MC11g_new0264 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1

Overview


Name	MC11g_new0264
Type	gene
Organism	Momordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Description	extensin-1-like
Location	MC11: 11131379 .. 11132474 (+)
RNA-Seq Expression	MC11g_new0264
Synteny	MC11g_new0264

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

AAGGGGCAAGAATTTTGCAGCTATATAAAGGCCAAAGGAGGCTTCATTTCAAAAGCACAATAGAAATAACCCTAATCGTAAGCAAAGATATGGGATCGTCTTCAATGGCTTCCCTTCTTATTCTAGTCTTGGTGGCAGCTCTAAGCTTGCCGTCGGCCACCGCGGGAGGCTACGGTTACTCTTCCCCTCCTCCACCACCTCCTAAATATAAATCACCGCCGCCGCCGGTGTACTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTATCCCTCTCCCCCACCTCCGGTGTATTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTATCATTCTCCTCCGCCACCACCTCCTGTTTACTACTCTCCACCACCACCAGTTTATCACTCTCCTCCACCTCCCATCTATCATTCTCCTCCACCACCAGTCTACCACTCTCCTCCACCACCAGTTTATTACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCCGTGTACTACTCTCCTCCACCACCGGTCTACCACTCTCCTCCACCGCCGGTCTATTACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCAGTATACTACTCTCCTCCACCACCAGTCTATCCGTCTCCTCCACCGCCGGTCTATTATTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCTGTGTACTACTCTCTCCCGCCACCAGTTTACTACTCTCCTCCACCACCAGTTTACTACTCTCCTCCCCCACCACCAAAAAAGTACGAGTACTCGTCACCCCCGCCACCTCCTCCCCACTATTAGGTCAACATATGTACTCTACTAAACCATACATGAAGGTGAGCTTCTTTACAAGATATATAACTCAATACATTAGACCTTTGCATATATCTCAACATGAATTTTGTTATTTTTTCAGGAAGAATGAAAGAAATATATGTTTCCAAATCAATAAAAGGGGATAGCCTAATGAAGATCATCCATCATTGCTATACAAAGAAGGCTTTTTTAATTTGTTTGCATCTATGATATTTTTTGTTGTTGTTTCTATATGTGTGTGACTTTTCCTATACTTTGATCAGTAAAAATAAATTTGCTTGTGTTTCTTTCTCAAAAAAGCT

mRNA sequence

ATGGGATCGTCTTCAATGGCTTCCCTTCTTATTCTAGTCTTGGTGGCAGCTCTAAGCTTGCCGTCGGCCACCGCGGGAGGCTACGGTTACTCTTCCCCTCCTCCACCACCTCCTAAATATAAATCACCGCCGCCGCCGGTGTACTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTATCCCTCTCCCCCACCTCCGGTGTATTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTATCATTCTCCTCCGCCACCACCTCCTGTTTACTACTCTCCACCACCACCAGTTTATCACTCTCCTCCACCTCCCATCTATCATTCTCCTCCACCACCAGTCTACCACTCTCCTCCACCACCAGTTTATTACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCCGTGTACTACTCTCCTCCACCACCGGTCTACCACTCTCCTCCACCGCCGGTCTATTACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCAGTATACTACTCTCCTCCACCACCAGTCTATCCGTCTCCTCCACCGCCGGTCTATTATTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCTGTGTACTACTCTCTCCCGCCACCAGTTTACTACTCTCCTCCACCACCAGTTTACTACTCTCCTCCCCCACCACCAAAAAAGTACGAGTACTCGTCACCCCCGCCACCTCCTCCCCACTATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGATCGTCTTCAATGGCTTCCCTTCTTATTCTAGTCTTGGTGGCAGCTCTAAGCTTGCCGTCGGCCACCGCGGGAGGCTACGGTTACTCTTCCCCTCCTCCACCACCTCCTAAATATAAATCACCGCCGCCGCCGGTGTACTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTATCCCTCTCCCCCACCTCCGGTGTATTACTCTCCTCCTCCACCAGTTTATCATTCTCCTCCGCCACCACCTCCTGTTTACTACTCTCCACCACCACCAGTTTATCACTCTCCTCCACCTCCCATCTATCATTCTCCTCCACCACCAGTCTACCACTCTCCTCCACCACCAGTTTATTACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCCGTGTACTACTCTCCTCCACCACCGGTCTACCACTCTCCTCCACCGCCGGTCTATTACTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCAGTATACTACTCTCCTCCACCACCAGTCTATCCGTCTCCTCCACCGCCGGTCTATTATTCTCCTCCACCTCCTAAGAAGTCACCACCACCTCCTGTGTACTACTCTCTCCCGCCACCAGTTTACTACTCTCCTCCACCACCAGTTTACTACTCTCCTCCCCCACCACCAAAAAAGTACGAGTACTCGTCACCCCCGCCACCTCCTCCCCACTATTAG

