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MS005420 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTTTGGGTTGTCTATACATATCTGTCCTCTGCCTCAATTCACTTCAGTATGAAAGTGGAGATGTTTTTTCAAACAATTGGATGCATGAATTTCGGCTGGTAACAGGCAATGGCTCTCAGAACGTTAGTCCATTCCTTTTTTCCTCTGTGAACCATTCTGTATCATGCGAGGACCTGGGTGGTGTAGGATCGTTTAGCACAACCTGCCTGTTAAACACAAACTTGTCTTTAGATTCTGATTTCCACATATCTGGAACGGGGAACTTAGAGATACTTCCTCATGTTTTGATTTGCTGCCCCATAGAAGGTTGTACGATTACTCTTAATATGTCTGGCAACATCAAAGTCAGTCACCATGCAGCTGTTGTTGCTGGTTCGGTGGTTTTTTCTGCTGCTAATGTGATGCTGGAATACAATTCTTACATAAATACCACCGCCCTTGGTGGAGCACCTCCTTCTCAAACTAGTGGCACACCAGTTGGTTATGATGGATCTGGTGGAGGTCATGGTGGCCGAGGGGCCTCCTGTTTGAAAAGTAATCAGGCAAGCAATTGGGGTGGTGATGTCTATGCTTGGTCTACATTGTCCGAACCATGGAGTTACGGGAGCAAGGGTGGTGGGATATCGGAGGAAAAACCATATGGAGGGCATGGTGGAGGACGTGTGAATCTTCTAGTAGTGGATGTATTATATTTAAATGGTTCTATCCTTGCAGAAGGCGGAAATGGAGGGTCAAGAGGTGGAGGTGGATCTGGTGGAAGTATCTTTGTGCATGCAGTAAAGTTGTGAGTTCAATTCATGCTTATGGACTAGTCTAGACTTGTTTAGTGCTTTCTCTTTAAAGTCATGATGTATACCTTTTTGCTTATCTAATTTGAAACCCGTGTAAGATTAACTGTTGAGTTTGTTTGTACGTTATGATTGAAGCATTTTGTTGTTTATTGGCCAATTAAGAGCAGAGATTCACTTTTGCATGTTTATTGCTAACTATACAACGTGAAATTTTAATAAAGACATCTGGTACTATTCATACAGTAGAGATATAATTATAAGTTGTAACAAACGAGGTTTTTTTTTCTAATAAAAACAGGACTGATGATGATTGATGGCATTGCAATTATAATTTAGAACTGTCTAATGATTGAACCATTCTTTTGCAGTTTTATATATATTAATGTTGCCTAAACTCAATTACAAGATCTTCAAATCTTTACAAATAAATTGACTTATGCTCATCAGGTCAAAGAATGAATCTCTTATCCATCTTATTTTGATCCATCCCGTGTGGAGTAGTACCTCCGTTAAGCAGGATCCAGCAGTTGACCTGTTAAGAGAAGAATAGTATTGAAACTGTAAAGTTTTGTTCAAGTAATTAGTTATGTTGTGAAAACTCTGAATGATCTACTGTAATAATTTTTTATATTTGGAATAATCTGTGATAGCATTGTGTAGATCTTTTGCAGGGACATGTGACACATCGTGATGACCTGCTTAGCATTTTAGGTTTGAGCCAAAGATAAAGATCAACGTTATTGAACGAATGAGTGTGACATATAGTTACATGCTGATAGAATTCTATATCATTTGGAAGGTTTTAGGCATTGTGTCTGATGTTGGCCTGTGTTCAAAACCTTATACTTTCTGGATTCTTCCGTCATTCTTTATTAGGTTCTGTCAGAACCATAGACTTCTCTGGAAGTATGGAACATATTGAAAATTCCAACCCCCTGGACTTCTTTAATTGTTGACTGGATAAGACATTAAAGACAAAGTACCATTGGGTAGAACTTTTTGAAAATGAATAACTGAAAGCACATTGATTATTATTTCATTATTGTCCATAATTTTTTGATTTACTGTTATTTCTTCCAAATTTCCTCTCATTTCTTTCAACCTGATGAGATATTAAGGGAGGGGAGTCTCAATATATTGCCTAAAGCCTTGTGTCTACTTTTCTTAGGTGGATGATCTCTAAACCATGGAGTCCTGGAATTTTCTCTGTAACTACTTTTGTTTTTGATTTAATATATTATGGTGTTACTGATCCCACCTAATAAGAAATAGAGAAAAAAAAAACACAACAATGCTGAAGGCGTAGTCCCCAGTTTTATTCATGCTTTTAATGTCGGAATAGATCCATCTCAAGTTTTATCTATTTTATAGCTAAAATATGCAGTTGGTGTCCCCAATTTACTTCCTTTACAATAAAAAAGGTTATGAATTTGTACAATCATGTATCTATTGTATTACAAAACAAGCAGATGACCTGATGAGTAATATGTTAATAAATTACCATCTACGGTAAGAGTCAGAATTTTGATTCAATTCTACACAAGTTATTGTGGTACAGGTTAGATCCTGCTTGAACTTATGGGTCTGGTAGTCAGGCAGATAGCAATTATAACTAACAAATTTACAAACTATTCTATGATTACAAGCAGCTTGGGATGATGTTCTATTCGTCTGTTTCTTATTATAAAAAAACAGATCTCTTATTGTAGGATGCAATAGTTTCACCAATGAATGATGCTTCTGTTGTCTTCTTCATATCCCTTTTTGTTAAATGTTGGCTATGTTACAAAGATCATATGCTGTTGGTTGTTTCATCTATTACTAATACTTGGTTCTCTATTTTATTACCTAGAAAGGGGAATGGAACTATATCTGCTGCAGGAGGGAAGGGATGGGGTGGAGGTGGCGGGGGAAGAATTTCTCTGGATTGTTATAGCATTCAAGAAGATATTAAAGTTACCGTACATGGTTTGTACTTTGCAGCAATGAAATATTCTATATAATCATATAATGATCAATATTCTTTTATATTACATGATATCAATAGTTTATCGGAAGCAAAAGTTATTAATGGTTTTTATTTTTATGTATGATATTTATAGAACTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTCATATGCTATATCCTTTGACAACAAATTTTTTAAATTGGTCAAGTGAGGGGACTTAGTAAAATTTAAAGCTTCATTTTGGTTTTCACTGTCTTCTTTATTTTGTGGTTGTTCAATGTGAAATATTTATAGGAATTTGGGGGGCGTTTATAATTTTCTTGTATCAAGAGAGGTAGTTGATAACCTCACAGAGCATCAGGATTATTTCTTGTATTATGACTAAGAGACATTGGCATACTTCTAAGGGAGTATGTACTTTGTAACTTGTCACTATTTTAATGAAAAAATCTGTTTATTTTTTCAAAAAATGTTGATAGAGTTGGGGAGCCGTCAATCAAATTCACATATTCTAGAAGGAAGCCTAAAGGCACCTGACGTGTATAGTTAGTTTATATGTGGGGCTATGGAATCTCTTGTAAGTTAGGAAATGGCGAAGAACCTTTTGGATGGAGGTTGAAGCCCTCTAAGAACTCTTCCATAGGTAGACCGTGGATCGATATCCAAAGAACATCTTCGGATTTTTGTAAGTTCTCCTTTTTCAAAGTGGAATCGGGGGAAACAGTGAGATTTTGGGAAGACCCTTGGATCGATTCTTCTCCTCTGGCAGTTTCTTTTCCTGACTTGTACAGTATCTCCACCAAGAAAGAGAAGTCTATTGCTGATTGCTGGATTACAGAGGCCATGACATGGGATGTGGGCATGAGAAGGAACCTTTTTGATAGAGAAATGGAGAGATGGGCAGTTTTCACTAGCAAGCTTGAAGGAGTGGTTATTGGCCAAGGTAGAGATTCACTCGGGTGGAAGGCAGATAGCAGAGGCACCTTTACAGTAAAATCTGCTTTTCTAGCCATCTCTTCCCCCTCCCCTAAGTTGAATTCTGCCACTGCATCTTTTATTTGGAATTTCAAGGTTCCTAAAAAGGTGAAGGTCTTCCTTTGGACTCTCTTCTATAGGGGAACTAATACAGCTGATAAAATCCAAAGAAAGTTTCCTCATTGGACCCTTTCTCCTTCAGTTTGTACTATGTGCATTAATAGCGCGGAAACAGTGGATCATCTCTTCCTTCATTGTGCTTTTGCTACTAAGGCGTGGAACTACTTAGCTTCTCTCTTTGACCTCGCTATCAGTGTTCCTAAGAAGATTGGCGATTTTGTAGCGGAAGGTTTTGGAGGCTTCAGACTCAAAGGAAAAGCGTATGTTCTTTGGAATTGTGCAGCTAGAGCTCTTCTATGGTTGCTTTGGAAGGAACGAAACCATAGACTTTTTGAAGAGAAAGAGGCCTCTTTTGACTCTTTTAGTGTGAATATTAAGCATATAGCTTCTTGGTGGGCTTCGACTCATAAGAAGGTTTTTTGTAACTATGGTTTCTTATTGATTTATCAAAGTTGGAACTCCTTGATTGTATAGTTTCTTCGGGGAGGGTCCCCTCGACCCTCTGCCTCTAGGCTGTTCTGTTTGCCTTCGGGCTTCTTTTGATCTTGAATACAAGACTCTTTGTTTCTTATAAAAAAAAAGAGTGAGTTAGTTATTATATTGTATGATGAGGTAAGCGAGAGAGATCATCACAGAATGCTTCTCTGCAGTAGGGAGAATTCTTAGGCCTCTCAAACAGTATTTAGTCTGTCCTTTTCATTTTGATTTTGGCAATAATAAAGTAAGTTTTTCTCTCTATATATCATTGGTCTAACGGGAGAAAGAAACAAAATGTTAAAAAAAAATACAAACTCTAAAAAGGAGTAAAAAGGCTACTCTTTGGCTTGAACAATTTTTGTGTTGCACCCTTTCAAGAAAGATAAGGCTACTCTTTGGAATAACATCAATCGGGCTTTCATTTGGATCATTTGGAAAGAAAGAAATCCAGGATTTTGGATCATTTGGAAAGAAAGAAATCCAGGATTTTCGAGGATTCCGACCATCCGCCCCAACAAATGATAGACTCTATTATCTTTTTGGCTTTATCTTGGTGCAAAAGTGTAAATCCTTTTAATAGTTATGATTTAAGTTATCTCATATCCAATTGGAGAAGTTTTCTGTAACTTCATTGGATAGGGTTTTTTGTATATTTCATATTATCAGTGA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Match: XP_004148522.1 (uncharacterized protein LOC101208985 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2587.8 bits (6706), Expect = 0.0e+00 Identity = 1282/1430 (89.65%), Postives = 1350/1430 (94.41%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. NCBI nr
Match: XP_031737959.1 (uncharacterized protein LOC101208985 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2582.4 bits (6692), Expect = 0.0e+00 Identity = 1282/1430 (89.65%), Postives = 1349/1430 (94.34%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. NCBI nr
Match: XP_022932979.1 (uncharacterized protein LOC111439602 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022932980.1 uncharacterized protein LOC111439602 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022932981.1 uncharacterized protein LOC111439602 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 2582.4 bits (6692), Expect = 0.0e+00 Identity = 1290/1430 (90.21%), Postives = 1345/1430 (94.06%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DVS2 (uncharacterized