
Lsi03G014830 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTCAAGGCAGTAAATTTGGTTATGACGTTACGGGGGTGGTGATGTCCATAAATAGCTCCTTTTTTTAAGCAGAGAATTGCAGCCTAAAGCGAACAGCCACTGACTTATTAGTCTATTATTAACCTTTCTCCTATTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCCCTTTCTCCGATGGATGATGAATCTCTCCATCGCACATTATCAGGCAACCTCCATGCGCCGCTTCTAAACGGAGACAAGCAAAACGACGTCGAACAGCAACGAATCACCGCCACCAATGGCGGTGGCGCCACCTCCTTCATCAAAACCTGCTTCAATGGACTCAACGCTCTTTCAGGTTCTAATTTTCTCTCTCTCTATATATATTTTTTGTTTGATTTTGTTTGTTGTTGCCGCCACCGCTTCTCCGCCGCCTATGGTTTTCCTTTTCTTCTAGGGTTTCCAAATGCTTGGATTTGATCTTATCTTCTCTCTGTTTTATTCACCAAGTGAAATTGAGAGTTTACAGATAAGAATGCTAGTTGAATCTTATTTTAGACACATGTTTAGGAATTAAAAAAGAATAATAATAGACCCAAGTTGAGAATTTAATACATATTAATGGATCTGCATCTTAAATTACCGTCGAGCTAAACTAACTTAAAAAAAAAAAAGATAGTAATGCCTCTTATTTCAATGATGTAATTTATATATTAATTTTTTTCTTAAGTAGAAAAGTTAAGCTTTTAACTTCAAAATTGATAGTACAAATAGGAAGATATTTGTTTTCTCACTAGCTGCTGATCTTACGAGGCTCGTCTCTTCAAAGATTACAGTCCTTCTACTATAGCAATAAATTTATAAGCTTGTTGTAACAATTAGATCGTTGGGGTTTTTTCTTCTAGTCCTTTTGTGTACTTATCCTACTCTTTTCATGCTTATTGAATATCAATGTAAAGGGAGATGATGAGGGTGCTAAGATGGTGTCTACCTAGTGGAGATAATTAGGTGCACTTTTGTTCTAATGTATCTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAATACAGCCTAGAGAGCACTAAGTATACTAGTAGAAATAGATTTTTAAAATATTACAACTAAAATTACTTTTTGTTTAGAAATAGATTAAACAGGTGTTTTGGAAAAATTACCTGGTGTAGCTAGATAAATAATTAGAGACATATTAGAATGTTCTTAGTGTGGTTTCAAGGTAATGGTGTGAATTTATTAACCACTTTAATTATTTCAGTCTCTTCAAATAATTGATACCTAATTCTACTGATTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTGTCTACCATGTTCTATGAAAACAAATTTTTCTAACCACATTATTACGCAGAAGAATCTAGAAAATGAAGAAAAAAAATTACTAAATAGATTTTTATTGGAATTTCTCAAAAGCTTTTGAAAAATTATAAAGAAAACATTAAATCAAATTAGGATAAAAAAACAAGAAGCATCGTTTTTTGAATGAGTTGATTCTTAGCGGTCGGACTCTACTTTTTTGCTTTCTCAGAGCTCTGGAGTTTCTGAATAAAAAACGAGAAAATGACAAGAGGAAAAACAAAATAGTTTCTGTACTAGAGTTCTTTATTTCTTTTCTAAAATAAAAAATAAAAATATATATAATAAAACAGAAATAGTAACAAAAAAGCTTTAGTTATACATTTTCCTAAAAAGTAAACGACTTGCAATCATTTTGCTTTTTCTATTACTAGATTTTATAACAAAATTCAAAAAAATTTAGAACCTTTTGTTAAGGTTTCCTAATTAACAAAAAAAAAAAAATAACTAAGTAAATAATCAGTAATCAATAATCAATAATTATTTTTAGTAAGAATTAAGACTTGGAAGTTAGTTCCGATGTGAATGTCTACGGAAAAACGATATAGTTGAAAAATATAAAACAATAAGAATTAAATTAAAAAGTTTATTATACTAGAGATTAAATTGAAAAAAAATGTCCAATTATTATAAACGAAAATATTTATTTAAAAAATTATTATAAATAGAAAAAATATCAAACTATTTATAAATGTAGAAAAAATTCACTAGAAGTTTATTGTGTCTTCAAAACTTTTTTTTAAAAAACCTATTTATTTTGTCTAAAAACTTTAGAAACATTCATAATTTAGTATTAGTTTAAGAGAGAGAAAAAAAAAGAGAAATCGAACTCTAAATATGAAAATAGAAGCGAAAAAAATTAGAAAAGAAAGAACATATTTGTTCCTTATTGATTTGAATTTATAATTTCTTTAGTATGAAATACGAGTCTAAAATAATTGAGGGGAAGACAAAGGAAAAATAGACAAAACTTTGTAGAATAATTTTTGTCGATAGCCAAAATTTTGATAAAGTGATGGCTTTAGGGAAAGTCATACGTGCCAAACAAGGCTCTAGTGAAATTGTCAATAATGGAGCTTCCCAATCCAACGAGACCTTTTGTTTTTCTTTTTTCCAAATATTTGATTTAAGCTTACTTTTTTGCTTCTCATGATCAAGCTAAATGGACGATGATCTTCATTTGGCTTTCTACTTGGTTGAGTTTCTTTAAAATTCTTTTATTGTTACGTGTTCAATTGCTATATGATTACTATTTTGTTTTACTTTATGATTATGTGGATAAGAATTCACTTTTCTTTTATGATTATTATTAGCTTAAGTTATCAGTTTGGTAAATAAACTTTTAAAGTTCTTAATAGGTAAGCATTTTCATTAGGTTGGGTTTGGTTGTTTTGGATTGGTTCAAACAAGTATAAATTGGGAGTCACTCCAAACTAATGTCTAGTGAGCATAAGACACTATTCAAGCCAAATGACTTTAATTGATCTCTCAAATATGAAATTAAATTTTGTGTGGAAAAAACTTTCAACAACTGAGAATGAACACTACCTACAATAGTCTTATGGATTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGATATCCGTGAGTGTCTAGGTCAACTTACGCACACCTCGATTAATCTCAATTTCTCCGTAGGATATTAAATCTTAAGAAAGTGGCCACCATGGATTGAACCCACAACCCTTTAGCCCTCGCCTTTTTTAAATGTTCCCACCACCACTAGGTCAACCCATGATGGTTATAGATTAACCCTTTTTGAAGGATGATTAATGAAAAATAAGTAATTCAACTGCCAAACTAGCTCAAGTGTGTTTAGGAAGGAATAAAGGTGCCTAACCCACTTTCAAATCCTTTAAAACTAATTTTGTGCGCCAAACTAGCAACACCCAAATTAGAGGACTTAAAGTTAGTTTCAAAACTAATTTTATCTATACTAAAGTAAGCATAACTCAACTGACATAAATTAGATCAACTTCAATGTGAAATGTTCAAATCTCCAACTCTATATTAAACTCAAAAAATAAAAATAAAAAATAAAAAATCTAATTCTATTGGTCATTTAGATTTGAGCACAGTGCATCGGTAATTGACATGTGCTTCTTTTCTTGATATTGGAAGTTAGTCTCACATAATTTTCTATTATCAATTACTATATAATAAATAGAATCTGTCTCGTTTTTTAACCTTTTGGTCTTTTATTTTTTTTATTTTTTAATAGTTAAGCTCAGAGATGTCCAATTAATTCGTGGAATTAGGGCCCTGCCCCAAATGGGGTGGGCAATTCCCAATTAGATGGGGAATGGGGAGGAAATTTTCTCCATTAGCTAAATGGGAAAGGGGACGGGATTATATTCTCCGCCTTTGTCCCCATCTCCGCCCTGCCCCACTTCGCTTAAATATATATATATTAATTAAACATAATTATAATTATAATTTCTTATTTGATATATATTTTTTAATTAAGTTGAGATTATGATAGGTTGGTGTTATATTTAAAATTTAATTTTTAGAAATTATGAAAATTAAACATTTTAATTATATCTTTGTTATATATGAGTGAGATATTTAACTATTTAAGTAAAAAAAATTCATAGTAGTGATTTAAGTTAATTAATTTTTTTTAAAAAAAAATCCAAACGGAGAAAATTTTTTCGTGAGGAATCCTTGCACAGATCCTTATGGGAAATTTAGCGAGGATGGAGAATGAAATTGGTAGCGAGAACGGGGATGGAGAAGCCATCCTCGGTCCCACCCTACCGCGTGGACATCTCTAGTTAAGCTTATAAAAACTACAACCATTCTTAAGTTTCTATGTTTTGTTTTTAATCTATTCATATTTTAAAAAATCAAGCTAAGTTTTGAAAACTGAAAATATATATATATATATAGTTTTCAAATATTGTATTTTTTTTTTTTAGCATATGACTAAAAATTCAAATGTTTCTTTCAAATAGATGAAACCCATATTAGAATAATGGAAAGAAGACAAACATAAATTTTAAAAACAGAAAACAAAAAATGAAATTGTTTTCAAACATGACATGAGAATCTTAAATATGGTAGCAAATAAAGATATTCACAAAACTTTAAGAAGTTAACACGTGATTACGAATCAGAATCATCTTTTCTTTGTTCCAAAGTGATAGGCAGAAATATGAAGAATAAGAAAATTAGGGCCCGTTTGATAACGTTCCCGTTTCCTGTTTCTTGTTTCTCGTTTCCTGTTTCTTTTTCTTGTTTCTTCTTTTTTTAGAACAAGAAACAGGAACATGTTTGATAACTATTCATGTTTCCTATTTCTTGAAAAAAAGAAACATAAAGAAAAACTTGTTTGATAACTCTTTCTTGTTTCTTGTTTCTAAAGAAGATATGTCATACATTAAACATTGAACAAGATATTATCAAAAGTTTGTGTCATCTAATACAAGTAAGTTTCGATGACAACTAAATATAATAACAAAGTTGTGTCCTATTCTTGCCCAAATTTGATCGGCGTTGTCATCTCCAATTCGAGTAATTTGTCTTAAGTGATGTCGAGTCAAATTCAATTTAATTATATTATTATGTAAATTTTGTGATTGTAACATATTAAAATAAAGCTAAATAAATGTCTTAGTC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MDDESLHRTLSGNLHAPLLNGDKQNDVEQQRITATNGGGATSFIKTCFNGLNALSGVGILSVPYALASGGWLSLILLFVIALVTFYTGLLIQRCMDAKSDIRTYPEVGELAFGNNGKIIVSVFMYVELYLVATGFLILEGDNLNNMFPDVGFELLGFRIAGQAFFVLVVALIILPSVWLDNMSLLSFVSASGVLASAVIIGSVFWCGAFDGIGFQHKGTTLINWKGIPNSISLFAFCYCAHPVFPTLYTSMNNKRQFSNVLTFCFIICTFCYASMAIMGYAMFGSDIQSQITLNLPTGKLSSLVAIYTTLVNPICKYALMTLPIVTAIKNRFPLNYNTKPLTMLISTSVLVSNVIVALAIPFFGSLMSLVGAFLSVTASIILPCVCYLKISGSYKRPFGFETVIISSIILIGVVVAIVGTYVALVEIVGKI Homology
