
Lcy11g016950 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAAAGACAATGTAGAGCTTATTTTGCAGAAGCTAAATGGTTCCATGAAGGGTATGTGCCAACAATGGAAGAGTACATGAAAGTTGCCGTCGTATCTACTTGTTACCATCTTCTTGTTCCAATTTCATTTCTCGACATGGGAGTTGCTGCTTCAGAAGAGGCTTTCCAATGGGTTGAGAGTGATCCAATGCTTCTTAAAGCAACTGGAGTAATTGGCAGACTTATGAATGACATAATTTCACACAAGGTACACAAACTAAGCCATCGGAAATAATAGGAAAAAAAAATTTAAGTCTTGTTCATCAGAAAAGTCCCAAAGCGTAGCAACGAAGTGACATTTTGAGTGTTTAAAAAAGTGTTTTTAAGTGTAAAAAAAAGTGTTTTTAATTTAAACATTTAGAAAGTCATTCCAAACAGACACTGAGATTAAGTAGATAAAATAGCATTCAAACATAAAAATTGAAAAAAGAAAACAAAAAAAGGCCAAAAACCTGCCCACAGAACCTGAACAATCAATTTGAAAAGAGTAGGGGTCCGTTTGGAATACATTTTAATTTAAATGGTTTTTAAGAATGCATTTTTTAAAAAAGATTTTGTATAAAAATGGTTTAGAATTTAAACACTCGTATGTTTGGATGCATTTCCTTATAAATGTTTTTATACACAAGTTATTGTTTACTTAAAAAGACTTTTTTAAAAAGTTGGTTTCAAATGTTTCTCTCAAAATGGTTTATTTATCAATCTCATTTTCTAATAAGTCATTTTTAGTGGTTACCAAACACTAGAAATTTTTCAAAATGATTTATTTTCAACATTAAACACTTGAAAAGTTAAACCAAACACACCCTAAGTCTCGCGTTCAAGCACAATAATGCACTAACTTATTTGAGGTTTGTTGTTAAATTTAATGAAATTGAATTTATGGGTTAAATTTGACTCACTCGAATAATAAAATATATATATATATGTACAGGGAAAAAAAACTAGATTTGTGATTATAAAAATTTCTTTCATATATTTATGTGATTATTTAAATTGTCTACTTCCCAGAAATCATTTTTTAATGATTGATTATGTTTCAATTTTTATTAGTTTGAACAAGAGAGATCATATTGGCTCAGCTGTTGAATGTTATATGAAACAACATGGAGTATCAGAAGAAGAAACCTTAGCTGAATAAGAAAAGGAGGTCGTAAAAGCATGGAAAGATATTATTGAAGACCATATGAAATGTACCAAGATTTCAAATGCGATCGTTATGCGCGTGTTGAATCTTGCTCGACTCTCAGACCTCTTTTACAAGAAGGAAGATGGTTACACATTCGTCAACCAAACGTTTCATTGCCTCCATCCTTGTAGACCCCATACCAATTTGATTTGGTCTTTTTTTCACCATATCTATCGTAAAATATGAATATATGAATATGCATGAAGTTGTCTAGTAAAAGTGTGTTTGAGAAACAATTGAAAGTACTCATTATTTATATGTGTTTTGAGTAAAAGAGTCGTTGCTTTATGAAAAACATAATTTTGATCTATACTAAGAAGTGTGTTTTTTTAATCATTAAAATATGCACTTAAGAGTTATTTTTAAAGTTGGTAAATTACTAAAATGCAACCATTAAGTAGGGGTGTTCAAATCAACCCCAAAAACCGAACCCGACCGTCCGAAACCGACTAAACCGACGTCTGTCGTCGATTTAGAGGCTGAGTCGGTTGGTGTCGGTATTTTAAAATATAAAACCGACCGGTCGGTCGGTCGGAATAAAAAAATTGAAAACGACCGACCGACCGAAAATATAAAGAAAAATCGTGGGCTGCATTCCATTTAAAGAAAATTGTTTTGAGAAAACTAAGGAAGCCCATGGTTTTCTCAAAAACCATTGTTGGTTTTGTAATATAAAATTATTATTTTCTCCTATTCTCTCTCCTCTCTTAACTCCCCATCCCTTCACCTGTCTTTTCACTTCCCTTTTTCAATTTTTGTTCATCTTCTCTCTCTTCTCTATCCTTTCCACCGGCAATTTCCCTCTCCCCTCTTCATTCATTCACTTCTTCTTTCTTCCCCTTTCTCTCTTCTCTCCTCTCCTTCCCTCCTGTCGACCATGGCCGTCACCACCATCCGAACCTTTTTTCTTTTTTATTTTCTTTTCCCTTTCTCATTTTTTTGTTTAGTTTCTTCTCCATCTCTTATTTTCTTCTCCATCGGCTATCTCCGCTTTTTTCTTTTTTTTTTTCACTCTTTCTCCTTTTTTAGATCACTGGAGTTCACAAAAACCGACGGAAACTGACCGATCGACCGACGATTGGTCGGTCGGCGTCACCAACCTTTCAAAAACCAATGAAAACCGACCGACAAGAACCGACATGTCGGTGGTCGGCGTCGGTTTTAGCCCAAAACCGACTCCGACCGACCGATGAACACCCCTACCATTAAGATGAAAGAATAACAAAGTATGTGAAAAGAGAGATTAGCAAAAAAAAATTGTGTATAGAGAAATGAATAAGATAATTTGTGTCCATAGAGAGATTGAAGATAATGAGAGAAAATAGGGGAAAATACATTTTTGTCCCCAAGTTTTGAGGGATAGTTACGTTTGGTTCGTTTTCAAAATAAACATTTTTAATCTCTAAGTTTTTTTAGAAATAGACTTAAAAGGTTTCTCAAACTATTTTATTAATTTTTTCAATTTATTATATAAAATTAATATATATATATATATATATATATACATATATTAATTCTTAATATTGAAGATTTTTTTAAAAGAATAAAAATAATCCCTCCACACTCTACCCCACTCCTCTCTCCTCTCTCCTCCCTCCACGTTCTTTTCCTCTTCTTCGTCTTTTCCCCTTTTCCCCACCATCTTCTTCTTCATTTCTCCTTCTCCCTCTCAACATGCTGCAGCAACAGTAGCAGTGATGGGGCTGGGATATTCGTCTTCTTCCCTCCTCTTCTGACAAATGCCAATACGTCATGTTTTGATCAGAATCGCAAATGGCCAACGGACTCTTGTATTTTATTACTATACCTATATGATAAACATGATTTGATTGATTAAGTTCACATTACAATGTCCTAATGGGTCTGGCCCATTTACTTCTCATTTATCTCATGCACGGCAAGTGGATGAAGGAGTTTTGTCTCCACACAATCCCTATCATATTTATGATTGCCACAAGCTTGAAAGTTGAAATAGCAGAAGTTAAACGTAAACCCCTATCTGTTGAGCCATTTTTCTCATCTTCAGAAGAAAAAGAATATGTCATATGGAGTCAAAACCTCAGATGATGCCTCACTCAATGAGGATGTTCCTCGTCGATTTGCAAACTTTCCACCATGTGCTTGGGGAGATTACTTCATTTCCTCTCATTTCAACACTATGGTAAATATATTATTTTCCCTATCATTTGCTTTTTTCTTTCTTTCGATTACAAAGGTCCGTTTTGATAAAGTTTTTGTGTCTCGTTTCTCATCATCCTTATTATTATTAGTTTACTTTCACGTTAATTCTTTTTTGATTTGTATACACACTTTCTAACATCCTCTTTCAATCTAAGATAAATTTGAAGTTTAGCTATCGAGTTTGTGTTTCCAAACTTTAAAAAAATGTCTAATATTTCTCCAAACTTTCAAGGAGTCCTAAGAAGTCTTTGAACATTTTTAAAAGTTTATTTAACCTACTTATAATTATATTGATCTTTTCGATGTGGGGATGCTTGACATGTCCCTCAAGATGACGGTTCTTTGTGTTAACGAATCTTGAGTTGGATTCTAATTTTTAGACCAAAAATCTGTCTCGACTTTATGAACTCTCATGCAATATTAAATAAAAATGAGGTTTCATATCAAAACTAATTGATAATGAGAGAAGTAACTTATGTATCTTATAAATTGTGAGGGCTCTATTCATCGTTGCGATGTGGGATACTTAATCGAAGAATTTGAGAAAAGAAAGAGAGAGGGGTTGAAGACGGAAGAAGGAAGAGGGAGACAGTTTTCTTGAGGAATAGAGTGAACATGGGGTCGAATTGCTGACATTAATTTTGGTTTTGTAATTGGGCTTCAATCTGGGGGAATACACTTTTGGTTCCCTAAGGTTTGAGTTAGATTTCATTTGGTCCCTAAGTTTGAAAACTCATATTTTAGTCCTGAGGTTTGGATTTCATTTCATTTTTTGGTCCCTTCATCCGATTTTCCTTTAATTACTAACAGATTGCTAGAGTGGCACTATTTTTTTTTATTAAAAAAAATTGTTTTTTAACTTTTTAAAATAAAATAATATTAAATTAATACGTCGTCGACTGTCGACTGCTAGTCAATTTTTTTTTTTTTTTATCATTTTCTTTCTTTCTTCTTCCTCTTTCTCTTCTTCTCCTTCCTCCTTTCCATATTTTTCTTTTCCCTCTTTGTTTATTCTCCCTTTCTTTTTCGTTTATATATATAAAAAAGGATATCCTCAATCTGAACCGGAACGAAGGGGAAACCCCCTTCGTTTAAGACTTTGTTATTATTTTGTAAAAGAAAATAGAAAGAAATGGAAGACAAAGAAAGAGAAGGAAGGGAGAAGAGAATAAGGGATGGAGAAGAAAGAAGAAAAGAGAAGGAAAAAAAAAGGTGATGGACAGTATTGGCGGACGACACCGGCGGCGACTATGGGATTAAGGTTTGTGGGACGGAAGAAGAATAGAGTGGAGGAAGAAGATGGAGTAAAAAAAAAAGAGAAAAGGAAAAAAAAAAAGAAAAAACAATATATTAAAAAATAATATATTATTTTGAAAATAGAAAAATAAATTTGTAAGTAAAAAATAGATGTCACATCAGCATTCTTTACTATCAAATAGAAAATTTGATGGAGGTATCAAAATGAAACAAAATCCAAACATCAGAAATTAAAATGTAAAAATTTCAAATTTAGGAATCAAAATGAAACCTGACCCAACCTTGAGTAACTAAAAGTGTCTTTTTCAACCAAAAAAAATTAATAA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BLAST of Lcy11g016950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6Q3H3 ((-)-germacrene D synthase OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VIT_19s0014g04930 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 574.3 bits (1479), Expect = 1.7e-162 Identity = 276/553 (49.91%), Postives = 391/553 (70.71%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9SCB6 (Probable terpene synthase 2 OS=Ricinus communis OX=3988 GN=TPS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 535.4 bits (1378), Expect = 8.7e-151 Identity = 257/541 (47.50%), Postives = 374/541 (69.13%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6Q3H2 (Valencene synthase OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=ValCS PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 523.1 bits (1346), Expect = 4.5e-147 Identity = 266/555 (47.93%), Postives = 368/555 (66.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F6M8H4 (Probable sesquiterpene synthase OS=Santalum album OX=35974 GN=SesquiTPS1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 521.5 bits (1342), Expect = 1.3e-146 Identity = 250/543 (46.04%), Postives = 367/543 (67.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B5A435 (Sesquiterpene synthase OS=Santalum album OX=35974 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 518.1 bits (1333), Expect = 1.4e-145 Identity = 252/543 (46.41%), Postives = 367/543 (67.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G1W9 ((-)-germacrene D synthase-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111449935 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 805.8 bits (2080), Expect = 1.3e-229 Identity = 402/551 (72.96%), Postives = 460/551 (83.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L1X6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G039850 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 796.6 bits (2056), Expect = 7.7e-227 Identity = 404/559 (72.27%), Postives = 463/559 (82.