Lsi02G010480 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1

Overview
NameLsi02G010480
Typegene
OrganismLagenaria siceraria (Bottle gourd (USVL1VR-Ls) v1)
DescriptionCOX assembly mitochondrial protein
Locationchr02: 11319940 .. 11334529 (+)
RNA-Seq ExpressionLsi02G010480
SyntenyLsi02G010480
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGGTGATTTTCAATCCAAATATTAATGTTTAAAATGACAAGCATGAATCACAAAGCTCATGAGCTTTGTATTTCCTTCGCACTTGACAAAAAGATACTCTTGGATAAAACTACTGTGCTGTTTTGAACGAAAAGCAACCACAAAACTTCATAATTTATTCAAATACCTGTCCTAACCTGTCAAAAGCTTCTACAAAATTTGAAAGTAATATAGATATTATAGATTTTTAAATTTTTATTCAATTTGATATGGTTAAAAAAAACCTTTGATTTATACTTCTTTTTTTTTTAAAATAAACATAAATGCATACTTTTGAAGCTAAAATTAAAAACTATCTATTTTAAGAAAGAAAACATATTTATATCTAAACATACCTTCATTAATTAATTTTTTTATTTCTTCTCAATTTTTTTGGCATTAATAGAAAAAATAATTTTGATTTAGAAGAGATGAAAAAAAAAATGTCTTAACAAATTCGGTTTGGTCTCTTCAACAACACAATCTTCCTTTTTTTTTAAAAAAAGACACAACCAACAAAGAAAAAAATGACTCTATTATATGTAGATGATATCCTTCTCATTGGGAATGAGGTAGGTTTCCTAACTAACATAAAACAATGGCTATCAACCCAATTCCAAATGAAAGATTAGGTGAGGCTAAGTTTGTTCTTGGAATCCAAATAGTTCGAAATCGCAAGAACAAAACGTTAGTCATGTCTCAAGCATCTTATATTGACAAAATGTTGTCTAGATATAAGATGCAGAATTCCAAGAGGGTTGTTACCGTTCAGACATGGAATTCATTTGTCACTCTGTATTGTGATAACAGTGGCGCAGTTGCAAACTCAAAAGAATCTAGAAGCCATAAGTGCAACAAACACATTGAGCACAAGTACCATCTCATCAGGGAGATAGTACAAAGAGAAGACATTATCGTCAAGCAGATAACAGTAGAAGATAACATTGTTGATCTGTTTACAAAGTTCCTTACGTCTAAAGTGTTTAAAGGTCACCTAGTGAGTCTAGAACTTCGAGTTGTATAATCTAGGGCAAGTGGGAGAAAGACATGGGTATCTAATGCCCTAGTTTATTGTATTTATTAATTTTCTCTCTGTAAATTCAACTATATATATACCCCACTAGGAGTTTTAGTCCAAGTGGGAGTTTGTTGGGTTTTATGTCCTGAAACTCGTAGTTTGTAAACACTAACGTGCATTCTATTTATCAATAAAGTTGTTATCGAGGTTATTCAGTAAACTTGTTATTGTGAGTAAGTGAATTGTTGTTAATATAACTTTAAATGCAATAAACTAAGAACTCATGGCTATAGTATGTATACATAAACTATATATGTGGAGACATAAAAGTGGATCAAGTTCGAGTAAATAGCCAAAATCGTCTATAGTATAGGGATAAGGTTGGGTGCCTTATCCTAGTAACACTATTGAATGCGCCTCACTTTGTATTTGGTACAAACGATGTGATCTTGAATCGTTCATGTGGAGACATGTTAGTGGGGGTGTTCTATACAATGAGTTTGCGTAAGACCGGACCATAAAATAGTCACTATTACTTTATAACGTCGTTTACTATTAACAATGACTATTTTAACTAGTTGACCTAGGTAACTCGATCTAAATCCTGAGCTAACTATGAACTCCTGTTTATTCGAGATTATTCTTAGATCTGTATGGGTGGGAGTGGTTCGGGTTTGCCAACTCAATATGTTCGGTTTGATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGTTGTATTTTGACCGTCATTAATAAATGATTATTCATTATTATTCAATAAATGTTATTGATTATTTTATCTTGTTTTAATAACCCTAAAATCCAATAAACTAACATCCTAGGTTTTTTTATGAGTCTTGAACAATATGTAGAGACATATAGAGATCAATGTTCAAGTTACAACCTAAAGGGTCTATAGTATAAAGATAGGGTTGGGTACCTTATCCTGGTAACACTATGGATACGGCCCACTTTGTATTTGATACAAACGCAATGATCCAACGCGTTCATGTAGGAGACATGCGAGTGGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACTGGACCACGAAATAGTAATCACTAGATGTAACTCCGTTGACTGGTTAGGTTTCTATTTCAATAGGTTGACCTAGGCAACTTAGTCTTAATCTTGAGTATATTGTGAACTCCTGTTCACGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTGGCCCGTTTGTCGACTCGATATGCCTACCATTTTGGGGACAAGACTGAGTGGGAGCTGGGAACATAATTATACAAGATGGATTTCACTCCTTCTCGACTGTAAGGTAAGTAGATAAGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCCGGGACTTGAACATAGGGCCTTACCCTCTCACTGGCCCGAGAGGGGTTTCTGTTTGATGGTTGGACCATAAACAAGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGATTTAGAAGTAACCCAGGAGTATAACGGTAATTTGACCCAGCTGGTGTTACGAACACTTGTGAAGGACTAACTTGCTGTCATTTGTCTATATCCGTGGACACAGAAATATATCTACAGTGAGAAGAGTGCAACTGTGGGTCTTTAATGGAGTGTACCCACAGTTAATGAATATTGATTAATGTGGTTAATGAGTTTAGCCCGTTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTTCATTAGGTCCCCTTCCTATCTCGTAAAGAATATTGAGGTTATTATTGGTTGAAATTTGAATAGTTCAAATTTTCTAAGGGAAAAGTATAATGTATAATGATATATTATAATATAAAGTTTATTTTACAAATTAAACTTTATAGTATAAATATAATTTTGGATATGATTCAAAGTTAATTTGTAAGAGAATTAAATATTTGAAATTGTTCAAATATTATTTTATTAAACTATAGGTTAAAATTAATGTGCATTAGATGTACATTAAAACTATAGGTTATGAAAGAAATGTATTTGAATTTGATTCAAATGCAGGTTAAAATTAAATATTTGATATTTAATTTGGTAATTAATTAATTGGAGAATTAATTAGTTATTTAATTTAATCTAATTTAATTAAATTTGATTTAATTAAATTAATTGAATTAAAACTATAGGTTATGTGAGAGATGTTCATTTAAATATGATTTAAATGAATTGATTAATTAAATTAGATTTAATTAATTTAATTAATTATTAATTTAATTAATTATTGATTTAGTTAATTAATTTAATTTTAATTAATTAAGTTTGTTGTAACTCCCACGTAGGGAAGTTACTTAATACGTGGGATAACACCCACGTTTCCCATTTTTCTCTCGCTTCTTTATATAGTGCAAAAACAGAATTTTGTTTGGGGTGAACCATTCTCTCAACAAAAAACAAAATTCTCAGCGTTCTCTAAAAAAAGATATCCAGAAGAGTTCTGTATTTTTTTTCCTGTGCCAAAAAGGTTCCACAAACCTTCTCTTAAGATTCAGAGAATAGGAAGGTCTCCAAGTGGTGGTGACACAACACATAAGAGTTTTTATTCTCTAATTTTTTGCTTAACCTAGATTAATTTAAGTCTTTTTTGCCAATGTAAAAGTATTTCAAAATTATTAAAATTAATTTTGAGATACGGTTCTGATACGTTTCCGCTGCGTTTTGGGTTTTAATCCCAGCACAATATGCCTCCCATTTCAGGGGTAAGATCGAGTAGATAGATGGAGATATAGTCTTGCAAGATGGAATTCACTCCTACCTGACTTAGGGTTAGTAGATAGGTTGTCCCCTCAAGTACTGATTTTGGGTCTTGAAGAAGGGGTCTCACCCTCTCATTGGCTTGAGAAGGACTCAGTTTAGTGATAGGATCACAAACCAATTGTTCATTAGAAGATCAGTGGAACTTAAGGAACAAGATATATTCACAGAAGTAAAATGATAATTTTGACCTAGCTGTGATTACGAACAACTTGTGAAGGATCGACTTATTAATTATGGTTATATCAAGTGGACATAAATATATCTACAGTGAAGAGAGTGCAGCTACGCACTTTAGTGGAGTGTCTCGTTAGTTGACGAATGTTGGTTAACTAGGTTAAAGAGTTTGGTTAGTTAATCTCGAATCGTTGGAGCTCATGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCTCTACTAGCTCATAAATGGATAAAACCTTAGATAGTGTGGTGAATAAATTTGAAACGTTCAAAATCGACTTAGGGAATAGACGTTGGATATATGTGATAGTTCTTGACATGTTAAACGTTTAATTACGAATTAAATGGACAAGAGAGTTAAGAATAATATTTAAATTTTATTTAAATATTAAAAATTTAAATAGGGATTCATATTCGAAAAATCGTTTTTTGAAAAATCGAGGTTGGTGTGAATATAATATTATTTTAATATTTAATATTAAATATTAAATTAATATTATTTTAATTAATTAAATTAATTTTTATAAAATTATTTATTTTATTTTAAATTAATTTTATTAATTAAAAATTAATTTTTTTAAGAAAAATGAAAAGTTGGAATTTCTCACTAAATAAGCTAGGAGTTTAGTTGTTAATCTCTCAATTAGCCACACAAATTGGACAAATTTGTTGTCAATTTGACATGCAATTGGATTGCATACTTATCCTTGGTAAATAAAGATGTATTTGGCTAAATTTTGGGTTGAGATTTTTGCAAATTAAAGGTTATTTTTGCTAAAATCTCTTAAGAACTCCCTTTCCTCTTCGACTTTCATTTCCTCACAAATTCACCACAAATTTGGACCCACCATCTAATCTAAGGCCTGAGAATAGTAGAGAAGACTCTTGTAATGGTCTACAAGCAATTGGTGTTCCATTTCGTGGAGAAATCAAGGAAAATTTGATCTTCAAAGGTTGCAATTTCTAATTATCTACTTTTCCCCTCTTTTGTATGAAAGTTTATCCTTAAAATTGGGCAT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TTGATAATATTAGTTGCTTGGTAGTCATTGGTTTGTTAAAAAAGAGATTGTTGTTATGTTAATGTTTTTGTTAGTGAGTTTTGTTATGGTTATTGGCAGTCATGTTGTTTTTGAATTTATAACTAGTGTGCTAGAAGACTTTAATAAATGTATTGAAAATAATGTCGATGATAAGTTGTCTTTAATTTTTATATTGGAACATATGGCTTATAAATAGTTTTGTTGTTGGTAAGTTCATGGCTTCGTGTTTTTAGATTTGTCTTTGGTTTTGATATCAAATTCTTATTTCCATGTTTGGATCGTTAAATTGTTAAATTGATCATTGCTTAAATTGCTAAATTGTTCATGGTTGTTATAGCCCAATTTTGTACTAGTATCTTTTCTCTTAGATTTGACAAACTTACTTGTTTGGGTTCATAAAATTTGTTTATGGTTTTCATTAAATTGTTTGTGTTTATAAGTTTATAAAGAAGAAATTTTAAAATATCTCAGTTAGTGAAAACATCATGTTAAATAATCTATTGAACTTTTGCAGTGTTGTTTAGTTTTTAATAGTAGTTTTTTATATACGCTAAGAAAAGACATGTTTTTTTTTTCTTTTTTTTGCAGGAAAACCTCCAGATTGGCAAGATTTTGGTTGTATGATGAGATTCAGCTGCGCGATTATTTTAGTTTTGTTGTTTTTGTTTTTGTTGGATGTATCTATATGACCCACCAAAATAGACAACCAACTCTCTAGATCTTTAGACTTTAGAGGTTTATGTATAATATATTGGTCAATATAACTTGTTGATAGGTTAGTTAAACAATTTGTCACTTTCTTTATAGTGAATTAGTTAATTTTTGTGTTTGTTTAAACTTAATTTGTATATATAAAAGCAATTAAGATTTTATTTTGTGCATGTACAAATAAAAGAGAAATATCATTGTTCCTAAAAAAAGAGAAATATTATTGATTTGCACGTGTGTAAGAAGTATATATATATATATATATTAATAACATAACAATGACGAACATTTAATATCAGACAGTTACTGACCAAAAGCAGGTGAAAAACTGACATTGAAAATGATGTTCAGTGTCAGTCGAAAACCAACATTGAAAATAATTGACATTGAAATTTTGGTCATCTATAATCTTGGTTTAAAACCGACATTAAACACAACCAACATTGAAGACCTTTTAAAATACGATCTTCGATGTCGGTTGTCAACCAACATTGTACTCCTAATGTCTGTTTTAAACTGACATTAAATCCCAGTTTTGTATTAGTGTTTGGAGCAATTCTATGTTGGGTAACCTCTTGAGAATTTTTCTAGGAAATATGTGAGTGAGGACAAGGTATACTAAAAGGACCTGTGTTGTCCGACATCGATGTTGTCCTATGGCTAGATTGAAACCATAGTTAATTGAACATGTACAATATAACTACACTGTATTAAAAAAATCATATGAAATATAGTTATCTGAAACGTGGGCATCATATCTACTGAGGGCAATTGAGGAATTATTAAAATTAGGTCTCATGTATGAGTGGTGTGTTTGTCATTCTGCAGAATAAATCTGAATTTTGCTATTTTTCCAACCGAAAATCACAAATTCTCTATTTAATAAGAGTTGTTTAGATTGAAGAAATTTTACAATCCGAACAATTAGGTTGGGTATAAAAATTGTTTCAATCCAACTAAAACAACCCACGAATGCCCCTACATATATATATTTAGCATGCATTAATGATTATTTATTTGTTTATTTTATTAGTCTCCCAAAGAAACTAACCATTTCCTTTCTATTTTAATTGTTTCAAAAATCGATAAGATTTTGTATTATTTTTGAATTTTTTTTATCTAATTCGTTTACTTCTAATTAACCTTCTATATAAATATAAATAGGTAAAACATTTTGTCATTTCTTAAAAGGAAAGTTCATTGCTAAGTAAAAACAATGCATGCCTTTTCTTTTGTGTCAAATTGACTAGTTCAAGTTATTTCTTATTATATATAAATATATATTATATTTGGGTTGTTTTCAAATACAGAACAATGAGCCTAACTATTTACAAATATAAAAAAATTTACCGTCTATCCACTTCTCAAGCTCTTCTTGGGTATGTCACTATGAACTCGACTCTTTCACGACTTAGAGTCGAATTGCTACAACGTTCCTTTTTCATCATTTTCCAAGTTCAAGAACAAACCTGATCATTTCCATTATTGAGGATCAAACCGTTACAACCACTATTTTTATGGATCAAGAGTAACCCTTACAATGAATTTGGAAATGAAGAACAAGATGAGAAAAACTCTCTCAAAGAGTAAAATTACAAATTTAAGCACTCAACAAATAAATTCTTACAATACAGTATATCTCTCTCAAGAATAAGATGAAAATAAAAAATGAGAGTTTTGAGAGTATAACAATGGTGGCTTTGAGGATTGTAAAAATATGTAATTTTTGTTTTAATTTTGGAAAAGATGAAGAGTTTAAAAAAAGATGGGTAAGTGAAAACCAAAATTAATTTGGGTCATCGGATGTTGGTAAAAGAAAATTGAATGGTGGAGATTTAAACTCAACTAGTCTTTAGACACAAACATAATATAATATAATATATATATATATATATTTAAATAAATTAGTTTCTTTTAATACCCTTTAAAACCCAACAAAAAAATAAAAGTCCACCATGTGTCCAATTAGCCCTTAGACACAAACATAAAATAATATTAAATTCATTTTCTTTTTAAAATTAATTCAAATATAAAAAAACCACCCTATGCCATTCCTCCCATGCTCCAAGTGGCACTTTTCAATTGGTCCACTTTGATGAAAAAAATCTACCACGTCATCAGCTCGAGACTTTTCCTTTAAGCTTTTTTCAGTTATATCTTCTTCGTTGAGCTTTTATTTGAATGATTCAAAATGCGTTGGAATCGTTGGTTCGAGCTCTATGCAATGAAAACTTCAAAACATCAAAATTGTAAATAAATTAATTCAGGTTTGTTATCATCAAAACATTAATTAATTAATTTGAGATTAAGGGCCAAAAAAGCCAACAATCTCCCTCTCTTTGATGATGACAAACAACTCAAGAAAAATGAATTCTAAAGTTGTGTGTGATGTGATTATATGAACTTGAATCGCAATCAACACACATACATAATTTCAATTCACTTGATATTAGGTATAAACTTAAATAATGAATATTCAATAAAAGCATGCTTCCATTTTTCTTATTAACTTCTCCCCTTTTGAAATCAATCAAAAAAGGGCAATTAAGAAAAATAAACAATGACATGAAAGCTTCTCCTAAAATCATGAATACATAATTTTGCATTTGTTCTCCCATTAACATGCCTTCTAAAAACAATATAACAAGCAACAACATTGTAAATTCTAGAGGCATCATAAAGAATCAGCCAAGTTTAGGCTAATTCTATTAATGACCAATTTCACAAATTTCTTCCCCTTTTGAAAACAGTTGTACACTCCCCCTTAATAAGGGACAAAAAGACATTTAGCACATAAATCAACTTGAGGGTAGAAATATCATACAAATATCATACATATTTTCAACAATATATTTTTACGTCAAAGACAATTGTTCCCTCTAAAAGGATAAGCAATATGCATAAGAGGGGTACACAACAATAAAGTAATAACTCCCCACTAAAATAAAGCATTCTCCTTCTAATAAAAAATATCAATACAAACGAAAGAGATAAAATCATTCTAGTAGAATTCAGGTAATTGAGATATCAAAGATCAAATATTATAAAATAAACACTAATTGTTGAAAAACAAATCATAATACTAAATAAAAGCAAATCAACATTATCACCTATTATGAGCGTGAATTAAGTTGGACTTTAGACCCGAACAACTTTAAATTACTCGGCTTAATCCATTTTATAAATTCACCCAATTTTATCAATTGTGGTCACCCAATTTTATCAATTGTGGTCCAGACTTTTTTAGTTTGTCATTTATTTGTCTCCAAATAAGATGAGCTTTTGTTGTAATGACGTGATGAAGTTTGGTTGCGCAAGTTTCTCATTTAGCAAGCGTAGTATTTGTACTATCAACCACTTCAATTATCTCACCCAATATATTGTAAAAATAAATAAATAAAATAACACAAAATTTATCATAAAGAAATAAAAAAATAAAAACAAGAAGATAGGTTTAATTTAGTAAATTTCAGAATATATACTCATTTGTTTTCTGAAAGCAAATATACAGAAACAGAAACCTTCTCTTCCGTCCCAAATGGTGTGGGACCCCATTGCCACAAAGCAAAGAAAGAGATGTCACCAACCGGCGAATCTCCTATATGTGGTGACGGCGGCTGCGAGCGGCTGGAGCAGGCTCTCCGAGAGTGCCACAAGCGACTTCCAGAAGGTCCGGCGCGGCGGTCGGCCTGCCGACACCTGAACCGATCTCTTGCACAGTGTCTGGTGGCGACGGCTTGCCCTAGCGAGGCGGAGGCGGTACGAACCCTCTGCTCCAGCGGCGGAACCACTCTGAAGAGATCGCAGTGCGAGCAAGCTAAGTTTTCGCTCTCTTTCTGTCTCTCATCTCTCCAATTTTGA

