MELO.jh031435.1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41

Overview


Name	MELO.jh031435.1
Type	gene
Organism	Cucumis melo var. reticulatus cv. Harukei-3 (Melon (Harukei-3) v1.41)
Description	Nodulin homeobox isoform X2
Location	chr07: 19222254 .. 19250789 (-)
RNA-Seq Expression	MELO.jh031435.1
Synteny	MELO.jh031435.1

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonpolypeptideCDSstart_codonstop_codon

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CGCGCCGCCTCCACCGACGAACGAACCCGAACCCGGAACCGCCCGCGCAACTGGAACCGCCCGCGCGAACTGGAACCGCCCGCGCGCCCGAACCCGAACCGAACCCGCGCCCGTGCCACACGTGCCGACTCTCCGCGTGCAAGCGCGCGCGCGTGTGTTCCGCGTAGCCGAGCCGCGTCCCTCCCCGTAGCAAGCCGAGCCGCACGCGAAGTCCCCATACCGAGCCGAGCCGCGTCCGCACCAAGCCGAGCCGGTCCTGCCTTCTTCCAGCCGAGCCGCCAAGCCTGTTTTGGCTCCTTCCACCTAAATTTTTGGTAATTTCCAAATTCCCTAGCCTGCCCAGTAATTAAATGAGTTAATTTGGAAATTTAATTAATTTAATTACTTTCCTCAAGAAGCAAATTGGACCAAATAGCTGCTGCAGCTTAGGACTTCCTCAGTAGGAACTCATCTAGCAACATCTCGAGGTAAGAGATTCCTACTACTAGCCCCATGTGAGAATTTGATGTTGCATGTTCCTTCAGTGACATACGATGATGGTTGGGCTTACGATGTATGATAATATTTTATCATGATCTGACGAATGACATGGCCATACTTTGGCATAATATTATAGTAATGAGAACCCTCGAACCATATGTGACTGTATGAAAAGACTGATGGACTTATGATGTATGTGACTGTATGATAAGACTGATGGACTTATGATGTATGTGACTGTATGATAAGACTGATGGACTTATGATGTATGTGACTGTATGATAAGACTGATGGACTTATGACGTAGGTGACTGTATAACGAGGACTATTAGTGACTGTTTGATGATAGTTGTAGTGGGGGATGAGATGGTGGTTATTTTCTGATGATAATTTGATGACGTATGCATGTGTATGTTGGGATTGGGGTATCTGTTAACTTCTCCTATCTGAGTCGTACCTGCATGGGTGTCCTTCGGGATCACCACCTATTTAGGACTGTTAGGCTCGACGGGGCGCCAGTCCAGCATGACTATAGATATGACTCGAGCGACTCGACGGGGTCCTCGCATCCCGACGGTCCTAAGTGTCCCCTGGACACCGAAGACCAGAGTTAAGTCCCCACGGGGCGCATGTTGCACGTGTTCGGGAGCGTGCCAGAGATTGGGTACTAGTTTCAGGACTCGATAGGAATGTTAACAGGCACCTAGTGGGACTAGTAGTGGGTCCCTTACTGAGTATTTTTATACTCATTCTCTTCGTTTTATGTTTTCAGGTAGAGGACGAGGCAAGGGCAAGGGCAAGCTGGCGAGCGACGTGAAGTGACCGTGGCGAGCCATAGGGGTTTTCCTGCTTCCGCACATGTTTTACCTTACAGTTAAATTCATGTTTCGGCTTTCTGCATGTTTACTTTGGTTATTTTTGTAGATAGGGCCCGCTTAGGGATTTTAAACTTAACTCGTATTTCCACATGTTACTTTAACTATCTTTCATAAATAAATTTGCTAGATTTCCTTGCATTTATTTACACCAGATTTTATGACTTAAACACTGATCCTAGATTTAGTAACCACTTCGATTCAGCATAAAGAGTCGGGTCGTTACAGCAACATCCGTTGACTTACCCAAGGAGAAGAAAGCTATCTCCAACCAAGCCTGCCGCAGAACCCGAGAACTTAAACGTCAATTCCTTAATACCTTCAAGGGATGAAAGATAGGACCAAAGCTTATTCCAATATTCAAACTCGCATCGGATGCAGCAACATCAGGGAATTCATCAAAACAATCTTTATCGAAAACTCACCGTGACCAGGAGTGGAGGAAGGAAGGCTTAGGTGGCTCGGCTCGGCTTGGCTCACTCTCGGCTCGGCTCGGCTTGGCCTCGGCTCACAGCTCGGCTCAACTCGGCTCGGCTCGGCTTGGCCTCGGCTAGCTCAACTCTCGGCTCGGCTCGGCTCGTGTGGCTCGGCTCCTTCGGCTTGACTGGCTCGCGGCTCGACTCGCGGCTCGTCAAGTCAACTTACGGCTCGGCTCGGCTTGTGGTTCGCGGCTCTACTGGATCTGCTTGGCTCGAGGCTCTACTGGATTTGCTTGTGGCTCGGGTCGGGTCATCTTAGAACCGGGGCGACCACGAACATCAGCCTCCGGCGTTCGACGACGGAAAAGCTTCGCTTCAACGCGACGGAGAGCGACTGGGCGTCGGCGGAAGGTGGGGCGCACGCCGGTGGCTGGCGTCGTGAGTCCGAGAGGAGATCAGAAATCAGAAATAGAGGGAGGCCGCGGCGGACGAACGTCGAAGCTGGAAAGCTTCGACGACGTGGACAGAGACGGAGACGTGCGCGACGGAAGGAAAAGAAGAGAAAAGCGGGCGGCGGCGTGCACGGAGAAGAGATGGTGAACGGCGGCGCTGAACGGAAAGGAGAGAGAGACGTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTGCTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTCTCTCTCTCCTCGCTCATCGCTATCGCTCGCTCCATCGCCTCGCTATTACTACTACTATCGCTCGCTCGCTATCGCTCGCTCTCTGCCTCTCGCTACCATCGCACCTGCCTCCTGCATCACACTACTGCTACTCTCTCTCTCCACGTTACCATCGCTACTCATCGCTACTACTCCTGCTACTACTACTACTACTCCTACTCCTGCTCCTACTACTACTCCTGCTACTCCTCCTGCTACTCCTCCTGCTACTCCTCCTCCTGCTACTACTACTACTACTACTCCTACTGCTACTACTACTCCTACTGCTACTCCTACTGCTACTCCTACTGCTACTCCTACTGCTACTCCTACTGCTACTCCTGCTACTACTACTACTACTCCTGCTACTACTCCTACTACTACTACTACTACTACTGCTACTCCTACTACTACTCCTACTACTACTACTACTACTGCTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTGCTACTCCTACTACTACTCCTGCTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTCCTGCTACTACTACTACTACTCCTGCTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACTACCGCTACTCCTACTACTACTCCTGCTACTACTACTACTACTTATTTTGAATAAGCCCTTCGTTCTGCGTGCCTTTATCTTCTTCATTTTTCTCTTCTTCAAACCCTAGTCGTCGCTCCAACCAGCGTCGTCGTTTTGCGTGCCTTTATCTTCTTCATTTTTCTCTTCTTCAAACCCTAGTCGTCGCTCCAACCAGCGTCGCCGGCTGCATTCTTCGTTCGACTCCATCTCACGCTCAGGTCAGTAGCCGATCCCTTCCAGTCGTCCACTAGCATTTGTTCGTCGCGCCGTCCACCACGCCGATCGTTTTCCACCGCGAAGTTTGTCTCTTCACGTTGCTTGGCTCCATCCGTCGTCTCGCACACCATCGTAGAAGCTCTATTCAGCTTAGATCGGAGATCTCTGTTGATTCAAGCCGAAACCACCGTCCTTGTAAGTTGCCGACCCGAGCCACTAGTCCCTTTAACTGCGTGCGCCCAGCCAATTCTGCCTTTAGCCGAGCCGACCAGCAAATTTTTTTTTATACTTATTTTGACATATTTGGACCTATTTTGGTAAGTTTTAATGGGTTTTAGGTAATACCCATTAAACGGAATTTTAGACTCTAATTAATTTAATTTGGATTTTTCCCCTTAAGGTTCAGTTGGCTAACACTTTGGAAAAATAATATGTGGAATTCTGCCAATAAGGTTTCAACCTTAACTTTGGGATTTGTCTATTGGAAAGCTTCGACTGTGCTAGATAGGGAATAAATATTTAACAAATCTCGAGGTAAGGGATTCTACTACTGGAACTTTGAACTGAATTTAAGAGACAACATGTATCACGACTACACATTGAGGTAGCTAAGATGCATAATGCGATGGTATAAATAATGATTGATGTTAAGTTGACGGCATTGACTGATGTTATGTTGTTAATGATAACTGTTATGTTTATGATTATTATGATACATGATATATTAATCACATGCTTAAAGACGTTATGATTAATATTTTCATGTTATGTTATGATGCTTAGATATAATCACATGCTTTTGGTTTATGGTGTCTCTGTTAACTTTATATGATAAGTTTCTTACTCCACCTGTATTGTGATTCTATCTATAGGGCCACTCGCACGACTAGGGGTGTTCCTACGGGATCACTCGCACGATTAGGGGGTGTGCCTACGAATCACGTGCACGGTTAGGGGACTATTATATTATGTATACGGGGCCGCTCGCACGACTAGGGGTGTTCCGACGGGACCACTCGCACGATTAAGGGTGTACCTATGCATTACATATATATTTATGGAGTGTGTACCTGCGATCACTCGCACGAATAGGGGTGTTTCCATGGGATCGCTCGCACGATTTAGGGGTGTTCATACAACCTCACTCACTCAGGTGCACTCCGTTGGACACACGATGCTACGTTTATGTTTCTAATGAAAAGTTAACAGATCACCAGTGGAACTAGTAGTGGGTCCTTTACTGAGTATATTTATATACTCACTCTTTCCTATGTTTAATATTTCAGGCTAAGGTAGAGAACTTAAGAAGTTGGTGAGCGATAGAAAATGATCCATGGTACGCCATATGGGACACAGTTCAGCTTCCGCACTTATTTTTATGTTTTCCAGTGTTTTAAATTTTAACCATTTTACTTGAG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Protein sequence

