MC09g0917 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: utr5CDSpolypeptideutr3 Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TAAAGTCATGAATTAAATCTTCTATCTGAATAGTTGTATTTTAAGTTTAAAAATAATAGAAAATGAAATAAATAAAATATAAATATAAGTTAAAAGAAACATGGTAAAAGAAAGAGACGCATTTCCGTTGTTTCAAAAGTACTTGTTTTCTCTATTTCAAAAAGTCCGCCCAAACGAGGGCGTTGTTTATGGCGCTCAGCCAGTGGATCGCCGGAGATGAGACCGCGGCGGAGATGCTCGCCAGAGTTTTGAAACAGCGACCCTCCTTGTTCGTTCCGCCTCTCCACAGGCTTCCTCTCCGCGCCGGGAACGTCGTCGAACTTGTTGGACCCTCTGGTTCTGCCAAGACGCAGATCTTAATCCAGGTCCAATTATCGTGTTACATTATCCTTTTGAACTTCTTGTTCGATTTCTAATTGCCAAGACCGATGAAAAGTTGATTTACTTGCTGCATATTCTAATTTGAGATTGCTGCTGTGGGCAGGCTGCAGTTAATTGCATTCTTCCCAAGGAGTGGAACGGGGTCCGCTATGGAGGCTTGGAGTGTTCAGTGGTGTTCATCGACTTGGATTGTCGTCTTGACGTCTCGAGGCTTTCCCAAGTTCTGAAGCTTCGAATTTTGGAAGCCAATGGCAATGGTGAGCTATTTATATCATTTAATATTAATGAAATGTTAATATCAAGGTTGTCTTCACGAGCTGCCATTGTACTTAAGGATATTCATAATGTCTTGGGTTGTTACTCGGATTTATAATGGGTTATTATTTGGTATTAGTGTCTTCTCCCGTTGTACATCTGATATAGAACTAGTTTTAGTTATGGCTATTCTGCTTGCATGTTAAAAGTATGGCGCTCTTAGTACAATTCCAATTATTAACTATTTTTGCAAGAGGATTCTATTTCTTTACTGTGCATGGAGATTAGCAAGGAAAAAGAATTTTACTTTGATTCAAATGTGTCTATGGAGAATTCCCAAGAAAGGTCGGCAATCTGGTATTCCTTCATCACTAGAAAGGACAGTTCTGGAGGCAATGGTTGTTTTCCGTCTCTGGTCTTCAGAGGATGAATTGGAAGTCCGTGGACTGGACTGTCATCTCTAAACAACTGGAGATTTTTCTTTGATCCAACATGACCTTGAAGGTTGGAAATGGGGAGAGACTCAGTTTTATGGTAAGGGGTAGATTCCTGATGAGTCTTTTCATTCCTCTATTCTTTATCATCTGTTTCAAGTTAAAATGTTGTAGATGATTTTAGGAAGAACTTCAACGAGACAGAAGTAGAGGAGAGAATCAACGCCCCTTGAAGGATTATCTTTAAACTTCCCATTTGCAGATTCCCAAAGCGGGAATTCAGACAGTATCAGCATATGCCCTTGCAAATCTTTCCTCAATTTCTTGCTAGTGGAAGAAAGTGCGCTGCCGACCAATACACTGAAGTTTGTCTGGAAATAAATATACCTAATGAAATCCATTATTTGCTCTGCCCATTACTACTTGGAAGATCAATGTCAATGGGAGGAGGATCCCTTCCATGGTTCTCTACTTACAGGGGCGTGTGATGGGTGGAAGTGCCGAGGAAGATCTAGATCATTCGTTTGTTCACTGCTCCTTAAAGTTTATGGGGTTCTTTATTTTGAAGGTTGGAGTTTCCTATGGTATGGTTCCCCTCCCTTGCATTAGGTGGTTTGGGTCCCCAAATCTCATGACAGAGAATTTTTGTGGCCTTGTTTTGTTTTGTGCATCCTTTTGGTTTTGGGAACTTGGAAGTTGGAAAGAGAAAACCACAATGATTTTTAAGGATAGGGACAGGGGAGTTAAGAAAGTATTGAATCACATCTTCTGAGGTTTCTGTTTGAAACTCCTACTTGTGGATTTTTATGTAACTTCTCATTATTTCTAACCTCCTAATTTTGAGATCAGAGTGCTTTTCTATGTGTTCCATAACTTTGGTTTAGCGTGGGATTCTAGTCCTCTCCACCTCTTTAGCTACTTTTCTTTTTCAGTAAAACTTATTTTAAAAATCCAGTCCTGCAATGAACATTGTTGTAATTGTTATCTCTACAGGTGTTGGGTCTGTTTATATTTTAAGGTTTGGGCTTTAGTAGGATTTATGTGATTGGATTTCTCGTAGCTTTTCACTATATCAATGAAAAGTGTTTCTTGTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGTAAAAAAACACCAGAACAGTCCCATGTAGCATTGTTCATAATGAGAAATAGACTTAGTAATTTTCTGTTGTTTGCTTAGTATCTAGTGAGTGGGTGAATCAGCAGGCTATGATGTAGTTACCTGTTAAAAGGTGCCCAAGTTTCTTGTCAGTAGCTCCAGTTTACTTGTACTTGTCATTGTCTTAAGCTTTGCTACAGAACTGGCACAGAGGCCGTCAATAATCTAAGAGGCACAAACACTTCAGTTTGGATAATGTATCCGTGTTGGACAGTTTGACACATAAAACACATATCGGATACTCGTTAGCTCAATAGATGTATGTCACACACTAGCTATACAAAGTGAATATGGATTCAACAGTTGTTAGGCGCCTGTTGATAGAATTTAGAAAGGAGAGAAGATTTCGTCCACCAAGCGGGACGAAGCTGGAGTTGGTTACACACAAATCTACTTTGATTCGATATCGAGCTGTTAAACTTCCAAGAGAAAGAAGATCGACCCAATTCTTGTATTCCCTTACTGAACGGAAGGAACGGTTCCCCTACTCGCTTGCTAATTGACTATAGCTAGAACGACAGATCCTTATCAGTTCAAGTGATAGTCTTTGCCATTCGGATGTGGAAAATTATTTTGATGCACTTGTTAAGTATAAAAAATAGACAAAAATAGTAATATAGTACGAAATAATAAATTTTAAGAGTAAACAAATCAAACTCATTTTTTAAGCATAAAAATGTGTCAGCTTATTGACTTTGAGTTTCCTTCCATTCTGGCATAAAATGATATGTACTTAAAAAAGTGGTAATATTTTAACAATCGTGTCATTGTCGTGTCTGTGTCCTAGATGTTTAGAAAATGTGTCATCGACACCGTGTTGTGTCGTATCCATATCTGTGCTTCTTAGTCAATTATTAGTAATCTCCTTGAAGAAATATTGTTGGTCGTTGCTTGCGGGGAGGGCGGGGGGTGGAACTACAACTCTCAAGGTGAACCACTATTGCCAAGTAGAGATATGTATTATAAACAAAAGAGCCGAAACAGCCCTTAAAATCTTCAACATAAGCTGGTGCTTTCCAAATACTGCCTCTAACGCCCTTCTGCAGCTTTTCCAAGGACCTAATTTTAGAGGACAAGCAAATATCCTTTGGTTCATTGGAATAGCCGTTTTGGTTTGGAAATTGTGGTCTGAATGCAATAAGAGGTGTTTTTTGGACCAAGAGTAAGATAGAAGAGTCTCTTGGGAGAATGTTAGAATTTTTGTTTCTTCTGGGGCTTCTACTAACAAAGCTTTTTGTAATTAATAGTATTTCTCAAATATTTTCCAATTGGGAAGCTTTTTTGTAATTCCTTGGTTGTGGGGATATCTCATCTCCCCTTTTCTTTTGTACTTTTCTTTTTGTACTTCCTCTTTGATAATGAAAGTCTAGTTTCTTATCAAAAAAAAACAGCCCAAGGGTTGGGTAGAGGAAATCTCAACCCAGCTTCCTAATTGTTCACAAATGTGGAGAAGCTAAAATTACAAAAGATATATCTATGATTGAGATACTACCGAGCAGTGATTAAAAAAGCGTGCTTAGGCGCGTCCAAGCACTGGGCGCAATAGATGCGCCTTGCCTTGAAAAGGCGAGACGAGTGTAGTGAGGCGCGCGCCTCAAGAGAAGCCCAAAGCACAATAAGCGTGTGTTTCATGCAGTGTTGTCGAGGCGCACCTAGGTGAGCGCCTCAGGCGAGAGGCGAGGCGATTTCGCCTGGGAGCGCCTTAAATGGTGCCAAGGCGAGCGCCTTCAACCGGGCGCTCGCCTTGGTGCGCCTCCCTACGCCTGGGCACGCCCTCGCCTTATGACGAGGCGAGCGCCTCGTTGAAGCGAGGCGTTTCACGCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAAATGTTAAAAACCCACGAAAAACAACCTTGAAAACCGAATATCCAGAGCAAAAAATCAAAATACCCACACCCGAAAGGCTTTTTCCTTCACTGTGTACACCACTTTCGTCCTTGTATTATAATTTTTTCGATTTTTCTCTTCGATTCTTCCTATGTTTGCTTCAATTCTTCTTCAATTATTCAATTCTTCATCAATTCTTTAATTGAGAAAAAGAAAAAAACAATAGAAGAATTAAAATTTAAGAAAGAAAAGAACCAAACAATAGAACACTAGAAGACAAAGAAGAAGAGTTGGAGAAAAAGAAGAATCAAGGAAGAAGTTGGAGAATAATGGAAGAAGAATCAAAGAGAAATTTGAAAAACCTGCAAATTGAAACCATGTCGCTTCAGTTCTTCTCTCCTTTTCTTTTTTTACATTTCCAAGCAGCCCACCTTTTCTTTTTTTACATTTCCATTTTCCAAGCCGCTCTCCTTTTCTTTTTTTACATTTCCATTTTCCAAGCCGCTCTCCTTTTCTTTTTTTATATTTCCAAGCCACACTAAACAAGTGCTAGTGCTAGAAAATTTACACCTGCAATTAAATTGCCATCTGGTGGCAACACTCCCAATGACAATAAGCACTCCCTACTTTAATGCATGGTTTAATTTAAATACAAATGTTTTTTTATCTTTCTATTTAACCACTGTCTACTAATTTTTTTTTTAGAATTTATATTTTGAATTTTTCTTAAATATTTGAACTTAAGTTTTTAATTTTTCTTAATTATTTAAGTTAAACTTTATTTGCACATTAAATAGTTGTACAAATATTTGCATCTAGAGTATTTTATTTTTTACTAGAATTACTATAGATAATATTTATTTATTATTTTATTAAGTGCGCCTCGCTTCAGTTAGGCGT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ATGGCGCTCAGCCAGTGGATCGCCGGAGATGAGACCGCGGCGGAGATGCTCGCCAGAGTTTTGAAACAGCGACCCTCCTTGTTCGTTCCGCCTCTCCACAGGCTTCCTCTCCGCGCCGGGAACGTCGTCGAACTTGTTGGACCCTCTGGTTCTGCCAAGACGCAGATCTTAATCCAGGCTGCAGTTAATTGCATTCTTCCCAAGGAGTGGAACGGGGTCCGCTATGGAGGCTTGGAGTGTTCAGTGGTGTTCATCGACTTGGATTGTCGTCTTGACGTCTCGAGGCTTTCCCAAGTTCTGAAGCTTCGAATTTTGGAAGCCAATGGCAATGGATTGTCTAACACAAAAGACTGCGAAAATTTTAATGCACTATTTGCGACATGCATGAGAAGGTTCCTTTACATCCGTTGCTATGACAGTTTTGAGTTTCTTGCCACTCTCAAGACCATGCACCATAGACTTCAAAAAGAAAGAGATGTCCTTGGAATTGGGGTACATCTGCTCATGATTGACAGCATTGGAGCTTATCATTGGGTTGATCGCGTCTCCTCATCCTTGCCTTTGTGGGGTCACAACAGGAAAGGCTTCTCTCTTGCGAATGTGTTAGAAGCTGTAGTTGAAGAGGTTAGAAAGCTTTTGCTGGTGCATCCGAGTATTGCTATTGCTACCAAAGCAACCATTTTTGGGGATAAATCTTCTGACATGGTCAGACGTGAAAAGCCTTCAGCAGAGTCAGAATCAAGATATGTGACAACTAGTAGTGGACCACAAGTTCTGTATCGTGAGTACATGCCTTTTGCATGGCAGTCTTTTGTCACGCACAGAGTTTTTGTTCGAGGATCAGATGAACATCTTACAGTGAGCAGTAGTGAGCATCAATCAATATATTTTTCTGAATGGCTTCTACCATCTCTGGGTTTCTTCGATAAATTTATTGTTAAAAATGCTGGTGTCTTTATAGTTCCATGA