Lcy03g003420 (gene) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATTTCAGAAGCTTGCGCACAGTTCAAACTTTGTATCGCACAGCACAGAATCGATCATTTACTTCTAGGTAAGTATTTGCTATATTTTTGTAATTTTTTTGTTCGGCTTCCAGGAATTTAGAAAGTTGAGTGGCTGGTAATAAGAAAAATTGGTATTCTTCTACTGTTTTTCTTATTCATAAATGTCTGTTTAGGCGATGGGAAAGCTCAGATTGGTATTGGCAGTCTTGAGTGTTAGATGTTTATTCAGTAATTGTTTAGCTGGTTGAAAAAAGTTAAATTCTGCTGGAAGCCTTGAAATGGAAAATATCATTTACTCGAATGCAGTTTATTTTTTTTTTCAATACCGTTAGGTGCTGTAAGATTGTAATTGGAATTTCTATTCTGTACTCGCATTTTCGTGGCGACATTGATAAGGATGTTTTTTTTTTTCTTTCTTTTTTATGTAGCGGGTGTTGAATATGTTTCATCTTCTTATTTTGGTCTAACAGTGTTATTGTAAATTGTCTAATGCTCAGGCTTGGAAGTTCAGGAAACTATTCATGCGGTGTTGCAAATGGTAACTTACTTTGATGATTTTTAATTTTTTATAAATTTTCTTACCTCAGACTTAGATGCAGAAACTTCCTTCAACTAATATGGTTTTCGGTTGGTTCAGTTAGTCAATTGGGTATCCAGAAAACTTCTTCTTTCCTCAGTAACAGTCACACTACTTTTTCACTGGCTCAGGGACATAAAATGATAATAAGTTCTGCAGTGGTAATTTCCTGAACTTAATACGAGTGTTTTTCTGTTACATTTTTAGTTTCAATGCACCAAGATTTTAGATCAGCGATCAAAATTTTGTGAAAGGGTATTTTCTTTTTCAAGTTCATCAAAATTATTTTTTTTTCTTTTATTGTTTAGGCTGCTGAGTTGTCAATGTTCTCACATGGCATTAGGTTGGTGACAACACAAGCAAAAGCCCCTCCGCAAGTACGTCAAATGGTGAGTTTATTTTTGCCTAATTGATCACGTTTTAATTCCTTCAAGTTCCATTGGGATACAATGATCAATTGCTGAATAATTATGGTCTTGATAAAAATTTGTTTTACCATTTACTTAATTAATTCTGTTAAACCTAAAACCAAATTCCTATTGAATGCAGATTATGAAAATTGCTTAATAATTAGCTTTCCTATTTTGAAAATATTGATTGTTAGAAAACCCTTTGGGGTTGGTACAATGGTCATGTGCACGCTCCACCATCCATGGTCGCTTGGGTTCGAGTCTAAGTGGGTGCAAAAAGTTGTTTTTTTCCTTTTAATCTAATCCAATATATATATATATTGATTGTTTGCTTGTTTCTTTTTACATGATATGATTTATTCGATAAGTCTTTTACTTGATTGAAACTCCTTTCTTTAATAGGGTCCCTTTTGTGGGCTTAGTTCTTTGGATGCCCGTGTATTCTTTCTTTTTTCTCAGTGAAAGGTTGACCTTTTATCGAAAAAAAACCATGATAGGATTGATATCATATTGTGTGAAAAGATAGTATGCCTTTTTTGTTTTATGAGAAATCAAGCTTTCACTAAGGGGCCGTTTGGTACAAGGTTTTTGGAGATGGGAATGGGCAAGGGTTTCTAATACCCTTGTTTGTTTCAAGATTTCTGTGGTGGGCCCAGGAAATAACGCATTCCCAGGCATCATTTATGCCCATAAGCAAGGGCTTTCTATGCCCTTGCAAAAGCATGGGTTTTCTCTTTTCCCATCTCTTCTTTTTTATTTTTATATGCAATTTTATTTTGAATATAGTTAATTAATTAACTAATGGCTACTAAATTAAAAATAATATAATAAATTATTTAATTAGATTAAATAATAATTTTTCAAGAGTTTCAATTTTTTTTAAACAAATACTTTTTTTAGGACTTTTTAACAAATACTTAGTCCAAGTTTATTAAAGGAATGTAATTTCATATTTATTAAAATTATAATTAATTAGTTAATATTATCGAAAATATATTTAATTATTGAAATAAGATCATTTAAATGAATTTAGTATAAAAATTCATTTTTCAATAATTATAATTAATTACTTATCGATTATTTATAATCAATTAATTACTTTTTTTAGATTTCCTTATAACAAATAAATAATCATATTATTATCAAATATTTATCTAATTAATTTTTATGGATACAATATATTAAATTATTGTAGTTAAAGAAATTTATTAAAAAATTAATTAAATAATTTTAATTTGTTAAATTAACATAGTTTATCCCATTAAAATTATTTCATGATTATTATTTCATTAATTTTTATTAATAGTTTGAATTAATTTTGATTATTTTATTAAAATTACATAAAGTTTACCTGATTAATTCTAAAAAATAAATACAGACATAATTTGTTCTCATAAAATCCTGATGACATTCCCATGCACAACCAAACACAGTTATCTTTGATTCCCAGCAATCTTATTCCCAGGCATAGTATTCCCAGGCATCATGTATTCCCGGGCATCTATAAAACCTTAAACCAAACGGGCCCTAAGAGGAAATGAAAAAATACAATAGCAAAACAAGAGAAGCCAAGCCCAGCTATACAAAAGAAGATTTTAGTTCAAAATAATGAGACCGAATGGATAATTATGAAAGTCATTGGAGACTAACACCCAAGTAGAGCCATTAAGCCTAACAATTGGTCTCTCACAATCCCTAAAAGTTACGTTCTTCCTTTCCAACCTAATACCCCATAGGACAATGAAGAAGCTAGCCTATGACAAAATTTGCCACTTTTCGTGAAAAGGAAAATTCTTAAGAATATCCTCCACCACAGAGGAGCAAACCTCATTGTTGTTGTTGTTGTTGTGATAAAACGTAAGAATGTACTAGGGTATACAAAAAACAAGCCCATAAAAGGAATTCGAAAAATAACTACAAAAAGGGATTCCGATCCCAAAAGGTTAAACCAAGTTGATAATTATGAAATTTCCGATCAACGGACGCTCATAAGGAAGCATTAAACCTAACAACCTCCGAAACCTTCTCCCAATATCTCTCCACCCCTCTAGCAATCCTTTTATTCCTCTCCAGCACAGAAAAACCAAGCATGCCACAAGACTCAGCCTTTATCTTGAAAGTGGCAATTTAGGAGCACCTCCTCAATCATAGAGCAATAGCCTCTACTACGAGCTAAGCGAAGACCAAAAGAATGCAAACATCGACTTTAAAGGCAATCCCATAATAAATGATTAATGTCCTCATGCCAATCCAATAGTAAGTGTTTTAGTGTGTTTGGGGTTTGCTTGGGTGTGTAACAAGGATTGCCGCTCTATGTTGACAAGATCTTGATGAACTCTCCTTAATAAGGGAAGATTGTTGTGGCAGGCTTGCTCCTTTGCGATCTTGTGGGGTGTATGTGGCTCCATAGGAATAATAGGTTCTTTGGAGGGGTTGAAAGATCTTTGGAGGAGGTTTGGGAGGTGGTAAGGTTTAATGCCTCCCTATGAACATCCGTTCCTTGGACTTTTTTGTAATTATCAATTTGGTCTTTTAGTTTTGGATTGGACTTCGTTCTTATAGGTTGTTGAGGACTCCTTTTGTGGGCTTGTTTTTTGTATGCCCTTGTATATTCTTTCATTTTTCTAGATGAAAGCTAAGTTTCTTACAAAAAAAAAAGTTGATGTCCTCCCCTTGCCGCCTACAAAGAACATACCATTGTGGATACAACACAAAAGAAGAAAGTCTTTGGATGCTATCTCGGGCATTCACTCTCCTATGTGTCACTTGTCAAGCAAAGAACTTCACTTTCTTGGAGATTAAAATCTTCCAAGGAGAGGAGGAAGCACACAAATTGACTTGAAATGATGAAAAGAAAGGCGACCACCTCCATCACCTCTCGGTTAGTAAGGGAACGACGAAAGCCCAAAGAGATAGAAGGGGATTGGTAAGACGAAGTCAAAATAAAGGCCATCGAGTGTGACCTCTTATCTAGAAATTGGTATAAACACGAAAAAAGAGAACAAAAGGGTTTGCCACCCACCCCGTAGTCTTTCCAAAAATAAATCTTAGAGCCATCCCCAACCGAGGATTTCACAAACTGAAAGAACATAGCAAAACTTGAAGCAATAGCAATCCAAAGGTGTTTTTTTTTTTCCAGAGCCCTTAGCTGTGTAAGCTAATGGTAGGTGATTTATAAATTTTTTTTAGCTTAAACACATCATTCTTGATCTCTCCTGGCACACACTTTCTTTCCCCTTAATTGCTCCCTATATGCAACTTGTTATTGAGATATCGAATATGAGAGAATCCAATATCCTTCTATACAATGGAGACAAATATATATAGGCATACATAGAAGCCCTAAACTAATAATAGTAAAATTACAATAAAGGACTAAAGACTACAAGCTACTATATTCACATATATACTATAACACTCCCCCTCAAGTTGGAGCATATATGTTAATCATGCCCAACTAGTTACAAAGATAATCTATTCTAACTCCATTTAAAGCTTTCGTGAAAATATCTCCTAATTGCTCTCCAATCTTCACATATCTTGTAGATACCAAACCTTGCTGTATTTTCTCCTGAACAAAATGACAATCGATTTCAATATGTTTAGTCCGCTCATGAAATACTAGGTTGGATGCAATATGAAGGGCAACTTGGTTATCACACCACAACTTGGTCAGAACTGTAACATTGAAGCCTAATTCAATCAAGAGTTGATGTACCCACATTATTTCACATAGTGATTGTGCCATAGCTCTGTATTCTGATTTTGCACTTGATCTTGAAACTACATTTTGTTTCTTACTTTTCCATGAGACCAAATTGCCTCCAATGAAAACACAATAGCCAGAAGTTGATCTTCTATCTTCTCTTGATCCTGCCCAATTGACGTCTAAAAAACACTCAATCTTCATATGATCGTGATCTTTATATTAGATCCCACGTCCAGGTGCAGCCTTCAAATAACATAGAACTTGTTGTACTGCA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ATGAATTTCAGAAGCTTGCGCACAGTTCAAACTTTGTATCGCACAGCACAGAATCGATCATTTACTTCTAGGCTTGGAAGTTCAGGAAACTATTCATGCGGTGTTGCAAATGTTAGTCAATTGGGTATCCAGAAAACTTCTTCTTTCCTCAGTAACAGTCACACTACTTTTTCACTGGCTCAGGGACATAAAATGATAATAAGTTCTGCAGTGGCTGCTGAGTTGTCAATGTTCTCACATGGCATTAGGTTGGTGACAACACAAGCAAAAGCCCCTCCGCAAGTACGTCAAATGGGAGCCCTCAAAGTTTCCATGTTGAGTCCTGGATTCATCTATGAACCTTATTCACCTCGTCAAGCAATCCCATTTTGGCAAAGATGGTTCACAAGAAGTGGTTGGAGAAGAACAAAAGATGATATCATTTTAGAGCTAAAAAGTGCGTATGCAATTGCAAAATTAAGAAAGAAGGGGTACTCAAAGAAACAATTTTACGAAGAGGCTGTAAAATTATATAAAGAGATAAACACTTTGATAGCAAATGGTGACAAAACATCGTTGAGGAAAGCAGTCACAGAGAATATGTATTCAGCATTGAAGAATGAAATCAAACTTAGAGAATCCAAATGGAACAAAGTTTACTGGGAAATGATTGTACCAGTTGTTAAGATCCGCACATTACGAGCTAGATTGATTGGTGTTGATCGAAGTGACCTCGAAAAGGTTTTCGTACAGCTTACCCTTGAGATTCTTGCCAAACAGAAGTTTGAAGCATACAATTCTGAAGGTGCAGTCGTTGCTGGAGACAGATCTAAGGAGGTCCTTGTACGTGATATCTGGGTATTTGAGAAATCTCTTTTTCACGAGGGAGCTTATTGGCGTCTCTGTGGGCGGATTCCAATCTAA MNFRSLRTVQTLYRTAQNRSFTSRLGSSGNYSCGVANVSQLGIQKTSSFLSNSHTTFSLAQGHKMIISSAVAAELSMFSHGIRLVTTQAKAPPQVRQMGALKVSMLSPGFIYEPYSPRQAIPFWQRWFTRSGWRRTKDDIILELKSAYAIAKLRKKGYSKKQFYEEAVKLYKEINTLIANGDKTSLRKAVTENMYSALKNEIKLRESKWNKVYWEMIVPVVKIRTLRARLIGVDRSDLEKVFVQLTLEILAKQKFEAYNSEGAVVAGDRSKEVLVRDIWVFEKSLFHEGAYWRLCGRIPI Homology
BLAST of Lcy03g003420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BPQ8 (39S ribosomal protein L45, mitochondrial isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492196 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 527.7 bits (1358), Expect = 3.1e-146 Identity = 269/301 (89.37%), Postives = 283/301 (94.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HUF6 (uncharacterized protein LOC111467908 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467908 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 5.4e-146 Identity = 271/299 (90.64%), Postives = 283/299 (94.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZD4 (uncharacterized protein LOC111025682 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025682 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 524.6 bits (1350), Expect = 2.7e-145 Identity = 269/300 (89.67%), Postives = 281/300 (93.