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Homology

[Close]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. NCBI nr
Match: KAA0033836.1 (nodulin homeobox isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK20584.1 nodulin homeobox isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 109 bits (273), Expect = 1.94e-26
Identity = 62/75 (82.67%), Postives = 70/75 (93.33%), Query Frame = 0


Query: 17  TKSSRGRNDIKQTNIVNSSKSNENAKETKQAGSLEEEKVKNVHSEEKIIRKQKHTVMNEK 76
           T S+RGRNDIKQT+IV+SSKSNENAKET+QAGSLEEEK++NVHSEEKI RK+K TVMNEK
Sbjct: 62  TNSTRGRNDIKQTDIVDSSKSNENAKETEQAGSLEEEKIENVHSEEKIRRKRKRTVMNEK 121

Query: 77  QISVIQRALFDELEM 91
           QISVI+RAL DE EM
Sbjct: 122 QISVIERALLDEPEM 136

[Close]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. NCBI nr
Match: XP_008457501.1 (PREDICTED: nodulin homeobox isoform X2 [Cucumis melo] >XP_016902119.1 PREDICTED: nodulin homeobox isoform X2 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 109 bits (273), Expect = 1.75e-25
Identity = 62/75 (82.67%), Postives = 70/75 (93.33%), Query Frame = 0


Query: 17  TKSSRGRNDIKQTNIVNSSKSNENAKETKQAGSLEEEKVKNVHSEEKIIRKQKHTVMNEK 76
           T S+RGRNDIKQT+IV+SSKSNENAKET+QAGSLEEEK++NVHSEEKI RK+K TVMNEK
Sbjct: 653 TNSTRGRNDIKQTDIVDSSKSNENAKETEQAGSLEEEKIENVHSEEKIRRKRKRTVMNEK 712

Query: 77  QISVIQRALFDELEM 91
           QISVI+RAL DE EM
Sbjct: 713 QISVIERALLDEPEM 727

[Close]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. NCBI nr
Match: XP_008457500.1 (PREDICTED: nodulin homeobox isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 109 bits (273), Expect = 1.75e-25
Identity = 62/75 (82.67%), Postives = 70/75 (93.33%), Query Frame = 0


Query: 17  TKSSRGRNDIKQTNIVNSSKSNENAKETKQAGSLEEEKVKNVHSEEKIIRKQKHTVMNEK 76
           T S+RGRNDIKQT+IV+SSKSNENAKET+QAGSLEEEK++NVHSEEKI RK+K TVMNEK
Sbjct: 660 TNSTRGRNDIKQTDIVDSSKSNENAKETEQAGSLEEEKIENVHSEEKIRRKRKRTVMNEK 719

Query: 77  QISVIQRALFDELEM 91
           QISVI+RAL DE EM
Sbjct: 720 QISVIERALLDEPEM 734

[Close]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. NCBI nr
Match: XP_031744039.1 (nodulin homeobox isoform X3 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 104 bits (260), Expect = 9.87e-24
Identity = 61/75 (81.33%), Postives = 68/75 (90.67%), Query Frame = 0


Query: 17  TKSSRGRNDIKQTNIVNSSKSNENAKETKQAGSLEEEKVKNVHSEEKIIRKQKHTVMNEK 76
           T S+RGRN IKQT+IV+SSKSNENAKET+QAGSLEEEKV+NVHSEEK  RK+K TVMNEK
Sbjct: 469 TNSARGRNGIKQTDIVDSSKSNENAKETEQAGSLEEEKVENVHSEEKHRRKRKRTVMNEK 528

Query: 77  QISVIQRALFDELEM 91
           QISVI+RAL DE EM
Sbjct: 529 QISVIERALLDEPEM 543

[Close]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. NCBI nr
Match: XP_011658036.1 (nodulin homeobox isoform X2 [Cucumis sativus] >XP_011658040.1 nodulin homeobox isoform X2 [Cucumis sativus] >XP_031744031.1 nodulin homeobox isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN65698.1 hypothetical protein Csa_019854 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 104 bits (260), Expect = 9.98e-24
Identity = 61/75 (81.33%), Postives = 68/75 (90.67%), Query Frame = 0


Query: 17  TKSSRGRNDIKQTNIVNSSKSNENAKETKQAGSLEEEKVKNVHSEEKIIRKQKHTVMNEK 76
           T S+RGRN IKQT+IV+SSKSNENAKET+QAGSLEEEKV+NVHSEEK  RK+K TVMNEK
Sbjct: 653 TNSARGRNGIKQTDIVDSSKSNENAKETEQAGSLEEEKVENVHSEEKHRRKRKRTVMNEK 712

Query: 77  QISVIQRALFDELEM 91
           QISVI+RAL DE EM
Sbjct: 713 QISVIERALLDEPEM 727

[Close]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DAP2 (Nodulin homeobox isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold237G001850 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 109 bits (273), Expect = 9.40e-27
Identity = 62/75 (82.67%), Postives = 70/75 (93.33%), Query Frame = 0


Query: 17  TKSSRGRNDIKQTNIVNSSKSNENAKETKQAGSLEEEKVKNVHSEEKIIRKQKHTVMNEK 76
           T S+RGRNDIKQT+IV+SSKSNENAKET+QAGSLEEEK++NVHSEEKI RK+K TVMNEK
Sbjct: 62  TNSTRGRNDIKQTDIVDSSKSNENAKETEQAGSLEEEKIENVHSEEKIRRKRKRTVMNEK 121

Query: 77  QISVIQRALFDELEM 91
           QISVI+RAL DE EM
Sbjct: 122 QISVIERALLDEPEM 136

[Close]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E1L6 (nodulin homeobox isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497176 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 109 bits (273), Expect = 8.48e-26
Identity = 62/75 (82.67%), Postives = 70/75 (93.33%), Query Frame = 0


Query: 17  TKSSRGRNDIKQTNIVNSSKSNENAKETKQAGSLEEEKVKNVHSEEKIIRKQKHTVMNEK 76
           T S+RGRNDIKQT+IV+SSKSNENAKET+QAGSLEEEK++NVHSEEKI RK+K TVMNEK
Sbjct: 653 TNSTRGRNDIKQTDIVDSSKSNENAKETEQAGSLEEEKIENVHSEEKIRRKRKRTVMNEK 712

