MELO.jh033058.1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonstart_codonCDSpolypeptidestop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TGGATCAAATTCGGATATTCATTTGGTGCTTTTTGATGAAGAAAACAGGGCAGTTGGTTTTCACTCGAAATCAGAAGGTCTCTGGTGTTTCTTGTATTTCAGAGTGTATCAGTGGAGTTAGAATCTCTATTTGGTATGGTTGGAAAGCTTATTCAATTTACTACAACTTTCATGAAGAAATTGTAAACCAAAAACGACTAAAAATCAGTTAAATTGTAGGGACAAGTTAAAGAGGTCGTGTGCGCGCGATTCTGGAAGTGGTTCTGTTTTGAGGGTTATATGTGTTTATGCACGGGGAATCAGATTTATATGTCTTCAGGTAAGTTTTATAGGATCTCAAAATGAAGATTTTGATATAAAGAACACTCATTTTGGTTAAGTATTGAGAAAGTTATAGTCCTTTGAAGTTTATGTTAGAAATCTAGAAATTTTAGAGAATTATTGAAATAGGATTTTATTTCTTAAGCTTTGTTTTCGTGAGCGTCATCTTTGGTGCGACATGTTATGTATATCTTTAGGAAACTAGAATGTTTAGAGTTTTAATACTCGGTTGGGTTGTTGGCAGGCCGAGAAGAATTAAACCGAGCTTATAGACCAAGGATCTAGCCCAAGACTGTGAGTGACAAAACCAACTTTGAAATATTTTCCATAATTGTTATTATGATTGAATGCGATAAATGTTTATTTACGAAGCCATGAAAAGTATTTGAATTTCATGACTATTTTCAAGTATACATTTGGAGACTAGATTTCTTAAAGAAATTTATGCTAGCACGTAGATATTAAATGTTTGGAAAGTATTTAAACCACAATATTTTAAGCAAAGCATGAATTAGTATGAAGTTTTGTTTTAAGAACTACAATTTTCCACGAAAGAGCTGAGTAAAGTTCGAGCTTTGTGTAAAATTTATAAGCAGGCATGTTTTAATATTTAAAGATGATTTATGAAATTTTCATTAACTACATGACTGAGATCTTGAGCCTGAGGCTAGAGATTACCGTGTGCACACTGGTTAGATTCCGTTGTTGACGTTGAGTGTACTCCGTAACAACGATGCTGTCGTGAGTGCTGGGCGGGCCCCACTACGACAAAGATGATGGGAGTGTTGGGCGGGCCCCACTACATCGTAGTGCTTGTAAATGTTGTTGTACTAGGTGTACCCTACACAACGTAGATTCGTCATGTTAGTTAAAATGCTTCGATATACTTGATATGCCTTGCTAGATTTCAATGATGAACATGCTGAGTATTTAAGGAAGCTATTTTTACTACTACACATTTACATTTGCGACTTGTATAAACAGATTTATATGTGTAAAGTTTTCACGTGCTCTTATCTTTAAATTCATAGTTTTAAACTGAGTCACTCACTGAGCTTCATAACTCATCCTTTCCAAAATGTTTTACCCATTTTCCAGGCAGAGATCGACTTCCCGGTGCCTGATAGACTGCCTTAGTCTAAGGAAGCTTCATTATCGATTGCCAATACGTGTTTTGAGTTGGGCATAGAGTCTGTTGTGTTGTGGTGTATATACACCCTTGTATGTTATAGATACTCCACAGTTTGTATAAGCTTTAGGAGCTGTAGTTGTGTAAATTTTGTTGCTTATATTTTGATTAAGGTGTCTTTAGGTTTACTCGTGAAATTGGTAAATTTTGAGGTACACTTCATGTATGTGTTTGACTAGCTGTGTTTGACTAGCCTAGGATCCGCTGTGTTTTGTGGCATGTACAATAGTTTATATACTAGATTGGCAATTTCATCACATGAAAGTTTTAAGCAGAGTCGACAGATACAGGTACAGAAAAGCGTTGTTCGTCGGCTTCACGCCATCTTTCGGTCTAAGGTAGCAGGTAGTCCGGGAGGGGGTGTGACACTTTCGGTGGCAGAAATTGAGACTATTAAGTTGGTGAGGCAAAAAGGAAGGGGGAGGACATTAAAAGAGTAAAACGAATTAAGCAAAAAAGAAAAAAAAACAACAAACAAAAAGAAAACAAAAAGAGTCCATAAAGAGTTTAACTTTATGTAGATATTATCACATTTCTTAAAAAAATAAACTATTGTCGAAGTAAATTTGTTCGTGGTAGGGAAAGAGTGATTTTGTGCAGGAAGTTTTGAAATTTAACAAGCAAAGATTTTCTATATTTTGTGTTTCATGTCTTGTGTTTTTTTTCCTTGACATATTGATTCTTATTATTATGACAATATGGTAAACAAATTTTAAGATTAACAACGAAGTATTTGTAAATTCCTTTTTATTGTTAAAAATGTTTTTATTATCATGGGTAGCACGTAACCACGTTAATGTACTATATCAAATTTATCTTTCTTTTCTATGCTCAAACATCGTAAAATAAATTGAGAGTGAAATGCTATTACACCCATCCTATATGTAATCTATTGAAATTCTATCGATGCTCCCGGAACAAAAGATCTCGAAACTTGCCAGTCCTTGGCTTCTTAAATTTTAGGAAATGTGCACAATTCGTTCATTCTTTCATAAACTGTTACGTTGCAAAACCCTTTTGAAATATTTAATCCCACAACTAGTATTTTTAGTTCATACACTCTAGTTTGGATCGCTGTGGTCTTCTATTTTATTATATTCATCACCTTTTTCATTGAATCATATATATGAAGTAACAGTTTTATCTGAAATTAAGGTAGCGATTGTTAAACAAATTTATATTGTCCAGACGACGAAAATTTTCACATTTTTTAAGAAACTTCTCGAGTTACATGTTTACCGATCAAAGTACAAGAGGTAGCAAATCGCCCTTCATGATTTTTGTATAACGAAATTCGAGTTTAGTATATCCTCAAATATTTAAAGCTACGTGGGTTCAATCGTTACATGTATTGACCCTCGAGTTTTGCGACACAGGTTTAATCGTATCAACAGTTGTAACGATCAATATATGAAGAAATTCGAGTTTGGTATCCTTTCATATTTAAATCTACATCGATTCAATTGTTAGAAATGTTGACCCTCAAGGTTTTCAATTGACGATAAAAAAGAAGTACCAAAACACCTAATTCTTTTCTTGGGAATGGTCGAACATGGGTGCTTAAACGTAGAGGATAGAGTTCGACGATAGACCCAAATTAACGTTTCAATTATGTGATGATTTAATTTGTTCGGGGTGTTCAATCATGTGGACAGCACGATAAAAAAAAAGAATTATAGAAAATATTGCCTACTTTTGAATACAAAAGAGGGAGAGTGCGAGCGAAGGAGCGAACTTATATACTTTTTTATGTCATTTCATTATAGTTGTCTGAGATGGAATTTAAATACTTGGAAACAACTGCATGAAAAAGATCTAACGTCAAAATATTTCATTACACAATGCTTGGCTCCTTATCTCCGTAGTTATAGCATATATCTTTGCCAGGGTTTTTCGGGTCTTGCAAGCACATGCTATATTCATGAATGATCCATCTACATGTGGTGCATTTCCCCGCATCCCTTTTGTCGTCAAAGATATTGAACCAGTAAATTTGGTGTTGTCCAGTCCATGTGAAGCTGCAGAAAAACAATGTCGTCCCCACGAGGTTGGGTCTGAACTTGAACGAGTATCCTTGTCCAAGCGGAAGGACATGGACTCCTAGGTCATCGTTCTTGGATTTGCAATGAACGGTGACAGGAATGCCATATTCAATTTGGTTGACGATTACGACTGTAGTTACTGGTTGGATGAAGATGGATCCTTGAATTGCACGTAGGTTACATAAAAAGAAAATTAGGAAAGATAGTGCAAGTGTTGGAGATGAGCCCATTTTTAGGGGGTTAGTTGAAACACAAAGGAAGAGACAAGAATGTGAGGGCTTTACACCTTTTGTCTTGTATTGGTATGATTCGGACGTGATAGAAATAGTGGATATATATACATAGGGTCTGTGCAAAGAAAAAAGTTGTTTTCTCGTGTGTTGGTAAAGAATGGTGAAACTATAATTCTTACTGTCGACGTTATTGTTTAAACGTTTGTGCAAAATAAGAAAGGAGTAAAGTTACCTTTCGGTGGTAGAAATTGAGACTATTCAGTTGGTGAGGCAAAAAGCAAGGGGGAGGACATTAAAAGAGTAAAACGAATTAAGCAAAGAAGAAAAAAAAAACACAACAAACAAAAAGAGAACAAAAAGAGTCCATAAAGAGTTTAACTTTATGTAGATATTATCACATTTCTTAAAAAAATAAACTATTGTCGAAGTAAATTTGTTCGTGGTAGGGAAAGAGTGATTTTGTGTAGGAAGTTTTGAAATTTAACAAGCAAAGATTTTCTATATTTTGTGTTTCATGTCTTGTGTTTTTTTTCCTTGACATATTGATTCTTATTATTATGACAATATGGTAAACAAATTTTAAGATTAACAACGAAGTATTTGTAAATTCCGTCTTATTGTTAAAAATGTTTTTATTATCATGGGTAGCACGTAACCACGTTATTGTACTATATCAAATTTATCTTTCTTTTCTATTCTCAAACATCGTAAAATAAATTGAGTGTGAAATGCTATTACACCTATCCTATATGAAATCTATTGAAATTCTATCGATGCTCCCGGAACAAAAGATCTCGAAACTTGCCAATCCTTGGCTTCTTAAATTTTAGGAAATGTGCACAATTCGTTCATTCTTTCATAAACTGTTACGTTGCAAAACCCTTTTGAAATATTTAATCCCACAACTAGTATTTTTAGTTCATACACTCTAGTTTGGATCGCTGTGGTTTTCTATTTTATTATATTCATCACCTTTTTCATTGAATCATATATATGAAGTAACAGTTTTATCTGAAATTAAGGTAGAGATTGTTAAACAACTTTATATTATCCAGACGACGAAAATTTTAACATTTTTTAAGAAACTTCTCGAGTTACATGTTTACCGATCAAAGTACAAGAGGTAGCAAATCGTCCTTCATGATTTTTGTATAACAAAATTCGAGTTTGGTATATCCTCAAATATTTAAAGATACGTGGGTTCAATCG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BLAST of MELO.jh033058.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0056684.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 1.62e-10 Identity = 30/33 (90.91%), Postives = 31/33 (93.94%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh033058.