MC03g_new0414 (gene) Bitter gourd (Dali-11) v1

Overview
NameMC03g_new0414
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. Dali-11 (Bitter gourd (Dali-11) v1)
Descriptionalpha-glucan water dikinase, chloroplastic
LocationMC03: 17556692 .. 17572424 (+)
RNA-Seq ExpressionMC03g_new0414
SyntenyMC03g_new0414
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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AAAAATAAAGTAAAAGCAGTTTTTTTATTTTGTTTTATTTTATATTTCCAGAGATTTGATTGTTATATTAATATTTTCATTTTGAGAATATATATATATATATACGCACACACAAACACAAAACCTGATAAAATAATGTATTGTATTTATAACAATTTATTTTTAGAACTACTAAAACAAAAATTAATTACAACTTCTTACTGGTTAGGTAACGTGTAATCGATATTTTGAAATGTATTATTTATTTTATTATTTTTTGAGTTTCGTTATGAAAGGATAGAGAGAGAGATGATTGTGGCTCCGTGGGCCGAATTAGGGGCCCATCATTTGTTATTTGATGGTTTTTATTTTGTTAAAAGCATTTTATTTTGAGTTAGCTTCTTCTCCACGCACGATCCAACGGCTATAAGTACGGAGTCGCTTCTGTTTGGTTAGAGAAACGTCGCCTCAAACGTTAGTAGCTCTTCCTCTCCAGCCTTCTTCTCCTCCTCCTCTGTGGCCTTCATCATTCGCTTTTCTTTTCCGATCTCATTTATGGGTTTCCAGTTAGGGTATTCTCTTCTTCGCTCTCTCGCTCATTATCAGTCGATTATCGATGTTGGAAGTACGTAAAATCATATTGCAATCTTCTTCTTCTTGGTCTGGTCTCGCAGGTTCTAATCGCACTGGCTCCCGGTTTGGAGTTTTCTCAATTCCGATGGAACTCTTATTTGTTGCCTTTGTCCTCGATTGA

mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGATTCTTGAAGGAATTTTAGATCTGAAGAAGTTTTTTCTCAGTATGATGAGCACAAGAGTTTCACCAGAGGAGAAAACTCTTGTTCTAATCGTTGCCTCGGTCTCGGTTTGGAGGGTTGGCAATCTCTTAGCTCTTGAATTGGCGGGTTCTAATCTCTATATTCTTTGGCAGATTTGGAGGGTTTGTGATCTCTTGGCTTCTGATTTGGAGGTTTCTCAATCCCTAGATTCTCAAGTTTGCAGTGCAGATGGATTATGGTTGATAAACAAACCTACTGGTTCTTCGTGTTCGGGGAACAAGATTATTTTGTTCGAGATATGTGATGGTGGAAGAACAAAGATTCATTTGACTACAGATTTGCAGGGTCCAGTAACTCTTTTATGTGGTTTATCTAGAACAAATGTTGGACACTGCCTCACTGGTTCAGTTTCATTGAGCAAGGCTGCTGAACCACAGGTTATATCCGTTATTAAATGTTCTAATCGCACTGGCTCCCGGTTTGGAGTTTTCTCAATTCCGATGGAACTCTTATTTGTTGCCTTTGTCCTCGATTGA

Protein sequence

MILEGILDLKKFFLSMMSTRVSPEEKTLVLIVASVSVWRVGNLLALELAGSNLYILWQIWRVCDLLASDLEVSQSLDSQVCSADGLWLINKPTGSSCSGNKIILFEICDGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLTGSVSLSKAAEPQVISVIKCSNRTGSRFGVFSIPMELLFVAFVLD
Homology
[Close]
BLAST of MC03g_new0414 vs. NCBI nr
Match: XP_023542914.1 (alpha-glucan water dikinase, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023542915.1 alpha-glucan water dikinase, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.05e-05
Identity = 34/66 (51.52%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 0 

Query: 99  GNKIILFEIC-DGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLT--------GSVSLSKA 155
           G+K +L  +  +  +TK++LTTDLQ PVTL  GLSRTN G  LT        GSV LS+A
Sbjct: 434 GDKDLLVLVTKNASKTKVYLTTDLQEPVTLHWGLSRTNAGEWLTPPPDVLPLGSVPLSQA 493

[Close]
BLAST of MC03g_new0414 vs. NCBI nr
Match: XP_022944894.1 (alpha-glucan water dikinase, chloroplastic [Cucurbita moschata] >XP_022944895.1 alpha-glucan water dikinase, chloroplastic [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.05e-05
Identity = 34/66 (51.52%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 0 

Query: 99  GNKIILFEIC-DGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLT--------GSVSLSKA 155
           G+K +L  +  +  +TK++LTTDLQ PVTL  GLSRTN G  LT        GSV LS+A
Sbjct: 434 GDKDLLVLVTKNASKTKVYLTTDLQEPVTLHWGLSRTNAGEWLTPPPDVLPLGSVPLSQA 493

[Close]
BLAST of MC03g_new0414 vs. NCBI nr
Match: KAG7012797.1 (Alpha-glucan water dikinase, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.05e-05
Identity = 34/66 (51.52%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 0 

Query: 99  GNKIILFEIC-DGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLT--------GSVSLSKA 155
           G+K +L  +  +  +TK++LTTDLQ PVTL  GLSRTN G  LT        GSV LS+A
Sbjct: 434 GDKDLLVLVTKNASKTKVYLTTDLQEPVTLHWGLSRTNAGEWLTPPPDVLPLGSVPLSQA 493

