Lsi03G010530 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview


Name	Lsi03G010530
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
Description	F12P19.7, putative isoform 2
Location	chr03: 20268810 .. 20285713 (-)
RNA-Seq Expression	Lsi03G010530
Synteny	Lsi03G010530

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR

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mRNA sequence

GGAAAAAGAGGATGATGCCCGTGGAGTGCACTCACCACTACCACTATTCACATAAAAATCCAACCAAAAGCTAAAAATCGAAACACAAAATGATGGGAAGCAAGAAGACAAAACCAAATCAAATACATATATTATATCAAATTTCTCTCTTTCATTCACGGGTTCACTTAACTGTTCCACTTCTACTTTTTCTCTCTCTGTTTCACTTCTTTTTTTCCCATTTCCCCCTGTAAAATCCCCTGTTTTTTTTAGGGCTTTTCTGCAATTTGTCTTTCCTTCTCCGTTTTCGATGAATGCATTGGTGGTGTTTCTCTTCGCCGTCTGGTTTCCGCTTATTGGCGGAGTGACGGCGGCTTCTACGGCGGCGGTGAAGGTCGGGAATGTTTCGAAAGTTGAAGATGCGGTTAATTTCAGGATTTATTATGGACAGTCGTTTAAAGTTATTAAGAACGCCGTTGATGGCAAGAGCTACCTTCTCATTCAGGAAGAACAAAGTATTGCACTTCAAGAATCAAATCTTACGTCATCCCTTTGGCTAATTATTCCGTTGATACCGACCTCTTTCCAGCGACTTCCATATTCCATTTCTCAAGCATCAATTATTGAACTTCTAGGGTTATTAGGAAGCTTGAAGGGCATAACGTCGGAGAAGGTGACGTCAGAATGCGTATTAAAGCAATACGAAAAAGGAGAAATTCAGATTATAAATAAAACGGAAATCCAACAGCTGGCACAGTTTGCGGCTCACTTCGTTGCTGACGTGGACCAACCACAGTCCTGCAATTTTGCCACGAGTTGCCCTCACCGGCATGGAACTAGGTTTCATAATTTTTGCTACATAGAGTGGATAAAGTTATTGGGAGCTTTTGCAAACCTGGAGGCAAGAGCCACTCAAATTTACACTGCGATCAAAGAAAATTACATGTGCCTGAAGAACATAGCAACCACGAGAAAGACTTTCAAACCCATTGTTGCCTGGATGGACGCCGGAGGAGAAAATGTGGACGACTCCATCAACAAAATCACTTACAACGTCTCTAATCCCGACGACTTAGATGCCTTTCATGGTATCCTCTGCACGGTGGAAGTGATTATCGATGAAACATTTACATCAGATCCAACTGCATATAATGTATGTAACTTTTTGTGTATGATATTAGATTGGTTCGACGGAGCAATCTCACAGCCGCAGTTGGTATTGGCAGACATAATAGAGGTTTTATTCCCTACGGGTAATTTCACAACAACCTATTTCAGGAACTTGGCAAAGGAGGGAGTTACAAACATTGGCCCAGAAATGTGTGAGAGAGATAGTTCCTCTGCCTTGGAGCCCACCATCATAGCCTGTGGATAATTTTACCCTTTCTTTTATATTTCATATTTTGCAAACTTTAATTTAAACCTTATGATTCAATCTCATATTTATGTGGATACTTTTTAAGTTTTAAGACAATACTTTAAATGAAACATTTTTTTATTAATTGTTTTTACATATTTCATTTGAAAGCATTTCAAGGGTTGTTAATATTATTAAATGGATAGCTACATTTCTTAAATAAAATTTTATATGTTCATTTTTT

Coding sequence (CDS)

