
MELO3C026617 (gene) Melon (DHL92) v4
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAAAACTATGGGTTTGATACCTTGGAGTGCGACAGACGATGGTTGGTTCAAATATTCTACTTTTATCCACAAGTAAGCTCCCTTGCACTGTCTCGAAATGGAACTCTCCCTTGTTGGTAATGGTTATCACCGCCATGTCCTCCGGACTCGGTTGCCCACACCTTATTCTGTAATGGCTTCTGCGTCGCATGCTGTCCCTAGCCTCAAGAACAATCAATCTAATTCTGTCGCAATTCTCCCTAAAGAGCCTCAATTCCTCCCCGGCTCTTCAAATTCTAAACTCTTCAATGGCGCCCAGAAGCGCCACTCCAAATCATACCTTGAGAGACAGTCCGCTATTGCTCAAGTTAAAGATTGCTCCGAGTTGGCTCCGGCTCTTGCCAGGTTCTTCTTCTCTTACCTTTTTGGCATGTGTTTTTGGATTTTGAGCTGTGGGAAATCACTTGCTCGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACTTTGTTAGAAAGGTTTCTTTTTCAATGTTAGTTAATTATCGATTTTGGTAAAGAACTATATGTAGTTGGAGGGCAGCGAGAGAATTCTAATCCCGTGTGCTTACAAGATTACTGCTCGGGTCTTATTGAATCGATTGAAACAGGTTCTTCAATCTACCATTGCTTTAAATCAGCTTGCTTTTGTTGAAAATAGACAGATTCTGGATGCATCCTTATGGCTAACGAATTGGTGGATGATTGGTTTCATGAAACCAAGAAAGGTGTGATTATTAAACTTGATCTTGAAAAGCTTTTGGTACGGTCAATTAGGACTTTTTAGATGCAATTCTTTGGGCTAAAGGCTTTGGAAGGGTTTGGCGTAAGTGGATTCATGAATGTGTCTCTAGTGCAAATTTTTCCATTATTATTAATGGTAGACCTCGTGGTGAAATAATCCCTACTTGCGACATTAGACGAGGTGATCCTCTTTCTTCTTTTCTTTTTATGTTGGTTGCCGATTGCTTAAGTCATCTGTTGGATCATAATCTATCTAAAAATTTGATAGCCACTAACCCCATTGGTGCTTGGAGTTTTATCCTGAATTACTTGCAATTTGCTGATGACACTTTGCTTTTCTCCACTGCTGACCGCGTTGTCCTTACATGCTTGTTTGAGGTTATTCATGTCTTTGAACAAGCTTCTGGTTTATCAATTAATCTCTCTAAAAGTGAGCTCCTTAGGGTTTATATCTTTGATGATGATTTGGATTGGATAGTGACTGTTTTTGGGTGTAAGAAGGGACAATGGCCAACTTCTTATCTTGGCCTTCCCCTTGGTAGCAACTCTAAATCAATGATTTTCTGGCAACCAATTATTGAGAAGTTCCAACAAAAACTCTATAATTGGAAGTATGACTATAGGGTGGTCGTCGTACACTTATTCATGCCCGACTTATTCATGCTACCCTGTCAAGCTTGCCTACTTATTACCTCTCTTTTTCATGCCCTTGATAATTAATTGTTTGGAGAAACCGATTCATGATTTTTTTTGGGACGATTCATGTGATGAAAATGGTATGCATAATGTTAAATTGAATTACTACTCTAGCGCCCTAAGCTCTTGGTGGTTTTGGCATTGGCAATTTTCGTCATCGAAATTCTGCCCTTTTGGGGAAGTAGATTTGAAGGTTTTTAGATGAGCAAGATGCTTTGTGGCGTCAGCTCATTGTGGCTAAGTACTATTATCCTTTTTGTGTTTGACCAACTATTGTTAGAAGGTCGTCAAAGTCCCCGTGGATCTCCATCTGCCATACTGCTGACCTTGTATTTCACTATCTCTTTTTGGAAATATCGATGGCATGATTGTGGTATTCTCTTTGTGATTTCTCCTTGTTTGTTTTGTCTCTCTTGTACTCCTGATATTTTTGTTGCTGAAGCGTGGCTTGCTGATTCTGAGACTTGGAACTTGCACTTTAGACGTAATTTTACTGATCACGAAATTCAGGAATGAGTATCTTTGTCTACTATTTTGTCTTCTAGCTGATTTCATATGGTGCCTGATTCTTGGAGATGGACTATTGACTCCTCATCTATATTTATTGTGAAATCTATGATTGATGACTTGATAGGTGTTCTCGAACCTTTTTAAAGGGATTTTTATTCAATCACTTGGATAGATCACTTCCTAAAGAAAATTAAAATTTTTCTTTTGAAGCTTAGTCATAAATCTATAAACACTACCGATCATCTTCAACGTCGTATGCCTTATATGTCTCTTTCTCCTTCTTGGTGTATTATTTGTTGTGCTAATGTTGGATCCCATGTTCATCTTTTTATTCATTGTCCTTTTGCTTGGGAATTTTGGGATCGCATTTTGAGGCTTTTGGTTGGTCTACTACTTTGTCCACCGACATTTCAAACATCCTCAACTCTCTTATGCTGGGTCACCCGTTTATTGGTTGCAAGAAGATTATTTGGCTGGGTGTTCTTCGGGCTTTCTTTTGGACTTTATGGGGCGAGCTTAATAGGCGTCTTTTCCAAGACTCGTTTTCATCTTTTAGTTCTTTTTTTGACATGGGTCCACAAGTTTTTGTTGGTGCAAATTTGGGCACCCTTTTAAGAACTTTAGCTTATCGGTCTTAGTTGCCAATTGGCACTCTTTTTGTAAATCACCTTTTGGTGCTTAGGGTTTCCCTTTATTTCATTTTATCAATGAAATGTTTGTCTCTTGTCAAAAAAAACAATGGATGGAAGATGTTATGCGTTAGCAAGGATTTGGACCTTGATTCGAATTTTGTATTCAGCACCTAATGGCTCTGACATTCCCTACATTCTTGCAATATGACAACGTTATCCTTGTTTCAAATTGTTTCTAAGTGGGAAGACTATCCCCACATACTCACATACCAATACTGGGACCTTTTAACATCCTTGATTCTCACTTACATGCTTACTAACGAGAATTACTTCAAGCTAAAGACGCTTAACTTTGAAGTTTTTATGATTGAGTTAAAAAAAAAAATGAAAATGTACCTTGTTGGTATATGGTGAATTCGTGGGGCCCGAAGATTTGTTGGAATTGAGCTCAGAAACAACATATTTGACCTCTTTCTTGGTGAAGGTGGTTTCTAGAAGTGATGCTTGTTGTGTGGAGATGGGTAGCCAATTTGAGATTTTCTGGAGAGAGTGGCTGCTCTGTTTTTTTGTTTGTTTGTCTTTTTTGTGTGTGTATAGATCAGTTAACGTTGCCCTCATATGGCCATTTTGTCTTACATTTTTGTTACCTCCTTAGCAACCAAAGAAAGAAGCTATTCCTTCAAAAGTGTTTCTTTGTAGTTTATGGGAAACCAACATATCCCCTGATTACTCTGTGCTGTTGATAGTGATAATTTCTGCAATAAGCTGGTGTTTCTGGGTGATATTGCAGCTAAAGGTCTCACAGTTCCACTCTTTAAGAATAGCTTTTGAAACCTTTAAGTTTTTGCATCAATCCATGTCCTGGTCAAGCGCAAATAGGGGTATCTTCACCAATGGTCCACTATAGGAGAAAGGGAATGCTGTTGCAATGACATATTCTCAAATTAAAAAAGGGGGTGTAATCCTAAGATACACGTGCGACCAATGGAGAGAAGCAACAGCTAGTGATAAGAGGTTGGTCTTTCAAGCCTTCAAACAGTGGCCATTAAATTTATCTAACACCTTTTTAATTGTTAAGAATCGATTAATCAACATAAGCCTTAGAGAGTCATGAAAATAAAACCAATTGTAGAGGTTGTTTTGGAGGGGGATATCAATAAGAACAATATTCTCAATGAACCAATTAAAAGGTCCTATACTTCTCGTGTTCTATTCCCAGTTAGAAGTTTGAGAAGACCATCGTGCCATATTGGAATCTCCTCCCAATAATCAATAATCAACACAAAGATGAGACAAAACTTCCGGTTCCTTTAGAAAATAAGACTTAATGGGTAAAGAAGTCTCAGGGATTCTTGTGAACCAAAATTCAAATGGATCTAGATCGCGATTCCTCCCTTGAATACATTGCCCCATAATAGGGGCTTCATAAAGTTAGAGCTTTGGAGGTGGAGGTTTGAGATTGGTAGGGATGATGGGTACGTAGAGAAGAAGGAAGGGAGGTTAGGGGTGGGGATGGGGGAAAGATGAAGCTTAAGGACTGGAAACTGGATCATAGATGTCGATGTTGAGAAGATGGATGGAGATTTAATCTTGGGTGTTGGATTTGAGAAAGTAGGGACTGTTGTGGGGGTTAATGGTAATTTTAGAGTTGTCTTTTAGTATTTTGTTAATGTCAGGCTGCTGATGTAAAAGTCTTATGTTTTGGACCATTTTTACTTTCTCAATATCATTTCATTAACCGGCAAGCTTTTATTGTTTAGTCATGTTGAGTCCAGCTAAGGAGAGTTAGGCAAGGCCTTTTTTTTGTCCGGTTTAGATTTGTCTTTTAGTGTTTTGTTCATGGTAGGATGCTGATGTAAAGGTCTTATGTTTTCAACCACTTTTATTAGCTCTATGTCATTTCCTATTGTACTTTGAGCTCTACCTCATTTTTTAATAAATGAGATTCGTTTCCTTTAAAAAAAAGTATGGTCTTGTAGTTGTATTAGTATGTATTGAGTAAAGAGGTGATGGAGGACACATGTCTTTTTTTGGAAGTATTGGTTTTCTTGGAAAGATGTGGTTAAGATTCATGCAGATTTTTAGGGTGTTGTTGGCCCAAGCTGAGGCTGATGAACATGAACTATGATGGACAAGGTCTTGGTCCTTTACCATCTACTTCTTAGGACAGAGGAAGAACGCTCAGGTGGGCTGGGTTTTTTTGCTAATTGTTGGAGTGTCTGGCTAGAAATTTATGGAAGGATATTTATTGCGTAGTCTCACTTCAATAATACCTCTTGTTTGGTGTTTTACTGTTTTTATGACTTTCCATTTTTATTCTTATTACTAACTGCTAAGGCTTGCCTATTTCTCATTTTTATCATAGCCTTTCATCACTTTTTTTTCTTTCTTTCTTTCCTATTTTG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ATGGAACTCTCCCTTGTTGGTAATGGTTATCACCGCCATGTCCTCCGGACTCGGTTGCCCACACCTTATTCTGTAATGGCTTCTGCGTCGCATGCTGTCCCTAGCCTCAAGAACAATCAATCTAATTCTGTCGCAATTCTCCCTAAAGAGCCTCAATTCCTCCCCGGCTCTTCAAATTCTAAACTCTTCAATGGCGCCCAGAAGCGCCACTCCAAATCATACCTTGAGAGACAGTCCGCTATTGCTCAAGTTAAAGATTGCTCCGAGTTGGCTCCGGCTCTTGCCAGATATGGTGGACTACTAAAACCGCAAGATTTGAATGTTATACTGCGGCATTTTGGGATGTTAAATAGGTGGAAGGATCTATCTCAGCTGTTTGAGTGGATGCAGGAGACTGGAAAGACCAATATTTCTTCTTACAGCAGTTACATAAAGTTCATGGGGAGAGGTCTCAATCCTTTGAAGGCACTAGAAGTATACAATAATATTCAAGAAGTATCAATAAAGAATAGTATTTTTATTTGTAATTCTATCCTCAATTGTCTGGTGAGAAATGGCAAGTTTGATACCAGTGTTAAGCTGTTTCATCAAATGAAGAATGATGGTTTATGTCCAGATACAGTTACATATAGCACGATGCTTACCGGTTGCATCAGGGTTAAACATGGTTATGCTAAAGCAATGGAGCTTCTTAAGGAGCTGCAGGACAATGGACTATGCATGGATTGTGTATTGTATGGGACATTGATAGCTATTTGTGCTTCACATAATAGATTGGAAGATGCAGAGAGCTTCTTCAACCAGATGAGAGCTGAAGGTCATTCACCAAATATGTTCCATTATGGCTCTCTACTCAATGCTTATTCAATCAATGGAGATTATAAAAAGGCTGATGAGCTGATTGAGGATATGAAATTGACCGGGTTAGTACCAAATAAGGTGATTTTAACGACGTTGCTGAAGGTTTATGTTAGGGGAGGTTTGTTTGAGAAATCGAGGAAATTATTATCAGAATTGGAATCCCTTGGCTATGGTGAAAATGAGATGCCATATTGTTTGCTGATGGATGGCCTTGCCAAGGCAGGTTCTGTTAGAGAAGCAAAGGCAGTTTTTGATGAAATGAAAGCAAAAAACGTTAGATCTGATGGGTATGCTCACAGCATCATGATATCAGCTTTTTGCCGAAGTGGGCTTCTAGAAGAGGCAAAGTTGTTGGCTAAAGATTTTGAAGCCACATATGACAGATATGACATTGTAATATTGAATACAATGCTCTGTGCCTACTGCAGAGCAGGGGAAATGGAGAGTGTAATGCAAATGCTTAGGAAAATGGATGACTTAGCAATCAGTCCAGATTATACTACCTTCCATATCTTAATCAAATATTTCTTTAAGGAGAAACTATATCTACTTTGTTATAGGACATTGGAGGACATGCATCGTAAAGGCCATCAACCAGAGGAGGAGCTTTGTTCATCTTTAATATCATCTCTTGGGAACATACGGGCTTATTCGGAAGCATTTTCCGTTTACAATATATTGAAATATAGTAAAAGAACAATGTGCAAGGCACTCCATGAGAAGATTTTGCACATTCTAATTGCAGGTCGACTTCTCAAAGATGCTTACGTCATTGTCAAGGACAATGAAGGGCTAATTTCTAAACCTGCTATAAGGAAGTTTGCTTTTGGATTTATGAAGTTTGGTAATGTCAACTTGATAAATGACGTAATGAAGGCAATCCATGGTTCTGGATACAAGATTGATCAGGATTTGTTTATGATTGCTACATCACGCTACATTGAGCTACCTGAAAAGAAGGATTTATTTATTCAATTGCTACATTGGATGCCTGGTCAGGGTTATGTTGTTGACTCATCAACAAGAAACCTTATCTTAAAGAATGCACATTTATTTGGTCGCCAGCTTATTGCAGAGATCCTATCAAAGCATAGTCTATTGTCAAAATCCACAAAATCTCGTGAGAACACCTTTCGTTTAAAATAA MELSLVGNGYHRHVLRTRLPTPYSVMASASHAVPSLKNNQSNSVAILPKEPQFLPGSSNSKLFNGAQKRHSKSYLERQSAIAQVKDCSELAPALARYGGLLKPQDLNVILRHFGMLNRWKDLSQLFEWMQETGKTNISSYSSYIKFMGRGLNPLKALEVYNNIQEVSIKNSIFICNSILNCLVRNGKFDTSVKLFHQMKNDGLCPDTVTYSTMLTGCIRVKHGYAKAMELLKELQDNGLCMDCVLYGTLIAICASHNRLEDAESFFNQMRAEGHSPNMFHYGSLLNAYSINGDYKKADELIEDMKLTGLVPNKVILTTLLKVYVRGGLFEKSRKLLSELESLGYGENEMPYCLLMDGLAKAGSVREAKAVFDEMKAKNVRSDGYAHSIMISAFCRSGLLEEAKLLAKDFEATYDRYDIVILNTMLCAYCRAGEMESVMQMLRKMDDLAISPDYTTFHILIKYFFKEKLYLLCYRTLEDMHRKGHQPEEELCSSLISSLGNIRAYSEAFSVYNILKYSKRTMCKALHEKILHILIAGRLLKDAYVIVKDNEGLISKPAIRKFAFGFMKFGNVNLINDVMKAIHGSGYKIDQDLFMIATSRYIELPEKKDLFIQLLHWMPGQGYVVDSSTRNLILKNAHLFGRQLIAEILSKHSLLSKSTKSRENTFRLK Homology
BLAST of MELO3C026617 vs. NCBI nr
