Lcy12g005240 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACATGTGGTACCTCAAGATGGATATCAGATGAAAACAATTTGCAAGGTGTATCAAGATCACAATCAAAAAAGTCAAAGAGAAAGCATGCCAAAATTTTACGTTACTTCCCATTGAAGAGTAGGTTACAAAGATTATATATATCTTCAAAAACTGTTGAACATATGAGATGGCATGATGAAGGACGTAATAAAGATGGAGTTCTTAGGCATCCTGCTGATTCAGAGGTTTGGAAATCATTTGACACACGATATCCTGAATTTTCACTAGAATCTTGTAATGTTAGACTTGCATTAGCTAGTGATGGCTTCAATCCTTTTGGAATCATGAGTAGTAGTTATAGTATGTGGCCTGTTGTACTAAGACCTTATAATTTACCCCCATGGATGTGTATGAAACCATCTTATTTCATTCTTTCTATGTTAATTCCTGGTCCAAAAATGCCTGGAAATAATATAGATATATATTTACAACCATTAATTGATGAACTCAAAGAGTTGTGGGACGTCGGTGTACCTACCTATGATGCATCCAAAAAGGAAATGTTCACACTTCATGCAGCTTTAATGTGGACTATCAGTGACTTCCTTGGATATGATAATTTATCTAGATGGAATACTCATTCTAAGTATTCATGTCCTCCTTGTGGGTTTGAAACACATTCATTAAGATTGAAACATTCCAAAAAATATTGTTTCATGGGCCATAGGCGATTCTTAGATCTTGATCATAGATTTCAATATGATAGAAGATTTGACGGTACCATTGAAGATAAAACAACTCCAATACCACTTTCTGGATCAAATATTCTTCAAGAATTACAGAATGTTAATGTAACTTTTGGGAGGACTACATCAGTGGAAATGAAAAGAAGACGAGGGGTGGATAATGTTCAATATTGGAGAAAAAAAAGTATTTTTTTCTCACTTCCTTATTGGGAGTATAATCTTCTTCGTCATAATTTAGATATGATGCACATTGAAAAAAATGTTTGTGATAACATTCTTGGAACACTTTTAAATGATATATCATTAAAATGTCGACAATTATGAGAGATAATTTTTTTTTAATACTTAGTACATAAAATGTGATGTTTATTTAAAAAAAAATATAAATGTAATCGTATGGTTTCTTATTTTTGTGGTTTGAAAGAGAAAATCAATTAATATAATCATATACTAATTTTTTTTTAATACAACAACATTTGGGGGTGAGGGTTCGAACCTCTGACCTCTTGGTTGAGGGTATATGCCAATTACCACTAACTATTTTTGCTAAGCTACAAATTAAATTTAAAAAGATTCCTATTCTATATAAGGTTTCATAATAATAATTAGTATTATAAAATAAACACTAAAACTAAAATATATATGGAAGGAGAGAATATCTATGAAGTTAAAACATATTTGCATTTCTTGTAAAAAAAAAAAATAAATCGCATTTGAGTTCAATTGGAGGTATATCATCTATAACTCTCTTATTTACATATCTTCAAGCCTTTTTTTTTTAAATTGCAAATTATCAATATTATATCAAAAGACAAACTAAAGATGCATGTTAAATTAAGCAATCAAATATTGTTACGCAAATTGCTTACCGCAAGTGTACGAGCCAAGTTATAATATATTGATTAAAAATCGAATGTCGTCCTCTGGATTGGTTTTCCTAGCTCACCTAATTATTAAAGATGTATTTGCCCAATTTTATTTAGAGAAAAGATTCGAGTAAGATGCAAATAAATACAAAACTACTCAAAGCAATTAAAATGTGTGAAAACTTAATGGATAAAAGCCTTGGAAAATTGATTTCACCTATTTGATGCATGAATTAATCTAGTGATTAAATATGATTGAACACGTAACGATTTCATAAACCAAGAATTATTAATTATTAACTGCCTCTCTCGAGCATAATTAAATCATGCAAAATTAAGAAATTGATATCCCTATCTAATTTCCTTAGAGTTCAATTCTTTTGACGGTTTTTCAAACAATCCTAAATCTCCCAATTATAGAACCACCTAAGTCATGCAATTGATAAATCTAATCTAAACTACCCTTGTAGCTGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGTACTTTTGACCGAACATTAATAAAAGTGATGAATTATTCATTTAATCTATGTTTGTATTATATCTTGTCTTATTAACCCTAATCCAATGAACTAAACATCCAAGGCTAATAGAATGAGGCTTGAACTAGTATGTAGGGACATACGGGGATCGATGTTCAAGTTTTAGCCTAAAGGGTCTGTAGTATAGGGATAAGGTTGGGTACCTTATCCTGGTGACACTATAGATACGACCCGCTTTGTATAATGATACAAACGTATTGATCCAACGCGTTCATGTAGTTGACATGCGAGTGGGGGTATCCTGTGCAATGAGTTTGCACAAAGACCGGACCGCGAAATAGTTAACCACTAACTGTAACACCGTTAGTTAACTCGGTTCTATTTCACTAGGATGACCTATGCAACTTGGCCTTAATCCTGAGTGGATTATGGACTCCTGTCCATGAGGGATTGTCATTTGATTTGTACGGGTGAGAGTGGCCTGCACGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGGAGCTGGGAACATAGTCTTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCAAGATTAGGGTAAGTAGAGGTGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCCGGGTCTTGAACAATGGGCCCTACCCTCTCTATGGCACGAGAGGGACTTTTGTTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGATGAAGAGGTAGCCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCTAGCTGGGGTACGAACACACGTGAAGGGCTAACTTGCTGTTGATGGTCGATATCCGTGGACACAGAAATATATCTGCAGTGAGAAGAGTGCAGCTGTGGTTCTATAGTGGAGTGAACCACAATTAACGAACATTGATTAATTTGGTTAATGAGTTTAGCCAATTAATCTCACATTGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCACCGGTAGCTCTATAAGGGCGTTGAGGTAAATTTCTAAGGGAGAATTGAATATGAAGGTGTACATATTACACATGCGGAAGCAATTGAAGATCGAAAGCACTTAAGACATTCAATTTTACTCCTAAAGCATGCATGTTCTAGAAAAGACAGAATAGAGAGTTTAGAAAACACCAACCTTTGTAGCTCACTTATGTTGAACTCCTTGTGGTGTTTGCCTCTCCTATGCTCCTTGGACAACCTCTAGAGTCTTCCCTACTATACTCCGGGCCAAGAACGACTTGTGGGAGTCTATATAAGATAGGGAATGGGAAGGGAATGCTTGAAGCATCAAGCAATGGAGAAGAATGAGAGATGAGAGAACTTTGAGTCCAAATTCCAGCAGCATAACATTAAGGAAAATGACTCTCATAGCTTTGAATCTGATTCAAGCTCCTTTTAAAGACATTCTTCATGCAAAGCCAAGCCTCAAGACACAAGACACATGGTGTATTTGCAAGTTCAAGTGGATTCTAGGTGTACATCTCACAAGACATGCAACAATGCATGAGTGAGTTGTCTTTCCACTTTGAATGTTCATGCATAAGTGGATTTCCAACTAAATCCACCAAATACAAATTGAAATCTAATTTCAAGCTTGCAATTTAATGTTCATTTCAATTCCAAATTGAATTTAACATTAGGTAATTGATTTTGAGGCATTACAAAATGATTTCTTATGATTAATCCAATTAATCATTCTAATCTTGTGCAATAAATCATATATGATTCCTAATACATATATACGGTATTCAAAACACTTTTAAATACTCCATCTCTCATTTTCTAATTTAATTCATAATTAAATTATTGTGTCAAACACAATTTACGATAATATCCTTTTTCCCGATTTTTGAACGATTCAAAGCTTCCTATCTTTTGTTCTAGGCTTAATTCCGATATGAGCTAGTAGGGGGACCTAATGGACCTATAGATCATGGGCTCCAACGATTTGAGGCTAACCGACTAATCTCATTATCCAAGCTAGCCAACATTCGTTAACTACCGGGGCACTCCACTATAGCCCGATAGTTGCACTCCCCTCACTATAGATATATTTCTGTCCACTTGATTTAACCATGATTAGTAAGTCGATCCTTCACAGGTTGTTCGTAGCTATAGCTAGGTCAATAAGCCGTTTTACCCCTATAGTACTTCTAGTTCCTTAAGTCCCACTGATCCTCTAATGAACAATTGGTTTATGGTCCAACCAATAAACCGAGTCCCTCTCGGGCCAATGAGAGGGCGGGATCCCTTTGTTCAAGCCTCGGAGTCAGCACTTAAGGGAACAACCTCTCTACTATCCCTAATTCACTATGTCCCCAGCTATCTACCCGTTCCTATCCCTGAAATGGGAGGCTTATTGAGTCGGCGATACTGAGCCACTCTCACCTATGCAGATCTAAGGATAAGTCCGAATAAACAGGAGTTCATAGTTAGCTAAGGATTAAGATCGAGTTACCTAGGTCATCACATGAAATAGTCAGTCTCGTCAGTAAACAGTGTTATAAAGCGAGAGTGACTTATTTCTTGGTCCTGGTCTTATGCAAACTCATTGCATAGGACGCCCCCACTCGCATGTCTCTACATGGACGATTTAGGATCACATCGTCTATACCATTTATAAAGTGGGCCGCGTCTCATAGTGTCCCCAGAATAAGGTACCCAACCCTATTCCTATACTATAGACCGTTTTGGCTATTACTCAAGCTTGATCCACTTTTATGTCTCTACATAAAGCTCAAGTGTTCATCCTATAGCCATGGATCTTAGTTTATTGGATTTGAGTTATTATATGTGCAATTTACTTTATTCAGTAATAACTTTACTGAATTAATCTCGATAACGCCTTTATCGAATAAGTATATAATTCGTTTAACATTCACTATCTACGAGTTTTAGGACACCAATCCCAACAGAATATTCGAAAGGGTTCGAATATTAAGTTGAAATATGAATTTGATTCATATTAAAACTATAGGTTATAATTAATACACATATGATGTATATTAATTCTATAGTTAATTTGAGAGAAATATAATTAAATATATGATATTTAATTATAATATTAATTAATTGGTGAATTAATTAATATTTTTTGTTTTAATTTAATTTAATTAAATTTTGATTTAATTAAATTATATTAAGACTGTAGGTTATGTAGAGTATTTGTATAAATATGTTTTATACAAATGAAATTAAATTAAAAGTTAATTTAATTAAAATAATTAATTAATATTTGTTATAAGATATTAATTAATTATTTTTATCCCATCAGTTAGGTTAACTGATGGGAACGTGTATTCAGCATAACCGAAGGACTGCGTGAAACATGAGAAGTTTAAGGGAGTTGACCTCTTCTTCCGTAAGGAATTCCATTCAGTGCATTCTCTCTCAGTTTTTCACGCATTCTCTTTCACTCTCCAGATCTCTCTGTAATTCTCTCAATAATACAGAGAAGAAAAATTCTTCCTAACCCTTAGAAATCACACTCCCACAAGCCCCTAACGCACATCCTTGAAGAGAATACCGGTGCAACCTTGGTGGTGGTGTTCGTGACGAATTTCCAGCAAGATCAAGACCTTTTGCTGCTGGTTTTTTGCGTGAAATCAAGGGATTTTTGGCGAGGTGATCAAGAATTTCCATATCGGTAAGGTATTCTTGATCTAGGATCATTAGGGTCCATCCTAGATTAGATCTAGGGTTTTTAAATGTGAATTAGCATGTTTTATAATAGATTTACAGCATGTTAATTTTTGTTTACTGCTGTGATTTAATTTTCCAACGTATTGGTATTTTAGTTCAAATTAAAACTGAGTTAAGGTTCTATACGTTTCCACTGCGCAAGGGCTATTATCCCTTCAATTGGTATCAGAGCCTTCTCTGTATTTTAATTTGTGAATTAAAATTTGCGTTGGTTTTAGGTGGGATTTAATTGCATTATGGATGTTAATTTGCTATGAACTGGAGATTAATTGGCCTTAGATTTACAATTTTTTGATGCGATCAAATGTAAAGGCCCCTGCGTTTTTGGGCAATTAAAATTGTAAATCGAGTCCCTGTAAGTCCAAGTCTAGTTTAGACTTAAGAACGATGAAGATTGGGACCAAATTTGGCCAAAAACGGTGGAAAACGGCGAAAAATTGCGGCTGGAACAGTGCAGGTTTTTCCAGGAATTCGAAAAAAAAAAACGAAAAATCGGACGGAACGCGCGTACAGAGGGTAGGGCTGACGTCAGCGTGCGTCAGCGAGGCGCGGTTCAAGTTGCGTCAGCCGGTTCTTCGGAAAAACGTCGGTTCGTTGACTGGCGTGTCTGGTTCGTTGACTTTTCGCCTGGTTCGTTGACTGGGCGGTTTTTGAAGCTGGTTCAGTGTTTTGTCGGTCCGATTCGAGCGGTTTTGGCAAATTTTGAGCATTTTTTGTCCAGTTCGGGGCTGCAGAAGGCTGTAATAGGATAGATTTTTGCTTTATTATTGTAATTTAAGCTTTAATTTTATCCTAGGGGCCAATTAATCGATTCATATGCTATTTTATATGCTTTATGGATGTCATATAAAATTAGAAATCCCACCTTAGGTTATAAAGCATGCTCATGCATTTATGTATGTTATAATTAGATTATAATATATGATTAAAATGCATGGTTTGATTTTCATGAATTTTTTAATATATAGTTGAGTTATATTAAAATCATGAAAATGTAATAGTATGATGCATGCAATTACATAGAAAATCGGATCGTCGTCGGCGCCGTCGCGAGCCTCCGCATCGTCGTTGCCTCCTCGCTCTGGTCGTCAGTGTCGCCGCCGCTTCAGATCCGCCGCTGTCATCGCGTAGCTTCGCCGACCTGCCGCCGTGCCGCCACAATCACACAAGCTCGCTGCAAGAAGCTCGAAACCCACGCATTCAGCTCGTTCCAGCATGTGTTCTATCGCCATCATCGCCGAGTGTTGTTTGCAGTAGCCATAGTTACGTATTACGTGATGTCGGGGTAAGTTTTGTTGAGTTTCCATGCTTTATTTGAGTCTCTTTAGCAAGTTTCTTAAGGATAGATCAAGCAATAAATTTTCCTGATTCGTTTTCAGATTAG