MELO.jh004793.1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDSstart_codonstop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAACAACTAACCAAATACAATAACAACGCTGGCTCCCCAAACCTGCCCAAAAGAGAACGGCAACCAAAACAGCCATTAATGTCCCCCAATTTTCGTTTGAAAGTTTTGCCGCCGTTTGCTCCTTCTTTTCACTGACTTGGTTATTTTCGCTTTCCTGCGTTGTGAGTTCTTTTGTTCTATGGCGTTTAGGATGTGTCCAATGGCAGCAAGTAATCGAGAATTCACTGTTGACGACAACGACGACGACGACGTAAATGCCGTTCGCGTCCTTCCTCTTTCTTGTTAACTTACCTCATATGTCTGAGTCCTTTGACCTCTCTCCCATCCCATTTTCAGGACTTCGACTGGGAAGCAGCCGTCAAAGAAATTGACGTGGCCTGCCTATCAGGAATTCACTCTGCTTCATCACATTCACTTCATCCTTCCCTAACGGAATCCTCCGACGCCACTGCAGAAACTCCAGCTTCATTTCCACTTTCCGAGGAGAATGAAAAACGCGGGACTTCTCGCCAGTCTACACTTCACAGATTTATCATGAATGCAAAGTTTCAAAAGAAAACAATGGACGTCGAAAAACCGGTTCAAGATCCCGGCCTTGTTGAAGACTCGGTTGGTCTTGTTGACATAGATGAGGAGGCAGCAAAGACCTGGATATATCCAGGTCGTCTTTGAACTCCGGACTAATTTTGATTTCCATCATTTTGGGATTGTTATCCACGGACTCAATTTGTTCTATTCTCACCATGATTTTCTGTGAAACGTACTCCTCACTTACCCCAAGCAACTAGAACATGTAAAATACAAAAGATAACCTAAATTTGTCAACTGATTGTTTAGATCAACTACAAGCTTCTTCAGGTGGCATATGTTTTACTGCAAGAGTTGTAGTCCTATTTTGGAATGCAACGAGTCCAATTTACTTCCTCAAACCATATGGTTTTTGATAGCCTTTCTTTTGTTTCAACTCTAAGTTTGTTTAATATGCCAACATATTCCTTAGAATTTCTTGAGTTCACTGTTTGATATGTAGGCTATAAATTTCATGAAGTCAGTAGATAAGGAGATTTATTGCGTATATACAGTATTTTGCATCATTGACTGCTTGATGAATTATTTCTTTTCTTAGAAGTTAGGTGTTAATAGAATTATAATCTGATGTGATGTCAGTTAAATCATGTAGTTAATGTTCCTCTTCGGGATTATCAGCTGGCTATTACAAAGACAGCACTATTTTCAAATACGTTGGTGGCTTTGCCTACAGGACTTGGAAAGACTCTTATTGCTGCAGTTGTTATGTATAACTACTTCAGATGGTTTCCTGAGGGTAAGGGAAAACTTTTGCTATCTTATTGAGTGTTAAAGTTATATCATATCAATGGAATGTCCATTAGCCTAATTGAACATAGTTTCAGTAAGGTATAGGTTCAACTAAAGGTTTATAGTGTAATACCAAAATCTGAATTTGAATGAAATGATTCTCTTCCTCAACTGAGGTGAGATGAGGTTTATTTATAGGGTAAGCAGAATATAGATTATATTTTTATAACTGAATTACAACAAAACTAACAAGTTTAAAACATCAAACAATTCTTAACAAACACCCAAGTAAGTAACTAACTATCCTTCAATGATAAAGCTTCTCATTGTATCATATTCCATCCCCAAAATCAAACTGACCTTGAGGATAATCATTTAGCATGCCAATTGTGTAACATTTTCTTTTTAAAAAAAGAAAAGAAAATAACCATTCTTTTTTATTGAGAAAAATATGAAGAATACATGGGCATACGAACAACCAAACCCACAAAAAGGAGAATCCTCTACAAGAACGGGCTTCAACTATGCAGTATCAATCCTAAAGCATAATTACAAAAGGTCTTTGAAATTGAAACCCAGAGAAACATGAAAATGAACAAGGGACCAAAGCTCACTAGGATCCCTCTCAAGACCCATAAACACCCTTCTGTTGCTCTCATCCCACAAAATCCATTACAAACCACACATGCCGACAAGCCAAAGAAACCACCCTTTCTCCCCAAAAAAGCGGATTGGGAAGGGACTCCATACTTATCGCGTAAACATCTTTTTGATGAGCACTTGGCATCCCAAAAGATTGGAAGAAAGAGTCCCAAACAACGACTGCAGCATTACAACTCCAAAGAATGTGATCTAAGTCTCCCTCTGCCTTCCAACGAAGAATACAACAAAAAGGCCCAAACAGCATAGGCAACTTCCAACCAAGCTTGTCCAAATATGTTAGCTTGGTTGTGGAGAACCTGCCAAGTAAAGAACCTAACCTTCCTAGGGACCTTAATCCTCCAAACCATTGCAAAGACCGACTCACCTGAGGGAGAGGGATCAATTAAGCAATTGAAAAAAGATTTGCACGAGAACCAGACTCTAACATCTCTCCTCCCTAACCTGAAAGGGTGAACATCAAGCAAAGAAGGAAGGATAGGCACATAAGAAGCTTCCTAGTTGAAAAGAGAACGACAAAGCCCAAAGGAGAAAGAAAAAATAACTCTCGGACCACACAAGAAAATCCGCCATGAAATTATTTTTAGATTATTTTTAAAGGAAGATAGATGATATAAGCGCCCACCTGATGATCTTCCCAAAAGTGTCTCTCCTTCCCCCATGACACAATGAACCCAAGGAACAAAAGAAGGGTTTAAGGCAAGGAGATCCTTTAATCCCTTTCTTGTTTCTTCTTGTCTTTGATGTCTTACGTCGTCTAATTCCTAAGGGAGTGGAAGGAGGCAGAAGGTTAGTGATGTAATATCAAATTTGTTTTCTCTAAAATTTTTCTTATCTTCCCAATGTGGTGAAGATGTTTATTTATACTAGAAATTTACAGTTGTGTAACTGTTTAGTTGTAACAACTTTAACAACTTTTAGTTAGTTATCTAGGTGGCTTATTTAGTTAGCCTATTTAGTTACATCAAATCCACCCCACCCAAAATCAACTCGTCCCAGAGTTGAACTAGTCAGCAAGCTGGAACTCATTTGGGGCGTGATAGGTCTTCAAGTCTGCTACGTTAAAAACAAGGCTGATATGTAGGTCGTCGGGCAGTTCCATTCTATAGGCATTATCACCATATTTTGCTAGTACTTTACAAGGTCCAAGCTGTTTGTGTTTTAGTTTATTGTATGTCCCTGTTGGAAATATGTTCTTTAGATGAATCATCACTAGATCTCCCTCTTTGAACTTTACTTTCCTTCTTTTCTTGTCTTTATCTTGTTTATAAGATAAAGTAGTATTCTGTAGGTGTTCGCGAACTTCTTTGTGCAGACTTTGTATTCTTTCGATCATATTTTCTCCTTCTATGTTGATATCTGCATCAGATGGTAGATTGGCAAGGTCAAACGTAAGTCTAGGACTTTTAGTGTAAACAATTTCAAAGGGGCATCTCTCGGTTGATCTGTTTTTCATGTTGTTGAATACAAATTCAGCTTGAGCTAGTGCTAGATCCCACTGTTTCGGCTTAGAACCACTTAGACAACGAATAAAATTCCCCAAGGTTCTGTTAGTGACTTCAGTTTGGCCATCTGTTTGTGGGTGTGTTGTAGTACTGAATTTAAGTGTGGTGTCTAGTTTCTTCCACAATATTCGCCCAAAGTGGCTTAAGAATTTCACGTCCCTATCTGACACAATAGATTTAGATATGCCATGTAGTCGTATTATCTCTCGAAAAAAGAGATTAGCAATATAGACATCATTAGTCTTCTTGCAGGGTAGAAAATGGGCCATTTTGCTGAATCTGTCTACCACTACCATTACAACATCATTCTGTCTTTGTGTCTTAGGTAGCCCCAATACAAAATCTTCTGATAAGTCCTCCCATATAAACATAGGAATTGGCAAAGGGTTGTATAGGCCAGCATTGGTACTAGTCCTTTTAGCTTTTTGGCATATGGCGCAATGCTTCACAAAATTATTTGTCTTTTCGTAATTGTGGCCAATAATATCTAGAGGAGAGTATTTCAAGTGTCTTGTCTTGCCCGAAGTGACCAGCGAGTCCTCATGAGTGTGCTTCCTTTAGTAGGGCTTCTCTTAGAGACTTATGGGGTATGCACAGTTTTTCTCTTTTGAAAAGAAATCCATCAATGATGTGAAACTCTCCAGCTTCGAGGTGATAGACGCATTTGTACCAAATTTTGCTAAAGTCAGCATCATCTTCATATAGGTCTGGTCAATGTTTGAATGCTATCACCTCGGATTATAGTGTAGAAAGTAAGGAGTGCTTTCTACTCAGTGCGTCGGCTACTTTGTTTTCTTTCCCACTTTTGTGCTTGATAACAAAATCGAATCTTTGTAGAAAGGAAATCCATCTAGCGTGCATCTTGTTGATAAATTTTTGTGCTTGGAGATATTTTAGGGAAAAGTGATCTGTCAATAGGAGTAACTCTTTAGATAGTAGGCAGTGCTCCCATTGTTTTTAGTGCTCGGACGAGAGCATACATTTCTTGCTCATAAGTGCTCCACATCTGTCTTGATTGGTTGAGTTTTTCACTGAAGTACTCAATGGGATGACCTGATTGAGATAAGACAGCTCCAGTGCCAGTCCCGGAGGCATCAACAACTACTTCAAATGGCTGTGTAAACTTGGGGAGTTTTAGGACTGGTTTATTACTAAGCTTTTTCTTCAATGCTTCAAAGCTATCTTGTTGTTTCTTTCCCCATAGGAAGCCTCCCTTCTTTAGGCAGTCTGTAATTGAGGCGGCAATGGTACTGAAGTTATAAATGAACTTCTTGTAGAATGATGCCAAGCCTAGGAATGCTTGTACTTCTTTTATTGATTTCGGTATTGGCCAGTTTCTAATTGCCTCGACTTTCTTTTCATCCATTAGGATGTGATTCTTCTTGATAATAAATCCCAAGAATGCTATTTCTTCTACACAAAAGGCCAGCACTTTGAACACTTGGTATAGATGTGGATTATGCTCTTCTAGGCATCTGCTAAAAACCAAGATATCATCAAAATAAACAACGA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BLAST of MELO.jh004793.1 vs. NCBI nr
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BLAST of MELO.jh004793.1 vs. NCBI nr
Match: XP_008441146.1 (PREDICTED: Fanconi anemia group M protein isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1396 bits (3613), Expect = 0.0 Identity = 715/718 (99.58%), Postives = 718/718 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. NCBI nr
Match: XP_011649875.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1299 bits (3361), Expect = 0.0 Identity = 670/718 (93.31%), Postives = 687/718 (95.68%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. NCBI nr
Match: XP_031736810.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X5 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1299 bits (3361), Expect = 0.0 Identity = 670/718 (93.31%), Postives = 687/718 (95.68%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. NCBI nr
Match: XP_031736811.1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM isoform X6 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1299 bits (3361), Expect = 0.0 Identity = 670/718 (93.31%), Postives = 687/718 (95.68%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: I3XHK1 (DEAD-box ATP-dependent RNA helicase FANCM OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=FANCM PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 275.8 bits (704), Expect = 1.4e-72 Identity = 260/798 (32.58%), Postives = 375/798 (46.99%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3H7 (Fanconi anemia group M protein isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485372 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1396 bits (3613), Expect = 0.0 Identity = 715/718 (99.58%), Postives = 718/718 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3E0 (Fanconi anemia group M protein isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485372 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1396 bits (3613), Expect = 0.0 Identity = 715/718 (99.58%), Postives = 718/718 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LQJ7 (Helicase C-terminal domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G393190 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1299 bits (3361), Expect = 0.0 Identity = 670/718 (93.31%), Postives = 687/718 (95.68%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DUR1 (Fanconi anemia group M protein isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485372 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1069 bits (2764), Expect = 0.0 Identity = 547/555 (98.56%), Postives = 551/555 (99.28%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B2A7 (Fanconi anemia group M protein isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485372 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1068 bits (2762), Expect = 0.0 Identity = 545/550 (99.09%), Postives = 548/550 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. TAIR 10
Match: AT1G35530.2 (DEAD/DEAH box RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 254.2 bits (648), Expect = 3.1e-67 Identity = 263/839 (31.35%), Postives = 383/839 (45.65%), Query Frame = 0
BLAST of MELO.jh004793.1 vs. TAIR 10
Match: AT1G35530.1 (DEAD/DEAH box RNA helicase family protein ) HSP 1 Score: 218.4 bits (555), Expect = 1.9e-56 Identity = 239/794 (30.10%), Postives = 349/794 (43.95%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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