Match: XP_008464969.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1333.2 bits (3449), Expect = 0.0e+00 Identity = 668/668 (100.00%), Postives = 668/668 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. NCBI nr
Match: XP_004141206.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN59861.2 hypothetical protein Csa_001278 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1285.8 bits (3326), Expect = 0.0e+00 Identity = 642/668 (96.11%), Postives = 653/668 (97.75%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. NCBI nr
Match: XP_031738874.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1277.7 bits (3305), Expect = 0.0e+00 Identity = 637/661 (96.37%), Postives = 648/661 (98.03%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. NCBI nr
Match: XP_031738873.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1276.2 bits (3301), Expect = 0.0e+00 Identity = 636/663 (95.93%), Postives = 649/663 (97.89%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. NCBI nr
Match: XP_038903773.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1241.5 bits (3211), Expect = 0.0e+00 Identity = 615/660 (93.18%), Postives = 638/660 (96.67%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WVV0 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g10910 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 811.2 bits (2094), Expect = 8.6e-234 Identity = 399/603 (66.17%), Postives = 494/603 (81.92%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FIT7 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g61990, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g61990 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 158.7 bits (400), Expect = 2.3e-37 Identity = 94/392 (23.98%), Postives = 197/392 (50.26%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9S7Q2 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74850, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PTAC2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 157.9 bits (398), Expect = 3.9e-37 Identity = 107/422 (25.36%), Postives = 193/422 (45.73%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LYZ9 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g02860 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g02860 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 153.7 bits (387), Expect = 7.4e-36 Identity = 102/406 (25.12%), Postives = 189/406 (46.55%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FMF6 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g64320, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g64320 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 148.3 bits (373), Expect = 3.1e-34 Identity = 97/339 (28.61%), Postives = 173/339 (51.03%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CN74 