mRNA sequence

ATGGGAAAACCTCCAGATTGGCAAGATTTTGAAACAGAAACCTTCTCTTCCGTCCCAAATGGTGTGGGACCCCATTGCCACAAAGCAAAGAAAGAGATGTCACCAACCGGCGAATCTCCTATATGTGGTGACGGCGGCTGCGAGCGGCTGGAGCAGGCTCTCCGAGAGTGCCACAAGCGACTTCCAGAAGGTCCGGCGCGGCGGTCGGCCTGCCGACACCTGAACCGATCTCTTGCACAGTGTCTGGTGGCGACGGCTTGCCCTAGCGAGGCGGAGGCGGTACGAACCCTCTGCTCCAGCGGCGGAACCACTCTGAAGAGATCGCAGTGCGAGCAAGCTAAGTTTTCGCTCTCTTTCTGTCTCTCATCTCTCCAATTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGGAAAACCTCCAGATTGGCAAGATTTTGAAACAGAAACCTTCTCTTCCGTCCCAAATGGTGTGGGACCCCATTGCCACAAAGCAAAGAAAGAGATGTCACCAACCGGCGAATCTCCTATATGTGGTGACGGCGGCTGCGAGCGGCTGGAGCAGGCTCTCCGAGAGTGCCACAAGCGACTTCCAGAAGGTCCGGCGCGGCGGTCGGCCTGCCGACACCTGAACCGATCTCTTGCACAGTGTCTGGTGGCGACGGCTTGCCCTAGCGAGGCGGAGGCGGTACGAACCCTCTGCTCCAGCGGCGGAACCACTCTGAAGAGATCGCAGTGCGAGCAAGCTAAGTTTTCGCTCTCTTTCTGTCTCTCATCTCTCCAATTTTGA

Protein sequence

MGKPPDWQDFETETFSSVPNGVGPHCHKAKKEMSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAEAVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF
Homology
BLAST of Lsi02G010480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CLT3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold302G00190 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 3.4e-41
Identity = 86/94 (91.49%), Postives = 89/94 (94.68%), Query Frame = 0

Query: 33  MSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAE 92
           M P GESP+CGD GCERLEQALRECHKR+PEGPARRSACRHLNRSLA+CLVATACPSE E
Sbjct: 1   MLPIGESPMCGDDGCERLEQALRECHKRVPEGPARRSACRHLNRSLAECLVATACPSEVE 60

Query: 93  AVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 127
           AVRTLCSSGGT LKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF
Sbjct: 61  AVRTLCSSGGTALKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 94

BLAST of Lsi02G010480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C8S8 (uncharacterized protein LOC103498267 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498267 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 3.4e-41
Identity = 86/94 (91.49%), Postives = 89/94 (94.68%), Query Frame = 0

Query: 33  MSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAE 92
           M P GESP+CGD GCERLEQALRECHKR+PEGPARRSACRHLNRSLA+CLVATACPSE E
Sbjct: 1   MLPIGESPMCGDDGCERLEQALRECHKRVPEGPARRSACRHLNRSLAECLVATACPSEVE 60

Query: 93  AVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 127
           AVRTLCSSGGT LKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF
Sbjct: 61  AVRTLCSSGGTALKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 94

BLAST of Lsi02G010480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LYC1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G702000 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 176.4 bits (446), Expect = 7.5e-41
Identity = 86/94 (91.49%), Postives = 90/94 (95.74%), Query Frame = 0

Query: 33  MSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAE 92
           M P GESP+ GDGGC+RLEQALRECHKR+PEGPARRSACRHLNRSLA+CLVATACPSEAE
Sbjct: 1   MLPMGESPLGGDGGCDRLEQALRECHKRVPEGPARRSACRHLNRSLAECLVATACPSEAE 60