[Close]
BLAST of MC03g_new0414 vs. NCBI nr
Match: KAG6573724.1 (Alpha-glucan water dikinase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.06e-05
Identity = 34/66 (51.52%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 0 

Query: 99  GNKIILFEIC-DGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLT--------GSVSLSKA 155
           G+K +L  +  +  +TK++LTTDLQ PVTL  GLSRTN G  LT        GSV LS+A
Sbjct: 486 GDKDLLVLVTKNASKTKVYLTTDLQEPVTLHWGLSRTNAGEWLTPPPDVLPLGSVPLSQA 545

[Close]
BLAST of MC03g_new0414 vs. NCBI nr
Match: XP_038892070.1 (alpha-glucan water dikinase, chloroplastic [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 1.43e-05
Identity = 34/66 (51.52%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 0 

Query: 99  GNKIILFEIC-DGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLT--------GSVSLSKA 155
           G+K +L  +  +  +TKI+L TDLQ PVTL  GLSRTNVG  LT        GS+ LS+A
Sbjct: 435 GDKDLLVLVTKNASKTKIYLATDLQEPVTLHWGLSRTNVGEWLTPPPDVLPRGSIPLSQA 494

[Close]
BLAST of MC03g_new0414 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FZC6 (alpha-glucan water dikinase, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449288 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 5.09e-06
Identity = 34/66 (51.52%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 0 

Query: 99  GNKIILFEIC-DGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLT--------GSVSLSKA 155
           G+K +L  +  +  +TK++LTTDLQ PVTL  GLSRTN G  LT        GSV LS+A
Sbjct: 434 GDKDLLVLVTKNASKTKVYLTTDLQEPVTLHWGLSRTNAGEWLTPPPDVLPLGSVPLSQA 493

[Close]
BLAST of MC03g_new0414 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DWY3 (alpha-glucan water dikinase, chloroplastic isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488983 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 9.16e-06
Identity = 33/66 (50.00%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 0 

Query: 99  GNKIILFEIC-DGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLT--------GSVSLSKA 155
           G+K +L  +  +  +TK++L TDLQ PVTL  GLSRTN G  +T        GSVSLS+A
Sbjct: 146 GDKDLLVLVTKNSSKTKVYLATDLQQPVTLHWGLSRTNAGEWMTPPPDVLPPGSVSLSQA 205

[Close]
BLAST of MC03g_new0414 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CYW7 (Alpha-glucan water dikinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold35G001230 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 9.34e-06
Identity = 33/66 (50.00%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 0 

Query: 99  GNKIILFEIC-DGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLT--------GSVSLSKA 155
           G+K +L  +  +  +TK++L TDLQ PVTL  GLSRTN G  +T        GSVSLS+A
Sbjct: 435 GDKDLLVLVTKNSSKTKVYLATDLQQPVTLHWGLSRTNAGEWMTPPPDVLPPGSVSLSQA 494

[Close]
BLAST of MC03g_new0414 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BEF3 (alpha-glucan water dikinase, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488983 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 9.34e-06
Identity = 33/66 (50.00%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 0 

Query: 99  GNKIILFEIC-DGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLT--------GSVSLSKA 155
           G+K +L  +  +  +TK++L TDLQ PVTL  GLSRTN G  +T        GSVSLS+A
Sbjct: 435 GDKDLLVLVTKNSSKTKVYLATDLQQPVTLHWGLSRTNAGEWMTPPPDVLPPGSVSLSQA 494

[Close]
BLAST of MC03g_new0414 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SUY4 (Alpha-glucan water dikinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold65G002920 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 9.35e-06
Identity = 33/66 (50.00%), Postives = 42/66 (63.64%), Query Frame = 0 

Query: 99  GNKIILFEIC-DGGRTKIHLTTDLQGPVTLLCGLSRTNVGHCLT--------GSVSLSKA 155
           G+K +L  +  +  +TK++L TDLQ PVTL  GLSRTN G  +T        GSVSLS+A
Sbjct: 448 GDKDLLVLVTKNSSKTKVYLATDLQQPVTLHWGLSRTNAGEWMTPPPDVLPPGSVSLSQA 507

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MC03g_new0414 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MC03g_new0414 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_023542914.11.05e-0551.52alpha-glucan water dikinase, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_0235... [more]
XP_022944894.11.05e-0551.52alpha-glucan water dikinase, chloroplastic [Cucurbita moschata] >XP_022944895.1 ... [more]
KAG7012797.11.05e-0551.52Alpha-glucan water dikinase, chloroplastic [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
KAG6573724.11.06e-0551.52Alpha-glucan water dikinase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subs... [more]
XP_038892070.11.43e-0551.52alpha-glucan water dikinase, chloroplastic [Benincasa hispida][more]
BLAST of MC03g_new0414 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1FZC65.09e-0651.52alpha-glucan water dikinase, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1... [more]
A0A1S4DWY39.16e-0650.00alpha-glucan water dikinase, chloroplastic isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN... [more]
A0A5D3CYW79.34e-0650.00Alpha-glucan water dikinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaf... [more]
A0A1S3BEF39.34e-0650.00alpha-glucan water dikinase, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN... [more]
A0A5A7SUY49.35e-0650.00Alpha-glucan water dikinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaf... [more]
BLAST of MC03g_new0414 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MC03g_new0414.1MC03g_new0414.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0007049 cell cycle
biological_process GO:0050896 response to stimulus
cellular_component GO:0043229 intracellular organelle