Lsi03G002990 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi03G002990
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr03: 3632421 .. 3639345 (+)
RNA-Seq ExpressionLsi03G002990
SyntenyLsi03G002990
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGCGTACATTTTATGGTAGATAAATTTAATTTTCAGTGCACATTGAGCACAAAGAAGTGGGAGGAAATATATTTTTATGAAAAATAATACGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACTTTTGTTTGCGTTGAAAATGCAACATAAAGATATAGAAGGGATCATTAGACAATGTGTTAGTTTCTATCTTTCATTTAGCCTTTCTTTGCTATGTGAATAATGTGTCTAACACATGTTGAATGAATCAAGTTCTCTGATTAATCTGAAGAGAAGCTCATACATTAAATTACAATATATTTGCCCTTTATACAAAAATGACACAAAAGAATCAAACTAACCAACTGAATAACTAAATACTAACAAGAAAACATAACAACGGGATAATTAGTTTACAGTCTCTCAGTATTCTCACTCAAGTTGGAAAATGAATATTAAGAACGCCCAACTTGACTAACATCCCAAATAAAACAGAGGAAGATAAAACTTTTAATTATAAACGTATCAACTAATTGCAAACTTGAAGAATAGGCAAAATCTTGAGGAAGTCATCCGTCTTTGACAAAATGACAATCAATTTCAATGTGTATAATTTGTTCATGAAAATGTTAGATTTAAAGTAATGGTAATATATAGTAGCTTGGTTATCACAAAAAGCAGTAAAAGGAAGTAAACAAGCTACTTTCAAGTCCACTAATAATTGAGAAATCCAAGGCAGATGTTTTAGAAATTAAACTTCATTAATGACATTATTAAACACAACTGTTTTGACTCTTGAATCAATTAACACAACACCTAGGTCTAGAAGTCTTTTATCTGGATTGTCCCTCTCAAGGTCAATCTTTTCTTTCACCTAATTACTAATTTACTAATCTCTTGAAACTAGATAATTAAGCAAAGTGTTAAGACATATCATCAACAATCTCTACCATTATCTGACTACTCTAGTGTTTTCAAACGATAGTCTAGCATGCATGATCTAATTTAGCCTACTTTCTCAAGCAAGATTTAAACCATAAAATCATATGCAAATATTGGCCAAACATTCAAAAGCATTAAGAATGATCATGCTAGAAAGCATTAATGCAAATTAATATTCAAGAATCACAAAGTGATTAACAAAAATTCATAAAATCCATCTAAGCCTAGAAAAATGAGAAATTCATTCTAACATGGCTTCTATGGACAGAACCATAACAAGAATGCAAAAATATAGAAAAGAATTCAAGATGAAAAAAAGAGAAAAAAATTATCTGGCGTCCCAATCCCGTCTCCGTGATAGAATTAACCCTACAATGCTCTCCAATTGGCTTTACACTAAAGAACCTCTATATTATGCTCAAAACTCTATCTCTTAGCCCAAAAAGCTCCAAAATTCGATGATGAGAACTACTGCAAACTTGAAAGTAGATGAAAGAAAATCTAAAATCTACTGTTGTAAATAGATAGAGAATGAAAAAAACGAAGAAAACAAGTGGTCATTCGCCAAAAATGACCATCCAGATCAAAAGTTATGACCAAATTACAAACACTGCTGGTTTTATAGCAGTGAAACAGCACCGCCCACGCGGTTTTCACGCCTCTTTTTCCTCTAATTCGTCACTTTTCATCAACTTTGACCCCTTCTCTTGTCCTAGGTCAAATTTTGAATAATTATAGGGGTATTTACATCATTTTAATCTCAAAATAGCCCGTTTTCGTCCAGATGCTTGATTCTTATAATTAAACATAATAAAGCATTCAACGAACACAAATTAACAATCAAACTAACAATATTCTAAGCCTAAAATGCACTTTTTAGTGTGTTTCGGTGTTTCAACAAGCATAAAGAATTGAGGAATAGTATGTCAAACATCATTATTATGCTTTAGAAGATAAACCTATGTATATCAAGATTTATCATCAACTAAAGTAACAAAATAATGAGTAACCAGCCATGTGTTAAATCTAAAATCTCAGCAGCAACATTATTCAAAGCAGGAAAAGCAAGTCGATGTTGCTTTGCCAAAGGACAAACACCACATGTATTATGACTATGAACAAAATCAGAAAAAGTCAAAATACTTGATAAATCCTTCATTCGAGCAGTAGAAGGATGCTCCAAACCTTGATGTCAAACATAATTGGAAGTTTTACATACTAGAGCAGGTTTTTCAATATATTTGGTGAAACCTTCATCTTTGTCAATGTGTATAGAAGGCAAATAAAGGTCATCGACAAGCTTAACCTTCCCAATTGTTCTCAATTTTAACTTGCCTTGAATGAGACAATGATCATTAGAGAAAAGAATAGAGTAATATTGATCCTTCAGCAGAACACTAATAGATAACATATTATATATAGGGCAAATTCTAGAATGAAAAGCACATCATGGAGCCAAACATCTGTCTGTAAGATGACATCACCTATGAACTCAACTATAAATGGAGTTTGATTAGGGACAACAACTGATATATTATAAGCATGTCTGAGATTAACAAATAAGGAACTATTGTGATTTATATGACTGGACCCACTGAAATCAAGAACCTAGACAATGTGATGATTATGCATAGACGACATAAGAGTAGAGAAACATGTACCTACTATATGAGTAGTCTCATTCTCGATAGTACCTTCACTTTCAGTAGTTGTAAGATGAGATTGCAACATGTTTAAGAGCTGCGAGTATTAATCACCAGTAAGGCTCACAAAAAATGCAGATTGATAATTGACTTTGTACCATCAAGATTCTTATTAGATCAAATTGAAGAAGATGTTGTAGAAACAGCTTCTTTCAGATGAATAGAGGAATTATTATCGTTGAATTTGTATCATGGTGGATATCTATGGAGCTTGTAACACTTATCAATGACGTAACCTTTAATACCACACTCGGAACATATTGGACGTTGTCCATCTTTCTTCTTGAATCAATGGGAGTTTGTTCGTTTTGTACTGTCAAAGGTTGTCATTAGAGTAACGACTTCAATTGATGAAGAAGAGCATCCAATAGATCATTGTCTTTCTTCTTGAATTATCAACGAAAACATCTTATTAATAGTCGACAAAGGATCAATCAGAAGAATTTGAGCATGAATCTAAACATACAACTCCTTCAGTCCCTTGAGAAATATCATAACGAACTCGACATAAAGAAACTCTAGCAATTTCTTCGATCTGTCACAAGTGCATTTATCAAGAGGTTGATACTCTATGAGATCTTGCCAAATAGTAGTAATTTTAGCATAGTAAGCTTCGTCAATAGAAAGAATACTTTGCGTATTTGTAACAAGATCCTTTTGCAATTAATATATGTGAGAGTCGTTGGACTAATGATAATGCTCCTTCAAATTTTTAGTGTAAACCAAGCTTGTAGCAATTTCTTTTAAAATTGAATTAATAATACACGATGTGATGATATCGTTGTTGCACTACCAAGCTAACAAACGATTTCCTTCAGTCGTCAATTTCAAAATAGTTCGATGATACAACCTAATTAACTTTTTACCAGAGACAACTCCAAAATAACTTGATCCAGCAAGTGGTTGAGTGACAAGATTGGTCGTTGTCAGAGAAACCGAATGATGTAAAAGGTATGAATTCAACTAAACTTCAAGTATGAAATTGTAAGAGATGAAGTCACGATAAGGATAAAATGAGAATGTAAAGATTCACCCCTCAAAACTATCTTTTTATATATAATATAGATTAGGACTAGATTGAAAAATGTTTTACCAAAGATTAAATTAAAAAATTTTAAAGACTAAATTAAAAAAAAAAAAAGAATAGTAAGGACTAGAACGTATATTAGTAGAGAGTAATTTAGTACGAAAAGAAGTAAAGAATAATTTTGAAAAGTAAACTTCAACTCTCTCTTTTTGTAGGCAAGTTTTTAGCATTGGGCTGTTTCGATCTGTCATTATGGCCCAAAATGCCCCAAGTGGCCCATCAAAGTCCGAACCGACTTTAAATTAGGGTTTTTGTCACTATATATATAAATCCGAAGCCCTGGAATACAGAACGTCGTCGATCTCGTCACTCGCCTCGGTCACCAGACCATTGTTGTTCTTTGGTGGATCGGTTAGCAGGTCTTCAACATGAGGGCTAAGGTAAGTTTCGAAGTTTTTTAATCAAGTTTTTTTACTCATAGCATGGTTCTTCTGTTGATTTTTATTGTTGGTTTGTTTTTTTCTTTCGATTCACCAGTGGAAGAAGAAGAGAATGAGGAGATTGAAGAGGAAGCGCCGAAAGATGAGGCAGAGATCCAAGTAGTTTGTGTCTTTTTTAAATAAAAAATAGTCGTTCTTTTAGTCGCTACTGATCTAGGACGAGTAATAGTTGAATTTCTTGTGTTTTTGTTGGATTTTTATCGAGTTCTTTTAGTTTCAATGAGCAATTTTGTTTGACTTACTTCCCACTGGGATCTACGTTATTGAATTCGCTGTCTGGAGTTTATGAAATATCAGTTGATGATATGTTGTTTGCCACCATTATCTTATAACTTATTTTTTTTCTCCGTTTCAAGTATGTATCCGTATCCAACGAAATAGCCGTGACCCGTTCTAACATTCCATCGCTGTAAGCATGTAAACGCTTTAAAGTTGCAGTCGATCTTCCCCATTTTACGCTCGGATAGAAGAATAAGATTGCTGTGATAATTCTGAGTGAATATGAAGATCGTTCTTAGATACTTTTTTATTTTGGTAATTGCAACCCATTTGGTTATTCGATGTTAATAGCTGCTGTGTAATGTCTCGAATGCAATTATCTGATCAAACGATTGGTTTCATATTAGTTCGGGCACTCGCATAAGAGAACGTTGAGCCAATACTCCCGTTCATTATTTTAGCTTGAAATATTCATCTGATGTATTTTTTGTGATTGTCATTCTAGTGTTTTAAGTTGCCTGTGTTGGATTCAATCTTAAAATTATGAGTGACGGCTGAGTAAGTCTATACTTTTGTTAAATGTATCACACTAATTAATGTTCTGCAACGGAATGTTGATGTAAGGAATGAGAA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mRNA sequence

ATGGCCCCTGGAATACAGAACGTCGTCGATCTCGTCACTCGCCTCGGTCACCAGACCATTGTTGTTCTTTGGTGGATCGTGGAAGAAGAAGAGAATGAGGAGATTGAAGAGGAAGCGCCGAAAGATGAGGCAGAGATCCAATATGTATCCGTATCCAACGAAATAGCCGTGACCCGTTCTAACATTCCATCGCTGATAAGTATGCTTTTAATGCGGCCACCAACACTAGCCATATCAGCCCTTATTGTTGTGAGCTTCAACCCCTTGATCACTTGGATGAGCTCTGTGAACAGTTCTGGCCGATCATCACAGCTCACTGATACCTTTATCGCAATATTGTTCCTGCTGTTGTCTTCAACCATGGTGGAGTCAATAGTTACTTCATCCATGTCTGTTGGAACTGTCATGTTCTTGCTGGCTTCCATTGCTTTTTGTTTCAGGTCATCACAGATAGAAAGAGAAAGGGCTGAAGAGAGAGAAAGAGAAAGACAAGAGTACCTTATCAGACTTGGGAATGAGTTTCCTAAGGGTTGCAAGCTGAGCATTGATTCTGTCCCTACGCCTCTTTTCTGCTTGGCTATGGCTCTTGGAAGCAGAAGCTGCTCTATCTTCAGCAATAATTCCTTCTGCTGGAGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCCCCTGGAATACAGAACGTCGTCGATCTCGTCACTCGCCTCGGTCACCAGACCATTGTTGTTCTTTGGTGGATCGTGGAAGAAGAAGAGAATGAGGAGATTGAAGAGGAAGCGCCGAAAGATGAGGCAGAGATCCAATATGTATCCGTATCCAACGAAATAGCCGTGACCCGTTCTAACATTCCATCGCTGATAAGTATGCTTTTAATGCGGCCACCAACACTAGCCATATCAGCCCTTATTGTTGTGAGCTTCAACCCCTTGATCACTTGGATGAGCTCTGTGAACAGTTCTGGCCGATCATCACAGCTCACTGATACCTTTATCGCAATATTGTTCCTGCTGTTGTCTTCAACCATGGTGGAGTCAATAGTTACTTCATCCATGTCTGTTGGAACTGTCATGTTCTTGCTGGCTTCCATTGCTTTTTGTTTCAGGTCATCACAGATAGAAAGAGAAAGGGCTGAAGAGAGAGAAAGAGAAAGACAAGAGTACCTTATCAGACTTGGGAATGAGTTTCCTAAGGGTTGCAAGCTGAGCATTGATTCTGTCCCTACGCCTCTTTTCTGCTTGGCTATGGCTCTTGGAAGCAGAAGCTGCTCTATCTTCAGCAATAATTCCTTCTGCTGGAGTTGA

Protein sequence

MAPGIQNVVDLVTRLGHQTIVVLWWIVEEEENEEIEEEAPKDEAEIQYVSVSNEIAVTRSNIPSLISMLLMRPPTLAISALIVVSFNPLITWMSSVNSSGRSSQLTDTFIAILFLLLSSTMVESIVTSSMSVGTVMFLLASIAFCFRSSQIERERAEERERERQEYLIRLGNEFPKGCKLSIDSVPTPLFCLAMALGSRSCSIFSNNSFCWS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi03G002990.1Lsi03G002990.1mRNA