BLAST of Lsi03G014830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LXF8 (Amino acid transporter AVT1J OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AVT1J PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 488.0 bits (1255), Expect = 1.1e-136 Identity = 252/409 (61.61%), Postives = 321/409 (78.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4J1Q9 (Amino acid transporter AVT1I OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AVT1I PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 464.2 bits (1193), Expect = 1.7e-129 Identity = 237/394 (60.15%), Postives = 308/394 (78.17%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JE35 (Amino acid transporter AVT1B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AVT1B PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 336.7 bits (862), Expect = 4.0e-91 Identity = 174/392 (44.39%), Postives = 262/392 (66.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IUW3 (Amino acid transporter AVT1C OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AVT1C PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 327.0 bits (837), Expect = 3.2e-88 Identity = 177/439 (40.32%), Postives = 280/439 (63.78%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80668 (Amino acid transporter AVT1A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AVT1A PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 317.0 bits (811), Expect = 3.3e-85 Identity = 166/393 (42.24%), Postives = 255/393 (64.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B7X7 (vacuolar amino acid transporter 1-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487001 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 763.8 bits (1971), Expect = 3.7e-217 Identity = 397/433 (91.69%), Postives = 416/433 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F0W3 (amino acid transporter AVT1I isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441142 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 709.9 bits (1831), Expect = 6.4e-201 Identity = 374/428 (87.38%), Postives = 399/428 (93.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L1M9 (amino acid transporter AVT1I-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499028 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 709.5 bits (1830), Expect = 8.4e-201 Identity = 375/429 (87.41%), Postives = 400/429 (93.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DPP1 (Vacuolar amino acid transporter 1-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold352G008010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 707.2 bits (1824), Expect = 4.2e-200 Identity = 372/429 (86.71%), Postives = 394/429 (91.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B7H1 (vacuolar amino acid transporter 1-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487001 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 707.2 bits (1824), Expect = 4.2e-200 Identity = 372/429 (86.71%), Postives = 394/429 (91.84%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. NCBI nr
