MELO3C002986 (gene) Melon (DHL92) v4
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCCTACACAACCCAAAAGCCCTAGTACATGGCGGCAATTTCTACTTCACTTCTTTCTTCTTTCCCTTCCATTCGGACCGTTGTGCACAGTAAACTCATCCTGCTCTAACCCAGTGATCCATTGAGAACTTGAGAAGAGGACGTCTTATTTCCTCACCCACATCCTTCTCTCTACCATAATGCTTCCATATAAACATGGCGGCCTCGAAGCCAGTTTTCCCATGACGAATCACACACGCTGTTGATTTTCGAACCACATTCCAGTGAATGGGCTGGAGAAGGGCTGCTTCAGTTTTTCTCAGCCGCATATCGTTAGCTTCTAAATCTCCCATCCCAATTCCTTTCGCCAATTCAAGACCTTCCTATTCCTTTCATTCTCCAAACCCCGTGTTTCGTTTTCGATGTTTGAGGTCTTTTTCTGCTGTTGCATCTCCGATTTCTTTTGTTGCTAATCAATTTGAATCCGAGGTTGATCATTCCTACGATTTCGAGCCGGAAGATGATGACGAAATTGGGAAAATTCCCATCAAAGCTTACTTCCTTTGCACCAGGTTTGTCACTGTATTGACCTTTGGATTGATGTATTTCTCGTAGATTATCTTGTTTAATCTACTTCATTTGTCTCCACTTGTATATTAGACTATTAGGTGTTGGAACTTGTTAAAATTAGACGCCATTTCTTCATTCATAGACAAGTTGGTATTGAAGTAAACCGAAGCTGATTTTTTTTTTTTTGAATTTTTTTTTTGGCTGCCTAGTTGATGCATGCTTCTCTATTCTTTCTTTTTTCCTGGTCATTTGTGGGTTTCCTTTCTCAGATTCGTGATTTTGGCAGTATAAATTTGAAGAATATGCAATCTGAGAATCTAAGCAATGTTGTCCCTCCTACCTCCCGCGCGTCAAATTATATCGCTCTGAGATACACTGATTTCCCTCGAGAAACCTCCGTAAGCAGTTGAAACATATGTATATTCTTTATGCTTAAATATCATGCTTTGTTCAAGTTACTCTTTTTGTTATTATTACTTTTTTGATACAAAACGGATGATTATTCATTCAAAAAAAGGGGAGCCGAACAACCTAACGGGCCAAGGGGCAAGAAGCCTTCAAATGTAAATTAATGTGGAAGGTGGAGCAAATACAAAAAAACTTGTGTTGGCAACCCCACCTAGAAGTCGTGAACTGGAAAAAGTTACAAGTAATAAAAAGAATTGTACTTATCTAAGCTAATTCTAGCATTTATTTCCTTACAAGCTTCCAAATAAGCTACAAAAAGCCTTCGTTGTATTCGACCACAACACTCCTATCTCTTCCAATTTCCAATCGCTCAAAGAGTTCACCTTCCACCTAGAGCCAAAGGTTAACATCACTGCAAACCAAATAAGTTACCAGAATAGTTCCACACTCTCTAGCTGAAGCTACAACGAAGCAAAAGGGAGAGTGTTTGCTCACTCCCTTTATTGAGGACACACAAATTGGGGGAGATGTTTTGGTGGGGATAATGCATATCTTCGTTGCACCTTGTTATGAGTATTAATACTGCAGAGAACACACATACTACAAGGCTAATTCAGAGGCTTGTCAGATTGGATTATAAGATTTGTAGTTTGGCCAACTCAGGTGGTGGATTCTTTATTCACATGCCTTTGGGGTTTTCGAAGAAGGGTGGTCACTCTTTCTTAGGAATGCTAAAGAGCTTTAAGGAGAAAAGAGTCTTTTGTTTGTCAAACTAGGCAGACACTGATTTTTAAGCCTCAATATCTAAGCAAGGCTATTCCATCGTCTTTCATTCTGAAAGACCAGAGATAGTGCAGGTAAAGAGCGATTGTCGTGATTGTCATTCCTCTATTCTTCATACAAGAAAACAGAGCATGACTTATGAAGGAATAAAAAGATAGGCACACTCCTCTATTTTAGGTATGGGAAAACAGAGCAAGAATTCATTTTGGGTTAAAAAAGAATGATGAAGTTTTTGTGGAAAATTTCAATAATCTCTGGATTATTTCAAGGCTGTTTACGTTTAGAGACTCCGACTAGAAGAAGATAACAAAATTGTTGGAAGATTTTTCAAATTCAAGTATTTATCAATCCTCCGTTTGCAGGCTATACACTGATTAAAATTGATCAGGGTGATTTTTGATTGAGTCCCTATGTAAATGATATGTTTTTGGTCCCTTTCACTTGTTCGAAAAATGGGACAAATTTCTTCACAGTTGCCCTTGCAATACCATTGGGATAGTTTGGTACATTCAAATTAATCCTAGTTAATCCTTGATTAATTACATCTTAGTTACCCTAACTTACAAGAAGCTTACATTTTAGTTACCCCTTTAGGTTTTAGTTTCCCTTTAGTTATCCTTTTAAGGATTCTTTTAATTTTCTATAAATAGTGAGTCCCTTCTTGTATTAGACAACTTTTGATAATAATAAAGATTTTGATTTGGTTCTTGGTGAAAGTTTCTTTTATCTCTTGAGGCTACATACATCACATAAGGAGTGAAAATAATTGAACACAAGGCAAACTAATAAGTAATAACACAAGTCAAAGCAACCAAAGTCTTGGAAATGATGGTAAAAAGATCAATGTACAAGAATCATCATTAACTGGCCTATGTTAGACCACCAGTCCTTCAGACGTATAAAAGGAGGGGCAAGAAAGGAAATCCACATAATAATACTATGAGAGAGATCATTGGAGAGGAAAGAAATACCTGAGGGTCCCACTAGATTGTTGGTTTAAATAGGGAATGTGTTGGGATTGATCATTGAGCTTTTATTTTGGTAAAAAGCTGCTGTAAGCTTCTCGGGGAGAGGATTCTAGCCTTCTCGAAGGAGCTGGTTTGTTGCTTTTTTGTTATGTATTTTGCTTTCCATTTATGTTCATCTTTAGACTCTATTTTGGCTTGTAGAAACCTGGTTGATATTGCAATATGTTTAAGTAGAGTGCTGTCTCTGTTTTACTATTGTTGTGATCTTTCTGAGTTTCAGGTTGAAGAGTCTTAACACCCTAGTGGTAAAAAAGAAGACAAAGTCTCAATAAATGGCTAAGAGGTTATGGGTTCAATCCATGGTGACTACCTACCTAACAATTAATTTCCTACAAGTTTCCCTTGCACCCAAATGTTGTAGAGTCAGGTCGGTTGTCTTGTGAGATTAATCGAGATGCTCGTAAGTCAGTCCGAACGCTTACGGATATCACAAAAAAAAAAAAAATGATCAATGGGAAAGCATAGCAAAACCAAACCACATTCCACTCCACTCCTAGCTAAGATACATTAAAGAAATCTCATGATGAAGTCATATGCATGCATCACATTATGTGACACGATACTTCTATGCCATATAAACGAGTTCTTTTTCCTTTTAAGAATGCATTTACGTGTGTACCATTAGTTGCACTAATATAATTCTGCACTATAATCAAACTGTTAAACTTTTGTAATTAGCCAGGAATAAGCAAGTGCAAGCCAATGCAAACTAGTCCCTGCCACTAACTCAACTGTAATACGTGAACATAAGATTCCTCATGCAGTCCTTCTCAATAGATTAGAGGCGACATGCATGTGCATGTTTATAGATTCAAGCAATCCATGCTTAAGAAAAAAGTGTTTGATAGCGTACTGATCTTATTTTTCTTTAATTACACTCCTCATTTTTTTGTTGGTAATCTTTTACTTATGTTTTAGGGTGTTAGAGTTAAAGGAGGGAACACAAATTGCTACAGATACATGGTTGTATTTCAATATGGCTCTGCTGTTCTGTTTAACATTGAAGATCATGAAGTTGAAAGTTTTCTAGATTTGGTCAGAAGACATGCTTCTGGTTTGCTTCCAGAAACAAAGAAGGATGGTAATTTCTTTCTGCATATTCAGATTATTTATTCTGTTTTTCTGTGACCTTGCAAATCAAGCTCCTCCCTTTAAGCAGTGGTAATAAAGCATCTGATCACTCTTACAAGAGTATATCTACCATGAATTAGATCATTTAAAAAATGCTGAGTAAACAAAAATATGTATAGTACCGGCATGCATATGCATATGATGTTTATACGCAATTGTTTATTTCTGTCCCTGTGGCCTTGGGGACATCCGATAAATTTGAAATAATTTATTTTTTCTTCAATGAAAGCTTACTTTCTTAAAAAGAGTCGAGATGTAATTGGTAAGGGACCATCTTTCTCACTGTCTACTCATTTTTTACCCTGTTATGGATACGATGAGGTAAATGAAAGGTAAACATGGTTATGTGGGTACTTAACAATTGCCGGCAAAGTTTTCAACTAGGAAGCACTCACACACGATACGGATATGGCACCGACACGACGTCACACCAATTTCTAGAAAAGTAGGACACGACATGGTAGAGATATGTTATTTTAAAAATAAATGTATGTTGTGCATGTAAACATGTTTTTGATAGAACACCAAGTAGTTGTGTTCTAATTTGATTGAAAATACTTCAAAGATTACGAGGTAGAATTGATGTATTATCAATTCTGAATTGAAAAGTACAAGAAACTATGAACCAAAAGTAAAATATTACCCTCTCTGCCTATCCTCTCTCTCACAAACTGAACCAAAAGGAAGAGTGCAGAAAACTACCCACAAACTGATTCCCCCCTTATTATTTTCTCCCAATTCTTCTATTAATGAAGTTAGGACTTAGGTGTATTTTTATTCGTTTTAATATTATTTATTATTTTGACATTTTTTTAAAATAAAAGACATATAAACATTTTATCAAGAATAATTGCCTCGATTAATCGGGGCTTGCCACCATTTGAGGCTATGGTGCAAAAGATTAAAGATGGCGCAATATGGCAAGTGTCTTATTAGAGCCACTCACCTTCTATATGTTAAAGGCGTTGAGTACTCACCTCTCCTTGCCTCTTGTCATAGGTGAGCTCTTGGGCTTGCCTTAACAACACTGTTTGCTGGTTTTGTTTTTGAATTTTGCATCAACTTGCTACGGATTAATAGTAGTACACATTTTTAT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Match: XP_038890045.1 (uncharacterized protein LOC120079752 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 679.9 bits (1753), Expect = 1.3e-191 Identity = 340/371 (91.64%), Postives = 355/371 (95.69%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. NCBI nr
Match: XP_016903477.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503365 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 645.6 bits (1664), Expect = 2.6e-181 Identity = 325/325 (100.00%), Postives = 325/325 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. NCBI nr
Match: KAG6585856.1 (hypothetical protein SDJN03_18589, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7020763.1 RMD1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 639.4 bits (1648), Expect = 1.9e-179 Identity = 326/371 (87.87%), Postives = 340/371 (91.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C565 (Protein RETARDED ROOT GROWTH, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RRG PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 457.2 bits (1175), Expect = 1.7e-127 Identity = 240/374 (64.17%), Postives = 296/374 (79.14%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FNB2 (Protein RETARDED ROOT GROWTH-LIKE OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RRL PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 339.3 bits (869), Expect = 5.3e-92 Identity = 187/365 (51.23%), Postives = 249/365 (68.22%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPM6 (uncharacterized protein LOC103503365 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503365 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 735.7 bits (1898), Expect = 9.4e-209 Identity = 371/371 (100.00%), Postives = 371/371 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5I0 (uncharacterized protein LOC103503365 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503365 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 645.6 bits (1664), Expect = 1.3e-181 Identity = 325/325 (100.00%), Postives = 325/325 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GGP5 (uncharacterized protein LOC111454067 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454067 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 636.7 bits (1641), Expect = 5.9e-179 Identity = 324/371 (87.33%), Postives = 340/371 (91.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IAZ1 (uncharacterized protein LOC111471847 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471847 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 630.6 bits (1625), Expect = 4.3e-177 Identity = 322/371 (86.79%), Postives = 338/371 (91.11%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWC6 (uncharacterized protein LOC111024098 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024098 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 622.5 bits (1604), Expect = 1.2e-174 Identity = 324/375 (86.40%), Postives = 342/375 (91.20%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. TAIR 10
Match: AT1G69380.1 (Protein of unknown function (DUF155) ) HSP 1 Score: 457.2 bits (1175), Expect = 1.2e-128 Identity = 240/374 (64.17%), Postives = 296/374 (79.14%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C002986 vs. TAIR 10
Match: AT5G13610.1 (Protein of unknown function (DUF155) ) HSP 1 Score: 339.3 bits (869), Expect = 3.8e-93 Identity = 187/365 (51.23%), Postives = 249/365 (68.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (DHL92) v4
Date Performed: 2022-08-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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