ATGACATGTGGTACCTCAAGATGGATATCAGATGAAAACAATTTGCAAGGTGTATCAAGATCACAATCAAAAAAGTCAAAGAGAAAGCATGCCAAAATTTTACGTTACTTCCCATTGAAGAGTAGGTTACAAAGATTATATATATCTTCAAAAACTGTTGAACATATGAGATGGCATGATGAAGGACGTAATAAAGATGGAGTTCTTAGGCATCCTGCTGATTCAGAGGTTTGGAAATCATTTGACACACGATATCCTGAATTTTCACTAGAATCTTGTAATGTTAGACTTGCATTAGCTAGTGATGGCTTCAATCCTTTTGGAATCATGAGTAGTAGTTATAGTATGTGGCCTGTTGTACTAAGACCTTATAATTTACCCCCATGGATGTGTATGAAACCATCTTATTTCATTCTTTCTATGTTAATTCCTGGTCCAAAAATGCCTGGAAATAATATAGATATATATTTACAACCATTAATTGATGAACTCAAAGAGTTGTGGGACGTCGGTGTACCTACCTATGATGCATCCAAAAAGGAAATGTTCACACTTCATGCAGCTTTAATGTGGACTATCAGTGACTTCCTTGGATATGATAATTTATCTAGATGGAATACTCATTCTAAGTATTCATGTCCTCCTTGTGGGTTTGAAACACATTCATTAAGATTGAAACATTCCAAAAAATATTGTTTCATGGGCCATAGGCGATTCTTAGATCTTGATCATAGATTTCAATATGATAGAAGATTTGACGGTACCATTGAAGATAAAACAACTCCAATACCACTTTCTGGATCAAATATTCTTCAAGAATTACAGAATGTTAATGTAACTTTTGGGAGGACTACATCAGTGGAAATGAAAAGAAGACGAGGGGTGGATAATGTTCAATATTGGAGAAAAAAAAATTAG ATGACATGTGGTACCTCAAGATGGATATCAGATGAAAACAATTTGCAAGGTGTATCAAGATCACAATCAAAAAAGTCAAAGAGAAAGCATGCCAAAATTTTACGTTACTTCCCATTGAAGAGTAGGTTACAAAGATTATATATATCTTCAAAAACTGTTGAACATATGAGATGGCATGATGAAGGACGTAATAAAGATGGAGTTCTTAGGCATCCTGCTGATTCAGAGGTTTGGAAATCATTTGACACACGATATCCTGAATTTTCACTAGAATCTTGTAATGTTAGACTTGCATTAGCTAGTGATGGCTTCAATCCTTTTGGAATCATGAGTAGTAGTTATAGTATGTGGCCTGTTGTACTAAGACCTTATAATTTACCCCCATGGATGTGTATGAAACCATCTTATTTCATTCTTTCTATGTTAATTCCTGGTCCAAAAATGCCTGGAAATAATATAGATATATATTTACAACCATTAATTGATGAACTCAAAGAGTTGTGGGACGTCGGTGTACCTACCTATGATGCATCCAAAAAGGAAATGTTCACACTTCATGCAGCTTTAATGTGGACTATCAGTGACTTCCTTGGATATGATAATTTATCTAGATGGAATACTCATTCTAAGTATTCATGTCCTCCTTGTGGGTTTGAAACACATTCATTAAGATTGAAACATTCCAAAAAATATTGTTTCATGGGCCATAGGCGATTCTTAGATCTTGATCATAGATTTCAATATGATAGAAGATTTGACGGTACCATTGAAGATAAAACAACTCCAATACCACTTTCTGGATCAAATATTCTTCAAGAATTACAGAATGTTAATGTAACTTTTGGGAGGACTACATCAGTGGAAATGAAAAGAAGACGAGGGGTGGATAATGTTCAATATTGGAGAAAAAAAAATTAG MTCGTSRWISDENNLQGVSRSQSKKSKRKHAKILRYFPLKSRLQRLYISSKTVEHMRWHDEGRNKDGVLRHPADSEVWKSFDTRYPEFSLESCNVRLALASDGFNPFGIMSSSYSMWPVVLRPYNLPPWMCMKPSYFILSMLIPGPKMPGNNIDIYLQPLIDELKELWDVGVPTYDASKKEMFTLHAALMWTISDFLGYDNLSRWNTHSKYSCPPCGFETHSLRLKHSKKYCFMGHRRFLDLDHRFQYDRRFDGTIEDKTTPIPLSGSNILQELQNVNVTFGRTTSVEMKRRRGVDNVQYWRKKN Homology
BLAST of Lcy12g005240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P5EZG9 (uncharacterized protein LOC109710609 OS=Ananas comosus OX=4615 GN=LOC109710609 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 383.6 bits (984), Expect = 7.5e-103 Identity = 177/304 (58.22%), Postives = 232/304 (76.32%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g005240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1J6KFE9 (DUF4218 domain-containing protein (Fragment) OS=Nicotiana attenuata OX=49451 GN=A4A49_63398 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 