Match: XP_038905111.1 (amino acid transporter AVT1J-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 778.1 bits (2008), Expect = 4.0e-221 Identity = 406/432 (93.98%), Postives = 418/432 (96.76%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. NCBI nr
Match: XP_004147475.1 (amino acid transporter AVT1J isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 768.1 bits (1982), Expect = 4.1e-218 Identity = 397/432 (91.90%), Postives = 416/432 (96.30%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. NCBI nr
Match: XP_008443410.1 (PREDICTED: vacuolar amino acid transporter 1-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 763.8 bits (1971), Expect = 7.7e-217 Identity = 397/433 (91.69%), Postives = 416/433 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. NCBI nr
Match: XP_038905110.1 (amino acid transporter AVT1I-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 713.4 bits (1840), Expect = 1.2e-201 Identity = 379/425 (89.18%), Postives = 392/425 (92.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. NCBI nr
Match: KAG6588368.1 (Amino acid transporter AVT1J, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7022217.1 Amino acid transporter AVT1J [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 710.3 bits (1832), Expect = 1.0e-200 Identity = 375/428 (87.62%), Postives = 399/428 (93.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. TAIR 10
Match: AT5G15240.1 (Transmembrane amino acid transporter family protein ) HSP 1 Score: 488.0 bits (1255), Expect = 7.6e-138 Identity = 252/409 (61.61%), Postives = 321/409 (78.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. TAIR 10
Match: AT3G28960.1 (Transmembrane amino acid transporter family protein ) HSP 1 Score: 464.2 bits (1193), Expect = 1.2e-130 Identity = 237/394 (60.15%), Postives = 308/394 (78.17%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. TAIR 10
Match: AT2G39130.1 (Transmembrane amino acid transporter family protein ) HSP 1 Score: 327.0 bits (837), Expect = 2.3e-89 Identity = 177/439 (40.32%), Postives = 280/439 (63.78%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. TAIR 10
Match: AT2G41190.1 (Transmembrane amino acid transporter family protein ) HSP 1 Score: 317.0 bits (811), Expect = 2.3e-86 Identity = 166/393 (42.24%), Postives = 255/393 (64.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi03G014830 vs. TAIR 10
Match: AT5G15240.2 (Transmembrane amino acid transporter family protein ) HSP 1 Score: 303.9 bits (777), Expect = 2.0e-82 Identity = 187/409 (45.72%), Postives = 237/409 (57.95%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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