MELO3C020869.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonstart_codonCDSpolypeptidestop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TATATAGATATTCGTCCAATGACTTCTTAAATTTACTCTAAAGAACAATATCTTCTCTCTTACTAACCGTTTTACCCAACGCCAACTCTATTTTCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCACAATGAAGAAATCATCAGGCCGTCAAAAAATCGAAATCAAGAAGCTAAATGTGAAGAGTAGGCGGCAAGTAACCTTCTCCAAACGCCGTGCCGGACTCTTCAACAAGGCAGCGGAACTCTCCATTCTTTCCGGCGCTGAGATTGCTATCCTCGTCTTCTCTTCCACCGGCAAAATCTATACATTCGGACATCCTAACGTTGATATGCTCATAGATCGTTTCCTGACGTCGAATTTTGTTCCGACGAAGCCGGCGGAAGCCTACCTCCCTTTGGAGGAGTTGAATCGTGATTTGAAGGATGCGACTGCGGAGTTTGAAATAGAGAAGATGCGGGCTGAGAGAATGAGGAATACCGGGGGGTTTTGGTGGGATGAGACGGAGATGGAATGTATGGGAATTGAGGAGTTGAAGCGATTCCGGTCGTCGTTGATGGAACTCAGGGGAAAAGTTGCGGAGAAAGTGGAGGAATTGGCGGCGGTGAATCAAGAGGTTCTAATCACTTCCCCGTCGTTTCATCATCACGCGACGACGATTGAGGATTTGGGGTTAGGGTTTCTCTAATTTTAGTGTTTAATTAAAAAGATAGAAAGATTTCAGATTAAGAGTGATTGATTTTAGATTAATTACTTCATTCTAAGTATGATTTTAAGAAATTAGTCGAACAAGAGTTTAGTTTTGTATACATAATCGATTATACCGAATATAGAAATTTATAAACTTTTATTACTCTTGTCACTTATACAAACATATATCGTTTATTATTTTTAGAATCTGAAATTTTGTTATATTTTGTAAGTTTGTCACTTTTGTCGATTCCTCTCAACTCAATTCGTTTATATTGGGTATGATTAAGATGGATTTAATTTCTATACATCGAGATTGTTTATAAGTTCATTTAAAATGTTCAAACCAACTTGTTTGTTCCGGTTAGACAACGAATTTAATATTAATTTTGAAATGTATGTTTTCTTATTTCCGATATAGAAGATTAAAAAGAACTTATGGTTTCCAATCTTTTATGAAATAAACAATTTAGTTCATAAACTACCATTTATAACGATTCAATCTCTATATTTTTAATTTTGTAACAATTTAGTCATTGAACTTTTATCGTATAACGATTTGATCTTTATATTTTGAAATTTGTAGCAAAAAATTAATCAAAATCATATGTTAAATACTCTTATGATATAGATTTAGTATGATATAAGAATATAGAATGTCTAATAGTTTATTGATTCATTTATGGAAAAAATCTAACTAAATATTTAACACAAATTTATACCTATGAACTAAATTATTACAAATGTTAAAGTATGTTTGTTTACTTTTTAAATGTAACGTAAGGATCAAGTGTGTATATATAAATGATTCGATCGTTCTCAATGAAAGTTTGACTTTCCCTCTCAAAATGAATCACAATTCACCAAACTCCAACTGAAATTGTTTGATGTTAAATCCATCGCAGCTCTCAATCCATTCAACTTCCTCTTCCATCTTCGATCTTCTTCATTTCGTTGACCTCCGCCATTTTCATTCCCCTTCAGTTCTTCCCAATGGCAAAATCACCTTTCCTACTACTCCCTGCAATTCTCCTCCATTTCTTTCTCTCCGCCGATCCCATCTCCCCCAATCCTCTCATTACTCCTTCGCATCGCGCCATGGTGTTGCCTCTTTACCTCTCTTCCTCTAATTCCTCCAAATTCATTTCCAATCCTCACCGCCATCTCCGCCAATTCCCCACTTCGGATAATCGCTCCAACGCTCGTATGCGCCTCTATGACGACCTCCTTCTAAATGGGTATGTTCCATTTCCTTCAAATTTTGGATTGTTATGATTTTTTTTTTTTTTTTTGATGAAATGTGGGTTTTTTGTTAAGGTATTATACCACTCGGCTTTGGATCGGAACTCCACCGCAGCAATTCGCGCTTATTGTTGATACGGGGAGTACGGTTACTTATGTTCCTTGTTCAACTTGCGAACAGTGTGGGAGACATCAGGTTAAAATGTTTAGAGATTAATGTTTTTCAGATAATTTATAAGATCTTCATATTCGTAGTCATATTCAATCCTCTGTTCTGTTTCCTTTAATTGACTTTTATAAATTTTGATTTGGAAATTGGTAAATGATCGATCTGTAAATGACTAAATTTGTTAGATGATATAATAATGAATTTACCCTCACACATCAATTTATGTTTTCACATCAATTGATGTTGTAAGACACTGGTTCAAGAGGTCTTGTGTTCAAACCTGCACAATTTCTTTTCTCATCAATTAAATATTAATTTCCACTTATTGGGCCTTTTGCATATTCCAAACTCACAAGTGAGATAGAGTGTTAGATTACAAATTGTTAAATTTAACTTCACCTATTAGCTTAAGCTTTTGGATCAATATATAATTCAAGACGAGTCTCCTGGATGGGCAAATTGTTTTCTAGGAACAAGAGATCTTGGAGAATGGTATCTGATCGTGGAGACCAGAAAATTGTCTCTCCTATTAAGGGAAATGTATTACTAAAAGGCGTTGGGTATTTAATGAATGTGATAGAATTGTAGTGTGGGTATTCTATATGGGTCTTGAAGTTGCCCATATTTAGTTTTATGGATAAAATTTCTCTAGTCATTTATTGAATTTTTATTTAAACATTACTAGTTTTTTTTCCATTGGTACCTTGCAATGTGCTGTAGTTGCTACTTAAACTTTTATTTCTATCAGGACCCGAAGTTTGATCCAGAATCGTCAAGCACTTACAAACCTATTAAATGCAATATTGATTGCACTTGTGACAGTGATGGAGTGCAGTGCGTCTATGAGAGGCAATATGCTGAAATGAGTACTAGTAGTGGTGTCCTTGGTGAGGATGTTATATCCTTTGGCAATCAGAGTGAACTCATACCACAGCGTGCTGTGTTTGGTTGTGAGAATATGGAAACTGGTGATCTTTTTAGTCAACGTGCTGATGGAATTATGGGTTTGGGTACTGGTGATCTTAGTCTTGTCGACCAACTAGTTGAAAAAGGTGCGATCAATGATTCTTTCTCATTGTGCTATGGTGGTATGGATATTGGTGGAGGTGCTATGGTTCTTGGTGGAATCTCTCCTCCATCGGATATGATTTTTACCTACTCAGACCCTGTCAGAAGGTGTGCACTAAAGTCGCTTTAACCTTAAAAAACGTGCTTAATGCTCTTTCATAACAATTACAATTGATACATCTCACACATTTACTTTAGTTTCGGGATGGCAACAGTCCATATTACAATGTTGATTTGAAGGAGATACATGTTGCGGGTAAGAAGTTGCCTCTGAGCTCAAGCATCTTTGATGGAAGATATGGTACTGTCCTGGATAGTGGTACGACTTATGCTTACCTACCAGCAGAAGCCTTCGGAGCTTTCAAGGATGCTGTAAGCTTCTATGTCTCTGAACTTAACATTCTGGAGTATCTTTGCTTACGTCTGAATTTGAAAATTGTTGCATGTTTTCTCAAGGACTTAGTAAGATGGTCTAAGACTTACTTTTTCAGGATTTTCTGTTGCAATATGGTAATTGTCTGTATTGTTTTTTTTCTTTGTTTAAACATGCTCTAGTTTCTCTACGTTTAATGTTTTGATATGGCTCCATTTACATTGTTTCCTCCATAACCTTGATGATTGGGACCATTTGATATATTTGCGGATGATTTCAACTCACTGTGATACAGTGGAACGCCAAGTTCTTGTCTGATCTGAAGACCAACTATACAATGAAATGGAGAAAGAAACAGAATGAAATGAAGAAAGTTTTGGTTTCTTATTACGAAAAGGAATGATCGATCTCCTGTAGTAGTTATATCCTGACCAGGCTTATAACTCGTGTCTCTTTTTTCTTGTTCCCTCTATTGCATTGCCTTGTATGTCTTCTTTGCCATATGATCAACTGTTATAGATTTCTTCTTTTGCAAGAGTCTTGGTCTCAAATGTGATCATTATTTGTTAACTATTTGGATCCCGTTTTTGACATTTTTGTTTTAGAATGGATAATTGATTAATTAATTATTATTTTCAAAAAATCCTTCAGATTATGGATGAGCTTCATTCTTTGAAGAAGATTGATGGTCCTGACCCAAATTTTAAGGATATATGTTTTTCTGGTGCTGGAAGGTGTGGTTAGCTAAAACATTGTCAGTTCTAAAGTGATTTACAACAATGAGTAATTAATTCGTTACTTCATGTTAGTGATGCTGCTGAATTATCAAACATATTTCCGACAGTTGACATGGTATTTGAAAATGGGCAAAAGTTGTCTCTAGCACCAGAAAATTACTTTTTCCGGGTAAGGACTTACTCTTGATTACTTTGAGTTTTGGATTTTGATATTACTTTGTGAATCCGTGTCTGTTTACATGGAATTATATGTGGGGTAGGAGTAATAATACTATATGCCTCCTTAACAAAAATGAGAGTCTCGGGTTGATTTTTAGTTAATTATCTATTTGTTTAATTTTAAGCCTCCTTTTATTATTATTATTATTATTATTATTTTTTCACTAGATATAATGGTTGTAAAAGTTTGTGGAATTACTAAGCATAGTAACTAGAAATTTAATGGCTTCTTCTTTACTGTGAATTTTCTGAATCATTAATTCAGCACTCGAAGGTGCACGGTGCATATTGTCTGGGAATTTTTGAGAATGGAAATGATCAAACCACTCTTCTAGGAGGTACGGTTTTTCATAGTTCATATGATTTTCCCGCAAGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTATTTAAAAACATATCACATTTTAGTATGACTGTTTTTTTGTTATAGGAATTGTTGTCCGCAACACTTTAGTGATGTATGACAGAGCACATTCAAAAATTGGATTTTGGAAAAC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MKKSSGRQKIEIKKLNVKSRRQVTFSKRRAGLFNKAAELSILSGAEIAILVFSSTGKIYTFGHPNVDMLIDRFLTSNFVPTKPAEAYLPLEELNRDLKDATAEFEIEKMRAERMRNTGGFWWDETEMECMGIEELKRFRSSLMELRGKVAEKVEELAAVNQEVLITSPSFHHHATTIEDLGSQSIQLPLPSSIFFISLTSAIFIPLQFFPMAKSPFLLLPAILLHFFLSADPISPNPLITPSHRAMVLPLYLSSSNSSKFISNPHRHLRQFPTSDNRSNARMRLYDDLLLNGYYTTRLWIGTPPQQFALIVDTGSTVTYVPCSTCEQCGRHQDPKFDPESSSTYKPIKCNIDCTCDSDGVQCVYERQYAEMSTSSGVLGEDVISFGNQSELIPQRAVFGCENMETGDLFSQRADGIMGLGTGDLSLVDQLVEKGAINDSFSLCYGGMDIGGGAMVLGGISPPSDMIFTYSDPFRDGNSPYYNVDLKEIHVAGKKLPLSSSIFDGRYGTVLDSGTTYAYLPAEAFGAFKDAVSFYVSELNILEYLCLRLNLKIVACFLKDLIMDELHSLKKIDGPDPNFKDICFSGAGSDAAELSNIFPTVDMVFENGQKLSLAPENYFFRHSKVHGAYCLGIFENGNDQTTLLGGIVVRNTLVMYDRAHSKIGFWKTNCSELWERLRTSDDNAHAPSISTKSHGSDMAPASAPIESPHYTIPGELQIGRITFEILLNKSYTDLEPHITELSDHIAQELNVSHSQVLLLNFTMRGNDSLIKLAIIPYGSSEIFSHATVNTIISKIVEHHMQLPPTFGSYQVVRWNVEPPMERSMWKRLYVLVGLAIIVIFILGLSALGAWFILRSRQQAINSYKPVNAAVPEQELQPLCSNLTQILLIHLLPSLSTPPSFSFSSSHHTGQDPLPTSTPPPPPPLTSFSLTPPSLASSRSPPAGECGSLVSSLSLSTRISFFLSFEISAAACGDSRHWVLRSCRSAFNRSAMGVSLLKVLLRHISSFLQLSSSDYINLQPTLKYYHKIEGALKLLRPILDAVVDSDIASDEELTQAFEELDHSVDELRVLFENWQPLSSKVLQSETLISKIGKFSLDIFQLLQSSNENLPEELSSKSLEHCVQKIKNIGKEEISSVIKDAIRNQVDGIAPSSDVLVKLADSLSLRSNQAILIEAVALEKLKESAEQAENTGEAEDIDQMIALVTRMHERLIMIKQSQSTSPVSIPPDFCCPLSLELMTDPVIVASGQTYERVFIKNWIDQGLNVCPKTRQTLVHTNLIPNYTVKALIANWCDTNNVKLSDPSKSVNLNQLSPLLVGSFEPDTHREPLFPHSPGYQPMSPQSTRSAGSGKNLNSLGGTHRDGSSSLLSHSLSEDSLSNDAGDERGIEVSRLLLSSSEEQMTKLEENGCDPVAKPSTSPSGTNVPNTCGEDEPSHGHNRSSSTSSGVSNANHSRGTSGEANEATHLSTNLTGYGSDAAGESKSEPLAVAASSTNYREPEREHPPRLADHPRPRGNTMWLRPSERFASRIITSSANETRPDLSAIEAQVQKVVEELKSSSLDTLRGATAELRLLAKHNMDNRIVIAQCGAIDYLVGLLLSEDSKIQENAVTALLNLSINDNNKSAIAQANAIEPLIHVLKTGSPEAKENSAATLFSLSVIEENKVKIGRSGAIGPLVELLGNGTPRGKKDAATALFNLSIFHENKARIVQAGAVRHLVELMDPAAGMVDKAVAVLANLATIPEGRSAIGQEGGIPVLVEVVELGSARGKENAAAALLQLCTTSNRHCSMVLQEGAVPPLVALSQSGTARAKEKAQALLSHFRSQRHGNSGRGLYRMRLEP Homology
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. NCBI nr
Match: TYJ99494.1 (aspartic proteinase CDR1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1838 bits (4762), Expect = 0.0 Identity = 941/988 (95.24%), Postives = 945/988 (95.65%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. NCBI nr
Match: KAF2295464.1 (hypothetical protein GH714_032984 [Hevea brasiliensis]) HSP 1 Score: 1584 bits (4102), Expect = 0.0 Identity = 918/1598 (57.45%), Postives = 1060/1598 (66.33%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_008457779.1 (PREDICTED: U-box domain-containing protein 4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1581 bits (4094), Expect = 0.0 Identity = 838/841 (99.64%), Postives = 838/841 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. NCBI nr
Match: KAA0045785.1 (U-box domain-containing protein 4 [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ99495.1 U-box domain-containing protein 4 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1544 bits (3998), Expect = 0.0 Identity = 819/822 (99.64%), Postives = 819/822 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_004149702.1 (U-box domain-containing protein 4 [Cucumis sativus] >XP_031736746.1 U-box domain-containing protein 4 [Cucumis sativus] >KGN61966.1 hypothetical protein Csa_006267 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1542 bits (3993), Expect = 0.0 Identity = 818/841 (97.27%), Postives = 824/841 (97.98%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22193 (U-box domain-containing protein 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB4 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 866.7 bits (2238), Expect = 4.7e-250 Identity = 516/841 (61.36%), Postives = 614/841 (73.01%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5XEZ8 (U-box domain-containing protein 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 641.3 bits (1653), Expect = 3.2e-182 Identity = 402/844 (47.63%), Postives = 515/844 (61.02%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GWV5 (U-box domain-containing protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 493.8 bits (1270), Expect = 8.3e-138 Identity = 342/840 (40.71%), Postives = 478/840 (56.90%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5VRH9 (U-box domain-containing protein 12 