MELO3C030448 (gene) Melon (DHL92) v4

Overview
NameMELO3C030448
Typegene
OrganismCucumis melo cv. DHL92 (Melon (DHL92) v4)
DescriptionUnknown protein
Locationchr04: 9010159 .. 9022238 (+)
RNA-Seq ExpressionMELO3C030448
SyntenyMELO3C030448
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAATTAATAAATTTACTAAATGTTGAGTAAGGATGTGACCACTTTTCATTTACTCTTGAAAACTAGACCATTTTTCATTTGACCTCCAAACAAAGTCATCACCTAAAGAACACACCTTCAGAAGGAAAAGCATCGGAACAGAGACTGTTTTCTTGGTTTAATCTTATGAAACGGAAATTCTGGGGGACTCCCATGGGTGTTCAATCTTGCTTATTTCTCACCAAGCTCTAGTTTCTGATTCATGCAACACTTGCGATGGAATGTGATAAAGTAGAGAAATAAGAAGAATGTCACGGTTCCCAAAAGCGCGTGTGATACTTACTCCAAATAATTCCGTCTCATCGGAAATAAAAAGATCACAACTCAGAGCAAAGCATGGATTCTTAATAATTGCACGAACGCCCCTTTTGGCTGTCAACACTCATTCTACATCCGCCGAGTCTCTACCCTTGCACGGACATCAAAACCATATTCCCTCCTACTTACATTCCTCTCCCGTATCCGCTTTCTCTCCCCCACCGTTGTCTCCTCCGTCGGTTTCAAAATTGGAGAATTTCTTCTGTTTTGGCCGCAAATATTTTAATGCGATACTCTTCATTAAAGACCGTGGCCGGAAGTACTGTTTAGAATTTGCATTCATCTTTAACTCTCTTTTGTTTGATGGGTTTTTCTTTCCCTATAGATGAACCCGGGAAACAGGTAAAGAGCGCCTTCAGAATGAAGAATACAAGCAGATCCCATGTAGCTTTCAAGGTGTTACTTTAATTATTTTTCCATTGCAGGCCTACTTTCACTTTTTCTTCTTTCAATTATTCTTATATCGATTTCTTACTTCTTAAGTCCCAACAAGCCGATCGTACGGAAAACGCTTAACTCAAACGTCAGTGCATATGATTCTGTTCTTCCATGTACCTTTCTCAAATTCCATGCATGTTAATTATTTGTTATTTTTTTTTCTCGGGCAATTAATGTTTTTGGGAACTTTATTAAAAGATAAAGATAGTTTCAGCAAATCCATCTAACAAACTGCTCGTCTCGTAGTATAGTTTGTCCCGGTGGTCTGCTTGATCATCTTAAATTGTGAAAATTTGCATTCAAAATTGTTTTCAGCTTCTTGTAAATTTGTGCTAAGAACAAGGTAGTATGGGATCTCTTTGTCCACGGATTGGAATGAGATAACGAATGTGATACTTAAGAGGCTTGACTCTCTCACCCCAATAACTAACTTTTGGGTGTGGTTCTTCAAGGTGCTTAAGTACCTAATAATGGCATCAAAATCAGCTGTTGACGTTTTGAAGTGGAATTGTGGAGGGTTCTGATTGGGTGTGGCCGAGTGAAGTACCATCAGGACATCATGGAAAGTTTTTAGTAACCAAGGTAGTATAGGATTCCTTTGTCTCACATTGGTTAGGATGGGATGATCATGTGGTACTTAAGTGATTTGGCTCTTCCACCCTAATAGTTGACTTTTTGGGGCGTGGTTCCCTAAGATGCTTAAGTACTTAACAAGTTGTTCGGTTGAGGCAATCAAATTTGTTGAAGGTTTTATCTGCTAATGGGTATGATTTTATTTCAATCATTCTTTTCGAGTTCTTATTTTTCCGAAGAATCATTATAAGTTTTAACTAATTCATCAATTAGATCGTTGGAGTTATTGTATTATTACTCTAGGTTCTGATTTCCTATTGACATTACCAGCAAGGCAGGTAAGGCTGGTGAACTGCATACTCGTTTGAATGTCATTTCAAATCAATGTGAAATCTTCATTTTCATACTTTAGATTCTACACAGAAGAGAAAAAAAAAAGGGAAGATCTACGGGAATCAAAAAGACAGTCCGTTAAAACCGGTTTATATGACTTGATTCTACACGGAAGCTAACATTACAGGCTTAAATTTTTTTTTATATGACTTGATTTTTTCTTTAAAGTTTTAGAAGCATTTCTAATTAACTTTTTGTCTATATGATGTCCTATCATTGAAAAATGCAACAATTCATGCAGAATCCTGTTTTCTGTACACTGCTCAATGATATTTTCAATTTTAAGTTATCTATACTGTAGATTGTGTCATTGGTTCTTTGTGTATTGATCAGACCTTCTTTTCAATTGTCACGCCAGGAATCAGGAGATGTCTCTACAGAAGATGATGTGAAACAATGATGTTCCAGCTCATTTGCTCATTCCTGTGGATAAAATTCTTTATTGAAGTTAATCCATGTCACAAGTGGTGAGATTTGGGCATTTACTGAGGACCAAATGGTGGAATTATGTTATGTTCTAACACTTACAACCATTTTTTTTTCCTCGAGGGCAAAAGGCTGCTTAGCTTGTCGCATAGCTTAAACTACTAAGGTGACGTGAAAGTTCTCTAAAAAATTTGTATGTTTAAGTACGGGTTGACTCCTTTTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTGCTGTTAATATAGCATCAGATCAGAGGTCGATTCTAGTTTCTACAAGTGTAGTTTTTTCCATGTATGTTGACCTGTTAATCATCTGATGGTGATGTTATAGGAGGGAGTACAGCAAAAAGAGCACAAACGTTTGGCCCTTTTTTAAATTTTCTCCTGCTATTTCTTTAAAAATTTATTTCTTTTATCTCTAACCAAATCTCAGTACTTAACCATGCAAAACCACAACACCTGTAGTTTGTCGTTGAAAGGAGTGCCAGAATGAGTTGTTCAATGTAGCAGCAGGGGAATGTGTCATATACTAGCTTAGACGTAACTCATCAGGAAAGCTCATTCTAGCTTCTAGAAATGACTTGACTGCTGAGAAAAAATAGTTCACTTCTACGGCTCTCCTTGCAAAGACACAGCAACTTGGAGACAGGCAAGGACCACACAAAAACCTAACCCCCCTGCCCCCTTTCTTTTCGGTGCATTTTGACCATTAACTACATCGTAGATGAATCTAACCAAAAATTGAGTGTCCTGAAACTCTCAAACCCAACCTATAAAGCACGACACTCCTAAGTGGCTCATTATCGCTCGATGGATACCCACACATGTCCAACCCATGCCAGCTGGTGTGTCCATTATTATTATTTATTAGTTCTATTTTTCAACGTGTTAAGACACTCGATGGATACGCGAAGGACAAGCAATCTGCTAAAATTTAGGGGGCAAAAATATAATGTAGAACATGCTACTTTGACCCTTTTAAGCCCATTAGGGTTCAGTGTTCAATCCATATTGTTTGAAATTCTAGGGTTTTAACCACAATTCCTCAGAATTGCATAATACACTGACTCTCAAACCCATGAGCAACAGCTAATTGATTCTGTCTTGTAGCTTGAGGAAAATATGCAGAAGGCTTGTTGGATTCTAATTTGTAGTTTTGTTGTGTTAAACTAATTACTAACTTATTGGGTTTTGAACAATGTTATGATGTTGGCCGTCTTATCTATTGTTTTCTTTTCATGAATTGATGACTGTTATTTCGATGCTTAAAGGTAATATTTCATATGTCAAAATATGCATACATATGTTTACTTTTGTAAGAAAAAGAAAAAAAAAAAATAATAGTGTGTCCCCAATGTGTCGTGTCCTACTTTTTCTAAAAATTGATGTGTCGTCGTATCTGTACTGTGTCGTATTTGTTTCGCATGATAGTGCCTTTGCTTCTTAGAATGCAACAAACCGAATCTTGTATTGAGCAAAAGTGGTAGCAGATATTCAATGTGAAGTTGCCATTGATTTAAAAATTTTGTTGCTTTCTCTAATTGTTTGTTCCCCTAATGGGATAGACTTCTAATCTTTGAATTTTGACCTCACATTGATGTTCGTGAAGCTGGGTTGATCCCGTCTCCCCCCAAAATAGTTCTAGTTTAGAAAAACTAAAGTCTAGTTTGTTGGATTAGTATATGTATTTAAACTGAAGACATAATGCAAGCATAATTAGCCTTATTTATCCTGTTTGAATTGAAGATCAGTCATGAAAAGGTGGTAAACCTGCCGAAGGAAAAAGGTTGGTGCTTCATGTTAAATATGGATTACACCGTATTAAACTCTCAAAATGGACTCTGAACAAAGTATGAAACTTCTAACCCAAAACTTCTTGTTTTCTATGTTTAGTAAGTTAGTAACCATAATTGGAATCATTTTGGGTTAGAACTCCATTTCTTTTCCTCAATTTTCTGAGTAAATTGTCCATGTCCCTTGTCATCGTTCTAGTAGGATGCTACTTTTGTGGCGCACATTGTCTCTCTAGAATTAATGAACTATATGGAAATTCCGGTGTTGATATAGCATCCAGAAATCTTGTAGAAGGGGTTTTAATGATCTATATGGAAGTTTCAGTGTTAATGTAGATGCCTGTATCTTTCAGGTTGAAAATGTTAAAGTTGTTTAATATTAAATATGAAGAAGTCTAACAGTTTCTTCCTTATTTATAGCTACCATGTAAATTTTATTATAATTCTAAAATAACGTACACATGTCTATAATTGGGTTTAATCCAAGTCCTAAATTCTATTAGAAGTTTAAAAACAAGCCTATTGTGATCGCACTACATTCATTAAGTTCTACAATGAGATTTAGGTAATTTCCTTGAGCTTTCATAATGGAATAAATTGATAATGTAGTAAGGTGACTGTAAATTTTAGTTGATTGTGTCAACTGCCAAAGGAACTTCTGTAATGAATTTATGTGTGCTATGGAAGTTTTCGCATGCTCAAGCACTTCACAACATTTCAAACTATTGACCATATTTGTGTCGCTGTTGTTATAGATTTGGTATGTAGAACTTAAGGACGTAATTATACAGTTTACAGAAAGTTTTGTTCAAGTTAGGTCATTATTGTATTTTTGGTATTGCAATTGGAAGCAGATGGAAAGATTTCTAAGACAGTTTTGTTACATTGTGATGGTTGGATTAGAGTTATGATTTATTTATTCTTTTAGAGTCGAAATGTTAAAGCTATAGAAATTGTTTGGAATTGTGAGTTTGTATTGTTTGTGTTTTTTCTTTCG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mRNA sequence