Query: 93  AVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 127
           AVRTLCSSGGT LKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF
Sbjct: 61  AVRTLCSSGGTALKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 94

BLAST of Lsi02G010480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K2P5 (uncharacterized protein LOC111490507 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490507 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 162.9 bits (411), Expect = 8.5e-37
Identity = 79/93 (84.95%), Postives = 84/93 (90.32%), Query Frame = 0

Query: 33  MSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAE 92
           M PTG++PI GDGGCERLEQALR+CHKRLPEGPARRS C HLNRS A+CLVAT CP+EAE
Sbjct: 1   MVPTGKAPIGGDGGCERLEQALRDCHKRLPEGPARRSGCWHLNRSFAECLVATVCPNEAE 60

Query: 93  AVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQ 126
           AVRTLCSSGGT LKRSQCEQAKFS S CLSSLQ
Sbjct: 61  AVRTLCSSGGTALKRSQCEQAKFSFSLCLSSLQ 93

BLAST of Lsi02G010480 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GSM0 (uncharacterized protein LOC111457119 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457119 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 1.9e-36
Identity = 78/93 (83.87%), Postives = 84/93 (90.32%), Query Frame = 0

Query: 33  MSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAE 92
           M PTG++PI GDGGCERLEQALR+CHKRLPEGPARRS C HLNRS A+CLVAT CP+EAE
Sbjct: 1   MVPTGKAPIGGDGGCERLEQALRDCHKRLPEGPARRSGCWHLNRSFAECLVATVCPNEAE 60

Query: 93  AVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQ 126
           AVRTLCSSGGT LKRSQCE+AKFS S CLSSLQ
Sbjct: 61  AVRTLCSSGGTALKRSQCEEAKFSFSLCLSSLQ 93

BLAST of Lsi02G010480 vs. NCBI nr
Match: XP_038893663.1 (uncharacterized protein LOC120082530 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 185.3 bits (469), Expect = 3.3e-43
Identity = 91/97 (93.81%), Postives = 93/97 (95.88%), Query Frame = 0

Query: 30  KKEMSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPS 89
           KKEM PTG + ICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLA+CLVATACPS
Sbjct: 3   KKEMLPTGGASICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAECLVATACPS 62

Query: 90  EAEAVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 127
           EAEAVRTLCSSGGT LKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF
Sbjct: 63  EAEAVRTLCSSGGTALKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 99

BLAST of Lsi02G010480 vs. NCBI nr
Match: XP_008459043.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103498267 [Cucumis melo] >KAA0043206.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold110G00780 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK12262.1 uncharacterized protein E5676_scaffold302G00190 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 6.9e-41
Identity = 86/94 (91.49%), Postives = 89/94 (94.68%), Query Frame = 0

Query: 33  MSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAE 92
           M P GESP+CGD GCERLEQALRECHKR+PEGPARRSACRHLNRSLA+CLVATACPSE E
Sbjct: 1   MLPIGESPMCGDDGCERLEQALRECHKRVPEGPARRSACRHLNRSLAECLVATACPSEVE 60

Query: 93  AVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 127
           AVRTLCSSGGT LKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF
Sbjct: 61  AVRTLCSSGGTALKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 94

BLAST of Lsi02G010480 vs. NCBI nr
Match: XP_004145445.1 (uncharacterized protein LOC101219184 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 176.4 bits (446), Expect = 1.5e-40
Identity = 86/94 (91.49%), Postives = 90/94 (95.74%), Query Frame = 0

Query: 33  MSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAE 92
           M P GESP+ GDGGC+RLEQALRECHKR+PEGPARRSACRHLNRSLA+CLVATACPSEAE
Sbjct: 1   MLPMGESPLGGDGGCDRLEQALRECHKRVPEGPARRSACRHLNRSLAECLVATACPSEAE 60

Query: 93  AVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 127
           AVRTLCSSGGT LKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF
Sbjct: 61  AVRTLCSSGGTALKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQF 94