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502713 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1333.2 bits (3449), Expect = 0.0e+00 Identity = 668/668 (100.00%), Postives = 668/668 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IWQ9 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479891 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1185.2 bits (3065), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/664 (88.25%), Postives = 631/664 (95.03%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ERS3 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436973 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1182.9 bits (3059), Expect = 0.0e+00 Identity = 584/664 (87.95%), Postives = 627/664 (94.43%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DRU4 (pentatricopeptide repeat-containing protein At1g10910, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023788 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1154.0 bits (2984), Expect = 0.0e+00 Identity = 573/665 (86.17%), Postives = 620/665 (93.23%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LCK2 (PPR_long domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G842670 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1117.1 bits (2888), Expect = 0.0e+00 Identity = 554/573 (96.68%), Postives = 562/573 (98.08%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. TAIR 10
Match: AT1G10910.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 811.2 bits (2094), Expect = 6.1e-235 Identity = 399/603 (66.17%), Postives = 494/603 (81.92%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. TAIR 10
Match: AT5G61990.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 158.7 bits (400), Expect = 1.6e-38 Identity = 94/392 (23.98%), Postives = 197/392 (50.26%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. TAIR 10
Match: AT1G74850.1 (plastid transcriptionally active 2 ) HSP 1 Score: 157.9 bits (398), Expect = 2.8e-38 Identity = 107/422 (25.36%), Postives = 193/422 (45.73%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. TAIR 10
Match: AT5G02860.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 153.7 bits (387), Expect = 5.3e-37 Identity = 102/406 (25.12%), Postives = 189/406 (46.55%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C026617 vs. TAIR 10
Match: AT5G64320.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 148.3 bits (373), Expect = 2.2e-35 Identity = 97/339 (28.61%), Postives = 173/339 (51.03%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (DHL92) v4
Date Performed: 2022-08-06 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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