ATGAATTAATAAATTTACTAAATGTTGAGTAAGGATGTGACCACTTTTCATTTACTCTTGAAAACTAGACCATTTTTCATTTGACCTCCAAACAAAGTCATCACCTAAAGAACACACCTTCAGAAGGAAAAGCATCGGAACAGAGACTGTTTTCTTGGTTTAATCTTATGAAACGGAAATTCTGGGGGACTCCCATGGGTGTTCAATCTTGCTTATTTCTCACCAAGCTCTAGTTTCTGATTCATGCAACACTTGCGATGGAATGTGATAAAGTAGAGAAATAAGAAGAATGTCACGGTTCCCAAAAGCGCGTGTGATACTTACTCCAAATAATTCCGTCTCATCGGAAATAAAAAGATCACAACTCAGAGCAAAGCATGGATTCTTAATAATTGCACGAACGCCCCTTTTGGCTGTCAACACTCATTCTACATCCGCCGAGTCTCTACCCTTGCACGGACATCAAAACCATATTCCCTCCTACTTACATTCCTCTCCCGTATCCGCTTTCTCTCCCCCACCGTTGTCTCCTCCGTCGGTTTCAAAATTGGAGAATTTCTTCTGTTTTGGCCGCAAATATTTTAATGCGATACTCTTCATTAAAGACCGTGGCCGGAAGTACTGTTTAGAATTTGCATTCATCTTTAACTCTCTTTTGTTTGATGGGTTTTTCTTTCCCTATAGATGAACCCGGGAAACAGGTAAAGAGCGCCTTCAGAATGAAGAATACAAGCAGATCCCATGTAGCTTTCAAGGTGCTTAAGTACCTAATAATGGCATCAAAATCAGCTGTTGACGTTTTGAAGTGGAATTGTGGAGGGTTCTGATTGGGTGTGGCCGAGTGAAGTACCATCAGGACATCATGGAAAGTTTTTAGTAACCAAGGTAGTATAGGATTCCTTTGTCTCACATTGGTTAGGATGGGATGATCATGTGGTACTTAAGTGATTTGGCTCTTCCACCCTAATAGTTGACTTTTTGGGGCGTGGTTCCCTAAGATGCTTAAGTACTTAACAAGTTGTTCGGTTGAGGCAATCAAATTTGTTGAAGGTTTTATCTGCTAATGGGAATCAGGAGATGTCTCTACAGAAGATGATGTGAAACAATGATGTTCCAGCTCATTTGCTCATTCCTGTGGATAAAATTCTTTATTGAAGTTAATCCATGTCACAAGTGGTGAGATTTGGGCATTTACTGAGGACCAAATGGTGGAATTATGTTATGTTCTAACACTTACAACCATTTTTTTTTCCTCGAGGGCAAAAGGCTGCTTAGCTTGTCGCATAGCTTAAACTACTAAGGTGACGTGAAAGTTCTCTAAAAAATTTGTAGAAGCAATTGCAACCTTTCCTAAACTTCTGTCGAGCTAAATTGTACAAAAGGCTTAGAAGGAATGTGAACCTACCCAGATGTTCGATATCAGCATGGATGCAAAAAGTTTGTAGTTCTTCGGATAGATTGAGTTCTGCAAGCCTACGATATTAGCTTCTCTGGAGAAATCAAGTGATATAAACAGGCTTTAATAGACCGTCTTTTTTTATTTGGTCTAATATGATCCATCGGTTGCAGCAGAATAGTGATGCTAAGGGATTGAGTAGTTCAACTTGAATTTTATTGTTCATCTGTGACGGTCTTTCCATGGAGAAAGAAATGTGAAGTTTTAATTCTATAATATTGGTTGCGCATGGCATGGCAATCGCGGTACAGACATGCAAATAAAAGAAATTGTGTGTTCGTGCTGTAAGGACCCACTGGCTATCCTATCAAGCGACAAGAAGCGATGGGCCGAAAGGAACTAGAAACAAATATTTATATGAATTGCAAGCACTTAGCTTAGCGATGGAAAATCGCTGCTGTGGAATCATAAAACCCTTTCTTGTCATCTTCATGATTTTTAAATCTCTTTTTGGGCCATCATGTCAGGTAGTTGGGTTGGGGAGGCAGGCCATAATGCTGTTTATGATCCTTTTGTCGGCGGAAAACATGCATGGAACGAATTACGTGTCGATATGAGGCAAATTAGCTTCATGAAAATTGAAAGAGATGAAAAGAGATTGGTAAGCAGCAGAAATTAATCGAGTTAAAAGGTGAGAGAGCCTCGAATCTGCCATGAATTGAAAGCTACGTTTCAGTTTGTATGTGCCCAGGGAAATGGCTGTGTGAAACCCATGATTTTGTGCCCCTTCCCAATGGGGAACTGTGAAACTCGACCCCCAAAGCCTTCCTTGCGGCGAGAAGATGAAGAAACCCTCTCAACTTTTTTTTGGTTTAGAGTGTCCATAGAGGTGATCAAATAGGTATTTGGTCGGAAAATAAATTGAATTTCAACCTAAAAATGATGTACTTGAAGGACATCTTGAACGGACACAAATTTTTAATAATATTTAGGAGTTACTCTTA

