Lcy13g006250 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAAAATCCCCGACCTCTTTTTTCCAACAATCCACCTCTAAAAATGGTCGCCGCCGGTCCGGGAGGCGGCGGAGGAATCTCCAGCTGCTCCGACATACGAACCATCGCCGTCCACGTCATCACCGGGCGGTGGTTCGTGGTGTTCGCTTCACTTCTGATCATGGCGGCCGCCGGCGCCACCTACATGTTCAGCCTGTATTCCAACGACATAAAGTCAGTTTTGGGGTACGATCAAACCACGTTGAATTTGTTGAGCTTTTTCAAGGATTTGGGTGCAAACGTCGGCGTTTTGTCCGGTCTTATCAATGAAGTTACGCCGCCGTGGGTGGTTCTCTCCATCGGCGCCGTCCTCAATTTCTTTGGTTACTTCATGATTTGGCTCGCCGTCACTAAGAGGATCTCCACCCCCAAAGTTTGGCAAATGTGTCTCTATATTTGTGTTGGAGCTAATTCTCAGTCCTTCGCCAACACCGGTTCCCTTGTTACTTGCGTCAAGAACTTCCGCGAAAGTCGGGGCGTCGTTCTCGGTGAGTGATTATCAATATTAATTGTTGAAAAATTGACATTTTTGCTGTCTAGTGTTTTCATGTATATATCTTTTGAATTTCAAAAGATATACTCACTTTTAACTATGTTTAGATTGACTGTTATGTCAAATTAGTTCGTATATTCAAAAGTTTAAGCTTATATAACCTCAACCATTTTCCTTTTGGGTTTGTGAGAAAGAATAAAAATTATCTACATATCAATAGATTCAATATTACCATACCATGAAATGATTTGACAACAATTCTTGACAACTAGGAGAAATAAAAAAGTTTCATCATTTTCTCCCATCTTCTTTCTTAGTTGTCAAAATTAAATCTGTTAGATAAGTTTTTTTTTTGGTTCAAAGAGATTCGAACCTCTGATCTTTTAGTCATAGTATATGTCAATTACCGTTAACTATGTCCACTTTGACTTGTTAGATAAATATTGTTAGTTTGAAAATTAGCCAAACACTCAAGAGTGTATTCTTTTTTTCCTCAAAATATTTACATGAGACTTGTGTGATGTTTTGGGTAGAGAGTTTGAACAGGTTTGGCATAAGCCATTGGACTCATACTTAATTTGTTTTCCTGAATCCAAGGTTTCCTTAATCTAGATTTTCTAAACTCTCCATGATTTAAACTATATATATATATATTATTTTCATCCCAAACTCATAGAGATTCGAACACTATATTGTATTCTATATTAAATTACTATTCAGCTCTGAAACTTTTTTTTTTTTACAATAGGTGGGATATGAGATTCGAACCACAGACCTCATGGTCATTAATATAACTTCAATTGAGCTATGTTTTGTTCGCTATTCAACTCCAAAACTTAAACATAAATTTAATCATTTATTCATGTTTTGAACAGGTATCTTAAAGGGCTACGTCGGGCTTAGCGGCGCCATAATCACACAACTCTTCCACGCCTTCTACGGCTCCGACACCAAATCCTTAATCCTCCTCATCGGATGGCTCCCGGCGGCCATTTCCTTCGCATTTCTCCGAACAATTCGGATCATGAAAGTTATCCGACAGCCCAACGAGCTCAAAGTCTTCTACAATTTCCTCTACATTTCTCTCGCCCTCGCCGGATTCCTAATGCTAATGATCATCATAGAAAGCAAACTAATGTTCACTCAAAGCGAATTCGGCGGCAGCGCCGCCGTCGTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCCCCCTCGCCGTCGTAGTAATCGAAGAATACAACCTCTGGAAACTCAAAACCGCCGCCATTGGAGCTCCAAATCCAGTCCAGATCATAACAGAGAAGCCAAACATCCCAAAAATAGAGCATCAGAAACAAACCCAACAAAAACAAAAACAAAAGCAGCCATCTTGCTGGACGACGATCTTCAGCCCGCCGGAACGCGGCGAGGATTTCACGATTCTCCAAGCTCTCTTCAGCATGGACATGTTGATTCTCTTCTTCTCTGCAATCTGCGGCGTCGGCGGCACGTTGACGGCGATCGACAATCTGGGTCAGATCGGAATGTCTTTAGGATATCCAAAAAGAAGCATCAGCACATTTGTGACACTCGTGAGCATTTGGAATTACCTCGGCCGAGTCGCCTCTGGTTTCGTCTCTGAAATTGTTCTAACCAAATACAAATTCCCTCGTCCTTTGATGCTCTCTTTGACTCTGCTTTTGTCCTGCGTCGGCCATTTGATGATCGCTTTCGATGTCCCAAATGGGCTTTACGTGGCTTCGATCGTGATCGGATTCTGCTTCGGCGCGCAGTGGCCGTTGCTTTTCGCTATAATTTCGGAGCTTTTCGGGTTGAAGTATTACTCCACGCTTTACAATTTCGGGTCAGTGGCGAGCCCGATTGGGCTTTATGTTCTGAATGTGAAAGTGGCGGGGAATTTCTACGACAGAGAGGCGGAGAAGCAGCTGATAGCAAAAGGACTTGTGAGAAAAGCAGGGGAAGAGCTGAAGTGCTTTGGAGCAGAGTGCTTTAAGCTGTCGTTTATTGTGATTACGGGAGTTACTTTGTTGGGTATGCTTGTTTCTTTGATTTTAGTGATCAGAACGAGGAGTTTTTACAAGAGTGATATTTACAAGAAGTTCAGAGAGGAAGCTGAAGCAGAGGTTGCCGGAAATGGCGCGGTGGTGGCCGCCGAGAGATAAAGAGAAATGTTTGTGATTTTGGGGAGAGAGATTTTTCTGATCTCTTGGCTTGTTTGAAGAAACAATGTTTGTTCTTTGTGGACAAGAGTATAATTTAAGCACACTTGGAAGAAAAAGTTAAGAGAAGTTTTTTTTTTTGAACCAAAGTTAAGAGAAGTTACAAGTTCCATGATAAAGTTTTAAGGGATATTTTGATTATGTTATGTGTATCCCATTATTGTAATTTATAAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACAACATGTGATCGAGGTGGAGGATTTGAACCACAGATCTCTTGGTCATTGTTAAAAGTTTTATGCCAGTTGAATTGGCTTATGTTAGCATTGGAATTTACAAGTTTCTAATATAGTCCTATCATTTTCAATTTTATGTGTTATATATTTTTGTATTTTTAATTTAAATGATATGTTTGAGGTATCAAAATAAGCAATAAAAGAATTACTTTTTTTTTTAATAAAAAACACAATTACTTATTAATACACAACCTAAATTTTTAAAGAACTTTTAAAGAATAAATAAACACTAGTCTGGAGTATGTTTGATTTAACTTTTCAAGTATTTAATTTTGAAAAAAAAAACCATTTTGAAAAAATTTCTAGTTTTTGACAACCTCTAAAAATGACTTAATAAAAAATAAACAATTTTGAGAGAAACACTTGAAAACAAATTTTTTAAAAAGAGTTTTTAAGTATATAATAACTCGTGTACAAAAACACTTATGAGGAAATGTAACAAAACATATGAGTGTTTAAATTCTAAACAATTTTTTTATACAAAATGTTTAAAGAAAATGCATTCTTGAAAACAGATTCCAAACGGACCCTAATTCTAAAATTTTAGAGTCAAACTTGTAATTTAACTTGACTAAATTCACATAGAAGTTTTAGGTAGTTTTGGTTCATGAACTTTCAAACTTATGTTTAATAAGATAAATTATTAGAGGAGACTATCATGATATGACTAACAGTTTTGTACTGCCAATAATGTATACGAGAGAGACATCGTAAAAGTTCTTTGAATGTGTATCTAATTGTTATTAAGAGAAATGTACATTTTCAAAGCCACATCTAACTATTATTATGAAGTAGTCACTGTTGAGTGAGAAATTTCGGCCAATCACAAATTGTCACGTCATTAATTTGAATTAATGATAAAATAATTTTGGGACCAATTACAAATTTACACGTGTCCCTAAATTAAATTAATAGACATTAAAATTCGGCAAATCAAACAATGCCACTTGTCTATCATTGATCCATCAGATGACATAAGCCGAGTCCAATCAAATTATGCCACGTGGCAATTGGACGCGAGACTAATGTGACCCGAGATCATTGAAGAAATTGGACTAAATTAAAATGATCCAATTTTATTAAAAATGAGTTGGATTAAAGCCCAAATAGAGTCAAAGCCCAAAGGCTGGGCCCAGGCCCAAGCCCATATGAGGTCCATCAAACTCTATAAATAGAGGAGGCCACCATTCATTTTGGGCATTCAGACAGAGTCAGAGAAGCCAGAGCCCAGAGCATTCTCCCAAAGTCCAGAGTCTTCAGAAGTCAGAGAGTCCAGAGAATTCAGAAGACCCAAGATTCAGAATTCGACCATCTCAAGACTCAGAAGATCCAACGACTGGAAGACTCCAAAGAATCAACCGTTTCTTCATCAAGATACAAGTTGAAGATTCAACCTTCCTCCGTCTGAGATCAAGCTCGCCAGCCCTCAGATCAGACTCTACATTTTGAGAGAAAGCATCAGAGGATAAATATTAGAGACTGTAACACTTCTACATACAAATTCAATAAAATCAAGTTCATTTCCACGAATTAAATTTCCTTGTCGAAATCTCGTGTGAACAGTCACATTGTAGTGGCTTCATTGAATAATTTTTTCTTTTAATCGGTCCTTAAGTTTTAAAATGTCTTTGATAAAACACAAACTCTATAGTACACAACTCATGAGACCCCAATATATCAAATTGAAATCAACTCAAATTGAGAGGTAAATTAGGATATTGTCCTTGATTGAAAATAAAGAGATAAGCACTTGAACTTATCATAAGGTTTAAAACACTCCACAAGGATGACCAATCAATCTTTGAATGCTTTAAACATGCAAACTAAACAAGACTTGCAAAGGACAAACACTAAGCCAAAGAGTTTCACAAAAACAACACTCTTTATTATCAAAATTCAACTTGAAGAAAATACAAGCCATTCTTGGTATATATAGAACCAAGAAGAAAGAAAAAAAAAATCTAGCCTACAACAATTGAGGAAAAAATAAAACAAAA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MVAAGPGGGGGISSCSDIRTIAVHVITGRWFVVFASLLIMAAAGATYMFSLYSNDIKSVLGYDQTTLNLLSFFKDLGANVGVLSGLINEVTPPWVVLSIGAVLNFFGYFMIWLAVTKRISTPKVWQMCLYICVGANSQSFANTGSLVTCVKNFRESRGVVLGILKGYFGLSSAIITQLFHAFYGSDTKSLILLLGWLPAAISFAFLRTIRIMKVIRHPNELKVFYNFLYISLALAGFLMLMIIIESKVVLTQGEYGGSATVVLLLLFLPLAVVVIEEYNLWKLKTAAIGAPNPVQIITEKPNIPKTEHQKQTQQKQKQKQPSCWTTIFSPPERGEDFTILQALFSMDMLVLFFSATCGVGGTLTVIDNLGQIGMSLGYPKRSISTFVTLVSIWNYLGRVASGFISEIVLTKYKFPRPLMLSLMLLFSCAGYLMIAFDVPNGLYAASIVIGFCFGAQWPLIYAIISELFGLKYYSTLFNFGSVASPIGLYVLNVKVTGNFYDREAEKQLRAKGLVRKAGEELKCFGAECFKLSFIVITGVTLLGMLVSLILVIRTRSFYKSDIYKKFREEAEAEVAGNGAVVAAGAPEETRKQ Homology
BLAST of Lcy13g006250 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4I9E1 (Protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NFD4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 2.5e-27 Identity = 130/542 (23.99%), Postives = 246/542 (45.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FZF2 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449326 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1011.5 bits (2614), Expect = 1.4e-291 Identity = 524/592 (88.51%), Postives = 550/592 (92.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GZI8 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111458291 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 997.3 bits (2577), Expect = 2.8e-287 Identity = 515/588 (87.59%), Postives = 546/588 (92.