ATGAATGCATTGGTGGTGTTTCTCTTCGCCGTCTGGTTTCCGCTTATTGGCGGAGTGACGGCGGCTTCTACGGCGGCGGTGAAGGTCGGGAATGTTTCGAAAGTTGAAGATGCGGTTAATTTCAGGATTTATTATGGACAGTCGTTTAAAGTTATTAAGAACGCCGTTGATGGCAAGAGCTACCTTCTCATTCAGGAAGAACAAAGTATTGCACTTCAAGAATCAAATCTTACGTCATCCCTTTGGCTAATTATTCCGTTGATACCGACCTCTTTCCAGCGACTTCCATATTCCATTTCTCAAGCATCAATTATTGAACTTCTAGGGTTATTAGGAAGCTTGAAGGGCATAACGTCGGAGAAGGTGACGTCAGAATGCGTATTAAAGCAATACGAAAAAGGAGAAATTCAGATTATAAATAAAACGGAAATCCAACAGCTGGCACAGTTTGCGGCTCACTTCGTTGCTGACGTGGACCAACCACAGTCCTGCAATTTTGCCACGAGTTGCCCTCACCGGCATGGAACTAGGTTTCATAATTTTTGCTACATAGAGTGGATAAAGTTATTGGGAGCTTTTGCAAACCTGGAGGCAAGAGCCACTCAAATTTACACTGCGATCAAAGAAAATTACATGTGCCTGAAGAACATAGCAACCACGAGAAAGACTTTCAAACCCATTGTTGCCTGGATGGACGCCGGAGGAGAAAATGTGGACGACTCCATCAACAAAATCACTTACAACGTCTCTAATCCCGACGACTTAGATGCCTTTCATGGTATCCTCTGCACGGTGGAAGTGATTATCGATGAAACATTTACATCAGATCCAACTGCATATAATGTATGTAACTTTTTGTGTATGATATTAGATTGGTTCGACGGAGCAATCTCACAGCCGCAGTTGGTATTGGCAGACATAATAGAGGTTTTATTCCCTACGGGTAATTTCACAACAACCTATTTCAGGAACTTGGCAAAGGAGGGAGTTACAAACATTGGCCCAGAAATGTGTGAGAGAGATAGTTCCTCTGCCTTGGAGCCCACCATCATAGCCTGTGGATAA

Protein sequence

MNALVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKSYLLIQEEQSIALQESNLTSSLWLIIPLIPTSFQRLPYSISQASIIELLGLLGSLKGITSEKVTSECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFHNFCYIEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWMDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAYNVCNFLCMILDWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTGNFTTTYFRNLAKEGVTNIGPEMCERDSSSALEPTIIACG

Homology

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KV51 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G001610 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 514.6 bits (1324), Expect = 3.2e-142
Identity = 282/399 (70.68%), Postives = 295/399 (73.93%), Query Frame = 0


Query: 4   LVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKSYLL 63
           LV+FLFAVWFP I  +TAAST AVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKN++DGKSYLL
Sbjct: 7   LVLFLFAVWFPAIDRLTAASTTAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNSIDGKSYLL 66

Query: 64  IQEEQSIALQESNLTSSLWLIIPLIPTSFQRLPYSISQASIIELLGLLGSLKGITSEKVT 123
           IQ    +A +    TS +   +  IP S   L   +   S  ELLGLLGSLKGITSE VT
Sbjct: 67  IQNTSKMAGRTKYCTSRIKSYV--IPLSNYSLDTDLFPVSFFELLGLLGSLKGITSESVT 126

Query: 124 SECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFHNFCY 183
           SECVLKQYEKGEIQIINKTE QQLAQFAAHF+ADVDQPQSCNFAT  P    T       
Sbjct: 127 SECVLKQYEKGEIQIINKTETQQLAQFAAHFIADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQK--- 186

Query: 184 IEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM------------ 243
            EWIK LGAFAN+E RA QIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM            
Sbjct: 187 AEWIKFLGAFANVEPRANQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWMGYYDGIWSFTKD 246

Query: 244 --------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAYNVC 303
                   DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAYN+ 
Sbjct: 247 AYKLKYIEDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAYNLS 306

Query: 304 NFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG 355
            FL +I                             DWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG
Sbjct: 307 TFLQLINIQDQSCLSFLSTQSIWRFDKRFHNSNAFDWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG 366

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TMJ6 (F12P19.7, putative isoform 2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold46G00910 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 4.1e-137
Identity = 276/403 (68.49%), Postives = 296/403 (73.45%), Query Frame = 0


