
Lsi05G007590 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGTTTTTGGAATGATGTTCTTTGGAGTTTTGTTTAATTTGTTAATCTTAGGTGCAGGTGCAATTTGTTAATCTTAGGTTGATGGAATTTTAGGTGCTAGTTTGATTGACAGGTATTTTTAGGCACATCATAGAATTCTATCTTAAACACAGCTTCAAACTTTGTATAAAATCTATCAAAGATAGATGGAGATAGGATTCTATCTGTAATAGACAACTGGATTTTCTATCAAAGATAGACAAAGATAGAATTCTATATGTGTATTTCTATCAAAGATTCTTCAAACTTTGTATAAAGAGTCTTCAAATCTTGTATCAAAACTATCAAATATTGGACATGTAAAATCTTGTAGTAGTAGATAGATGGATATCCATGACAGTTTTGCCATATTTTTTCATCTTTGTCACAGTTATTTGGGATGGCTTATTTAAGTTATTGAATGCTTCAAAGCAAGGTTAACCTTTTTCTTCTCTAACTTACTCATTTTCATTTTCTTCCTTTTTTTGTGAATAGATGGAGAGCAAAAAAATATCAATTATCAAAGGAGAATCAAACAAAACAAAAACAAAAACAAAACCAAACTCTCAAAGATCTCAAAAGGTATAAAATCAAACTAGAATGTGATAGTTTCTGTTGCTTTCAAATCATTTCTATTTGATTCAAACATGTTACATTGAGAGTGATGGAATTCTATCACAGTTTATGACGTGATAGACAGTGATAAAATTCTATTTATAGACTGTTTTCAGTTTCCATTTGATTTAAACATGTTATTCTGTTTAGATTGTCACTTTTGTGTTAAAGTTTCTATTCTGACATATTGTTTTAATTTATCTTTTAAATAGGGTGTAGGTGTATTATTAATGGAAGATTTAAATAAATACTTGAGGAAGATTACTCTGTATTTTACTTTAGATGTATTAGATTTGATAAAAAAGAATTTAGATCCAACATATTGAGGGCTTTTAGAAACGGTCCTTTTGGCCCTTTCTTAGATATTAAGATGGCTAGAATACCGACCCAAGTCATCAACTACTTGCTTAGATGAAAATGTTCAAGTAGTAGGCCAAATGTGTTGGCTTTCAATTTTAATGGACAAGTGGTTGAATTTGGACTCAAAGAATTTTATATTGTAACAGGGCTGAAAGGTCATGAATACCCCTAGATTCAAATTTAAATTTAAATGAACAAAATAAAAATGAAATGTCTCACCTAAGGTTTATGTTTAAGAATGACAAAAACATCACAATGAAAGATGTAGATAGAACCTTTAAGATGTTAAAAGATTCTGAACTTGAGACAACAAAGATCAAATTGGCCAACTTATATCTGTTGGAGTGTTTCCTCATCCTTAAGCAGAACTACACATGTATAAATCGGAAGCACGTAGACATAGTGGACAATGATCAACTCTTTAGAGAATATCCATGGGAGAGAGTTTCTTATGACCTTATGTATGAGTTTTTCAAGAAGGATCCCGTACACAGACAGATGCAGTGTACCTACAAGGATTCCTATTTGCATTCGTTTATTGGGCTTTTGAAACCATTCCAAAACTTTCATTCTTAGATATAGGATTTGGAAAAAAAATAGGAAACCAAAGCCCTAGAATAACAAGATGACAATGTTTGCAGCCCGATAATTGGAGAAATCTTCTTCATGAAAACATCTTTCAAACCAATGATGTAAGTAATTGTTCTCTTATCTAATTTCTTTACAAGATAGAATTCTATCAGATAGACTATCTATATAGAAAGGGATAGAATTCTATCTGTGTCTATCACGTGATAGATACACACGGATAGAATTCTATCACTGTCTATCGATAGAAAGTGATAAACTATTAATATTTGAATTTTGGTCTAATGATTTAAATGTGTTTATATGTAGTTTTCTTTTATTCAAATTGTTCTGACTAAAATGAAGTTGAATCCTTCCAATATTTTGTGGATTTGGAGAAAAAGGAAAGAGAGGAAAGAGAACAAGAAGAAAGATAAAAGAAAGAAAAAGATAAGGGAAAAAATCATGTCGAACAGGAAGAGGAGGTGGGGGAAAAAAGAATAAGAGAACAAATAGAAGAGATCAAGAAAAGCCAACTGAGACTTGAAGAAGGACAAGAACAGATAAGTAAACTTTTAGTGTCTTTTTTGCAAGTTTTAAATGATAGAATCTCCTCATGAAGATCTTGGTAAAGAGTCTCAAGGTTCACATAATTCCTTAAGACTATTCATCAAAATAATAAAAACTATCAATAAAAAAATTCCCCAAACACAAAAAGAAATAGAAAATCTTGATCCTTCTACCGAGAAAAACAAAGCCCCGGCCATCTTGTAGTCTTCAACTTCTTGAAGAATCTAATGAGGAAATTGATAGAATGGTTGAGTATGCCGCCAAATATATATCAGAGGTAAGATTTGACTTCAATGTGGCTTTTTATATTATTTATATCTCACAAAAGATTTACTAATTAAAATTAATTATATCTAGATTGAAGTTGATAATGTTGATGATGAGATGCAAGAAAAAGACTGTGAAGGAAAGGTTTGTGTATAAATTTGTGTATAGATAGACAATGATAGAATTCTATCACTGTCTATTAGTGATGTCTTATTCTCCCAAGTTTTATTTTTTTTTTATTATTTTTTTTTTTGCAGGAAGCTAACATCCAAACAACTGAAAACATTGAAATACAAGAAGTTGAAACACAAAAAAGTATTCCAACTCAACCCTTGGAGTCACCAGAGCTAGGACAAACACAAATACAGAAATTGCCAACGCAAGAAAGTATTCCAACTCATCACTTGGTGTCACCAGAGCCAGGACAACACATAGAAGTTGCAGACACAAGAGTTGGAGGTTATGTTCCTTTTGAGTTTTGAGTCATATCTTTTAGTTGGTTTGATATTCTTTTCTTTTTTTTTTTTGTATATATCTCGATAGAAAGTCTATCACTGTCTATTGCGATAGACAGTGATGGAATTCTATCACTATATGTTTATCTCAGCATTGTCTATCTAAATAGAAAATAATAGTAATAAATAACACAATTTATTGCAGGATATTGAAGTTCAAATTGAAGAAATTGTGAAAGTTTACATAGAAGAAGAAACAAATGAGCAAAGAGAAAAAGAAACAAAAGAAAATGATGAAACTGATGAAGAAGAAAATCGAAGAAGAGAAAATACAACAAAAAAAGGTTACATGAACTTAGATTAAAAAAAAAGTAGTAGACAATGATAGAATTCTATCACTGTCTATTACTAATAGTATTCTAACTTGAAAACATTTTTTTTTTGCAGCAACAAGAGAAAGTGCAGGAAGTTGAGGAAGATACTAATGAAGAAGATGTTAATGAAGAAGATGCTAATGAAGACAATGAAAAAAGACAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGTGAGAAGAAGGTAAATATCAAACTAGTATATTCATTCTCTTACATTCAACCACTATTATATTACCAACATTCTTCCAATTTCATTTCAGGTTGTTCAACAAAAAGGAAAGGCTAAAAAGTATAGACCGAAGGTGGCTGTTAATACCCACGTTAAAGATGAAAGGCCAAAGCGACAAAGAAAACCATCACAAAAAGCATTGGACAACAAAGTCCCACCAATGAAAATCAAGGAAAAGAAGAAAGTATCTCCAAAGAAGTCAACAACAGGGACCTCGTTGATGGACAGTGCGCCAAGCTTCGATTTAAACATTTCTCAACTTAAATCTCAATCTCAATGACTTGACTATAGATTTATTTTTCTTCAATTTAGGACTACATATTTAGTACTAGTTTTGTATCACTGGTTGTAAATTCAATACAATGTTCACTTGTTACTTTTAATTTAGGACTACATATTTAAGACTATTTTTGTATCACTGGTTGTAAATTCAATACAATGTTCACTTGTTACTTTTAATTTTGGATGGAGTTTGGTTGATGGAATATTTATGTTCATTCATGAAGTTTTTGGAGTGAAGTTCTTTGGAGTTTTGTTCAATTTGTTAATTTTAGGTGCAAGTGAAATTTGTTAATCTTAGGTTGATGGAATTTTAGGTGCTAGTTTGATTGATGGAGATTTTTAGGCACATCGTAGAATTCAATCTTAAACACAACTTCAAACTTTGTATGAAATTTATCAAAGATAGATGGAGATAGAATTCTATTTGTGTCTATCTGCAATAGACAGAGATAGAATTCTATCAAAGATAGATAGAGATAGAACTCAATTTGTGTCTATCTGCTATAGACACAACTAGAATTTTCTATCAAAGATAAAGTCAAACTTTTATTTAGAGATAGACATAGACACAACTAGAATTTCTATCAAAGATAAAAGTTTTCAAACTTTGTATGAAATCTATCAAAGATAAAATTCTATTTGTGCGATAGACACAACTAGAAGACTAATAGTCTTCAAACATTGTATGAAATCTATCAAAGATAGAAAGAGATAAAATTCTATCTGTGTCTATTTGCGATAGACAAAGATAAAATTCTATAAAAAATAGACAGAGATAGAACTCTATCTATGTCTATTTGCTATAGACACAACTAGAATTTCTATCAAGATAAAGAGTCTTCAGTTTATGTATGAAATATGAAATCTATCAAAGAGGATTATTAAAATCTCCAAACTTTGTATAAAATCTATCAAGGACATAAAGAGATAGAATTCTATATGTGTCTATCTTCAAACTTTGATTTAGAGATAGAATTCTATCTGTGTCTATCTACAACAAACGCAACTAGTCTATAAAAGATAAGAGTCCTCAGACTTTGTATGAAATAATTTCTATCAAAGATAAGAGTCTTCAAACTTTATATGAAATCTATCAAAGATAGACAGAGATAGAATTCTATATGTGTCTATCTGCGATAGACACAAGAATCTTTATCAAAGATAAGAGTCCTCAAACTTTGAATGAAATTTAACAAAGATAAATAGAGATAGAATTCTATCTGTGTTTATCTGCTATAGACACA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MKCFRLICTHTTHLTREVPTVSYQNYFAPLQRVPFFADHSHSKFKASGILSGLNKQLTNGEFSDDGYPREGTILPDCMSSYNLYLLHFFFTDVFAAQFCMLMLGLTCTSKDKDYRYMATSDLLNELNKETFKADTDLEIKLSNIIIQQLDDAAGDVSGLAVKWPLTSMLVAYQATAIPIDDYFFVIFLAPLVKKVSETRVVEMTNKLCDKLLNGKDQHRDVASIALKTVVAEVSVPSLAQSILISLSPQLIKGITTAGMSTEIKCESLDILCDVLHKFGNLMANDHELLLSALLSQLGSNQASVRKKTVSCIASLASSLSDDLLAKATTEVVRSLRIKSTKAEMTRTNIQMIGALSRAVGYRFGPHLGDTVPVLINYCTSASESDEELREYSLQALESFLLRCPRDISSYCDDILHLTLEYLSYDPNFTDNMEEDTDDESHEEEEEDESANEYTDDEDLSWKVRRAAAKCLSALIVSRPEMLSRLYEEACPKLIDRFKEREENVKMDVFSTFIELLRQTGNVTKGQVDMNELSPRWLLNQEVPKIVKSINRQLREKSIKTKVGAFSVLKELVVVLPDCLADHIGSLIPGIEKALSDKSSTSNLKIEALIFTRLVLASNSPSVFHPYIKDLSSPVLSAVGERYYKVTAEALRVCGELVRVVRPGIEGQGFDFKQYVHPIYNAIMSRLTNQDQDQEVKECAISCMGLVVSTFGDNLKAELATCLPVLVDRMGNEITRLTAVKAFAVIAASPLQIDLSCVLEHVISELTAFLRKANRALRQATLGTLNSLIAAYGDKIGPSAYEVIIVELSTLISDSDLHMTALALELCCTLMGDRRSSPSIGLAVRNKVLPQALLLIKSSLLQGQALVALQSFFAALVYSANTSFDALLDSLLSCAKPSPQSGGVAKQALFSIAQCVAVLCLAAGDQKYSSTVKMLTEILKDDSSTNSAKQHLALLCLGEIGRRKDLSLHAHIENIVIESFQSPFEEIKSAASYALGNIAVGNLSKYLPFILDQIDNQQKKQYLLLHSLKEVIVRQSVDKAEFQDSSVEKILNLLFNHCESEEEGVRNVVAECLGKIALIEPGKLVPALKVRTTSPAAFTRATVVIAVKYSIVERPEKIDEIIYPEISSFLMLIKDHDRHVRRAAVLALSTFAHNKPNLVKGLLPKLLPLLYDQTIVKQELIRTVDLGPFKHVVDDGLELRKAAFECVDTLLDSCLDQVNPSSFIVPYLKSGLDDHYDVKMPCHLILSKLADKCPSAVLAVLDSLVDPLQKTINFKPKQDAVKQEVDRNEDMIRSALRAIASLNRIRH Homology
BLAST of Lsi05G007590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L5Y6 (Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CAND1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1864.4 bits (4828), Expect = 0.0e+00 Identity = 977/1197 (81.62%), Postives = 1083/1197 (90.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P97536 (Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Cand1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 884.8 bits (2285), Expect = 1.2e-255 Identity = 518/1206 (42.95%), Postives = 771/1206 (63.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7MBJ5 (Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Bos taurus OX=9913 GN=CAND1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 884.4 bits (2284), Expect = 1.6e-255 Identity = 518/1206 (42.95%), Postives = 771/1206 (63.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q86VP6 (Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAND1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 884.4 bits (2284), Expect = 1.6e-255 Identity = 518/1206 (42.95%), Postives = 771/1206 (63.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6ZQ38 (Cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Cand1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 884.4 bits (2284), Expect = 1.6e-255 Identity = 518/1206 (42.95%), Postives = 771/1206 (63.93%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BTD2 (cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493300 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2182.1 bits (5653), Expect = 0.0e+00 Identity = 1162/1197 (97.08%), Postives = 1164/1197 (97.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C8K0 (cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008417 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2182.1 bits (5653), Expect = 0.0e+00 Identity = 1157/1197 (96.66%), Postives = 1166/1197 (97.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EU84 (cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111435968 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2167.1 bits (5614), Expect = 0.0e+00 Identity = 1153/1197 (96.32%), Postives = 1162/1197 (97.