MELO3C031875 (gene) Melon (DHL92) v4

Overview
NameMELO3C031875
Typegene
OrganismCucumis melo cv. DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionUnknown protein
Locationchr06: 25936257 .. 25945248 (-)
RNA-Seq ExpressionMELO3C031875
SyntenyMELO3C031875
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CTATTTTTCCCTAGAATATTATTTTTTTTCCTCTCTCTCTACAACACTTCACTTTATCCTTATTTTCCCTTCAACACTTTTTCACACTTTTTCCTCAAGTGTTAATAGACTAGGTAGCTTTCAAATTGTTCTTTCCTTTTGCAATTCTATAGTCCCTCCATTCCATTAACTTTTCTTTCACTTCACTTTCTTCGCCACACTTATTCTTTCATTTTGTTCACACATCAACTATGTCAAGCAAACAAGCTACATCAAGCACAACCCAATTTCCTTGCACCTTGTGTGACAAGGTGTAAGATAACAAGAAGCACCTAGTAGAACATCAAAACGACCGACACATGGAAAACATGTCCGGTCAAGTATGAGTCCAAATCCGATCTAACAAAGCACGGGAGGAGAGTAGACACTAATGCTCCTTCTTTTGGTCTATTTTTATGTTTCTATTTGTTAGTTGTGTGTGTTTTTTTATGTTTGAGTCTGTATTTATTTTTAGACTGTCATTCATTGTGTGTTCTTTTACTTATGTTCATAGTGTTATTGAAAAAAAGGTATTCAGTGTGTTCCTTCAACTTTATGTAAATCGATGAATATATATATATATACATATTGGTTGTTGGAATTGTTGTACATTTCTCATTTAATTGTGCTAAAAAATATGTATTTCTTTTAAAAAAAGATGGATTTGAAGAAAAAACAAATCATTTATATTAACTATACTAATCCAAGCTCCAAAAAGAAAAGAAAGGAAAAATTGCAATCGGGGCCATTGTTTGTTTATCGCAAAATGTAGAAATATCTGATTGGTTTGATAAAACCTCACAAATAGAGTTAAGTTTGAAATTATAGACCCAATTTGAAATTAAATCTTAAATATATCAAATATTCAATAAACTAAAAGAAAGCAGATTCAAAATATTAAGCTCATCTCCCTCAAGGTTAACCAGAAGCTGAACTTGGACTTTTAATTTTAAGAACTAATTTTCATATTGAAAACAAAAAAGAAACAAGAAATGATGGTTATCAAAGCTGTTCTGTTCTGTCCTTTTTGGTTTGGTTTTGTTTGTTTGGCTTTTTTTTTTTTACATGGTAATTAATAAAAGATTCATACAGTTTTCATAGGGAAGGAAGTTAAACCATAACAGAGAAAATAAGTTAATCCTGTGTTCCTTCGCTCGGGCTTAATCAACGTGATCATGAGCATTTCAAAGTCAATTTTAAGAAAAGAAGGAACTTCCTAAATGTGGTATATCTAAGTCCCAAGGAGATTCCCAATCTTCCATTAACTCAGGAGCATAGAGAATTGAGAAGGAAGAGATTAATTTAAAAAATTCGAAGTAAAGGGGGAAAGGAAGGAGGCAACCAACCTGTGGTGTCATCCTCTGCTGGGTCTCGAAGACATACTTCTTTGAGGGAGAGGAAAGAATCCTGAGCAGCACGGGAAACCAGGGCCAGGGCAGAGAACCCGGCCGCCATGATTAGGGTAATTGGATAACCCAAGGAGGGAGTGGGAGATCTATAATGTGGAAATCATGAGAAGCTAGGGTTTTGGGAGAGAGGGAATTTGAGGAAGAGGCGAAGACGATGAGTTATCGTCGAAAAAAAATGAGAGAGAAAGGGAAGATTTTAGTTTTCTTTTTTCTATATAAATTCTCTTTTCCTTAATTCTCCTTTATTTTGATTTGTTAATTCAAACAAAATTCAAATCAAACTTAATTGAAGAGACAAATTTGAGTTTTAGATTTTTTTAAATTTTTAAAAAGTATCCCTTTACGTAAAATATTGAAGTTATTTAATATAATCAAAACATGTTCTTTTAGGTTTCTAAAATCATCACTTTATTTATTTATTTATTTATATATATATATATATATAGGTCTTAGAATGTGTTTGAAAGTGATTTTGAGAACATCACTTTCTCTCTTGACAAAATCACTTTTAAAGAAAAGAATGATGGTAATATTTGACATGTTCTAAAACTTCAAAAATAAGTTTTTGTTTTCTTATAAACAAAATTAATTAAACAAATCATTATGCAAATTGTTTTTTCACAAAATTTTTTATTACAAGATTATATGTATATATATTCATACTCATGAGATCGAGGAAAAATAAATATAAAAGATCTAATCATTAATTCAATAAAATTATAATAATACAGAGTTGTTATCTCAAAATTAGAACCACCCGCCCTGTAGTAACACTATACCTAAGCACCAACTTAATATAAATATTATATTCCAATAGAAACTCCTTTTCAAAACATGGGGCAACGGATCCTCAAAATCTCTGTAACATATCGTTGGGATGATCCATATGGGTGGAGGCAAATTTCTGTGTGCACTGTCGACTATATAATGTCTATCGAAGCTCTTGTCCTCTAGGCGGTATATTCCTGCATCTTGATGTCCATGTAAATAAGGAAATCTATAATGGTGACAATTATCTGTAAAGTATACGCGATCAGGTAAACATTTGGGAAAATCTCTAGTTGACGCACAAATGGATTGGTTGTCACCAATAAACATAGCATCGCCGTCTAAACTCTCCACCTCTACAACACACATCGTTCCATCTTCACATTCACGAGTAACTTTGTAGACTATAAACTTGGAAGTCCTTGTGAACAACATAATCCCATCTGGATCTTGTCCTTCCCGTTCATCAACGACAAACCTACTAACTAATAAAAGCTCACGTTTGGAGGACACGACAAGATACGCAATATCAGCTTCGACAAAATCGATACTAAATATGACCTTCTTCAAATAAATCGAACTATTCTCAACTTTCACAATCCAAAGTCCAATCCGCCAATCCAAAACATACAAAACGTCGTCGAGAACATTAATATCGTCAAAACCATTAGTCCTGTTTAGGTTGTGATAGATCCACCTTTTATCCTTTGCTTCCATGAGACACAATCTACGATACGAACTATAGATGGCAACAATGGTGAACCCGTGTGGATACAACGACGGATCTTTGGTTAGTATGGCTTTGTGTATGGCAAGAGGACAATAATCAGGTTCATCATCTATAGTAATGGGAGGAATATGAATGACATTCCCATTAAAAGGGTTAAACAAAGTAATGTCTAGTGTCTCTTCAAGCAAGATCAACCAACCGAAAGATGAACCACAACACCTTTTGTTGAAGGAACGTACGAAGTCTACAGGACGGATTTCATTGTTAGTGAGATCGTAAAGACAATGTTGTTTCTCACTATCATATTCTGAAGGAACAATAAGCATGGGAAGTTGAGAATGGTTAGAAGTAATTAAGGATCGTTGATGTTTGTGGCGTAAGGCAATAAAATTCCAAGACTTACATACCCGGCTAAATTGAAGATAGTCATAGAGAGATACCATTTTGTTAAGAATCACACCAAGGACATCGTATTCGAGTGTTGACCAATCTCGAGACTCCAAACAATCCATGTTGTGCCTCTTCTTGTTGTGTTTTTGCCCTTTGTGTCTAATCACAAATGAGAGAGGGAGATGAGTTTTATGAATATCCCATAAAATTATAACCTTTATTAATTGTCCTATATCTTTCTTATCTTCACATTTGGCAGTATATTGGTATTTTCTATTAATTGTTTTGTCACAAATGATACATAAATTTTATATTTTTAATACAATACGTAAATTTAAAGAAAAGAATGGAAAAAAATATATATATTATTTGTGAATGTTTCCAAAATTGTTTCTAACCATAATTAAGATGTCATTAAATTCCTAATTTGAATAATCAATTCCTTAAAAATAAAAATATAGATTAAAGAAGAAACACTTTTTCACCAATTTCATTTATTTTCATTTCTCCATATTTATTTATGGACGATATTATAATTCCTTTCTTTTACCGTATATATTTCTTTTTTTTTCTTTTTCTTCTAAACATGGTTTTCAAATGATAAAATCTAAATTAAACAAAGGAGCTTCAAATTACTTATATTTTAGTTATTATACATAATAAAAAGAATTTAACATTCACAATATTATATCTAAAAGTAGGATAATTTAATATATATTTAAAATTATATGGGTTTGTTAATTGAAACAAAATTAAAACCAAACTTTCAAAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAAGAGAAAAAAATTGAGTTTTAGATTTTTAGAACTTTAAAAAAGCACCTCTAATTTAAATCCATAATTATAAATTCTTTTAGATCTTAAAGTTAAATAGATATGGAAATAATAATCAAAATGGGGAGAAAATAATTGCCATTGATAAAGATTTAGATTCTAAAATTAAATAGATATAGAAACAAAATATAAAAATCAAACGTATATTAATGATAATATTGAGAAACTAAATTCCAATTTTATTTTCAAAACATGAAAGAAATATTTTCTTTTCTTCTTTTTTTTTTTTAAATATAGCAATTAATTGCCAAAACATTCTTGATGTGTTGGAAGGGTTTATGAAATGATTTTTGTTTTAATCTTTAAAATTTAAATATAAGAAATACGTGAAGGAATTAAATGTGTTTCGAATGAATTATTGTTATGTTAGAATGTCTTAAATTTGTTATACAAAGCTACAAACAACCTAACTAAACACGTGTACTTATTTACAAGTTTATTACGATTTTGATCCTAGAGTTAATGTAATATTTATATATTCTCTAATCTAATCTAGTAGCTTTCATATTTTGATTTTTATCTTCTAAATTTTGCAAAATCCAATTTAAATTAAATGCTAAATTATAAATCAAATTCCTAAAATAAATGATATATTATAAAATTTTTCCTAATATAAAATTTTCCTTAAAACTTTAATCAATAAAATAAAATAGGTAAATGATCTTATTTCATATGGGGGGGGACTCCAATTTCTATAAATACTAAAATTGATAATTACAATGTAATCAATCTGTCAACTTTATTAATGAGACTGCAATTAATTGTTCTAATACATCAAATTGAAGCATTTTTTCGAGTGGATTATTAGCCATAAATCTCGA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mRNA sequence