Protein sequence

MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY

Homology

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38913 (Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 1.2e-41
Identity = 164/251 (65.34%), Postives = 175/251 (69.72%), Query Frame = 0


Query: 6   MASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPP------PPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSP 65
           MAS L+L    +L+  S T   Y YSSPPP      PPP YKSPPPPV +  PPPVY SP
Sbjct: 1   MASFLVLAF--SLAFVSQTTANYFYSSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSP 60

Query: 66  PPPVYYSPPPPVYHSPPP------PPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPV 125
           PPPV +  PPPVY SPPP      PPPVY SPPPPVY SPPPP+ H  PPPVY SPPPPV
Sbjct: 61  PPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPV 120

Query: 126 -YYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPV-YYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSP 185
            +YSPPP  KSPPPPV +  PPPVY SPPPPV +YSPPP  KSPPPPV Y  PPPVY SP
Sbjct: 121 KHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSP 180

Query: 186 PPPV-YYSPPPPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPV-YYSP------PPPPKKYEYSSP- 230
           PPPV +YSPPP  KSPPPPV Y  PPPVY SPPPPV +YSP      PPPP KY YS P 
Sbjct: 181 PPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKYYSPPPVYKSPPPPVKHYSPPPVYKSPPPPVKY-YSPPP 240

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FS16 (Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3)

HSP 1 Score: 154.8 bits (390), Expect = 1.1e-36
Identity = 151/239 (63.18%), Postives = 163/239 (68.20%), Query Frame = 0


Query: 28  YGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPP----VYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPP------- 87
           Y Y SPPPP   Y   PPPVY+SPPPP    VY SPPPPV +  PPPVYHSPP       
Sbjct: 176 YVYKSPPPPVKHYS--PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV 235

Query: 88  ---PPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----IYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-----KSP 147
              PPPPV +  PPPVYHSPPPP    +Y SPPPPV H  PPPVY+SPPPPK     KSP
Sbjct: 236 YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSP 295

Query: 148 PPPVYYSPPPPVYHSPPPP----VYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPP----VYPSPPPPV 207
           PPPV +  PPPVYHSPPPP    VY SPPPP K   PPPVY+SPPPP    VY SPPPPV
Sbjct: 296 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPV 355

Query: 208 -YYSPPPPKKSPPPP----VYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY 230
            +YSPPP   SPPPP    VY S PPPV +  PPPVY+SPPPP +KY Y SPPPPP H+
Sbjct: 356 KHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKEKYVYKSPPPPPVHH 412

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XIL9 (Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PEX3 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 132.5 bits (332), Expect = 6.1e-30
Identity = 138/196 (70.41%), Postives = 146/196 (74.49%), Query Frame = 0


Query: 32  SPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVY-PSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVY 91
           SPPPPP     PP P++  PPPPVY P PPPPVY  PPPP  +SPPPPPPV +SPPPPV 
Sbjct: 492 SPPPPPVHSPPPPSPIHSPPPPPVYSPPPPPPVYSPPPPPPVYSPPPPPPV-HSPPPPV- 551

