
Lcy12g020760 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGTTTGAGGCTCAAGGGGTTAACCGTGCCCGTGACACTGATAGTCTGTATTGGGATGATGGAGTTTATTCCGACGTGAAACGGCTTCGGATTACACATAGCTCCGAATGGTTCTACTCTGTTCAAATTGAGTATATTGATAGAAATGGGAAAGCGAAATGGGGTTCCGCCAATCTTGGCGGACACAGTTGCCCAACTCGCGAGGTGGCACAAAACCAAAACCAAAACCAAAATCGTTTCCTTTTCCTTTTCATTTTCACTGCAGCAGCTTAGAATATAATGGTGTAATTGATTCCAGGTTGTTTTATCTTATCCGAACGAGTACCTCATTTCAATTCATGGCTACTACAAGTTGGAGTCGGAGTCGGACCCTGACCATGACCATGGGATAAAATCGCTGACTTTCGAAACCAATACAAACACTTGGGGACCATATGGTCAGGAAAAGGGAATCAAATTTTCATTCCCAATCATTGGGGCCAAGATTGTGGGCTTCCATGGCTTGATGAGTGGTCGCGGGCTCCATAAAATTGGAGTATTCGTGCGACCAATTACAAGGTATATGCTCGCCACATACTATATATCTTCTTTTTATTTATTTAGTTTAGAGGTTAAAATATCATTTTGATCTATGTATTTTTAGACTTATTTTGCTTTATGGATAACTTTTCCCTCATGCAGAAGCATGCGCGAACTCGAACCCAAGCCCGGGCCTGAACCCCAGCAACCAGCCCCGTCTGAGCGTTTTAGCTTGGGACGATATGGACGTGAAGATGGGGAATGTTGGGTCGAGATTTTTCGAGCAATCAAACGATTGCTAATTTACAGCAATGATGAGTGGATCATTTCCATTCAAATGGAATATGAGGATGAGAATGGAGAGTTAGTGTTGTCCAAGAAGCATGGTGGGGATGGAGGTTCCCTATTAGAGGTTACTACAAATCCTTAACTTTTTTTTTTTTTTAGTACATCAATATTTGGGGTGTGAATTTGAACCTCTAACCTCTTCGTTGATGTACATGTCACTTCCTCTTTGCTTATAACTCGTTTCGTTTATGTAATTGGTATATATTGCAGGTTGTTTTCAAATATCCAGACGAACATCTTGTTACAATTAAAGGATCCTACAACAACTCACGCGGCTCGGAATCGATTCGATCGCTGACTGTGGTAACCAACGAAAAAACTTATAAGCCATTTGGAGTTCAAGAAGGAAGGGCCTTTTCATTCCCTACTAGTGATCGGTTGAAGGTCGTTGGCATCCATGGCAGATCTGATTTGTATCTCAATGCCATTGGACTCTATGTAGTCTTGATTTAAGAGGAAGTCCATACATAGCTAAGCTTGGGTGCTTTTTAATTATGTGGCTAGGTTCAAATCTTTTCGTGGTTCGATCAGGGAATTTTTATGGATTGGTTTTGATTATTTGTTGATTGAAACTTACATAATTTATGGGTTGGTTCTTATTTGAATTGTGTTGTGTGTCTCTTCAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGTTGTGTGGGTGTTTATAAATGTTGCCTACAACATCAATTTTAAATGTTTGTAATTCAAATGCCACTCACGTAATATAAAATCTCATTGATACAAATTAAACTTAAGCTATATTTAAAAAGTAGTTATATTCTTTATTATGTATCAGATTTCTGTTAAAGTTGAATTTACATTTTGCCCTGCAAAACAATGAAGCAAACACATAAAAAAAGATTTAAATCAGTCCGTTTAAAGCTAGTGACCGAGTTTATCAAATAAGCCAACTTCCCTTTCAATGCTATAACACATGGATGTGGCGTGCATCTATAGAAAGGACAATCAGGATTTCTCTAAGACTCTCGAGAGAAAAGATTATTACATGTGGGAAGAGAGTTGGAACAAGCCTTGCCACATGGAAATTTTCTCCTTGGGGGATCTCCAAACCTATCACCTCATTGGTTTGAGGAAGAGGAGGCTACCAAAAGCTCCTATCGTGCTACTTTGTACCCACTTTTAACTGTATATATAGGTCTCTTTTGTCATTGTGCCAAAAGAAAAGATATTGTCGTTGTAATTGACAAAGTGGGATGCGTAGGATGATTTCTGCATCCTACGATAGAAACAACCCTGTGATTTGTGTCCTATTTCAATATCCATTATCTCTTTAGATAGCTAGTAGAATTATTGGTTAAAGGTCTAAGATAGAGATATATAAGCTTGAAGGTGGATTCCCTTGGGACCCACATATATATGAGAATACATATCGGTATGTAGCCAAGTTTTGTTCTATCAATAATGGATTGCACCCATCCCCTACTCTCCATCTTCTCCCTACCCGATAGTATGCCTCTCCATGTATGCGATGGTTCGACTACCAAGAGGGATATCTAGGAAGCTAGGTTGTGAGAAAAATATTATGTTTTTTTAGGCCATCAATGAATATTTTTGATAAATTAAATCACATTTTTAGTCTTTAAAGTTTTAGATTAAAAAGAAAATCTATTTAGTCCGTAAGTTACAAATTTAATGATTTAGACTTAGTTTGAGATTGTTGTAGCTTTTAAAATCTATTTACAAATTAAATCACATTTTTGTCAAAATCACATTTCATACTTTCAAAAGCATGTGGTATAACTCATCAAAAGTTGGGGATTTGTGATTTATCTCATTTTCATCACTTACATCACTAGAATTGTTGTCCAAATGAGCCACATCAACCATAAAAAGAATCTAGCTATCACATTTTTCCTCTTCCATTTCATGAATTTTTTTCTTGATTTTGAGAATTATAATTCTCCTTTATATCAAATAAATCATTAGTACAAGAAAAATATTCGACACACTATAAATATTGTCAAGAAAATTCCAAAAATGGTATACATAATCAAAATGTAAAATTTTTATCTCATGTATTTCTATCTAATGCACAATATATGATATTTACGGCTTTAGCATTAAAAGTTAGCAACTCACTCCTATTTTTCTCCTAAACCTCATTCTCAAGAAATTTAATTTTAGCAAGAAAAGAACATTTCTCTTTTTCTAAAGATGTATTGCTATTTTCCAAATCAAGAATTTTTTCTTTCAAACTAACAATTTCATCTTTCAAATTCAAAGAGAAAGATTCAATTTTCTTAATCATTCAATTCCATTTTCACTTCACAAGATAAGAATTTGATTTCATTATTTTCTTTTTCAAGAAATTTATGATTCTATCATTCATAGCATTTTTCTCATCGTCACGTGAATGATCAACATACAACAAATCATTAGTAGCCCTATTTTTCAAACAAGTTTCATCTATTAAAGATTTATTCTTCATGAATAAAGCATTGTATTTCTTTGACAGCTTGATATATTTAGCGCTAACTTTTTCCAAAATCACATTACATATACTTCCAAAAGTATCATATAACTCATCATAATTAAGTTGGAAATTTGTGATTTATCTCAAATTTTCATCACTGGATTAATTGTTGTTGTCTAAATGAGTCATCAAACATAAAAAGAACCCATCACATTTTTGCTCTTGCACTTCATGAACTTTTCTTGATTTTGAAAATTATAATAATTCTTCTTCACATCAAATAAATTAAATCTAGTACAAGGAGAGTTTTCTACCCAATACACATTGTCAAGAAAATTTCAAATATCATATGTCTTATCACATATATTTCTATCTAATATATGCACAAATATGTATATATGATATTTATTGGCTTTGAAATTAAATTAAAAGTGAGCAACTTTTATTATTCTCATGAACTTCATTCTCAAAAATTTTAATTTTATCAACAAAAGAATATTATATTTCTCTTTTTCTAAAGATATAATGATTTTTCAAATCAAGAATTTCATCTTTCAAACCATCTTTCAAATGAGAAAGATTCAATTTTCTCATTTTTATTCCTCAAGTCATCCCATTCTATTTTCAATTCACAAGATAATGATTTGATATCGTGATTTTCTTGTTCAAAGAAGTTGATTCTATATTTTTCAAAAAAAAAAAGAAGAAGTTGATTCTATCATTCATAGCGTTTTTTTCTTCATCATAAAAATGTCAACATACAACACATCATGATTGCTGGTAGTTTTACAATTTCTCTCGAAGCATTGCAAGATTGCATCAAGAGCATGCACCTAATAATTTTTCGATTGCTTGGCATTGCTTGTGCCGGGTTTCATCTTCTTGGATAGAGATATGGAGTATGATCTTGTGAATCGGCCGCACCCGCATCCATTGTTGTTTCAAGAAGAAAGAGAGTTTAATGGAGATCATGTGGTAATTGTGTGCTCCAGATGCCGTCAACCATTGTGTCCGCCGGCATTCAGCTGCTCCGACTCCGCCTGCAACTTTCATATTCACCTCTCATGCCTCCACCTTCCTCCTCAAATCCTCACACCCTTCCATCTCCATCGTCTCGATCAGGTCTTGGGATTCACGACCGACATCAATGGCTGTTACATCTGCGGTCAAACCCCATTTTGCGATGACAAATACATCTGCAATAAATGCTCCAAATTTGAAATGGACATCAAATGCGCCATCACCGACCCCAAATCCAGCGGCTTATGCCACACGGGCGGCCAGAAGTATCAACATTTCAGCCACCCCCATCCATTAACATTATTCACCCTCCCCCTCGATCAGCAACAACAAGACAACCGAGTCCTTGCTTGTGTTGTCTGTAAACATCTGATACAATCAAACGACGACGACAACGACGGCGACACTTCTACTTACTTCTGCTGCTCTCAATGTGACGACACCCATTTCCATAAAAAATGCGCCGAGCTGCCGCGCGAGTTGCCGTTGAACCTCGCCTGTCACCACCACCCCTTGTTTCTTCTAATCATTAAGATCACGCCGTACAGTAATGATGATGACGACGTCGTCTGTACTAGCTGCCGAAGCCCCTGCAGAGGGTTCGTTTACACGTGTCCCTCATGCAAATTCTTCCTTCACGCGGCGTGCTTACGAACGTTTAATCACAAGCACGCCT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ATGAAGTTTGAGGCTCAAGGGGTTAACCGTGCCCGTGACACTGATAGTCTGTATTGGGATGATGGAGTTTATTCCGACGTGAAACGGCTTCGGATTACACATAGCTCCGAATGGTTCTACTCTGTTCAAATTGAGTATATTGATAGAAATGGGAAAGCGAAATGGGGTTCCGCCAATCTTGGCGGACACAGTTGCCCAACTCGCGAGGTTGTTTTATCTTATCCGAACGAGTACCTCATTTCAATTCATGGCTACTACAAGTTGGAGTCGGAGTCGGACCCTGACCATGACCATGGGATAAAATCGCTGACTTTCGAAACCAATACAAACACTTGGGGACCATATGGTCAGGAAAAGGGAATCAAATTTTCATTCCCAATCATTGGGGCCAAGATTGTGGGCTTCCATGGCTTGATGAGTGGTCGCGGGCTCCATAAAATTGGAGTATTCGTGCGACCAATTACAAGAAGCATGCGCGAACTCGAACCCAAGCCCGGGCCTGAACCCCAGCAACCAGCCCCGTCTGAGCGTTTTAGCTTGGGACGATATGGACGTGAAGATGGGGAATGTTGGGTCGAGATTTTTCGAGCAATCAAACGATTGCTAATTTACAGCAATGATGAGTGGATCATTTCCATTCAAATGGAATATGAGGATGAGAATGGAGAGTTAGTGTTGTCCAAGAAGCATGGTGGGGATGGAGGTTACCTATCAGAGGTTATCCCAAATCAAGTCCTTAACTTGTTTCTTAAAATGTCCCAACTTGCCTTGTTTACTGTTGTAATGTAG