Lcy07g003860 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview


Name	Lcy07g003860
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Description	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
Location	Chr07: 17563034 .. 17587717 (+)
RNA-Seq Expression	Lcy07g003860
Synteny	Lcy07g003860

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

ATGACTTTGACTGTGGACAATGCCAGTTCAAATGATACTGCCGTTGCTTATCTTATTAAGAGATTTAGTAGTGGGTTGTTATTGAAAGGTGAATTTTTACACGTTAGATGTTGTGCCCACATATTAAATCTTATTGTATGTGATGCTTTTAAGGAGCATTATGAGTGCATTACTAGGATTCGCAATGTTGTGAGATTTGTGAGGTCTTCTCCCGCACTTGCTTCGAAATTTAAGAAGTGTATTGAAACTGAAAAGATTACTTTTAAGAGTTTGGTGTGTCTAGATGTTTCCACTAGATGGAACTCTACATATATGATGCTTGAGGCGGCTACGAAGTTCCAAAAAGCTTTTGAGAGGTTAGAGGATGAAGACTCAACTTTTATGAGTGAAATCCAACCAATAAAGAAGATTGGGATAATGCTAAGATGTTGTGCAAATCAAATTCTTTGTGATGTGGTTAAGAGCATGAAGTCTAAGTTTGAGAAGTATTGGGGAAATAATGAGAAGACCATTTTGTTGTTGTATGTTGCTGTTGTGTTGGACCCACGATATAAGTTGAAAATTTTGTCTTATTGTTTCAACAACTTGTTAGAGCCAACTTCTGCTAAAAGCATGACAGATAAGTTGGAAGATGAGGTTGTTCTGCTTGGTATTCTGAATGCTCGTCATCATCTTGGCTTTTGTGTGTGTTTGTATGAGATGAGATGTGATGTGGCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGACTTTGACTGTGGACAATGCCAGTTCAAATGATACTGCCGTTGCTTATCTTATTAAGAGATTTAGTAGTGGGTTGTTATTGAAAGGTGAATTTTTACACGTTAGATGTTGTGCCCACATATTAAATCTTATTGTATGTGATGCTTTTAAGGAGCATTATGAGTGCATTACTAGGATTCGCAATGTTGTGAGATTTGTGAGGTCTTCTCCCGCACTTGCTTCGAAATTTAAGAAGTGTATTGAAACTGAAAAGATTACTTTTAAGAGTTTGGTGTGTCTAGATGTTTCCACTAGATGGAACTCTACATATATGATGCTTGAGGCGGCTACGAAGTTCCAAAAAGCTTTTGAGAGGTTAGAGGATGAAGACTCAACTTTTATGAGTGAAATCCAACCAATAAAGAAGATTGGGATAATGCTAAGATGTTGTGCAAATCAAATTCTTTGTGATGTGGTTAAGAGCATGAAGTCTAAGTTTGAGAAGTATTGGGGAAATAATGAGAAGACCATTTTGTTGTTGTATGTTGCTGTTGTGTTGGACCCACGATATAAGTTGAAAATTTTGTCTTATTGTTTCAACAACTTGTTAGAGCCAACTTCTGCTAAAAGCATGACAGATAAGTTGGAAGATGAGGTTGTTCTGCTTGGTATTCTGAATGCTCGTCATCATCTTGGCTTTTGTGTGTGTTTGTATGAGATGAGATGTGATGTGGCTTGA

Protein sequence

MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRIRNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERLEDEDSTFMSEIQPIKKIGIMLRCCANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLEPTSAKSMTDKLEDEVVLLGILNARHHLGFCVCLYEMRCDVA

Homology

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9FJG3 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0239150 PE=3 SV=1)

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Identity = 75/256 (29.30%), Postives = 124/256 (48.44%), Query Frame = 0


Query: 2   TLTVDN-ASSNDTAVAYLIKRFS--SGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECIT 61
           T+T+DN  SS+D   A L    S  + L+LKG+   VRC AHILN +  D     +  I 
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Query: 62  RIRNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFE 121
            IR  ++F+++SP+   KF +     +I     +CLDV+T+WN+TY+ML AA  +++AF 
Sbjct: 363 NIRESIKFIKASPSCEEKFAEIALQLEIPSTKTLCLDVTTQWNTTYLMLLAALDYKQAFS 422

