
Lcy10g004320 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTGCGTGTTCAAATCCCAAATTGTTCAATTATTTTATATATATTTTTTCCTTTCTCTCCCCTCTCTCTTTCTTCATTCCACCACAACCCCACTCCCTCCCCTCTTTTTTGTTTAATTTCACCCATTTTTAGTTCAATTATCTCGTGTCTTTGTACAACATTTTTATTTTAACATATATAATGTTTATTTTTTAATATTATAATATAATTATAAATTTAATTTATACAGTACACTCATTATTTTTATTCTTTTAAAAATCAATACCACATTTCTAATAATTTTGTATATCTTTGATAATTTTAACTTTTGTGTATAAATTTTTTATTCTCATTTTCTTTTAAAGTTTTATTTAAAAAAAAAAACAGAAAACAATCCCCTAATTTTTACCTATAAACAATTTCCTATATATTTTCTTCTATTTTCCACACTTGATTTCAACTTTTTCATGGTTTTTTCACTTCAAACAAGACATTTGAAGTGAATTTTGCTTGATTCACTTGAAAATAAATTTATTCCTTTCCATTTTCAAGGATTTTATTTATAAATAAAAAAAAAATTGTTGAAGGAGAAATTTTGTCCAATCACAAATTGCCACGTCATTATATAAAATTAATGACGAAATTAAAATTAATTAAATTTGGGACCAATTATAAATTGACATGTGTCCTAAATTTAATTTGAAGACAAAGTTGGCCAATTATAAATTTAAAGAGCCAAATTTATATTTGATCAATTAATTAGAAAATAAATTACTTTGATCAAATTAATTAATTTGACCAATTAATTAACAAAATAATTAATTGGATCAAATTTGGGTCTTTTAAATATTTGGGTCATATGGTTTTGGGTCAAATATGAACCAAACCCAAAACCAAATAGTTGAACCAAAGACCAATAAAGCCCAAGTCCAGGTTGTTAGGCCCAAAAGTCATCAGGGTCCATCCAGCGAGAACTCTATAAATAGAGGGGTTCTCCTCCATTTCAGGGGTTCAAAAATTCGACACTCTCACAAAGACAAGAGTTCAGAGTTTCAAAGCTCTCAAGCAAAACCAGAGAATTCAGAGAGACTCCACCAAGTCTGAAGACCGAAGACTCTCTACAATTCATAAGTTCAAGTGTTGAGCACTTCTTGAAGACCAAACACTCTTCAAGATTTCAACACTCCTTGAAGACCAAACACTCTTCAAGACTTCAACACTCCTTGAAGATCAAAGACTCTTCAGGACATCAACACTTCTTGAAGACCCCAACACTCTTCAAGACTTCAACACTCCTTGAAGATCAAAGACTCTTCAGGACATCAACACTTCTTGAAGATTGAAGACTCCTTCATGACTGGAAGACTTCAAGCTCCAAGAATGCATTGAAGCTTCAGACTCGAGATCAAGCGTTCCAGTCCTCGAGTGAAACATATTCACACACATAAGAGAGAGAATCAGAGGATTAAAGTTAGAGATTGTACACCCACACGCATACAACATTAATACAAATATATTGTTTATTCCACGTGTCTCCATCTCCGAAGTTACGTGCGAACAAATTGGCACGCCCAGTGGGACCATCTCTTCCTTTCATCTCTCTCTCTTATCTCAAAACACAAGTGTAAACATGTCGTTCAAGACTTCTTCAATGGTCGCTGTCATGAACAAGTCTTACATGAGTTCTACTGCTCATTGTTGCTTCAATGAACTGACATTGCAAGAAGATAAAACTTTTATCGTTGCAGGCCAAGAAACAACCTTGCAGGGGGCATATACTAATGACAAGTTTCTTATTAAGTATAACCCTTTGTTTGAACCTGATTCTAACGTAGTGACTGTCATGATGACTGAGACAAGAACTATGGAAGAAAGAATGGCTGAGATGCAGGAACACATCAACACCTTGATGAAGGCGATTGAAGAAAAAGATTCTCAAATCGCGCAACTAAAGAGCCACATTGAGAATCAACATATCGCCGAATCAAGTCAAACCCAAGTCATAAAAAATCATGACAAAGGAAAGACTACAGTGCAAGATGATCAGCCATAGTGTTCTGCTTCGGTCGCTTCACTATCCATCCAACAGCTCCAAGATATGATCACAAACTGTATCAGAGCTCAGTACGGTGGACCTACTCAAGATTCCCTCTTGTATTCCAAACCTTATACTAAGAGGATTGATAACTTGAGAATGCCAATCGGGTATCAGCCACCAAAATTTTAGCAGTTTGATGGAAAGGGCAATCCTAAACAACATATTGCCCACTTCGTTGAGACATGCGAGAACGCTAGTACTCGAAGGGACCTACTAGTCAAGCAGTTTGTTCGAACACTTAAAGGAAATGCTTTTGACTGGTACACTGATCTAGAACCTGAGTCAATAGACAGTTGGGAGGAACTCGAAAGAGAGTTTTTGAATCGCTTCTACAGCACTAGACGAACCGTTAGCATGTTCGAGCTCACAAACACTAAACAACGAAAGGGTGAGCTTGTTGTTAACTATATAAATCGTTGGAGAGCCATGAGTCTAGATTGCAAAGATCGCCTCACTGAACTCTCTTTCGTTGAGATGTGCATTCAAGGCATGCATTGGGAACTCCTCTACATCCTTAAAGGTATAAAGCCTCGCACCTTTGAAGAACTAGCAACTCGCGCCCACGATATGGAGCTAAGTATTGCTAGTCGAGAAAACCAAGACCATCTACTCCCTAACATGAGGAAAGAAGGAAGGAAGGACGAAGAGACTGTAGAAGAATCTATGGTTGTAAACACAACCCTTCCCATGTCGTCTTCAAAAGAAAAACGACAAACAAATGGAACGCATCACTTAACTTTAAAGGAAAGACAGAAGAAAATCTATCCTTTCCCTGATGCCGACATCCCTGATATGTTGGAACAACTACTGGAAGCGCAACTGATAGAGCTTCCTAAGTGTAAACGACCAGAAGAGATGGAGAAAGTCGATGATCCCAAGTACTACAAGTATCATCGAGTTATTGGTCATCCAGTGGAAAGATGTTTCGTCCTAAAGGACTTAATTCTAAAGCTAGCTACGGAAGGAAAAATTGAGCTCGACCTTGATGAAGTAACTCAATCGAATCATGCTACAGTCAAAGGAAAGGACAAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCTCAAGAAGCTTCAATCTAAGAGGTAGAGAAGTAAAGAGTTTTCTCAACCTCGACAACCGGTGACTGCAAAGGAACTCTTCTCCAAAACTTTCCACAAAAAGGAAGAAGGAAACTTTGTGACTTCCTACTGCATCGACGTAGAAGAAGTTGACAATTCTGAGAAGGGTGAACAAAGGACCTCTGTTTTCGATCGCATCAAGCCTCCAACTACTCGTCCTTCGGTATTCCAGAGAATGAGTATGGTCGCGACAGAACAAGAACATCAATATTCGGTGTCCACCTCCACTCGACCTTCAGCTTTCCAAAGGCTAAGTGTCTCCACATCGAAGAAAAGCCAATTTTCAACATATGTCTTTGATCGTCTCAAAGTAACAAACGATCAACCTAAAAGAAAGATGGACAACTTGGAGTTGAAACTTTTCGATGAAGTAAACAACGACGAGAAGCTTCATAGTAGTATCCCGTCACGTATGAAGAGGAAGTTTTCTGTTCTCATAAATACGGAAGGTTCCTTGAAGGTGAAGCCAAATCTCATTATCCTGACCAATCCTACAAGTCAAGGATCTGATCAAGACCATGATGAAGATAAGAGCTTTTAAAATGTAAAAGCTCCTTATCGCAAGAGCCTAAACTGCATGATGCTTCTAGCACACACGAGCTTAAAAGGTGAGTGCAAAAAAATCTTGAACTACGTTATGACTTGATCCCTATTCCATAAGGGTACGTAGGCAGCTTAAAGAAAACTTTAAGTTCAGTCTCTATAAACAAAAAAAAAAAAGGTGCAACAAATATTGAAGCATGACAATACAAATTGAAGAAATTCTTTAGCACTGGGGGCAACACAACAAATTGAAGTTGTACACCGTTATAAATGTGAAGCTACGAGTTTGATGAATGAAAGAAGACGTCATTCCTCCAAGTTCAATGTCTCGCTAGCCTCAAGTTCGGTGTTTCACTCACCCTAAGTTCGTCGCTCCTGCTTCTTCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGGAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACACGCTTCGTTGGAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGTTGGAGTTCCTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCTAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGTTTCTCTGCAGTTCCTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTTACGCGTTTCGCTGGAGTTCCTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACATGTTCCGCTGCAGTTCCTTCTCTCAAAGTTCGAGGGTCCTTACACTGTACGCTATTACGTTGTTCCTTCTCCAAGTTCGAAGGTTACTCGTTGTACGCTGCTGCTTTGTTCCTTCTCCAAGTTCGAATGTTCTCAGTTGTACGACTGCTACGTTGTTCCTCTTCCAAGTGCGAAGGATTTTATGTTGTACGCTACTGCGTTGTTCCCTCTTCTCTCAAGTCTGAAGGTTCGCATGGCGTTGCTTCGCTGGTCATTCTCCAAGTTTGAAGGTTCTGACGCTGCACTGCTTCCTTCACCAAGTTTGAAGGTTCTCACGCTGCGCTGTTTTGCTCCACTTCCTTCTCTCAAAATTCGAAGGTTCTCACGCATTTCGCTGCAGTTCCTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGCTTCGCTCCAATTCCTTCTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGCGTTTCGCTGCAGTTCCTTCTCTCCAAGTTCGAAGGTTCTCACGTGCTTCGCTGGAGCTCCTTCTCCCCAAGTTCGAAGGTTCTCA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MATTSIVSECVKALLKVTPHMQCRPRDIIEYMRKKHGINISYGKAWRAREIALRDIRGDSPEESYALIPSFAARLIEKNPGTYTTYDIDEEGRFKYFFLNFAASINGWKHCLPIIVVDGTTLKNKFNGTLLTACTLDGNSQNYPLAFCIVDLENDTSWEWFFRNLKATFGEHKDLVIVSDRHHSIPKGVHRVYPINQYAFEIIDGNKNFEVNIQSCTCTCRRWELDLIPCAHACLALRRRGLILHRYVNEFYHISTLQQTYGTNIRPIGRIQHTPHSIVDTPISPPNVKRSAGRPRKRRILSSGERKSTSKCGRCGQSGHYRRCCKNPRLN Homology
BLAST of Lcy10g004320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E198 (MuDRA-like transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold208G001100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 314.7 bits (805), Expect = 4.6e-82 Identity = 176/479 (36.74%), Postives = 228/479 (47.