CTATTTTTCCCTAGAATATTATTTTTTTTCCTCTCTCTCTACAACACTTCACTTTATCCTTATTTTCCCTTCAACACTTTTTCACACTTTTTCCTCAAGTGTTAATAGACTAGGTAGCTTTCAAATTGTTCTTTCCTTTTGCAATTCTATAGTCCCTCCATTCCATTAACTTTTCTTTCACTTCACTTTCTTCGCCACACTTATTCTTTCATTTTGTTCACACATCAACTATGTCAAGCAAACAAGCTACATCAAGCACAACCCAATTTCCTTGCACCTTGTGTGACAAGGTTTACGAGAGCAAGAAGCGGCTGGTTGACCATCAGAACGACCGCCACAGGGGAAAGACTCATACTTGTCCGACATGTTCGAGTCCAAAACCGATCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCAAGCAAACAAGCTACATCAAGCACAACCCAATTTCCTTGCACCTTGTGTGACAAGGTTTACGAGAGCAAGAAGCGGCTGGTTGACCATCAGAACGACCGCCACAGGGGAAAGACTCATACTTGTCCGACATGTTCGAGTCCAAAACCGATCTAA

Protein sequence

MSSKQATSSTTQFPCTLCDKVYESKKRLVDHQNDRHRGKTHTCPTCSSPKPI
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO3C031875 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C031875 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C031875 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C031875 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (DHL92) v4
Date Performed: 2022-08-06
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR013087Zinc finger C2H2-typeSMARTSM00355c2h2final6coord: 13..36
e-value: 0.0083
score: 25.3
IPR013087Zinc finger C2H2-typePROSITEPS00028ZINC_FINGER_C2H2_1coord: 15..36
IPR013087Zinc finger C2H2-typePROSITEPS50157ZINC_FINGER_C2H2_2coord: 13..41
score: 10.283794
NoneNo IPR availableGENE3D3.30.160.60Classic Zinc Fingercoord: 1..49
e-value: 1.2E-6
score: 30.5
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 30..52
IPR036236Zinc finger C2H2 superfamilySUPERFAMILY57667beta-beta-alpha zinc fingerscoord: 10..47

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C031875.1MELO3C031875.1mRNA