Query: 92  HSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPP 151
           HSPPPP+ HSPPPPV HSPPPPV +SPPPP  SPPPPV YSPPPP  HSPPPPV +SPPP
Sbjct: 552 HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPVHSPPPPV-YSPPPPPVHSPPPPV-HSPPP 611

Query: 152 PKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSP 211
           P  SPPPPVY  PPPP   SPPPPV +SPPPP  SPPPPVY   PPP  YSPPPP   SP
Sbjct: 612 PVHSPPPPVYSPPPPPPVHSPPPPV-FSPPPPVHSPPPPVY--SPPPPVYSPPPPPVKSP 671

Query: 212 PPPPKKYEYSSPPPPP 227
           PPPP    YS P  PP
Sbjct: 672 PPPP---VYSPPLLPP 674

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T0K5 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX3 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 122.9 bits (307), Expect = 4.8e-27
Identity = 141/238 (59.24%), Postives = 149/238 (62.61%), Query Frame = 0


Query: 30  YSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPV 89
           YS PPPPPP    PPPP  YSPPPP  P PPPP  YSPPPP   SPPPPPP  YSPPPP 
Sbjct: 449 YSPPPPPPP----PPPPPVYSPPPPPPPPPPPPPVYSPPPP---SPPPPPPPVYSPPPPP 508

Query: 90  YHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPP-------PVYYS--PPPPKKSPPPPVYYSPPP-PVYHS 149
              PPPP+Y  PPPPVY SPPP       PVY +  PPPP  SPPPP +  PPP P Y+S
Sbjct: 509 PPPPPPPVYSPPPPPVYSSPPPPPSPAPTPVYCTRPPPPPPHSPPPPQFSPPPPEPYYYS 568

Query: 150 PPPPVYYSP----PPPKKSPPPPV--YYSPPPPVYP--SPPPPVYYSPPPP--------- 209
            PPP + SP    PPP  SPPPP+  Y SPPPP  P  SPPP   YSPPPP         
Sbjct: 569 SPPPPHSSPPPHSPPPPHSPPPPIYPYLSPPPPPTPVSSPPPTPVYSPPPPPPCIEPPPP 628

Query: 210 ----KKSPPPP---VYYSL--PPPVYYS--PPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY 230
               + SPPPP   V+YS   PPPVYYS  PPPPVYYS PPPP    YSSPPPP  HY
Sbjct: 629 PPCIEYSPPPPPPVVHYSSPPPPPVYYSSPPPPPVYYSSPPPPPPVHYSSPPPPEVHY 679

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LJ64 (Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PEX1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 122.5 bits (306), Expect = 6.3e-27
Identity = 136/196 (69.39%), Postives = 150/196 (76.53%), Query Frame = 0


Query: 32  SPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYH 91
           SPPPPPP + SPPPPV +SPPPP++ SPPPPV YSPPPPV HSPPPPP   +SPPPPV H
Sbjct: 646 SPPPPPPVH-SPPPPV-FSPPPPMH-SPPPPV-YSPPPPV-HSPPPPP--VHSPPPPV-H 705

Query: 92  SPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPP-PVYYSPPP 151
           SPPPP+ HSPPPPV HSPPPPV +SPPPP  SPPPPV   PPPPV+  PPP P+Y  PPP
Sbjct: 706 SPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPVHSPPPPVQSPPPPPVFSPPPPAPIYSPPPP 765

Query: 152 PKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSP 211
           P  SPPPPV+  PPPPV+ SPPPPV +SPPPP  SPPPPV +S PPPV+  PPP   YSP
Sbjct: 766 PVHSPPPPVHSPPPPPVH-SPPPPV-HSPPPPVHSPPPPV-HSPPPPVHSPPPPSPIYSP 822

Query: 212 PPPPKKYEYSSPPPPP 227
           PPP       SPPP P
Sbjct: 826 PPP-----VFSPPPKP 822

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. NCBI nr
Match: XP_022143630.1 (extensin-1-like [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 314 bits (805), Expect = 3.69e-106
Identity = 198/229 (86.46%), Postives = 198/229 (86.46%), Query Frame = 0


