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Lcy13g000060 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAACGAATACACGAAACATGTGAGAAACGAAGGACCACGATCCATTTTTTCCTTGAATGGCTCTTGCCTTCTCGTTTTCTCAAACCGCCATATTCTGCCTCAGGTGCACAGAATTTACTCGGCATTCTAAAAATATAGAGAAGGCCGATGAGTACGTCTAGAGAGGCTGGCAGGCTTTTCAATGGGGTTTCTTTAGTCGCAAGGGAACTGCTTGAACAGTCTCAAGTTTTGGAAATTGCCAGAATTGGGAACTTCAAAAGCCTTATTTCTACACCTGTCATAAAAGTCATCGTTTCTGTCACTGATATTTCCGGTCTCACCAGAGGCAAAGTTCGCCAAATTTCAAGTGCATATCGCCCTAAGGGCGATTCTATTGCCTATTTTTCTCATCCAATTCAAGCGAATAATATCGACAGTCCTGCAATCTCCGATCTAGGGGTTGGCCAGACTCAGACGTGCATTTCCGATATTTCAGTTCTTTCCGAAAATAAAGACAAAGAAAACAACTTGTTAATCGAAACGGAATCCGGGGACCTACCCAACAATGCCCGTTCTACTACATGTAATGGAACACGAATTGGAACACAGGGCGGGCAAGTGGAAGTAGCCCCACCCTTCAAACGACGGAAGCCCCGAGAGAGAAGAGTACCCTCCACTCCCTTCTCCAGAGCGCTCGGGTATGTTATTTCTGTTCTCCAAATTTGATCACATATACTTGTAGTTGTTATTTTACATTACGAGTTACGATAACTGTACCATACTGCCAGTGACAGTTGTCTACTGTTGATTTCATGACCTCGTCTAATGAATTACGTTTATAACAACCCCGAGAACTTATTGAGCTGAGTGAGGATTTATGAACTTATTCACCCGTTAAGTTTCCCTAGTCCATAGCCATCCACACCGCATGTCTTGGATTCCAACGATATCCTTCCTACTCCCTCGCAAAGTAAATGCTTCATTGATAAGCTTGTTCTGTTGCGCACCACTAGTATTTCGCCTACACATTGCATTATATACTGTATATAGAATTTTACAAAGATCTTGTTGTGGGAGCCCGTCCAAGTGAGTCCTTTTCGTTCTCTATTCTTCGGGTGGTCTCATCTCATCTAAACGAAAGTTTAGTTTCATTTGATATCATTATATCATTTATAAAGTTTTCTCAATGTCTTTCTGCATCATAGAATTGTTCTCCCCACAGAGTTCAACTCGAACTCGCTAGGGAGTGTCGGGAATTTAATTGTTATTTGAGTAGTTGAACAATGGAAAATACTTGTTAATTAATTGAACTGAATCATCACTACTCTCATAGGTTTGCTGGGCTAGGAGCTAGTCTTGCATGGGGGACACTGCAGGAATCAGCCAAGAGGCTTGTTTTTGGCCCAGAAAATTTTCAAAACCAGCCTTCTGCTCTTTCTCCGTTCCTGTCTGAAAAGAATGCAAAACGTTTGGCTCTTGCTTTGTGTAGAATGCGTGGAGCTGCATTAAAAATTGGGCAGATGTTGAGTATACAAGATGAATCTCTTGTACCAGCTCCGGTATTATTCTCACTTCAGTTCATCTTTCTACCACTTTATTATTAAAAATAAAAATAAAAAAGAAAAGAAACTAAGAAGAGCTGACGGGTGAAGAAAACACATGTTTACTGATTCCCGACCATGGTTCTTCTAATGTCTGCACACTCGGTGAACATTAAATGTCAATTTATGGAAGTTTACTTTCTATAGCTTTGCAGTTTGCACTCCAGCTAGTTCTCCCCCCTCCCCTTCCCCTTGTGCTATTTTATGCAACAAGGAGAATTTTGGAGAAAAAGGAGAATTTTGGAGGACTTGAATGTCACTAAGGAGGCATGGTCTATGATTTGGTTTCATGCTTCCCTTTGCTGGTTGATTTTTAGGGATTTTTGTAACTATCCAACAACCATTGACCTTTTTTTCAATCTCTTGGTTGTTTTTTTTGTACAAGCTCCTCTTCATAGCTTGTTTGTTTTCTTTCATTTTTTTTTCCAACATTGTGCGGTGGGAGATTTGAACCATAGACCTCTTGATCTTTAGTACAAGCTTTATGTCAGTTGAGTTATGCTCATGTTGGCTGATTTGTTTTTATGAAAACTTTGTTTTGTTTTATACATTATGGAATCATTTAAAAGGTTGTCTTGCTCGCTAGGATTATAGGGGTGTGGGCTCCTCATCAGTCTGTAAGGGTACTAGTATAGTATATAGGGAGAATAGTAGTAAGGGCATATTAGTAATTAGATAAGTAGTCTTGGTTATAAATAGGGTAGTTAGGGGTCTTAGATGGGTGTGGAGAATTTTGGTAGTGTCTCATTGTGGGACTTGGGAGAGAGTTAGCCCTCTCGAAAGGCTATCGGGTTTATATTGTAACGTCATCTCGATATTGCAATATAATATATCAGTGTTTGGTCTTTTCTTAGTTTGGATTCCTAACAAATTGGTATCAGAGCACGTTCGTCCTGGAAAACAACATCGATCGCAAAGGAATTGGAATTTGCTCGTAGGGTGGAGTTACACTGGGAAGCAATGCAACAAGGGTTGCAAGAAATGCAACAAATCTTGGAAAAAAATGCAGAAACGGCTCAAGGAATATGATCGCCAAAAGATAGAGAGAGATCAGAAAAATAAGGAAGATGACAATGTGAACTGCAAAAGGGCTGAGAAATTATTAGGTTATAAGCAGGGCTGAAGAGTAGCAGGGAGGCGTCGATCTTACGCAAAAGTACGGCCAGAAACGAGAGAGGAAGCAGTTCGAGAAAGTCCAAAAGTGTTTTCGGGTAAGGGATCATTGAAAGAGCACGAGAAGATCGATCCTCAACTGGGGGATGGGTGTACGAAGGGGAGAGAAAGTGGGCGAGGATGGAAGTTACACAGGAAAAATGAAAAAATCGAGGAGCAAAAATGGAAGGACAAGATTCCGGTGAATATAGCAAATGAGCAAGAATGCCGACAGGTGAAGAAGTGGCAAAACGGACGACTCCGACGATGGAAGTTTCATAAGGAAAAGGAAGAAAAAGCCGAGAGGGAAGGGACGAAAGAAAACATGCCGGCGGTCACATGGTCGGAAAAGCGAGAAAGGGGACAGACGAAGAAAAGATGGAGGAAGAACTGGCCGACGATCACATGGCTGGAAAAACAAGGTGGCAAGTGGAGGAAGAACTCGTCGCAAGCAGTTTGGCGTCAACAGCAAGGTTGGCGGCGGTGGAAGGCTAAAAGACGGAGGAGGAAAAGAAGGCAGGGGAAACGGTTAGGGTTGCATTGCAGAAGTAACCCAATAATTGGGTATTGGTCAAATAGGCCCAATCAAGCCCAATATGATAAAATGGATAGGTATGCTGCTTTACGGAGAAATTGTGGGTTTAATAATGGTGGGCTAGTACTTGGCTTGGGGCTGCAAGTGAACCATGGGCTTAGCCCATTGAAGAAGAACAAGATTTGTTTTGAAGAACTTGCCCGATTGGGAGACATCAACTCTTGGAAAAACCCTACCCATGAGAAGCCACTCACCTCAACCACCATGGTGTTCGGTGCTGCAATCACGTCGCCAGCCATCTCAGTTGGACAAGCTCATGTTGACTTCACTCACATGGATGAAGATAATCCTAGCAGTGGGCTGGTCTTGAATAGATTGGATAACAGGCCTAGTTGCAACATGATTTCTTTGGGCTGGATTGTTCTTGGGTTGCACTCGAACAGTTGGCATAATATGGCACCCATGGGCCCATGTGAAGTTTTCAAAGCCAACCCTATTGTCGCAAGAAATTTCCATACATGCTTTTCACTTACGTGGATTAGTGCTGCACACCGTCTCTTTCATACATCGCCAACAGTTGCCTCCTGCTCAGTTTCTGCCAACCACAAGCCACGACACATGATTGTTGAAGCGACTACTAGCTGGATTTTGTGTTAAAAATGCTTATCTTTTTTCTTTTTTGGAAGAATGTTGGTACTGTGTTTTTCTTTTTTTCTTGGAAAAGGAATAGTTGCCCAATTTTGAGATTATGTTTTGTAAGCACACCTTGAGGACAAGGTGTCTTTGAAGGGCGGAGTAATGTAAGTGTACTAGTATAGTATATAGGGAGAATAGTAGTAAGGGCATATTAGTAATTAGATAAGTAGTCTTGGTTATAAATAGGGTAGTTAGGGGTCTTAGATGGGTGTGGAGAATTTTAGTAATAGTGTCCATTGTGGGACTCTTGGGAGAGAATTAGCCCTCTCGAAAGGCTAGTGGTATATTGTAATTTTCTTTTGATATTGCAATATATATCTTCGTGTGTTTTTAGTATTTGGATTCTTAACATCTTCATCCTCCAAAAACTAAACATCTCTGCTAATCATCATCTTCTCTGTGTGAGGTTGATAGATCTTGTAGGCTTTGGACACCATGCTATAGCCTACAAAGATTCCTGGTTCGGCCTTCTCACTCAATTTGTCTCTCTTCACTTGTGGAACATAGAAAAAACACAAGCAACCAAACACCTTCAAATTTGTCAGTTTTGGTTTAGTGTCAAACCAAGCTTCATAAGGTGTCTTCTTCTCCAATAACCTCGTGGGTAGTCTATTCAATAGAAAGACTGCTGTGTTTGCTGCTTCAGCCCAAAATTCCTTTGGCAAGTTCTTCTCATGCAATAAGCATCTTGTCATTTCCATAATACTCTTGTTCTTCCTCTCACTGACTCCATTTTGTTGTGGAGAATATGGAGCAGTGAGCTGATGCTCTATCCCAACTTCTCTTAAACTTCAGAAACACTTCAGCTACTTCAGACTTATGCTTCATGAAATATATCCAACACATTCTGGTATAATCATCAATAAAGATAATGAAATATCTGCTACCATTTAGTGAGAGAGTTGGTTGAGGTCCACACAAGTCAGTGTGGATGAGCTGCAACTTCTCAGTTGCTTTCCATTGTGACTTCTTGAAAGGCAACCTTGTTTGCTTCCCTGTTAAACAAGCTCTGCAGTTTGTTTTTAGC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BLAST of Lcy13g000060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SBB2 (Protein ABC transporter 1, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 743.8 bits (1919), Expect = 1.5e-213 Identity = 396/613 (64.60%), Postives = 479/613 (78.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A3QJU3 (Atypical kinase COQ8B, mitochondrial OS=Danio rerio OX=7955 GN=coq8b PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 419.5 bits (1077), Expect = 6.6e-116 Identity = 219/451 (48.56%), Postives = 296/451 (65.63%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q29RI0 (Atypical kinase COQ8A, mitochondrial OS=Bos taurus OX=9913 GN=COQ8A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 414.5 bits (1064), Expect = 2.1e-114 Identity = 213/440 (48.41%), Postives = 289/440 (65.68%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AY19 (Atypical kinase COQ8B, mitochondrial OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Coq8b PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 414.5 bits (1064), Expect = 2.1e-114 Identity = 216/440 (49.09%), Postives = 293/440 (66.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96D53 (Atypical kinase COQ8B, mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=COQ8B PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 412.1 bits (1058), Expect = 1.1e-113 Identity = 212/442 (47.96%), Postives = 289/442 (65.38%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DXX1 (protein ABC transporter 1, mitochondrial OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025170 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1063.5 bits (2749), Expect = 3.2e-307 Identity = 541/607 (89.13%), Postives = 569/607 (93.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JV08 (protein ABC transporter 1, mitochondrial OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489989 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1026.9 bits (2654), Expect = 3.3e-296 Identity = 524/608 (86.18%), Postives = 563/608 (92.