Query: 122 RLEDEDSTF-----------------------------MSEIQPIK--------KIGIML 181
            LE  D  +                             M+   P          K+ + L
Sbjct: 423 TLETSDDNYNEAPSAEDWKKVEAACNYLKLLYDSAHSIMAAANPTSNLFFHEAWKLQLEL 482

Query: 182 RCCANQ---ILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 215
                +   +   + K M  +F+KYW   +   L+L +AVV+DPR+K+K++ + ++ +  
Sbjct: 483 SNATGREDPVFSSIAKDMHERFDKYW---KDCNLVLAIAVVMDPRFKMKLVEFSYSKIYG 542

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AVI0 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os03g0733400 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 105.5 bits (262), Expect = 8.3e-22
Identity = 75/256 (29.30%), Postives = 124/256 (48.44%), Query Frame = 0


Query: 2   TLTVDN-ASSNDTAVAYLIKRFS--SGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECIT 61
           T+T+DN  SS+D   A L    S  + L+LKG+   VRC AHILN +  D     +  I 
Sbjct: 303 TITLDNDCSSHDIYSANLRDYLSNKNNLMLKGQLFVVRCYAHILNAVAQDVIASIHGVIY 362

Query: 62  RIRNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFE 121
            IR  ++F+++SP+   KF +     +I     +CLDV+T+WN+TY+ML AA  +++AF 
Sbjct: 363 NIRESIKFIKASPSREEKFAEIALQLEIPSTKTLCLDVTTQWNTTYLMLLAALDYKQAFS 422

Query: 122 RLEDEDSTF-----------------------------MSEIQPIK--------KIGIML 181
            LE  D  +                             M+   P          K+ + L
Sbjct: 423 TLETSDDNYNEAPSAEDWKKVEAACNYLKLLYDSAHSIMAAANPTSNLFFHEAWKLQLEL 482

Query: 182 RCCA---NQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 215
                  + +   + K M  +F+KYW   +   L+L +AVV+DPR+K+K++ + ++ +  
Sbjct: 483 SNATGHEDPVFSSIAKDMHERFDKYW---KDCNLVLAIAVVMDPRFKMKLVEFSYSKIYG 542

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75HY5 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0583200 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 98.2 bits (243), Expect = 1.3e-19
Identity = 73/257 (28.40%), Postives = 122/257 (47.47%), Query Frame = 0


Query: 2   TLTVDN-ASSNDTAVAYLIKRFSS---GLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECI 61
           T+T+DN  SS+D   A +I   S+    +++KG+   VRC AHILN +  D     +  I
Sbjct: 343 TITLDNDPSSHDIYSANMINYLSNKKDNIMIKGQLFVVRCYAHILNTVAQDVIASVHSVI 402

Query: 62  TRIRNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAF 121
             IR  ++F+++S     KF +     +I     +CLDV+T+WN+TY+ML AA  +Q+ F
Sbjct: 403 YHIRESIKFIKASSVHEDKFAEIALQLEIPSAKTLCLDVTTQWNTTYLMLLAALDYQQVF 462

Query: 122 ERLE--DEDSTFMSEIQPIKKIGI------MLRCCANQILC------------------- 181
             LE  D D       +  KK+        +L   A+ I+                    
Sbjct: 463 ASLETCDGDYNEAPSTEDWKKVEAACSYLSLLYDSAHNIMAAPNPTSNIFFHEAWKLQSE 522

Query: 182 -------------DVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLL 215
                           K M  +F+KYW   +   L+L +AVV+DPR+K+K++ + ++ + 
Sbjct: 523 LSNAIAHEDPIFRSTAKIMHERFDKYW---KDCNLVLAIAVVMDPRFKMKLVEFSYSKIH 582

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P08770 (Putative AC transposase OS=Zea mays OX=4577 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 91.3 bits (225), Expect = 1.6e-17
Identity = 71/234 (30.34%), Postives = 102/234 (43.59%), Query Frame = 0