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J9S5 (cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482588 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2162.5 bits (5602), Expect = 0.0e+00 Identity = 1151/1197 (96.16%), Postives = 1161/1197 (96.99%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FUQ7 (cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447457 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2155.9 bits (5585), Expect = 0.0e+00 Identity = 1146/1209 (94.79%), Postives = 1164/1209 (96.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. NCBI nr
Match: XP_038903779.1 (cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2185.2 bits (5661), Expect = 0.0e+00 Identity = 1159/1197 (96.83%), Postives = 1167/1197 (97.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. NCBI nr
Match: XP_022136812.1 (cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Momordica charantia] >XP_022136813.1 cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2182.1 bits (5653), Expect = 0.0e+00 Identity = 1157/1197 (96.66%), Postives = 1166/1197 (97.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. NCBI nr
Match: XP_008452214.1 (PREDICTED: cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Cucumis melo] >XP_008452215.1 PREDICTED: cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Cucumis melo] >XP_008452217.1 PREDICTED: cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2182.1 bits (5653), Expect = 0.0e+00 Identity = 1162/1197 (97.08%), Postives = 1164/1197 (97.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. NCBI nr
Match: XP_004133735.1 (cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Cucumis sativus] >XP_011650579.1 cullin-associated NEDD8-dissociated protein 1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2171.0 bits (5624), Expect = 0.0e+00 Identity = 1154/1197 (96.41%), Postives = 1160/1197 (96.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. NCBI nr
Match: KGN56297.2 (hypothetical protein Csa_011215 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2170.2 bits (5622), Expect = 0.0e+00 Identity = 1163/1232 (94.40%), Postives = 1173/1232 (95.21%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. TAIR 10
Match: AT2G02560.1 (cullin-associated and neddylation dissociated ) HSP 1 Score: 1864.4 bits (4828), Expect = 0.0e+00 Identity = 977/1197 (81.62%), Postives = 1083/1197 (90.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi05G007590 vs. TAIR 10
Match: AT2G02560.2 (cullin-associated and neddylation dissociated ) HSP 1 Score: 1864.4 bits (4828), Expect = 0.0e+00 Identity = 977/1197 (81.62%), Postives = 1083/1197 (90.48%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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