Query: 4   LVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKSYLL 63
           LV+FLFAVWFP I  VTAAST AVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKN++DGKSYLL
Sbjct: 6   LVLFLFAVWFPAIDNVTAASTTAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNSIDGKSYLL 65

Query: 64  IQEEQSIALQESNLTSSL-WLIIPLIPTSFQR--LPYSIS-QASIIELLGLLGSLKGITS 123
           IQ    +A +    TS +   +IPL   S      P ++S   +I+ ++ LLGSLKGITS
Sbjct: 66  IQNTSKMAGRTKYCTSRIKSYVIPLSNYSLDTDLFPGTLSFLQTILFIICLLGSLKGITS 125

Query: 124 EKVTSECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFH 183
           E VTSECVLKQYEKGEIQIINKTE QQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFAT  P    T   
Sbjct: 126 ESVTSECVLKQYEKGEIQIINKTETQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQ 185

Query: 184 NFCYIEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM-------- 243
                EWIK LGAFAN+E RA QIYTAIKENY+CLKNIATTRKTFKPIVAWM        
Sbjct: 186 K---AEWIKFLGAFANVEPRANQIYTAIKENYLCLKNIATTRKTFKPIVAWMGYYDGMWS 245

Query: 244 ------------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTA 303
                       DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDP A
Sbjct: 246 FTKDAYKLKYIEDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPIA 305

Query: 304 YNVCNFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADIIEVL 355
           YN+  FL +I                             DWFDGAISQPQLVLADIIEVL
Sbjct: 306 YNLSTFLQLINIQDQSCLSFLSTQSIWRFDKRFHSSNAFDWFDGAISQPQLVLADIIEVL 365

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E0B2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold655G00920 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 1.1e-134
Identity = 271/399 (67.92%), Postives = 286/399 (71.68%), Query Frame = 0


Query: 4   LVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKSYLL 63
           LV+FLFAVWFP I  VTAAST AVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKN++DGKSYLL
Sbjct: 6   LVLFLFAVWFPAIDNVTAASTTAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNSIDGKSYLL 65

Query: 64  IQEEQSIALQESNLTSSLWLIIPLIPTSFQRLPYSISQASIIELLGLLGSLKGITSEKVT 123
           IQ    +A +    TS +   +  IP S   L   +            GSLKGITSE VT
Sbjct: 66  IQNTSKMAGRTKYCTSRIKSYV--IPLSNYSLDTDL----------FPGSLKGITSESVT 125

Query: 124 SECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFHNFCY 183
           SECVLKQYEKGEIQIINKTE QQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFAT  P    T       
Sbjct: 126 SECVLKQYEKGEIQIINKTETQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQK--- 185

Query: 184 IEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM------------ 243
            EWIK LGAFAN+E RA QIYTAIKENY+CLKNIATTRKTFKPIVAWM            
Sbjct: 186 AEWIKFLGAFANVEPRANQIYTAIKENYLCLKNIATTRKTFKPIVAWMGYYDGMWSFTKD 245

Query: 244 --------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAYNVC 303
                   DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDP AYN+ 
Sbjct: 246 AYKLKYIEDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPIAYNLS 305

Query: 304 NFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG 355
            FL +I                             DWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG
Sbjct: 306 TFLQLINIQDQSCLSFLSTQSIWRFDKRFHSSNAFDWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG 365

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F572 (uncharacterized protein LOC111442235 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442235 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 473.4 bits (1217), Expect = 8.3e-130
Identity = 261/401 (65.09%), Postives = 283/401 (70.57%), Query Frame = 0


Query: 1   MNALVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKS 60
           M ALVV L AVWFP+ GG      AAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNA+DG S
Sbjct: 1   MKALVVVLLAVWFPVHGG-----AAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAIDGNS 60

Query: 61  YLLIQEEQSIALQESNLTSSLWLIIPLIPTSFQRLPYSISQASIIELLGLLGSLKGITSE 120
           YLLIQ    +A +    TS +   +  IP +   +   +   S  ELLGL+G+LK ITSE
Sbjct: 61  YLLIQNNSKMAGRTKYCTSRIKSYV--IPLNNYSIDTHLFPVSFFELLGLVGNLKAITSE 120