Query: 3   LTVDNASSNDTAVAYLIKRF---SSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITR 62
           L++DNAS+N+ AV  +I+      S L+  G F HVRC  HILNL+  D        I +
Sbjct: 364 LSLDNASANEVAVHDIIEDLQDTDSNLVCDGAFFHVRCACHILNLVAKDGLAVIAGTIEK 423

Query: 63  IRNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFER 122
           I+ +V  V+SSP    +  KC     +     +  DVSTRWNSTY+ML  A  ++ A  R
Sbjct: 424 IKAIVLAVKSSPLQWEELMKCASECDLDKSKGISYDVSTRWNSTYLMLRDALYYKPALIR 483

Query: 123 LEDEDSTFMSEIQPIK---KIGIMLRCCANQI---------------------LCDV--- 182
           L+  D      I P     K+ + L  C  +                       C++   
Sbjct: 484 LKTSDPRRYDAICPKAEEWKMALTLFKCLKKFFDLTELLSGTQYSTANLFYKGFCEIKDL 543

Query: 183 ---------------VKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSY 192
                            +M  KFEKYW   + + + L VA  LDPRYK  ++ +
Sbjct: 544 IDQWCVHEKFVIRRMAVAMSEKFEKYW---KVSNIALAVACFLDPRYKKILIEF 594

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0JMB2 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os01g0518400 PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 89.0 bits (219), Expect = 8.1e-17
Identity = 69/259 (26.64%), Postives = 120/259 (46.33%), Query Frame = 0


Query: 2   TLTVD-NASSNDTAVAYLIKRFSSG--LLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECIT 61
           T+T++ + SS+D   A L    S    L+LKG+   VRC A+ILN +        +  I 
Sbjct: 270 TITLEHDCSSHDIYSANLRNHLSGDNILMLKGQTFAVRCYANILNAVAHGVLASVHNVIY 329

Query: 62  RIRNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFE 121
            IR  ++F+++  A  +KF +     KIT  + +CLDV++ WN+TY+ML AA  +++ F 
Sbjct: 330 LIRESIKFIKADDAHENKFAEIAVELKITSNNSLCLDVTSEWNTTYLMLLAALDYRQVFT 389

Query: 122 RLEDEDSTF--MSEIQPIKKI----GIMLRCCA--------------------------- 181
            LE     +      +  KK+    G +    A                           
Sbjct: 390 LLESYYDNYGTAPSTEDWKKVEAACGFLKLLYAFTLNIMSAEGNHQTANMFFHDAWVLQL 449

Query: 182 ---------NQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNL 216
                    + ++  +V  +  KF+KYW   +   ++L +AV +DPR+K+K++ + ++ +
Sbjct: 450 ELQNGMAHGDDVIRGIVIGIHEKFDKYW---KDCNVVLAIAVAMDPRFKMKMVEFAYSKI 509

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CXI1 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G004160 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 266.2 bits (679), Expect = 1.4e-67
Identity = 142/252 (56.35%), Postives = 167/252 (66.27%), Query Frame = 0


Query: 1   MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRI 60
           MTLTVDNASSNDTAVAYL+KRF+ GLL  GEFLHVRCCAHILNLIV DAFKEH +CI RI
Sbjct: 164 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 223

Query: 61  RNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERL 120
           R  VRF+RSSPA   KFKKCIE EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA KF+KAF+RL
Sbjct: 224 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 283

Query: 121 EDEDSTFMSEIQPIK------------------------------------KIGIMLRC- 180
           EDED+++  ++ P K                                    +I ++  C 
Sbjct: 284 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 343

Query: 181 -----CANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 211
                 AN +L  +  +MK+KFEKYWGNNEK  LLLYVA+VLDPR KL+ +S+C  N   
Sbjct: 344 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNFFG 403

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DZY7 (Putative transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2406G00150 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 266.2 bits (679), Expect = 1.4e-67
Identity = 142/252 (56.35%), Postives = 167/252 (66.27%), Query Frame = 0


Query: 1   MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRI 60
           MTLTVDNASSNDTAVAYL+KRF+ GLL  GEFLHVRCCAHILNLIV DAFKEH +CI RI
Sbjct: 73  MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 132

Query: 61  RNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERL 120
           R  VRF+RSSPA   KFKKCIE EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA KF+KAF+RL
Sbjct: 133 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 192