Query: 1   MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPP 60
           MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPP
Sbjct: 1   MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPP 60

Query: 61  PPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP 120
           PPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP
Sbjct: 61  PPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP 120

Query: 121 KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPP 180
           KKSPPPPVYYSPPPPVY                               PSPPPPVYYSPP
Sbjct: 121 KKSPPPPVYYSPPPPVY-------------------------------PSPPPPVYYSPP 180

Query: 181 PPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY 229
           PPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY
Sbjct: 181 PPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY 198

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. NCBI nr
Match: KAG6592187.1 (Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 246 bits (628), Expect = 4.41e-77
Identity = 184/232 (79.31%), Postives = 192/232 (82.76%), Query Frame = 0


Query: 1   MGSS--SMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPV--Y 60
           MG S  SMA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPPPP   YKSPPPPVYYSPPPP   Y
Sbjct: 1   MGESKPSMAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYYSPPPPKKEY 60

Query: 61  PSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYS 120
            SPPPPVYYSPPPPVY SPPPP  VY+SPPPPVYHSPPPP+YHSPPPPVY SPPPPVY+S
Sbjct: 61  KSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP--VYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHS 120

Query: 121 PPPPK-KSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPP 180
           PPPP  KSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVY+SPPPPVY SPPPP
Sbjct: 121 PPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPP 180

Query: 181 VYYSPPPPK-KSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPP 225
           VYYSPPPP  KSPPPP+Y+S PPPVY+SPPPPVYYSPPPP     Y SPPPP
Sbjct: 181 VYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP----VYKSPPPP 226

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. NCBI nr
Match: XP_023536462.1 (extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 244 bits (622), Expect = 1.53e-76
Identity = 187/250 (74.80%), Postives = 193/250 (77.20%), Query Frame = 0


Query: 6   MASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPP-----------------PPK----YKSPP 65
           MA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPPPP                 PPK    YKSPP
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPPVYHSPPPPKVKYEYKSPP 60

Query: 66  PPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP------PPVYYSPPPPVYHSPPPPIY 125
           PPVYYSPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYHSPPPP      PPVY+SPPPPVY SPPPP+Y
Sbjct: 61  PPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVY 120

Query: 126 HSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-KSPP 185
           HSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPP
Sbjct: 121 HSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPP 180

Query: 186 PPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPK 225
           PPVY+SPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVYYS PPPVY SPPPPVY+SPPPP  
Sbjct: 181 PPVYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPP-- 240

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. NCBI nr
Match: XP_022936196.1 (extensin-1-like [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 242 bits (618), Expect = 2.34e-75
Identity = 183/249 (73.49%), Postives = 192/249 (77.11%), Query Frame = 0


Query: 6   MASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPP------------------------PPK-- 65
           MA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPPPP                        PPK  
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKG 60

Query: 66  YKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYH 125
           YKSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVY SPPPP  VY+SPPPPVYHSPPPP+YH
Sbjct: 61  YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP--VYHSPPPPVYHSPPPPVYH 120

Query: 126 SPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-KSPPP 185
           SPPPP+Y SPPPPVY+SPPPP  KSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPP
Sbjct: 121 SPPPPIYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPP 180

Query: 186 PVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKK 225
           PVY+SPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPPP+Y+S PPPVY+SPPPPVYYSPPPP   
Sbjct: 181 PVYHSPPPPVYMSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP--- 240

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. NCBI nr
Match: XP_022976067.1 (extensin-3-like [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 237 bits (605), Expect = 6.98e-74
Identity = 189/273 (69.23%), Postives = 197/273 (72.16%), Query Frame = 0


Query: 1   MGSS--SMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPP----------------PPK--- 60
           MG S  SMA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPPPP                PPK   
Sbjct: 1   MGESKCSMAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  -YKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP---------------PPVYY 120
            YKSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYHS PPP               PPVYY
Sbjct: 61  EYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYY 120

