MS007548 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGCAGTGGCGGAGGGACTGTGGAGGCTGGCAGATTACCACGAGAAGAAGGGTGAAATAGGAAAGGCAATAAAGTGCCTGGAAGCCATATGTCAGAGTCAAGTGTCATTCTTTCCAGTCGTTGAGGTCAAGACCCGACTTCGCATTGCCACCCTCCTACTCACTCATTCTCACAACGTCAATCACGCCAAATCCCATCTTGAGCGTTCTGTATGATACTTTTTTTTTTCTTTTACCCGTATTTTCCTTGGATAATGATGTAGAGTGAGGGAGAAATTTGATATCAATGATGATTTTTAATTTCGCGGGCAGCAATTGTTGCTGAAGTCTATTCCATCATGCTTGGAACTGAAGTGCCGGGCTTATAGCTTATTAAGCCAGTGTTATCATCTCGTTGGGGCTATTCCTCCCCAGAAACAGATTCTTTATAAAGGTCTTGATCTCACCAATTCATCTGGTCATGAGTAAGCACTCATCCTATTTCCGTATGCCTAATCGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTCATTCCTCTCATTTTCTGTTGGTATTGCACTTATTTAAGACTGTCAGTGAAGCTATGGTCTTGCAACTTCAATTCACAGCTAGCAAATGCCTTGATTATTGAAGGAGACTATCAAAACTCAATCTCTGCCTTGGAGTCGGGATACGTATTTTCTGTTGAGATATGCTATCCCGAATTGCAGGTTGGTAAATAAGCTTCTGTATTCGTGTCCCACTTTCTTTATTCCTCTGGAAGTGCATCTTCTTGTTGTTTCTGTAATATTTGAGTGGCATTGTTTTTCATGCTCCATCATGATTTGTACGCGGAATATGACTTCCCATACATTGAATATGACTTGTTTGCATGGACCATCGCCCCTCTGTTACATTGCATTTTTTTGTATTATTTTAGAGAAAGAAAGACCTTTCGTTAAAAACGAATATATAGAAAAATGGAGGACGAGACATCCTTAAGAAAATGTCTAGGAGGTTACATAAAAGTACTCCAATTGGAGTCTATATTTAGAAGAGTGTAATTAAACAGACAACTATTCGGAGCTAGACTACTCACCCCTATTCTTTCCCAACCAAAGTTCCCAAAGAAGACCCTTAATTATATTGTTCGAAAAATTGTTTTTCTTCACATTGAAAGGAGCTTTGCAGAAGTATTAGATAAGAGTTTCGTTTATTGTTTTGGAGAAGTACCAACGAGTTCCAAAAGTTTTTAAAAGAAGATATGCTGGTTTCTTAATTTTAACCAGAAACAACTTTTCATTGATGGATGAAAAAGAACAAAATGTTAAGAGAAACAACCAAAAAAGGCAAAAATCGCAGCCATTAAAAGAAAAAACCAACTAAAAACTAAACAAAACAGCAAACTAACCAAAAACACCAAAACAACAAACGAACCACCGACAATCTAACCAAAAGCCTAAGAAAACCCAAACAAACTAAAGAAACCAAGCAATGAAGAATCCAACGAAAGAACCACTCCCAAACAAGCAGAGTCATCCAAACAGAACAGCAAACCAGATGCAAAAATAATCTAAAAAGAACAAATCTTTCCACTTATAAGAGCTTCTAAGCCCTCTTGGAGCTTGATTTTTTTTATATTTCTTTTTTAACAAGAAACATACATTTCGTTGAAAAGATAGAAAAATGTTCAAGCATACGAACTCCCAAGAAGAGTAAAAAGAAAACTAAACAACGAAATAAATAAAGTTCCAGTCCTCAAAATATTACAAGAACCAAAAGATAAAGTAAGGTTTGTGTTGGTTTATTATTTGTAAATATTAGCTGTAAATTAGTTGTCAATATTAATTGTTATTTTATCTTTATTTCCATTTATGTTTGAGCCTCTATTCTATATAAGAAGACTATGTATTTCTTATTATTAATATATATTGGAATACAAATAATTTTATTCCATCAAAACCAAGTTGGTATTAGAACCAAAATAAACCAAGTTGGTATCAGAGCCAAAATAAACCCTAATATGCTAAGAGTCTTTAGAAACCCTAGTCACCATCCTTACCTTTAAACCCTAGCTGCTGTCATTACCGTTGCCGGAACCCTAGCCGCTGTTATCCAAAAACGGCGCATCCTACTTCCGGCACGGTAGGTCACTATTTTGGCATTCGTCCTCTTCGGCAGTAGTGTCATTCGAGTTCGTCATTCAAGGCGGATCTTTACGGGTTTGTCACGGGGCTTTGTTGTTTGCCGTCGAGATCTGTTGCTGTCTGCTACTATTCAAGCCTCGCGCCCTTGTTCCGTTGCCGTCCGAGTCGCCGTCGTCTGCTGCTTGTATTTCATGGGTTGTGGCTGTCTTACAAACCCTAGACCGGTTTGGTCGGTTCGCTCAGTTCGGCTCGGCTCAGTTCAGCTCGATTCGGTTTGCATTTTGGATCGGTTTGGTCCGGTTAGGACCGGTTCACTCAGATCGGCTTGGTTCATCTGGTTTAGTTTGGTTTGGTTCATTGGTTCTGTCTGTTTCTTGCCATTCTTTTGGCTTTCTGGTTCAGTCTTTCTACTCTAATATCAGGTTTTTGGTCTGATTGTTATAGTTAACTTGCGTTACTTGATCTGTTGTCTAGTGTTTCGTTATCCTTTGGGAGGGAAGACGTGAGGGTGTGGATTCCCAACCCCTCGGGAGGTTTTTCTTGTAGCTCTTTTTTCCATGTCCTAATTTCCCCGTCGTCTTCATCCTTTTTGGCTTCTCTTTCTTCTTCCTCTTCTCCGTCCCTGGTGACCCCTTGGTTTACTTCTCTTTGGAAGATCAAAATTCCTAAGAAGATTAAGTTCTTTCTTCTTTGGGTGGCAAGTCTTACTTGGTTAAGTCAATACCTTTGATCGGATTCAAAGGATGTCTTCCTTTTGCCTGGGCCCGCAGTGGTGTGTTCTGTGTAGGAATGCTGCGGAAGATCTTGAGCATTTGTTGTGGTCTTGTCAGTTTGCGCAGAAGTTATTGTGTCGTTTTTTTAAAGGTTTTGGTATTGCTTGGGTTCGTTCCAGAGATTGCAGGGTGATGATGGAGGAAGTGTTGTTATTCCCCCTTTTCGTGTTTTCTTTGGCANCTCGTGATAGAGGCCGCTTTCTCTGCCAAGCGTGCTTTTCGGCTTCTTTATGGGGTATCTAGCTGGAGAGGAACAATAGGTTGTTTATGGGTGTGGAGAAATCTGTGGATTATGTTTGGGACTTCATTAGGTTTAATACTTCCTTATGGGATTTGGCCACTAAGGCCTTTTGTAATTATCCGTTAGGTCTTATTCTTTTGGATTGGAGCCCGTTCTTATAAGGGTTTCCTTTGCCGGCTGTTTTTTTGTATGCCGTTTTTGTGTATCTTCTTTTTTCATTTCTCTCAATGAAAGTGCAGTTTCTCATAAAAAAAAAAAATATTATATCAACGCCAATCAATAGTTAGTGGGTCGTGATAAGGAAGATAGAGGGATGCCAGTTGTCACATATGAGGTTGAAGATAGATAGATGCAAATGATCGAGGAGACCAATAAGGAATTGCAGGCACAAAAATCACTGGTTGGTGAGATTATGGAAGATTCCATAAATCACCTTATCGAGGATGGAGTGATACATAACTATTTAAATATCATTAATAAGGAGGGAGGATTAGAGGAAGTCTTGGCTATGTGTATTCTGGAAAAGGAGGTTTTGATTGGTCTGCCTCTTGAAGAAAATATCGAAGGAATATCAATATCTCCGACTATTCGTTGCCCTCCGAATTTGGGAGATATTGCTGCCAACTTAGACTCAATAAGGCCTATGCAATCCTTGTTCTTTAAGCCGTGAGTTTAAAAAATGAAAGGGGGAAGGGCCCCAAAGGAAATCACCTGCCTCAAGAAATAGGAGAAAATGATCTGATGTAATCCTTAAAGCTCTTTTTTTTTTTAATAAAACATGTGGGGGAGGGGATCGAACTCACAACCTCTTGGTTGGAAACATATGCCAATTACTATTGAGCTATACTTGCTTTGGCTGTAATCCTTTCAGCTCTTAATATTCTAGAATTGCTAAATAAATCCTCCCAGCCTTTGGAAATAAGAAACCTGTCCAAAAGATAATGGATTGAATCATTTACAGACTACGACCATGTAAACTTACCGTTGGATAGGGGAACCTCCATCAGTTCTAACTCCCCAATGATGGAATTGAACTTCTTAATGGCCTTTGAAATTCTACCACCAGAAGATCTTTCTAAGAACCATCTAATAACATTGAAGTCACCACCAATGCACCACAGATCCAGAATAGCAAGCAATGTCATGAAGTTTTGTCCAGAAGTACTCTCTTTCCTAATAATCTGTTGAACCATAGACATTAGTTAACCAAATATAAGCTAAACTTGAGAAGGAAATATGAATTGAGATAGAAAAATTCCCTTTTGTCATTTAATCCCTTATAATTTTCACTGTTAGATATTCCTTCCAACTGTTGCTTTTGAGTTTTAATATTTCAAAGAGGTTCCCCAATTATTTGAAGTTTTTCCTATTGTTTTGAGTTTCAATATTTCAAGGAAGGTTTCCCGATTATTTGAAGCTCTTCCTATCCCAAGCACAACTATAATAGGGTTTCTCCAAGGTTGGAAGATAGGTTGTGTATGTGTGGTGTGTGCGCGTGCATGCAAAAAAGAAAGAATAATTCTGGGGTGGTGTGTGTGCTGATTCAAAAAGAAAAGGAATTATGGGGTGGCCGAAGCATAGGTGTTGAAATCTGTATCTGTGGTGTGTGCACGGACATGCGTGCTAATTAAAATTCTTTTGGGGCAGTGTGTGTGTGTGTGTGCTTATTTGAAAAAAACATAAGGAATTATGGGGCGGCCAAAATGTTGGTGCTGAAGTTTGGGGCTAGAAGAATCGATAAAAAAAAAAGAAAAAAATCAGGCAGTGGGAGACCTCGAACAAAGCAGAATTTGCTGCAAGAATCAACAAAAAGAAAAAAAAAATAATCATAGGGGGCTGAAAAATAGGTGCTGGAATCGATAA