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C300 (uncharacterized protein LOC103495899 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495899 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 1.1e-78 Identity = 169/479 (35.28%), Postives = 226/479 (47.18%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VAU3 (MuDRA-like transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2030G00150 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 301.2 bits (770), Expect = 5.3e-78 Identity = 170/479 (35.49%), Postives = 226/479 (47.18%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DHP7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold142G002210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 294.7 bits (753), Expect = 4.9e-76 Identity = 156/393 (39.69%), Postives = 203/393 (51.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DFW1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold195G00040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 290.8 bits (743), Expect = 7.1e-75 Identity = 161/458 (35.15%), Postives = 215/458 (46.94%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. NCBI nr
Match: TYK29863.1 (MuDRA-like transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 314.7 bits (805), Expect = 9.5e-82 Identity = 176/479 (36.74%), Postives = 228/479 (47.60%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. NCBI nr
Match: XP_008455803.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103495899 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 303.5 bits (776), Expect = 2.2e-78 Identity = 169/479 (35.28%), Postives = 226/479 (47.18%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. NCBI nr
Match: KAA0064137.1 (MuDRA-like transposase [Cucumis melo var. makuwa] >TYK28603.1 MuDRA-like transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 301.2 bits (770), Expect = 1.1e-77 Identity = 170/479 (35.49%), Postives = 226/479 (47.18%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. NCBI nr
Match: TYK23191.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold142G002210 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 294.7 bits (753), Expect = 1.0e-75 Identity = 156/393 (39.69%), Postives = 203/393 (51.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. NCBI nr
Match: TYK22587.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold195G00040 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 290.8 bits (743), Expect = 1.5e-74 Identity = 161/458 (35.15%), Postives = 215/458 (46.94%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. TAIR 10
Match: AT1G64260.1 (MuDR family transposase ) HSP 1 Score: 80.5 bits (197), Expect = 2.8e-15 Identity = 41/173 (23.70%), Postives = 87/173 (50.29%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 43.5 bits (101), Expect = 3.8e-04 Identity = 23/95 (24.21%), Postives = 44/95 (46.32%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. TAIR 10
Match: AT1G49920.1 (MuDR family transposase ) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 9.1e-14 Identity = 49/182 (26.92%), Postives = 84/182 (46.15%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g004320 vs. TAIR 10
Match: AT1G64255.1 (MuDR family transposase ) HSP 1 Score: 73.9 bits (180), Expect = 2.6e-13 Identity = 44/163 (26.99%), Postives = 76/163 (46.63%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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