Query: 121 SPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPP 180
           SPPPPVY SPPPP+YHSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP  KSPPP VY+SPPPPVYHSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPP 180

Query: 181 PVYYSPPPPK---------KSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYY 225
           P+Y SPPPP          KSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVY+
Sbjct: 181 PIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYH 240

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CPB2 (extensin-1-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013490 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 314 bits (805), Expect = 1.78e-106
Identity = 198/229 (86.46%), Postives = 198/229 (86.46%), Query Frame = 0


Query: 1   MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPP 60
           MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPP
Sbjct: 1   MGSSSMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPP 60

Query: 61  PPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP 120
           PPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP
Sbjct: 61  PPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP 120

Query: 121 KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPP 180
           KKSPPPPVYYSPPPPVY                               PSPPPPVYYSPP
Sbjct: 121 KKSPPPPVYYSPPPPVY-------------------------------PSPPPPVYYSPP 180

Query: 181 PPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY 229
           PPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY
Sbjct: 181 PPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY 198

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F6U4 (extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442872 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 242 bits (618), Expect = 1.13e-75
Identity = 183/249 (73.49%), Postives = 192/249 (77.11%), Query Frame = 0


Query: 6   MASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPP------------------------PPK-- 65
           MA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPPPP                        PPK  
Sbjct: 1   MAYLVATVLVAILSFTSVIATDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKG 60

Query: 66  YKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYH 125
           YKSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPPVY SPPPP  VY+SPPPPVYHSPPPP+YH
Sbjct: 61  YKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPP--VYHSPPPPVYHSPPPPVYH 120

Query: 126 SPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-KSPPP 185
           SPPPP+Y SPPPPVY+SPPPP  KSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPP
Sbjct: 121 SPPPPIYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPP 180

Query: 186 PVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKK 225
           PVY+SPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPPP+Y+S PPPVY+SPPPPVYYSPPPP   
Sbjct: 181 PVYHSPPPPVYMSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP--- 240

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IER1 (extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476580 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 237 bits (605), Expect = 3.38e-74
Identity = 189/273 (69.23%), Postives = 197/273 (72.16%), Query Frame = 0


Query: 1   MGSS--SMASLLILVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPP----------------PPK--- 60
           MG S  SMA L+  VLVA LS  S  A  Y YSSPPPP                PPK   
Sbjct: 1   MGESKCSMAYLVATVLVALLSFTSVIAIDYSYSSPPPPYYVYKSPPPPVYHSPPPPKVKY 60

Query: 61  -YKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP---------------PPVYY 120
            YKSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYHS PPP               PPVYY
Sbjct: 61  EYKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSSPPPVYYSPPPKKEYKSPPPPVYY 120

Query: 121 SPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPP 180
           SPPPPVY SPPPP+YHSPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP  KSPPP VY+SPPPPVYHSPPP
Sbjct: 121 SPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPIYKSPPPLVYHSPPPPVYHSPPP 180

Query: 181 PVYYSPPPPK---------KSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYY 225
           P+Y SPPPP          KSPPPPVYYSPPPPVY SPPPPVYYSPPPP  KSPPPPVY+
Sbjct: 181 PIYKSPPPPVYHSPPPQVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYYSPPPPVYKSPPPPVYH 240

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7J6XCN3 (Extensin OS=Thalictrum thalictroides OX=46969 GN=FRX31_002868 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 224 bits (570), Expect = 1.49e-67
Identity = 169/217 (77.88%), Postives = 179/217 (82.49%), Query Frame = 0


Query: 30  YSSPPPP------PPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----- 89
           Y SPPPP      PP Y SPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVYHSPPPP     
Sbjct: 178 YHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSP 237

Query: 90  -PPV--YYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSPPP 149
            PPV  Y+SPPPPVYHSPPPP+Y SPPPPVYHSPPPPVY+SPPPP  KSPPPPVY+SPPP
Sbjct: 238 PPPVVLYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPP 297