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PUB12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 271.9 bits (694), Expect = 5.2e-71 Identity = 217/675 (32.15%), Postives = 301/675 (44.59%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SNC6 (U-box domain-containing protein 13 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PUB13 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 268.9 bits (686), Expect = 4.4e-70 Identity = 244/823 (29.65%), Postives = 353/823 (42.89%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BKF4 (Aspartic proteinase CDR1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold123G00600 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1838 bits (4762), Expect = 0.0 Identity = 941/988 (95.24%), Postives = 945/988 (95.65%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A6L3E3 (RING-type E3 ubiquitin transferase OS=Hevea brasiliensis OX=3981 GN=GH714_032984 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1584 bits (4102), Expect = 0.0 Identity = 918/1598 (57.45%), Postives = 1060/1598 (66.33%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C6Y9 (RING-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497388 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1581 bits (4094), Expect = 0.0 Identity = 838/841 (99.64%), Postives = 838/841 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TWL8 (RING-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold123G00610 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1544 bits (3998), Expect = 0.0 Identity = 819/822 (99.64%), Postives = 819/822 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LPT2 (RING-type E3 ubiquitin transferase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G277080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1542 bits (3993), Expect = 0.0 Identity = 818/841 (97.27%), Postives = 824/841 (97.98%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G23140.1 (RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain ) HSP 1 Score: 866.7 bits (2238), Expect = 3.4e-251 Identity = 516/841 (61.36%), Postives = 614/841 (73.01%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT2G23140.2 (RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain ) HSP 1 Score: 866.7 bits (2238), Expect = 3.4e-251 Identity = 516/841 (61.36%), Postives = 614/841 (73.01%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT3G50050.1 (Eukaryotic aspartyl protease family protein ) HSP 1 Score: 701.8 bits (1810), Expect = 1.4e-201 Identity = 365/641 (56.94%), Postives = 457/641 (71.29%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT5G43100.1 (Eukaryotic aspartyl protease family protein ) HSP 1 Score: 685.3 bits (1767), Expect = 1.4e-196 Identity = 359/662 (54.23%), Postives = 454/662 (68.58%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C020869.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT5G67340.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 641.3 bits (1653), Expect = 2.3e-183 Identity = 402/844 (47.63%), Postives = 515/844 (61.02%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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