MS005163 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AATAATGGAGGAATTGAGTTTCTGGAGAACAAGAGCATTTTGATCACTGGGGCTACTGGTTTTCTAGCAAAGAGTATGTATTATTACATGTAATTATGATTATTCTATGTGATATTGTAGCTTTTTTTTTTCTCCTAAAGAAAAACTTGTAATCTATAGAAGATGAAAATTGTTCAAAAAATAATAATGTGGGATATTTTGCAGTTTTGGTGGAGAAAATATTGAGGACTCAACCCAACGTGAAGAAACTCTATCTACTACTGAGGTCTAGTGATGAGATTTCAGCCGTGAAACGTTTCCATAATGAGGTAATTAGTTATTTAATTAGTTGCTTATGATGATCTAAAACCATGACTTTATATTATTATCATTTGTTAACACAAACTATGTATTATTGTTTGGTCTTTTAATACAGGTAATTGAGAAGGATTTGTTTCAAGTGCTGAGAAAAAAATGGGGTGCAAACTTAAGTGCATTGATTTCAGAAAAAGTTTGTGTGGTGCCTGGGGAGATCTCACTCCCATGTTTGGGACTGAAAGATTCAATTCGGGTTGAAGAGATGAAGCGTAAAGTAGAAATAATCGTTAATTTAGCTGCAACGACCAATTTCGATGAAAGGTACGGTACATGCTAAAAATTTAAAATATCGATGTCAATGAAAAAGTCGTAGATATTACTAAAAGTTGAAGACAGGAGTATTTTATTACAAAAAGTTGTCTGTTTTTCTTTGATAGATACGATGTAGCACTTGGGACCAACACTGTCGGAGCTAGAAATGCTGTAAGCTTTGCAAAGCAGTGTTGTAATTTGAAGCTTCTTGTTCATGTATCCACTGGTTAGTACATCTATATCATGGTTTATTTGATAATTCCAGCTTGAAAAATCCTCCGTTTTGGATCTTCAAGGCGAAATATTTACTTTTATACTAATTGTGATCGGATGTGCGTTTTTGTTAGCTTATGTTTCAGGAGAAAGGGAAGGACTTATTCTAGAAACTCCGTATAAATTGGGAGAGTCGTTGAATGGCATCAAAGGGCTGGACATTGAAACAGAACAAAAAGTAGTGGAAGAGCGATTAAAACAACTTAAAGAGAATGGTGCTACGAATGAATATATAACTCTAGCGATGAAAGATTTGGGCCTCGAGAGGTATATAATTAGTAAAGCATAATGAATTTATTTATTTTATTAATTAATGATAAATATACACTAAAATATTTGAATTTTTGTTTTAATCTTGATTATGATAAGGGCTAAGATGTATGGATGGCCAAACACATATGTATTTACAAAAGCAATGGGTGAGATGTTGGTTAGTGATCAAAAAGACGATCTTTCTTTGATTATCATACGACCAACCATAGTTACAAGTACTTACAAAGAACCTTTTCCGGGTTGGATTGAAGGAGTCCGGTACGTATTTTATTCTGAGTATATCTTTCAAATTGGAGTGGTTAATTAGGTGAACCACCAAAACAACCTTTTAAATATTTGTCTCCTATTTTAATGATTTTTTAATTTAGTCTTATTCTTTTGAAACTTAAATCAATACTGAGGATTTGTAGCATTTTTACAGGACCATCGATAGCATTACTCTAGGATATGCTAAAGGAAAACTAACTTGTTTTCTGGCTGGTACTAATTCAATCATTGATTTGGTGAGATCAACGTGATTTGTTTTCTAATATTCATCTCTTTTCAGTGTTAGAATCTTTCTCTGTATATTTTTTGGGAGTGAATAAAAAGTTTTGACGTTTAGAAAAATGCAGATCCCGGCAGATATGGTGGTAAATACAATTTTAATGTCAATGGTAGCTCACGAACTCCATCCATCTAATCAAACCATATATCATGTGGGTTCATCGGCAAGAAATTCCATGAGAAATATTGATTTTCAACGCTTTAACTTTCAATATTTCACCCAAAACCCATGGATCAATAGGGATGGAAATGTGGTTAAGGTTGGAAAAGTTGCCGTATTTGAGAGCATGACCAGCTTCCGTAGATATATTGCCATTCGCTACTTAACTTTTCTCAAGGTACATTGTTATCATCAACCACCCTGAAATTTCTATTCTATATCTTAAACTTAGAAAGTTTTCAATTTCAACCCAACTATGTCAATTTGAACCTAACTTAATGATTAAATCTCAATTCTAACAGGTTAAACTAGAAAGAAAAGAAAAAAAAAATTTATATGGCCATACCTCCTAAATCAACTCTAATTTTTTTATCTTTATATATAATAATTAATGACATCATTTATCTTTTTAATAATTGAATTATGAAGGGATTGGAATTTGCAAACAAGGCATTTTGCCACTCTTTTCAAGACAAGTATGTTGAGATGAGGAGGAAGTTCAATTTGGTGATGCGACTCATCGAACTTTATCGTCCATATTTATTCTTCAATGCTGTGTAAGTGAAGTTTTTTTTGTTTAAATTCTATTTTCCATTCTACAAGTTTCTTAACATTATTTCATTATATATATATATATAAATTTTATTTATTTATTTATCTTACCTACTCATTTATTGATATGTATTATTTTGTTTTTGAATGTACAGTTTTGATGATACAAATGCTGAAAGATTGAGAAAGGATATACAAAATAAAGATACAAAAACAGAGGCATTATTTTTTATGGATCCAAAGGCTATAAACTGGGAGGATTACTTCATGAATGTCCACTTGCCTGGGCTTGTTAAACACGTCATCAGATGATTCTAATTTATCTGAAATAAAATTAATTACTTGTTTGATTGTTTCCTAATTGAATGTTTTTTAGAAAAATTTTAAATTAAGATAAAAGTTATGTTTGCTATAAAGTCCTGTGGGGTAATTAATTATTGCATTGTATTTTTAGCAAAGGAAAAATCTATCGACATCAAAGGCAATAAAATTACATAACCAAAGTTATTGATTCTCATGTGTAGGTTCAAATTTCTTACTCTAAAAAGAAATAAAAATTTTGTGGTATTGTTTTTGTTTTTGTTATTTCCATGATTTTTAATAATCTTGGGATGAGTTCGATGATGATTGAGCCAGTCTATAATTAACAATTCAGGAGTTAGATGAGGACGAGAACCTAAACATATTTATGGATCACTCGATAAATTTTGAGAGAAAAAAATAAGGTTACTATTGTACTATAATATATTTAATTAATATTCAAAGAAAACTAAAAAACAAAAATTATGATAGTAAATGCCAACACGGCAGGATCATCACTTAGGTAAATACTTATAACTTTTTTTTTCCCTTTTTTCTTCCATGGGAGGTTCAATTCAGCACCCTAAAAAAAATCTCAATAGAAATTTTGAACATTCAAAAAGTTAAAAGGTGACTTTTTTTTTTTCAAGGCTGAATCACTTTCTCCCTCCGATTATTCGTTATACCCTTCATGACTCGTTTAGGAATAACCAATTCATGGGGGTTGGAGTATAACAGGACTATAACGAATCCAGGTAAATTTTATGTGAGGCCGAATTCAAAGGAACTAAAGCCAAATAAGTTAAACAACTTAACATTTGGTTAGACTTAACTTTCATTAACAACCATTTAAAATCACTTAAAATAAATCAAAATATTAAAAAGTTATTCAATATATCCAAAAGCATTAAAAATCTTTAGATGAAACATCGACCATAATTAATGGACATTAAAAAGCTTCGTAAGAATGTGAAAAAATTTTCTATAAGAAGATGTTTAGATAATATTTGTTTGGTTTTTTTCAAGTACAACAAGTGGGTCATGACTTCTTGGTTAGAAAGAAGTGCCAATTATTATTCAGTGTCATCTTCAAATCTCAAATGCTGGTCTAAGCCCAGTTCAGGCCCGATCCTAACACGACCCAAGGTCCACGTTTGATCGACTTGGCCCAACCGATCAACTTATCAATAAATTAGATTGAATATGAATTTTTGTTTTTTAAATTGAGTTGTACATGGACTGACCCATTTGAGCCATATTTAGATAAGCCCGTTGGACGAGTCAAAAAACTCAATCCAATATAATCCAATATTATTTTATATATATACATTAATTATTAATTATATAATTAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGTATAGTAATACCATTTAATTTTTTAAAAAATCAAAATAAATTAAGTTAGTAGTTATATGATATAACAAAATTTATTGATAATATTTTTTGAAAAAATAAAAAATATTACAAAAACATAAAATAAAAATACTAATTCTAAAACTCAAGAATTAGTTTGAAAAAATATTTAAAAAATAAATTTCAATGATTAAAAGTAAGTCCGAAACAAGTCCGATCTAACTTTTGCCCATTCATTTAGGTCAATGGATTAAGTCATGGGCTTAGGTTTTAGTGGTCGGGTCAGTCTAAATCAGACCTAAATAATGATCGAGGCCTGTAGGACTGAGGCTTATACCGAGCTTGAGCTTACGTTTCTTTGGACTGGGTTGGGCCGGATCGATCCAATGATGATGGTGAATTATCGCTGAGTTAAGCTTATCTAGAAATATATATATTTTTCTTTTTTATGAACACAAAAGTAAAATATTCTTTTATTTTATCACTATAATATTTTTATACTATACAAGGCCCTTAAAAAATTCGCTCTCTCTCTCTTTGTTTTTTTTGTCACTTGCAATTTCTTAGAGGTGGACATGGAATAATAACATTATTTGAGAAACCTGTAAATGTTATCTCTAATCCATTGAAGGAACACCTTAATATCTTCGTAAGCAAAATTTAAACTCATAAAATTAAAAAGTGATCCACAATGATTGTTCTCTACATTTTTCCATGAAAACATCTTAATTCTAATTCATATTGTATAATTAATAAAAAGAAAAAAAAATAATCGTACAATCAAACAAAACCCTTAAATTATTTTGTCCTTATTAAACTTATTGCTAAAAATAATTAGGGATGGTAGGAAGAATAATTGGTAAGAACATGACGAACAAAAAAACTTTTTTCTTTTTTCTGTTTTAAA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NNGGIEFLENKSILITGATGFLAKILVEKILRTQPNVKKLYLLLRSSDEISAVKRFHNEVIEKDLFQVLRKKWGANLSALISEKVCVVPGEISLPCLGLKDSIRVEEMKRKVEIIVNLAATTNFDERYDVALGTNTVGARNAVSFAKQCCNLKLLVHVSTAYVSGEREGLILETPYKLGESLNGIKGLDIETEQKVVEERLKQLKENGATNEYITLAMKDLGLERAKMYGWPNTYVFTKAMGEMLVSDQKDDLSLIIIRPTIVTSTYKEPFPGWIEGVRTIDSITLGYAKGKLTCFLAGTNSIIDLIPADMVINAIIMAIVTHMLQPSNQTLIYHVGSSARNSIRHMDFHNYLLRYFTKKPWINKDGSIIQSKKITLFNDMESFHRYMTLRYLIFLKGLEFVNKALCYSFQDTYIDLQRKFNWVMRQIELYRPYLFFKSKFDDTNLEKLRIATQDIDRDANTLFLDPRDINWEDYFVNIHIPGLVKHVQNK Homology