Query: 121 EDEDSTFMSEIQPIK------------------------------------KIGIMLRC- 180
           EDED+++  ++ P K                                    +I ++  C 
Sbjct: 193 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 252

Query: 181 -----CANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 211
                 AN +L  +  +MK+KFEKYWGNNEK  LLLYVA+VLDPR KL+ +S+C  N   
Sbjct: 253 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNFFG 312

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BX83 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold863G001050 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 266.2 bits (679), Expect = 1.4e-67
Identity = 142/252 (56.35%), Postives = 167/252 (66.27%), Query Frame = 0


Query: 1   MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRI 60
           MTLTVDNASSNDTAVAYL+KRF+ GLL  GEFLHVRCCAHILNLIV DAFKEH +CI RI
Sbjct: 280 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 339

Query: 61  RNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERL 120
           R  VRF+RSSPA   KFKKCIE EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA KF+KAF+RL
Sbjct: 340 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 399

Query: 121 EDEDSTFMSEIQPIK------------------------------------KIGIMLRC- 180
           EDED+++  ++ P K                                    +I ++  C 
Sbjct: 400 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 459

Query: 181 -----CANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 211
                 AN +L  +  +MK+KFEKYWGNNEK  LLLYVA+VLDPR KL+ +S+C  N   
Sbjct: 460 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNFFG 519

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CJE5 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold106G00510 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 265.8 bits (678), Expect = 1.8e-67
Identity = 141/252 (55.95%), Postives = 167/252 (66.27%), Query Frame = 0


Query: 1   MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRI 60
           MTLTVDNASSNDTAVAYL+KRF+ GLL  GEFLHVRCCAHILNLIV DAFKEH +CI RI
Sbjct: 253 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 312

Query: 61  RNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERL 120
           R  VRF+RSSPA   KFKKCIE EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA KF+KAF+RL
Sbjct: 313 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 372

Query: 121 EDEDSTFMSEIQPIK------------------------------------KIGIMLRC- 180
           EDED+++  ++ P K                                    +I ++  C 
Sbjct: 373 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 432

Query: 181 -----CANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 211
                  N +L  +  +MK+KFEKYWGNNEK  LLLYVA+VLDPR KL+ +S+C  N+ +
Sbjct: 433 RLNAGSRNALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFD 492

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CR68 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold84G001050 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 262.7 bits (670), Expect = 1.5e-66
Identity = 141/252 (55.95%), Postives = 166/252 (65.87%), Query Frame = 0


Query: 1   MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRI 60
           MTLTVDNASSNDTAVAYL+KRF+ GLL  GEFLHVRCCAHILNLIV DAFKEH +CI RI
Sbjct: 280 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 339

Query: 61  RNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERL 120
           R  VRF+RSSPA   KFKKCIE EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA KF+KAF+RL
Sbjct: 340 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 399

Query: 121 EDEDSTFMSEIQPIK------------------------------------KIGIMLRC- 180
           EDED+++  ++ P K                                    +I ++  C 
Sbjct: 400 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 459

Query: 181 -----CANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 211
                 AN +L  +  +MK+KFEKYWGNNEK  LLLYVA+VLDPR KL+ +S+C      
Sbjct: 460 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKIFFG 519

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. NCBI nr
Match: XP_038904452.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 282.7 bits (722), Expect = 2.9e-72
Identity = 148/240 (61.67%), Postives = 169/240 (70.42%), Query Frame = 0


Query: 1   MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRI 60
           MTLTVDNASSNDT + YL+KRFSSGLLLKGEFLH+RCCAHILN IVCDAFKEHY+CI+RI
Sbjct: 49  MTLTVDNASSNDTTMTYLVKRFSSGLLLKGEFLHIRCCAHILNFIVCDAFKEHYDCISRI 108

Query: 61  RNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERL 120
           RN VRFVRSSPA A KFKKCI+ EKI+ KSLVCLD+STRWN TYMML+AATKF+K F+RL
Sbjct: 109 RNAVRFVRSSPARAMKFKKCIKIEKISCKSLVCLDISTRWNFTYMMLDAATKFEKTFDRL 168