BLAST of Lsi02G010480 vs. NCBI nr
Match: XP_023542217.1 (uncharacterized protein LOC111802182 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 1.4e-36
Identity = 79/93 (84.95%), Postives = 84/93 (90.32%), Query Frame = 0

Query: 33  MSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAE 92
           M PTG++PI GDGGCERLEQALR+CHKRLPEGPARRS C HLNRS A+CLVAT CP+EAE
Sbjct: 1   MVPTGKAPIGGDGGCERLEQALRDCHKRLPEGPARRSGCGHLNRSFAECLVATVCPNEAE 60

Query: 93  AVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQ 126
           AVRTLCSSGGT LKRSQCEQAKFS S CLSSLQ
Sbjct: 61  AVRTLCSSGGTALKRSQCEQAKFSFSLCLSSLQ 93

BLAST of Lsi02G010480 vs. NCBI nr
Match: XP_022994930.1 (uncharacterized protein LOC111490507 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 162.9 bits (411), Expect = 1.8e-36
Identity = 79/93 (84.95%), Postives = 84/93 (90.32%), Query Frame = 0

Query: 33  MSPTGESPICGDGGCERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAE 92
           M PTG++PI GDGGCERLEQALR+CHKRLPEGPARRS C HLNRS A+CLVAT CP+EAE
Sbjct: 1   MVPTGKAPIGGDGGCERLEQALRDCHKRLPEGPARRSGCWHLNRSFAECLVATVCPNEAE 60

Query: 93  AVRTLCSSGGTTLKRSQCEQAKFSLSFCLSSLQ 126
           AVRTLCSSGGT LKRSQCEQAKFS S CLSSLQ
Sbjct: 61  AVRTLCSSGGTALKRSQCEQAKFSFSLCLSSLQ 93

BLAST of Lsi02G010480 vs. TAIR 10
Match: AT1G31175.1 (unknown protein; Has 20 Blast hits to 20 proteins in 10 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 20; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 120.2 bits (300), Expect = 1.2e-27
Identity = 55/79 (69.62%), Postives = 68/79 (86.08%), Query Frame = 0

Query: 47  CERLEQALRECHKRLPEGPARRSACRHLNRSLAQCLVATACPSEAEAVRTLCSSGGTTLK 106
           C+RLE+AL +CH+R+PEGPARRS CRHLN++ A+C+VA ACP E+EAVR+LCSSGGT+LK
Sbjct: 34  CDRLEEALLQCHRRMPEGPARRSGCRHLNKAFAECVVAEACPEESEAVRSLCSSGGTSLK 93

Query: 107 RSQCEQAKFSLSFCLSSLQ 126
           R QCE A+ SLS CLS  Q
Sbjct: 94  RKQCEYAQLSLSLCLSRHQ 112

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3CLT33.4e-4191.49Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold... [more]
A0A1S3C8S83.4e-4191.49uncharacterized protein LOC103498267 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498267 PE=... [more]
A0A0A0LYC17.5e-4191.49Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G702000 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1K2P58.5e-3784.95uncharacterized protein LOC111490507 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111490507... [more]
A0A6J1GSM01.9e-3683.87uncharacterized protein LOC111457119 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114571... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038893663.13.3e-4393.81uncharacterized protein LOC120082530 [Benincasa hispida][more]
XP_008459043.16.9e-4191.49PREDICTED: uncharacterized protein LOC103498267 [Cucumis melo] >KAA0043206.1 unc... [more]
XP_004145445.11.5e-4091.49uncharacterized protein LOC101219184 [Cucumis sativus][more]
XP_023542217.11.4e-3684.95uncharacterized protein LOC111802182 [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
XP_022994930.11.8e-3684.95uncharacterized protein LOC111490507 [Cucurbita maxima][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT1G31175.11.2e-2769.62unknown protein; Has 20 Blast hits to 20 proteins in 10 species: Archae - 0; Bac... [more]
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Lsi02G010480.1Lsi02G010480.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
cellular_component GO:0005739 mitochondrion