protein LOC111023954 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023954 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2786.9 bits (7223), Expect = 0.0e+00 Identity = 1400/1430 (97.90%), Postives = 1403/1430 (98.11%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F3N5 (uncharacterized protein LOC111439602 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439602 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2582.4 bits (6692), Expect = 0.0e+00 Identity = 1290/1430 (90.21%), Postives = 1345/1430 (94.06%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IDZ5 (uncharacterized protein LOC111471805 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471805 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2572.7 bits (6667), Expect = 0.0e+00 Identity = 1286/1430 (89.93%), Postives = 1343/1430 (93.92%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K6L2 (uncharacterized protein LOC111491138 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491138 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2572.3 bits (6666), Expect = 0.0e+00 Identity = 1283/1428 (89.85%), Postives = 1341/1428 (93.91%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5Q0 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103503496 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503496 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2572.3 bits (6666), Expect = 0.0e+00 Identity = 1276/1428 (89.36%), Postives = 1346/1428 (94.26%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. TAIR 10
Match: AT5G47020.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT5G11700.2); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1874.4 bits (4854), Expect = 0.0e+00 Identity = 942/1426 (66.06%), Postives = 1130/1426 (79.24%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. TAIR 10
Match: AT5G11700.1 (LOCATED IN: vacuole; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycine-rich protein (TAIR:AT4G32920.3); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1372.8 bits (3552), Expect = 0.0e+00 Identity = 730/1383 (52.78%), Postives = 949/1383 (68.62%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. TAIR 10
Match: AT5G11700.2 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glycine-rich protein (TAIR:AT4G32920.3); Has 8203 Blast hits to 3102 proteins in 389 species: Archae - 3; Bacteria - 5624; Metazoa - 852; Fungi - 139; Plants - 704; Viruses - 77; Other Eukaryotes - 804 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 1363.6 bits (3528), Expect = 0.0e+00 Identity = 733/1412 (51.91%), Postives = 954/1412 (67.56%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. TAIR 10
Match: AT4G32920.1 (glycine-rich protein ) HSP 1 Score: 1329.3 bits (3439), Expect = 0.0e+00 Identity = 710/1386 (51.23%), Postives = 943/1386 (68.04%), Query Frame = 0
BLAST of MS005420 vs. TAIR 10
Match: AT4G32920.2 (glycine-rich protein ) HSP 1 Score: 1329.3 bits (3439), Expect = 0.0e+00 Identity = 710/1386 (51.23%), Postives = 943/1386 (68.04%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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