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MEAVAEGLWRLADYHEKKGEIGKAIKCLEAICQSQVSFFPVVEVKTRLRIATLLLTHSHNVNHAKSHLERSQLLLKSIPSCLELKCRAYSLLSQCYHLVGAIPPQKQILYKGLDLTNSSGHELSVKLWSCNFNSQLANALIIEGDYQNSISALESGYVFSVEICYPELQMFFATSILHVHLMQWYDDNSVEQAVNKCDEVWESIEPEKRQQCVGLLFYNELLHIFYRLRICDYKNAAQHIDKLDAAMKADLQQTQYIEGLTKEMNALNQSLSRLDLHYKDRLALTEKHAQLQDQLRSINRPSSISRESLEPAHFGSMRRTSGDKLELAPYPIDGEWLPKSAVYALVDLMVVIFSRPKGLFKECAKRILSGMLTIQEELVKLGITDGVRAEVSLQHSAIWMAGVYLMLLMQLLENKVAIELTRSEFVEAQEALVQMKNWFLRFPTILQACESMIEMLRGQYAHYVGCYHEATFHYIEAAKLTESKSIQAMCQVYAAVSYICIGDAESSTQALDLIGPVYRMMDSFVGVREKTSVLFAYGLLLMKQHDLQEARYFFQLN Homology
BLAST of MS007548 vs. NCBI nr
Match: XP_022158435.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1083.9 bits (2802), Expect = 0.0e+00 Identity = 549/551 (99.64%), Postives = 550/551 (99.82%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. NCBI nr
Match: XP_008448423.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: MAU2 chromatid cohesion factor homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1038.9 bits (2685), Expect = 1.6e-299 Identity = 522/551 (94.74%), Postives = 538/551 (97.64%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. NCBI nr
Match: XP_022949168.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1038.1 bits (2683), Expect = 2.7e-299 Identity = 522/551 (94.74%), Postives = 537/551 (97.46%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. NCBI nr
Match: XP_022998788.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita maxima] >XP_022998789.1 sister chromatid cohesion protein SCC4 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1036.9 bits (2680), Expect = 6.1e-299 Identity = 522/551 (94.74%), Postives = 536/551 (97.28%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. NCBI nr
Match: XP_023521217.1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023521218.1 sister chromatid cohesion protein SCC4 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1035.4 bits (2676), Expect = 1.8e-298 Identity = 520/551 (94.37%), Postives = 537/551 (97.46%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FGN7 (Sister chromatid cohesion protein SCC4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SCC4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 717.2 bits (1850), Expect = 1.4e-205 Identity = 360/549 (65.57%), Postives = 444/549 (80.87%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B1H1Z8 (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=mau2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 2.7e-07 Identity = 53/220 (24.09%), Postives = 101/220 (45.91%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y6X3 (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=MAU2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 6.1e-07 Identity = 54/222 (24.32%), Postives = 101/222 (45.50%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9D2X5 (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Mau2 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 6.1e-07 Identity = 54/222 (24.32%), Postives = 101/222 (45.50%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B4ZIX8 (MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=mau2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 3.0e-06 Identity = 53/222 (23.87%), Postives = 100/222 (45.05%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DVU1 (sister chromatid cohesion protein SCC4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024925 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1083.9 bits (2802), Expect = 0.0e+00 Identity = 549/551 (99.64%), Postives = 550/551 (99.82%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L4R7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G000010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1038.9 bits (2685), Expect = 7.8e-300 Identity = 522/554 (94.22%), Postives = 537/554 (96.93%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BJ17 (LOW QUALITY PROTEIN: MAU2 chromatid cohesion factor homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490628 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1038.9 bits (2685), Expect = 7.8e-300 Identity = 522/551 (94.74%), Postives = 538/551 (97.64%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GBA4 (sister chromatid cohesion protein SCC4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452599 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1038.1 bits (2683), Expect = 1.3e-299 Identity = 522/551 (94.74%), Postives = 537/551 (97.46%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KHQ8 (sister chromatid cohesion protein SCC4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493351 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1036.9 bits (2680), Expect = 3.0e-299 Identity = 522/551 (94.74%), Postives = 536/551 (97.28%), Query Frame = 0
BLAST of MS007548 vs. TAIR 10
Match: AT5G51340.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 717.2 bits (1850), Expect = 1.0e-206 Identity = 360/549 (65.57%), Postives = 444/549 (80.87%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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