Query: 121 KVTSECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFHN 180
           +VTSECVLKQYEKGEIQIINKTE QQLAQFAAHF+ADVDQPQSCNFAT  P    T    
Sbjct: 121 RVTSECVLKQYEKGEIQIINKTETQQLAQFAAHFIADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQR 180

Query: 181 FCYIEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM--------- 240
               EWIK LG FANLEARATQIY+A+KENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM         
Sbjct: 181 ---AEWIKFLGVFANLEARATQIYSAMKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWMGYSDGMWSF 240

Query: 241 -----------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAY 300
                      DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFT DPT Y
Sbjct: 241 TKDAYKLKYIEDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTLDPTVY 300

Query: 301 NVCNFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADIIEVLF 354
           N+  FL +I                            LDW DG +SQPQLVLAD+I +LF
Sbjct: 301 NMSTFLELIDIQDQSCLSFLSTQSIWRFDKRFLDSTMLDWLDGGMSQPQLVLADVIHILF 360

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J5V7 (uncharacterized protein LOC111482047 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482047 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 466.1 bits (1198), Expect = 1.3e-127
Identity = 256/398 (64.32%), Postives = 281/398 (70.60%), Query Frame = 0


Query: 4   LVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKSYLL 63
           +VV L AVWFP+ GG      AAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNA+DG SYLL
Sbjct: 9   VVVVLLAVWFPVDGG-----AAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAIDGNSYLL 68

Query: 64  IQEEQSIALQESNLTSSLWLIIPLIPTSFQRLPYSISQASIIELLGLLGSLKGITSEKVT 123
           IQ    +A +    TS +   +  IP +   +   +   S  ELLGL+G+LK ITSE+VT
Sbjct: 69  IQNNSKMAGRTKYCTSRIKSYV--IPLNNYSINTHLFPVSFFELLGLVGNLKAITSERVT 128

Query: 124 SECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFHNFCY 183
           SECVLKQYEKGEIQIINKTE QQLAQFAAHF+ADVDQPQSCNFAT  P    T       
Sbjct: 129 SECVLKQYEKGEIQIINKTETQQLAQFAAHFIADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQR--- 188

Query: 184 IEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM------------ 243
            EWIK LG FANLEARATQIY+A+KENYMCLKNIATTRKTFKP VAWM            
Sbjct: 189 AEWIKFLGVFANLEARATQIYSAMKENYMCLKNIATTRKTFKPTVAWMGYSDGMWSFTMD 248

Query: 244 --------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAYNVC 303
                   DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFT DPT YN+ 
Sbjct: 249 AYKLKYVEDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTLDPTVYNMS 308

Query: 304 NFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG 354
            FL +I                            LDW DGA+SQPQLVLAD+I +LF   
Sbjct: 309 TFLELINIQDQSCLSFLSTQSIWRFDKRYLDSTTLDWLDGAMSQPQLVLADVIHILFSMP 368

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. NCBI nr
Match: XP_038903360.1 (uncharacterized protein LOC120089977 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 524.2 bits (1349), Expect = 8.5e-145
Identity = 288/403 (71.46%), Postives = 302/403 (74.94%), Query Frame = 0


Query: 1   MNALVVFLFA-VWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGK 60
           MNALVVFL A VWFP+IGGVTAASTA VKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNA+DGK
Sbjct: 1   MNALVVFLLAVVWFPVIGGVTAASTAVVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAIDGK 60

Query: 61  SYLLIQEEQSIALQESNLTSSLWLIIPLIPTSFQRLPYSISQASIIELLGLLGSLKGITS 120
           SYLLIQ    +A +    TS +   +  IP +   +   +   S  ELLGLLGSLKGITS
Sbjct: 61  SYLLIQNNSKMAGRTKYCTSRIKSYV--IPLTNYSVDTDLFPVSFFELLGLLGSLKGITS 120

Query: 121 EKVTSECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFH 180
           E+VTSECVLKQYEKG+IQIINKTE QQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFAT  P    T   
Sbjct: 121 ERVTSECVLKQYEKGDIQIINKTETQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQ 180