Query: 150 PVYHSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYY 209
           PVYHSPPPPVY SPPPP   SPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY+SPPPP   SPPPPVY 
Sbjct: 298 PVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYHSPPPPVYK 357

Query: 210 SLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY 229
           S PPPVY+SPPPPVY SPPPP   Y+Y SPPPP P Y
Sbjct: 358 SPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPTPVYKYKSPPPPTPVY 394

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6D2HCM3 (Extensin_2 domain-containing protein OS=Microthlaspi erraticum OX=1685480 GN=MERR_LOCUS720 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 214 bits (545), Expect = 9.34e-64
Identity = 169/233 (72.53%), Postives = 177/233 (75.97%), Query Frame = 0


Query: 28  YGYSSPPPP------PPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPP--- 87
           Y Y SPPPP      PP YKSPPP VY+SPPPPVY SPPPPVY+SPPPPVY SPPPP   
Sbjct: 142 YLYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPRVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYL 201

Query: 88  -----PPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK---KSPPPPVYY 147
                PPVY SPPPPVYHSPPPP+Y SPPPPVYHSPPPPVY SPPPP    KSPPPPVY+
Sbjct: 202 YKSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYLYKSPPPPVYH 261

Query: 148 SPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-KSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPK------ 207
           SPPPPVY SPPPPVY+SPPPP  KSPPPPVY+SPPPPVY SPPPPVY+SPPPP       
Sbjct: 262 SPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPP 321

Query: 208 -----KSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPP------PKKYEYSSPPPP 225
                KSPPPPVY S PPPVY+SPPPPVY SPPPP      P  Y Y SPPPP
Sbjct: 322 PVYLYKSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYKSPPPPVYHSPPPPVYLYKSPPPP 374

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. TAIR 10
Match: AT1G21310.1 (extensin 3 )

HSP 1 Score: 154.8 bits (390), Expect = 8.1e-38
Identity = 151/239 (63.18%), Postives = 163/239 (68.20%), Query Frame = 0


Query: 28  YGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPP----VYPSPPPPVYYSPPPPVYHSPP------- 87
           Y Y SPPPP   Y   PPPVY+SPPPP    VY SPPPPV +  PPPVYHSPP       
Sbjct: 176 YVYKSPPPPVKHYS--PPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYV 235

Query: 88  ---PPPPVYYSPPPPVYHSPPPP----IYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPK-----KSP 147
              PPPPV +  PPPVYHSPPPP    +Y SPPPPV H  PPPVY+SPPPPK     KSP
Sbjct: 236 YKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSP 295

Query: 148 PPPVYYSPPPPVYHSPPPP----VYYSPPPP-KKSPPPPVYYSPPPP----VYPSPPPPV 207
           PPPV +  PPPVYHSPPPP    VY SPPPP K   PPPVY+SPPPP    VY SPPPPV
Sbjct: 296 PPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPV 355

Query: 208 -YYSPPPPKKSPPPP----VYYSLPPPVYYSPPPPVYYSPPPPPKKYEYSSPPPPPPHY 230
            +YSPPP   SPPPP    VY S PPPV +  PPPVY+SPPPP +KY Y SPPPPP H+
Sbjct: 356 KHYSPPPVYHSPPPPKKHYVYKSPPPPVKHYSPPPVYHSPPPPKEKYVYKSPPPPPVHH 412

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. TAIR 10
Match: AT2G43150.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 139.0 bits (349), Expect = 4.6e-33
Identity = 132/209 (63.16%), Postives = 140/209 (66.99%), Query Frame = 0


Query: 12  LVLVAALSLPSATAGGYGYSSPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPV 71
           +V + AL + SA A    Y S PPPP +YKSPPPPV   PPP  Y SPPPPV  SPPPP 
Sbjct: 14  VVAMLALLVGSAMATEPYYYSSPPPPYEYKSPPPPVKSPPPPYEYKSPPPPV-KSPPPPY 73