ATGAAGTTTGAGGCTCAAGGGGTTAACCGTGCCCGTGACACTGATAGTCTGTATTGGGATGATGGAGTTTATTCCGACGTGAAACGGCTTCGGATTACACATAGCTCCGAATGGTTCTACTCTGTTCAAATTGAGTATATTGATAGAAATGGGAAAGCGAAATGGGGTTCCGCCAATCTTGGCGGACACAGTTGCCCAACTCGCGAGGTTGTTTTATCTTATCCGAACGAGTACCTCATTTCAATTCATGGCTACTACAAGTTGGAGTCGGAGTCGGACCCTGACCATGACCATGGGATAAAATCGCTGACTTTCGAAACCAATACAAACACTTGGGGACCATATGGTCAGGAAAAGGGAATCAAATTTTCATTCCCAATCATTGGGGCCAAGATTGTGGGCTTCCATGGCTTGATGAGTGGTCGCGGGCTCCATAAAATTGGAGTATTCGTGCGACCAATTACAAGAAGCATGCGCGAACTCGAACCCAAGCCCGGGCCTGAACCCCAGCAACCAGCCCCGTCTGAGCGTTTTAGCTTGGGACGATATGGACGTGAAGATGGGGAATGTTGGGTCGAGATTTTTCGAGCAATCAAACGATTGCTAATTTACAGCAATGATGAGTGGATCATTTCCATTCAAATGGAATATGAGGATGAGAATGGAGAGTTAGTGTTGTCCAAGAAGCATGGTGGGGATGGAGGTTACCTATCAGAGGTTATCCCAAATCAAGTCCTTAACTTGTTTCTTAAAATGTCCCAACTTGCCTTGTTTACTGTTGTAATGTAG MKFEAQGVNRARDTDSLYWDDGVYSDVKRLRITHSSEWFYSVQIEYIDRNGKAKWGSANLGGHSCPTREVVLSYPNEYLISIHGYYKLESESDPDHDHGIKSLTFETNTNTWGPYGQEKGIKFSFPIIGAKIVGFHGLMSGRGLHKIGVFVRPITRSMRELEPKPGPEPQQPAPSERFSLGRYGREDGECWVEIFRAIKRLLIYSNDEWIISIQMEYEDENGELVLSKKHGGDGGYLSEVIPNQVLNLFLKMSQLALFTVVM Homology
BLAST of Lcy12g020760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P82859 (Agglutinin OS=Castanea crenata OX=103480 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 3.6e-18 Identity = 68/191 (35.60%), Postives = 99/191 (51.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HQX1 (Jacalin-related lectin 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=JAL3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 4.7e-18 Identity = 54/136 (39.71%), Postives = 79/136 (58.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SSM3 (Jacalin-related lectin 19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=JAL19 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 2.0e-16 Identity = 52/142 (36.62%), Postives = 77/142 (54.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SE37 (Protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RTM1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 7.7e-13 Identity = 52/161 (32.30%), Postives = 85/161 (52.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D9UBI3 (Inactive protein RESTRICTED TEV MOVEMENT 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RTM1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 7.7e-13 Identity = 52/161 (32.30%), Postives = 85/161 (52.80%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LDY3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G858120 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 206.8 bits (525), Expect = 1.1e-49 Identity = 119/240 (49.58%), Postives = 155/240 (64.58%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CSU0 (jacalin-related lectin 3-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503936 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 205.7 bits (522), Expect = 2.4e-49 Identity = 115/235 (48.94%), Postives = 154/235 (65.53%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C6X3 (jacalin-related lectin 3-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008958 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 193.7 bits (491), Expect = 9.4e-46 Identity = 111/228 (48.68%), Postives = 146/228 (64.04%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TE69 (Jacalin-related lectin 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold242G00580 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 190.3 bits (482), Expect = 1.0e-44 Identity = 115/264 (43.56%), Postives = 154/264 (58.33%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C7A4 (jacalin-related lectin 3-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008896 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 179.5 bits (454), Expect = 1.8e-41 Identity = 105/229 (45.85%), Postives = 140/229 (61.14%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. NCBI nr