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LWH6 (Tim44 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G570770 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 521.2 bits (1341), Expect = 2.9e-144 Identity = 264/301 (87.71%), Postives = 281/301 (93.36%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HC62 (39S ribosomal protein L45, mitochondrial isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111462108 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 520.8 bits (1340), Expect = 3.8e-144 Identity = 268/299 (89.63%), Postives = 280/299 (93.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. NCBI nr
Match: XP_038879465.1 (uncharacterized protein LOC120071330 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 532.7 bits (1371), Expect = 2.0e-147 Identity = 274/301 (91.03%), Postives = 284/301 (94.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. NCBI nr
Match: XP_008450683.1 (PREDICTED: 39S ribosomal protein L45, mitochondrial isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 527.7 bits (1358), Expect = 6.5e-146 Identity = 269/301 (89.37%), Postives = 283/301 (94.02%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. NCBI nr
Match: XP_022968772.1 (uncharacterized protein LOC111467908 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 526.9 bits (1356), Expect = 1.1e-145 Identity = 271/299 (90.64%), Postives = 283/299 (94.65%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. NCBI nr
Match: XP_023520770.1 (uncharacterized protein LOC111784221 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 524.6 bits (1350), Expect = 5.5e-145 Identity = 270/299 (90.30%), Postives = 282/299 (94.31%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. NCBI nr
Match: XP_022159272.1 (uncharacterized protein LOC111025682 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 524.6 bits (1350), Expect = 5.5e-145 Identity = 269/300 (89.67%), Postives = 281/300 (93.67%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. TAIR 10
Match: AT5G27395.2 (Mitochondrial inner membrane translocase complex, subunit Tim44-related protein ) HSP 1 Score: 333.2 bits (853), Expect = 2.2e-91 Identity = 172/298 (57.72%), Postives = 222/298 (74.50%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy03g003420 vs. TAIR 10
Match: AT5G27395.1 (Mitochondrial inner membrane translocase complex, subunit Tim44-related protein ) HSP 1 Score: 329.3 bits (843), Expect = 3.2e-90 Identity = 173/315 (54.92%), Postives = 223/315 (70.79%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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