Query: 72  YHSPPPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYS 131
           Y         Y+SPPPPV   PPP +Y SPPPPV   PPP  Y+SPPPP KSPPPP YY 
Sbjct: 74  Y---------YHSPPPPVKSPPPPYVYSSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYH 133

Query: 132 PPPPVYHSPPPPVYY-SPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYY-SPPPPKKSPPPP 191
            PPP   SPPPP YY SPPPP KSPPPP YY  PPP   SPPPP YY SPPPP KSPPPP
Sbjct: 134 SPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPPYYYHSPPPPVKSPPPP 193

Query: 192 VYYSLPPPVYYSPPPPVY-YSPPPPPKKY 218
             YS PPP   SPPPPVY Y+ PPPP  Y
Sbjct: 194 YLYSSPPPPVKSPPPPVYIYASPPPPTHY 212

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. TAIR 10
Match: AT1G26240.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 136.0 bits (341), Expect = 3.9e-32
Identity = 167/245 (68.16%), Postives = 168/245 (68.57%), Query Frame = 0


Query: 28  YGYSSPPPPPPKYKSPPPP--VYYSPPPP--VYPSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPPPP 87
           Y YSSPPPPP  YKSPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPPP
Sbjct: 115 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPP 174

Query: 88  PVYYSPPPP--VYHSPPPP--IYHSPPPP--VYHSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP- 147
            VY SPPPP  VY SPPPP  +Y SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP    KSPPPP 
Sbjct: 175 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPP 234

Query: 148 -VYYSPPPP--VYHSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP--VYYSPPPP--VYPSPPPP- 207
            VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP    KSPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP 
Sbjct: 235 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPP 294

Query: 208 -VYYSPPPP----KKSPPPPVYYSLPPP---VYYSPPPP--VYYSPPPPPKKYEYSSPPP 230
            VY SPPPP    K  PPPP  YS PPP   VY SPPPP  VY SPPPPP  Y Y SPPP
Sbjct: 295 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYNSPPPPP--YVYKSPPP 354

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. TAIR 10
Match: AT2G15880.1 (Leucine-rich repeat (LRR) family protein )

HSP 1 Score: 132.5 bits (332), Expect = 4.3e-31
Identity = 138/196 (70.41%), Postives = 146/196 (74.49%), Query Frame = 0


Query: 32  SPPPPPPKYKSPPPPVYYSPPPPVY-PSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPPPVYYSPPPPVY 91
           SPPPPP     PP P++  PPPPVY P PPPPVY  PPPP  +SPPPPPPV +SPPPPV 
Sbjct: 492 SPPPPPVHSPPPPSPIHSPPPPPVYSPPPPPPVYSPPPPPPVYSPPPPPPV-HSPPPPV- 551

Query: 92  HSPPPPIYHSPPPPVYHSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSPPPPVYHSPPPPVYYSPPP 151
           HSPPPP+ HSPPPPV HSPPPPV +SPPPP  SPPPPV YSPPPP  HSPPPPV +SPPP
Sbjct: 552 HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPV-HSPPPPVHSPPPPV-YSPPPPPVHSPPPPV-HSPPP 611

Query: 152 PKKSPPPPVYYSPPPPVYPSPPPPVYYSPPPPKKSPPPPVYYSLPPPVYYSPPPPVYYSP 211
           P  SPPPPVY  PPPP   SPPPPV +SPPPP  SPPPPVY   PPP  YSPPPP   SP
Sbjct: 612 PVHSPPPPVYSPPPPPPVHSPPPPV-FSPPPPVHSPPPPVY--SPPPPVYSPPPPPVKSP 671

Query: 212 PPPPKKYEYSSPPPPP 227
           PPPP    YS P  PP
Sbjct: 672 PPPP---VYSPPLLPP 674

[Close]

BLAST of MC11g_new0264 vs. TAIR 10
Match: AT1G26250.1 (Proline-rich extensin-like family protein )