MALSQWIAGDETAAEMLARVLKQRPSLFVPPLHRLPLRAGNVVELVGPSGSAKTQILIQAAVNCILPKEWNGVRYGGLECSVVFIDLDCRLDVSRLSQVLKLRILEANGNGLSNTKDCENFNALFATCMRRFLYIRCYDSFEFLATLKTMHHRLQKERDVLGIGVHLLMIDSIGAYHWVDRVSSSLPLWGHNRKGFSLANVLEAVVEEVRKLLLVHPSIAIATKATIFGDKSSDMVRREKPSAESESRYVTTSSGPQVLYREYMPFAWQSFVTHRVFVRGSDEHLTVSSSEHQSIYFSEWLLPSLGFFDKFIVKNAGVFIVP Homology
BLAST of MC09g0917 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q682D3 (DNA repair protein XRCC2 homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=XRCC2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 329.7 bits (844), Expect = 3.7e-89 Identity = 169/326 (51.84%), Postives = 225/326 (69.02%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O43543 (DNA repair protein XRCC2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XRCC2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 100.9 bits (250), Expect = 2.8e-20 Identity = 90/317 (28.39%), Postives = 137/317 (43.22%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CX47 (DNA repair protein XRCC2 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Xrcc2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 1.2e-18 Identity = 79/282 (28.01%), Postives = 123/282 (43.62%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9HJ68 (DNA repair and recombination protein RadA OS=Thermoplasma acidophilum (strain ATCC 25905 / DSM 1728 / JCM 9062 / NBRC 15155 / AMRC-C165) OX=273075 GN=radA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 8.1e-04 Identity = 25/60 (41.67%), Postives = 32/60 (53.33%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q97BJ9 (DNA repair and recombination protein RadA OS=Thermoplasma volcanium (strain ATCC 51530 / DSM 4299 / JCM 9571 / NBRC 15438 / GSS1) OX=273116 GN=radA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 46.2 bits (108), Expect = 8.1e-04 Identity = 25/65 (38.46%), Postives = 35/65 (53.85%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. NCBI nr
Match: XP_022155175.1 (DNA repair protein XRCC2 homolog [Momordica charantia] >XP_022155176.1 DNA repair protein XRCC2 homolog [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 650 bits (1678), Expect = 1.28e-235 Identity = 322/322 (100.00%), Postives = 322/322 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. NCBI nr
Match: XP_022998310.1 (DNA repair protein XRCC2 homolog isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 542 bits (1397), Expect = 6.86e-193 Identity = 268/322 (83.23%), Postives = 291/322 (90.37%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. NCBI nr
