGAATATTTAAACCTCGATTTTTAAAGAAGTAAGTAATATCTTAACTAGTTGAATTATATGCTTTGGTTGACTATAAATGTCAAATTGACGAAAAACAGAAATATAATTGAGCATATTATAAATAATAAGTTTAAACCCAATTTTGGTCCCTAAACTTTCAAGATTATTTTATTTGGTTCTTGAACTTTCAAAATGTACACCTTTGATTCATGAACTTTAAAATTTGTTCTATTTTGGTCTCTAAACTTTTGTAAAATTTATTTCAACAAATTGACAACATGATTTCAAATATCTGTACCAATGTGTTACTATGAACATGTATTGCAATCAAGGTTTTAAATATCGATGTCGATGAAAATGTCGAGGTTTCAATTTCATGAAAATATCGATAAAATGTCGACATCGATGGATATTACTGTAAAAGTTATAAAAATTAAAAAATCGTAAAAAATATTTAAATTAATAAAATAAACATTTTCCTATCTCTAAATTAGTTAAAAATAATTAATATTAATATTATGTATATATTAGTGACATTTTGTTGATATTTTTCATATTTTGTCGATTTTATTGTGCTATGATGGAAACGTCGATTTATCCCTTCATGTCAATGTCAAACTCATAGAAACATGAATATATCGATGGAAATATGGACATGTCGACGGATATTTAGAACCATGATTGCAATTTGGCAAAAATATGGCGAAGATTCACAAAATATCTCCAAGGTGATGGGAAAGTGTGTGAAAGCATCCTCCAAATGAAGGAATATCAAAGGAAGGAAAAGCAAAGGAATCTTATCTGGAGGAGCAGGCTCAGGCTGTTGCATATAAATTGGTAATCTCAGTAACATGCTTCTACTCATTCAACTCTCAAACTCACCACTAATTATCACTTCCAAATTACATAATTTTTAGCATTAAACATCATAAGAATGCAGGCTGTTCTTACCATTCCTGTCCTTCCCCTTCTCCTCCCAACACCTTCCAACAACTCTTTTCCCTTGAACTCTTTCCGCTCTCTCTCGTCACGTTGCCCCGCAATCAAAGCAACCTCCACGTTCGCCTACGACACCTCGGTGGTTGATTATAGCTCCGCTGTCTCGTAAGTTATTTTCTTTCGTCTTTAGGTATTGAACTCGAACCACCCCATGTCAATGTATAAAAGCAGACATGACAGGAGGCAAGATAAGAAGAACATATTAAATTATAAGTTTGGTCTTTAAACTTTTAAAGTTAACTCGTTAGTTTACCATTTACAAGGCCTACCTACAATATGATTCAAAGATTACATGGTGAGCAGATTCTTGACAATTCAAATATTTAGTAGTATAAACATTCAACTTTACGAAATTCGAGTTCATCAACTCGGTATAAACATAAAATATTTTGAAATACACAGACTAAATAGAATATCCATCTTGAGGATTAGCATGTATATAATCGTCGGGATGCTCCAAAACGTTAAGAGCATAAAATTCATACATCTATTAGAAGCTTTTTAAAGTACCTTCCCAATTGATTGGACAATAGAACTATAAAAGTTTTGACCGA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LSSRGIIGPKKALFLLQNCKNFKHLKQIHANIIRSGLSNHQLLARKLIHLYSSHGTIAYAIILFRQIEIPCTFTWNLFIRANTINGLSEEALLWYRNMVRHGIAPDKFTFPFVIKACTLSFAIDLGKVVHASLIKYGFSTDTFVQNNLIDLYFKCGHKQCGHKVFEKMRVRNVVSWTSMISGLVACGEPEEAVELFGRMQAENVCPNEYTLVSLIKACTEMGIPSLGRKIHDFAITNCFEIGVYLGTALIDMYSKCGSLKDAVEVFETMPERSLATWNSMISSLGVHGLGEEALNVFSAMERVNVKPDAITFVGVFFPCAIKSCSALCDLVAGKQTHQQAFVFGFDTDLFVSSALIDMYSKCGQLKDARQLFDEIPLRNVVSWTSMITGYVQNEQADNALLLFKDFLEEETEVEDGDKIPLDPVVMVSVLSACSRVSEKGITEDVHGFVIKEGFDGNVGVGNTLIDAYAKCGQPLVSRKVFDGMEEKDEISWNSMIAVYAQSGLSEEALEVFHGMVRHDGVRYNAVTLSAVLLASAHAGALRAGKCIHNQVIKMDLEENVCVGTSIIDMYCKCGRVEMAKKTFDRMKEKNVKSWTAMVAGYGMHGCAKGALDIFYKMTQARVEPNYITFVSVLAACSHAGLVEEGWHWFNAMKYKYDIEPGIEHYGCMVDLFGRAGCLSEAYNLIKGMRMKPDFVVWGSLLGACRIHKNVDLGEIAAQKLFELDPDNCGYYVLLSNLYADAGRWADVERMRTLMKNRQLVKPPGFSLVELKGRVHVFLVGDKEHPQHEMIYKYLEKLTLELQKIGYVPNMTSVLHDVDEEEKEIILRVHSEKLAVAFGVMNSAAGTTISIIKNLRVCGDCHTVIKLISKVVHREFVVRDSKRFHHFKDGLCSCGDYW Homology
BLAST of MS009860 vs. NCBI nr
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BLAST of MS009860 vs. NCBI nr
Match: XP_011651585.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Cucumis sativus] >KGN58242.1 hypothetical protein Csa_017551 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1137.1 bits (2940), Expect = 0.0e+00 Identity = 554/645 (85.89%), Postives = 593/645 (91.94%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. NCBI nr
Match: XP_008450012.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Cucumis melo] >XP_008450013.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Cucumis melo] >XP_008450014.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Cucumis melo] >XP_008450015.1 PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1132.9 bits (2929), Expect = 0.0e+00 Identity = 551/645 (85.43%), Postives = 592/645 (91.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. NCBI nr
Match: XP_038878074.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1130.9 bits (2924), Expect = 0.0e+00 Identity = 546/622 (87.78%), Postives = 581/622 (93.41%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. NCBI nr
