Lcy07g003080 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCTGAGAAATTCTCGGCAACATTGAGAATTGGGGATCTGAATGATTTCATAACGCCTTCTCAGGCTTGCATAGTTTCTCTCAAGGGACTTAAAGTCACTGCCACGAAGTCATATAAAGTTGAAGTAACTTTTTGATTTGATGTACATGTTGTTGTCGTTGGTTTTGATTTCTTCTCTACTTTTAAGTAATCTTTAGGAATTAGCAGGCTTAAAAACTGAGTGGTTCTTTCAGAAATTTTCTGTTTATTGATTTGTCTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTTTCCTTTCCCCCCCTCCTTTATAGATGCCTGGGAATACATGATGCCTGGGAATACTATGCCTGGGAATAAGATTGCTGGGAATCAAAGATAACTGTGTTTGGTTGTGCATGAGAGTGTCATCAGGATTTTATGAGAACAAATTATGTCGGTATTTATTTTTTAGAATTAATCAGGTAAACTTTATGTAATTTTAATAAATTAATCAATAACATAATCAAAATTAATTCAAACTATTAATAAAAATTAATGAAATAATAATCATGAAATGATTTTAATGGGATAAATTATGTTAATTTAACAAACTAAAATTATTTAATTAATTTTTTAATAAATATCTTTAACTACAATAATTTAATATATTGTATCCATAAAAATTAATTAGATAAATATTTAATAATAATATGATTATTTATTTATTATAAGAAAATTTTAAAAAGTAATTAATTGATTATAAATAATCGATAAGTAATTAATTATAATTATTGAAAAATGAATTTTTATACTAAATTCATTTAAATGATTTTAATTCAATAATTAAATATATTTTCGATAATATTGACTAGTTAATTATAATTTTAGTAAATATGTAATTACATCCCTTTAATAAACTTGGACTAAGTATTTGTTTAAAAGTCCTAGAAAAAAGTATTTGTTTAAAAAAAATGAAATTCTTGACAAATTATTATTTAATATAATTAAATAATTTATTATATTATTTTTAATTTAGTATCCATTAGTTAATTAATTAACTATATTCAAAATAAAATTGCATATAAAAATAAAAAAGAAGAGATGAGAAAAGAGAAAACCCATGCTTTTGCAAGGGCATAGAAAACCCTTGCTTATGGGCATAAATGATGTCTGGGAATGCGTTATTTCCTGGGCCCACCACAGAAATCTTGAAACAAACAAGGGTATTAGAAACCCTTGTCCATTCCCATCTCCAAAAACCTTGTACCAAACGGGCCCTTATGCGTATATTATCTAGGTTTCGGCTTCTAGGAAACAATTGAAAGCAGAACCAGTTAAGATTTCACTGAAGGACTGCTTAGCATGCAGGTAATTTTAACTATAACAATCTCTATTGTTTAAGGATCAGACTGGGTTGTTGGTTGTACAAAACTTTTGAATTGCTCTTTGATTTGCCTTGTACTTCTGATCTCTCCCTTGCGACGGAATGTAATAGACCTAATTTATGTGTAATTGTAGTGGTTGTGTAACATCAGCAGAGACTGTCATGCTGGAGAAGCAAAGTTTGGATGAATTTCTTTCCAACATAGATAAAGGAAAGGTTGTAGTTGTCTCATTATCTCCCCAATCCAGGACCTCACTTGCTGTCCATTTTGGTATCTCCCCGCTGAAGGTAAAATTATTTTGCATTTCCCATGATTGTAATGAGTTTTCTGCGTATATTATTTTTGAGAGGACAACGGCCACGAGGAAAATCTTGTAATATGACTGGTTGGTGGATTTTGAAGTTGTATTTATGTCATTGCAATGCTTGAAATGTTTATATCTATTAAAACAACTAACTACATTAGGTGTTTGGCTATGGTCAGGTTTTTAAGAAACTCACAACATTTTTTAAGTCCATGGGTGTAAAAGCTATATTTGATACAAGTTGCAGTAGAGATTTCATAGCAAGGTATAGACAAAGCCAGTCAGACAATGAGGAAAAATGCAAGTCATCCATTCCTATGATCTCATCTGCCTGCGCAGGTTTTTTTTTCTTCTGTCATTTAGCTACTGTACTTTAATGATAATTGTGCAAATCCACACTTTCTTTTTCAAAATATCTGGTAATGTTGATGATAAGTCATCTTTTCTTTTCTGGTAGCATAGAGTTAGTAGGGGTAATTCCTTTTCTCCTCTTCAATTGGGGTTGGAAATTGGTCAGTTTGGATTGTTTTGAGAGATAATTTTCAACTTGCTAAGTCTTCTGCCATTAAAAACTATTTTGTGCGACATCATATGTTAGGTTAACCAATCACACTTTAGATCGCTTTGGTTGGATTGCCAAGAAAATAAATAAATAATAATTATAGTGTGTTGCAGAGTTTGGTCAGAGGGAGAAATAAAATAGCATTTTGCGAGCAATGAAAAGAGGAATAAGAATTTTCCAACATCTATAATTTTATAATCTGTGAGAGGATAAAAGGAAATCACTGAATACCTAGGATAAGCAGAGTGTAAAATCCCCGTGTGGAGTATTCATCCTAATGAGATTCGTGTAGTTGATAATAATTTTTTTCATATTATGATTACAACTAAAAATTACTATTTGGTAAAATACACCAAGAAAAGGCTAGAAAAGTGAACTCATCTAATTAACGCCTAAACTTTAGGGATCAAAGAATGTTATTAGAAAAAAAATATAATAAATCTAATTTTCTTAAAAGGTTATTTACAAGAATGCCCCAACTTTGACACTCATTTTCAACAATAAACATATCATGAACACAGTGTTACTTGGACAAATTCTAGAGCTTCCCTTCTCTCCCTAAAACATTTGGGAAACTAAGAAAACGACTATGCATCACTCTCTTGGTATAAATACTCCGCTCCCCATTAGGTAGTTACAAGGTCTCACATCAGCACACCTTACTAACCAAGTCCTTGACATCCTTACATTTCCGTTTCTAACCCCATGATTAGATCTTCTCAAGTGAGTGTATCTGAGGGAGGCCTATCATGACTTTTTTATTTATTTATTTTTTATTTATTTATTTATTTTTTATAGAAACTAGAGAAAATCTAATCAGTATTTTAAACGAGAAGGAAGATCTATAGATTGCAGAGACAGGTATAAAAGTTTATCTGCATCAGCTTCTTTTATTTCCTTAAGCAATTAACACTGTTTCCTCAAATTCAACTAATAAAGACATCCTGACTATAGGGGGCTAGTGGGTTGTGCTTCTTAAGCTAATAACATTGTTTTTCTTGAACTCTACTATTAAAGATGTCTTGATTAATTGCAAGTTGATTTTGACATACCCTTCTCATCATATAACCTAGGAAGCACGGACACTTTGTTTTTTTGACAAAGTGTTCGTGCCGGACATGCATTAGACATGGATATATCCGAACACGCTTCGGACACGTGTCCTACACACAAAATTGTGTATCCCTTTTATTATTTTTATTCTTAATTTCAGACACGTCATGGGCATGTCACAGACACATCAAGAACACGACATTCAAAACCCAAACCTTTCACGCGATCGACGACTAATGGAATGTTAGCCAATGTGGCTGGTGGCGAAGTCCATTAGAGATAGAGGGAGGAAGATCGAAAGAAAGTGGGGAGGGATGGAGGGAGTAGTAGAATTAGGTGGAGGGGAGGAAAAGTAGAATTGGGGGAGGGAGGGAGTAGCAAAATGAGGGGGGAGAGAGAGCAGAAGAATCGGGTGGGAGGATTTTAGGGTTAAGGTTCTTTTTTAAATTTTATTGAAGACAGTAGTTTCTTAAGCTAATAATCTAAGAAGCATGGACACTTTAGTTTGGCTAGCGTGTCCGTGTCCGACACGTGTCCGACACTTGGACACTCCGACACTTGTTGGCACAATTGATATGTGACAAACACTAGTTGTAAGTTCATTTCAAACCCTTGTTAAGTATATTAAATAGACACAATGCTTAAATGACAAAAATAATAAATTTTAAGAGTAAAATACATTAAATTCATTTTTTCAAGCATACGAATGCATAAACTCATTGATTTTGAATTTTCTTCCTGTATAAAAATGATATATCATATATTTTTCTAAACGTGTCCATGTCGTGTCCGTATCCTAGATTTTAAAAAAACGACGTGTAGCCGTGTCCGTGTCGTGTCGTATCCGTGTCTCGTGTCCGTATCCATGCTTCTTAGCTAATAATATTGTTTTTCTCAAACTCTACTATTAAAGACATCTTGATTAATTGCAAGTTGATGTTGACATACTGTTCTCATCATACAACTTTGTAAAAATATGTTTGATATGATCAGATCACTCGGAGTGACCACAAATTTTGGTCTTTTTCTAACATGTGAAATCTTATCACTGTCACCTAGTCCAATTGTTGGACTTGACGGACTGGAAGTATTTGGTCCCATATGATCTGAAGCCCTACTCCATTCATTAGATGTGCACATGGAACAAAGTTTTAATCTCCCACATTTTTTCGTTAACTGGAGGATAGAAATTTCACATTGATATGAGGGATGGTTTCATAGTTTTTATTTTGGGAATACCTGTTGGCATCAGTGTTTTATCATTTTTTTTTTAAAATTTAAGAGTGCAATATAATTATTCAATTTGACATTTAACTCCTTTTTGCACGTTGACTATTTTTCCTTCTCAAACCCACACATCCCTTCCGATTTCAGGATGGATATGCTATGCTGAGAAGCAACATGGATCCTACATTTTGCCTTACATATCATCAGTGAAGAGTCCTCAGCAAATGATTGGATCAATAGTCAAGCATCATACATGCCAAAAATTGGGTATTAGGTAATTACATTGTATTTCTATTATGATCTTTCTGATGTACTTGTTTGGAAATTGTGGTGATATGTAAAGCTGAGTTATTTACAGTGGAGCGAAGTGGTTATAATTAGGATGATAAAATATGGTTATGGTATTTATCGCAAGAATAGATTTATTTAGGAATGACATGGAAAGCGAGACAATTTCAATTGTTTCATATTTTTATTTCCTTTGTATTTTA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MSEKFSATLRIGDLNDFITPSQACIVSLKGLKVTATKSYKVEVSASRKQLKAEPVKISLKDCLACSGCVTSAETVMLEKQSLDEFLSNIDKGKVVVVSLSPQSRTSLAVHFGISPLKVFKKLTTFFKSMGVKAIFDTSCSRDFIARYRQSQSDNEEKCKSSIPMISSACAGWICYAEKQHGSYILPYISSVKSPQQMIGSIVKHHTCQKLGIRLTTVNEEGHLFGVRGSFGGYAETIFRHAAKVEGKTLLKFALCYGFRNLQNVVRKIKVGKCDYHFLDIMACPSGCLNGGGQIKPKPGQSSKDLIELLEVAYQENILIRDPFENPVVKDIFEWLEQPGSEKAKKYMHTEYHPVASMGFRVSGFGFFVYRVWGYGHDLVFRVKGFWFWEVWGLAFIGCWDKMNMNMKIMKMMMVMIMMIKLFDDNDEDDDDNNENDDDDDDEIVDIDNDNSDNYDDDDNE Homology
BLAST of Lcy07g003080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94CL6 (Protein NAR1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 466.1 bits (1198), Expect = 4.7e-130 Identity = 250/464 (53.88%), Postives = 299/464 (64.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8WH18 (Cytosolic Fe-S cluster assembly factor narfl OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=narfl PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 282.0 bits (720), Expect = 1.2e-74 Identity = 178/472 (37.71%), Postives = 246/472 (52.12%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7TMW6 (Cytosolic iron-sulfur assembly component 3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ciao3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 274.6 bits (701), Expect = 2.0e-72 Identity = 170/473 (35.94%), Postives = 246/473 (52.01%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5BK18 (Cytosolic iron-sulfur assembly component 3 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Ciao3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 271.6 bits (693), Expect = 1.7e-71 Identity = 170/480 (35.42%), Postives = 250/480 (52.08%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4FV58 (Cytosolic iron-sulfur assembly component 3 OS=Bos taurus OX=9913 GN=CIAO3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 270.4 bits (690), Expect = 3.8e-71 Identity = 175/482 (36.31%), Postives = 250/482 (51.87%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CNT4 (protein NAR1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012714 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 608.2 bits (1567), Expect = 2.8e-170 Identity = 329/467 (70.45%), Postives = 339/467 (72.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LVS1 (Fe_hyd_SSU domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G181420 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 604.7 bits (1558), Expect = 3.1e-169 Identity = 325/467 (69.59%), Postives = 338/467 (72.38%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KFK6 (protein NAR1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495356 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 600.1 bits (1546), Expect = 7.6e-168 Identity = 325/468 (69.44%), Postives = 339/468 (72.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EHJ5 (protein NAR1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434364 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 599.4 bits (1544), Expect = 1.3e-167 Identity = 324/468 (69.23%), Postives = 338/468 (72.22%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EEW4 (LOW QUALITY PROTEIN: protein NAR1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432623 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 588.2 bits (1515), Expect = 3.0e-164 Identity = 319/468 (68.16%), Postives = 334/468 (71.37%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. NCBI nr
Match: XP_038894944.1 (protein NAR1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 609.0 bits (1569), Expect = 3.4e-170 Identity = 328/467 (70.24%), Postives = 338/467 (72.38%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. NCBI nr
Match: XP_022142658.1 (protein NAR1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 608.2 bits (1567), Expect = 5.8e-170 Identity = 329/467 (70.45%), Postives = 339/467 (72.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. NCBI nr
Match: XP_011654936.1 (protein NAR1 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031736116.1 protein NAR1 isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8652843.1 hypothetical protein Csa_022724 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 604.7 bits (1558), Expect = 6.4e-169 Identity = 325/467 (69.59%), Postives = 338/467 (72.38%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. NCBI nr
Match: KAG6583743.1 (Protein NAR1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 602.8 bits (1553), Expect = 2.4e-168 Identity = 325/468 (69.44%), Postives = 340/468 (72.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. NCBI nr
Match: XP_023520381.1 (protein NAR1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 600.5 bits (1547), Expect = 1.2e-167 Identity = 324/468 (69.23%), Postives = 339/468 (72.44%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy07g003080 vs. TAIR 10
Match: AT4G16440.1 (ferredoxin hydrogenases ) HSP 1 Score: 466.1 bits (1198), Expect = 3.3e-131 Identity = 250/464 (53.88%), Postives = 299/464 (64.44%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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