Lsi06G008700 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi06G008700
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr06: 18211357 .. 18217727 (-)
RNA-Seq ExpressionLsi06G008700
SyntenyLsi06G008700
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGGATCCAGCAATCGGGCACTAAATAATACTGTAAACGCTTCTTCAAATTGGTCTGTGCTGTGTAAGAAGATGGCATTGGCGAGCCAGGAGCATGGCAGCGAGTACAGCGAGCCATACCATCCGGGTCTCCGAAGGCCAAACAACCAGGGAAGTAGAGATGAGAACGATGAAGAAAGAAAGTTGAGGTTTTAGTGGAAGCTTGTGAGGAAGCAGAAGATTCATTGTGTAATATGTACAATCTACAACACCTTTCTCTCTTTCTTTTGGATTAATGTTTGGATTATAAGGATTCTTTCATCAGTCAGTTGGCTTTGTAAAATGGAAGAGAGTTGAGATAAAAGATTGGACTAGATTTTGCGCACGCAAAATGAGTTATAAAATGGATTCTGATTCTTTGTTTGTTCTCTGCTGATTCTGAATAGTACCGCCTCTCGAGGTTCAAAGTACTCCTTTTAATGGTTGTATTCATTGGAAAATCGTCACAAATAGCTCTAAAATATTTTTCCTTTTTACAACTAGCACATTTTTTAGAAACTTGTTCAAATAGTTTTTTCCGATCCTTTCCAGCCGAGCTCGGAACCGAGATTGAGTTAAAAACATAAAAATTTTAAATCAGCCAAGTATTTGAATTCATTAATAAAAGGGTCGATTTTATGTTTATGCCCCCAATTATTATATTATTTTATTATTATTAAATCAATATTTTAGAAACCCACACTTTGGCTTGCTCAACAAATTTAGGTTCTCAAATATCCTCATTCTCACATTTTGAGTTTTTCTTCTCTTTTCAACACTCTCTTTACACAAAATCACAAAAGAAGGTATATATCTGGCTCTTCTCTTTTTAAAATGATGTTTAGTTTCGAATATGCATGTTGTTGAAAAAAAAGTGTTTTGCGTGAGTGTGTACGTAATCTTGATTCAAAATATAAATCTCGTTTGAGATTAGACCTAATTGCCTCAAGATTGTCTAATGAAATAAAGCTCGGGCGAGATGTTGACATTTCTTGATTGAGATACAGAATTCTCCTCAAGAATTTGACAGTTTTGTGTAACTTTCTATTTATCTGTTTGCTTTTATTCCGGATGTCTCGCATATTTGTCTACTTTGGTGGCAAATGGAAGAAAACTGAGAAAGAATATGTAGGAGGCCAGTTGAAAAGTTTGATTGCTGATGTTGGAATAGCGTATGAGGACTTTTTACGTCAAGTATATAGAATAAGCGGGATAAATTCTGCTGAGTTTGAGTTGGTTCTAAGGTGTCTATATACTATTAGGCTAAATGTTTTTGCTTTTGTGATTAGTAATAAAAAAGACCTTCATTTTTTTTCTTAACGGGTCATGTGTATCTCATATGGCTCTTTTAGTGTCTAAGGTACCAATTGTAGTGCAAAATACTAGGAGTATGGCACCGTTATTTCCCAATCCCAATGGTGCAAATATACCCTCATTTCCCTCCCACCTTGATTTTGTTCCTAAATACGACATGAGTTTAAATGACGTGTGATCCCTAAGTCCATTAAATAATGATGTTGTCTCACTTAAACTAGGAGAAGATACGGATGGGTTGTTGAATAGAGAGTCGGTCTTCGATGTAGATATGTAAATAGATTCTAATGTCGATGTTAGTGCGGAGAATGTGAATACATTTGAGGCAGTGGTTAATATCCTCCATAGTGACTCACTCAACGATCAACATTCAATGACCACGGAGGTAGAGTCAACGATGAATATAGAATCACAGATTGATAGAGGACCGTCGAAAGAGAGTCACCCGACAATTAACGGTCAATCTTCTATGGATTTGATGAGAAGTAGTGAGCTGGTCACCAATCGTAGGAAGAGGAAGCATACCTCACAAGGATCGATCAACCCCATTATCATCTCATTTGAGTCCACCTCGTCTATAGAGGATGTCCAGGTTGGTAACCTGTTTTTATGTAAGAAAGATTTGTGCAAAAAATTGTCAGTCATTACCATGAAGAAAATTTTAAGTGTAAAGAGTAATCTAAGTAGGAAAAGGTAAAAAGACAATATTGTTGATTTTTTGGCCTTTAATCTCAAATTAATTAATTTTAATTAATTAATTAATTAATGTTTTGAGATAACAAACCTGATTTTGTTTACTAATAATTTTATTATTTTTAATAGCCCATAGTATAGAGCTCAATACAACGATTCTGATGCCTCTTGAATCACCCAAATCAGAGTTCAAACGAAGAAGTTATCACCTAAATAAAGTTAACGAAAAAATACCCGAGGTGGTGACGTGGCCAAATTAATCATCAAATTGGACTAATTAGGGAGTGCCACTTGGAGCCATAGAGGGAGTGACACATGGGGTTTAATTTTATTATTGATGGATTTTAATTTTATTTAAAAGAAAAGAAGACTAAAAAATATTGATTTTGAAAAAAAAAATTTAAAAAGAAAATAAATTTAATATTATATATATGGTTGTGTCTAACGCTAGTTATTTTTAAACGCAAATGAATTTAATATTATATATGTTTGTGTCTAACAGCTAATTTATTTTAAAATTAAAAAAATATTACTTTTTTCCTTTTAATCTCAACTACTCAATTTCTTTTTTATACAATCCAATGGCCCAAATTTAAATTCAATTTTTTTAGTCCACTTCCCTCTCTTTTTAAACTTCATCTTTCTAAAATTGTTTGAACTTTTTCACACTTTTCAATTCTTAAAATTAGCAAAAGGCCACCATTGTTGCTCTCTCTCCAAGCTTCCAATTTTTATTCTTTTCATCTTATTCTTGGGAGAAATTTCTATTGTATTGTGAGGATTAAGGTGTGTAACCTCAAAATTTGTATATCCACTCTTTTTAGAGAGTTTTATTGTGTGATTTAAAACTTTCAACACCATTGTAACAATTTGATCCTAACCCGTGGAAATGGTTGAGTTTGCTCTTGAACCCGAAAAAGGAGCAAGGTAGCGGTTCGGCTCTCATCTGTGGAAAGAGTCAAATGAGATTTTTAATTGAAATCCCAAGAGGCGCTTGAAAAAATGGATGTAGGTCGAGTTTGACCGAACCACTAAAAATTACGGTGTCTTCTTCTCTAACTCTTTTCTAATTATTTTTGCATTTAATTTTAATGGAATGTTTTTGTTGGTTGATATTGATTAAGTTTATTATTACCTACTTTTTATTATTTGACATCAATTAGAGCTTTTATTAATTTATTTTAAAAAGTATTTAATTAGTTGAAAAGTTAACCCATTCACCCCTCTAGACTATACCGGTCCAACAAATATGACAAAGATATTTACAGTAGTGTTATAATACTAATATTAGCACTATAACAAACTTCAATCAACCAAATAATCAAAGTCTTTGTTTCTAAAGAAATGTTTTCAATACTCTTTTTTTCTTTTCTTCTTCTCCAAAAACCGGGTAAAATTCAAAATTAATGTTAAATTTTGAACTATTGACAAAAATAGGGTACATAGTAAAGAAATCTAAAAAATAGTGTGGTTGAAGAAAATATTGACAAAAATAAGGTGGTGAAATCGTGTACCCCGTACACGATTTCCACGTGGCTTCCACGTGGTTGGTCAATGGGACCAAAATCGTGTACGGGGTACACGATTTCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTAATCAACAATTACATTTCTTAATATTCTTGTTTTATAGCATACTCATATAAATGCTTCTGAAGATTAAAAATTCATAAAAACTTAAACTTTAAATTACAAACGAGTCATGTGCCACATGGTGGACGTCTTCGTTGACGGTGTGGACGACGAGGTACAGGCACTTCAAAGTGTTGTTGTTGATGAATTAATTCATCAATATCCTCTTGGGTGACGACGGATTGATGTTCATAATACTCTTGTTGATTGCCAAAACTCGATCCGATCTCTGCTCTAGGAGAAGTTGGACCTGGATCATGAAACATTGGAGGTTCTGGTTCTGGGTCAACTTGTTCCTCTGGAATAGCTTCACCCTGTTGGCGTTATCGTCTACGACGAATACGTCTTCGATCAGTGTCAGCAACATTAAGTCGTCTTGTCTGCTGAATAATATTTTGTACATTTACCAAGTTTTGATCACACATTGTAGTCAACTCTGGTAAATCTTGTTGTACAGAATATTGATGTACATCGTGGACAAAATTATTCTGAATGGTGAAAAATTTTAGTATTAAATAATGTTCATATCATATAAATAAAAAATATAAGATTACAAAACTCTTACCATGCAGTAGTAGTAAGCACCGTCAGGGGTGATAAATCGCCTCGTGATTGAATCGTACCAGGGAAAGTAGTCGTCTGATACAGCTGGGCCATTTGTTATTTCTCCCTGTACGCAACGGTTACGACGTGCAATCTTTCTAACAATTTGCAATTTTTCTAATAAATATGCTAATACAGAAACTTATTGCAGATTGTTGCTACTGAAATTGATGTGCCAGTTGTTGGTATAGAAATTGATAGGGCAGAATCTTCTAGTTCACCAACATATGTAAGCTAAGTATAGCTTTTCATAGAGCTAGAAAAGTTGGTGTTGGACCTCCAAACAGGTATGGTTTTGAGGATATGATGGAAAAATATTTACTGGAAAAATTGCTTCATCAAAATTGCAAATACGAGAATTTCACTAACAACATGCTCAACAGGACCAAGTGCATGACACATGGAAATAAAACATTCATAGAGAAAATTGTTATGGACAAATTTAGCCTAGTTAGTGGGACCCATGAAGTAAGTTAAGTGGAGCTAGGAGTCTAGGAGAGAGCTCAATAGAACCCATGGAAGAGCCTAAGCAAACTTAGAGAGAGTTCAGTAGGACCTATGAAGTAAATTAAGTTGAGTTAGGAGCCTAGGAGAGAGCTCAATAGAACCCATGGGAGAACCTAAGAGAGCTTAAAGGTAGCTCAGTGGGTCCCATGAGGTAAGTTTAATGAAGCTAAAGCCTAGGAGAAAGCTCCATAGGATCCATAGGAGAGCTTAGAGAAAGCTC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mRNA sequence

ATGGGATCCAGCAATCGGGCACTAAATAATACTGTAAACGCTTCTTCAAATTGGTCTGTGCTGTGTAAGAAGATGGCATTGGCGAGCCAGGAGCATGGCAGCGAGTACAGCGAGCCATACCATCCGGGTCTCCGAAGGCCAAACAACCAGGGAAGTAGAGATGAGAACGATGAAGAAAGAAAGTTGAGATTGTTGCTACTGAAATTGATGTGCCAGTTGTTGGTTCCAAGTAATAAGTATTCTTACCAAATTCTTGTGGAGAATGCTATAACAAACAATTTTGCATCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGATCCAGCAATCGGGCACTAAATAATACTGTAAACGCTTCTTCAAATTGGTCTGTGCTGTGTAAGAAGATGGCATTGGCGAGCCAGGAGCATGGCAGCGAGTACAGCGAGCCATACCATCCGGGTCTCCGAAGGCCAAACAACCAGGGAAGTAGAGATGAGAACGATGAAGAAAGAAAGTTGAGATTGTTGCTACTGAAATTGATGTGCCAGTTGTTGGTTCCAAGTAATAAGTATTCTTACCAAATTCTTGTGGAGAATGCTATAACAAACAATTTTGCATCCTAA

Protein sequence

MGSSNRALNNTVNASSNWSVLCKKMALASQEHGSEYSEPYHPGLRRPNNQGSRDENDEERKLRLLLLKLMCQLLVPSNKYSYQILVENAITNNFAS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 32..58

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi06G008700.1Lsi06G008700.1mRNA