Match: KAG7017863.1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein, mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1117.4 bits (2889), Expect = 0.0e+00 Identity = 537/622 (86.33%), Postives = 578/622 (92.93%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LW32 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H34 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 850.5 bits (2196), Expect = 1.7e-245 Identity = 405/624 (64.90%), Postives = 503/624 (80.61%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7Y211 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At3g57430, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H81 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 651.4 bits (1679), Expect = 1.5e-185 Identity = 347/842 (41.21%), Postives = 503/842 (59.74%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3E6Q1 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g11290, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H40 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 619.8 bits (1597), Expect = 4.9e-176 Identity = 316/765 (41.31%), Postives = 470/765 (61.44%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SVP7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At4g13650 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H42 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 619.4 bits (1596), Expect = 6.4e-176 Identity = 328/918 (35.73%), Postives = 513/918 (55.88%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZUW3 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g27610 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PCMP-H60 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 618.6 bits (1594), Expect = 1.1e-175 Identity = 318/816 (38.97%), Postives = 493/816 (60.42%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D374 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016910 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1211.4 bits (3133), Expect = 0.0e+00 Identity = 591/622 (95.02%), Postives = 600/622 (96.46%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LC14 (DYW_deaminase domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G598390 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1137.1 bits (2940), Expect = 0.0e+00 Identity = 554/645 (85.89%), Postives = 593/645 (91.94%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BPA8 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491728 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1132.9 bits (2929), Expect = 0.0e+00 Identity = 551/645 (85.43%), Postives = 592/645 (91.78%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F879 (pentatricopeptide repeat-containing protein At3g26782, mitochondrial OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441773 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1115.9 bits (2885), Expect = 0.0e+00 Identity = 537/622 (86.33%), Postives = 577/622 (92.77%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VNS5 (Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold595G00120 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1112.8 bits (2877), Expect = 0.0e+00 Identity = 544/638 (85.27%), Postives = 585/638 (91.69%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. TAIR 10
Match: AT3G26782.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 850.5 bits (2196), Expect = 1.2e-246 Identity = 405/624 (64.90%), Postives = 503/624 (80.61%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. TAIR 10
Match: AT3G57430.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 651.4 bits (1679), Expect = 1.1e-186 Identity = 347/842 (41.21%), Postives = 503/842 (59.74%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. TAIR 10
Match: AT1G11290.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 619.8 bits (1597), Expect = 3.5e-177 Identity = 316/765 (41.31%), Postives = 470/765 (61.44%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. TAIR 10
Match: AT4G13650.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 619.4 bits (1596), Expect = 4.6e-177 Identity = 328/918 (35.73%), Postives = 513/918 (55.88%), Query Frame = 0
BLAST of MS009860 vs. TAIR 10
Match: AT2G27610.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 618.6 bits (1594), Expect = 7.8e-177 Identity = 318/816 (38.97%), Postives = 493/816 (60.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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