Match: XP_038898652.1 (jacalin-related lectin 3-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 219.2 bits (557), Expect = 4.3e-53 Identity = 121/243 (49.79%), Postives = 161/243 (66.26%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. NCBI nr
Match: XP_038898654.1 (jacalin-related lectin 3-like isoform X4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 217.6 bits (553), Expect = 1.3e-52 Identity = 119/241 (49.38%), Postives = 162/241 (67.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. NCBI nr
Match: XP_038898651.1 (jacalin-related lectin 3-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 216.9 bits (551), Expect = 2.1e-52 Identity = 121/235 (51.49%), Postives = 158/235 (67.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. NCBI nr
Match: XP_038898653.1 (jacalin-related lectin 3-like isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 213.4 bits (542), Expect = 2.4e-51 Identity = 121/243 (49.79%), Postives = 159/243 (65.43%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. NCBI nr
Match: XP_004147880.1 (jacalin-related lectin 3 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN59973.1 hypothetical protein Csa_002668 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 206.8 bits (525), Expect = 2.2e-49 Identity = 119/240 (49.58%), Postives = 155/240 (64.58%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. TAIR 10
Match: AT1G19715.1 (Mannose-binding lectin superfamily protein ) HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 3.3e-19 Identity = 54/136 (39.71%), Postives = 79/136 (58.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. TAIR 10
Match: AT1G19715.2 (Mannose-binding lectin superfamily protein ) HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 3.3e-19 Identity = 54/136 (39.71%), Postives = 79/136 (58.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. TAIR 10
Match: AT1G19715.3 (Mannose-binding lectin superfamily protein ) HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 3.3e-19 Identity = 54/136 (39.71%), Postives = 79/136 (58.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. TAIR 10
Match: AT1G73040.1 (Mannose-binding lectin superfamily protein ) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 1.4e-17 Identity = 52/142 (36.62%), Postives = 77/142 (54.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g020760 vs. TAIR 10
Match: AT1G05760.1 (Mannose-binding lectin superfamily protein ) HSP 1 Score: 75.9 bits (185), Expect = 5.5e-14 Identity = 52/161 (32.30%), Postives = 85/161 (52.80%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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