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BMD3 (LOW QUALITY PROTEIN: (-)-germacrene D synthase-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 778.1 bits (2008), Expect = 2.8e-221 Identity = 377/514 (73.35%), Postives = 443/514 (86.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DXE3 ((-)-germacrene D synthase-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491131 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 2.3e-218 Identity = 389/553 (70.34%), Postives = 449/553 (81.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3D784 ((-)-germacrene D synthase-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold443G00730 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 756.5 bits (1952), Expect = 8.9e-215 Identity = 369/508 (72.64%), Postives = 435/508 (85.63%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. NCBI nr
Match: XP_023539491.1 ((-)-germacrene D synthase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 813.5 bits (2100), Expect = 1.3e-231 Identity = 402/548 (73.36%), Postives = 463/548 (84.49%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. NCBI nr
Match: XP_022945806.1 ((-)-germacrene D synthase-like isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 805.8 bits (2080), Expect = 2.6e-229 Identity = 402/551 (72.96%), Postives = 460/551 (83.48%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. NCBI nr
Match: XP_011650453.1 ((-)-germacrene D synthase [Cucumis sativus] >KGN55965.1 hypothetical protein Csa_010180 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 796.6 bits (2056), Expect = 1.6e-226 Identity = 404/559 (72.27%), Postives = 463/559 (82.83%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. NCBI nr
Match: XP_008449179.2 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: (-)-germacrene D synthase-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 778.1 bits (2008), Expect = 5.9e-221 Identity = 377/514 (73.35%), Postives = 443/514 (86.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. NCBI nr
Match: XP_016900654.1 (PREDICTED: (-)-germacrene D synthase-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 768.5 bits (1983), Expect = 4.7e-218 Identity = 389/553 (70.34%), Postives = 449/553 (81.19%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. TAIR 10
Match: AT5G23960.2 (terpene synthase 21 ) HSP 1 Score: 372.9 bits (956), Expect = 5.3e-103 Identity = 199/547 (36.38%), Postives = 324/547 (59.23%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. TAIR 10
Match: AT5G23960.1 (terpene synthase 21 ) HSP 1 Score: 368.2 bits (944), Expect = 1.3e-101 Identity = 198/550 (36.00%), Postives = 325/550 (59.09%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. TAIR 10
Match: AT1G31950.1 (Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 352.4 bits (903), Expect = 7.4e-97 Identity = 203/601 (33.78%), Postives = 339/601 (56.41%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. TAIR 10
Match: AT1G70080.1 (Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 352.1 bits (902), Expect = 9.7e-97 Identity = 197/563 (34.99%), Postives = 321/563 (57.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy11g016950 vs. TAIR 10
Match: AT3G14520.1 (Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 350.1 bits (897), Expect = 3.7e-96 Identity = 197/558 (35.30%), Postives = 319/558 (57.17%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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