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ETP6 (protein ABC transporter 1, mitochondrial OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436426 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1019.6 bits (2635), Expect = 5.3e-294 Identity = 519/608 (85.36%), Postives = 562/608 (92.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CMQ0 (protein ABC transporter 1, mitochondrial isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502560 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 999.6 bits (2583), Expect = 5.7e-288 Identity = 509/607 (83.86%), Postives = 554/607 (91.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D2N9X0 (ABC1 domain-containing protein OS=Gossypium tomentosum OX=34277 GN=ES332_A11G119700v1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 829.7 bits (2142), Expect = 7.8e-237 Identity = 437/614 (71.17%), Postives = 497/614 (80.94%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. NCBI nr
Match: XP_022158707.1 (protein ABC transporter 1, mitochondrial [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1063.5 bits (2749), Expect = 6.6e-307 Identity = 541/607 (89.13%), Postives = 569/607 (93.74%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. NCBI nr
Match: XP_023530440.1 (protein ABC transporter 1, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023530448.1 protein ABC transporter 1, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1036.9 bits (2680), Expect = 6.7e-299 Identity = 528/608 (86.84%), Postives = 567/608 (93.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. NCBI nr
Match: KAG6601681.1 (Protein ABC transporter 1, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1027.7 bits (2656), Expect = 4.0e-296 Identity = 522/608 (85.86%), Postives = 563/608 (92.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. NCBI nr
Match: XP_022994172.1 (protein ABC transporter 1, mitochondrial [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1026.9 bits (2654), Expect = 6.9e-296 Identity = 524/608 (86.18%), Postives = 563/608 (92.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. NCBI nr
Match: KAG7032443.1 (Protein ABC transporter 1, mitochondrial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1022.7 bits (2643), Expect = 1.3e-294 Identity = 523/616 (84.90%), Postives = 564/616 (91.56%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. TAIR 10
Match: AT4G01660.1 (ABC transporter 1 ) HSP 1 Score: 743.8 bits (1919), Expect = 1.1e-214 Identity = 396/613 (64.60%), Postives = 479/613 (78.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. TAIR 10
Match: AT5G64940.1 (ABC2 homolog 13 ) HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 5.5e-25 Identity = 86/296 (29.05%), Postives = 141/296 (47.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. TAIR 10
Match: AT5G64940.2 (ABC2 homolog 13 ) HSP 1 Score: 113.6 bits (283), Expect = 5.5e-25 Identity = 86/296 (29.05%), Postives = 141/296 (47.64%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. TAIR 10
Match: AT1G65950.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 7.9e-24 Identity = 85/294 (28.91%), Postives = 142/294 (48.30%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy13g000060 vs. TAIR 10
Match: AT3G07700.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 3.0e-23 Identity = 76/244 (31.15%), Postives = 119/244 (48.77%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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