BLAST of MS005163 vs. NCBI nr
Match: XP_022153083.1 (fatty acyl-CoA reductase 3-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 842.4 bits (2175), Expect = 1.9e-240 Identity = 420/489 (85.89%), Postives = 452/489 (92.43%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. NCBI nr
Match: XP_022153088.1 (fatty acyl-CoA reductase 3-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 3.6e-218 Identity = 379/486 (77.98%), Postives = 429/486 (88.27%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. NCBI nr
Match: XP_022943504.1 (fatty acyl-CoA reductase 3-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 741.1 bits (1912), Expect = 6.1e-210 Identity = 360/487 (73.92%), Postives = 427/487 (87.68%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. NCBI nr
Match: KAG6570488.1 (Fatty acyl-CoA reductase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 741.1 bits (1912), Expect = 6.1e-210 Identity = 360/487 (73.92%), Postives = 427/487 (87.68%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. NCBI nr
Match: XP_022986982.1 (fatty acyl-CoA reductase 3-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 739.6 bits (1908), Expect = 1.8e-209 Identity = 358/484 (73.97%), Postives = 427/484 (88.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93ZB9 (Fatty acyl-CoA reductase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 559.3 bits (1440), Expect = 4.3e-158 Identity = 268/484 (55.37%), Postives = 364/484 (75.21%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XGY7 (Alcohol-forming fatty acyl-CoA reductase OS=Simmondsia chinensis OX=3999 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 542.0 bits (1395), Expect = 7.1e-153 Identity = 268/486 (55.14%), Postives = 355/486 (73.05%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39152 (Fatty acyl-CoA reductase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 513.5 bits (1321), Expect = 2.7e-144 Identity = 257/486 (52.88%), Postives = 354/486 (72.84%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LXN3 (Probable fatty acyl-CoA reductase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 510.0 bits (1312), Expect = 3.0e-143 Identity = 254/489 (51.94%), Postives = 352/489 (71.98%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WRB0 (Probable fatty acyl-CoA