Query: 181 NFCYIEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM-------- 240
                EWIK LGAFANLEARATQIY+AIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM        
Sbjct: 181 R---AEWIKFLGAFANLEARATQIYSAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWMGYYDGIWS 240

Query: 241 ------------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTA 300
                       DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDP  
Sbjct: 241 FTKDAYKLKYIEDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPAT 300

Query: 301 YNVCNFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADIIEVL 355
           YN+  FL +I                             DWFDGAISQPQLVLADIIEVL
Sbjct: 301 YNLSTFLQLINIQDQSCLSFLSTQSIWRFDKRFHNSNAFDWFDGAISQPQLVLADIIEVL 360

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. NCBI nr
Match: XP_004152259.1 (uncharacterized protein LOC101208429 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN52794.1 hypothetical protein Csa_015282 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 514.6 bits (1324), Expect = 6.7e-142
Identity = 282/399 (70.68%), Postives = 295/399 (73.93%), Query Frame = 0


Query: 4   LVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKSYLL 63
           LV+FLFAVWFP I  +TAAST AVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKN++DGKSYLL
Sbjct: 7   LVLFLFAVWFPAIDRLTAASTTAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNSIDGKSYLL 66

Query: 64  IQEEQSIALQESNLTSSLWLIIPLIPTSFQRLPYSISQASIIELLGLLGSLKGITSEKVT 123
           IQ    +A +    TS +   +  IP S   L   +   S  ELLGLLGSLKGITSE VT
Sbjct: 67  IQNTSKMAGRTKYCTSRIKSYV--IPLSNYSLDTDLFPVSFFELLGLLGSLKGITSESVT 126

Query: 124 SECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFHNFCY 183
           SECVLKQYEKGEIQIINKTE QQLAQFAAHF+ADVDQPQSCNFAT  P    T       
Sbjct: 127 SECVLKQYEKGEIQIINKTETQQLAQFAAHFIADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQK--- 186

Query: 184 IEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM------------ 243
            EWIK LGAFAN+E RA QIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM            
Sbjct: 187 AEWIKFLGAFANVEPRANQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWMGYYDGIWSFTKD 246

Query: 244 --------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAYNVC 303
                   DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAYN+ 
Sbjct: 247 AYKLKYIEDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAYNLS 306

Query: 304 NFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG 355
            FL +I                             DWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG
Sbjct: 307 TFLQLINIQDQSCLSFLSTQSIWRFDKRFHNSNAFDWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG 366

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. NCBI nr
Match: KAA0044364.1 (F12P19.7, putative isoform 2 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 8.5e-137
Identity = 276/403 (68.49%), Postives = 296/403 (73.45%), Query Frame = 0


Query: 4   LVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKSYLL 63
           LV+FLFAVWFP I  VTAAST AVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKN++DGKSYLL
Sbjct: 6   LVLFLFAVWFPAIDNVTAASTTAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNSIDGKSYLL 65

Query: 64  IQEEQSIALQESNLTSSL-WLIIPLIPTSFQR--LPYSIS-QASIIELLGLLGSLKGITS 123
           IQ    +A +    TS +   +IPL   S      P ++S   +I+ ++ LLGSLKGITS
Sbjct: 66  IQNTSKMAGRTKYCTSRIKSYVIPLSNYSLDTDLFPGTLSFLQTILFIICLLGSLKGITS 125

Query: 124 EKVTSECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFH 183
           E VTSECVLKQYEKGEIQIINKTE QQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFAT  P    T   
Sbjct: 126 ESVTSECVLKQYEKGEIQIINKTETQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQ 185

Query: 184 NFCYIEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM-------- 243
                EWIK LGAFAN+E RA QIYTAIKENY+CLKNIATTRKTFKPIVAWM        
Sbjct: 186 K---AEWIKFLGAFANVEPRANQIYTAIKENYLCLKNIATTRKTFKPIVAWMGYYDGMWS 245

Query: 244 ------------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTA 303
                       DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDP A
Sbjct: 246 FTKDAYKLKYIEDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPIA 305