HSP 1 Score: 132.1 bits (331), Expect = 5.6e-31
Identity = 165/245 (67.35%), Postives = 167/245 (68.16%), Query Frame = 0


Query: 28  YGYSSPPPPPPKYKSPPPP--VYYSPPPP--VYPSPPPP--VYYSPPPP--VYHSPPPPP 87
           Y Y+SPPPPP  Y SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPPP
Sbjct: 85  YVYNSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPP 144

Query: 88  PVYYSPPPP--VYHSPPPPIY-HSPPPP---VYHSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP- 147
            VY SPPPP  VY SPPPP Y +SPPPP   VY SPPPP  VY SPPPP    KSPPPP 
Sbjct: 145 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSPPPPPPYVYQSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPP 204

Query: 148 -VYYSPPPP--VYHSPPPP--VYYSPPPPK---KSPPPP--VYYSPPPP--VYPSPPPP- 207
            VY SPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP    KSPPPP  VY SPPPP  VY SPPPP 
Sbjct: 205 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYKSPPPPP 264

Query: 208 -VYYSPPPP----KKSPPPPVYYSLPPP---VYYSPPPP--VYYSPPPPPKKYEYSSPPP 230
            VY SPPPP    K  PPPP  YS PPP   VY SPPPP  VY SPPPPP  Y Y SPPP
Sbjct: 265 YVYSSPPPPPYVYKSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPPYVYSSPPPPP--YVYKSPPP 324

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q38913	1.2e-41	65.34	Extensin-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT1 PE=2 SV=2	[more]
Q9FS16	1.1e-36	63.18	Extensin-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=EXT3 PE=1 SV=3	[more]
Q9XIL9	6.1e-30	70.41	Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thali...	[more]
Q9T0K5	4.8e-27	59.24	Leucine-rich repeat extensin-like protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L...	[more]
Q9LJ64	6.3e-27	69.39	Pollen-specific leucine-rich repeat extensin-like protein 1 OS=Arabidopsis thali...	[more]

BLAST of MC11g_new0264 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022143630.1	3.69e-106	86.46	extensin-1-like [Momordica charantia]	[more]
KAG6592187.1	4.41e-77	79.31	Extensin-3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]	[more]
XP_023536462.1	1.53e-76	74.80	extensin-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]	[more]
XP_022936196.1	2.34e-75	73.49	extensin-1-like [Cucurbita moschata]	[more]
XP_022976067.1	6.98e-74	69.23	extensin-3-like [Cucurbita maxima]	[more]

BLAST of MC11g_new0264 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1CPB2	1.78e-106	86.46	extensin-1-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013490 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1F6U4	1.13e-75	73.49	extensin-1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442872 PE=4 SV=1	[more]
A0A6J1IER1	3.38e-74	69.23	extensin-3-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476580 PE=4 SV=1	[more]
A0A7J6XCN3	1.49e-67	77.88	Extensin OS=Thalictrum thalictroides OX=46969 GN=FRX31_002868 PE=4 SV=1	[more]
A0A6D2HCM3	9.34e-64	72.53	Extensin_2 domain-containing protein OS=Microthlaspi erraticum OX=1685480 GN=MER...	[more]

BLAST of MC11g_new0264 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G21310.1	8.1e-38	63.18	extensin 3	[more]
AT2G43150.1	4.6e-33	63.16	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT1G26240.1	3.9e-32	68.16	Proline-rich extensin-like family protein	[more]
AT2G15880.1	4.3e-31	70.41	Leucine-rich repeat (LRR) family protein	[more]
AT1G26250.1	5.6e-31	67.35	Proline-rich extensin-like family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PRINTS	PR01217	PRICHEXTENSN	coord: 46..62 score: 41.18 coord: 32..44 score: 38.46 coord: 83..104 score: 39.09 coord: 67..79 score: 52.31

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
MC11g_new0264.1	MC11g_new0264.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009664	plant-type cell wall organization
molecular_function	GO:0005199	structural constituent of cell wall