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0042134.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 2.21e-10 Identity = 30/33 (90.91%), Postives = 31/33 (93.94%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh033058.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0032946.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold269G00200 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 2.33e-09 Identity = 28/31 (90.32%), Postives = 30/31 (96.77%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh033058.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0043123.1 (transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 4.48e-08 Identity = 26/33 (78.79%), Postives = 29/33 (87.88%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh033058.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0035073.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold57G001380 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 5.47e-07 Identity = 25/28 (89.29%), Postives = 26/28 (92.86%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh033058.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UNA3 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold73G00100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 7.85e-11 Identity = 30/33 (90.91%), Postives = 31/33 (93.94%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh033058.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TFC5 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold67G006220 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 65.1 bits (157), Expect = 1.07e-10 Identity = 30/33 (90.91%), Postives = 31/33 (93.94%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh033058.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SSI1 (Reverse transcriptase domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold269G00200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 62.0 bits (149), Expect = 1.13e-09 Identity = 28/31 (90.32%), Postives = 30/31 (96.77%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh033058.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TIE3 (Transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold332G00080 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 58.5 bits (140), Expect = 2.17e-08 Identity = 26/33 (78.79%), Postives = 29/33 (87.88%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh033058.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SX02 (CCHC-type domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold57G001380 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 2.65e-07 Identity = 25/28 (89.29%), Postives = 26/28 (92.86%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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