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K186 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489721 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 986.1 bits (2548), Expect = 6.4e-284 Identity = 514/589 (87.27%), Postives = 539/589 (91.51%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CFW3 (Protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold475G002400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 984.2 bits (2543), Expect = 2.4e-283 Identity = 510/585 (87.18%), Postives = 540/585 (92.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BG09 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489435 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 984.2 bits (2543), Expect = 2.4e-283 Identity = 510/585 (87.18%), Postives = 540/585 (92.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. NCBI nr
Match: KAG6573851.1 (Protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1014.6 bits (2622), Expect = 3.5e-292 Identity = 524/592 (88.51%), Postives = 552/592 (93.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. NCBI nr
Match: XP_022944943.1 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1011.5 bits (2614), Expect = 2.9e-291 Identity = 524/592 (88.51%), Postives = 550/592 (92.91%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. NCBI nr
Match: XP_023541417.1 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1000.3 bits (2585), Expect = 6.7e-288 Identity = 517/592 (87.33%), Postives = 545/592 (92.06%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. NCBI nr
Match: XP_022956604.1 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 997.3 bits (2577), Expect = 5.7e-287 Identity = 515/588 (87.59%), Postives = 546/588 (92.86%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. NCBI nr
Match: XP_023535761.1 (protein NUCLEAR FUSION DEFECTIVE 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 996.5 bits (2575), Expect = 9.7e-287 Identity = 514/588 (87.41%), Postives = 545/588 (92.69%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. TAIR 10
Match: AT2G39210.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 805.1 bits (2078), Expect = 3.9e-233 Identity = 408/596 (68.46%), Postives = 482/596 (80.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. TAIR 10
Match: AT2G28120.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 681.0 bits (1756), Expect = 8.4e-196 Identity = 343/551 (62.25%), Postives = 423/551 (76.77%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. TAIR 10
Match: AT5G14120.1 (Major facilitator superfamily protein ) HSP 1 Score: 334.3 bits (856), Expect = 1.9e-91 Identity = 214/583 (36.71%), Postives = 327/583 (56.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. TAIR 10
Match: AT1G74780.1 (Nodulin-like / Major Facilitator Superfamily protein ) HSP 1 Score: 319.3 bits (817), Expect = 6.4e-87 Identity = 194/559 (34.70%), Postives = 309/559 (55.28%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g006250 vs. TAIR 10
Match: AT1G18940.1 (Nodulin-like / Major Facilitator Superfamily protein ) HSP 1 Score: 317.8 bits (813), Expect = 1.9e-86 Identity = 193/560 (34.46%), Postives = 309/560 (55.18%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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