Query: 121 EDEDSTFMSEIQPIK------------------------------------KIGIMLRCC 180
           EDE+ TF SE QP K                                    +I     C 
Sbjct: 169 EDEEPTFASECQPTKNYWENDRLLFRFLEVFYNVTLKVSGSLYSTSNVIFRQISTTHNCI 228

Query: 181 -------ANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLL 198
                   N I  +VVKSM++KF+KYWGNNEKT LLLYVAVVLDPRYKL++LSY F  ++
Sbjct: 229 QENSMDNENLIFVNVVKSMEAKFDKYWGNNEKTNLLLYVAVVLDPRYKLRLLSYLFQQVV 288

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. NCBI nr
Match: TYK28895.1 (putative transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 266.2 bits (679), Expect = 2.8e-67
Identity = 142/252 (56.35%), Postives = 167/252 (66.27%), Query Frame = 0


Query: 1   MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRI 60
           MTLTVDNASSNDTAVAYL+KRF+ GLL  GEFLHVRCCAHILNLIV DAFKEH +CI RI
Sbjct: 73  MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 132

Query: 61  RNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERL 120
           R  VRF+RSSPA   KFKKCIE EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA KF+KAF+RL
Sbjct: 133 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 192

Query: 121 EDEDSTFMSEIQPIK------------------------------------KIGIMLRC- 180
           EDED+++  ++ P K                                    +I ++  C 
Sbjct: 193 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 252

Query: 181 -----CANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 211
                 AN +L  +  +MK+KFEKYWGNNEK  LLLYVA+VLDPR KL+ +S+C  N   
Sbjct: 253 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNFFG 312

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. NCBI nr
Match: TYK16593.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 266.2 bits (679), Expect = 2.8e-67
Identity = 142/252 (56.35%), Postives = 167/252 (66.27%), Query Frame = 0


Query: 1   MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRI 60
           MTLTVDNASSNDTAVAYL+KRF+ GLL  GEFLHVRCCAHILNLIV DAFKEH +CI RI
Sbjct: 164 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 223

Query: 61  RNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERL 120
           R  VRF+RSSPA   KFKKCIE EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA KF+KAF+RL
Sbjct: 224 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 283

Query: 121 EDEDSTFMSEIQPIK------------------------------------KIGIMLRC- 180
           EDED+++  ++ P K                                    +I ++  C 
Sbjct: 284 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 343

Query: 181 -----CANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 211
                 AN +L  +  +MK+KFEKYWGNNEK  LLLYVA+VLDPR KL+ +S+C  N   
Sbjct: 344 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNFFG 403

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. NCBI nr
Match: TYK03730.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 266.2 bits (679), Expect = 2.8e-67
Identity = 142/252 (56.35%), Postives = 167/252 (66.27%), Query Frame = 0


Query: 1   MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRI 60
           MTLTVDNASSNDTAVAYL+KRF+ GLL  GEFLHVRCCAHILNLIV DAFKEH +CI RI
Sbjct: 280 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 339

Query: 61  RNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERL 120
           R  VRF+RSSPA   KFKKCIE EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA KF+KAF+RL
Sbjct: 340 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 399

Query: 121 EDEDSTFMSEIQPIK------------------------------------KIGIMLRC- 180
           EDED+++  ++ P K                                    +I ++  C 
Sbjct: 400 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 459

Query: 181 -----CANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 211
                 AN +L  +  +MK+KFEKYWGNNEK  LLLYVA+VLDPR KL+ +S+C  N   
Sbjct: 460 RLNAGSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNFFG 519

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. NCBI nr
Match: TYK12117.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 265.8 bits (678), Expect = 3.7e-67
Identity = 141/252 (55.95%), Postives = 167/252 (66.27%), Query Frame = 0


Query: 1   MTLTVDNASSNDTAVAYLIKRFSSGLLLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRI 60
           MTLTVDNASSNDTAVAYL+KRF+ GLL  GEFLHVRCCAHILNLIV DAFKEH +CI RI
Sbjct: 253 MTLTVDNASSNDTAVAYLLKRFNKGLLFGGEFLHVRCCAHILNLIVTDAFKEHNDCIDRI 312

Query: 61  RNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKITFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERL 120
           R  VRF+RSSPA   KFKKCIE EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA KF+KAF+RL
Sbjct: 313 RYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAVKFEKAFDRL 372