377.9 bits (969), Expect = 4.1e-101 Identity = 177/314 (56.37%), Postives = 228/314 (72.61%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g005240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P5F985 (uncharacterized protein LOC109712821 OS=Ananas comosus OX=4615 GN=LOC109712821 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 370.2 bits (949), Expect = 8.5e-99 Identity = 177/308 (57.47%), Postives = 233/308 (75.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g005240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1U7YLX8 (uncharacterized protein LOC104249398 OS=Nicotiana sylvestris OX=4096 GN=LOC104249398 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 366.3 bits (939), Expect = 1.2e-97 Identity = 181/316 (57.28%), Postives = 229/316 (72.47%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g005240 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P5GCE5 (uncharacterized protein LOC109722603 OS=Ananas comosus OX=4615 GN=LOC109722603 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 364.0 bits (933), Expect = 6.1e-97 Identity = 172/307 (56.03%), Postives = 228/307 (74.27%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g005240 vs. NCBI nr
Match: XP_020088912.1 (uncharacterized protein LOC109710609 [Ananas comosus]) HSP 1 Score: 383.6 bits (984), Expect = 1.5e-102 Identity = 177/304 (58.22%), Postives = 232/304 (76.32%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g005240 vs. NCBI nr
Match: XP_028120260.1 (uncharacterized protein LOC114317702 [Camellia sinensis]) HSP 1 Score: 383.6 bits (984), Expect = 1.5e-102 Identity = 180/308 (58.44%), Postives = 228/308 (74.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g005240 vs. NCBI nr
Match: XP_028111137.1 (uncharacterized protein LOC114309564 [Camellia sinensis]) HSP 1 Score: 382.9 bits (982), Expect = 2.6e-102 Identity = 180/308 (58.44%), Postives = 229/308 (74.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g005240 vs. NCBI nr
Match: XP_028074698.1 (uncharacterized protein LOC114277071 [Camellia sinensis]) HSP 1 Score: 380.9 bits (977), Expect = 1.0e-101 Identity = 180/308 (58.44%), Postives = 230/308 (74.68%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy12g005240 vs. NCBI nr
Match: XP_028109391.1 (uncharacterized protein LOC114308096 [Camellia sinensis]) HSP 1 Score: 380.6 bits (976), Expect = 1.3e-101 Identity = 178/308 (57.79%), Postives = 230/308 (74.68%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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