Coding sequence (CDS)

ATGTCACGGTTCCCAAAAGCGCGTGTGATACTTACTCCAAATAATTCCGTCTCATCGGAAATAAAAAGATCACAACTCAGAGCAAAGCATGGATTCTTAATAATTGCACGAACGCCCCTTTTGGCTGTCAACACTCATTCTACATCCGCCGAGTCTCTACCCTTGCACGGACATCAAAACCATATTCCCTCCTACTTACATTCCTCTCCCGTATCCGCTTTCTCTCCCCCACCGTTGTCTCCTCCGTCGGTTTCAAAATTGGAGAATTTCTTCTGTTTTGGCCGCAAATATTTTAATGCGATACTCTTCATTAAAGACCGTGGCCGGAAGTACTGTTTAGAATTTGCATTCATCTTTAACTCTCTTTTGTTTGATGGGTTTTTCTTTCCCTATAGATGA

Protein sequence

MSRFPKARVILTPNNSVSSEIKRSQLRAKHGFLIIARTPLLAVNTHSTSAESLPLHGHQNHIPSYLHSSPVSAFSPPPLSPPSVSKLENFFCFGRKYFNAILFIKDRGRKYCLEFAFIFNSLLFDGFFFPYR
Homology
[Close]
BLAST of MELO3C030448 vs. NCBI nr
Match: KAG7024870.1 (Vesicle-associated protein 4-1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 1.9e-04
Identity = 40/99 (40.40%), Postives = 52/99 (52.53%), Query Frame = 0 

Query: 6   KARVILTPNNSVSSEIKRSQLRAKHGFLIIARTPLLAVNTHSTSAESLPLHGHQNHIPSY 65
           KAR I+ PNNS+SSE K+S    +HGF+IIART  + ++        +  HGHQNHIP Y
Sbjct: 10  KARGIIIPNNSISSE-KKSYNSEQHGFVIIART-AIGLSRRIFRVTRVHPHGHQNHIPPY 69

Query: 66  LHSSPVSAFSPPPLSPPSVSKLENFFCFGRKYFNAILFI 105
           LH    SA     L    +      F FG    N I+ +
Sbjct: 70  LHPPLESALRHRRLHQRGIGD----FRFGPGNLNVIVLM 102

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO3C030448 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7024870.11.9e-0440.40Vesicle-associated protein 4-1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrospe... [more]
BLAST of MELO3C030448 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C030448 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO3C030448 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO3C030448.1MELO3C030448.1mRNA