Query: 77  QISVIQRALFDELEM 91
           QISVI+RAL DE EM
Sbjct: 713 QISVIERALLDEPEM 727

[Close]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C587 (nodulin homeobox isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497176 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 109 bits (273), Expect = 8.48e-26
Identity = 62/75 (82.67%), Postives = 70/75 (93.33%), Query Frame = 0


Query: 17  TKSSRGRNDIKQTNIVNSSKSNENAKETKQAGSLEEEKVKNVHSEEKIIRKQKHTVMNEK 76
           T S+RGRNDIKQT+IV+SSKSNENAKET+QAGSLEEEK++NVHSEEKI RK+K TVMNEK
Sbjct: 660 TNSTRGRNDIKQTDIVDSSKSNENAKETEQAGSLEEEKIENVHSEEKIRRKRKRTVMNEK 719

Query: 77  QISVIQRALFDELEM 91
           QISVI+RAL DE EM
Sbjct: 720 QISVIERALLDEPEM 734

[Close]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LVA2 (Homeobox domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G502860 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 104 bits (260), Expect = 4.83e-24
Identity = 61/75 (81.33%), Postives = 68/75 (90.67%), Query Frame = 0


Query: 17  TKSSRGRNDIKQTNIVNSSKSNENAKETKQAGSLEEEKVKNVHSEEKIIRKQKHTVMNEK 76
           T S+RGRN IKQT+IV+SSKSNENAKET+QAGSLEEEKV+NVHSEEK  RK+K TVMNEK
Sbjct: 653 TNSARGRNGIKQTDIVDSSKSNENAKETEQAGSLEEEKVENVHSEEKHRRKRKRTVMNEK 712

Query: 77  QISVIQRALFDELEM 91
           QISVI+RAL DE EM
Sbjct: 713 QISVIERALLDEPEM 727

[Close]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K739 (nodulin homeobox OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492885 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 89.4 bits (220), Expect = 1.23e-18
Identity = 51/75 (68.00%), Postives = 64/75 (85.33%), Query Frame = 0


Query: 17  TKSSRGRNDIKQTNIVNSSKSNENAKETKQAGSLEEEKVKNVHSEEKIIRKQKHTVMNEK 76
           T S+RGRN I+  +IV+SSKSNENAKE +Q+G+LEEEKV+NVHSEEK  RK+K TVMN+K
Sbjct: 657 TNSARGRNSIQPMDIVDSSKSNENAKEIEQSGNLEEEKVENVHSEEKHRRKRKRTVMNDK 716

Query: 77  QISVIQRALFDELEM 91
           QI++I+ AL DE EM
Sbjct: 717 QITIIESALLDEPEM 731

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAA0033836.1	1.94e-26	82.67	nodulin homeobox isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK20584.1 nodulin homeo...	[more]
XP_008457501.1	1.75e-25	82.67	PREDICTED: nodulin homeobox isoform X2 [Cucumis melo] >XP_016902119.1 PREDICTED:...	[more]
XP_008457500.1	1.75e-25	82.67	PREDICTED: nodulin homeobox isoform X1 [Cucumis melo]	[more]
XP_031744039.1	9.87e-24	81.33	nodulin homeobox isoform X3 [Cucumis sativus]	[more]
XP_011658036.1	9.98e-24	81.33	nodulin homeobox isoform X2 [Cucumis sativus] >XP_011658040.1 nodulin homeobox i...	[more]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5D3DAP2	9.40e-27	82.67	Nodulin homeobox isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaf...	[more]
A0A1S4E1L6	8.48e-26	82.67	nodulin homeobox isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497176 PE=4 SV=1	[more]
A0A1S3C587	8.48e-26	82.67	nodulin homeobox isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497176 PE=4 SV=1	[more]
A0A0A0LVA2	4.83e-24	81.33	Homeobox domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G502860 PE...	[more]
A0A6J1K739	1.23e-18	68.00	nodulin homeobox OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492885 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of MELO.jh031435.1 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..44
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..55

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
MELO.jh031435.1.t1	MELO.jh031435.1.t1	mRNA