Query: 121 EDEDSTFMSEIQPIK------------------------------------KIGIMLRC- 180
           EDED+++  ++ P K                                    +I ++  C 
Sbjct: 373 EDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFHQITVVQNCI 432

Query: 181 -----CANQILCDVVKSMKSKFEKYWGNNEKTILLLYVAVVLDPRYKLKILSYCFNNLLE 211
                  N +L  +  +MK+KFEKYWGNNEK  LLLYVA+VLDPR KL+ +S+C  N+ +
Sbjct: 433 RLNAGSRNALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRFVSFCLKNVFD 492

[Close]

BLAST of Lcy07g003860 vs. TAIR 10
Match: AT3G42170.1 (BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain )

HSP 1 Score: 72.0 bits (175), Expect = 7.2e-13
Identity = 49/219 (22.37%), Postives = 99/219 (45.21%), Query Frame = 0


Query: 27  LLKGEFLHVRCCAHILNLIVCDAFKEHYECITRIRNVVRFVRSSPALASKFKKCIETEKI 86
           +L G+ +   C A     +  D  ++  + I  IR+ V+ V++S +   +F +  E  ++
Sbjct: 326 ILDGQLVIGNCVARTFGSLAKDVLEKGKDVIKNIRDSVKHVKTSESHEERFTELKEQLQV 385

Query: 87  TFKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERLEDEDSTFMSE---------------I 146
             + ++ LD  T+WN+TYMML AA++ ++ F  L+  D  +                  +
Sbjct: 386 PSEKVLSLDDQTQWNTTYMMLVAASELKEVFSCLDTADPDYKKPPSAEDWRHVEALCTFL 445

Query: 147 QPIKKIGIMLRCCAN-------------------------QILCDVVKSMKSKFEKYWGN 206
           +P+ +    L+   N                           +  + K+M+ K +KYW  
Sbjct: 446 KPLFEAVSTLQSTGNPSAVTFFHEVWKTQSDLSRAIAGEDPFVTGIAKTMQEKVDKYW-- 505

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
B9FJG3	4.9e-22	29.30	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 1 OS=Oryza sativa subsp. j...	[more]
Q6AVI0	8.3e-22	29.30	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 OS=Oryza sativa subsp. j...	[more]
Q75HY5	1.3e-19	28.40	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3 OS=Oryza sativa subsp. j...	[more]
P08770	1.6e-17	30.34	Putative AC transposase OS=Zea mays OX=4577 PE=2 SV=2	[more]
Q0JMB2	8.1e-17	26.64	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 4 OS=Oryza sativa subsp. j...	[more]

BLAST of Lcy07g003860 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5D3CXI1	1.4e-67	56.35	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var...	[more]
A0A5D3DZY7	1.4e-67	56.35	Putative transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold240...	[more]
A0A5D3BX83	1.4e-67	56.35	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var...	[more]
A0A5D3CJE5	1.8e-67	55.95	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var...	[more]
A0A5D3CR68	1.5e-66	55.95	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var...	[more]

BLAST of Lcy07g003860 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_038904452.1	2.9e-72	61.67	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Benincasa hispida]	[more]
TYK28895.1	2.8e-67	56.35	putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
TYK16593.1	2.8e-67	56.35	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. ...	[more]
TYK03730.1	2.8e-67	56.35	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. ...	[more]
TYK12117.1	3.7e-67	55.95	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. ...	[more]

BLAST of Lcy07g003860 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT3G42170.1	7.2e-13	22.37	BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR025525	hAT-like transposase, RNase-H fold	PFAM	PF14372	DUF4413	coord: 141..212 e-value: 6.5E-14 score: 52.0
None	No IPR available	PANTHER	PTHR23272:SF137	ZINC FINGER BED DOMAIN-CONTAINING PROTEIN DAYSLEEPER-LIKE	coord: 27..207
None	No IPR available	PANTHER	PTHR23272	BED FINGER-RELATED	coord: 27..207
IPR012337	Ribonuclease H-like superfamily	SUPERFAMILY	53098	Ribonuclease H-like	coord: 2..195

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lcy07g003860.1	Lcy07g003860.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
molecular_function	GO:0003677	DNA binding