reductase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FAR5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 3.2e-137 Identity = 259/494 (52.43%), Postives = 342/494 (69.23%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DGK4 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020669 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 842.4 bits (2175), Expect = 9.4e-241 Identity = 420/489 (85.89%), Postives = 452/489 (92.43%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DGK9 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020672 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 1.7e-218 Identity = 379/486 (77.98%), Postives = 429/486 (88.27%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FUI8 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448256 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 741.1 bits (1912), Expect = 3.0e-210 Identity = 360/487 (73.92%), Postives = 427/487 (87.68%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J929 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484571 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 739.6 bits (1908), Expect = 8.6e-210 Identity = 358/484 (73.97%), Postives = 427/484 (88.22%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C9F8 (Fatty acyl-CoA reductase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497948 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 731.9 bits (1888), Expect = 1.8e-207 Identity = 358/486 (73.66%), Postives = 424/486 (87.24%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. TAIR 10
Match: AT4G33790.1 (Jojoba acyl CoA reductase-related male sterility protein ) HSP 1 Score: 559.3 bits (1440), Expect = 3.1e-159 Identity = 268/484 (55.37%), Postives = 364/484 (75.21%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. TAIR 10
Match: AT5G22500.1 (fatty acid reductase 1 ) HSP 1 Score: 513.5 bits (1321), Expect = 1.9e-145 Identity = 257/486 (52.88%), Postives = 354/486 (72.84%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. TAIR 10
Match: AT3G44540.1 (fatty acid reductase 4 ) HSP 1 Score: 510.0 bits (1312), Expect = 2.1e-144 Identity = 254/489 (51.94%), Postives = 352/489 (71.98%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. TAIR 10
Match: AT3G44550.1 (fatty acid reductase 5 ) HSP 1 Score: 490.0 bits (1260), Expect = 2.3e-138 Identity = 259/494 (52.43%), Postives = 342/494 (69.23%), Query Frame = 0
BLAST of MS005163 vs. TAIR 10
Match: AT3G44560.1 (fatty acid reductase 8 ) HSP 1 Score: 474.6 bits (1220), Expect = 9.9e-134 Identity = 246/493 (49.90%), Postives = 341/493 (69.17%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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