Query: 304 YNVCNFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADIIEVL 355
           YN+  FL +I                             DWFDGAISQPQLVLADIIEVL
Sbjct: 306 YNLSTFLQLINIQDQSCLSFLSTQSIWRFDKRFHSSNAFDWFDGAISQPQLVLADIIEVL 365

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. NCBI nr
Match: TYK29493.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold655G00920 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 2.3e-134
Identity = 271/399 (67.92%), Postives = 286/399 (71.68%), Query Frame = 0


Query: 4   LVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKSYLL 63
           LV+FLFAVWFP I  VTAAST AVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKN++DGKSYLL
Sbjct: 6   LVLFLFAVWFPAIDNVTAASTTAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNSIDGKSYLL 65

Query: 64  IQEEQSIALQESNLTSSLWLIIPLIPTSFQRLPYSISQASIIELLGLLGSLKGITSEKVT 123
           IQ    +A +    TS +   +  IP S   L   +            GSLKGITSE VT
Sbjct: 66  IQNTSKMAGRTKYCTSRIKSYV--IPLSNYSLDTDL----------FPGSLKGITSESVT 125

Query: 124 SECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFHNFCY 183
           SECVLKQYEKGEIQIINKTE QQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFAT  P    T       
Sbjct: 126 SECVLKQYEKGEIQIINKTETQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQK--- 185

Query: 184 IEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM------------ 243
            EWIK LGAFAN+E RA QIYTAIKENY+CLKNIATTRKTFKPIVAWM            
Sbjct: 186 AEWIKFLGAFANVEPRANQIYTAIKENYLCLKNIATTRKTFKPIVAWMGYYDGMWSFTKD 245

Query: 244 --------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAYNVC 303
                   DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDP AYN+ 
Sbjct: 246 AYKLKYIEDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPIAYNLS 305

Query: 304 NFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG 355
            FL +I                             DWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG
Sbjct: 306 TFLQLINIQDQSCLSFLSTQSIWRFDKRFHSSNAFDWFDGAISQPQLVLADIIEVLFPTG 365

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. NCBI nr
Match: XP_022935312.1 (uncharacterized protein LOC111442235 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 473.4 bits (1217), Expect = 1.7e-129
Identity = 261/401 (65.09%), Postives = 283/401 (70.57%), Query Frame = 0


Query: 1   MNALVVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKS 60
           M ALVV L AVWFP+ GG      AAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNA+DG S
Sbjct: 1   MKALVVVLLAVWFPVHGG-----AAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAIDGNS 60

Query: 61  YLLIQEEQSIALQESNLTSSLWLIIPLIPTSFQRLPYSISQASIIELLGLLGSLKGITSE 120
           YLLIQ    +A +    TS +   +  IP +   +   +   S  ELLGL+G+LK ITSE
Sbjct: 61  YLLIQNNSKMAGRTKYCTSRIKSYV--IPLNNYSIDTHLFPVSFFELLGLVGNLKAITSE 120

Query: 121 KVTSECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFHN 180
           +VTSECVLKQYEKGEIQIINKTE QQLAQFAAHF+ADVDQPQSCNFAT  P    T    
Sbjct: 121 RVTSECVLKQYEKGEIQIINKTETQQLAQFAAHFIADVDQPQSCNFATFLPSSEDTPLQR 180

Query: 181 FCYIEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM--------- 240
               EWIK LG FANLEARATQIY+A+KENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWM         
Sbjct: 181 ---AEWIKFLGVFANLEARATQIYSAMKENYMCLKNIATTRKTFKPIVAWMGYSDGMWSF 240

Query: 241 -----------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSDPTAY 300
                      DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFT DPT Y
Sbjct: 241 TKDAYKLKYIEDAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTLDPTVY 300

Query: 301 NVCNFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADIIEVLF 354
           N+  FL +I                            LDW DG +SQPQLVLAD+I +LF
Sbjct: 301 NMSTFLELIDIQDQSCLSFLSTQSIWRFDKRFLDSTMLDWLDGGMSQPQLVLADVIHILF 360

[Close]

BLAST of Lsi03G010530 vs. TAIR 10
Match: AT1G65900.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; Has 306 Blast hits to 306 proteins in 119 species: Archae - 19; Bacteria - 238; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 34; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 15 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 355.1 bits (910), Expect = 6.3e-98
Identity = 203/407 (49.88%), Postives = 257/407 (63.14%), Query Frame = 0


