Lsi02G017350 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTTCGTTGTTTTTGCTTGTGTTCTTGGATCCGTTGTGTGTAGGTTGTAGTTGAGACAGAGACGAAGGAGCAAATCACAGGCTATAGTCGGAGACAAAGGGCACCATATAAAGGTTTGGACTCATACTGACTTATTCTAAACGTCGATCTCAATCTAAAGTGGTTTCTTCATTTGAATTGTTTCCAATGTACTCCATATTTTCATCTTCTTTTGATTTGTTTTCAAACATAGTTGTACGCATTGTTCACGAGGAGGTGGTGCCCGTCTTTTCTGATCATGGGTGCTATCATTTTATGAATCTTTTTTTTTGTTAATCGTAATAGGTTTTATACTGAACAAATGATTGTTCTGCAGAATTTTATGACCTCTAATACAAGCCACATCTATCTAAATGAATGCGCCAAAATTCTATAATAACATGAAATCAATGTTTCATGTCTTTATTTAAACTTCTTAAATTCATAAAATTCCTGAACATCTACTGTGTTTGTAACGTTGCTTTGCAGGATTTGTGATGTCATGTCATTTGGTCTCTATTTCTATTTCTCACTGTTACATCATTTAGTTGCTTAGTGCCTCCCTTCCTGCCTACGTCAGTGCCACAGGTATCTTCCCTTCTTCCCTGTTCCCATCTTCCTTATGTTTGATATTTATAATTTATCTTTGTATATGTCGGGATAATAGATTGAGCTAATATTAGCATCTCTCTGTTTTCCTTTTCTATAAGCCGTTATCTTCAACAATAATTTTGTTTATTTGCTACAAACTCAGAGTTAGCTTTTTAAGGCCTGTTTGGTAATCATTCGAATTTTGGTTTTTAGTTATTGAAAATTAAGCCTATAAAAACACTCCTATTGCTTTGTTATCTACTTTTTACCAATATTTTTAAAAAGACACAAATCATTGTAACAAATGGAGAGAAAATAGGCTTAATTTTCAAAAATCAAAAACAAAAAGTTAATGATTACCAAATGGGGCTTGAGTAATTCTAAACTATTGACACATTTTTATTCTCGTGCTTGATCTTTTGAATTGTTGATTCTACATAACTACATTAGTATCTATGTTTTGAATTACTTTTCTAATTTTTTATGTTTTTCCCCTCAATTTTTTTTAAGAACTTAATTTGTTCTTTGCTTACTTTTTATAATCCTGCAACTATTTATATTTATTTTTTTAATTTTCTATTTTTATCTTTTCCAAATCCTATTCTTTCCATTTTCTTTTGCAACTATTGAATGCTTTTTTAAAATTTGAATATTAGTGGCAAGTAATCTTCAATTCCAGGGAAGATAATATCGTTGTGTATTTGCTTCAGACTCAATGTCAGCTTTTTAAGTTAACTCTAAACTATTGGCTTCTCGTTTAGATTCTTGTGCTTGGTCTTTTGGACTGTCATTCTATATAATTATCTATATTAGTATCTATTTTTTTATTCTTGTTTTAAGTTAATTTGTTCCTTGCTTATTTTTCATAATGCTGCAGCTGTTTATATTTATTTATTTTATTTTCTACTTTTGTATATCGTTTCTTTTATCATTTCCAAATCATATTCTTTTTCCATTTTCATTGGCAACCTATAAAATGGCTTTTTTTTTTTTAGAATTTGAATAATAGTTGCAAATAATCTTTAAATCCAAGGAAGTTAATATTGTTTGTTAAGAGATGGTTTTGCCACGTGTTGGAGATTTATAAACCAATCCTTAGGGTTGATGCATGTCCCATTTAAAGAATTTTCTAAGGTTTGAAGATTATTTGACGATAATTTTCATTTCCCTAGGCAAATCGCATCATTTAGTCAGAGATGATTTAATTGAGTGATTGATTCTCCATGGTTTTAATACAATCTTGTAAGAGCCATTTTTCCATTATTAAAGATTTCTACAACCTAACCTTTACTCAATCTAGTCAGGTTTTCTAGTATTTGAAGATTAGTAGGAGGTAACCTTCAATTTCTGAGGTGTTAGTGAGTTGATTATAGCCTTAAATTTAATTGAATAAATACCCACCTCTTTGTTATTAATATGACTTTCAATGAGATAAAAATGAACGAAAACAAGGGCATACAAGAAATCAAGCCCACAAAGACAGAGAGGAATCTCTCAAAAGGAAGGGATTCCAACTATAGAAAATAGGATCATGTGGACCAGACATAAAAAAAAATCTATCTCTAACCCTTGAAACATCTTGTTATTTTGTTTCCCCCACATGACCCTAAGAACAACACACATCTCGACCATCCATCAAAAGCACTCCTCTCCAGAAGGCAGATAGAGGAGGTCCGACCATATCACTAGGAAAGGAACCCTATTAAGTGAATTTTCTAGGTTTTTAAGATTAGTATCCTCTATCCAATGACTCTTGATCCTGTTCTTGAAGAATTTTATAATCCCTAGGACTTATTCGGTAGTGAGGTAGATTTAGTAAAACAAAGCCAAGAAGGAAGTCAATTTGATGTTGAATGCCCCTTAGGGGTGGGAGGTCCGAAGGTGTTTTCGTAATATTTGGAAATTCTTCCAACAAATGAATCTCCCTATAGACGGTATTCTCACAATCACCCGTTTCTTAGCCATCAACAATAAGTGCCCAAACTTCAATGTTTTGAAATGAAAGGTTCTTTATGAATAACAGTATAAAGTTGCCTTTTGGATGTTCCTTCTTCACCTTTCTTGGCCATTTCCTCACCATTTTAAGGTAAAAGAACTACTTTACGGCCCCTCCGGTTGAACTCGTAGGTGTTATCTCTTTCTTACGTCCTAACAAGCTATGGCAAACATTCATATCAAGAACATAACAAAGTATTTAAGAGAGAGAACATTTTACTTGTGTTAAAGATTTCTAACATAGCCCTTACAGTGTTGTTTATCAACATTGATGATTGTTCTAGAATTTGGAGATTAGCGGGAGATGATCTTCAAATCTCTATAGGAGTTTATACAATTTTATCTAATCCTTTCATACGTCAAAGAATTCCAACCTAACCTTTAGTGATATTGATGTTGTTCTAGTGTTTGAAGATTAACACGAGATGGTATTCAATGTCATAAGATAATTCATATCATCTAGTAAGAGATGTTGTTGCTCTTTGATTCAAAGAACACATTCTAGAGTTTGAAGATTTGCGGGAGATAATCTTCAATTTTCTTGGGAGCACATATTAATTGGCTGGAAACGATTTTGCCATGTTCTAAAGATTCCTGACCTAACCGTAAAGATCGATCACCCATATTAAGTGGATTTTCTAGGTTTTGAAGATTAGCGGGAGATAATCTTCAATTTCCTAGGAATTTCATATGTTTTGGAAAGAGATAAATTGCTTTGTGTTAAAGATTTCTCACTTAGCCCTTGAAGTTATTCCACAAGATTGATGACTCTTCTAGAATTTGATGATTAGCGGGAGATGATCTTCAAATATCTATAGAGTTTATACAATTTTGTCTGATTGCCACATCTTGGCTAGCATTTTAAGAGAGATCTCCATTCGAGCCAATGTCGGGTCTCCCTTGATCACGATCTTCGCATCCCCAGCCGTAAAGGTCATTGTTAGCTCCCTCCAGTCAATCGTCATAGCCCCTTGTTTTCGCAGCCATTTCATTCCCAAGTCCATGTCCAAATTTCCCAATTTCAGCGGCAAAGAATCATCCACAAACGTCACTTCTGGTAGGCTTACCGTGACGCCTCGACATATCCCTTTCCCTTGAACAGCCTGCCCGGAACCCATTATGACTCCATAGTTGGTTGTCTCTGTCAATGGTAGATTAAGGAGTTCCACCACTTGCTATGCCACGATGTTGAGGGTAGCTTCGTGTCACAATCGTACTTTGCTAAACGATTGTGCGGCACTTGTCCTCGCTCAGGAACAAGTCAGCCAACTCTGATTCAAATCACCTTCGGCACACCGGGTGCCTCTCGCAACGACTATCCCCGTTTCTAGAGGGAAACGGGTTTAGAGGAAAGGGCTTTCGCAAACAGTTTAGAAGAATGTTTGAGAAAAAAAATGTGTCGTAAGGCTAGAAAGCATAATAGGGGACAACAACGGCTTTATAGCTTACAACTCTCGGGTATGCAAGTATGATGATTAGTCTCACTCGCATATAGTACATTATAAGCTTTTACAAGAGTGACATGGTTGCACGTACAAAGTGCTACGCCGTCACAAGAAATGAAAAGTAAAGGAAAGCGATAAAGGAAAGCGGTAAACAAACATAATGAAATACATACTATGAAATGACATAGGGTTCGGAACGGTAATGCGGCCATAGGCAACACGCCCTGGACAAGCATGACCGTGACACTTCGCAGTCCACCATCACCACGATTTCTTGGTCTCCCACTAAGCCTTTAAGTTTGAATGTTCCGGGGGTTGTGAGACCCACTATCGAGTTCAATGATAACTCGACTATCGGACTTACTTCCAGCATGCGACTCCATCGGAGTGTCTTCCGTTTCCATCTTGTCCAAATCGTCAGCCACCATGTACAGTCTTAACTCTTTATTCTTACAACGATGCCCCTTGCTAAACGGCTTGTCACAGCGAAAACACAGTCCTTTGTCTTTCCGTGCGTGCAATTTCGAATCCGTCCACTTGCGAAAAGGAGGGTCTCGACGATTCGTTCCCGAAGTAGGTCCTGGAGCTGGAATATTTTCTGCCAGAGTGATGGTGCGTGTTGTCACCCCATCTGCGCTCTTGACCGTTGGCCTTTGGGCTGGTTTCCAGTCCTTGCCGTATGGGCCTGGGGCCGATAGGGCCGTTTCGATTCTATCTTCTGCCAACTGGGCCGCATCCATCATATCTTCCAGGCCCACGACCCGCATGGAAAAGACCTCAGTTCTAATCACTGGGTCCAAGTCGTTTGTGAACGTGTTTACCAGGACGTCCTCCGCCATATCCGGCAACGGAGCCGAGAGCTCCTCAAACCTCTGCAAATAATCGGTAACAGTCCCTTCCTGCTTGATTGTTAAGAAACGAGCGCACGACATCCCTCTTTGTCGTG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Match: A0A5A7TEV5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold98G00210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 305.4 bits (781), Expect = 2.1e-79 Identity = 159/188 (84.57%), Postives = 166/188 (88.30%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi02G017350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPH3 (uncharacterized protein LOC103503323 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503323 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 305.4 bits (781), Expect = 2.1e-79 Identity = 159/188 (84.57%), Postives = 166/188 (88.30%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi02G017350 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KTZ2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G487730 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 304.3 bits (778), Expect = 4.8e-79 Identity = 159/188 (84.57%), Postives = 165/188 (87.77%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi02G017350 vs. NCBI nr
Match: XP_022999560.1 (uncharacterized protein LOC111493888 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 321.6 bits (823), Expect = 6.0e-84 Identity = 163/187 (87.17%), Postives = 171/187 (91.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi02G017350 vs. NCBI nr
Match: XP_038889576.1 (uncharacterized protein LOC120079457 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 319.7 bits (818), Expect = 2.3e-83 Identity = 166/188 (88.30%), Postives = 172/188 (91.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi02G017350 vs. NCBI nr
Match: KAG6599044.1 (hypothetical protein SDJN03_08822, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 319.3 bits (817), Expect = 3.0e-83 Identity = 162/187 (86.63%), Postives = 170/187 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi02G017350 vs. NCBI nr
Match: XP_022946374.1 (uncharacterized protein LOC111450455 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 318.9 bits (816), Expect = 3.9e-83 Identity = 161/187 (86.10%), Postives = 170/187 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi02G017350 vs. NCBI nr
Match: KAG7029989.1 (hypothetical protein SDJN02_08333, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 317.8 bits (813), Expect = 8.6e-83 Identity = 161/187 (86.10%), Postives = 170/187 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lsi02G017350 vs. TAIR 10
Match: AT2G03420.1 (unknown protein; Has 38 Blast hits to 38 proteins in 17 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 38; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 176.8 bits (447), Expect = 2.2e-44 Identity = 92/168 (54.76%), Postives = 119/168 (70.83%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1
Date Performed: 2021-10-18 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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