
Lcy12g012290 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATTTCAAGGGTGTTCATGTTCTTGTCTTTGGATTGCTGCTATTCAACTTCTTCTTCTTTGGATTTCAATCTGACGCCCAACCTCTGCCTCCACAAGAAGGTACTATCATTTTATTATTTAATCTTTTTCCATGTTCTCTGCCTCCAAATTACTCTGTTTCGTGCTTTCTAGATTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATAACAATTAAGTTACAAATTTAGTTGTCAACTTAGCTGATCGGCGGTAAAACATCCCTTTGGACATTTACTCGACTAGCTTTTCTAAAATAATTGATTATATTGATAAATAACTCCCTCATCTTTTGCTCTCATCCATTTAGTAAGTGTGAAATTAAAGATGTATAAAGTTTTCTTTAATTTAAAAACTAAGGAAATTCTTTTTAAAAATATTATCAAATAAGAACTTAGTAAATTTAAGTCAATTTGTTGAATAGTATATGTAGCATAGTTAAAAATGAACTAACAAATCCATGTTTACCCTGTTGAGAAAATGAAAGGTTTTTCATTTTCATTATTAAACTTTATTTGGCAATTAGTGTGACTTTTGGCTTTTGGTTTCTTGTAACCAATAGTGACTTTTGAGTTTTGGGAGTTAGATGAGTTATGAGCATTTTATCACATTTAAAGTTTTGAACCATTGGTATTCTATGGTTACTTTTGTAAGCCTATATAAAGGCATGCTTAGTTGAATGAAAAATCATCTCCATTCATACTTGTCCTCCACATTTTTCTAACAAAGTGGTATCAGAGCGAGTAGCAAAAAAATTGAGAGAAATGGCCAACGGTTGGATGGGTTCGCTTCAACTACCGATGCTTTCCAAGCTCAACTATGACAATTGGAGCATCAAGATAAAAGCGTTACTAGGAGCACAAGATGTGTGGGAGATCGTAGAGAACGGTTTCCAAGAGGCAGAAGCTGGAGCCGATCAAGCGCAAAGAGATGCGTTAAAGGAGACAAGAAAGAAGGACAAGAAGGCCCTCTATATCTTGTACCAATCGGTGGACGAAGACACGTTTGAGACCATCGCCAATGCCGAGACGTCAAAGGCGGCATGGGACAAGCTCCAATCGACTCATAGAGGAGCCGATCGTGTGAAAAAGGTACGGTTGCAAACTTTACGTGGTGAGTTTGAATCTTTACAAATGAAGGAGACAGAGGTGATAGCGGAATATCACACCAGAGTAATGACCGTCGTCAACCAATTGAGACGGAACGGTGAAGAAATCGCCGATGTTCGTGTCATGGAAAAGGTTCTACGGAGCCTAAATACAAAGTTCGAGATTATTGCCACGACAATCGAGGAGACACAGGATCTCGAGATTATGACAATTGAACAATTTATAGGCTCATTGCAAGCCTATGAGGAGAAAAAGAAAAGAAGGATGGAGCAAACAGAGACTGTTGAACAACTTCTCCAACTCAAACTCAAGGAGGAGAATAGTCATGGACGTGGAAGAGGTCGCGGTGGTCGAGGCCGTGGTGGAAGAGGTGAAACCAACACCGATGTTTCTCAAAATTCGAGTGATTCCTCAAGAGGAAGAGGAGGCCGAGGTCGTGGAAGGCGTGGTGGAAGATCTGGGAGAGATAAATCTCAGGTAAAATGCTATAATTGTAATAAGTATGGACATTATGCAAATGAGTGTTACTCATCTCAATCAGAATCAAATGATCGGAAGCATCAAGACCAGTCAACCACCAGCACATCAAAAGCTCATCAAGGGCAATCCAATTATGCAGAGGAGAACGAAACCTTATTTATGGTTTCAAAGGGAGAAGAAGAGAGTCAAGATAGTATGTGGTATCTTGACACCGGAGCCTCAAACCACATGTGTGGAAAACACGAGATGTTTGTGGAGTTGAACGAGATGGAGAAAGGTAATATTGCCTTTGGAGACAATTCTTTGGCCGCCATCAAAAGAATAGGTAAAATTCTCATTCGGTTAAAAAATGGAGAAAATCAATATATTACAAATGTTTATTACATTCCCAGTATAAAAAATAATATATTGAGTGTAGGACAATTGTTAGAGAAAGGTTTTGAAGTTCAAATGAAAAACAATTGTTTGTATTTGAGGGATGATCATGAGAGACTTATTGCTAAAGTTTGTTTCCTTTGAATATATGTAATGATGTTCCAAAATGCTTGAAGACGTGTTATGAGGATCTCTCCTGGTTATGGCATCTACGGTTCGAACACCTCAATTTTAGAAGTCTAGAAGACTTGTCGAAGAAGCAGATGGTGCGGGGTTTACCGCACATTCACAAGCCGAACCAAGTGTGTGAATGATGTCTACTTGGCAAACATCATCGAAGTAGTTTTCCGAAGGAGTCTATGACAAGAGCCAAGAAGCCTCTCGAACTCATCCATGCTGATGTGTGTGGAATGATTAAACCGGAGTCTCATGGTAAAAGTAAATACTTCCTTCTATTTATTGATAATTTTTCTAGAAAAACATGGGTGTACTTTTTGAAGGAAAAATCAGAAGTATTTGAAATCTTCAAGAGATTTAAGGCACGTGTGGAGAATGAAAGCAATCTTACAATCAAGGCCATGAAAACTGATCGAGGTGGTGAATTCACATCAAATGAGTTCAAATAGTTTTGTGATGAAAAAGGCATCCGACGTCCGTTAACAGTGCCAAGGACACCACAACAAAATGGAGTGGTGGAGAGGAAGAATCGGACAATCTTGAATATGGCAAGAAGCATGCTAAAGACAAAGAAAATGCCAAGGGAATTTTGGGCGGAGGCCGTAGCTTGTGCGGTCTATTTGACAAATCGAGCACCAACCAAAAGTGTGCTTGACAAGACGCCTCAAGAAGCATGGAATGGAAGAAAGCCCGGAATTGGTCACTTCAAGGTATTTGGGAGTATTGCATATGCTCATGTGTCAGAGGAAAAAAGGACCAAGCTTGACGATCGAAGTGAGAAACTCATATTCATCGGTTATGATGCAAGTTCAAAGGGTTATCGCCTTTACAATCCTTTGAATGGGAAGGTAATTATTAGTCGTGATGTTGTTTTTGATGAACAAGCATCTTGGGATTGGAATATACAGGAGGAGGAGTATGATTTCCTTCCATATTTTGAAGAAGACGATGAAAATGAGCCAACCAGAGATGAAATGGGTGAAGTTTTGCCTAGTCCAGTGTCATCCCATTCGACCGATCGATTGTCATCTGAAGGTTCATCCAGTAATTCTGAGAATTTGGTCCAAGAGGAACCCGAAGTCTACAGGAACTTAATGAGGTAAATGAAAATCAAAATGACGTAACTCTCTATTGTCTTTTTGGTGATTGTGAGCCTATTAGTTTCCAAGAAGCCATTGCAAGCAAGAAATGGAAGGATGCAATGGATGAAGAAATTCGAGCGATAGAGAAAAATGACACATGGGAGTTGACCAAGCTTCCAAAAGGGCACAAGCCGATCGGAGTGAAGTGGTCGTTATACAAGACAAAGAGAAAGGCCAATGGCGATGTTGAAAGGCACAAGGCGAGACTAGTGGTGAAAGGGTATAGTCAACAACATGGCATCGACTATGATGAGGTATTTGCCCCCGTTGTTCGCCTTGAAACCATTCGTTTGATTATTGCTTTGGCAGCTCATAATCATTGGAAAATACATCAAATGGATGTCAAATCGGCATTCTTGAACGGAATTCTTGAGGAAGAAGTCTATGTGGAGCAACCGTTGGGTTATGAAGTCAAGGGTGAAGAAAACAAAGTGCTTCGATTGAAGAAGGCTCTTTACGGTTTGAAGCAAGCACCGAGAGCATGGAATTCGAAAATTGACAAGTATTTTCAAGAGAAGAAGTATATGAAGTGTCCTTATGAGCATGCCCTTTACATCAAAATGCAAGGTGAAAGCATACTAATCATTTGTTTATATGTTGATGATTTAGTATTTACTGGAAACAATCCTAACATGTTTGATGAGTTCAAAAGAGAGATGACAAAAGAGTTTGAAATGACGGACATTGGTCTCATGAGTTACTATCTTGGGATCGAGGTCAAGCAAAGTGAAGATGGGATTTTTATATCCCAAGAGGGCTATGCTAAAGAAATGCTCAAAAAGTTCAACATGGATGATGCTAATCCAGTTGGAACACCGATGGAATGTGGAGTCAAAATCACCAAGCAAGGTGGAGGAGAGAAGGTAGATTCTACATATTTCAAAAGTTTGGTTGGAAGTTTGAGATACTTGACATGCACAAGACCGGATATTCTTTATTCAGTTGGAATTATTAGTCGATTTATGGAGGAGCCGACAACTACGCATTGCAAAATGGCAAAAAGGATACTTTGCTACATCAAAGGGACGATTGGGTATGGTCTTTCCTATGTCTCTTCTAGTAATTTTGATATTGTTGGATATTGTGATAGTGATTGGAGTAGTGACTTGGATGATCGAAAGAGTACTACGGGGTTTGTGTTTTTTATTGGTGAAACGGCGTTCACATGGATGTCAAAAAAGCAACCCATAGTCACATTATCAACATGCGAGGCAGAGTATGTCGCGGCAACTTCCTGTGTATGTCATGCAATTTGGCTAAGAAATTTAGTGAAGGAGTTGAAGTTTAAAATGGAAGGTCCAATGGAGATTTTTGTTGACAACAAATCGGCCATTGCCTTAGCCAAAAATCCGGTATTTCATGGGAGGAGCAAGCACATTGATACCCGATTTCATTACATTCGGGATTGCGTTGTGAATAAAGAAGTGGAACTCAAATATATCAAGTCACAAGACCAAGCGGCAGGTATTTTCACAAAGCCCCTCAAGTTGGAGACTTTTATCAAAATGAGGAGTTTACTTGGTGTAACAAATCAAGTTTAGGGGGGGGGGTGTTGAGAAAATGAAAGCTTTTCCATTTTCATTATTAAACTTTATTTGGCAATTAGTGTGACTTTTGGCTTTTGGTTTCTTGTAACCAATAGTGACTTTTGAGTTTT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BLAST of Lcy12g012290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGG8 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53430 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g53430 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1051.6 bits (2718), Expect = 5.3e-306 Identity = 578/1027 (56.28%), Postives = 710/1027 (69.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGG9 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g53440 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1049.7 bits (2713), Expect = 2.0e-305 Identity = 576/1025 (56.20%), Postives = 712/1025 (69.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGE0 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g07650 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g07650 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 800.0 bits (2065), Expect = 2.8e-230 Identity = 474/992 (47.78%), Postives = 610/992 (61.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGG7 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53420 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g53420 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 789.3 bits (2037), Expect = 4.9e-227 Identity = 460/981 (46.89%), Postives = 588/981 (59.94%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGN2 (Probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRR-RLK PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 787.7 bits (2033), Expect = 1.4e-226 Identity = 455/996 (45.68%), Postives = 601/996 (60.34%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C7W8 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008232 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1392.9 bits (3604), Expect = 0.0e+00 Identity = 730/1007 (72.49%), Postives = 808/1007 (80.