Match: XP_038891841.1 (DNA repair protein XRCC2 homolog isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 541 bits (1393), Expect = 3.35e-192 Identity = 267/322 (82.92%), Postives = 291/322 (90.37%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. NCBI nr
Match: XP_023550059.1 (DNA repair protein XRCC2 homolog isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 540 bits (1392), Expect = 3.96e-192 Identity = 268/322 (83.23%), Postives = 289/322 (89.75%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. NCBI nr
Match: XP_022957215.1 (DNA repair protein XRCC2 homolog isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 538 bits (1387), Expect = 2.29e-191 Identity = 268/322 (83.23%), Postives = 289/322 (89.75%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DLP4 (DNA repair protein XRCC2 homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022310 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 650 bits (1678), Expect = 6.21e-236 Identity = 322/322 (100.00%), Postives = 322/322 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KC54 (DNA repair protein XRCC2 homolog isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492982 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 542 bits (1397), Expect = 3.32e-193 Identity = 268/322 (83.23%), Postives = 291/322 (90.37%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GZX5 (DNA repair protein XRCC2 homolog isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458674 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 538 bits (1387), Expect = 1.11e-191 Identity = 268/322 (83.23%), Postives = 289/322 (89.75%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C491 (DNA repair protein XRCC2 homolog isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496670 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 517 bits (1332), Expect = 3.17e-183 Identity = 256/322 (79.50%), Postives = 279/322 (86.65%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KMH0 (RECA_2 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G289900 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 515 bits (1327), Expect = 1.83e-182 Identity = 253/322 (78.57%), Postives = 279/322 (86.65%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. TAIR 10
Match: AT5G64520.2 (homolog of X-ray repair cross complementing 2 (XRCC2) ) HSP 1 Score: 329.7 bits (844), Expect = 2.6e-90 Identity = 169/326 (51.84%), Postives = 225/326 (69.02%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. TAIR 10
Match: AT5G64520.1 (homolog of X-ray repair cross complementing 2 (XRCC2) ) HSP 1 Score: 329.7 bits (844), Expect = 2.6e-90 Identity = 169/326 (51.84%), Postives = 225/326 (69.02%), Query Frame = 0
BLAST of MC09g0917 vs. TAIR 10
Match: AT5G64520.3 (homolog of X-ray repair cross complementing 2 (XRCC2) ) HSP 1 Score: 278.1 bits (710), Expect = 9.0e-75 Identity = 143/249 (57.43%), Postives = 182/249 (73.09%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (Dali-11) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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