Query: 5   VVFLFAVWFPLIGGVTAASTAAVKVGNVSKVEDAVNFRIYYGQSFKVIKNAVDGKSYLLI 64
           ++ L  +W  ++  ++  ++  VKVG +SKVEDA NF IYYGQ+FKVIKNA+DGKSYLLI
Sbjct: 11  LILLLVLWC-MVARLSNGASNNVKVGIISKVEDATNFHIYYGQTFKVIKNAIDGKSYLLI 70

Query: 65  QEEQSIALQESNLTSSL-WLIIPLIPTSFQRLPYSISQASI----IELLGLLGSLKGITS 124
           Q    +A++    TS +   +IPL+  S   L    SQ S+     ELLGLLGSLKGITS
Sbjct: 71  QNTSRMAVRTKYCTSRIKSYVIPLLNYS---LDTQSSQGSVPVSFFELLGLLGSLKGITS 130

Query: 125 EKVTSECVLKQYEKGEIQIINKTEIQQLAQFAAHFVADVDQPQSCNFATSCPHRHGTRFH 184
           ++V S C+LK  E GE+  ++K E  QL+QFAAHF++D DQPQ+CNFA   P   GT   
Sbjct: 131 DEVVSPCLLKLCEAGEVVKLDKGE--QLSQFAAHFISDTDQPQTCNFANFFPLSEGTPLQ 190

Query: 185 NFCYIEWIKLLGAFANLEARATQIYTAIKENYMCLKNIATTR-KTFKPIVAWM------- 244
                EWIK LGAF NLE +A Q+Y ++K +Y CL  +A  + K+FKPIVAWM       
Sbjct: 191 R---AEWIKFLGAFTNLETKANQVYDSVKASYTCLSQMAANKTKSFKPIVAWMGYDQNGG 250

Query: 245 ---------------DAGGENVDDSINKITYNVSNPDDLDAFHGILCTVEVIIDETFTSD 304
                          DAGGEN+D SINK++YNVS+PDDL+A H ILCTV+ +IDET +SD
Sbjct: 251 MWSFTKESHKLKFVEDAGGENIDKSINKVSYNVSDPDDLEALHAILCTVDAVIDETLSSD 310

Query: 305 PTAYNVCNFLCMI----------------------------LDWFDGAISQPQLVLADII 355
           P  Y    FL  I                            LDW+DGAISQP LVLADI+
Sbjct: 311 PQNYTQTTFLANINVDDNSCFAFLANQSIWRYDKRVRNRTTLDWYDGAISQPNLVLADIV 370

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lsi03G010530 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Lsi03G010530 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A0A0KV51	3.2e-142	70.68	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G001610 PE=4 SV=1	[more]
A0A5A7TMJ6	4.1e-137	68.49	F12P19.7, putative isoform 2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_sca...	[more]
A0A5D3E0B2	1.1e-134	67.92	Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold...	[more]
A0A6J1F572	8.3e-130	65.09	uncharacterized protein LOC111442235 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114422...	[more]
A0A6J1J5V7	1.3e-127	64.32	uncharacterized protein LOC111482047 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482047...	[more]

BLAST of Lsi03G010530 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_038903360.1	8.5e-145	71.46	uncharacterized protein LOC120089977 [Benincasa hispida]	[more]
XP_004152259.1	6.7e-142	70.68	uncharacterized protein LOC101208429 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN52794.1 hy...	[more]
KAA0044364.1	8.5e-137	68.49	F12P19.7, putative isoform 2 [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
TYK29493.1	2.3e-134	67.92	uncharacterized protein E5676_scaffold655G00920 [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
XP_022935312.1	1.7e-129	65.09	uncharacterized protein LOC111442235 [Cucurbita moschata]	[more]

BLAST of Lsi03G010530 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G65900.1	6.3e-98	49.88	unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biologic...	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PANTHER	PTHR38360	OS03G0120000 PROTEIN	coord: 232..286 coord: 5..231 coord: 289..353

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lsi03G010530.1	Lsi03G010530.1	mRNA