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CK04 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501837 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1364.4 bits (3530), Expect = 0.0e+00 Identity = 714/1009 (70.76%), Postives = 799/1009 (79.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C483 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008221 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1364.0 bits (3529), Expect = 0.0e+00 Identity = 718/1018 (70.53%), Postives = 805/1018 (79.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DVZ6 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold384G00520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1350.9 bits (3495), Expect = 0.0e+00 Identity = 710/1015 (69.95%), Postives = 797/1015 (78.52%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VHA9 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold271G00610 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1345.9 bits (3482), Expect = 0.0e+00 Identity = 710/1022 (69.47%), Postives = 796/1022 (77.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. NCBI nr
Match: XP_022136558.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53430 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1392.9 bits (3604), Expect = 0.0e+00 Identity = 730/1007 (72.49%), Postives = 808/1007 (80.24%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. NCBI nr
Match: XP_038898935.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1370.1 bits (3545), Expect = 0.0e+00 Identity = 723/1009 (71.66%), Postives = 796/1009 (78.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. NCBI nr
Match: XP_008463773.1 (PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1364.4 bits (3530), Expect = 0.0e+00 Identity = 714/1009 (70.76%), Postives = 799/1009 (79.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. NCBI nr
Match: XP_022136550.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1364.0 bits (3529), Expect = 0.0e+00 Identity = 718/1018 (70.53%), Postives = 805/1018 (79.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. NCBI nr
Match: XP_004146083.2 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53430 [Cucumis sativus] >KAE8649819.1 hypothetical protein Csa_012945 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1362.4 bits (3525), Expect = 0.0e+00 Identity = 712/1009 (70.56%), Postives = 801/1009 (79.39%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. TAIR 10
Match: AT1G53440.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 1049.7 bits (2713), Expect = 1.4e-306 Identity = 576/1025 (56.20%), Postives = 712/1025 (69.46%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. TAIR 10
Match: AT1G53430.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 1042.7 bits (2695), Expect = 1.8e-304 Identity = 575/1019 (56.43%), Postives = 708/1019 (69.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. TAIR 10
Match: AT1G53430.2 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 1029.2 bits (2660), Expect = 2.0e-300 Identity = 563/993 (56.70%), Postives = 694/993 (69.89%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. TAIR 10
Match: AT1G07650.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 800.0 bits (2065), Expect = 2.0e-231 Identity = 474/992 (47.78%), Postives = 610/992 (61.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g012290 vs. TAIR 10
Match: AT1G07650.2 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 793.9 bits (2049), Expect = 1.4e-229 Identity = 474/998 (47.49%), Postives = 610/998 (61.12%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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